郭 巖,馬 建,楊宗政,張?zhí)煊睿瑢O 煒,吳志國
(1.天津津港基礎(chǔ)設(shè)施養(yǎng)護(hù)運(yùn)營(yíng)工程管理有限公司,天津 300456;2.天津科技大學(xué)海洋與環(huán)境學(xué)院,天津 300457;3.天津科技大學(xué)化工與材料學(xué)院,天津 300457)
石油作為運(yùn)輸業(yè)重要的動(dòng)力燃料,其產(chǎn)量與需求量逐年提高。石油生產(chǎn)、儲(chǔ)存及使用等過程中難免會(huì)泄露于外界環(huán)境中[1],因其具有成分復(fù)雜、難降解等特點(diǎn),長(zhǎng)期滯留于環(huán)境中會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的水、土環(huán)境污染[2,3]。石油中包含多種不同的正構(gòu)、異構(gòu)烷烴、多環(huán)芳烴等[4-5],在眾多石油烴污染的修復(fù)方法中,生物修復(fù)法是清除環(huán)境中石油烴污染物最經(jīng)濟(jì)、有效的方法,能夠通過微生物的特異性代謝作用將石油烴轉(zhuǎn)化成無毒的終產(chǎn)物[6-8]。具有石油烴降解能力的菌株種類繁多,但其中有關(guān)分枝桿菌屬的報(bào)道相對(duì)較少,且大多只針對(duì)多環(huán)芳烴類石油烴進(jìn)行了研究。例如,劉沙沙等[9]發(fā)現(xiàn)微黃分枝桿菌對(duì)芘有著良好的增溶與降解作用。Wu等[10]發(fā)現(xiàn)結(jié)核分枝桿菌能夠在以芴和蒽為唯一碳源的培養(yǎng)基中快速生長(zhǎng)并起到良好的降解作用。Sun等[11]發(fā)現(xiàn)嗜芳族分枝桿菌可通過雙加氧酶降解菲。現(xiàn)有研究大多只報(bào)道了分枝桿菌的多環(huán)芳烴降解能力,對(duì)柴油類石油烴的降解研究鮮有報(bào)道,因此針對(duì)分枝桿菌進(jìn)行柴油的降解研究對(duì)該菌屬的降解多樣性具有重要的推動(dòng)作用。
本研究基于含油污泥篩選得到一株柴油降解菌Mycolicibacterium fluoranthenivoransY3,并對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,考察菌株的生長(zhǎng)特性及以柴油為底物的條件下菌株的柴油耐受程度和降解特性,通過GC-MS進(jìn)一步研究其降解能力與機(jī)制,研究結(jié)果可推進(jìn)分枝桿菌屬對(duì)石油烴降解的多樣性并為石油烴污染的原位修復(fù)提供重要種質(zhì)資源。
柴油為車用0#柴油,石油醚為國產(chǎn)分析純,氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(gas chromatography-mass spectrometer,GC-MS)分析用試劑為高效液相色譜純,分子生物學(xué)試劑購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
菌種篩選材料取自天津港南疆污水處理廠(38.97°N,117.77°E),該污水處理廠進(jìn)水常年以港口、船舶含油污水及生活污水為主,污水中所含石油主要為柴油、燃料油等,污水經(jīng)斜板隔油+混凝沉淀處理后得到的含油污泥置于曬泥場(chǎng)晾曬,取曬泥場(chǎng)0~10 cm深處油泥作為菌種篩選材料。
(1)無機(jī)鹽培養(yǎng)基:NaCl 1 g,NH4Cl 1.34g,K2HPO41.5 g,KH2PO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.2 g, 1L去離子水,pH 7.0(固體培養(yǎng)基加20 g/L瓊脂)。
(2)柴油培養(yǎng)基:無機(jī)鹽培養(yǎng)基中添加1%(V/V)柴油。
(3)LB培養(yǎng)基:含牛肉膏5 g,蛋白胨10 g, NaCl 5 g,pH為7.0(固體培養(yǎng)基加20 g/L瓊脂)。
1.2.1 柴油降解菌的篩選
