彭明玉,何慶玲,王文博,趙 聃,張 婧,王迎偉,邱 文
南京醫(yī)科大學(xué)免疫學(xué)系,江蘇 南京 211166
大鼠Thy?1 腎炎(Thy?1 nephritis,Thy?1N)是一種公認(rèn)的研究人類系膜增生性腎小球腎炎(mesan?gial proliferative glomerulonephritis,MsPGN)的動(dòng)物模型[1-2],給大鼠注射抗Thy?1抗原的抗體后,該抗體能與大鼠腎小球系膜細(xì)胞(glomerular mesangial cells,GMC)表面的Thy?1抗原結(jié)合,繼而激活補(bǔ)體,引起炎癥反應(yīng)和GMC 增生病變。已知補(bǔ)體作用靶細(xì)胞可分為全溶解型(lytic)和亞溶解型(sublytic),sublytic C5b?9 雖不能導(dǎo)致細(xì)胞溶破,但能促發(fā)多種生物學(xué)反應(yīng)[3]。本課題組以往研究證實(shí),Thy?1N 病變具有補(bǔ)體C5b?9 依賴性,尤其是sublytic C5b?9 依賴性。Thy?1N大鼠腎組織內(nèi)和體外受sublytic C5b?9刺激的大鼠GMC 中,多種炎癥因子如白介素(inter?leukein,IL)?6、IL?23和IL?36a表達(dá)顯著上調(diào),且參與腎組織炎性病變[4-9]。但是,其他炎癥因子或介質(zhì)在Thy?1N發(fā)病過程中發(fā)揮何種作用目前尚不知曉。
本課題組前期實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),Thy?1N大鼠腎組織中和體外受sublytic C5b?9刺激的大鼠GMC中,炎癥介質(zhì)S100A8 的mRNA 和蛋白表達(dá)均顯著上調(diào)。S100蛋白家族是僅存在于脊椎動(dòng)物中的低分子量蛋白[10],于1965年由Moore 等[11]在牛腦中首次發(fā)現(xiàn),因其可100%溶于飽和硫酸銨而得名。S100 蛋白家族共計(jì)20 余個(gè)成員,包括S100A1?A18、S100B、S100P等[12-13],且具有組織和細(xì)胞特異性以及結(jié)合Ca2+的能力[12]。在損傷或應(yīng)激等因素的作用下,S100蛋白被釋放到細(xì)胞外,促發(fā)組織炎癥反應(yīng)[13]。已發(fā)現(xiàn),S100 在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)、炎癥性腸?。╥nflammatory bowel disease,IBD)和狼瘡腎炎(lupus nephritis,LN)等免疫性疾病中發(fā)揮了重要的促炎作用[14]。另有研究報(bào)道,在心肌梗死后發(fā)生的炎癥中,梗死灶中的中性粒細(xì)胞釋放的S100A8可與TLR?4結(jié)合,促進(jìn)NLRP3炎癥小體釋放IL?1β,后者可增強(qiáng)骨髓中粒細(xì)胞的分化,進(jìn)而加重炎癥反應(yīng)[15]。
為了研究Thy?1N 大鼠GMC 中S100A8 基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,本課題組前期又篩查了Thy?1N大鼠腎組織內(nèi)和體外受sublytic C5b?9 刺激的大鼠GMC中上調(diào)的轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)性別決定區(qū)Y框蛋白7(SRY?related HMG?box gene 7,SOX7)的mRNA 和蛋白表達(dá)均顯著上升(資料未發(fā)表)。SOX7是一種含有高遷移率族框結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,可與啟動(dòng)子區(qū)DNA序列結(jié)合啟動(dòng)靶基因轉(zhuǎn)錄,發(fā)揮相應(yīng)的生物學(xué)功能。目前發(fā)現(xiàn)的SOX 家族根據(jù)HMG 結(jié)構(gòu)的氨基酸序列分為A、B1、B2、C、D、E、F、G 和H 亞群,共20余個(gè)成員,其中SOX7屬于F亞群[16-17]。有文獻(xiàn)報(bào)道,SOX7 作為抑癌基因可通過Wnt/β?catenin 信號(hào)通路抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖[16]。此外,SOX7 還可通過Notch信號(hào)通路促進(jìn)血管生成[18]。本課題組前期實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在大鼠GMC 中過表達(dá)SOX7 可上調(diào)S100A8基因的表達(dá)(資料未發(fā)表),另生物信息學(xué)軟件預(yù)測提示大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子區(qū)含有SOX7的結(jié)合元件,但是上調(diào)的SOX7 能否直接促進(jìn)S100A8 基因的轉(zhuǎn)錄,目前尚不清楚,故本實(shí)驗(yàn)擬對(duì)此問題展開研究。