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微泡菌ALW1重組β-半乳糖苷酶的異源表達(dá)和酶學(xué)性質(zhì)

2022-10-09 05:47唐桂均李鶴賓朱艷冰姜澤東倪輝李清彪陳艷紅
現(xiàn)代食品科技 2022年9期
關(guān)鍵詞:糖苷酶糖苷底物

唐桂均,李鶴賓,朱艷冰,3,姜澤東,3,倪輝,3,李清彪,3,陳艷紅,3*

(1.集美大學(xué)海洋食品與生物工程學(xué)院,福建廈門 361021)(2.廈門醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系,福建廈門 361023)(3.福建省食品微生物與酶工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廈門市食品生物工程技術(shù)研究中心,福建廈門 361021)

β-半乳糖苷酶(β-galactosidase,EC 3.2.1.23)又稱乳糖酶(Lactase),是一種重要的生物催化劑[1],歸屬于不同糖苷水解酶(Glycoside Hydrolases,GH)家族:GH1、GH2、GH35、GH42和GH59[2]。β-半乳糖苷酶不僅可以通過(guò)水解乳糖中的β-1,4-D-半乳吡喃糖苷鍵以達(dá)到降解乳糖的作用,還可以通過(guò)轉(zhuǎn)糖苷生成具有益生作用的低聚半乳糖(GOS)[3,4]。

乳糖是乳品中重要的碳水化合物,它是以單體分子形式存在于乳品中的雙糖。人體無(wú)法直接吸收雙糖分子,雙糖攝入后,需分解成單糖才可被吸收利用。β-半乳糖苷酶可降解乳制品中的乳糖為半乳糖和葡萄糖,有利于人體的吸收,同時(shí)避免乳制品(如冰淇淋和某些類型的奶酪)在冷藏條件下形成乳糖結(jié)晶[5,6],保證乳制品質(zhì)量。在工業(yè)生產(chǎn)中常利用β-半乳糖苷酶水解乳糖,具有反應(yīng)產(chǎn)物單一、不污染奶源,以及不破壞其他成分等優(yōu)點(diǎn),因此該酶在食品行業(yè)具有重要的應(yīng)用價(jià)值。此外,β-半乳糖苷酶還可以與葡萄糖氧化酶聯(lián)合使用制備生物傳感器,用于測(cè)定牛奶等乳制品中乳糖的含量[7],也可以用于乳清中乳糖的水解,從而減緩乳清排放后對(duì)水造成的污染[8]。

β-半乳糖苷酶在植物、微生物及動(dòng)物體中較為常見(jiàn),大部分β-半乳糖苷酶來(lái)源于微生物[8,9]。來(lái)源于微生物的β-半乳糖苷酶具有高產(chǎn)、低成本、酶源廣等優(yōu)點(diǎn)。在工業(yè)應(yīng)用中,β-半乳糖苷酶存在著穩(wěn)定性差、酶活力不高等問(wèn)題。因此,研究不同微生物來(lái)源的β-半乳糖苷酶,篩選具有優(yōu)良特性的酶具有重要意義[10]。不同來(lái)源的β-半乳糖苷酶具有不同的酶學(xué)特性,包括最適反應(yīng)溫度、最適反應(yīng)pH、溫度穩(wěn)定性、pH穩(wěn)定性等,這也決定了酶的不同用途。例如,黑曲霉來(lái)源的β-半乳糖苷酶在酸性條件下具有好的穩(wěn)定性和酶活力,可用于治療乳糖不耐癥[11];絲狀真菌來(lái)源的β-半乳糖苷酶在堿性條件下酶活力良好,常用于面包發(fā)酵[12]。

在先前的研究中,從腐爛海帶中分離出海洋微泡菌ALW1[13],并進(jìn)行了該菌株的基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)一個(gè)預(yù)測(cè)編碼β-半乳糖苷酶的基因(GenBank收錄號(hào):Mw366919)。本研究對(duì)來(lái)自微泡菌的β-半乳糖苷酶進(jìn)行克隆、表達(dá)和純化,并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行研究,為微泡菌ALW1的β-半乳糖苷酶的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 主要材料

