李俊林 張煥朝 聶文婧 張海洋 王向譽(yù) 郭洪恩 韓蕾
(1. 山東省蠶業(yè)研究所,煙臺(tái) 264002;2. 南京林業(yè)大學(xué),南京 210037;3. 魯東大學(xué),煙臺(tái) 264025)
植物啟動(dòng)子在基因的表達(dá)調(diào)控中起關(guān)鍵作用,基因表達(dá)的時(shí)空特異性、組織特異性和條件特異性主要取決于基因的啟動(dòng)子。植物基因啟動(dòng)子是重要的順式作用元件,能夠在轉(zhuǎn)錄水平上參與并調(diào)控下游相應(yīng)基因表達(dá),使植物能夠抵御外界各種環(huán)境脅迫[1-2]。因此,研究植物啟動(dòng)子有助于了解基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控表達(dá)模式及其調(diào)控機(jī)制,并應(yīng)用于基因工程中提高或改進(jìn)外源目的基因的表達(dá)。
干旱條件下,植物體內(nèi)ABA水平升高,保衛(wèi)細(xì)胞中的離子從細(xì)胞質(zhì)膜運(yùn)出,從而驅(qū)使氣孔關(guān)閉,減少蒸騰失水[3-4]。保衛(wèi)細(xì)胞外向整流鉀離子通道(guard cell outward rectifying K+channe,GORK)是擬南芥保衛(wèi)細(xì)胞唯一一個(gè)介導(dǎo)鉀離子外流的鉀離子通道,在氣孔關(guān)閉過(guò)程起重要作用[5-7]。擬南芥GORK在保衛(wèi)細(xì)胞、根及維管組織中表達(dá),在轉(zhuǎn)錄水平上受干旱、鹽和冷脅迫誘導(dǎo)[8]。在保衛(wèi)細(xì)胞中,GORK的表達(dá)與分布對(duì)ABA不敏感,但其分布受細(xì)胞外鉀濃度影響[7-8]。但是,ABA對(duì)保衛(wèi)細(xì)胞外向整流鉀通道轉(zhuǎn)運(yùn)鉀離子有直接調(diào)控作用[9]。GORK也可通過(guò)蛋白磷酸酶(PP2C-type protein phosphatase,PP2CA)介導(dǎo)的信號(hào)途徑增強(qiáng)擬南芥對(duì)ABA的敏感性,并對(duì)高鹽和滲透脅迫的相關(guān)機(jī)制起到了負(fù)調(diào)節(jié)作用[10]。GORK通道可以作為細(xì)胞代謝的“主開(kāi)關(guān)”,調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)K+穩(wěn)態(tài)以適應(yīng)環(huán)境條件的變化,從而最大限度地發(fā)揮植物的適應(yīng)潛力[11]。迄今為止,除了擬南芥GORK,Li等[12]曾報(bào)道蒙古沙冬青中一個(gè)與擬南芥GORK同源的外鉀離子通道AmGORK,該通道與擬南芥GORK電生理功能特征相似,但其體內(nèi)生理功能還未有報(bào)道。
蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)為豆科,沙冬青屬,是我國(guó)西北荒漠區(qū)特有的常綠旱生闊葉灌木,起源與第三紀(jì),瀕危物種,國(guó)家三級(jí)保護(hù)植物[13-14]。常年生長(zhǎng)在年降水量不足100 mm,年蒸發(fā)量大于3 000 mm的極端干旱環(huán)境中,是研究植物抗旱機(jī)制的很好材料[15]。
本研究從蒙古沙冬青中克隆了外向鉀離子通道AmGORK的啟動(dòng)子序列,利用PlantCARE預(yù)測(cè)AmGORK啟動(dòng)子順式作用元件。將AmGORKpro定向替換植物表達(dá)載體Cambia1301的CaMV35S啟動(dòng)子,構(gòu)建重組載體Cambia1301-AmGORKpro-GUS,通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)轉(zhuǎn)入野生型擬南芥。組織化學(xué)染色和定量分析揭示該啟動(dòng)子對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)特性,為深入研究該基因在水分及養(yǎng)分利用、光合作用、抗旱等過(guò)程的功能奠定基礎(chǔ)。
蒙古沙冬青(A. mongolicus)由甘肅民勤沙生植物園提供。擬南芥(Arabidopsis thaliana)哥倫比亞(Columbia)野生型和根癌農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)GV3101為海水農(nóng)業(yè)實(shí)驗(yàn)室保存。大腸桿菌(Escherichia coli)Trans1-T1、Taq酶、限制性?xún)?nèi)切酶、T4DNA連接酶購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司。
