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大黃素-大黃素甲醚型二蒽酮化合物安全性研究△

2022-09-07 09:51汪祺楊建波文海若馬雙成
中國現(xiàn)代中藥 2022年8期
關(guān)鍵詞:底物黃素純度

汪祺,楊建波,文海若,馬雙成

中國食品藥品檢定研究院,北京 100050

蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)是一種在體內(nèi)廣泛表達于細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶,為胰島素的負調(diào)節(jié)劑,在調(diào)節(jié)胰島素敏感性和能量代謝的過程中起著重要作用,PTP1B 可通過去磷酸化激活胰島素受體或其底物上的酪氨酸殘基,其抑制劑可以改善或延長胰島素的作用,起到降血糖效果。大黃素-大黃素甲醚-二蒽酮(emodin physcion dianthrone,EPD)為有效的PTP1B 抑制劑,反式-EPD(trans-EPD)和順式-EPD(cis-EPD)對PTP1B的半數(shù)抑制濃度(IC50)值分別為(2.77±1.23)、(7.29±2.32)μmol·L-1,是治療2 型糖尿病的潛在有效成分[1]。本課題組前期已從傳統(tǒng)中藥何首烏中分離出trans-EPD 和cis-EPD,同時推測該類成分可能是何首烏發(fā)揮降糖作用的物質(zhì)基礎(chǔ)[2]。此外,已有研究表明,EPD 類具有高度共軛二聚體結(jié)構(gòu)的雙炔酮作為次生代謝產(chǎn)物廣泛存在于陸地和海洋植物、動物和真菌中[3]。因此針對這類成分進行研究,可為相關(guān)新藥開發(fā)和臨床應(yīng)用提供參考。

研究發(fā)現(xiàn),尿苷二磷酸(UDP)-葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶1A1(UGT1A1)為人體內(nèi)源性物質(zhì)膽紅素的唯一代謝酶,當(dāng)其被抑制時可引發(fā)膽紅素代謝異常,造成肝內(nèi)堆積引發(fā)肝損傷[4-8]。本課題組前期研究表明,何首烏中的大黃素-大黃素二蒽酮具有抑制UGT1A1的作用[9]。由于trans-EPD和cis-EPD與大黃素-大黃素二蒽酮結(jié)構(gòu)特征極為相似,因此可能同為UGT1A1酶的底物并對其產(chǎn)生影響。

本研究以trans-EPD 和cis-EPD 為研究對象、UGT1A1 為研究切入點,結(jié)合分子對接、體外酶動力學(xué)實驗及UGT1A1 蛋白和基因變化等結(jié)果,探究trans-EPD 和cis-EPD 是否具有潛在肝毒性風(fēng)險,并從化合物構(gòu)效關(guān)系的角度對這類單體成分進行安全性評價。

1 材料

1.1 儀器

ACQUITY?Ultra Performance LC 型超高效液相色譜儀(Waters 公司);VICTOR X5 型多功能酶標(biāo)儀(PerkinElmer 公司);FQD-96A 型熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)儀(杭州博日科技股份有限公司);Nano-100 型分光光度計(杭州奧盛儀器有限公司);17R型高速低溫離心機(Thermo公司);Vortex-Genie 2 型渦旋振蕩器(Scientific Industries公 司);懸滴GravityPlus ?板及GravityTRAP ?板(Insphero公司);SDC-6節(jié)能型智能恒溫槽(寧波新芝生物科技股份有限公司)。

