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miR-502-3p通過靶向GTPBP2基因調(diào)控結(jié)直腸癌干細胞增殖與凋亡

2022-02-27 02:03柯超周紅見蔣斌謝興旺張超武漢市第三醫(yī)院胃腸腹壁與疝外科湖北武漢430061
中國腫瘤生物治療雜志 2022年1期
關(guān)鍵詞:細胞周期熒光素酶靶向

柯超,周紅見,蔣斌,謝興旺,張超(武漢市第三醫(yī)院 胃腸腹壁與疝外科,湖北 武漢 430061)

結(jié)直腸癌是常見的消化道惡性腫瘤之一。關(guān)于結(jié)直腸癌的治療方法以外科手術(shù)、放療等為主,雖然提高了患者5 年生存率,但是其遠處轉(zhuǎn)移、復(fù)發(fā)等仍影響患者的治療效果[1-2]。腫瘤干細胞具有自我更新、多向分化、耐藥、高度致瘤等特性,被認為是腫瘤發(fā)生、轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)的種子細胞[3]。目前,眾多學者致力于研究腫瘤干細胞和miRNA 調(diào)控作用,包括如何有效地抑制腫瘤干細胞的發(fā)展,以達到治療腫瘤的目的[4-5]。研究結(jié)果[6]顯示,miRNA(如miR-19、miR-501-5p和miR-744)與腫瘤干細胞發(fā)展有關(guān)。miR-502-3p在胃癌、肺癌等腫瘤中表達失調(diào),與腫瘤細胞增殖、凋亡等有關(guān)[7-8],但是對結(jié)直腸癌干細胞(colorectal cancer stem cell,CCSC)的研究報道尚不清楚。GTP結(jié)合蛋白2(GTP-binding protein 2,GTPBP2)是蛋白質(zhì)合成GTP酶超家族成員,廣泛存在于人體的胰腺、胃、小腸等,且表達水平較高[9],關(guān)于GTPBP2 對CCSC的作用機制尚不明確。鑒于此,本課題用免疫磁珠實驗從結(jié)直腸癌HCT116 細胞中分選出CCSC,探討miR-502-3p 是否通過調(diào)控GTPBP2 基因影響CCSC 增殖、周期和凋亡的分子機制,旨在為結(jié)直腸癌診斷和治療提供參考依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 細胞和主要試劑

結(jié)直腸癌細胞HCT116購于中科院上海細胞庫。胎牛血清、RPMI 1640培養(yǎng)基購于上海聯(lián)碩生物科技有限公司,表皮生長因子(bFGF)、堿性成纖維細胞生長因子(bFGF)購于美國Pepro Tech公司,小鼠抗人CD133和CD44 抗體購于德國Miltenyi 公司,Lipofectamine 2000 試劑盒購于上海研卉生物科技有限公司,miR-NC、miR-502-3p、si-miR-NC、si-miR-502-3p、空載體vector、GTPBP2 過表達載體和引物由上海生工公司設(shè)計合成,TRIzol試劑盒、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、熒光定量PCR(qPCR)試劑盒購于日本TaKaRa 公司,MTT試劑盒、BCA試劑盒、電化學發(fā)光液購于北京索萊寶公司,細胞凋亡檢測試劑盒和細胞周期檢測試劑盒購于江蘇凱基生物公司,Ki67抗體、CDK1抗體、Bcl2抗體、BAX 抗體、GTPBP2 抗體、GAPDH 抗體購于美國Abcam 公司,辣根過氧化物酶(HRP)標記的山羊抗兔IgG、熒光素酶報告基因檢測試劑盒購于艾美捷科技有限公司。

1.2 細胞培養(yǎng)和分選

結(jié)直腸癌HCT116 細胞在37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。當細胞生長匯合度達85%時,加入胰酶進行消化并制備細胞懸液。將結(jié)直腸癌細胞接種于含有2%B27、20 μg/L EGF、20 μg/L bFGF、不含血清的完全培養(yǎng)基中進行培養(yǎng),觀察細胞成球情況,用第3代細胞與小鼠抗人CD133 和CD44 抗體包被的磁珠進行培養(yǎng),采用流式細胞術(shù)分選出雙陽性細胞(CD133+CD44+)和雙陰性細胞(CD133-CD44-)。并檢測CD133+CD44+細胞的表達率。

1.3 細胞轉(zhuǎn)染及分組

將CD133+CD44+細胞接種至6 孔板中(2×105個/孔),參照Lipofectamine 2000試劑盒說明書的方法將miR-NC、miR-502-3p、si-miR-NC、si-miR-502-3p、miR-502-3p+vector 和miR-502-3p+GTPBP2 轉(zhuǎn) 染 至CD133+CD44+細胞中,分別記為miR-NC組、miR-502-3p組、si-miR-NC 組、si-miR-502-3p 組、miR-502-3p+vector組和miR-502-3p+GTPBP2組。轉(zhuǎn)染6 h后更換細胞培養(yǎng)液,培養(yǎng)48 h后進行后續(xù)實驗。

