劉駿逸,程衛(wèi)東,李朝暉,劉曉東,彭 鵬,申 晟
[1.河南省洛陽正骨醫(yī)院(河南省骨科醫(yī)院),河南 鄭州 450000; 2.珠海市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院,廣東 珠海 519000]
根據(jù)國際糖尿病協(xié)會(huì)統(tǒng)計(jì),2015年的全球糖尿病患者總數(shù)已經(jīng)達(dá)到4.15億,到2040年預(yù)期將達(dá)到6.42億人,其中接近3/4的糖尿病患者生活在低中收入水平國家[1]。糖尿病足(diabetic foot,DF)屬于糖尿病較為嚴(yán)重的并發(fā)癥之一,也是最常見的截肢原因[2]。據(jù)估計(jì),每年有19%~34%的糖尿病患者發(fā)生糖尿病足;約40%的糖尿病足愈合患者在1年內(nèi)潰瘍復(fù)發(fā),60%的患者3年內(nèi)復(fù)發(fā),65%的患者5年內(nèi)復(fù)發(fā)[3]。多種因素均可導(dǎo)致糖尿病足的復(fù)發(fā),而糖尿病足的復(fù)發(fā)將對患者的心理及生理產(chǎn)生極大的不良影響,且會(huì)增加患者關(guān)于傷口處理所產(chǎn)生的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[4]。最近一項(xiàng)Meta分析顯示:DF患者的性別、既往DF潰瘍時(shí)長、吸煙、跖側(cè)面潰瘍、糖尿病患病時(shí)長及周圍血管病變、神經(jīng)病變均為DF發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因素[5]。
DF的治療十分困難,且其預(yù)后受全身、局部、治療等多方面影響。在治療糖尿病足的過程中,中西醫(yī)結(jié)合療法具有明顯優(yōu)勢。四妙勇安湯為治療糖尿病足的代表方劑之一[6-7],由金銀花、玄參、當(dāng)歸、甘草4味藥物組成,是治療脈管炎、脫疽熱毒熾盛證的經(jīng)典名方。方中玄參清熱涼血,瀉火解毒?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究表明:玄參為玄參科植物玄參的根,具有舒張血管、降血糖、抗炎、抗菌、抗癌等作用,在治療DF中起到了至關(guān)重要的作用[8-9]。但是由于中草藥所含成分的多樣性,目前對于玄參治療糖尿病足的作用機(jī)制尚不完全清楚。筆者采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù),通過“疾病表型-基因-靶點(diǎn)-藥物”的模式,全方位、多角度深入研究玄參治療糖尿病足的作用機(jī)制,以期為深入研究玄參及含有玄參的中藥復(fù)方治療糖尿病足的臨床運(yùn)用提供參考依據(jù)。
采用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP)[10]查詢。關(guān)鍵詞:玄參。限定條件:口服利用度(oral bioavailability,OB)>30%,類藥性(drug-likeness,DL)>0.18[11-12]。在數(shù)據(jù)庫中篩選出玄參的化學(xué)成分和對應(yīng)靶點(diǎn)。通過蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(UniProt)將靶點(diǎn)的名稱轉(zhuǎn)換為簡稱,將物種設(shè)置為人,對靶點(diǎn)基因和蛋白信息進(jìn)行校正,獲得標(biāo)準(zhǔn)的Symbol名稱。
通過人類基因綜合數(shù)據(jù)庫(GeneCards)和人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM)查詢疾病靶點(diǎn),以“糖尿病足”“diabetic foot”為檢索詞搜索,將搜索結(jié)果合并、規(guī)范化、去重后,與1.1項(xiàng)下的結(jié)果取交集,獲得玄參-糖尿病足靶點(diǎn)交集。
通過Cytoscape 3.7軟件中的網(wǎng)絡(luò)分析功能,調(diào)節(jié)節(jié)點(diǎn)的顏色及度值(Degree),獲得玄參的主要化學(xué)成分以及相互作用網(wǎng)絡(luò)圖。