首先構(gòu)建大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子全長和截短質(zhì)粒,與大鼠S100A8過表達(dá)質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染HEK?293T 工具細(xì)胞,觀察SOX7 對(duì)S100A8 基因啟動(dòng)子活性的影響,同時(shí)篩選SOX7 與S100A8 基因可能的結(jié)合元件,并對(duì)上述SOX7 結(jié)合元件進(jìn)行突變分析,擬為進(jìn)一步研究Thy?1N 大鼠GMC 中SOX7促進(jìn)S100A8基因啟動(dòng)和轉(zhuǎn)錄的機(jī)制提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
人胚腎293T(HEK?293T)細(xì)胞購自美國模式培養(yǎng)物集存庫(American Type Culture Collection,ATCC)。pGL3?basic 和pRL?SV40 熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒以及雙熒光素酶報(bào)告基因檢測試劑盒(Promega 公司,美國);基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化技術(shù)有限);SanPrep 柱式PCR 產(chǎn)物純化試劑盒(上海生工生物工程股份有限公司);高保真酶PrimeSTAR@Max DNA Polymerase、限制性內(nèi)切酶KpnⅠ、SmaⅠ和T4 DNA連接酶(TaKaRa公司,日本)。
1.2.1 引物設(shè)計(jì)
登錄NCBI,通過Gene 數(shù)據(jù)庫中搜索大鼠S100A8 基因(ID:116547),利用Primer 5.0 軟件輔助設(shè)計(jì)針對(duì)S100A8基因啟動(dòng)子區(qū)(-2 068~+174 nt)的引物,上游:5′?GGGGTACCATCCTAGCAGATGT?GAGATGG?3′;下游:5′?TCCCCCGGGGCTACTC?TATTCCCCCAACTC?3′,并在上下游引物序列前加入KpnⅠ、SmaⅠ酶切位點(diǎn)序列,后交由滁州通用生物系統(tǒng)有限公司制備。
1.2.2 大鼠S100A8基因啟動(dòng)子全長序列的擴(kuò)增
以大鼠基因組DNA 為模板,用PrimeSTAR@Max DNA Polymerase 進(jìn)行PCR 反應(yīng),反應(yīng)體系:PrimeSTAR Max Premix(2×)25 μL,上、下游引物各2 μL,基因組DNA 2 μL,滅菌雙蒸水19 μL;反應(yīng)程序:98 ℃變性10 s;60 ℃退火15 s,72 ℃延伸2 min,循環(huán)30 次;擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)SanPrep 柱式PCR 產(chǎn)物純化試劑盒回收。
1.2.3 大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子全長熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定
將pGL3?basic 質(zhì)粒與S100A8 基因啟動(dòng)子PCR產(chǎn)物與限制性內(nèi)切酶KpnⅠ和SmaⅠ37 ℃水浴2 h,利用SanPrep柱式PCR產(chǎn)物純化試劑盒分別回收線性化的pGL3?basic質(zhì)粒和S100A8啟動(dòng)子PCR產(chǎn)物,再通過T4 DNA連接酶進(jìn)行連接反應(yīng)(16 ℃,8~12 h),并將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌DH5α,將其均勻涂布于含Amp 抗性的LB 平板瓊脂表面,于37 ℃中培養(yǎng)12 h 后,挑取5 個(gè)單克隆菌落于3 mL 含有Amp 抗性的液體LB 培養(yǎng)基中,37 ℃震蕩培養(yǎng)12 h。取1 μL 培養(yǎng)后的菌液作為模板DNA 進(jìn)行PCR 鑒定,篩選出的陽性克隆送通用生物系統(tǒng)(安徽)有限公司測序鑒定,將構(gòu)建成功的質(zhì)粒命名為pGL3?S100A8?FL。
1.2.4 大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子截短和突變質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定
利用JASPAR 軟件預(yù)測S100A8 基因啟動(dòng)子區(qū)SOX7 的結(jié)合元件,并根據(jù)預(yù)測結(jié)果通過通用生物系統(tǒng)(安徽)有限公司構(gòu)建4 個(gè)S100A8 基因啟動(dòng)子截短質(zhì)粒。后由該公司將S100A8基因啟動(dòng)子-86~-57 nt 區(qū)SOX7 結(jié)合元件5′?GAAATGCTCAATGT?GCTCAGTGATTGCCAC?3′突變?yōu)?′?GGGCGCGC?GCGCTATAGGGCGCGCGCGCCC?3′,突變質(zhì)粒命名為pGL3?S100A8?M。
