王 爽,何 勇,童曉紅,應(yīng)杰政,田志宏*,王以鋒
(1.長江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/濕地生態(tài)與農(nóng)業(yè)利用教育部工程研究中心/澇漬災(zāi)害與濕地農(nóng)業(yè)湖北省重點實驗室,湖北荊州 434025;2.中國水稻研究所/水稻生物學(xué)國家重點實驗室,浙江杭州 311400)
合成生物學(xué)是以系統(tǒng)生物學(xué)為研究基礎(chǔ),利用基因工程和工程學(xué)概念人工設(shè)計和改造現(xiàn)有的生物系統(tǒng),以獲得具有新功能生物體系的一門學(xué)科。近些年,合成生物學(xué)已成為農(nóng)作物改良的重要手段和焦點領(lǐng)域,在提高農(nóng)作物產(chǎn)量、增強(qiáng)作物營養(yǎng)品質(zhì)等方面發(fā)揮著重要作用。
水稻是世界重要的主糧之一,它高度自交、花粉壽命短,作為轉(zhuǎn)基因受體具有生態(tài)安全可控的特性。水稻作為合成生物學(xué)的載體具有以下明顯優(yōu)勢:1)水稻易儲存且蛋白不易因變性降解等導(dǎo)致功能損失;2)水稻產(chǎn)量較高,是我國居民的主食,在水稻上進(jìn)行營養(yǎng)加強(qiáng)是提升全民健康的最便捷方式;3)作為真核生物,水稻具有類似人和動物的加工修飾系統(tǒng),可以保證下游產(chǎn)物的活性;4)水稻高度自交是轉(zhuǎn)基因生態(tài)安全的重要保證。本文綜述了合成生物學(xué)在水稻生物反應(yīng)器上取得的一系列進(jìn)展。
人血清白蛋白(Human scrum albumin,HSA)是一種可溶性、球狀和非糖基化的單體蛋白,主要作為類固醇、脂肪酸和甲狀腺激素的載體蛋白,在穩(wěn)定細(xì)胞外液方面起著重要作用。HSA 在臨床上廣泛用于治療嚴(yán)重?zé)齻?、失血性休克、低蛋白血癥和肝腹水等,也被用于癌癥和艾滋病的輔助治療[1-2]。在過去的幾十年中,各種表達(dá)系統(tǒng)被用來產(chǎn)生HSA,包括大腸桿菌[3]、釀酒酵母[4]、乳桿菌[5]、轉(zhuǎn)基因動物[6]、轉(zhuǎn)基因植物[7-8],雖然在這些系統(tǒng)中成功地表達(dá)了HSA,但它們都沒有實現(xiàn)大規(guī)模、高效、低成本的目標(biāo)。Yang 等成功地在水稻種子中表達(dá)重組人血清蛋白(rHSA),rHSA 水平達(dá)到水稻籽??偪扇苄缘鞍椎?0.58%,大規(guī)模生產(chǎn)rHSA 產(chǎn)生的蛋白純度>99%,生產(chǎn)率為2.75 g·kg-1糙米[9-10]。將得到的OsrHSA 與眾人血漿中提取的血清蛋白(pHSA)進(jìn)行各項物理指標(biāo)的對比,發(fā)現(xiàn)它們具有高度的一致性。在促進(jìn)大鼠細(xì)胞生長和治療肝硬化方面,OsrHSA 的效率與pHSA 相似。此外,OsrHSA 在體外和體內(nèi)的免疫原性與pHSA相似。
人胰島素樣生長因子1(Human insulin-like growth factors 1,hIGF-1)是一種由70 個氨基酸組成的單鏈小肽,是調(diào)節(jié)生長、存活和代謝的主要生長因子[11]。臨床上,hIGF-1 用于有效治療生長激素(GH)受體缺乏、GH 不敏感綜合征、hIGF-1 基因缺失或GH 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路缺陷的患者[12]。此外,hIGF-1可有效用于治療1 型和2 型糖尿病或嚴(yán)重胰島素抵抗綜合癥患者[13]。Xie 等通過轉(zhuǎn)基因水稻植株在種子中高度積累重組人胰島素樣生長因子1(rhIGF-1),達(dá)到種子總蛋白的(6.8±0.5)%[14],相當(dāng)于每粒(136±10)μg。功能分析表明,rhIGF-1 的融合作用在體外可刺激人乳腺癌細(xì)胞系MCF-7的增殖。動物試驗表明,糖尿病小鼠口服未加工的轉(zhuǎn)基因種子可顯著提高血漿IGF-1水平,降低血糖。
