華 燁, 劉 鵬, 王永紅
(華東理工大學(xué)生物反應(yīng)器工程國家重點實驗室,上海 200237)
凝結(jié)芽孢桿菌(Bacillus coagulans)是一種兼性厭氧革蘭氏陽性菌,具有耐高溫、耐酸、穩(wěn)定性好、抗逆性強等優(yōu)點[1],在工業(yè)發(fā)酵中主要用來生產(chǎn)L-乳酸。相比于其他生產(chǎn)菌株,凝結(jié)芽孢桿菌的發(fā)酵溫度更高,不易染菌,且發(fā)酵工藝較簡單[2],并可以利用一些廉價碳源作為底物原料。但目前在以玉米粉/淀粉水解液為底物的凝結(jié)芽孢桿菌生產(chǎn)乳酸的工業(yè)發(fā)酵過程中,發(fā)酵結(jié)束時會有較高濃度的殘?zhí)荹3],這會使得糖酸轉(zhuǎn)化率下降,并導(dǎo)致乳酸分離純化過程費用增加、產(chǎn)品質(zhì)量下降以及貨架期縮短。在乳酸發(fā)酵液殘?zhí)侵?,異麥芽糖質(zhì)量占?xì)執(zhí)强傎|(zhì)量的60%左右,而寡聚-1,6-葡糖苷酶(oligo-1,6-glucosidase,EC 3.2.1.10)對于異麥芽糖有較高的利用活性。
寡聚-1,6-葡糖苷酶也稱異麥芽糖酶或糊精6-α-D-葡萄糖水解酶[4-5],是一種外切酶,可以從多糖的非還原性端催化水解α-1,6-糖苷鍵,如α-極限糊精、異麥芽糖、異麥芽糖酮糖、異麥芽三糖等,同時也能水解對硝基苯-α-D-葡萄糖苷(pNPG)生成葡萄糖苷和對硝基苯酚(pNP)[6]。不同細(xì)菌來源的寡聚-1,6-葡糖苷酶的酶學(xué)性質(zhì)有所差異,為了水解凝結(jié)芽孢桿菌乳酸發(fā)酵殘?zhí)且褐械漠慃溠刻?,要求酶具有較好的耐熱性和耐酸性。關(guān)于酶的熱穩(wěn)定性,Suzuki 等[4]和Watanabe 等[7]提出了脯氨酸法則,在氨基酸序列中脯氨酸含量的增加會使得每個區(qū)域結(jié)構(gòu)更加緊密穩(wěn)定以及疏水性更強,從而提高蛋白的熱穩(wěn)定性。研究人員將蛋白中的氨基酸殘基定點誘變?yōu)楦彼岷笤黾恿说鞍椎臒岱€(wěn)定性,在一定程度上支持了脯氨酸法則,如Matthews 等[8]將β-轉(zhuǎn)角的丙氨酸定點突變?yōu)楦彼岷筇岣吡耸删wT4 溶菌酶的熱穩(wěn)定性,但需要更多實驗依據(jù)來驗證脯氨酸的普適性。
基于前期研究工作并經(jīng)BRENDA 數(shù)據(jù)庫搜索挑選了5 個可能耐溫、耐酸的寡聚-1,6-葡糖苷酶基因,分別是凝結(jié)芽孢桿菌(Bacillus coagulans)ATCC 7050中的malL BF29_2011(BC1)和malL BF29_2004(BC2)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)168 中的 malL yvdL BSU34560(BS1)和yugT BSU31290(BS2)以及嗜熱葡萄糖苷地衣芽孢桿菌(Bacillus thermoglucosidasius)KP 1006 中的malL(KP)。其中Bacillus coagulansATCC 7050 適 合 的 生 長 溫 度 為37~50 ℃,BC1 和BC2 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)分別為4.32% 和4.80%;Bacillus subtilis168 適合生長溫度為37 ℃,BS1 和BS2 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)分別為4.10% 和4.33%,Bacillus thermoglucosidasiusKP 1006 適 合 生 長 溫 度 為55~60 ℃,KP 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)為5.69%??梢奒P 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)最高,BC1、BC2、BS1 和BS2 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)較為接近,其中BS1 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)最低。