1.2.1 基因組DNA提取 利用CTAB法提取蒙古沙冬青幼嫩葉片基因組DNA,微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA質(zhì)量和濃度,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 AmGORK基因5′側(cè)翼片段克隆 鑒于AmGORK啟動(dòng)子序列未知,參考Liu等[16]的方法進(jìn)行交錯(cuò)式熱不對(duì)稱(chēng)PCR法(thermal asymmetric interlaced PCR),以沙冬青基因組DNA為模板,根據(jù)前期已經(jīng)克隆得到的AmGORK序列,分別在其DNA序列ATG下游45、114和248 bp處設(shè)計(jì)3條反向引物GP1-3、GP1-2和GP1-1。為了增加PCR反應(yīng)特異性,在GP1-2引物前添加一段隨機(jī)引物序列。合成4條隨機(jī)引物L(fēng)AD1-1、LAD1-2、LAD1-3和LAD1-4以及1條引物AC1,具體序列見(jiàn)表1。
AmGORK的5′側(cè)翼片段的擴(kuò)增由3輪PCR完成,第一輪PCR反應(yīng)以沙冬青基因組DNA為模板,上游引物分別是4條隨機(jī)引物,下游引物是GP1-1;首輪PCR產(chǎn)物稀釋40倍后作為第二輪PCR反應(yīng)模板,上游引物為AC1,下游引物為GP1-2;第二輪PCR產(chǎn)物稀釋10倍后作為第三輪PCR反應(yīng)模板,上游引物為AC1,下游引物為GP1-3。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,將PCR條帶切膠回收,與pMD19-T載體連接,送華大基因測(cè)序。根據(jù)測(cè)序結(jié)果設(shè)計(jì)引物(GP2-1、GP2-2和GP2-3),用同樣方法進(jìn)行PCR擴(kuò)增,直到獲得需要大小的目的片段。
1.2.3 AmGORK啟動(dòng)子的克隆及鑒定 根據(jù)上述測(cè)序得到的DNA拼接序列設(shè)計(jì)上游引物AmGORK-pro-F和下游引物AmGORK-pro-R(表1),并分別在引物5′端引入KpnⅠ和NcoⅠ酶切位點(diǎn)。
表1 試驗(yàn)所用引物序列Table 1 Primer sequences used in the experiment
以沙冬青基因組DNA為模板,用上述引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖電泳檢測(cè)。按照回收試劑盒說(shuō)明書(shū)回收目的片段。獲得的目的片段和pEasy-blunt zero載體(TransGen Biotech)連接,并轉(zhuǎn)化Trans1-T1,涂在含氨芐的平板上,挑取菌斑做菌落PCR鑒定,初步確認(rèn)為陽(yáng)性克隆后,送華大公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果正確,含有AmGORK啟動(dòng)子重組質(zhì)粒,保存待用。
1.2.4 AmGORK啟動(dòng)子序列的特征分析 通過(guò)在線軟件PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)進(jìn)行順式作用元件預(yù)測(cè)分析[17]。
1.2.5 AmGORK啟動(dòng)子植物表達(dá)載體的構(gòu)建 用KpnⅠ和NcoⅠ分別對(duì)上述測(cè)序正確的含有AmGORK啟動(dòng)子重組質(zhì)粒和植物表達(dá)載體pCambia1301-GUS進(jìn)行酶切、片段回收、純化、連接及陽(yáng)性克隆鑒定(圖 1)。
圖1 表達(dá)載體構(gòu)建示意圖Fig.1 Construction map of expression vector
1.2.6 AmGORK啟動(dòng)子轉(zhuǎn)化擬南芥 根據(jù)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的花序侵染法,將Cambia1301-AmGORKPro-GUS轉(zhuǎn)化擬南芥。將收獲的T0代種子播種于含有50 mg/L潮霉素的1/2 MS培養(yǎng)基中,選取能夠長(zhǎng)出綠色真葉,根系較長(zhǎng)的抗性苗移栽到基質(zhì)中。