纖維素生長因子(Fiber growth factor,F(xiàn)GFs)是一類蛋白質(zhì)家族,與肝素結(jié)合多肽在結(jié)構(gòu)和生物活性上相似。到目前為止,已經(jīng)分離出23 種不同的FGFs[15]。堿性纖維生長因子(Basic fibroblast growth facto,bFGF)是FGFs 的一種,它是一種單鏈蛋白,能刺激NIH/3T3 細(xì)胞的增殖,抑制干細(xì)胞的分化,并可能因其體外增殖,遷移和改變?nèi)藲獾榔交〖?xì)胞收縮表型的能力而在治療哮喘中發(fā)揮重要作用[16];在臨床上,bFGF 廣泛應(yīng)用于加速傷口愈合,也用于心血管和神經(jīng)退行性疾病的有效組織修復(fù)和傷口愈合等方面[17-18]。An 等成功地在水稻胚乳中表達(dá)了重組bFGF,表達(dá)水平達(dá)到99.11~185.66 mg·kg-1糙米[19],進(jìn)一步的研究表明,OsrbFGF 對NIH/3T3 細(xì)胞增殖具有相同的刺激作用。純化的FGF 與其他測試產(chǎn)品也具有相同的體內(nèi)傷口愈合效果。
乳鐵蛋白(Lactoferrin,LF)是80 kDa 鐵結(jié)合糖蛋白的轉(zhuǎn)鐵蛋白家族的一個成員,具有單個多肽鏈和兩個鐵結(jié)合結(jié)構(gòu)域,由乳腺、唾液腺和胰腺分泌,在人(1.0~3.0 mg·mL-1)和哺乳動物的初乳中含量最高。LF是一種多功能蛋白,具有多種生物活性,包括抗菌、抗病毒、調(diào)節(jié)鐵的吸收、調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)和促進(jìn)細(xì)胞生長等,被認(rèn)為是一種新型抗菌、抗癌藥物和極具開發(fā)潛力的食品和飼料添加劑。Nandi 等將一種合成人乳鐵蛋白(HLF)的基因與水稻的glutelin 1啟動子結(jié)合轉(zhuǎn)入水稻中,得到了rHLF 表達(dá)水平為4.5~5.5 g·kg-1糙米的轉(zhuǎn)基因水稻,并且能在水稻中穩(wěn)定遺傳[20-21]。進(jìn)一步分析表明,rHLF 與人類HLF 在一系列的生化和生物物理指標(biāo)高度相同。該產(chǎn)品目前已經(jīng)商業(yè)化,名稱為Lacromin。
人母乳中含有50~400 μg·mL-1溶菌酶(Homan iysozyme,Hlys),這種酶是母乳中最豐富的蛋白質(zhì)之一,可作為一種具有殺菌作用的天然抗感染物質(zhì),在抗菌、抗病毒、止血、消腫止痛及加快組織恢復(fù)功能等方面具有重要的作用。Huang 等通過利用Gt-1啟動子及其信號肽區(qū)域構(gòu)建了Hlys基因相應(yīng)的表達(dá)載體,轉(zhuǎn)入水稻中成功表達(dá)了rHlys[22]。溶菌酶的表達(dá)水平達(dá)到糙米重量的0.6%或可溶性蛋白的45%,并能在后代中穩(wěn)定遺傳。
豬蛔蟲病是由于豬蛔蟲寄生在豬體內(nèi),導(dǎo)致生豬發(fā)育不良,嚴(yán)重者發(fā)育停滯,甚至造成死亡。該病在世界各地都存在并且相對廣泛,是一種危害養(yǎng)豬業(yè)極為嚴(yán)重的寄生蟲病,給養(yǎng)殖戶經(jīng)濟(jì)收入造成巨大的壓力。Yasunobu 等在胚乳特異性GluB-1啟動子的控制下,在水稻胚乳中表達(dá)As16(Ascaris suum 16,一種豬蛔蟲的保護(hù)性抗原)[23]。這種抗原以與霍亂毒素(CT)B 亞單位CTB 的嵌合融合蛋白的形式被生產(chǎn),表達(dá)水平達(dá)到50 μg·g-1糙米。進(jìn)一步實驗表明,將含有As16 的水稻種子喂食小鼠,會引發(fā)小鼠體內(nèi)產(chǎn)生As16特異性的血清抗體免疫應(yīng)答。雖然疫苗的佐劑配方導(dǎo)致未能繼續(xù)提高特異性免疫應(yīng)答,但重組As16能誘導(dǎo)抗體表達(dá),表明利用水稻胚乳生產(chǎn)該疫苗具有可行性。