寡聚-1,6-葡糖苷酶屬于α-淀粉酶GH13 家族,其結(jié)構(gòu)與其他α-淀粉酶結(jié)構(gòu)相似,其在CSR V 中的序列是QPDLN[9-10],是能夠區(qū)分GH13 家族中的寡聚-1,6-葡糖苷酶和普魯蘭酶的關(guān)鍵區(qū)域[11]。對比BC1、BC2、KP、BS1、BS2 在CSR V 以及CSR Ⅱ的氨基酸序列,BC2 在CSR V 的 序 列 是MPDLN,BC2 和BS2 在CSR Ⅱ的序列中也含有中介酶特異性殘基,可推斷BC2 以及BS2 基因所表達(dá)的酶是中介酶。
目前關(guān)于寡聚-1,6-葡萄糖苷酶的研究,主要是將來源于蠟樣芽胞桿菌、枯草芽孢桿菌等的寡聚-1,6-葡糖苷酶在大腸桿菌[12]、釀酒酵母畢赤酵母中[13]進(jìn)行異源表達(dá)。寡聚-1,6-葡糖苷酶在大腸桿菌中的表達(dá)水平較低,因此蛋白純化難度較高。隨著基因工程的發(fā)展,大腸桿菌pET 表達(dá)系統(tǒng)開始得到廣泛應(yīng)用,它是一種可以使用乳糖或乳糖類似物進(jìn)行誘導(dǎo)的高效表達(dá)系統(tǒng),同時可以為外源目的基因帶上純化標(biāo)簽進(jìn)行融合表達(dá),是一種強大有效、應(yīng)用極廣的克隆及表達(dá)重組蛋白的系統(tǒng)[14]。其中,pET-22b(+)是大腸桿菌在pET 表達(dá)系統(tǒng)中常用的一種高表達(dá)載體,且?guī)в蠺7 啟動子、His 親和標(biāo)簽以及多克隆位點,可以在宿主E. coliBL21(DE3)中高效表達(dá)不同來源的寡聚-1,6-葡糖苷酶,并滿足蛋白純化和酶活性研究的需求。
本文對不同來源的寡聚-1,6-葡糖苷酶進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)的特性比較研究,可為今后乳酸發(fā)酵用凝結(jié)芽孢桿菌的基因工程改造和高效菌株融合篩選奠定基礎(chǔ),并有效降低乳酸發(fā)酵后期的殘?zhí)菨舛取?/p>
Bacillus coagulansATCC 7050,E. coliBL21(DE3),E. coliDH5α:均由本實驗室保藏;Bacillus subtilis168:美國ATCC 細(xì)胞庫;Bacillus thermoglucosidasiusKP 1006:中國普通微生物菌種保藏管理中心;pET-22b(+):由本實驗室保藏;酵母膏、蛋白胨、瓊脂:生化試劑,上海凌峰化學(xué)試劑有限公司;異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG):生化試劑,上海碧云天有限公司;pNPG:w> 99%,西格瑪奧德里奇(上海)貿(mào)易有限公司;限制性內(nèi)切酶:寶日醫(yī)生物技術(shù)有限公司;細(xì)菌基因DNA 抽提試劑盒、AxyPrep DNA 凝膠回收試劑盒:愛思進(jìn)生物技術(shù)有限公司;One Step Cloning Kit:南京諾唯贊生物科技股份有限公司;PAGE 凝膠快速制備試劑盒(10%):上海雅酶生物醫(yī)藥科技有限公司;Ni-NTA 6FF 蛋白純化預(yù)裝柱(5 mL):上海翊圣生物科技有限公司。
高速冷凍離心機(德國Hermle 5 418):4 ℃離心;超聲破碎儀(美國Qsonica Q500):工作時間10 min,超聲3 s,暫停7 s,振幅34%;蛋白電泳槽(BIO-RAD Laboratories 165-800):濃縮膠操作電壓80 V,分離膠操作電壓120 V;核酸定量儀(Thermo Scientific ND2000/2000c):在280 nm 下檢測核酸濃度,在205 nm下檢測蛋白濃度;96 孔酶標(biāo)儀(Thermo Scientific Varioskan lux):在405 nm 下檢測對硝基苯酚的濃度。
1.3.1 培養(yǎng)基配制 LB(Luria-Bertani) 液體培養(yǎng)基(g/L)[15]:蛋白胨10,酵母膏5,氯化鈉10,pH 為7.0;LB 固體培養(yǎng)基:在液體培養(yǎng)基基礎(chǔ)上再添加18 g/L的瓊脂,用于E. coliDH5α、E. coliBL21(DE3)、Bacillussubtilis168、Bacillus thermoglucosidasiusKP 1006 的培養(yǎng)。將LB 培養(yǎng)基用鹽酸溶液調(diào)節(jié)pH 為5.0,用于Bacillus coagulansATCC 7050 的培養(yǎng)。