1.2 肝微粒體、細胞及試藥

人源肝細胞HepaRG(美國菌種保藏中心);大鼠肝微粒體(RLM,BD Gentest 公司);trans-EPD及cis-EPD均由中國食品藥品檢定研究院楊建波博士分離,純度均大于98%;膽紅素(批號100077-201206,純度:99.3%,購自中國食品藥品檢定研究院);磷酸鉀(純度≥98%)、氯化鎂(純度≥98%)、抗壞血酸(純度≥98%)、三羥甲基氨基甲烷(Tris,純度≥98%)、還原型輔酶Ⅱ(NADPH,純度≥98%)、氧化型輔酶Ⅱ(NADPNa2,純度≥98%)、葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G-6-PDH,純度≥98%)及D-葡萄糖-6-磷酸二鈉(G-6-P,純度≥98%)均購自北京百靈威科技有限公司;丙甲菌素(純度≥98%)、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸(UDPGA,純度≥98%)、葡萄糖二酸單內(nèi)酯(純度≥98%)、二甲基亞砜(DMSO,純度≥98%)均購自Sigma Aldrich公司;乙腈、甲醇均為色譜純(默克公司);其他試劑均為分析純(北京化學(xué)試劑廠);0.25%胰蛋白酶-乙二胺四乙酸(trypsin-EDTA)及胎牛血清(FBS)均購自Gibco 公司;瓊脂糖(Spain Biowest公司);10 000×DuRed核酸染料(北京富百科生物技術(shù)有限公司);總RNA提取試劑盒、cDNA 第一鏈合成試劑盒、D2000 DNA Marker、Real SYBR Mixture及2×TaqPCR Mastermix均購于北京厚生博泰生物技術(shù)有限公司;引物由生工生物工程(上海)股份有限公司提供。

2 方法

2.1 分子對接

本課題組前期研究中采用Discovery Studio 2.5軟件BLAST Search 模塊,通過同源模建的方法成功構(gòu)建了UGT1A1 蛋白結(jié)構(gòu),并同時識別出UGT1A1上的9 個活性口袋區(qū)(site A~I)[10]。本研究在此基礎(chǔ)上應(yīng)用該軟件From Receptor Cavities 模塊將trans-EPD 和cis-EPD 單體與UGT1A1 蛋白進行分子對接。由于UGT1A1 為膽紅素唯一代謝酶,因此以膽紅素為陽性對照,以膽紅素對接打分值的80%作為最低標(biāo)準(zhǔn),將打分高于閾值且相互作用模式與原配體相似的化合物定義為UGT1A1底物[11]。

2.2 UGT1A1體外抑制實驗

應(yīng)用本課題組前期已建立的RLM 孵育體系[4-6],研究trans-EPD 和cis-EPD 對UGT1A1 的作用及作用強度,同時啟動Ⅰ、Ⅱ相代謝反應(yīng),以表觀抑制常數(shù)(Ki)為最終評價指標(biāo)。取蛋白質(zhì)量濃度為0.5 mg·L-1的RLM 30 μL,加入系列濃度的膽紅素對照品溶液(0.36~3.35 μmol·L-1)及EPD 單體溶液(trans-EPD 0.05~2.00 μmol·L-1,cis-EPD 0.05~1.50 μmol·L-1),置于37 ℃恒溫水浴預(yù)孵育3 min,同時加入NADPH和UDPGA再生系統(tǒng)(UDPGA終濃度為5 mmol·L-1)。反應(yīng)啟動15 min 后加入含維生素C 200 μmol·L-1的冰乙腈-甲醇(2∶1)600 μL,沉淀蛋白,渦旋1 min 后13 000 r·min-1(離心半徑為5 cm)離心25 min,取上清液1 μL 進行測定,測定方法見文獻[12-13]。每個樣本重復(fù)3次。

以膽紅素及其代謝產(chǎn)物生成總量對應(yīng)其底物濃度作圖,縱坐標(biāo)為加入EPD 后膽紅素代謝速率的倒數(shù)(1/v),橫坐標(biāo)為膽紅素濃度的倒數(shù)(1/S),采用米氏方程雙倒數(shù)法作圖;加入不同濃度EPD 對應(yīng)不同曲線,以不同曲線斜率對膽紅素濃度繪制slop圖,求得Ki[9]。