在String 11.0數(shù)據(jù)庫中,限定物種為人,忽略孤立節(jié)點(diǎn),選擇結(jié)合分?jǐn)?shù)>0.4的連接關(guān)系,導(dǎo)入1.2項(xiàng)下玄參-糖尿病足結(jié)果;得到玄參-糖尿病足靶點(diǎn)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò),利用R語言軟件(版本4.0.2),分析PPI網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)后做圖。
采用DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫,導(dǎo)入玄參-糖尿病足交集基因,限定物種為人類,設(shè)定閾值P<0.05,進(jìn)行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,再將結(jié)果導(dǎo)入基迪奧生物信息云平臺(OmicShare)繪制通路信息圖。
本研究以玄參為關(guān)鍵詞,TCMSP為數(shù)據(jù)庫,OB>30%、DL>0.18為搜索條件,共得到玄參化學(xué)成分9個(gè);檢索玄參的作用靶點(diǎn),根據(jù)選出的化學(xué)成分篩選出對應(yīng)的靶點(diǎn),共得到靶點(diǎn)36個(gè)。
使用關(guān)鍵詞“Diabetic foot”在GeneCards數(shù)據(jù)庫和OMIM數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行檢索,分別得到糖尿病足的相關(guān)靶點(diǎn)4 553個(gè)和192個(gè),去除重復(fù)靶點(diǎn),共得到不重復(fù)靶點(diǎn)4 726個(gè),與2.1項(xiàng)下結(jié)果取交集,得到玄參-糖尿病足交集靶點(diǎn)28個(gè)。
將玄參的活性成分及交集靶點(diǎn)結(jié)果導(dǎo)入Cytoscape數(shù)據(jù)庫,得到玄參-活性成分-靶點(diǎn)-糖尿病足網(wǎng)絡(luò),見圖1。網(wǎng)絡(luò)中,共有34個(gè)節(jié)點(diǎn)、69條邊,藍(lán)色圓形代表活性成分,綠色長方形代表靶點(diǎn),邊表示活性成分與靶標(biāo)之間相互聯(lián)系?;钚猿煞种蠨egree值最高者為β-谷甾醇,接下來依次是柳杉酚、玄參苷,其他類型谷甾醇如γ-谷甾醇、α1-谷甾醇,其所對應(yīng)的作用靶點(diǎn)分別為21,10,3,1個(gè)。由網(wǎng)絡(luò)可知,玄參治療糖尿病足是由多成分參與并作用于多個(gè)靶點(diǎn)的,非單一模式,其中β-谷甾醇可能是玄參治療糖尿病足的關(guān)鍵成分。
導(dǎo)入玄參-糖尿病足的交集靶點(diǎn)至STRING 11.0數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),含有28個(gè)節(jié)點(diǎn)和84條邊,表示有28個(gè)相關(guān)蛋白參與,以及84個(gè)蛋白之間的相互作用關(guān)系。將PPI網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape數(shù)據(jù)庫,依據(jù)蛋白的Degree值調(diào)節(jié)節(jié)點(diǎn)大小,Degree值越大,節(jié)點(diǎn)越大。見圖2。由此可推測,玄參治療糖尿病足可能與半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(Prostagrandin-endoperoxid synthase 2,PTGS2)、乙酰膽堿酯酶(A cetylcholinesterase,AChE)、JUN原癌基因(Jun Proto-oncogene,JUN)、半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶9(Caspase 9,CASP9)這些節(jié)點(diǎn)有關(guān)。
圖2 玄參-糖尿病足交集靶蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)圖