4-硝基苯基-β-D-吡喃半乳糖苷(pNP-Gal)、4-硝基苯基-β-D-葡萄糖醛酸苷(pNP-Glu)、4-硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷(pNPG)、4-硝基苯基-α-L-吡喃巖藻糖苷(pNP-α-L-F)、4-硝基苯基-β-D-吡喃巖藻糖苷(pNP-β-D-F)、4-硝基苯基-β-D-吡喃甘露糖苷(pNPM)和4-硝基苯基-β-D-吡喃木糖苷(pNP-xyl),Sigma-Aldrich公司;Ni-NTA agarose,GE Healthcare Life Sciences公司。

1.2 主要儀器與設(shè)備

Epoch2T酶標(biāo)儀,美國(guó)博騰儀器有限公司;Avanti?J-25冷凍離心機(jī),美國(guó)Beckman公司;Unic3-18K冷凍離心機(jī),Sigma-Aldrich公司;超聲破碎儀,上海虔鈞科學(xué)儀器有限公司;JS-680C凝膠成像系統(tǒng),上海昕瑞有限公司。

1.3 β-半乳糖苷酶的序列分析

利用DNAMAN軟件對(duì)β-半乳糖苷酶的基因序列進(jìn)行分析,使用ExPASy中的ProtParam分析β-半乳糖苷酶的理論分子量和pI,使用SignalP 5.0分析β-半乳糖苷酶的信號(hào)肽。利用BLAST對(duì)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行同源性搜索,使用ClustalX2程序生成蛋白質(zhì)序列的比對(duì)。在碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active Enzyme,CAZy)數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索、下載來(lái)自不同家族的典型β-半乳糖苷酶的基因序列,利用ClustalX2和MEGA7.0軟件構(gòu)建β-半乳糖苷酶的系統(tǒng)發(fā)育樹。

1.4 β-半乳糖苷酶的基因工程表達(dá)菌株構(gòu)建

以微泡菌ALW1的基因組DNA為模板,使用PCR技術(shù)對(duì)β-半乳糖苷酶基因進(jìn)行擴(kuò)增。利用DNA回收試劑盒進(jìn)行純化后,使用EcoRI和SalI分別對(duì)目的基因和表達(dá)載體pET-28a(+)進(jìn)行雙酶切反應(yīng)。目的基因和表達(dá)載體使用DNA回收試劑盒純化后進(jìn)行連接反應(yīng),將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至E. coliDH5α中。轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞均勻涂布于含50 μg/mL卡那霉素的LB固體培養(yǎng)基上,37 ℃培養(yǎng)16 h。經(jīng)菌落PCR驗(yàn)證后,對(duì)插入的序列進(jìn)行測(cè)序分析,將測(cè)序成功的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E. coliBL21中,獲得含有β-半乳糖苷酶基因重組表達(dá)質(zhì)粒的E. coliBL21(DE3)基因工程菌株。

1.5 β-半乳糖苷酶的表達(dá)和純化

將含微泡菌β-半乳糖苷酶基因的E. coliBL21(DE3)按1%(V/V)的接種量接種到250 mL LB培養(yǎng)基(含50 μg/mL卡那霉素)中,37 ℃、180 r/min培養(yǎng)至OD600為0.8時(shí),加入25 μL IPTG(0.5 mol/L),在18 ℃、180 r/min條件下誘導(dǎo)表達(dá)20 h。將發(fā)酵液在4 ℃、8 000 r/min條件下離心10 min,收集菌體沉淀,用10 mL緩沖液(50 mmol/L NaH2PO4、300 mmol/L NaCl、15 mmol/L咪唑,pH 8.0)重懸菌體,冰浴條件下對(duì)菌體進(jìn)行超聲破碎,然后在4 ℃、10 000 r/min條件下離心20 min,收集上清液,即為粗酶液。參照GE Healthcare Life Sciences公司的Ni-NTA使用說(shuō)明書純化重組蛋白。利用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)分析目的蛋白的純度及其分子量大小。蛋白質(zhì)濃度的測(cè)定參照Bradford法[14],使用凝膠過(guò)濾層析法確定β-半乳糖苷酶的天然分子量[15]。