2.3 HepaRG細胞毒性考察

取對數(shù)生長期的HepaRG 細胞,消化后調(diào)整密度為5×104個/mL接種于96孔板,每孔接種細胞約為5000 個,孵育24 h 后加入trans-EPD 和cis-EPD。設(shè)置空白對照組(不含HepaRG 細胞)、對照組(0.5% DMSO)、trans-EPD(0.1、0.3、1.0、3.0、6.0 nmol·L-1)組和cis-EPD(0.1、0.3、1.0、3.0、6.0 nmol·L-1)組。細胞孵育24 h(5%CO2,37 ℃),每孔加CCK-8 細胞活力檢測試液10 μL,37 ℃避光孵育2 h,采用酶標(biāo)儀于450 nm 處檢測各孔吸光度(A),按公式(1)計算細胞存活率[14],并計算trans-EPD和cis-EPD對細胞的IC50。

2.4 qRT-PCR實驗

細胞培養(yǎng)及給藥同2.3 項下操作,設(shè)對照組、cis-EPD 組和trans-EPD 組,給藥組濃度均為0.1、1.0、10.0 nmol·L-1。細胞經(jīng)EPD 單體處理24 h 后用磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌2次,加入0.25%胰蛋白酶-EDTA消化,離心收集細胞。

以β-肌動蛋白(β-actin)作為內(nèi)參,正向引物:5′-AGCCATGTACGTAGCCATCC-3′,反向引物:5′-ACCCTCATAGATGGGCACAG-3′;UGT1A1 基因正向引物:5′-CTCCCCTGGATTCTCAGACC-3′,反向引物:5′-CCGTGCCACCCACAAAAC-3′;提取RNA后,經(jīng)Nano-100型分光光度計測定濃度和純度。采用cDNA第一鏈合成試劑盒反轉(zhuǎn)錄cDNA,進行qRT-PCR檢測[15]。反應(yīng)程序為95 ℃預(yù)變性10 min;95 ℃變性20 s,55 ℃退火20 s,72 ℃延伸30 s,40個循環(huán)。

2.5 統(tǒng)計學(xué)分析

實驗數(shù)據(jù)均采用SPSS 13.0 軟件處理分析,多組間比較采用單因素方差分析,數(shù)據(jù)以(±s)表示,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

3 結(jié)果

3.1 UGT1A1蛋白分子對接

采用Discovery Studio 2.5 軟件中的LibDock 功能,在確定trans-EPD 和cis-EPD 的對接口袋區(qū)后,對其與UGT1A1 蛋白的對接結(jié)果進行LibDock score值測定,由結(jié)果可知,trans-EPD 和cis-EPD 對接口袋為site F,與膽紅素對接活性區(qū)相同。膽紅素LibDock score 值為108.623(80% 打分閾值為86.898),trans-EPD為101.469,cis-EPD為103.15,均遠高于閾值,因此提示trans-EPD 和cis-EPD 與UGT1A1 的親和能力與膽紅素底物相當(dāng)。此外,由于trans-EPD 和cis-EPD 與膽紅素結(jié)合位點為同一位點site F,存在競爭結(jié)合的可能,因此提示trans-EPD 和cis-EPD 對于UGT1A1 結(jié)合底物膽紅素均可產(chǎn)生影響,使膽紅素代謝受阻,存在引發(fā)肝損傷的風(fēng)險。

trans-EPD 和cis-EPD 分子體積大,剛性強,存在較大的共軛體系(圖1)。分析對接模式發(fā)現(xiàn),trans-EPD 和cis-EPD 均與UGT1A1 中的氨基酸殘基GLY332 形成了碳氫鍵,與ILE343、VAL345 形成了多個Pi-Alkyl 鍵,同時和PHE283 形成了更為穩(wěn)定的Pi-Pi T shape鍵,增大了化合物與UGT1A1的疏水結(jié)合作用。從相互作用方式看,trans-EPD 和cis-EPD與UGT1A1蛋白對接模式基本一致(圖2)。