利用David 6.8在線數(shù)據(jù)庫對玄參治療糖尿病足的有效作用靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能富集分析。以P<0.05為閾值進(jìn)行篩選,結(jié)果見圖3。GO富集分析包含3個(gè)部分:生物過程(Biological Process,BP)、分子功能(Molecular Function,MF)和細(xì)胞組分(Cellular component,CC)。確定了72項(xiàng)條目:其中BP部分45項(xiàng),列出前20項(xiàng);CC部分12項(xiàng),列出前5項(xiàng);MF部分15項(xiàng),列出前5項(xiàng)。見表1。
圖3 玄參有效成分對應(yīng)靶標(biāo)的KEGG通路富集分析結(jié)果圖
表1 玄參-糖尿病足有效作用靶點(diǎn)GO富集分析結(jié)果
以P<0.05為閾值,共發(fā)現(xiàn)82條KEGG通路。根據(jù)P值由小到大的順序,取排名前20的通路,采用Omicshare網(wǎng)站作圖,進(jìn)行可視化展示,見圖4。其中信號傳導(dǎo)、神經(jīng)系統(tǒng)、內(nèi)分泌系統(tǒng)、癌癥、感染5大類的信號通路包含的基因最多,分別包含17,14,13,12,10個(gè)基因。具體涉及通路包括神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路、乙型肝炎、麻疹、卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染、EB病毒感染、1型人體免疫缺陷病毒感染、人巨細(xì)胞病毒感染、大腸癌、細(xì)胞凋亡、心肌細(xì)胞的腎上腺素信號傳導(dǎo)、鈣離子信號通路、凋亡-多種、鉑耐藥、p53信號通路、小細(xì)胞肺癌、唾液分泌、白細(xì)胞介素(IL)-17信號通路、晚期糖基化終末產(chǎn)物(AGE)-AGE受體(RAGE)信號通路、膽堿能突觸、乳腺癌、雌激素信號通路、血清素能突觸等,主要包括神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路、AGE-RAGE信號通路、Ca2+信號通路、雌激素信號通路、IL-17信號通路、p53信號通路等6個(gè)通路,說明玄參可通過影響多個(gè)通路治療糖尿病足。
圖4 玄參-糖尿病足KEGG富集前20條信號通路圖
玄參性微寒,味苦、甘、咸,歸肺、胃、腎經(jīng),具有抗炎、抗菌、降血糖、抗腫瘤、解熱鎮(zhèn)痛等作用?!侗静菡x》曰:“玄參,稟至陰之性,專主熱病,味苦則泄降下行,故能治臟腑熱結(jié)等證。味又辛而微咸,故直走血分而通血瘀。亦能外行于經(jīng)隧,而消散熱結(jié)之癰腫。寒而不峻,潤而不膩,性情與知、柏、生地近似,而較為和緩,流弊差輕。玄參賦稟陰寒,能退邪熱,而究非滋益之品?!彼拿钣掳矞珵橹委熖悄虿∽愕拇矸絼?,其中玄參為該方的主要用藥。雖然越來越多的研究證實(shí)了玄參對糖尿病足治療的有效性[13],但其治療機(jī)制尚未明確。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對玄參治療糖尿病足的機(jī)制進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,研究結(jié)果發(fā)現(xiàn):玄參治療糖尿病足的主要化學(xué)成分為β-谷甾醇,接下來依次是柳杉酚、玄參苷、谷甾醇等。既往研究表明:β-谷甾醇屬于植物甾醇,結(jié)構(gòu)與膽固醇類似;在高脂飲食和蔗糖誘導(dǎo)的2型糖尿病大鼠中,β-谷甾醇可通過調(diào)節(jié)IRS-1/Akt信號通路,減弱脂肪組織中的胰島素抵抗[14]。玄參苷具有在人體外周血單核細(xì)胞中誘導(dǎo)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的能力。研究表明:玄參苷可增加靜息電位人體外周血單核細(xì)胞中Foxp3、轉(zhuǎn)化生長因子-β和IL-10 mRNA的表達(dá),有作為消炎藥的巨大潛力[15]。目前,尚缺乏關(guān)于柳杉酚治療糖尿病足的相關(guān)研究,這為今后的實(shí)驗(yàn)研究提供了新的方向。
玄參-糖尿病足PPI網(wǎng)絡(luò)包括28個(gè)相關(guān)蛋白和84個(gè)蛋白之間的相互作用關(guān)系,其中主要靶點(diǎn)包括CASP3、DTGS2、AChE、JUN、CASP9等,這說明玄參治療糖尿病足的機(jī)制是多成分、多靶點(diǎn)的。