從天津港南疆污水處理廠采集含油污泥作為菌株篩選材料,稱取5 g油泥樣品制成油泥水混合液,將其按5%(V/V)接種量加入到柴油含量為0.5%(V/V)的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,置于30℃搖床上以180 r/min的轉(zhuǎn)速震蕩培養(yǎng)3~5 d,待培養(yǎng)液明顯渾濁后,將培養(yǎng)液以5%(V/V)接種量轉(zhuǎn)接于新鮮的柴油培養(yǎng)基中(柴油濃度依次為:1%、2%、3%),如此共富集培養(yǎng)三輪,取完成富集的菌液梯度稀釋至10-1、10-2、10-3、10-4,10-5、10-6,各吸取200 μL稀釋后菌液均勻涂布于含柴油的無機(jī)鹽固體培養(yǎng)基(無機(jī)鹽固體培養(yǎng)基表面均勻涂布 200 μL柴油)中,30℃培養(yǎng)2~3 d,挑取不同菌落形態(tài)的單菌落連續(xù)純化3次,得到若干株細(xì)菌,分別接種于柴油培養(yǎng)基中,5 d后測(cè)定柴油的降解率,選擇對(duì)柴油降解率最高的菌株命名為Y3(初步柴油降解率為42.5%)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
1.2.2 形態(tài)學(xué)及生理生化鑒定
菌落的生長(zhǎng)狀況、菌株的形態(tài)特征以及菌株的生理生化測(cè)試按照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》進(jìn)行初步判定,并采用掃描電鏡(JSMIT300LV)在10000倍下觀察Y3形態(tài)。
1.2.3 分子生物學(xué)鑒定
采用16S rDNA序列分析方法鑒定Y3菌株,由金唯智生物科技有限公司完成測(cè)序工作,測(cè)序結(jié)果用NCBI Blast程序?qū)⑵唇雍蟮男蛄形募﨨CBI中的已知序列進(jìn)行同源性比對(duì),利用MEGA 7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并在Genebank申請(qǐng)16S rDNA保藏號(hào)。
1.2.4 種子液的獲取
取保存菌種,于LB平板劃線,30℃恒溫培養(yǎng)48 h,挑取單菌落接種于20 mL LB培養(yǎng)基中,于30℃、180 r/min搖床培養(yǎng)12 h。
1.2.5 菌株的生長(zhǎng)特性研究
將種子液以5%接種量接種至LB培養(yǎng)基中,考察在不同初始pH(5、6、7、8、9)、不同溫度(20℃、25℃、30℃、35℃、40℃)、不同NaCl濃度(10 g/L、20 g/L、30 g/L、40 g/L、50 g/L)、不同金屬離子(Cu2+、Zn2+、Mn2+、Co2+、Ni2+各 50 mg/L)等因素對(duì)菌株生長(zhǎng)的影響。各個(gè)試驗(yàn)中的固定條件為:pH=7、溫度為30℃、無NaCl、無金屬離子,NaCl與金屬離子不作為生長(zhǎng)特性試驗(yàn)的主要條件。實(shí)驗(yàn)中以不接菌的LB培養(yǎng)基作為空白對(duì)照,測(cè)定菌株的OD600表征菌量。
1.2.6 柴油降解曲線
將種子液以5%(V/V)的接種量接種于柴油培養(yǎng)基中,30℃、180 r/min培養(yǎng)7 d,以不接菌的柴油培養(yǎng)基為對(duì)照,測(cè)定菌株的OD600及柴油降解率。
1.2.7 接種量對(duì)柴油降解效果的影響
將種子液分別以1%、3%、5%、10%、15%(V/V)的接種量接種于柴油培養(yǎng)基中,30℃、180 r/min培養(yǎng)5d,以不接菌的柴油培養(yǎng)基為對(duì)照,測(cè)定菌株的OD600及柴油降解率。
1.2.8 不同條件對(duì)菌株Y3降解柴油的影響