1.6 β-半乳糖苷酶的活力測(cè)定

以pNP-Gal為底物測(cè)定β-半乳糖苷酶的活力。配制2.5 mmol/LpNP-Gal底物溶液(溶于50 mmol/L檸檬酸-Na2HPO4緩沖液,pH值4.5)。90 μL底物溶液中加入10 μL酶液(0.1 mg/mL),在30 ℃反應(yīng)10 min后,立即加入200 μL 1 mol/L Na2CO3溶液終止反應(yīng),在405 nm處測(cè)定吸光度值。每組做三個(gè)平行,以滅活的酶液作為空白組。β-半乳糖苷酶的酶活力單位定義為:在上述條件下,每分鐘釋放1 μmolpNP所需的酶量為1個(gè)酶活力單位(U)。

1.7 重組β-半乳糖苷酶的酶學(xué)性質(zhì)研究

1.7.1 酶的底物特異性

用50 mmol/L檸檬酸-Na2HPO4緩沖液(pH值4.5)配制2.5 mmoL/L的不同人工底物溶液,包括4-硝基苯基-β-D-吡喃半乳糖苷、4-硝基苯基-β-D-葡萄糖醛酸苷、4-硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷、4-硝基苯基-α-L-吡喃巖藻糖苷、4-硝基苯基-β-D-吡喃巖藻糖苷、4-硝基苯基-β-D-吡喃甘露糖苷和4-硝基苯基-β-D-吡喃木糖苷,按1.6的方法測(cè)定酶對(duì)不同底物的活力,研究酶的底物特異性。

1.7.2 溫度對(duì)酶活力和穩(wěn)定性的影響

將β-半乳糖苷酶在不同溫度下(15、20、25、30、35、40和45 ℃)反應(yīng)10 min,測(cè)定酶的活力,研究酶的最適反應(yīng)溫度。為探究β-半乳糖苷酶的溫度穩(wěn)定性,將酶置于不同溫度(4、15、20、25、30和35 ℃)下放置2 h,每隔30 min取樣,測(cè)定酶的殘余活力。以未經(jīng)處理的酶活力定為100%。

1.7.3 pH對(duì)酶活力和穩(wěn)定性的影響

用50 mmol/L不同pH值的緩沖液分別配制2.5 mmol/L的pNP-Gal底物溶液,在不同pH條件下測(cè)定酶的活力,研究酶的最適反應(yīng)pH。為探究β-半乳糖苷酶的pH穩(wěn)定性,將酶分別置于不同pH值的緩沖液中,在25 ℃下放置60 min后,測(cè)定酶的殘余活力。以未經(jīng)處理的酶活力定為100%。

1.7.4 酶的動(dòng)力學(xué)參數(shù)的測(cè)定

用50 mmol/L檸檬酸-Na2HPO4緩沖液(pH值4.5)配制不同濃度(2.5、5、10、15、20、25 mmol/L)的pNP-Gal底物溶液。將β-半乳糖苷酶分別與不同濃度的底物反應(yīng),測(cè)定酶的活力。利用Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法,計(jì)算重組β-半乳糖苷酶的最大反應(yīng)速率(Vmax)與底物親和常數(shù)(Km)。

1.8 化學(xué)添加劑對(duì)酶穩(wěn)定性的影響

將β-半乳糖苷酶分別與不同金屬離子(K+、Ca2+、Mg2+、Ba2+、Zn2+、Cu2+、Mn2+、Al3+和Fe3+)或其他化學(xué)試劑(Triton X-100、吐溫20、吐溫80、SDS、CTAB、β-ME、DTT、EDTA、尿素)混合,使化學(xué)添加劑達(dá)到不同的指定終濃度。酶與化學(xué)試劑25 ℃溫育30 min后,加入pNP-Gal底物,測(cè)定酶的殘余活力。以未添加化學(xué)試劑處理的酶活力定為100%。