1.2.7 GUS組織化學(xué)染色 參考Han等[18]的方法,選取T3代純合轉(zhuǎn)基因擬南芥的不同組織置于GUS染色液中,37℃黑暗培養(yǎng)過(guò)夜,用梯度濃度酒精完全脫色,顯微鏡下觀察拍照。
AmGORK的5′側(cè)翼片段的擴(kuò)增由3輪PCR完成(圖2-A),獲得約1 200 bp的序列。然后根據(jù)測(cè)得序列重新設(shè)計(jì)3條引物GP2-1、GP2-2和GP2-3(表1),繼續(xù)向5′側(cè)翼延伸(圖2-B)獲得500 bp左右的序列。將2次測(cè)得的序列拼接,刪除中間重復(fù)片段,得到長(zhǎng)度為1 723 bp的序列,命名為AmGORKpro。
圖2 AmGORK啟動(dòng)子序列的擴(kuò)增Fig. 2 Amplification of AmGORK promoter sequence
根據(jù)上述拼接序列設(shè)計(jì)上游引物AmGORK-pro-F和下游引物AmGORK-pro-R,分別在引物5′端引入KpnⅠ和NcoⅠ酶切位點(diǎn)。以沙冬青基因組DNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增(圖2-C),得到2條約1 700 bp的特異條帶。將上述片段與pEasy-blunt zero載體(TransGen Biotech)連接,轉(zhuǎn)化Trans1-T1,進(jìn)行菌落PCR鑒定,初步確認(rèn)為陽(yáng)性克隆后測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果正確含有AmGORKpro的重組質(zhì)粒保存待用。
利用在線數(shù)據(jù)庫(kù)PlantCARE對(duì)AmGORK啟動(dòng)子序列的結(jié)構(gòu)特征及重要的順式作用元件進(jìn)行分析。結(jié)果(表2)顯示,AmGORK啟動(dòng)子序列包含典型的TATA-box及CAAT-box。此外,還包含ABA響應(yīng)元件ABRE、赤霉素響應(yīng)元件GARE、干旱誘導(dǎo)元件MBS、低溫響應(yīng)元件LTR等各1個(gè),及多個(gè)光響應(yīng)元件。表明AmGORK可能受到干旱、低溫等非生物脅迫或光信號(hào)的調(diào)控。
表2 AmGORK啟動(dòng)子序列預(yù)測(cè)分析Table 2 Prediction analysis of AmGORK promoter sequence
根據(jù)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的花序侵染法,將Cambia1301-AmGORKPro-GUS轉(zhuǎn)化擬南芥。將收獲的T0代種子播種于含有潮霉素的1/2 MS培養(yǎng)基中,提取能夠長(zhǎng)出綠色真葉,根系較長(zhǎng)的抗性苗基因組DNA,進(jìn)行PCR檢測(cè)(圖3),抗性植株的PCR產(chǎn)物與目的條帶大小一致。初步證明目的基因已成功轉(zhuǎn)入擬南芥中。按照上述方法獲得T3代純合轉(zhuǎn)基因株系。
圖3 轉(zhuǎn)AmGORK擬南芥PCR鑒定結(jié)果Fig. 3 PCR validation of AmGORK transgenic A. thaliana
構(gòu)建了Cambia1301-AmGORKpro-GUS植物表達(dá)載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo),將該表達(dá)載體轉(zhuǎn)入擬南芥中,觀測(cè)轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株GUS的表達(dá)情況(圖4),轉(zhuǎn)基因擬南芥的葉片葉柄、葉脈、保衛(wèi)細(xì)胞和莖均有明顯的藍(lán)色GUS染色信號(hào),表明AmGORK的表達(dá)在整個(gè)發(fā)育階段具有連續(xù)性。除了葉片,在主根中柱和花萼也有GUS的表達(dá),表明AmGORK的表達(dá)具有組織特異性,并且主要在輸導(dǎo)組織中表達(dá)。
圖4 轉(zhuǎn)基因擬南芥中AmGORK啟動(dòng)子活性分析Fig.4 Activity analysis of AmGORK promoter in transgenic A. thaliana
為了研究非生物脅迫對(duì)擬南芥中AmGORK啟動(dòng)子活性的影響,對(duì)轉(zhuǎn)AmGORK啟動(dòng)子的擬南芥進(jìn)行PEG或ABA處理。定量表達(dá)分析顯示,PEG處理24 h后,轉(zhuǎn)基因植株葉片的GUS表達(dá)為對(duì)照的3.2倍,ABA處理24 h后,轉(zhuǎn)基因植株葉片的GUS表達(dá)為對(duì)照的4.1倍(圖5)。以上結(jié)果表明,AmGORK啟動(dòng)子活性受PEG或ABA誘導(dǎo)。
