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基于高通量測序技術(shù)探究加味二陳湯對肥胖大鼠腸道微生物組的影響

2021-08-25 08:25
關(guān)鍵詞:灌胃單純性菌群

杜 恒

(武漢市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院兒科,武漢 430022)

隨著人類工業(yè)文明發(fā)展,人們生活水平提高,兒童肥胖率呈逐年上升趨勢。據(jù)相關(guān)研究表明,2014年我國7~18歲兒童肥胖與超重總檢出率高達(dá)19.4%。肥胖會引起兒童心血管系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)等多個系統(tǒng)疾病,還會對兒童心理、骨骼以及肝臟等產(chǎn)生影響[1-3]。據(jù)相關(guān)實驗表明,阻塞性睡眠呼吸暫停低通氣綜合征等也與肥胖有著密不可分的聯(lián)系[4-5]。鑒于單純性肥胖對我國兒童健康的巨大威脅,且西藥減肥藥存在的對兒童健康的未知影響,本課題組從5年前開始針對中藥減肥展開了一系列的研究。加味二陳湯為研究成果之一,是武漢市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院兒科徐輝甫主任醫(yī)師的經(jīng)驗方,其主要功效是運脾和胃,燥濕化痰,可治療以痰濁中阻為主要證候的單純性肥胖。本實驗借助小窩喂養(yǎng)誘導(dǎo)肥胖幼鼠模型,對其進(jìn)行加味二陳湯灌胃,實驗結(jié)果表明,治療后小窩喂養(yǎng)肥胖幼鼠體質(zhì)量、Lee’s 指數(shù)、膽固醇、三酰甘油及游離脂肪酸等指標(biāo)具有明顯改變[6-7]。本文通過高通量測序技術(shù),進(jìn)一步研究加味二陳湯對肥胖大鼠腸道微生物組的影響,從分子生物學(xué)水平分析治療小兒單純性肥胖采用加味二陳湯的應(yīng)用價值。

1 材料和方法

1.1 肥胖大鼠模型建立及分組

從湖北實驗動物研究中心購買成年SPF級SD大鼠雌性10只,雄性5只(根據(jù)2:1比例使其交配并自然分娩)。將出生后的雄性大鼠分為大窩組與小窩組,其中大窩組每只母鼠哺乳10只雄鼠,小窩組每只母鼠哺乳3只雄鼠。給予哺乳母鼠常規(guī)飲食,并在大鼠出生21 d后斷奶,將小窩喂養(yǎng)后的肥胖幼鼠(體質(zhì)量≥大窩組體質(zhì)量均值+1.4倍標(biāo)準(zhǔn)差)隨機(jī)分成2組:加味二陳湯組(予加味二陳湯灌胃)與對照組(予生理鹽水灌胃),均以標(biāo)準(zhǔn)飼料喂養(yǎng)。

1.2 藥物

治療組方:法半夏、蒼術(shù)、生山楂、茯苓、決明子、陳皮、甘草,由四川新綠色藥業(yè)科技發(fā)展有限公司提供中藥顆粒劑。

1.3 給藥方法

參照5歲兒童生理體質(zhì)量確定大鼠灌胃劑量,大鼠劑量與人劑量等效。治療組采用加味二陳湯灌胃,時間為5周,直至處死;對照組采用生理鹽水灌胃,時間為5周,直至處死。

1.4 糞便收集、測序及DNA提取

灌胃后采集大鼠腸道微生物樣品。固定大鼠后,在肛門周圍涂抹75%乙醇刺激其排便。用無菌棉簽涂抹糞便后,放入10 mL無菌EP管中,快速放入干冰箱,-80℃冰箱中保存待后續(xù)送實驗室。樣本送到上海美吉生物公司進(jìn)行抗微生物DNA的提取,PCR擴(kuò)增細(xì)菌的16 s區(qū)域后,采用Hiseq 2 500平臺進(jìn)行高通量測序。

1.5 統(tǒng)計學(xué)方法

采用Vsearch算法,將相似性大于97%的序列讀數(shù)定為一個OTU(operational taxonomic units)。對于相似度水平的OTU代表序列采用RDPclassifier貝葉斯算法進(jìn)行分類學(xué)比對分分析。2組大鼠腸道微生物組在門(phylum)和屬(genes)水平上的豐度,采用t檢驗評估。以P<0.05表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。最后采用LEfSe分析,比較組間菌群差異,找出各組間差異的微生物種類。