1.9 β-半乳糖苷酶的三維建模及酶與pNP-Gal底物的分子對(duì)接

在PDB蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)獲取模板,利用Modeller 9.18構(gòu)建β-半乳糖苷酶的三維結(jié)構(gòu),pNP-Gal的三維結(jié)構(gòu)在NCBI中的PubChem下載pdb文件。應(yīng)用AutoDock進(jìn)行酶與底物的分子對(duì)接,選擇構(gòu)象最佳的對(duì)接結(jié)果,使用Discovery Studio 2019軟件進(jìn)行分析和圖像顯示。

2 結(jié)果與討論

2.1 β-半乳糖苷酶的序列分析

微泡菌β-半乳糖苷酶基因的長(zhǎng)度為141 9 bp,編碼472個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。該蛋白質(zhì)的理論分子量和pI分別為52.8 ku和5.29,該β-半乳糖苷酶不含有信號(hào)肽。蛋白序列的同源性分析表明,微泡菌β-半乳糖苷酶與來(lái)源于Actinoalloteichus hymeniacidonis(AOS64332.1)、Amycolatopsis albispora(AXB42219.1)、AActinoplanessp. N902-109(AGL19093.1)和Amycolatopsis albispora(AXB41531.1)的β-半乳糖苷酶分別具有51%、50%、49%和48%的相似性。蛋白質(zhì)序列比對(duì)分析顯示,β-半乳糖苷酶含有GH1家族的β-半乳糖苷酶典型的氨基酸序列NEP(185-187位氨基酸)和ENG(370-372位氨基酸),其中Glu186預(yù)測(cè)為酸堿催化殘基,Glu370預(yù)測(cè)為親核催化殘基;差異序列主要集中于蛋白質(zhì)中間區(qū)域及C末端(圖1)。采用系統(tǒng)進(jìn)化分析來(lái)確定微泡菌β-半乳糖苷酶所屬家族。利用碳水化合物活性酶家族(CAZy)數(shù)據(jù)庫(kù)中5個(gè)糖苷水解酶(GH)家族的16個(gè)特征性β-半乳糖苷酶構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2)。該酶與來(lái)自Acidilobussp. 7(AMD30575.1)和Acidilobus saccharovorans345-15(ADL19795.1)的β-半乳糖苷酶在同一分支,它們是GH1家族的代表成員。這些結(jié)果表明,本研究中微泡菌β-半乳糖苷酶歸屬于GH1家族。

圖1 微泡菌β-半乳糖苷酶與其他β-半乳糖苷酶蛋白序列的比對(duì)分析Fig.1 Alignment of β-galactosidase from Microbulbifer sp.with other β-galactosidase protein sequences

圖2 β-半乳糖苷酶的系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2 Phylogenetic analysis of β-galactosidase

2.2 β-半乳糖苷酶的表達(dá)和純化

pET-28a(+)表達(dá)質(zhì)粒插入外源基因后,可表達(dá)出帶有多聚組氨酸標(biāo)簽的重組蛋白。含有微泡菌β-半乳糖苷酶基因的E. coliBL21(DE3)經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)和純化后,SDS-PAGE分析顯示,與經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)的含pET-28a(+)陰性菌(圖3,泳道1)相比,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)的含重組質(zhì)粒的陽(yáng)性菌在蛋白理論分子量大小的位置附近有明顯的蛋白表達(dá)條帶(圖3,泳道2),說(shuō)明有目的蛋白表達(dá)。β-半乳糖苷酶大量誘導(dǎo)表達(dá)后,利用超聲進(jìn)行菌體破碎,上清過(guò)Ni-NTA Agarose親和層析柱,獲得重組β-半乳糖苷酶,重組酶的分子質(zhì)量約為64 ku(圖3,泳道3)。使用Sephacryl S-200凝膠過(guò)濾層析法測(cè)定純化的重組酶分子量為64.6 ku。這些結(jié)果表明,微泡菌β-半乳糖苷酶是單亞基蛋白質(zhì)。

