陳佳靜,李彤彤,張則,盧安然,李陳飛,馮秀麗
(南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動(dòng)物細(xì)菌學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/教育部“動(dòng)物健康與食品安全”國(guó)際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 210095)
法氏囊是禽類(lèi)中樞體液免疫器官。法氏囊源活性分子發(fā)揮了多種功能,如免疫調(diào)節(jié)[1-3]、促進(jìn)B細(xì)胞分化[4-5]、抗氧化[6]及抗腫瘤[7-8]等功能。前期研究發(fā)現(xiàn),法氏囊源活性分子法氏囊五肽(BPP-I、BPP-IV)來(lái)源于同一種蛋白分子,即Cbl(Casitas b-lineage lymphoma)[9]。Cbl蛋白家族是具有Ring Finger結(jié)構(gòu)域的一種泛素化激酶(E3)。哺乳動(dòng)物細(xì)胞中存在3種Cbl亞型,分別為c-Cbl,Cbl-b和Cbl-3[10]。Cbl-b蛋白可以通過(guò)充當(dāng)銜接蛋白來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞活化。在免疫系統(tǒng)中,Cbl-b可通過(guò)調(diào)節(jié)T細(xì)胞,B細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞(natural killer cell,NK)激活途徑在抗腫瘤免疫中發(fā)揮關(guān)鍵作用[11]。Cbl編碼906個(gè)氨基酸的多結(jié)構(gòu)域蛋白c-Cbl,其主要功能是調(diào)節(jié)酪氨酸激酶[12]。c-Cbl是一種120 kDa的蛋白質(zhì),包含1個(gè)變異的SH2結(jié)構(gòu)域,1個(gè)RING結(jié)構(gòu)域,1個(gè)富含脯氨酸的區(qū)域和1個(gè)與泛素(Ub)相關(guān)的結(jié)構(gòu)域,與活性血小板衍生的生長(zhǎng)因子、表皮生長(zhǎng)因子和集落刺激因子-1受體結(jié)合并刺激其泛素化[13]。有研究表明,在P-選凝素活化β2整合素的信號(hào)通路中,存在有c-Cbl泛素化激酶介導(dǎo)的負(fù)反饋調(diào)控過(guò)程[14],說(shuō)明c-Cbl蛋白在炎癥反應(yīng)方面有著精細(xì)的調(diào)控作用。最近有研究表明,c-Cbl可以作為E3分子調(diào)控維甲酸誘導(dǎo)基因I(retinoic acid inducible-gene I, RIG-I)、干擾素調(diào)節(jié)因子8 (IRF8)等分子泛素化,與細(xì)胞Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生以及抗病毒反應(yīng)有密切的關(guān)系[15]。
自1992年在中國(guó)發(fā)現(xiàn)甲型H9N2流感病毒以來(lái),已給家禽養(yǎng)殖業(yè)造成了重大的經(jīng)濟(jì)損失[16-17]。前期研究發(fā)現(xiàn),重組表達(dá)的Cbl能夠抑制H9N2亞型禽流感病毒(AIV)復(fù)制[18],說(shuō)明該蛋白具有一定的抗病毒復(fù)制功能。有文獻(xiàn)報(bào)道,H9N2作為一種臨床上常見(jiàn)的AIV亞型,為多種AIV亞型提供了基因片段,具有重要的公共衛(wèi)生意義[19]?;诖耍狙芯恳匀嗽醇?xì)胞A549為宿主細(xì)胞模型,開(kāi)展Cbl蛋白表達(dá)對(duì)H9N2亞型AIV增殖的影響研究。
人肺腺癌細(xì)胞(A549)由本實(shí)驗(yàn)室保存,采用含有10%胎牛血清1640培養(yǎng)基于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng)。AIV毒株A/chicken/Shandong/LY1/2017 (H9) 由本實(shí)驗(yàn)室于2017年分離、初步鑒定并保存。Cbl siRNA(表1)和陰性對(duì)照siRNA購(gòu)自南京擎科生物科技有限公司。
表1 siRNA序列
