何志昂 梁彩嬌 姜維
深圳市達(dá)科為生物工程有限公司 廣東 深圳 518000
聚丙烯酰胺凝膠電泳簡稱為PAGE(Polyacrylamide gel electrophoresis),是以聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì)的一種常用電泳技術(shù)。聚丙烯酰胺凝膠由單體丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺聚合而成,聚合過程由自由基催化完成。催化聚合的常用方法為化學(xué)聚合法?;瘜W(xué)聚合以過硫酸銨(APS)為催化劑,以四甲基乙二胺(TEMED)為加速劑。在聚合過程中,TEMED催化過硫酸銨產(chǎn)生自由基,后者引發(fā)丙烯酰胺單體聚合,同時(shí)甲叉雙丙烯酰胺與丙烯酰胺鏈間產(chǎn)生甲叉鍵交聯(lián),從而形成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。
PAGE根據(jù)其有無濃縮效應(yīng),分為連續(xù)系統(tǒng)和不連續(xù)系統(tǒng)兩大類,連續(xù)系統(tǒng)電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場作用下,主要靠電荷和分子篩效應(yīng)。不連續(xù)系統(tǒng)中由于緩沖液離子成分,pH,凝膠濃度及電位梯度的不連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動(dòng)不僅有電荷效應(yīng),分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng),因而其分離條帶清晰度及分辨率均較前者佳。不連續(xù)體系由電極緩沖液、濃縮膠及分離膠所組成。濃縮膠是由AP催化聚合而成的大孔膠,分離膠是由AP催化聚合而成的小孔膠。
研發(fā)一款蛋白電泳彩色凝膠試劑盒(BioSci? NewFlash Protein AnyKD Color PAGE Kit),需要滿足低丙烯酰胺產(chǎn)品,該產(chǎn)品使用了最新的凝膠技術(shù)降低丙烯酰胺濃度,提高凝膠速度。該凝膠試劑盒操作簡便,配膠快速安全,無TEMED試劑,無特殊氣味,且提供彩色染料染色濃縮膠.彩色上層膠,易于上樣。蛋白膠凝固快,25 min即可完成整個(gè)制膠過程。可以高電壓快速電泳,300 V恒壓25 min左右即可完成電泳,也可進(jìn)行常壓電泳。適用于(10 ~ 250) kDa蛋白的分離鑒定,無須根據(jù)蛋白大小調(diào)整分離膠濃度。
彩色蛋白膠分別與無色蛋白膠進(jìn)行蛋白電泳測試
蛋白mark(Dakewe Cat.No.8011021,8011031),NK細(xì)胞總蛋白(Dakewe 提?。?,電泳緩沖液(Dakewe Cat.No.8015021),蛋白上樣緩沖液(Dakewe Cat.No.8015011),蛋白染色液(Dakewe Cat.No.8019011),蛋白電泳儀(北京六一儀器 DYY-2C)。
1.3.1 實(shí)驗(yàn)分組。實(shí)驗(yàn)設(shè)置5個(gè)組,分別為實(shí)驗(yàn)組1(紅色凝膠),實(shí)驗(yàn)組2(黃色凝膠),實(shí)驗(yàn)組3(綠色凝膠),實(shí)驗(yàn)組4(紫色凝膠),對照組(無色凝膠)。加入等量的Mark與總蛋白樣品,蛋白染色脫色相同時(shí)間。
1.3.2 制膠。分離膠A液和B液1∶1混勻,配膠可以使用15mL或50mL離心管配制。濃縮膠A液和B液1∶1混勻,然后加入濃縮膠體積0.4%~0.7%的濃縮膠染液(建議3mL濃縮膠加30ul濃縮膠染液,加入對應(yīng)顏色染料于濃縮膠的即為對應(yīng)的實(shí)驗(yàn)組不加染料的即為對照組)。