玄參-糖尿病足KEGG通路富集分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)了82條顯著相關(guān)的通路。在所篩選出的通路中,信號傳導(dǎo)、神經(jīng)系統(tǒng)、內(nèi)分泌系統(tǒng)、癌癥、感染5大類的信號通路包含的基因最多,主要涉及神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路、鈣離子信號通路、p53信號通路、IL-17信號通路、AGE-RAGE信號通路、雌激素信號通路。KHANAL P等[16]研究發(fā)現(xiàn),神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路可作為調(diào)節(jié)糖尿病蛋白的主要通路,能夠調(diào)節(jié)絕大部分降糖的蛋白。內(nèi)皮細(xì)胞的胰島素抵抗是造成胰島素抵抗及2型糖尿病患者發(fā)生動(dòng)脈粥樣硬化和心血管疾病的主要原因,而下肢動(dòng)脈粥樣硬化造成肢體遠(yuǎn)端缺血、壞死、感染是糖尿病足的直接原因。研究表明:多種基因增強(qiáng)內(nèi)皮細(xì)胞中的胰島素敏感性都是依賴鈣離子信號通路的,如細(xì)胞膜鈣轉(zhuǎn)運(yùn)三磷酸腺苷酶1。p53是一種大小為53kD的蛋白質(zhì),首先在腫瘤的病毒研究中被發(fā)現(xiàn),是目前發(fā)現(xiàn)的與人類腫瘤相關(guān)性最高的基因。TP53也是人類癌癥中最常見的突變基因[17]。p53蛋白不但可以限制腫瘤發(fā)展,響應(yīng)DNA損傷、缺氧、癌基因表達(dá)、營養(yǎng)剝奪及核糖體功能障礙等多種信號,而且可以控制多種生物反應(yīng)過程,如組織重塑、自噬、ROS控制,以及代謝過程等[18-20]。IL-17是一種促炎性細(xì)胞因子,與多種自身免疫性疾病有關(guān)。對自身免疫性糖尿病動(dòng)物模型和1型糖尿病患者的相關(guān)研究均提示,IL-17參與糖尿病的發(fā)病機(jī)制。IL-17可以增加炎癥反應(yīng),加速氧化應(yīng)激和細(xì)胞凋亡。減少IL-17,可以降低血糖,提高血清胰島素。IL-17聯(lián)合鏈脲霉素會(huì)增加對胰島MIN6細(xì)胞的破壞[21]。研究[22]表明,阻斷IL-17可以減輕糖尿病視網(wǎng)膜病變。糖尿病足是糖尿病的嚴(yán)重并發(fā)癥之一,主要表現(xiàn)為足部的潰瘍及創(chuàng)面難以愈合。AGE-RAGE信號通路是糖尿病足發(fā)生的一個(gè)重要環(huán)節(jié)。AGE是多種不同中間產(chǎn)物,是縮合、重排、裂解、氧化修飾等非酶促糖基化反應(yīng)產(chǎn)物。正常人體內(nèi)的AGE含量較低,但糖尿病患者體內(nèi)AGE的生成會(huì)明顯加速。AGE的蓄積是導(dǎo)致神經(jīng)、血管等組織器官損傷的重要病理基礎(chǔ)[23-24]。已有研究表明,雌激素受體存在β細(xì)胞中,雌激素可以影響胰島β細(xì)胞中胰島素的合成與分泌,同時(shí)影響β細(xì)胞的存活和胰島素基因的表達(dá)。雌激素干預(yù)可以降低糖尿病小鼠的血糖水平,增加胰島素分泌,增強(qiáng)胰島素基因的表達(dá)[25]。
綜上所述,玄參治療糖尿病足的機(jī)制具有多成分、多靶點(diǎn)、多通路等特征,相較于西藥單一作用機(jī)制更具有優(yōu)勢。玄參的主要治療成分為β-谷甾醇,作用靶點(diǎn)包括CASP3、PTGS2、AChE、JUN、CASP9,核心通路涉及神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路、鈣離子信號通路、p53信號通路、IL-17信號通路、AGE-RAGE信號通路、雌激素信號通路6個(gè)通路。采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究玄參治療糖尿病足的機(jī)制僅是分子機(jī)制的預(yù)測,為進(jìn)一步深入探討其作用機(jī)制指明了方向,后期將在此研究基礎(chǔ)上開展動(dòng)物實(shí)驗(yàn)和臨床研究來驗(yàn)證其作用機(jī)制。