1.3.2 菌體培養(yǎng) 按照Bacillus coagulansATCC 7050 的培養(yǎng)溫度為50 ℃,Bacillus thermoglucosidasiusKP 1006 的培養(yǎng)溫度為55 ℃,Bacillus subtilis168、E. coliDH5α、E. coliBL21(DE3)的培養(yǎng)溫度為37 ℃進(jìn)行培養(yǎng)。首先將凍存于-80 ℃的細(xì)菌融化后,在無抗性LB 固體平板上劃線倒置培養(yǎng)12~14 h,挑取單菌落接種于4 mL液體LB 培養(yǎng)基中,220 r/min 條件下振蕩培養(yǎng)。
1.3.3 構(gòu)建不同來源寡聚-1,6-葡糖苷酶表達(dá)系統(tǒng)
(1)提取Bacillus coagulansATCC 7050、Bacillus subtilis168、Bacillus thermoglucosidasiusKP 1006 基因組。將3 株菌在LB 液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)至光密度(OD600)值達(dá)到1~2,再取2 mL菌液使用Takara 細(xì)菌基因組DNA 小量純化試劑盒提取基因組,具體操作按試劑盒內(nèi)說明書進(jìn)行。
(2)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR) 擴(kuò)增目的基因。分別以3 株菌的基因組為模板,利用PhantaTM高保真DNA 聚合酶擴(kuò)增出BC1、BC2、BS2、BS1 和KP 5 個基因(BC1(NedI)-F/BC1(HindIII)-R、BC2(NedI)-F/BC2(HindIII)-R、BS1(NedI)-F/BS1(HindIII)-R、BS2(NedI)-F/BS2(HindIII)-R、KP(NedI)-F/ KP(HindIII)-R),引物具體堿基序列見表1。PCR 擴(kuò)增條件:95 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃變性5 s,55 ℃退火10 s,72 ℃延伸1.5 min,進(jìn)行35 個循環(huán);72 ℃徹底延伸5 min。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù),下同)瓊脂凝膠電泳鑒定為目的基因后,使用Axygen 膠回收試劑盒進(jìn)行片段回收。
表1 不同來源寡聚-1,6-葡糖苷酶基因PCR 擴(kuò)增上下游引物設(shè)計Table 1 Primers of different oligo-1,6-glucosidase genes for PCR amplification
(3)構(gòu)建表達(dá)載體。將質(zhì)粒pET-22b(+)用NedI和HindIII 兩種限制性酶雙酶切,經(jīng)1%瓊脂凝膠電泳鑒定后,使用Axygen 膠回收試劑盒進(jìn)行片段回收,得到目的基因片段和載體酶切片段。使用ClonExpress?試劑盒進(jìn)行重組連接,挑取陽性轉(zhuǎn)化子送上海生工生物工程股份有限公司測序。
1.3.4 重組蛋白異源表達(dá)及制備樣品 采用熱激法將經(jīng)過測序驗證堿基序列正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到E. coliBL21(DE3)中獲得相應(yīng)重組菌。挑取單菌落于10 mL含50 μg/mL 氨芐的LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃、220 r/min振蕩培養(yǎng)12~14 h 至OD600達(dá)到4 左右時,按照2.5%的接種量接種至LB 液體培養(yǎng)基中,使得初始OD600為0.1,于37 ℃、220 r/min 條件下振蕩培養(yǎng)1.5 h 至OD600達(dá)到0.5~0.8,加入IPTG(終濃度為0.3 mmol/L),于20 ℃、220 r/min 條件下誘導(dǎo)表達(dá)重組蛋白。將菌液倒入預(yù)冷離心管中取樣,8 000g、4 ℃下離心收集菌體,用去離子水和1×PBS(磷酸鹽緩沖液)各清洗一次,最后用1×PBS 緩沖液重懸菌體,置于冰上進(jìn)行超聲破碎,至液體澄清透明則破碎完全。破碎后樣品于8 000g、4 ℃下離心15 min 后分別收集上清和沉淀,上清液為蛋白表達(dá)液,沉淀用1×PBS 緩沖液重懸,通過十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDSPAGE)檢測重組蛋白的表達(dá)情況。
