国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

山羊痘病毒PC R 檢測方法的建立

2022-04-01 08:24趙文年馬蘭英徐全武葉爾加那提漆雯雯齊姍姍張啟耀韓佳佳朱夢瑩葉里哈孜努爾孜哈
草食家畜 2022年2期
關鍵詞:病原敏感性引物

趙文年,劉 雙,馬蘭英,徐全武,葉爾加那提,漆雯雯,齊姍姍,張啟耀,韓佳佳,朱夢瑩,馬 莉,葉里哈孜,努爾孜哈

(烏魯木齊縣畜牧獸醫(yī)站,烏魯木齊 830036)

山羊痘(Goat pox)是一種急性、熱性、高度接觸性傳染病,病原為山羊痘病毒(Goat pox virus,GTPV),癥狀為發(fā)熱、皮膚出現(xiàn)痘疹。 在世界較多國家和地區(qū)常有發(fā)生,造成巨大的畜牧經濟損失[1,2]。 我國農業(yè)部將其確定為一類動物傳染病,世界動物衛(wèi)生組織(OIE)也確定為必須報告的動物傳染病[3]。 新疆也有山羊痘疫情發(fā)生[4]。 近年來,隨著烏魯木齊縣羊養(yǎng)殖數(shù)量增加,流通交易頻繁,個別鄉(xiāng)鎮(zhèn)也有山羊痘發(fā)生。 山羊痘診斷主要依靠臨床癥狀進行判斷,采用疫苗免疫后,部分羊不出現(xiàn)明顯痘疹,但仍然帶毒排毒。 烏魯木齊縣獸醫(yī)實驗室無山羊痘病毒病原檢測能力,出現(xiàn)臨床診斷漏診及病毒污染范圍評估困難。因此,需要建立適合本實驗室條件的檢測方法。本文選取山羊痘病毒p32 基因序列保守區(qū)域作為檢測目的片段,設計、合成一對擴增引物,成功擴增了該目的片段,建立了山羊痘病毒核酸的PCR 檢測方法,為山羊痘病毒的臨床診斷提供實驗室診斷依據(jù)[5]。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 DNA 模板及檢測樣品

羊痘疫苗(批號:2012019)山東綠都生物科技有限公司產品;隨機采集的羊口腔、鼻腔棉試子30 份。

1.1.2 儀器設備與試劑

A100 PCR 儀購自杭州朗基科學儀器有限公司;DYY-6C 型電泳儀購自北京六一儀器廠;GelSMART凝膠儀購自大龍興創(chuàng)實驗儀器有限公司;TIANGEN 2×Taq PCR MasterMix 購自TIANGEN;QIAamp MinElute Virus Spin kit 購自QIAGEN;DL 2000 DNA Marker 購自TaKaRa; 引物由上海生工生物科技有限公司合成;Gold View(1000x)購自浙江博而金科技公司;其余輔助試劑為國產。

1.2 方法

1.2.1 引物設計、合成

參考p32 基因序列及PCR 檢測研究文獻[6,7]以及GenBank 中公布的山羊痘病毒p32 基因序列(MG458381.1),使用DNASTAR,比對保守序列,選取檢測目的片段,用Primer 5.0,設計一對擴增引物,擴增片段預期218 bp。 上游引物:5’GTATTTCTACCAGTTTGAG3’;下游引物:5’CCAATGGATGGGATACAT AGTA 3’;用dd H2O 溶解至100 μmol,-20 ℃保存。

1.2.2 模板DNA 提取

山羊痘疫苗溶解液0.5 mL,按照QIAamp MinElute Virus Spin kit 試劑盒說明書操作,提取山羊痘疫苗DNA,作為模板DNA-20 ℃保存。

1.2.3 PCR 擴增

PCR 擴增反應體系為25 μL。2×Pfu PCR Mix 12.5 μL,上、下游引物各1 μL,模板DNA 5 μL,dd H2O補至25 μL。 PCR 擴增條件為:94 ℃5 min;94 ℃15 s,40 ℃~45 ℃20 s,72 ℃30 s,30 個循環(huán);72 ℃5 min,4 ℃保存。 1%瓊脂糖凝膠電泳PCR 產物,照膠查看擴增條帶大小。