1.4 qPCR法檢測CCSC 中miR-502-3p 和GTPBP2 mRNA的表達

取CD133-CD44-細胞和CD133+CD44+細胞,以及轉(zhuǎn)染成功的各組細胞按照TRIzol法提取細胞中總RNA,檢測濃度和純度后,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,將cDNA 根據(jù)qPCR 試劑盒說明書步驟進行PCR 擴增反應(yīng)。引物序列:miR-502-3p 上游為5′-ACACTC CAGCTGGGAATGCACCTGGGCAAGG-3′,下游為5′-CTCAACTGGTGTCGTGGA-3′;U6上游為5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游為5′-AACGCT TCACGAATTTGCGT-3′ ;GTPBP2上游為5′-CTG GCTGAGGAGGAAATG-3′,下游為5′-CACACG GAGGTCTAGGAAC-3′;GAPDH上游為5′-GAA GGTGAAGGTCGGAGT-3′,下游為5′-GAAGAT GGTGATGGGATTTC-3′。PCR反應(yīng)條件:預(yù)變性95℃30 s;95 ℃5 s,60 ℃30 s,共循環(huán)35次。以U6、GAPDH作為內(nèi)參基因,采用2-ΔΔCt法計算miR-502-3p和GTPBP2 mRNA的相對表達量。

1.5 MTT法檢測CCSC的增殖率

將各組CD133+CD44+細胞接種至96孔板中(5×103個/孔),繼續(xù)培養(yǎng)48 h,每孔加入10 μL MTT試劑,繼續(xù)培養(yǎng)4 h,清除培養(yǎng)液,每孔加入150 μL DMSO試劑。酶標儀檢測波長490 nm處每孔光密度(D)值,計算細胞增殖率(實驗組D值/對照組D值×100%)。

1.6 流式細胞術(shù)檢測CCSC細胞周期和凋亡水平

細胞周期實驗:將miR-NC 組、miR-502-3p 組、miR-502-3p+vector 組、miR-502-3p+GTPBP2 組CD133+CD44+細胞接種至6孔板中(5×105個/孔),PBS清洗后,1 200×g離心5 min后收集上清液,加入乙醇溶液,固定過夜。棄去乙醇溶液,加入PI和RNA酶,避光反應(yīng)15~30 min,上流式細胞儀檢測細胞周期變化。

細胞凋亡實驗:取各組CD133+CD44+細胞(同細胞周期實驗),離心后棄去上清液,采用預(yù)冷PBS 進行清洗,加入PBS重懸細胞,然后與各5 μL的Annexin Ⅴ-FITC和PI染液混勻,避光反應(yīng)15~30 min,置于流式細胞儀檢測細胞凋亡水平。

1.7 WB 法檢測CCSC 中Ki67、CDK1、Bcl2、BAX 和GTPBP2蛋白的表達

取各組CD133+CD44+細胞用蛋白裂解液提取細胞中總蛋白,BCA 法檢測蛋白濃度,水浴煮沸反應(yīng)5 min,以每孔35 μg蛋白上樣,行SDS-PAGE,用半干法轉(zhuǎn)移分離的蛋白質(zhì)至PVDF 膜上,在含5%脫脂奶粉溶液中封閉2 h,在均以1∶1 000 稀釋的Ki67、CDK1、Bcl2、BAX、GTPBP2和GAPDH一抗中4 ℃過夜。次日在1∶2 500稀釋的HRP標記的山羊抗兔IgG二抗室溫下處理2 h,加入電化學發(fā)光液顯色,曝光。以GAPDH 作為內(nèi)參,應(yīng)用凝膠成像軟件掃描,分析蛋白條帶的灰度值。

1.8 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞CmiR-502-3p 與GTPBP2的靶向關(guān)系

通過TargetScan 軟件預(yù)測miR-502-3p 和GTPBP2 之間是否存在互補核苷酸序列。將含有miR-502-3p 結(jié)合位點的GTPBP2 3′UTR 序列克隆至熒光素酶報告基因質(zhì)粒中,構(gòu)建GTPBP2 野生型(GTPBP2 3′UTR WT)和GTPBP2 突變型(GTPBP2 3′UTR MUT)載體。按照Lipofectamine 2000試劑盒說明書步驟與miR-NC 或miR-502-3p 共轉(zhuǎn)染至CD133+CD44+細胞中,6 h后更換細胞培養(yǎng)液,繼續(xù)培養(yǎng)48 h,按照熒光素酶試劑盒說明書步驟檢測轉(zhuǎn)染細胞的熒光素酶活性。