1.3.5 重組蛋白分離純化 重組蛋白帶有His 親和標(biāo)簽,使用Ni-NTA 蛋白純化預(yù)裝柱進(jìn)行純化。低咪唑上樣,再用濃度為100、150、200、250 mmol/L 的咪唑依次梯度洗脫,確定最適濃度咪唑洗脫的方式進(jìn)行純化。純化蛋白超濾濃縮后經(jīng)SDS-PAGE 分析,并使用核酸定量儀在205 nm 處測定蛋白濃度。
1.3.6 寡聚-1,6-葡糖苷酶活性檢測 通過酶標(biāo)儀檢測pNPG 在寡聚-1,6-葡糖苷酶作用下水解生成的pNP 在405 nm下的吸光度來測定寡聚-1,6-葡糖苷酶的酶活。分為實驗組和對照組,每個反應(yīng)按200 μL體積加樣,并做3 個平行。實驗組先加入131.4 μL濃度為50 mmol/L 的pNPG 緩沖液,再加入11.5 μL蛋白溶液,在特定溫度下孵育一定時間后加入57.1 μL濃度為0.3 mol/L 的Na2CO3溶液終止反應(yīng),測定405 nm處的吸光度。對照組則加入高溫滅活后的蛋白溶液。一個酶活單位(1U)定義為在最適條件下,1 min內(nèi)水解產(chǎn)生1 mmol pNP 的酶量。
1.3.7 不同來源寡聚-1,6-葡糖苷酶酶學(xué)特性
(1)最適pH 及pH 穩(wěn)定性。將不同來源寡聚-1,6-葡糖苷酶分別置于不同pH 和緩沖液(pH 4.0~6.0,100 mmol/L CH3COOH-CH3COONa 緩沖液;pH 6.0~8.0,100 mmol/L Na2HPO4-NaH2PO4緩 沖 液;pH 7.0~9.0, 50 mmol/L Tris-HCl 緩 沖 液) 配 制的pNPG 溶液中檢測酶活,并分別置于各自最適pH 的緩沖液中,4 ℃靜置,在3、6、9、12、15 h 取樣檢測殘余酶活。
(2)最適溫度及熱穩(wěn)定性。在各自最適pH 下,測定不同來源寡聚-1,6-葡糖苷酶在30~64 ℃的活性。在最適條件下孵育一定時間后,測定在最適條件下的殘余酶活。
(3)離子對酶活影響。參考培養(yǎng)基常用添加成分選取測試離子,檢測Ni+、Zn2+、Cu2+、Co2+、Ca2+、Mg2+、K+、 N H+4對于酶活的影響,分別在緩沖體系中添加NiSO4、ZnSO4、CuSO4、CoCl2、CaCl2、MgSO4、KCl、(NH4)2SO4溶液(終濃度為5 mmol/L),以不添加金屬離子的體系作為參照,在最適條件下測定酶活。
(4)測定酶動力學(xué)參數(shù)。在各自最適條件下,測定酶在不同濃度(0.46、0.92、1.84、2.76、3.68、4.60 mmol/L)pNPG 底物下產(chǎn)生pNP 的速率,利用Microsoft Excel 2016 基于Michaelis-Menten 公式進(jìn)行非線性規(guī)劃求解,得到動力學(xué)參數(shù)Vmax和Km,轉(zhuǎn)換數(shù)Kcat根據(jù)公式Kcat=Vmax/[E]求解(其中[E]為酶的濃度),催化效率根據(jù)Kcat/Km計算獲得[16]。
(5)分析底物特異性。參考乳酸發(fā)酵液中的殘?zhí)浅煞诌x取測試對象。用緩沖液配制質(zhì)量濃度均為2 g/L 的麥芽糖、異麥芽糖、蔗糖、乳糖、海藻糖以及可溶性直鏈淀粉的底物溶液,通過檢測水解產(chǎn)物葡萄糖的濃度來分析不同來源寡聚-1,6-葡糖苷酶的底物特異性。
以各細(xì)菌的基因組為模板,根據(jù)基因組序列分別設(shè)計相應(yīng)的引物擴(kuò)增目的基因。BC1、BC2 擴(kuò)增長度為1 665 bp 和1 689 bp,KP 擴(kuò)增長度為1 686 bp,BS1、BS2 擴(kuò)增長度為1 683 bp 和1 662 bp。質(zhì)粒pET-22b(+)經(jīng)NedI 和HindIII 限制性內(nèi)切酶雙酶切后得到線性片段,片段長度為5 382 bp。各片段的1%瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果如圖1 所示,可見長度符合預(yù)期。
圖1 BC1、BC2、KP、BS1、BS2 基因PCR(a)和pET-22b(+)雙酶切(b)結(jié)果Fig. 1 Results of PCR amplification of the BC1, BC2, KP, BS1 and BS2 gene (a) and double enzyme digestion of pET-22b(+) (b)