阿爾茨海默?。ˋlzheimer′s disease,AD)亦稱老年癡呆癥,是一種起病隱匿的進(jìn)行性發(fā)展的神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,主要導(dǎo)致認(rèn)識障礙。AD 的發(fā)生被認(rèn)為是由于淀粉樣β 肽(Aβ)沉積在大腦皮層[24],由于Aβ是一種蛋白質(zhì),AD疫苗是潛在的治療或預(yù)防手段。Yoshida 等將Aβ 基因與綠色熒光蛋白(GFP)結(jié)合后轉(zhuǎn)到水稻中,得到的轉(zhuǎn)基因水稻中Aβ-GFP 融合蛋白最高可達(dá)400 μg·g-1糙米[25]。通過將含有Aβ-GFP 融合蛋白的糙米喂給小鼠來評價Aβ 水稻的免疫原性,結(jié)果發(fā)現(xiàn)口服Aβ 米引起小鼠血清抗Aβ 抗體滴度升高,并且煮熟的Aβ 米并不會降低疫苗的有效性,從而允許其作為一種可食用的疫苗使用,因此Aβ 水稻可作為一種有效地預(yù)防阿爾茨海默病的疫苗。
植物營養(yǎng)素和微量營養(yǎng)素在人體的營養(yǎng)與健康中起著重要作用,但它們往往在不同主食中表現(xiàn)不同程度的缺乏。此外,一些有利于健康的營養(yǎng)物質(zhì)也在糧食作物中缺乏。因此,合成生物學(xué)對于提高糧食作物的營養(yǎng)健康物質(zhì)含量具有重要的應(yīng)用潛力。迄今為止,通過合成生物學(xué)的方法已經(jīng)開發(fā)出富含類胡蘿卜素的“黃金大米”[26-27]、富含花青素的“紫晶米”[28]、富含蝦青素的“蝦青米”[29]等。
花青素屬于生物類黃酮物質(zhì),而黃酮物質(zhì)最主要的生理功能是清除自由基和抗氧化能力,可以作為天然色素和營養(yǎng)強(qiáng)化劑應(yīng)用到食品著色劑、抗衰老化妝品、保健等方面。Zhu 等開發(fā)一種高效的轉(zhuǎn)基因堆積載體系統(tǒng),并利用該系統(tǒng)構(gòu)建了一個由胚乳特異性啟動子驅(qū)動的8 個花青素相關(guān)基因(來自玉米的2 個調(diào)控基因和來自錦紫蘇的6個結(jié)構(gòu)基因),加上一個可選擇的標(biāo)記和一個用于標(biāo)記切除的基因;將該載體轉(zhuǎn)入水稻中產(chǎn)生了一種新的“紫色胚乳稻”(紫晶米);其在胚乳中具有較高的花青素含量和抗氧化活性[28]。該研究為多基因堆積提供了一個高效、通用的工具包,可應(yīng)用于復(fù)雜生物合成途徑,在合成生物學(xué)和改善植物農(nóng)藝性狀方面具有顯著的應(yīng)用潛力。
類胡蘿卜素(carotenoids)是一類重要的脂溶性植物營養(yǎng)素,動物自身不能合成類胡蘿卜素,故在促進(jìn)人類營養(yǎng)和健康方面起著重要作用。流行病學(xué)研究表明,類胡蘿卜素可以降低多種癌癥、代謝綜合征、肥胖、白內(nèi)障及黃斑變性等疾病的發(fā)病率[30]。Ye 等將來自水仙花的八氫番茄紅素合酶(phytoene synthase,psy)基因和來自細(xì)菌中的crtI基因轉(zhuǎn)入水稻中,成功獲得了在水稻胚乳中類胡蘿卜素含量達(dá)到1.6 μg·g-1的“黃金大米”[27]。Paine 等為了提高類胡蘿卜素的含量,將不同植物來源的psy基因在玉米的愈傷組織中表達(dá),發(fā)現(xiàn)玉米和水稻的psy基因?qū)е骂惡}卜素含量最高,胡蘿卜、番茄、胡椒、擬南芥的psy表現(xiàn)為中間功效,水仙花psy表現(xiàn)最低;他們又將玉米、番茄、胡椒、水稻和水仙花psy的cDNAs 轉(zhuǎn)入水稻,發(fā)現(xiàn)在T1代種子種類胡蘿卜素含量最高的是玉米(14 μg·g-1)和水稻(18 μg·g-1),胡椒或番茄psy產(chǎn)生中間的類胡蘿卜素含量,而水仙花psy產(chǎn)生的含量最低(1.2 μg·g-1),這與玉米愈傷中的實驗結(jié)果一致[26]。