圖1 trans-EPD和cis-EPD結(jié)構(gòu)

圖2 trans-EPD和cis-EPD與UGT1A1蛋白對接模式

3.2 UGT1A1體外抑制實驗

trans-EPD 和cis-EPD 在RLM 中對UGT1A1 酶的抑制情況見圖3。由實驗結(jié)果可知,trans-EPD 和cis-EPD 對UGT1A1 均表現(xiàn)出競爭型抑制作用,Ki值分別為5.22、11.45 μmol·L-1,抑制作用較強(Ki<1 μmol·L-1,強抑制;Ki>50 μmol·L-1,弱抑制[16]),與分子對接結(jié)果一致。

圖3 trans-EPD和cis-EPD對UGT1A1的影響

3.3 HepaRG細胞毒性結(jié)果

由HepaRG 細胞毒性結(jié)果(圖4)可知,trans-EPD(IC50為3.248 nmol·L-1)和cis-EPD(IC50為3.984 nmol·L-1)IC50值較小,提示具有肝細胞毒性風(fēng)險。體外毒性實驗數(shù)據(jù)與對接篩選結(jié)果相一致。

圖4 trans-EPD和cis-EPD對HepaRG細胞活性的影響(±s, n=3)

3.4 UGT1A1 mRNA表達變化

由結(jié)果可知(圖5),與對照組比較,trans-EPD和cis-EPD 低、中、高濃度下均可下調(diào)UGT1A1 mRNA 表達水平(P<0.05),且作用存在劑量效應(yīng)相關(guān)性。結(jié)合體外UGT1A 抑制實驗和細胞毒性數(shù)據(jù),初步推測trans-EPD 和cis-EPD 可通過作用于UGT1A1 對肝細胞中膽紅素代謝循環(huán)產(chǎn)生影響,存在引發(fā)肝損傷的可能。

圖5 trans-EPD和cis-EPD對HepaRG細胞中UGT1A1 mRNA表達的影響(±s, n=3)

4 討論

在本課題組前期研究的基礎(chǔ)上,本研究以膽紅素的唯一代謝酶UGT1A1 為切入點,針對二蒽酮類成分trans-EPD 和cis-EPD 開展了安全性研究。通過分子對接實驗,證明trans-EPD 和cis-EPD 均與UGT1A1 結(jié)合于site F,該位點同時也為膽紅素的結(jié)合位點,提示其存在與膽紅素爭奪代謝酶的可能。trans-EPD 和cis-EPD 與UGT1A1結(jié)合的LibDock score 值與膽紅素接近,提示兩者與UGT1A1 的親和能力與膽紅素相當(dāng)。分析對接模式發(fā)現(xiàn),trans-EPD和cis-EPD共軛體系較大,分子結(jié)構(gòu)增大的同時剛性增強,2 個化合物均與氨基酸殘基形成了較強的疏水結(jié)合作用;此外共軛體系還與酶蛋白形成了更為穩(wěn)定的Pi-Pi T shape 鍵,增強了化合物與UGT1A1的疏水結(jié)合作用。

體外UGT1A1 抑制實驗結(jié)果顯示,trans-EPD 和cis-EPD 均對UGT1A1表現(xiàn)為競爭型抑制,且抑制作用較強。體外細胞毒性實驗結(jié)果表明,trans-EPD 和cis-EPD 均具有肝細胞毒性作用,低、中、高濃度下可對UGT1A1 mRNA 表達產(chǎn)生顯著抑制作用,并且存在明顯的劑量依賴關(guān)系。

綜上所述,初步推測二蒽酮成分trans-EPD 和cis-EPD 可通過作用于UGT1A1影響膽紅素代謝,進而可能產(chǎn)生肝毒性作用,同時提示具有這類母核結(jié)構(gòu)的化合物可能同樣存在毒性風(fēng)險。本研究結(jié)果將為探討二蒽酮類成分的臨床肝毒性提供參考。

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