向上述分離膠溶液中加入10% APS溶液(5mL加50μL),混勻后灌入模具中,分離膠溶液加至距前玻璃板頂端1.5cm或距梳齒約0.5cm,迅速小心加入水、無水乙醇或異丙醇覆蓋分離膠。待分離膠凝固(3 ~ 10 min)后,倒掉覆蓋液,用去離子水沖洗分離膠頂部數(shù)次以去除未聚合凝膠,排除頂部液體、用濾紙吸走殘留的去離子水。在上述濃縮膠溶液中加入10% APS溶液(2mL加20μL的10% APS溶液),混勻后灌入分離膠,將梳子插入凝膠內(nèi),靜置15~20 min,等待凝膠聚合。
1.3.3 上樣電泳。凝膠聚合后拔出梳子、上樣。Marker使用BioSci? ColorBand Prestained Protein Marker(Cat.No.8011011& 8011021 & 8011031),上樣緩沖液使用BioSci? SuperDrop SDS-PAGE Protein Loading Buffer 5×(Cat.No.8015011)。各組上樣相同量蛋白Mrak與總蛋白,在電泳緩沖液中實(shí)現(xiàn)快速電泳,電壓最高設(shè)置為300V,25min左右完成電泳,電流最大不要超過140mA,如果電流過大產(chǎn)熱多,可降低電壓。電泳緩沖液使用BioSci? Tris Glycine SDS Running Buffer (10×)(Cat.No.8015021)。
1.3.4 蛋白染色洗脫。電泳后,各組的蛋白凝膠放置在干凈的容器中,加入300~400mL純水搖晃清洗5分鐘,重復(fù)3次。棄去純水,加入適當(dāng)體積(覆蓋凝膠為宜)的SpectBlue染色液(Cat.No.8019011)。置于搖床上染色15~30min。染色結(jié)束后,棄去染色液,加入純水洗滌去除殘留染色液,即可觀察結(jié)果。加入200mL純水進(jìn)行脫色,可每隔20min更換純水進(jìn)行漂洗,重復(fù)3~4次即可得到極低背景的凝膠[1]。
1.3.5 觀察拍照。觀察各組蛋白凝膠的條帶清晰度,染料是否遷移等,并拍照記錄結(jié)果。
圖1中abcde分別為紅、黃、綠、紫、無色蛋白凝膠制膠后的圖片,可以看出有色濃縮膠顏色鮮艷,濃縮膠與分離膠界限清晰,無色蛋白凝膠的濃縮膠與分離膠無明顯界限。
圖1 各組電泳上樣前結(jié)果圖
圖2中abcde分別為紅、黃、綠、紫、無色蛋白凝膠上樣中的圖片,可以看出有色濃縮膠顏色鮮艷,濃縮膠的梳孔在電泳緩沖液中清晰可見上樣非常方便,無色蛋白凝膠的梳孔濃縮膠在電泳緩沖液中非常模糊難以分辨。
圖2 各組電泳上樣中結(jié)果圖
圖3中abcde分別為紅、黃、綠、紫、無色蛋白凝膠電泳中的圖片,可以看出有色濃縮膠顏色鮮艷未褪色也為發(fā)生遷移擴(kuò)散,電泳條帶與無色蛋白凝膠無差別。
圖3 各組電泳中的結(jié)果圖
圖4中abcde分別為紅、黃、綠、紫、無色蛋白凝膠電泳中的圖片,可以看出有色濃縮膠顏色鮮艷未褪色也為發(fā)生遷移擴(kuò)散,電泳條帶與無色蛋白凝膠無差別[2]。
圖4 各組電泳染色后的結(jié)果圖
市面上的SDS-PAGE蛋白凝膠常用的濃縮膠是無色透明,在無色的電泳緩沖液中,很難看清蛋白上樣梳孔,我們研發(fā)的彩色SDS-PAGE蛋白凝膠,濃縮膠可以選擇紅、黃、綠、紫四種顏色。在無色的電泳緩沖液中,可以清晰看清蛋白上樣梳孔,極大地提高了上樣的辨識性,減少了蛋白上樣的錯(cuò)誤率。此外所用的濃縮膠彩色染料是惰性染料,長期保存也不會發(fā)生顏色改變。染料鮮艷且可以非常均勻的染色濃縮膠,在電泳的過程中染料顏色沒有發(fā)生遷移也沒有顏色變淡,也沒有與Mark或蛋白結(jié)合而影響其電泳遷移。濃縮膠染料可以清晰地分界濃縮膠與分離膠方便做蛋白Westen時(shí)準(zhǔn)確的分離切除濃縮膠。也可以根據(jù)不同的樣品選擇不同的顏色的蛋白凝膠,從顏色上更加方便的區(qū)分不同樣本的電泳的結(jié)果。