線性化質(zhì)粒載體和擴(kuò)增目的基因片段經(jīng)一步克隆酶連接后轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α 中,并涂布于含有氨芐(50 μg/mL)的抗性平板上。挑取轉(zhuǎn)化子菌斑,用pET-22b(+)質(zhì)粒上選擇的克隆位點上下游引物YZF/YZ-R(序列見表1)進(jìn)行菌落PCR 驗證陽性轉(zhuǎn)化子。陽性轉(zhuǎn)化子進(jìn)行進(jìn)一步的測序驗證,若測序序列與插入目的基因序列一致則表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
圖2 所示為5 種寡聚-1, 6-葡糖苷酶表達(dá)情況及純化結(jié)果。由圖2(f)可見,E. coliBL21(DE3)和含空載質(zhì)粒pET-22b(+) 的菌表達(dá)的蛋白大致相同,在IPTG 誘導(dǎo)前后總蛋白沒有差異,且在66.2 kDa 大小附近沒有明顯條帶,說明宿主菌本身和含有空載質(zhì)粒的菌株不表達(dá)重組蛋白。
將構(gòu)建好的pET-BC1、pET-BC2、pET-KP、pETBS1 和pET-BS2 分別轉(zhuǎn)入到E. coliBL21(DE3) 中獲得各個轉(zhuǎn)化菌株,并進(jìn)行IPTG 誘導(dǎo)表達(dá)。各重組菌在IPTG 誘導(dǎo)前和誘導(dǎo)后取樣,菌體經(jīng)超聲破碎后獲得總蛋白液,離心后獲得上清液和沉淀,進(jìn)行SDSPAGE 蛋白凝膠電泳分析。
比較對照組和各重組菌,以及各重組菌IPTG 誘導(dǎo)前的菌體總蛋白(圖2(a)~2(e) Lane 1)和誘導(dǎo)后的總蛋白(圖2(a)~2(e) Lane 2),各重組菌誘導(dǎo)后的總蛋白中含有目的重組蛋白(BC1:66.2 kDa;BC2:
圖2 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶表達(dá)及純化Fig. 2 Expression and purification of five oligo-1,6-glucosidases
66.6 kDa;KP:67.7 kDa;BS1:67.3 kDa;BS2:65.3 kDa),說明誘導(dǎo)表達(dá)成功,且在沉淀和上清液中都存在目的重組蛋白。上清液流經(jīng)鎳柱后,目的重組蛋白親和吸附于鎳柱上,依次用含100、150、200、250 mmol/L咪唑的洗脫液進(jìn)行洗脫,在含100 mmol/L 咪唑的洗脫液中有較多雜蛋白(圖2(a)~2(e) Lane 5),在含150 mmol/L 咪唑的洗脫液中得到單一的純化蛋白(見圖2(a)~2(e) Lane 6),將用含150 mmol/L 咪唑的洗脫液洗脫并超濾濃縮得到的目的重組蛋白進(jìn)行酶學(xué)特性檢測。
2.3.1 最適pH 及pH 穩(wěn)定性 在pH 4.0~9.0 范圍內(nèi),5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶的pH-相對酶活曲線如圖3 所示。當(dāng)pH=4.0 時,5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶的相對酶活都在20%~30% 之間,酶活較低。當(dāng)pH=5.0 時,BC1、BC2、KP 的相對酶活為100%。當(dāng)pH=6.0 時,BS1、BS2 的相對酶活(CH3COOH-OH3COONa 緩沖液中)達(dá)到100%。隨著pH 的升高,各個寡聚-1,6-葡糖苷酶的相對酶活都顯著下降。BC1、BC2、KP 的最適pH 為5.0,BS1、BS2 的最適pH 為6.0。因此,5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶在堿性環(huán)境下酶活較低,都屬于酸性酶。
圖3 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶的最適pHFig. 3 Optimum pH of five oligo-1,6-glucosidases