圖3 β-半乳糖苷酶基因在大腸桿菌中的表達(dá)Fig.3 Expression of β-galactosidase gene in E. coli

2.3 微泡菌β-半乳糖苷酶的酶學(xué)性質(zhì)

2.3.1β-半乳糖苷酶的底物特異性

根據(jù)酶與不同底物反應(yīng)生成pNP的含量不同來(lái)研究β-半乳糖苷酶的底物特異性。如表1所示,相比于4-硝基苯基-β-D-吡喃半乳糖苷,微泡菌β-半乳糖苷酶對(duì)4-硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷、4-硝基苯基-α-L-吡喃巖藻糖苷的相對(duì)酶活力分別為153.79%和158.16%,對(duì)4-硝基苯基-β-D-葡萄糖醛酸苷、4-硝基苯基-α-L-吡喃巖藻糖苷、4-硝基苯基-β-D-吡喃甘露糖苷、4-硝基苯基-β-D-吡喃木糖苷無(wú)活力。結(jié)果表明,微泡菌β-半乳糖苷酶對(duì)具有立體化學(xué)偏好的芳基-β-糖苷具有特異性作用。

表1 β-半乳糖苷酶的底物特異性Table 1 Substrate specificity of β-galactosidase

2.3.2 溫度對(duì)β-半乳糖苷酶活力和穩(wěn)定性的影響

圖4 溫度對(duì)β-半乳糖苷酶活力和穩(wěn)定性的影響Fig.4 Effect of temperature on the activity and stability of β-galactosidase

溫度對(duì)微泡菌β-半乳糖苷酶活力的影響結(jié)果(圖4a)顯示,β-半乳糖苷酶的最適溫度為30 ℃,在20~40 ℃之間相對(duì)活性保持在60%以上,在45 ℃時(shí),相對(duì)活性急劇下降至13.75%。溫度對(duì)β-半乳糖苷酶穩(wěn)定性的影響結(jié)果(圖4b)顯示,隨著時(shí)間變化,酶的穩(wěn)定性呈下降趨勢(shì)。溫度≤25 ℃時(shí),酶活力下降較慢,在4 ℃和25 ℃放置2 h后,酶分別具有78.26%和38.35%的相對(duì)酶活力。溫度為30 ℃和35 ℃時(shí),酶活力下降顯著,在30 ℃和35 ℃放置30 min后,相對(duì)酶活力迅速分別降至53.05%和7.58%。目前商業(yè)β-半乳糖苷酶大多為中溫酶,而乳品加工中許多工藝以及貯運(yùn)均在低溫下進(jìn)行[16]。朱五二等[17]研究的鹽單胞菌S62來(lái)源低溫β-半乳糖苷酶生成低聚半乳糖的最適反應(yīng)溫度為40 ℃。Turkiewicz等[18]的研究中,Pseudoalteromonassp.22b來(lái)源的低溫β-半乳糖苷酶最適反應(yīng)溫度為40 ℃。與上述報(bào)道的低溫β-半乳糖苷酶相比,本研究中微泡菌β-半乳糖苷酶的最適反應(yīng)溫度相對(duì)較低,且在低溫條件下仍能保留較高的酶活力,因此本研究的β-半乳糖苷酶在乳品加工中具有應(yīng)用潛力。