2 結(jié)果

2.1 測序原始數(shù)據(jù)分析

通過高通量測序,2組大鼠共12個樣本,共獲得了340 263條高質(zhì)量的序列讀數(shù),占總序列的96.86%,序列平均長度為300~500 bp。各組樣本數(shù)據(jù)分析結(jié)果,見表1。

表1 序列數(shù)據(jù)統(tǒng)計(±s)

表1 序列數(shù)據(jù)統(tǒng)計(±s)

分組 Raw tags均數(shù) Valid tags均數(shù) Valid tags均數(shù)百分比/%對照組 32 273±3 632 23 718±2 689 73.51±2.57加味二陳湯組 43 818±6 000 34 848±5 025 79.15±5.72

2.2 2組大鼠腸道微生物多樣性探究

對照組與加味二陳湯組大鼠腸道菌群多樣性分析結(jié)果顯示:1)加味二陳湯灌胃導(dǎo)致大鼠腸道菌群特有的OTU減少。2)對照組的腸道菌群均勻度低于加味二陳湯組,說明加味二陳湯組的腸道菌群物種豐富度較高。3)對照組和加味二陳湯組大鼠Shannon指數(shù)相近,但經(jīng)t檢驗差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。4)對照組的Simpson指數(shù)高于加味二陳湯組,且t檢驗存在統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),表明加味二陳湯組腸道菌群生物多樣性高于對照組。5)加味二陳湯組大鼠的Chao1指數(shù)較對照組高,數(shù)據(jù)結(jié)果具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),說明加味二陳湯對腸道微生物群落具有改善作用。

2.3 2組大鼠菌群差異探究

通過物種分析,研究對照組和加味二陳湯組大鼠腸道菌群的組成。2組中腸道菌群相對較高的前12門見表2。從表中可以看出,在2組大鼠的糞便樣本中,12個門中有9個門出現(xiàn)。但經(jīng)t檢驗,大部分門的差異均不具有統(tǒng)計學(xué)意義,只有螺旋菌門、柔性菌門2組間差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。加味二陳湯組大鼠腸道菌群中僅存在疣狀微菌和螺旋菌,其Mean豐度分別為(0.010±0.013)%、(0.010±0.014)%、(0.010±0.005)%。

表2 2組大鼠腸道菌群組成中主要門的相對豐度

研究結(jié)果顯示,菌屬水平對照組和治療組大鼠腸道菌群的組成。1)對照組和加味二陳湯組腸道菌群豐度最高的三個門分別是厚壁菌門、擬桿菌門和變形菌門。對照組和加味二陳湯組腸道菌群豐度在細(xì)菌在屬水平上的差異,其中對照組菌群排名前3的是毛霉、紫色單孢子菌和乳酸菌。2)加味二陳湯組大鼠中豐度較高的前3種細(xì)菌分別為瘤胃菌、毛霉菌和紫色單孢子菌。在細(xì)菌屬的分類水平上,2組大鼠的腸道菌群有統(tǒng)計學(xué)差異,如瘤胃細(xì)菌、螺桿菌、副桿菌、真細(xì)菌、布魯氏菌、梭菌等。

2.4 2組大鼠腸道菌群LEfSe差異分析

對照組和加味二陳湯組大鼠腸道微生物的LEfSe多級物種層級樹圖結(jié)果顯示:2組之間特定細(xì)菌門的差異主要表現(xiàn)在厚壁菌門、變形菌門和柔性膜菌門的豐度上。結(jié)合統(tǒng)計學(xué)分析,加味二陳湯組大鼠腸道微生物多樣性高于對照組。