1.2.5 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HEK?293T細(xì)胞
將HEK?293T細(xì)胞接種于24孔板中(1×105個(gè)/孔),培養(yǎng)24 h 后,用Lipofectamine 2000 將pIRES2?SOX7、pRL?SV40分別與S100A8基因啟動(dòng)子全長質(zhì)粒及各截短質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HEK?293T細(xì)胞。
1.2.6 熒光素酶活性的測定
待上述質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染HEK?293T 細(xì)胞48 h 后,用雙熒光素酶報(bào)告基因檢測試劑盒中PLB 裂解液稀釋后裂解細(xì)胞,收集細(xì)胞裂解產(chǎn)物,分別檢測S100A8 基因啟動(dòng)子質(zhì)粒及內(nèi)參照質(zhì)粒(pRL?SV40)的熒光活性,其中,目的基因的螢火蟲熒光素酶活性(M1)/pRL?SV40 質(zhì)粒的海腎熒光素酶活性(M2),即為被檢測質(zhì)粒的相對(duì)熒光素酶活性(RLU)。
所得定量數(shù)據(jù)均以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)誤()表示。采用SPSS 19.0 軟件對(duì)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析和Bonfferoni法兩兩比較,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
PCR 擴(kuò)增大鼠S100A8 全長啟動(dòng)子(-2 068~+174 nt)后,經(jīng)雙酶切插入pGL3?basic 質(zhì)粒中,將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后均勻涂布于含Amp抗性的固體LB平板瓊脂表面,經(jīng)菌液PCR 篩選出陽性克隆菌落,再送公司測序驗(yàn)證,測序結(jié)果顯示質(zhì)粒構(gòu)建成功,命名為pGL3?S100A8?FL(圖1)。
圖1 瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果Figure 1 Agarose gel electrophoresis results
將pIRES2?EGFP、pIRES2?SOX7、pRL?SV40 和pGL3?S100A8?FL 不同分組共轉(zhuǎn)染HEK?293T 細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后48 h 檢查GFP 表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)GFP 顯著表達(dá),其轉(zhuǎn)染效率約為80%(圖2)。隨后裂解細(xì)胞并進(jìn)行熒光素酶報(bào)告基因檢測,結(jié)果顯示,pGL3?S100A8?FL、pIRES2?SOX7 與pRL?SV40 共轉(zhuǎn)染組其RLU值顯著高于pGL3?S100A8?FL、pIRES2?EGFP與pRL?SV40 共轉(zhuǎn)染組,提示SOX7 過表達(dá)能夠明顯上調(diào)S100A8基因的啟動(dòng)子活性。
2.3.1 大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子各截短質(zhì)粒位置的確定
應(yīng)用生物信息學(xué)軟件JASPAR 對(duì)S100A8 基因啟動(dòng)子全長序列中SOX7 的結(jié)合元件進(jìn)行預(yù)測(表1)。參考其各結(jié)合元件的位置,設(shè)計(jì)相應(yīng)的截短質(zhì)粒(表2)。
2.3.2 大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子各截短質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定
基于pGL3?S100A8?FL 質(zhì)粒,由通用生物系統(tǒng)(安徽)有限公司構(gòu)建上述4 個(gè)截短質(zhì)粒,即pGL3?S100A8?1、pGL3?S100A8?2、pGL3?S100A8?3和pGL3?S100A8?4,測序結(jié)果顯示pGL3?S100A8?1~4 截短質(zhì)粒構(gòu)建正確。
2.3.3 SOX7過表達(dá)對(duì)大鼠S100A8基因啟動(dòng)子各截短質(zhì)?;钚缘挠绊?/p>