GAPDH單抗,購(gòu)于Enogene生物公司;HRP標(biāo)記山羊抗兔IgG二抗,購(gòu)于優(yōu)寧維生物公司;DL2000 DNA Marker、DL15000 DNA Marker、核酸內(nèi)切酶EcoRⅠ和HindⅢ、Mix、核酸膠回收試劑盒、TRIzol試劑,購(gòu)于TaKaRa公司;DMEM和胎牛血清(FBS),購(gòu)于Gibco公司;蛋白預(yù)染Marker、LipofectamineTM3000轉(zhuǎn)染試劑,購(gòu)于Invitrogen公司;抗流感病毒A核蛋白抗體 (ab20343) 和c-Cbl蛋白抗體(ab32027),購(gòu)于Abcam公司。
根據(jù)GenBank中Cbl基因(NM_204208.1)的序列設(shè)計(jì)特異性引物擴(kuò)增基因,引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。引物序列為,F(xiàn):5′-AAGCTTATGTCGGCTCCGCTGAAGAAGGG-3′,R:5′-GAA-TTCTTACAGGGATAACTTCGTCAGGTTACGCCTAGGC-TGAG-3′。
在50 μL PCR體系中加入反轉(zhuǎn)錄后的HD11 cDNA模板2.5 μL,上、下游引物各1 μL,rTaq酶mix 25 μL,補(bǔ)加ddH2O至50 μL。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性 5 min;95 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸5 min,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,在16 ℃終止反應(yīng)。PCR結(jié)束后,回收PCR產(chǎn)物進(jìn)行雙酶切。酶切體系為:質(zhì)?;蚰康钠? μg、限制性內(nèi)切酶各2 μL、10 × Cutsmart buffer 5 μL、ddH2O補(bǔ)至50 μL。37 ℃酶切45 min,65 ℃ 5 min結(jié)束酶切反應(yīng)。清潔回收酶切產(chǎn)物,然后利用T4 DNA連接酶連接。16 ℃連接過(guò)夜,取連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,在含有氨芐抗性的LB固體平板上37 ℃ 過(guò)夜培養(yǎng)。挑取單克隆菌落進(jìn)行菌液PCR鑒定,選取1~3個(gè)陽(yáng)性克隆送南京擎科生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。
A549細(xì)胞接種至24孔板中,待其貼壁生長(zhǎng)至密度為60%~70%,利用Lip3000轉(zhuǎn)染相應(yīng)質(zhì)粒至A549細(xì)胞中,其中FLAG-Cbl組轉(zhuǎn)染FLAG-Cbl質(zhì)粒,F(xiàn)LAG組轉(zhuǎn)染FLAG-N空載體,對(duì)照組則僅加入Lip3000轉(zhuǎn)染試劑,轉(zhuǎn)染后6 h更換培養(yǎng)液,用含2%血清的1640培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)至24 h。接種感染復(fù)數(shù)(MOI)為0.1的H9N2亞型病毒,在對(duì)應(yīng)時(shí)間點(diǎn)收集細(xì)胞沉淀制樣,進(jìn)行SDS-PAGE檢測(cè)后,轉(zhuǎn)印至PVDF膜,于5%脫脂奶中室溫封閉2 h,用PBST洗膜3次,洗膜完成后根據(jù)蛋白Marker大小剪取所需蛋白大小的膜至稀釋好的對(duì)應(yīng)單抗中,4 ℃孵育過(guò)夜。清洗后置于5%脫脂奶稀釋的HRP標(biāo)記山羊抗兔二抗中于37 ℃繼續(xù)孵育1 h。利用化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑盒進(jìn)行化學(xué)發(fā)光顯色,檢測(cè)蛋白表達(dá)情況。