2.3.3 pH對(duì)β-半乳糖苷酶活力和穩(wěn)定性的影響

圖5 pH對(duì)β-半乳糖苷酶活力和穩(wěn)定性的影響Fig.5 Effect of pH on the activity and stability of β-galactosidase

pH對(duì)微泡菌β-半乳糖苷酶活力的影響如圖5a所示。β-半乳糖苷酶的最適pH為4.5,pH值在4.0~5.5時(shí),相對(duì)酶活力在55%以上。為探究β-半乳糖苷酶的pH穩(wěn)定性,在不同pH條件下對(duì)酶處理1 h。結(jié)果表明(圖5b),β-半乳糖苷酶在pH值4.0~5.0范圍內(nèi)具有良好的穩(wěn)定性,殘余酶活力在80%以上。在以往的報(bào)道中,Erwiniasp. E602來(lái)源β-半乳糖苷酶[19]的最適反應(yīng)pH值為7.0,在pH 4.0下處理1 h后的殘余酶活力為55%;Paracoccus marcusiiKGP來(lái)源β-半乳糖苷酶[20]的最適反應(yīng)pH為8.0,在pH 4.0下處理30 min后無(wú)酶活力。而本研究中微泡菌β-半乳糖苷酶的最適pH相對(duì)較低,且在酸性條件下具有優(yōu)良的穩(wěn)定性。

2.3.4β-半乳糖苷酶的動(dòng)力學(xué)參數(shù)

圖6 β-半乳糖苷酶作用于pNP-Gal的雙倒數(shù)曲線Fig.6 The lineweaver-burk of β-galactosidase acting on pNP-Gal

以pNP-Gal為底物,研究微泡菌β-半乳糖苷酶的動(dòng)力學(xué)參數(shù)。當(dāng)β-半乳糖苷酶與不同濃度的pNP-Gal進(jìn)行反應(yīng)后,通過(guò)計(jì)算反應(yīng)初速度繪制出雙倒數(shù)曲線(圖6),計(jì)算出微泡菌β-半乳糖苷酶的Km和Vmax分別為10.98 mmol/L和7.48 U/mg,高于來(lái)自Akkermansia muciniphila[21]的β-半乳糖苷酶的Km和Vmax。

2.3.5 不同來(lái)源β-半乳糖苷酶的酶學(xué)性質(zhì)比較

不同來(lái)源β-半乳糖苷酶的酶學(xué)性質(zhì)見(jiàn)表2,可以看出,相較于其他來(lái)源的酶,本研究中微泡菌來(lái)源β-半乳糖苷酶的最適反應(yīng)溫度較低,而且酶的溫度穩(wěn)定性不高;該酶在酸性條件下起作用,并在pH值4.0~5.0的條件下具有優(yōu)良的耐酸性,使其更適用于酸性乳清和干酪的水解。動(dòng)力學(xué)參數(shù)比較分析顯示,微泡菌來(lái)源β-半乳糖苷酶具有較高的Km值,該酶的Vmax值高于Lactobacillus plantarumFMNP01和Akkermansia muciniphila來(lái)源的β-半乳糖苷酶,低于Erwiniasp. E602、Paracoccus marcusiiKGP和Lactobacillus curieaeM2011381來(lái)源的β-半乳糖苷酶。

表2 不同來(lái)源β-半乳糖苷酶的酶學(xué)性質(zhì)Table 2 Enzymatic properties of β-galactosidases from different sources

2.4 化學(xué)添加劑對(duì)β-半乳糖苷酶穩(wěn)定性的影響

金屬離子能通過(guò)調(diào)節(jié)催化過(guò)程或酶的結(jié)構(gòu)對(duì)酶活力產(chǎn)生影響[24]。將微泡菌β-半乳糖苷酶利用不同金屬離子處理后,測(cè)定酶的剩余活力。由圖7可得,測(cè)試的金屬離子(包括K+、Ca2+、Mg2+、Ba2+、Zn2+、Cu2+、Mn2+、Al3+和Fe3+)對(duì)β-半乳糖苷酶活力存在不同程度的抑制作用。其中,10 mmol/L的K+、Ca2+、Mn2+處理后,β-半乳糖苷酶保留80%的相對(duì)酶活力;Zn2+和Cu2+處理后,β-半乳糖苷酶幾乎喪失其酶活力,這與來(lái)自Alteromonassp. ML117和Akkermansia muciniphila的β-半乳糖苷酶的研究結(jié)果相似[21,25]。