1.9 統(tǒng)計學處理

以上主要實驗均重復(fù)3次。采用SPSS 22.0統(tǒng)計學軟件分析實驗數(shù)據(jù),符合正態(tài)分布的計量數(shù)據(jù)以表示,兩組間數(shù)據(jù)比較采用t檢驗,多組間數(shù)據(jù)比較采用單因素方差分析,以P<0.05 或P<0.01 表示差異有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

2.1 miR-502-3p在CCSC中低表達

利用免疫磁珠分選技術(shù),成功從結(jié)直腸癌HCT116細胞中獲得CD133-CD44-和CD133+CD44+細胞,CD133+CD44+細胞陽性率為94.35%。qPCR 法檢測結(jié)果顯示,CD133+CD44+細胞中miR-502-3p表達水平顯著低于CD133-CD44-細胞(0.36±0.05vs0.99±0.09,t=18.357,P<0.01),因此,后續(xù)實驗選擇CD133+CD44+細胞。

2.2 轉(zhuǎn)染miR-502-3p對CCSC增殖、周期、凋亡及相關(guān)蛋白表達的影響

轉(zhuǎn)染miR-502-3p 后,qPCR 法檢測結(jié)果顯示,miR-502-3p 組CD133+CD44+細胞中miR-502-3p 表達水平顯著高于miR-NC 組細胞(2.87±0.30vs1.00±0.07,t=18.211,P<0.01),表明成功建立miR-502-3p過表達細胞,可以進行后續(xù)實驗。

MTT 法、流式細胞術(shù)和WB 法檢測結(jié)果(表1、圖1)顯示,與miR-NC 組比較,miR-502-3p 組細胞增殖率、S 期細胞比例均顯著降低(均P<0.01),Ki67、CDK1 蛋白表達顯著降低(均P<0.01);細胞凋亡率、G0/G1期細胞比例均顯著升高(均P<0.01),Bcl2蛋白表達顯著降低(P<0.01),BAX 蛋白表達顯著升高(P<0.01)。結(jié)果表明,上調(diào)miR-502-3p 可顯著抑制CCSC增殖、周期進展并誘導(dǎo)細胞凋亡。

表1 上調(diào)miR-502-3p對CCSC增殖、周期和凋亡的影響

圖1 上調(diào)miR-502-3p對CCSC細胞周期及Ki67、CDK1、Bcl2和BAX蛋白表達的影響

2.3 miR-502-3p靶向負調(diào)控GTPBP2表達

TargetScan軟件預(yù)測結(jié)果顯示,miR-502-3p 和GTPBP2 mRNA之間存在互補結(jié)合位點(圖2A)。雙熒光素酶實驗報告基因?qū)嶒灲Y(jié)果顯示,與miR-NC組相比,miR-502-3p 與GTPBP2 3′UTR WT 載體共轉(zhuǎn)染細胞的熒光素酶活性顯著降低(0.41±0.06vs0.99±0.07,t=18.873,P<0.01),而與GTPBP2 3′UTR MUT載體共轉(zhuǎn)染細胞的熒光素酶活性無顯著改變(1.01±0.05vs0.98±0.06,t=1.152,P>0.05)。qPCR 和WB 實驗檢測結(jié)果(圖2B、C)顯示,與miR-NC 組比較,miR-502-3p 組細胞中GTPBP2 mRNA 和蛋白表達水平均顯著降低(t=25.378、17.819,均P<0.01);與si-miR-NC 組比較,si-miR-502-3p 組細胞中GTPBP2 mRNA 和蛋白表達水平均顯著升高(t=29.601、12.348,均P<0.01)。結(jié)果表明,miR-502-3p靶向負調(diào)控GTPBP2表達。

圖2 miR-502-3p靶向負調(diào)控GTPBP2的表達

2.4 過表達GTPBP2可逆轉(zhuǎn)上調(diào)miR-502-3p對CCSC增殖、周期和凋亡的作用

轉(zhuǎn)染GTPBP2 后,qPCR、MTT、WB 和流式細胞術(shù)實驗結(jié)果(圖3、表2)顯示,與miR-502-3p+vector組比較,miR-502-3p+GTPBP2組細胞中GTPBP2 mRNA和蛋白的表達水平均顯著升高(均P<0.01),細胞增殖率、S 期細胞比例均顯著升高(均P<0.01),細胞凋亡率、G0/G1期細胞比例均顯著降低(均P<0.01),細胞中Ki67、CDK1、Bcl2蛋白表達均顯著升高(均P<0.01)、BAX 蛋白表達顯著降低(P<0.01)。實驗結(jié)果表明,過表達GTPBP2 可逆轉(zhuǎn)上調(diào)miR-502-3p 對CCSC 增殖、細胞周期和凋亡的作用。