值得注意的是,在pH 6.0 情況下, BC1、BC2、BS1 和BS2 在CH3COOH-CH3COONa 緩沖液中的相對酶活高于在Na2HPO4-NaH2PO4緩沖液中的相對酶活;在pH 7.0~8.0 情況下,5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶在Na2HPO4-NaH2PO4緩沖液中的相對酶活高于在Tris-HCl 緩沖液中的相對酶活,說明Na2HPO4-NaH2PO4緩沖液較CH3COOH-CH3COONa 緩沖液對酶活有一定抑制作用,而Tris-HCl 緩沖液較Na2HPO4-NaH2PO4緩沖液對酶活的抑制作用更強。
5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶在各自最適pH 下,孵育不同時間后測定其pH 穩(wěn)定性,孵育時間-相對酶活曲線如圖4 所示。 KP 在孵育3~6 h 后相對酶活迅速下降至47%,在孵育15 h 后相對酶活下降至27%。隨著孵育時間的延長,BC1、BC2、BS1、BS2 的相對酶活均緩慢下降,孵育15 h 后相對酶活分別降至80%、64%、79%、67%,說明這4 種酶的pH 穩(wěn)定性高于KP。
圖4 5 種寡聚-1,6-糖苷酶在各自最適pH 下的穩(wěn)定性Fig. 4 Stability of five oligo-1,6-glycosidases at their optimum pH
2.3.2 最適溫度及熱穩(wěn)定性 在30~64 ℃溫度范圍內(nèi),5 種寡聚-1,6-糖苷酶的溫度-相對酶活曲線如圖5所示。BC1 和BC2 從30 ℃開始隨著溫度升高相對酶活逐漸增加,56 ℃為最適反應(yīng)溫度,此時相對酶活達(dá)到最高,在60 ℃ BC1 和BC2 仍分別有74%和94%相對酶活。KP 從48 ℃升溫到52 ℃時相對酶活大幅提升,60 ℃為其最適反應(yīng)溫度,相對酶活達(dá)到最高,在64 ℃仍有78% 的相對酶活。BS1、BS2 的最適溫度均為43 ℃,隨著溫度繼續(xù)升高相對酶活迅速降 低。綜 上,BC1、BC2、KP 為 嗜 熱 性 酶,BS1、BS2 為嗜溫性酶。
圖5 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶最適溫度Fig. 5 Optimum temperature of five oligo-1,6-glucosidases
5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶在各自最適條件下孵育不同時間后測定其熱穩(wěn)定性,孵育時間-相對酶活曲線如圖6 所示。BS1 在43 ℃孵育2 min 時相對酶活急速下降,孵育20 s 時相對酶活迅速降至50%。BC1在孵育1 min 時相對酶活降至50% 以下,BC2 在孵育1.5 min 時相對酶活降至50%以下。BC1、BC2 和BS1 在孵育5 min 時都幾乎失活。相比之下,BS2 在孵育0.5 h 時相對酶活降至35%,孵育2 h 時相對酶活幾乎為0。KP 在孵育0.5 h 時仍有60%以上的相對酶活,隨后酶活隨孵育時間的延長而緩慢降低,孵育2 h 時相對酶活降至31%,表現(xiàn)出了較高的熱穩(wěn)定性。
圖6 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶在各自最適溫度下的熱穩(wěn)定性Fig. 6 Thermostability of five oligo-1,6-glucosidases at their optimum temperatures
Suzuki 等[4]在深入研究比較了來源于不同芽孢桿菌的寡聚-1,6-葡糖苷酶的氨基酸組成、結(jié)構(gòu)參數(shù)和熱穩(wěn)定性后提出了脯氨酸法則,即增加氨基酸序列中脯氨酸殘基的摩爾分?jǐn)?shù)可以提高蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性。5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)及熱穩(wěn)定性關(guān)系如表2 所示。由表2 可見,KP 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)最高,其最適溫度及熱穩(wěn)定性明顯高于其他寡聚-1,6-糖苷酶。BC1、BC2 及BS1 的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)較低,相應(yīng)的熱穩(wěn)定性也較低,其中BC1 的相對酶活衰減速度明顯快于其他酶,符合脯氨酸法則對這些酶的熱穩(wěn)定性的預(yù)測。