采用TRIzol裂解法提取細(xì)胞總RNA,并且反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 模板用于實(shí)時(shí)熒光定量 PCR,反轉(zhuǎn)錄體系為 20 μL:RNA 模板 6 μL;AccuRT reaction mix (4×) 2 μL;AccuRT Reaction Stopper (5×) 試劑2 μL;5× All-In-One RT MasterMix 試劑 4 μL;Nuclease-free H2O試劑6 μL;反應(yīng)程序?yàn)?5 ℃ 10 min,42 ℃ 15 min,最后85 ℃ 5 min。
根據(jù) GenBank上公布的 H9N2 亞型 AIV 的血凝素(HA)、核蛋白(NP)和非結(jié)構(gòu)蛋白(NS)基因序列,設(shè)計(jì)并且合成熒光定量 PCR引物,如表2所示。引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。
表2 熒光定量PCR引物
反應(yīng)體系: EvaGreen 2×qPCR MasterMix 10 μL,上下游引物各0.6 μL,模板DNA 2 μL,水6.8 μL。反應(yīng)程序?yàn)轭A(yù)變性95 ℃ 1 min,然后95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,35個(gè)循環(huán),采集信號(hào)分析結(jié)果。熒光定量PCR試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理采用2-ΔΔCt法。
A549細(xì)胞接種至24孔板中,待其貼壁生長(zhǎng)至密度為30%~40%,利用LipofectamineTM3000轉(zhuǎn)染試劑轉(zhuǎn)染相應(yīng)siRNA各50 pmol,轉(zhuǎn)染后6 h后更換培養(yǎng)液為含2%血清的1640培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)36 h。然后接種MOI=0.1的H9N2亞型AIV,分別在感染后不同時(shí)間段收集細(xì)胞樣品,采用熒光定量PCR檢測(cè)病毒HA基因相對(duì)表達(dá)水平。
以禽源HD11細(xì)胞的cDNA為模板,擴(kuò)增出Cbl片段,大小為420 bp (圖1) ,與預(yù)估大小符合。將擴(kuò)增產(chǎn)物Cbl與空載體FLAG-N連接后,以單菌落擴(kuò)增后提取的質(zhì)粒為模板進(jìn)行 PCR,瓊脂糖凝膠電泳顯示,在420 bp處有1條明顯條帶(圖2),與預(yù)期結(jié)果一致。PCR陽(yáng)性質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),發(fā)現(xiàn)約3 779和420 bp 2條特異條帶,如圖3所示。這些結(jié)果說(shuō)明,真核重組表達(dá)載體FLAG-Cbl已構(gòu)建成功。
M.DNA Marker;1~3.Cbl的PCR產(chǎn)物
M.DNA Marker;1~5.FLAG-Cbl的重組載體PCR產(chǎn)物
2.2.1 從蛋白水平上檢測(cè)Cbl蛋白對(duì)病毒復(fù)制的影響
FLAG-Cbl 重組載體和FLAG空載體轉(zhuǎn)染A549細(xì)胞24 h,然后接種H9N2病毒,分別于6、12、24和36 h后收樣,檢測(cè)不同時(shí)間點(diǎn)病毒NP蛋白的表達(dá)情況,如圖4。結(jié)果顯示,在接毒6 h后FLAG-Cbl組的NP蛋白表達(dá)低于FLAG空載組。該結(jié)果表明表達(dá)的Cbl蛋白抑制了H9N2 病毒在A549細(xì)胞中的早期復(fù)制。
M.DNA Marker;1~3.雙酶切FLAG-Cbl重組載體
圖4 Western blot檢測(cè)病毒NP蛋白的表達(dá)
利用 Image J 軟件進(jìn)行結(jié)果分析,分析不同細(xì)胞組的NP蛋白與內(nèi)參蛋白GAPDH蛋白的比值,結(jié)果如圖5所示。接毒6 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl組的NP蛋白水平明顯低于對(duì)照和FLAG組(P<0.05)。接毒12 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl組的NP蛋白水平也低于對(duì)照組,不過(guò)沒(méi)有達(dá)到差異水平(P<0.05)。