1.2.4 敏感性試驗

模板DNA 用核酸測定儀測定濃度,然后進行10 倍倍比稀釋,各取5 μL 進行PCR 擴增,對方法的最小靈敏濃度進行測試。

1.2.5 樣品檢測

隨機采集的羊口鼻棉試子樣品30 份,提取DNA 后,按照上述方法PCR 擴增,進行山羊痘的診斷,山羊痘疫苗提取DNA 作為陽性對照。

2 結果與分析

2.1 PCR 方法的建立

最終反應條件為94 ℃5 min;94 ℃15 s,43 ℃20 s,72 ℃30 s, 擴增30 個循環(huán);72 ℃5 min;4 ℃保存;檢測結果見圖1。

圖1 GTPV 疫苗的PCR 擴增產物電泳圖

2.2 PCR 的敏感性

核酸測定儀測定提取DNA 的濃度約為1.82×108拷貝/μL (30 ng/μL)。 結果稀釋到105(1.82×105拷貝/μL)仍可檢測出條帶,說明該方法具有較高的敏感性,見圖2。

圖2 PCR 敏感性試驗

2.3 樣品檢測

陽性對照擴增出明顯條帶,隨機采集的羊口鼻棉試子樣品30 份,均未擴增出218 bp 的特異性條帶,見圖3。

圖3 羊口鼻棉試子PCR 檢測試驗

3 討論

2019 年烏魯木齊縣出現(xiàn)山羊痘癥狀羊,經上級實驗室檢測為山羊痘病毒核酸陽性。 建立病原診斷的方法是開展病原流行病學調查和發(fā)病風險預警的重要手段。 因免疫抗體干擾,用血清學檢測方法檢測山羊痘效果也不理想[8,9]。同時血清學檢測方法耗時、試劑盒價格昂貴等原因局限了其在實際當中的應用[8,9]。本方法的建立,為山羊痘的臨床診斷提供實驗室依據(jù)[10]。 但因為實驗室無其它DNA 病毒及核酸,無法使用該方法檢測其它(非羊痘)DNA 病毒,未驗證本方法的實驗特異性。引物的特異性只是通過BLAST 進行了檢索,該方法的特異性為理論結論,存在一定缺陷[11]。

4 結論

本文建立了山羊痘病毒PCR 檢測方法,該方法的敏感性濃度為1.82×105拷貝/μL,可儲備為本實驗羊痘病毒病原檢測方法。

猜你喜歡
病原敏感性引物
CT聯(lián)合CA199、CA50檢測用于胰腺癌診斷的敏感性與特異性探討
玉米雜種優(yōu)勢類群劃分高多態(tài)SSR引物篩選
甜菜全基因組SSR引物的篩選與評價
兒童細菌性腹瀉的病原微生物檢驗結果分析
馬鈴薯SSR引物的開發(fā)、特征分析及在彩色馬鈴薯材料中的擴增研究
有關PCR擴增過程中的疑慮與剖析
新媒體時代培養(yǎng)記者新聞敏感性的策略
何為鹽敏感性高血壓
延安市寶塔區(qū)蘋果白粉病大發(fā)生原因及對策
瞳孔大,決策力差
东乡| 工布江达县| 澎湖县| 滦平县| 汽车| 绥德县| 永兴县| 富阳市| 青河县| 上虞市| 汉源县| 广饶县| 潞城市| 青冈县| 平昌县| 交城县| 赤城县| 巴彦淖尔市| 玉林市| 广平县| 佳木斯市| 乌拉特后旗| 七台河市| 邯郸县| 丰宁| 郓城县| 赞皇县| 安阳市| 银川市| 常德市| 凌源市| 志丹县| 仁寿县| 惠来县| 平遥县| 辉县市| 巩留县| 临泉县| 嘉善县| 潢川县| 来安县|