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SMYD3基因在急性髓系白血病中的表達及其臨床意義

2021-03-22 19:11張怡王娟娟馬超徐凱紅歐陽桂芳牧啟田
中國醫(yī)學創(chuàng)新 2021年29期
關鍵詞:基因表達

張怡 王娟娟 馬超 徐凱紅 歐陽桂芳 牧啟田

【摘要】 目的:研究SMYD3基因在急性髓系白血?。╝cute myeloid leukemia,AML)中的表達情況,探討其臨床意義。方法:收集2012年9月-2015年7月在本院就診的初發(fā)AML骨髓樣本87例,非腫瘤患者骨髓20例為對照樣本,實時熒光定量PCR檢測SMYD3基因表達水平,統(tǒng)計分析其與臨床特征的關系。結果:初發(fā)AML的SMYD3基因表達水平明顯高于對照組(P<0.001);將AML分為M3組與非M3組,M3組與非M3組的SMYD3基因表達水平均明顯高于對照組(P<0.001);非M3組的SMYD3基因表達水平高于M3組(P<0.05),年齡大于M3組和對照組(P<0.05)。結論:SMYD3在初發(fā)AML中呈現(xiàn)高表達,是一種AML相關基因,非M3比M3有更高的SMYD3表達水平。

【關鍵詞】 SMYD3 急性髓系白血病 基因表達

Expression Level of SMYD3 Gene in Acute Myeloid Leukemia and Its Clinical Significance/ZHANG Yi, WANG Juanjuan, MA Chao, XU Kaihong, OUYANG Guifang, MU Qitian. //Medical Innovation of China, 2021, 18(29): 0-026

[Abstract] Objective: To investigate the expression level of SMYD3 gene in patients with acute myeloid leukemia (AML) and to evaluate its clinical significance. Method: A total of 87 bone marrow samples of AML patients with initial onset was collected from our hospital from September 2012 to July 2015, and 20 bone marrow samples from non-tumor patients was used as control samples. The expression level of SMYD3 gene was determined by real time quantitative PCR, and the relationship between SMYD3 gene and clinical features were analyzed. Result: The expression level of SMYD3 gene in newly diagnosed AML was significantly higher than that in the control group (P<0.001); AML was divided into M3 group and non-M3 group, SMYD3 gene expression level of M3 group and non-M3 group was significantly higher than that of control group (P<0.001); the expression level of SMYD3 gene in non-M3 group was higher than that in M3 group (P<0.05), older than those of M3 group and control group (P<0.05). Conclusion: SMYD3 is highly expressed in primary AML, it is an AML-related gene, non-M3 has higher SMYD3 expression levels than M3.

[Key words] SMYD3 Acute myeloid leukemia Gene expression

First-author’s address: Ningbo First Hospital, Ningbo 315010, China

doi:10.3969/j.issn.1674-4985.2021.29.006

急性髓系白血?。╝cute myeloid leukemia,AML)是常見的惡性腫瘤之一,發(fā)病率呈現(xiàn)逐年上升的趨勢,其耐藥率、復發(fā)率和死亡率居高不下,因此迫切需要尋找新的相關基因作為診斷、預后監(jiān)測的新靶點。SET和MYD結構域蛋白3(SET and MYND domain-containing 3 protein,SMYD3)由東京大學醫(yī)學院Hamamoto等[1]于2004年在肝癌及結腸癌中首次發(fā)現(xiàn),在多種惡性腫瘤中呈現(xiàn)高表達,成為近幾年腫瘤研究的新熱潮。本研究前期的體外研究也證明沉默SMYD3基因后乳腺癌細胞侵襲性明顯降低[2-4]。但是SMYD3在血液腫瘤中的報道較為少見,在AML中的研究迄今尚無報道。為探討SMYD3基因在AML中的表達情況,本研究分析87例初發(fā)AML中的SMYD3表達情況,為AML的研究提供了新的思路,現(xiàn)報道如下。

1 材料與方法

1.1 標本來源 選取2012年9月-2015年7月在本院就診的初發(fā)AML骨髓樣本87例為AML組,其中男53例,女34例;年齡15~87歲,中位49歲。AML的診療標準參考成人急性髓系白血?。ǚ羌毙栽缬琢<毎籽。┲袊\療指南(2011年版)和急性早幼粒細胞白血病中國診療指南(2011年版)[5-6]。FAB分型:M0 1例,M1 3例,M2 3例,M3 38例,M4 24例,M5 18例。將初發(fā)AML的標本按FAB分型分為M3組(n=38)和非M3組(n=49)。對照組樣本20例為非腫瘤患者骨髓。本研究已通過醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會審批(2021-R039),獲得患者或其家屬的知情同意。

1.2 材料 TRIzol試劑和反轉錄試劑為賽默飛世爾科技(中國)有限公司產(chǎn)品。TB Green PCR試劑為寶日醫(yī)生物技術(北京)有限公司產(chǎn)品。Ficoll細胞分離液為美國GE公司產(chǎn)品。實時熒光定量PCR儀為美國應用生物系統(tǒng)公司StepOne Plus。核酸蛋白檢測儀為賽默飛世爾科技(中國)有限公司NANODROP 2000。