*表示差異顯著(P<0.05)。下同
2.2.2 從mRNA水平上檢測(cè)Cbl蛋白對(duì)病毒復(fù)制的影響
FLAG-Cbl重組載體和FLAG空載體轉(zhuǎn)染 A549 細(xì)胞24 h,分別于接種H9N2亞型病毒6、12、24和36 h收樣,進(jìn)行熒光定量PCR檢測(cè)。結(jié)果如圖6所示,接毒6、12和24 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NP基因相對(duì)水平顯著低于對(duì)照和FLAG組(P<0.05,P<0.01),表明重組表達(dá)的Cbl蛋白抑制了H9N2亞型AIV在A549細(xì)胞中的早期復(fù)制。在病毒接種36 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NP基因相對(duì)水平低于FLAG空載體組(P>0.05),不過(guò)極顯著高于對(duì)照組(P<0.01)。
**表示差異極顯著(P<0.01)。下同
同時(shí),采用定量PCR技術(shù)檢測(cè)了H9N2病毒的HA、NS基因表達(dá)水平。結(jié)果顯示,在接毒6和12 h,F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NS基因相對(duì)水平明顯比FLAG空載體組低(P<0.05,P<0.01)(圖7),且該組的HA基因相對(duì)水平明顯低于FLAG空載體組(P<0.05)(圖8)。在病毒接種24 h時(shí),各試驗(yàn)組的NS和HA基因表達(dá)水平差異不大(P>0.05)。在病毒接種36 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl組的病毒NS和HA基因相對(duì)水平低于FLAG空載組,不過(guò)高于對(duì)照組。
圖7 熒光定量PCR檢測(cè)NS基因相對(duì)表達(dá)水平
為了探究?jī)?nèi)源性Cbl蛋白對(duì)于H9N2病毒的影響,在A549細(xì)胞中分別轉(zhuǎn)染對(duì)照和3條靶向Cbl蛋白的siRNA (Cbl-1、Cbl-2和Cbl-3) 敲低Cbl蛋白的表達(dá)。轉(zhuǎn)染72 h后,經(jīng)Western blot和熒光定量PCR驗(yàn)證敲低效率。與對(duì)照相比,siRNA-Cbl-1、-2和-3均敲低細(xì)胞中Cbl蛋白的蛋白表達(dá)及基因表達(dá)水平明顯減少,其中以siRNA-Cbl-1敲低Cbl蛋白和基因表達(dá)最為明顯(P<0.05)(圖9、10)。
圖8 熒光定量PCR檢測(cè)HA基因相對(duì)表達(dá)水平
圖9 Western blot檢測(cè)siRNA對(duì)Cbl蛋白的敲低作用
***表示差異極顯著(P<0.001)。下同
基于上述結(jié)果,選擇敲低效果最顯著的siRNA-Cbl-1進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。轉(zhuǎn)染siRNA-Cbl-1 36 h后,以MOI=0.1的H9N2病毒感染,分別在感染后 6、12、24和36 h收集細(xì)胞樣品,做熒光定量PCR驗(yàn)證。結(jié)果如圖11所示,在A549細(xì)胞中敲低Cbl蛋白表達(dá)12~36 h時(shí),病毒HA基因水平明顯上升(P<0.001),說(shuō)明敲低細(xì)胞內(nèi)Cbl時(shí),病毒復(fù)制增強(qiáng),暗示細(xì)胞內(nèi)的Cbl蛋白能夠在一定程度上抑制H9N2病毒的復(fù)制。
圖11 熒光定量PCR檢測(cè)敲低細(xì)胞內(nèi)Cbl對(duì)病毒HA基因表達(dá)的影響
H9N2亞型AIV已給我國(guó)家禽養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,并造成了嚴(yán)重的公共衛(wèi)生安全隱患[16-17]。開(kāi)展抗AIV的功能機(jī)制研究已成為眾所關(guān)注的重要課題。本研究前期發(fā)現(xiàn),Cbl為法氏囊源活性分子的同源蛋白[9]。Cbl作為一種泛素化激酶(E3),是細(xì)胞內(nèi)泛素化生物過(guò)程的重要組成[20-21]。有研究顯示,E3泛素連接酶可通過(guò)促進(jìn)TBK1 泛素化修飾來(lái)調(diào)控其表達(dá)及活化[22],也可與TRAF3相互結(jié)合并對(duì)其進(jìn)行K29泛素化修飾,增強(qiáng)下游信號(hào)分子IRF3的活化,從而促進(jìn)Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生來(lái)抑制病毒復(fù)制[23]。那么,Cbl對(duì)H9N2亞型AIV的復(fù)制影響如何,有待于進(jìn)一步探索。