將pGL3?basic、pGL3?S100A8?FL 和pGL3?S100A8 各截短質(zhì)粒分別與pIRES2?SOX7 和pRL?SV40共轉(zhuǎn)染HEK?293T細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后48 h裂解細(xì)胞并測定其熒光素酶活性,轉(zhuǎn)染pGL3?S100A8?4 細(xì)胞的RLU 值較pGL3?S100A8?FL 和pGL3?S100A8?1~3 轉(zhuǎn)染組相比顯著降低(圖3)。提示S100A8基因啟動(dòng)子區(qū)的SOX7結(jié)合元件可能位于-200~+51 nt區(qū)域。
2.3.4 SOX7過表達(dá)對(duì)大鼠S100A8基因啟動(dòng)子突變質(zhì)?;钚缘挠绊?/p>
為了進(jìn)一步確定SOX7在S100A8啟動(dòng)子-200~+51 nt區(qū)內(nèi)的結(jié)合元件,根據(jù)JASPAR結(jié)合元件預(yù)測結(jié)果,又開展了啟動(dòng)子突變實(shí)驗(yàn),構(gòu)建了S100A8 啟動(dòng)子-86~-57 nt 區(qū)突變的熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒,即將5′?GAAATGCTCAATGTGCTCAGTGATTGCCAC?3′突變?yōu)?′?GGGCGCGCGCGCTATAGGGCGCGCGC?GCCC?3′,并將其命名為pGL3?S100A8?FL?M。將pGL3?basic、pGL3?S100A8?FL和pGL3?S100A8?M分別與pIRES2?SOX7質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染HEK?293T細(xì)胞,于轉(zhuǎn)染48 h裂解細(xì)胞并檢測各組熒光素酶活性。結(jié)果顯示,S100A8基因全長啟動(dòng)子-86~-57 nt突變后其熒光素酶活性顯著降低,初步確定轉(zhuǎn)錄因子SOX7可通過與-86~-57 nt區(qū)結(jié)合并上調(diào)S100A8的啟動(dòng)子活性(圖4)。
圖2 HEK?293T細(xì)胞中質(zhì)粒共轉(zhuǎn)效率的評(píng)估以及SOX7過表達(dá)對(duì)大鼠S100A8基因啟動(dòng)子全長熒光素酶活性的影響Figure 2 Transfection efficiency of plasmids in HEK?293T cells and the effect of SOX7 overexpres?sion on rat S100A8 gene full?length promoter activity
表1 JASPAR 預(yù)測的大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子區(qū)SOX7 結(jié)合元件Table 1 SOX7 binding elements within rat S100A8 gene promoter predicted by JASPAR
表2 S100A8截短質(zhì)粒位置Table 2 location of different S100A8 truncated luciferase reporter plasmids
圖3 HEK?293T 細(xì)胞中SOX7 對(duì)S100A8 各截短質(zhì)粒熒光素酶活性的影響Figure 3 The effect of SOX7 on the activity of different truncated rat S100A8 promoter in HEK?293T cells
本課題組前期研究證實(shí),大鼠Thy?1N發(fā)病過程中炎癥介質(zhì)S100A8 和轉(zhuǎn)錄因子SOX7 的表達(dá)均顯著上調(diào),且體外用sublytic C5b?9刺激大鼠GMC后亦可明顯增強(qiáng)S100A8 和SOX7 的表達(dá)。此外,在大鼠GMC中過表達(dá)SOX7可顯著上調(diào)S100A8的表達(dá),另生物信息學(xué)軟件預(yù)測提示,S100A8基因啟動(dòng)子區(qū)包含多個(gè)SOX7 結(jié)合元件。因此推測,sublytic C5b?9刺激大鼠GMC 后可通過上調(diào)SOX7 促進(jìn)S100A8 基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),進(jìn)而加重Thy?1N的炎性病變。
為了研究大鼠SOX7 對(duì)S100A8 基因啟動(dòng)的影響,本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了大鼠S100A8基因啟動(dòng)子全長熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒(pGL3?S100A8?FL),將pGL3?S100A8?FL質(zhì)粒與我們前期構(gòu)建的pIRES2?SOX7質(zhì)粒行不同分組共轉(zhuǎn)染HEK?293T細(xì)胞,轉(zhuǎn)染48 h裂解細(xì)胞并測定其熒光素酶活性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),pGL3?S100A8?FL和pIRES2?SOX7共轉(zhuǎn)染組其熒光素酶活性顯著高于其他組,提示過表達(dá)大鼠SOX7能夠增強(qiáng)HEK?293T細(xì)胞中大鼠S100A8基因的啟動(dòng)子活性,這一發(fā)現(xiàn)與本課題前期GMC 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的結(jié)果一致,即轉(zhuǎn)錄因子SOX7能夠促進(jìn)大鼠GMC中S100A8基因的表達(dá)。