1.3 實驗方法 (1)提取RNA:按骨髓樣本2 mL︰Ficoll細胞分離液1 mL的比例,密度梯度離心法獲取單個核細胞,按TRIzol試劑說明書提取mRNA,核酸蛋白檢測儀檢測mRNA濃度和純度(A260/A280為1.8~2.0)。(2)cDNA合成:按反轉錄試劑說明書兩步法合成cDNA,反應體系為20 μL。RNA

1 μg,隨機引物1 μL,水補至12 μL,65 ℃,5 min,至冰上,加M-Mulv 1 μL,dNTP 2 μL,5×緩沖液4 μL,RNA酶抑制劑1 μL,42 ℃,60 min,70 ℃,5 min。(3)實時熒光定量PCR擴增SMYD3基因:引物序列(5’-3’):SMYD3基因上游TGT GAC TGT TTC CGT TGC,下游 CAG AAC CTG CTC CCA CTT[2-4];內參基因GAPDH上游GAA GGT GAA GGT CGG AGT C,下游GAA GAT GGT GAT GGG ATT TC。反應體系為20 μL:2×TB Green PCR混合液10 μL,

上下游引物各0.8 μL,50×ROX染料0.4 μL,cDNA 2 μL,水6 μL。擴增條件:95 ℃,30 s,1個循環(huán);95 ℃,5 s,60 ℃,30 s(收集熒光信號),40個循環(huán)。SMYD3和GAPDH基因的擴增效率須在90%以上。擴增后增加熔解曲線步驟以確定擴增特異性。熔解曲線條件:95 ℃,15 s,60 ℃,60 s+

0.3 ℃(收集熒光信號),95 ℃,15 s。每孔樣本的熔解曲線須僅見單峰,峰值在80~90 ℃。每個樣本設3個復孔。每批次樣本均以細胞株THP-1為內對照,并設陰陽性對照。(4)SMYD3基因表達量計算方法:以細胞株THP-1為內對照,2-??Ct法計算SMYD3基因表達量。?Ct=[CtSMYD3-CtGAPDH]樣本-[CtSMYD3-CtGAPDH]內對照。因部分數(shù)據(jù)較小,SMYD3基因量以2-??Ct×100表示。

1.4 統(tǒng)計學處理 采用SPSS 19.0軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。計量資料呈非正態(tài)分布,以M(P25,P75)表示,組間比較采用Mann-Whitney U檢驗;計數(shù)資料用頻數(shù)或百分率表示,組間比較采用字2檢驗、連續(xù)校正字2檢驗或Fisher確切概率法。P<0.05表示差異有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1 AML組和對照組患者臨床特征及SMYD3基因表達水平比較 兩組年齡、性別比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05);AML組的SMYD3基因表達水平高于對照組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.001)。見表1。

2.2 非M3組、M3組和對照組的臨床特征及SMYD3基因表達水平比較 非M3組的年齡大于M3組和對照組,差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.05);M3組和對照組的年齡及三組的性別構成比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05);非M3組和M3組的SMYD3基因表達水平均高于對照組(P<0.001);非M3組的SMYD3基因表達水平高于M3組(P<0.05)。見表2。

2.3 初發(fā)AML患者高表達水平組和低表達水平組的SMYD3基因表達水平和臨床特征比

較 以SMYD3基因作為分類變量,將初發(fā)AML根據(jù)SMYD3中位表達數(shù)27.49分為高水平表達組(≥27.49,n=44)和低水平表達組(<27.49,n=43)。高水平表達組的SNYD3基因表達水平為39.67(34.00,56.44),低水平表達組為16.75(12.66,20.41)。兩組的年齡、性別、白細胞計數(shù)、高白細胞(≥100×109/L)、紅細胞計數(shù)、血紅蛋白、血小板計數(shù)以及FAB分型比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表3。

2.4 非M3患者SMYD3基因表達水平和臨床特征關系 以SMYD3基因作為分類變量,將初發(fā)AML(非M3)根據(jù)SMYD3中位表達數(shù)29.86分為高水平表達組(≥29.86,n=25)和低水平表達組(<29.86,n=24)。高水平表達組的SNYD3基因表達水平為49.26(37.26,101.84),低水平表達組為17.50(12.72,25.15)。兩組的臨床特征與SMYD3基因表達水平比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表4。