表2 過表達GTPBP2可逆轉(zhuǎn)上調(diào)miR-502-3p對CCSC增殖、周期和凋亡的影響

圖3 過表達GTPBP2可逆轉(zhuǎn)上調(diào)miR-502-3p對CCSC的作用

3 討論

腫瘤干細胞是一群獨特的細胞亞群,因其具有高度致瘤性而參與腫瘤的發(fā)展,對腫瘤細胞分化、增殖、轉(zhuǎn)移等有重要的作用[10-12]。有研究結(jié)果[13]顯示,miRNA 與CCSC 發(fā)展有關(guān),如miR-451a 在結(jié)直腸癌細胞中表達水平較低,過表達miR-451a降低了CCSC中Ki-67、cyclin D1的表達,抑制CCSC增殖。VILLANOVA 等[14]通過對CCSC 的功能研究發(fā)現(xiàn),miR-1285 通過靶向調(diào)控細胞凋亡相關(guān)蛋白酶2 表達抑制細胞增殖和阻滯周期,誘導(dǎo)細胞凋亡。閻立昆等[15]研究發(fā)現(xiàn),miR-1231 在CCSC 中表達水平降低,過表達miR-1231抑制結(jié)直腸癌細胞增殖、遷移,并促進細胞凋亡。關(guān)于miR-502-3p的研究主要集中在胃癌,如miR-502-3p 在胃癌細胞中低表達,過表達miR-502-3p 能抑制胃癌細胞增殖、遷移和侵襲并誘導(dǎo)細胞凋亡[16],但是對CCSC的作用尚不清楚。本研究利用免疫磁珠分選技術(shù),從結(jié)直腸癌HCT116細胞中分選出雙陰性細胞(CD133-CD44-)和雙陽性細胞(CD133+CD44+),qPCR法檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn),miR-502-3p在CD133+CD44+細胞中表達水平顯著低于CD133-CD44-細胞,說明miR-502-3p 與CCSC發(fā)展有關(guān)。將miR-502-3p 過表達質(zhì)粒轉(zhuǎn)染CD133+CD44+細胞后,結(jié)果發(fā)現(xiàn)細胞增殖率、S期細胞比例顯著降低,細胞凋亡率、G0/G1 期細胞比例顯著升高,細胞中Ki67、CDK1、Bcl2 蛋白表達下調(diào)、BAX 蛋白表達上調(diào),說明上調(diào)miR-502-3p 抑制CCSC 增殖、阻滯細胞周期并誘導(dǎo)細胞凋亡,這與上述研究結(jié)果相似。

GTPBP2 是GTPase 家族四個家族成員之一,其存在于所有真核細胞中,位于人類染色體6p21-12區(qū)域,與蛋白合成、細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、骨架調(diào)節(jié)等密切相關(guān),在人體卵巢、腦、胰腺、骨骼肌等組織中均有表達[10,17-18]。關(guān)于GTPBP2與腫瘤的研究相對較少,主要在人類遺傳學中研究較多[19]。最近的研究結(jié)果[20]顯示,GTPBP2 在非小細胞肺癌組織和細胞中表達上調(diào),其高表達與患者TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān);敲低GTPBP2抑制非小細胞癌肺癌細胞的增殖、遷移和侵襲。但是GTPBP2 在結(jié)直腸癌中的作用尚不清楚。本研究通過在線數(shù)據(jù)庫預(yù)測發(fā)現(xiàn),GTPBP2是miR-502-3p 靶基因,通過雙熒光素報告基因?qū)嶒灪蛁PCR實驗驗證二者的關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-502-3p調(diào)控GTPBP2 的表達。上調(diào)miR-502-3p 降低CCSC中GTPBP2 mRNA和蛋白表達水平,下調(diào)miR-502-3p則上調(diào)GTPBP2 mRNA 和蛋白表達水平,結(jié)果表明miR-502-3p 靶向負調(diào)控GTPBP2 的表達。進一步實驗的結(jié)果顯示,過表達GTPBP2 可以部分逆轉(zhuǎn)上調(diào)miR-502-3p對CCSC增殖、細胞周期和凋亡的作用。

綜上所述,miR-502-3p 在CCSC 中表達下調(diào),miR-502-3p 靶向負調(diào)控GTPBP2 的表達,從而抑制CCSC 的增殖和阻滯細胞周期并促進細胞凋亡。關(guān)于GTPBP2對CCSC作用的具體機制有待深入研究。

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