其他化學(xué)添加劑對(duì)微泡菌β-半乳糖苷酶穩(wěn)定性的影響結(jié)果如表3所示。β-半乳糖苷酶對(duì)非離子型去垢劑吐溫80和低濃度的吐溫20具有良好的穩(wěn)定性,當(dāng)吐溫20濃度為1%時(shí),酶活力提高到157.09%;非離子型去垢劑Triton X-100對(duì)酶活力具有抑制作用。離子型去垢劑SDS和CTAB存在時(shí),β-半乳糖苷酶幾乎喪失活性。還原試劑DTT對(duì)β-半乳糖苷酶活力具有促進(jìn)作用;低濃度的β-ME還原試劑對(duì)酶活力沒(méi)有影響,但高濃度下呈現(xiàn)中等抑制作用。金屬螯合劑EDTA對(duì)β-半乳糖苷酶表現(xiàn)出中等抑制作用,表明它可能是一種對(duì)二價(jià)陽(yáng)離子有一定要求的金屬酶,而對(duì)于來(lái)自Bacillus subtilis的β-半乳糖苷酶[26],EDTA則不會(huì)影響其活力。變性劑尿素強(qiáng)烈抑制β-半乳糖苷酶的活力,2.5 mol/L尿素處理后,酶的活力完全喪失。

圖7 金屬離子對(duì)β-半乳糖苷酶穩(wěn)定性的影響Fig.7 Effects of metal ions on the stability of β-galactosidase

表3 其他化學(xué)添加劑對(duì)β-半乳糖苷酶穩(wěn)定性的影響Table 3 Effects of other chemical reagents on the stability of β-galactosidase

2.5 β-半乳糖苷酶的三維結(jié)構(gòu)及酶與底物的相互作用

將微泡菌ALW1的β-半乳糖苷酶進(jìn)行三維建模,在PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行同源搜索,模板的PDB登入號(hào)為1UYQ,氨基酸殘基的范圍為24-471,與模板序列相似度為42.9%。微泡菌β-半乳糖苷酶的三維結(jié)構(gòu)中觀察到糖苷水解酶GH1家族典型的(α/β)8桶結(jié)構(gòu)域,其中催化殘基Glu186和Glu370被標(biāo)記(圖8a)。

為進(jìn)一步從分子水平上認(rèn)知β-半乳糖苷酶與底物相互作用模式,利用分子對(duì)接研究了pNP-Gal在活性位點(diǎn)處的作用模式。pNP-Gal與β-半乳糖苷酶的分子對(duì)接結(jié)果如圖8b所示,酸/堿催化殘基Glu186和親核催化殘基Glu370在糖環(huán)兩側(cè),Tyr314、Thr315、Glu370和Glu431與pNP-Gal形成氫鍵(圖8b,綠色線條),Tyr314還與底物形成Pi-Pi T型作用力(圖8b,紫色線條)。

圖8 微泡菌β-半乳糖苷酶的三維結(jié)構(gòu)(a)及酶與底物的分子對(duì)接(b)Fig.8 The tertiary structure of β-galactosidase from Microbulbifer sp. (a) and molecular docking of β-galactosidase and pNP-Gal substrate (b)

3 結(jié)論

本研究將來(lái)自微泡菌ALW1菌株的β-半乳糖苷酶進(jìn)行表達(dá)和純化,研究其酶學(xué)性質(zhì)。微泡菌β-半乳糖苷酶歸屬于GH1家族,在溫度低于25 ℃時(shí)具有良好的溫度穩(wěn)定性,在酸性條件(pH值4.0~5.5)下表現(xiàn)出較好的穩(wěn)定性。β-半乳糖苷酶對(duì)還原試劑DTT、一些非離子型去垢劑(吐溫80和吐溫20)顯示良好的穩(wěn)定性。分子對(duì)接提供了微泡菌β-半乳糖苷酶與pNP-Gal底物相互作用模式的深入了解,對(duì)微泡菌β-半乳糖苷酶的應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。

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