3 討論

SMYD3是近幾年備受關注的腫瘤相關基因,位于染色體1q44,是SMYD(含有SET和MYND結構域)家族蛋白中的重要成員[1]。國內外研究發(fā)現(xiàn)SMYD3不僅高表達于肝癌和結腸癌[1],在乳腺癌[2-4]、肺癌[7]、前列腺癌[8]、膽囊癌[9]、胰腺癌[10]、卵巢癌[11]等各種實體腫瘤中也均呈現(xiàn)高表達。針對其作用機制的多方研究證實,SMYD3位于多條通路的關鍵位置,可接受多種上游基因的調節(jié)[12],也可調節(jié)多種下游基因[13],在促進癌細胞的生長增殖和侵襲轉移中發(fā)揮不可或缺的作用。敲除SMYD3可恢復其所調節(jié)的基因的正常表達模式,從而阻止癌細胞不可控制的無限增殖[14]。本研究前期的體外實驗也顯示,SMYD3在乳腺癌細胞株上呈現(xiàn)高表達,microRNA沉默SMYD3后可通過Wnt/β-Catenin通路下調C-Myc基因表達,從而減弱乳腺癌細胞的生長和侵襲轉移能力[2-4]。因此國內外研究者均認為SMYD3是表觀遺傳調控和信號通路的致癌驅動因子,靶向SMYD3的小分子抑制劑的開發(fā)是當前的研究趨勢[15]。

SMYD3在血液腫瘤方面的研究相對實體腫瘤要少得多。文獻[16]分析了59例慢性淋巴細胞白血?。╟hronic lymphocytic leukemia,CLL)中SMYD2和SMYD3的基因表達譜,發(fā)現(xiàn)兩者在CLL患者中過表達,有殘留表達的患者呈現(xiàn)高白細胞計數(shù)和復雜的染色體核型。文獻[17]的研究對象為SMYD2基因,通過分析83例兒童急性淋巴細胞白血?。╝cute lymphoblastic leukemia,ALL)骨髓樣本,證實了SMYD2基因在兒童ALL患者中的表達顯著高于非腫瘤對照組,并且SMYD2高表達與較差的生存率相關,化療緩解后SMYD2表達明顯下降。由此可見SMYD3對血液腫瘤的發(fā)生發(fā)展的影響并不弱于實體腫瘤,在血液腫瘤領域研究SMYD3具有同樣重要的意義。但迄今為止SMYD3在急性髓系白血病中的研究尚未見報道。本研究在AML標本中檢測SMYD3的表達情況,為AML研究尋找新的分子指標。

本研究結果顯示,非腫瘤對照組20例樣本均存在低水平的SMYD3基因表達,提示SMYD3并非腫瘤特異性基因,它作為組蛋白甲基轉移酶的一員,在多種生物過程如染色質形成、X染色體失活及轉錄調控中發(fā)揮重要功能[1]。而87例初發(fā)AML樣本的SMYD3基因表達水平明顯高于對照組,這與眾多實體瘤和上述CLL及兒童ALL的報道一致,充分說明AML中也存在SMYD3的高表達。

在AML中,急性早幼粒細胞白血?。ˋPL),F(xiàn)AB分型M3,是一種特殊類型,絕大多數(shù)患者具有特異性染色體易位t(15;17)(q22;q12),形成PML-RARα融合基因。近三十年來,由于全反式維甲酸及砷劑的規(guī)范化臨床應用,APL已成為基本不用進行造血干細胞移植即可治愈的白血病[6]。國內外診療指南均將M3單獨分析而與其他類型的AML區(qū)別開來。從成人急性髓系白血?。ǚ羌毙栽缬琢<毎籽。┰\療指南可知,年齡≥60歲則是AML(非M3)的不良預后因素之一[5];急性早幼粒細胞白血病診療指南中提到M3易見于中青年,平均發(fā)病年齡為44歲,年齡并不是M3預后不良的判斷因素[6]??梢娔挲g在AML(非M3)中是需要重點考慮的因素之一,而在M3中所占的比重要小得多。本研究通過將AML分為非M3組與M3組進行對比分析,發(fā)現(xiàn)M3作為一種特殊的AML類型,與AML(非M3)在SMYD3的表達水平和年齡上均存在差異:AML(非M3)比M3有更高的SMYD3表達水平和更高的年齡。

本研究結果顯示,初發(fā)AML樣本SMYD3基因中位表達水平為27.49,范圍為3.68~182.48,SMYD3基因表達的異質性較大。因此本研究將SMYD3作為分類變量,以中位表達水平將AML樣本分為SMYD3高水平表達組和低水平表達組進行比較,本研究將AML(含M3)和AML(非M3)均進行了高低水平的對比,但并未發(fā)現(xiàn)SMYD3表達量與年齡、性別、白細胞計數(shù)、高白細胞(≥100×109/L)、紅細胞計數(shù)、血紅蛋白、血小板計數(shù)以及FAB分型有相關性。

綜上所述,本研究證實了SMYD3在AML中高表達,或許可以作為一種新的分子靶點應用于AML的診斷中。近幾年,隨著醫(yī)學檢測方法和診療水平的發(fā)展,國內外醫(yī)學組織更多地采用遺傳學變異和基因突變等來進行白血病的診斷、分型和危險度分層,患者也可以選擇更多的檢測方法來提高診斷的準確性和生存預測的精準性。因此本研究將在之后的實驗中收集更多的病例和臨床指標來分析SMYD3與白血病之間的相關性,并在此基礎上進行患者的生存分析及作用機制研究,為白血病研究提供新的思路。

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(收稿日期:2021-09-09) (本文編輯:張爽)

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