表2 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶的脯氨酸摩爾分?jǐn)?shù)與熱穩(wěn)定性Table 2 Proline molar fraction and thermostability of five oligo-1,6-glucosidases
Zn2+對這5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶都有強烈的抑制作用,其中使BS2 的相對酶活降低了99.32%。Zn2+被報道對許多酶的活性均具有抑制作用[17-19],可能是因為Zn2+易與蛋白酶親和而改變酶的構(gòu)象,從而抑制了酶的活性[20]。除Zn2+以外,Ni+也有普遍的抑制作用,其作為重金屬離子的作用可能與Zn2+相似[21]。Cu2+對5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶都呈現(xiàn)出強烈的抑制作用,但由于Cu2+在反應(yīng)體系中產(chǎn)生沉淀會影響酶活的檢測,其抑制程度不能精確確定。
表3 離子對5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶相對酶活的影響Table 3 Effects of ions on relative enzyme activities of five oligo-1,6-glucosidases
2.3.5 底物特異性 在凝結(jié)芽孢桿菌利用玉米粉水解液進(jìn)行乳酸發(fā)酵過程中,發(fā)酵后期發(fā)酵液中的菌體難以利用的殘?zhí)侵饕挟慃溠刻牵ê?1,6-糖苷鍵)、蔗糖(含α-1,2-糖苷鍵)、麥芽糖(含α-1,4-糖苷鍵)以及海藻糖(含α-1,1-糖苷鍵)[3]。因此選取以上發(fā)酵液殘?zhí)侵泻枯^高的糖類,同時還選取了乳糖(含β-1,6-糖苷鍵)以及可溶性直鏈淀粉(含α-1,4-糖苷鍵)作為底物來測定分析底物的特異性。如表5 所示,5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶水解其他底物時的酶活相對于水解pNPG 時的酶活較低。BC1、BC2、KP、BS1 對異麥芽糖都有水解活性,只有BS2 未檢測到該活性。其中BC1 對異麥芽糖的水解活性最高,酶活達(dá)到了(12.82±0.08)mmol/(min·g),其次是KP,酶活達(dá)到了(7.24±1.35)mmol/(min·g)。5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶對麥芽糖都有催化水解的活性,其中BS2 催化水 解 麥 芽 糖 的 酶 活 高 達(dá)(4.11±0.04)mmol/(min·g)。此外,BC1、KP、BS1 還具備一定的催化水解蔗糖的活性。而5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶都不具備催化水解乳糖、海藻糖及可溶性直鏈淀粉活性的性能。
表4 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶酶動力學(xué)參數(shù)Table 4 Enzyme kinetic parameters of five oligo-1,6-glucosidases
表5 5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶的底物特異性Table 5 Substrate specificity of five oligo-1,6-glucosidases
(1)以pET-22b(+) 作為表達(dá)載體分別構(gòu)建了來源 于Bacillus coagulansATCC 7050(BC1、BC2)、Bacillus thermoglucosidasiusKP 1006(KP)和Bacillus subtilis168(BS1、BS2)的5 個寡聚-1,6-葡糖苷酶基因的大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng),在E. coliBL21(DE3)中誘導(dǎo)表達(dá),并利用鎳柱親和層析方法進(jìn)行純化。純化后5 種寡聚-1,6-葡糖苷酶BC1、BC2、KP、BS1、BS2對水解pNPG 的酶活分別達(dá)到了(3 385.51 ± 39.26)、(36.57 ± 1.94)、(5 657.29 ± 50.64)、(759.58 ± 73.50)、(114.70 ± 7.57) mmol/(min·g)。