3 討論

單純性肥胖是指由于卡路里攝入量超出利用與消耗量,導(dǎo)致脂肪在體內(nèi)不斷積累,體質(zhì)量超標(biāo),不產(chǎn)生器質(zhì)性病變的肥胖[8-10]。西醫(yī)治療單純性肥胖主要以健康教育、改善生活方式、堅持體育鍛煉、藥物以及手術(shù)等方式[11-12]。中醫(yī)學(xué)認(rèn)為,兒童單純性肥胖主要與飲食不節(jié)有關(guān)?!端貑枴ねㄔu》中指出:“甘肥貴人,則膏梁之疾也?!眱和捎诒╋嫳┦骋约懊τ趯W(xué)習(xí)而忽視體育鍛煉致使肥胖發(fā)生[13-14]?!端貑栃髡龤庹摗酚小熬米鴤麣猓米鴤狻钡拿鑼?,《丹溪治法必要》有“肥人多痰”“肥人多濕”的論述。中醫(yī)學(xué)認(rèn)為,飲食不節(jié),脾失健運,運化失施導(dǎo)致小兒肥胖。彭真等[15]研究發(fā)現(xiàn),兒童單純型肥胖主要病機(jī)與病理發(fā)展轉(zhuǎn)歸的重要因素與痰濕有關(guān)。我院兒科徐輝甫教授在治療兒童單純性肥胖方面以加味二陳湯為經(jīng)驗方,通過多年臨床驗證,治療效果較好,不易反彈,并且副作用較小。治療組方在二陳湯基礎(chǔ)上加生山楂、決明子、蒼術(shù)。二陳湯出自《太平惠民和劑局方》,主要功效是理氣和中、化痰燥濕,屬于治療痰濕證經(jīng)典方。《丹溪心法附余》指出: “此方半夏豁痰燥濕,橘紅消痰利氣,茯苓降氣滲濕,甘草補(bǔ)脾和中?!奔游抖悳诙悳降幕A(chǔ)上增加生山楂健胃消脂,降低血清中的膽固醇[16],增加決明子清肝祛濕,調(diào)節(jié)體內(nèi)葡萄糖和脂肪代謝[17],另加蒼術(shù)加強(qiáng)運脾燥濕之功,理氣燥濕化痰治標(biāo)的同時,運脾健脾截生痰之源兼顧治本。在本課題組的前期研究中,加味二陳湯在改善小窩喂養(yǎng)肥胖幼鼠的血脂代謝,減輕體質(zhì)量和降低 Lee’s 指數(shù)等方面獲得了很好的效果。

腸道內(nèi)微生物主要依靠動物腸道生活,并幫助寄主完成諸多生理功能[18-19]。腸道具有消化吸收的作用,是人體最大的免疫器官,能夠維持人體正常免疫防御功能。微生物是人體內(nèi)最復(fù)雜、最龐大的微生態(tài)系統(tǒng),人體腸道是其主要生長環(huán)境,其本身以及代謝產(chǎn)物除能夠調(diào)節(jié)人體健康外,還可以溝通膳食與宿主之間的關(guān)系?;诖耍狙芯吭诜治黾游抖悳臏p肥功效時,亦探討加味二陳湯對人體腸道微生物的相關(guān)影響。

根據(jù)高通量測序結(jié)果顯示,加味二陳湯組大鼠腸道微生物多樣性高于對照組,而腸道生物多樣性可協(xié)助宿主進(jìn)行能量吸收與儲存[20]。加味二陳湯可能通過調(diào)控腸道微生物組來達(dá)到減肥效果。埃希氏菌屬是條件菌,通常情況下不致病,但是如果發(fā)生特殊情況,會導(dǎo)致宿主腹痛或者腹瀉[21]。本研究中服用了加味二陳湯大鼠埃希氏菌屬豐度要明顯高于對照組,可見加味二陳湯可通過促進(jìn)排泄降低體質(zhì)量。值得注意的是,顫螺菌屬和乳桿菌菌屬都屬于益生菌,在宿主對食物的消化中起著必不可少的作用[22],加味二陳湯組大鼠腸道中的相對豐度要少于對照組。本研究發(fā)現(xiàn),加味二陳湯的使用導(dǎo)致了肥胖大鼠的腸道微生物多樣性明顯升高,其中一些和食物消化相關(guān)的菌屬豐度發(fā)生了改變,但是這些改變對于宿主健康的影響是未知的,值得我們更進(jìn)一步的研究。本課題組未來的探索中,會考慮使用更多的大鼠進(jìn)行實驗,并且設(shè)置空白對照組,使實驗的結(jié)果更有說服力。

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