本試驗(yàn)成功構(gòu)建了FLAG-Cbl真核表達(dá)載體,并將其轉(zhuǎn)染至A549細(xì)胞中,感染H9N2亞型AIV后,經(jīng)Western blot和熒光定量PCR檢測(cè)NP等病毒蛋白的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)在病毒感染6和12 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中病毒NP、NS和HA基因表達(dá)水平均明顯低于FLAG組,且低于對(duì)照組,這說(shuō)明Cbl蛋白在H9N2亞型病毒早期復(fù)制有一定的抑制作用。同時(shí)發(fā)現(xiàn),病毒感染24 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl轉(zhuǎn)染組、FALG組和對(duì)照組細(xì)胞中病毒NS和HA基因表達(dá)水平相似,而在病毒感染36 h時(shí),F(xiàn)LAG-Cbl轉(zhuǎn)染組細(xì)胞中病毒NP、NS和HA基因表達(dá)水平均低于FLAG組,但高于對(duì)照組。我們推測(cè)可能是因?yàn)?4 h以后,細(xì)胞內(nèi)病毒總量復(fù)制增加,Cbl雖然具有一定抑制病毒的能力,但病毒可能通過(guò)一些機(jī)制仍在不斷增加,以至于Cbl蛋白不能充分發(fā)揮抑制病毒復(fù)制的功能,這些側(cè)面說(shuō)明了Cbl蛋白僅在病毒早期發(fā)揮抑制病毒復(fù)制的作用。至于其中的功能機(jī)制尚不清晰,還有待深入探索。
HA蛋白是H9N2亞型AIV的重要結(jié)構(gòu)蛋白,不僅介導(dǎo)病毒吸附及穿入宿主細(xì)胞,而且是一種保護(hù)性抗原[24]。本試驗(yàn)用RNAi技術(shù)敲低細(xì)胞內(nèi)Cbl蛋白后,以HA基因水平反映H9N2亞型AIV的入侵宿主細(xì)胞及其在宿主細(xì)胞中的復(fù)制情況。熒光定量PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn)病毒HA基因水平明顯增高。這說(shuō)明細(xì)胞內(nèi)Cbl蛋白降低后,細(xì)胞內(nèi)AIV增多,暗示著細(xì)胞內(nèi)Cbl蛋白降低后,AIV復(fù)制增強(qiáng)。該結(jié)果與FLAG-Cbl轉(zhuǎn)染過(guò)表達(dá)的結(jié)果具有一定的負(fù)相關(guān)關(guān)系。這也反過(guò)來(lái)暗示了Cbl蛋白對(duì)于H9N2亞型流感病毒復(fù)制有一定的抑制作用。鄭陽(yáng)等[18]報(bào)道,重組表達(dá)的Cbl蛋白能夠在犬MDCK 細(xì)胞上抑制H9N2亞型AIV的復(fù)制。本研究以A549細(xì)胞為模型,采用不同的重組表達(dá)載體,取得了與此相似的研究結(jié)果。這暗示著Cbl能夠在不同宿主細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮抑制H9N2亞型AIV復(fù)制的功能。許多研究都證實(shí),E3泛素連接酶家族成員可通過(guò)泛素化途徑來(lái)調(diào)控干擾素水平從而影響病毒復(fù)制情況[23]。那么,Cbl蛋白抑制AIV早期復(fù)制的作用機(jī)制是否與其泛素化調(diào)節(jié)干擾素的功能機(jī)制相關(guān),還有待進(jìn)一步研究。
總之,本研究證實(shí)法氏囊源多肽同源蛋白Cbl的重組蛋白能夠在人源細(xì)胞模型中抑制H9N2亞型AIV的早期復(fù)制,為深入研究Cbl蛋白抗病毒復(fù)制機(jī)制提供了重要的試驗(yàn)依據(jù),同時(shí)為開(kāi)展抗H9N2亞型AIV藥物提供了重要參考。