圖4 HEK?293T 細(xì)胞中SOX7 對(duì)S100A8 全長和突變啟動(dòng)子質(zhì)粒熒光素酶活性的影響Figure 4 The effect of SOX7 on the activity of full length and mutant of rat S100A8 promoter in HEK?293T cells
為了進(jìn)一步確定大鼠SOX7 與S100A8 基因啟動(dòng)子的結(jié)合部位,通過JASPAR 軟件預(yù)測發(fā)現(xiàn)大鼠S100A8 基因啟動(dòng)子區(qū)可能存在5 個(gè)SOX7 結(jié)合元件,并據(jù)此構(gòu)建了4個(gè)大鼠S100A8基因啟動(dòng)子截短熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒,即pGL3?S100A8?1~4。之后將pGL3?S100A8?FL 或pGL3?S100A8?1~4 分別與pIRES2?SOX7 和pRL?SV40 共轉(zhuǎn)染HEK?293T 細(xì)胞,于48 h裂解細(xì)胞檢測各組RLU值,結(jié)果表明,pGL3?S100A8?4 熒光素酶活性顯著低于pGL3?S100A8?FL和pGL3?S100A8?1~3,提示SOX7 與S100A8基因啟動(dòng)子的結(jié)合元件可能位于啟動(dòng)子-200~+51 nt 之間。而根據(jù)JASPAR軟件預(yù)測結(jié)果,-200~+51 nt 區(qū)域含有1 個(gè)SOX7 結(jié)合元件(-86~-57 nt,5′?GAAATGCT?CAATGTGCTCAGTGATTGCCA C?3′),隨后,將該結(jié)合元件進(jìn)行序列突變,構(gòu)建S100A8啟動(dòng)子全長突變質(zhì)粒即pGL3?S100A8?M,并將pGL3?S100A8?FL 和pGL3?S100A8?M 分別與pIRES2?SOX7 和pRL?SV40共轉(zhuǎn)染HEK?293T 細(xì)胞,于48 h 裂解細(xì)胞檢測各組熒光素酶活性。結(jié)果發(fā)現(xiàn)與pGL3?S100A8?FL相比,pGL3?S100A8?M 組熒光素酶活性顯著降低,提示S100A8基因啟動(dòng)子-86~-57 nt區(qū)可能是SOX7結(jié)合元件。不過有關(guān)SOX7 能否與該啟動(dòng)子區(qū)直接結(jié)合,仍需要通過染色質(zhì)免疫沉淀(chromatin immuno?precipitation,ChIP)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步確證。
綜上所述,本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建了大鼠S100A8基因啟動(dòng)子全長熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒,并在HEK?293T 細(xì)胞中證實(shí)過表達(dá)SOX7 可增強(qiáng)S100A8 基因的啟動(dòng)子活性。此外,用生物信息學(xué)軟件預(yù)測SOX7 結(jié)合元件的分布,據(jù)此設(shè)計(jì)并構(gòu)建了4個(gè)S100A8基因啟動(dòng)子截短熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒,在HEK?293T 細(xì)胞中過表達(dá)SOX7 探討其對(duì)S100A8 基因啟動(dòng)子不同截短活性的影響,初步篩選出大鼠S100A8基因啟動(dòng)子區(qū)可能的SOX7 結(jié)合元件(-86~-57 nt)。接著對(duì)上述結(jié)合元件序列進(jìn)行突變,并在HEK?293T 細(xì)胞中檢查過表達(dá)SOX7 對(duì)S100A8 基因啟動(dòng)子突變質(zhì)粒啟動(dòng)的影響,進(jìn)一步確證了上述SOX7 結(jié)合元件的有效性。本研究結(jié)果為今后進(jìn)一步探究sublytic C5b?9刺激大鼠GMC后通過上調(diào)SOX7促進(jìn)S100A8基因的轉(zhuǎn)錄及其機(jī)制提供了必要的啟動(dòng)子質(zhì)粒和有用的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。