圖5 不同處理下轉(zhuǎn)基因擬南芥葉片中GUS的表達(dá)分析Fig. 5 Expression analysis of GUS gene in the transgenic A. thaliana leaves under different treatments
啟動(dòng)子位于基因上游,被RNA聚合酶特異性識(shí)別并結(jié)合的一段DNA序列,在轉(zhuǎn)錄水平,對(duì)基因的表達(dá)起調(diào)控作用。啟動(dòng)子核心區(qū)域一般包括TATA-box和CAAT-box等模塊,這也是啟動(dòng)子的特征序列[19-20]。本研究通過(guò)生物信息學(xué)對(duì)克隆的AmGORKpro序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)該序列含有多個(gè)TATA-box和CAAT-box,說(shuō)明該序列具有典型的啟動(dòng)子特征。除了這些核心特征序列外,啟動(dòng)子中還有很多特異的順式作用元件和非生物脅迫響應(yīng)元件[21-22]。研究結(jié)果顯示,AmGORK啟動(dòng)子序列內(nèi)包含干旱響應(yīng)相關(guān)元件、激素響應(yīng)元件和光響應(yīng)元件等。啟動(dòng)子區(qū)域的干旱誘導(dǎo)響應(yīng)元件、ABA響應(yīng)元件和水楊酸響應(yīng)元件與基因參與的逆境響應(yīng)和對(duì)應(yīng)激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān),而ABA和水楊酸介導(dǎo)植物對(duì)外界環(huán)境的響應(yīng)[23-25]。
擬南芥中2個(gè)外向型鉀離子通道分別為中柱鉀離子外向整流通道(stelar K+outward rectifier channel,SKOR)和GORK,SKOR主要在根中柱鞘和中柱薄壁細(xì)胞中表達(dá)[26]。GORK主要在保衛(wèi)細(xì)胞中表達(dá),進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)其在根、葉、花和花粉中都有表達(dá)[6,8]。本研究結(jié)果顯示,AmGORK組織定位模式與擬南芥GORK基本一致,都在根中柱、葉脈、葉柄等輸導(dǎo)組織中表達(dá)。輸導(dǎo)組織是植物體中擔(dān)負(fù)物質(zhì)長(zhǎng)途運(yùn)輸?shù)闹饕M織,根從土壤中吸收的水分和無(wú)機(jī)鹽分,由輸導(dǎo)組織運(yùn)送到地上各個(gè)部位。植物組織間的物質(zhì)重新分配和轉(zhuǎn)移,也要通過(guò)輸導(dǎo)組織來(lái)進(jìn)行。AmGORK在輸導(dǎo)組織中表達(dá),推測(cè)其可能參與植物水分或養(yǎng)分運(yùn)輸與再分配過(guò)程。此外,AmGORK啟動(dòng)子還存在數(shù)個(gè)“TAAAG”元件,這些元件能夠驅(qū)動(dòng)馬鈴薯鉀通道KST1在保衛(wèi)細(xì)胞中特異性表達(dá)[27],同時(shí),AmGORK在保衛(wèi)細(xì)胞中有強(qiáng)烈的GUS信號(hào),表明AmGORK可能參與保衛(wèi)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)過(guò)程。植物遭遇干旱脅迫時(shí),體內(nèi)ABA含量提高,ABA通過(guò)激活保衛(wèi)細(xì)胞內(nèi)Ca2+、K+及陰離子通道,使保衛(wèi)細(xì)胞內(nèi)離子外流,減少保衛(wèi)細(xì)胞滲透壓,導(dǎo)致氣孔關(guān)閉,從而適應(yīng)水分虧缺[28-29]。蒙古沙冬青幼苗受到PEG模擬水分脅迫及ABA處理2 d后,都能引起AmGORK表達(dá)上調(diào)[12],有報(bào)道顯示,擬南芥外向整流鉀離子通道AtGORK受到干旱脅迫時(shí),表達(dá)量也上調(diào)[8],表明AmGORK可能參與干旱脅迫引起氣孔關(guān)閉過(guò)程。
本研究克隆并鑒定一個(gè)沙冬青外向鉀離子通道AmGORK的啟動(dòng)子,該啟動(dòng)子可以驅(qū)動(dòng)外源基因在植物葉片葉脈、葉柄、氣孔、根系中柱和花萼中表達(dá),且主要集中于葉脈、葉柄和根系的輸導(dǎo)組織。AmGORK啟動(dòng)子活性受PEG和ABA誘導(dǎo)。