蝦青素(astaxanthin)是一種紅色酮類化合物,是一種類胡蘿卜素,也是類胡蘿卜素合成的最高級別產(chǎn)物。在自然界,蝦青素具有最強(qiáng)的抗氧化性。蝦青素主要在一些微藻、細(xì)菌和酵母中合成,但在大多數(shù)高等植物和動物中不合成,因此人類主要從一些海洋食物中獲得蝦青素,如鮭魚、貝類和鱒魚。Zhu 等利用自己開發(fā)的TransGene Stacking II(TGS II)將蝦青素合成途徑的sZmpsy1,sPaCrtI,sCrBKT和sHpBHY四個基因轉(zhuǎn)入水稻中,在水稻胚乳中建立了蝦青素生物合成途徑,使得蝦青素在胚乳中富集,并且具有較高的抗氧化活性[29]。
據(jù)聯(lián)合國經(jīng)濟(jì)與社會事務(wù)部預(yù)測,至2050年,全球人口將增至97億。如果農(nóng)作物產(chǎn)量依然維持在現(xiàn)有水平,屆時,人類必將面臨嚴(yán)重的糧食短缺局面。因此,提高農(nóng)作物產(chǎn)量、改良農(nóng)藝性狀就變得尤為重要。植物的產(chǎn)量與光合作用的效率緊密相關(guān),因此,提高農(nóng)作物的光合作用效率是關(guān)鍵。Shen 等將水稻自身的三個基因:OsGLO3(乙醇酸氧化酶)、OsOXO3(草酸氧化酶)和OsCATC(過氧化氫酶)組合在一起成功構(gòu)建了一條新的光呼吸支路,簡稱GOC 支路;將該支路轉(zhuǎn)化到水稻(GOC 植物)中,通過這三種酶在葉綠體的作用可以將乙醇酸依次完全氧化成CO2,形成一種類似C4植物的光合CO2濃縮機(jī)制;GOC 植物的光合效率、生物量、氮含量和籽粒產(chǎn)量等均得到顯著增強(qiáng);該研究還發(fā)現(xiàn),GOC 水稻在高光條件下更有優(yōu)勢[31]。
雖然合成生物學(xué)在水稻中已經(jīng)取得一系列重大進(jìn)展,但是仍然存在諸多困難和挑戰(zhàn)。比如在利用水稻胚乳生產(chǎn)藥用蛋白方面,目前除HIys、LF 和HSA 已在生產(chǎn)中應(yīng)用外,多存在表達(dá)水平低、純化生產(chǎn)成本較高等問題,導(dǎo)致產(chǎn)業(yè)化困難。
從分子生物學(xué)的角度來看,目前提高水稻胚乳中活性蛋白產(chǎn)量主要的方法在于提高特異性啟動子的啟動效率,以及特異的增強(qiáng)合成活性蛋白的表達(dá)積累。
而在合成代謝產(chǎn)物方面,主要問題是了解生物體中的代謝途徑和關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。盡管有越來越多的植物基因組被測序,但由于缺乏有效的基因功能注釋,使得很難確定編碼完全代謝途徑中關(guān)鍵酶的基因組成。而且組成的合成代謝產(chǎn)物很可能導(dǎo)致細(xì)胞發(fā)育和生長異常。同時,代謝途徑容易受到反饋調(diào)節(jié)等因素的影響。
隨著全球氣候變暖,極端天氣頻繁出現(xiàn)而可能引發(fā)的糧食危機(jī),大力發(fā)展新的科學(xué)技術(shù)保障世界糧食安全日趨緊迫。水稻作為世界上主要的糧食作物之一,改良其農(nóng)藝性狀尤為迫切,目前利用合成生物學(xué)原理提高植物的光合效率是當(dāng)前進(jìn)一步大幅度提高水稻產(chǎn)量的有效手段。如何改造、優(yōu)化當(dāng)前光合作用系統(tǒng),使得光能利用效率提高進(jìn)而增加作物產(chǎn)量,仍是需要我們解決的重大問題。相信合成生物學(xué)的研究將在提高水稻產(chǎn)量、增強(qiáng)營養(yǎng)品質(zhì)等方面發(fā)揮重要作用。