將種子液以5%接種量接種至柴油培養(yǎng)基中,考察不同柴油濃度(0.5%、1%、2%、3%)、初始pH(5、6、7、8、9)、溫度(20℃、25℃、30℃、35℃、40℃)、外加碳源(葡萄糖、蔗糖、乳糖、碳酸鈉、乙酸鈉,投加濃度均為100 mg/L)、氮源(氯化銨、酵母浸粉、蛋白胨、尿素、硫酸銨、硝酸鈉,投加濃度均為1.34 g/L)等因素對(duì)菌株生長(zhǎng)和降解效果的影響。各個(gè)試驗(yàn)中的固定條件為:柴油濃度1%(V/V)、pH=7、溫度為30℃,碳氮源為外加條件,不作為降解試驗(yàn)的主要條件。以不接菌的柴油培養(yǎng)基作為空白對(duì)照,測(cè)定菌株的OD600及柴油降解率。
1.2.9 菌株Y3降解柴油的組分分析
將種子液以5%接種量接種至柴油培養(yǎng)基,在最優(yōu)條件下(柴油濃度1%(V/V)、30℃、pH=6)培養(yǎng)5 d,利用正己烷萃取最終發(fā)酵液中柴油等有機(jī)組分,在萃取液中加入無水硫酸鈉直至不再結(jié)塊,取上清液適當(dāng)稀釋,于氣相色譜-質(zhì)譜儀測(cè)定發(fā)酵液成分。
1.3.1 柴油的測(cè)定
以石油醚為萃取劑,采用液液萃取的方法,萃取無機(jī)鹽液體培養(yǎng)基中的柴油,并采用紫外分光光度法在225 nm處測(cè)定其濃度[12]。按式(1)計(jì)算柴油降解率。
式中:C0—空白培養(yǎng)基柴油的濃度;C1—實(shí)驗(yàn)培養(yǎng)基柴油的濃度。
1.3.2 氣相色譜-質(zhì)譜儀分析條件
氣相色譜條件(GCMS-QP2020):色譜柱Rxi-5Sil(0.25 mm×30 m×0.25 μm);進(jìn)樣量 1 μL,不分流;柱溫升溫程序:40℃保持5 min,以10℃/min升至290℃,保持10 min,再以15℃/min升至310℃,保持2 min。
質(zhì)譜條件:EI源,離子源溫度220℃,接口溫度200℃。溶劑延遲時(shí)間2.5 min,掃描范圍35~500 amu,自動(dòng)調(diào)諧。
通過柴油培養(yǎng)基培養(yǎng)、篩選和分離,純化得到1株高效柴油降解菌株Y3。通過革蘭氏染色實(shí)驗(yàn)確定菌株Y3為革蘭氏陰性菌,其菌落形態(tài)為圓形,白色,表面濕滑不透明,邊緣整齊,其生理生化特性見表1,掃描電鏡照片及菌落形態(tài)特征如圖1所示。
圖1 菌株Y3形態(tài)圖
表1 菌株的生理生化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
以菌株Y3的DNA為模板,利用通用引物擴(kuò)增得到1387 bp的16S rRNA基因片段。通過在基因序列數(shù)據(jù)庫中的比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)其與Mycolicibacterium fluoranthenivoransFA-4的同源性達(dá)99.78%。將Y3與分枝桿菌進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析如圖2所示,菌株Y3的16S rRNA基因序列GenBank登陸號(hào)為OM149383。
圖2 菌株Y3基于16SrRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
不同溫度、pH、NaCl濃度、金屬離子對(duì)菌株Y3生長(zhǎng)的影響,如圖3所示。
菌株Y3在20~40℃的溫度范圍內(nèi)生長(zhǎng)較好,30℃獲得了最佳生長(zhǎng),屬于中溫菌(圖3-a)。在6.0~8.0的pH范圍內(nèi)菌株生長(zhǎng)良好,pH =6.0條件下菌株獲得最佳生長(zhǎng),pH=5.0的條件下菌株生長(zhǎng)受到嚴(yán)重抑制,說明菌株Y3適宜在中性偏酸性的環(huán)境中生存(圖3-b)。Y3在鹽度范圍為3%以內(nèi)均可生長(zhǎng),具有良好的耐鹽性(圖3-c)。菌株Y3在50 mg/L的Zn2+、Mn2+、Cu2+、Ni2+條件下均能生長(zhǎng),與對(duì)照組相比Co2+完全抑制了菌株的生長(zhǎng),Ni2+、Zn2+、Cu2+的抑制作用相對(duì)較弱,Mn2+則無明顯的抑制作用(圖3-d)。
圖3 菌株的生長(zhǎng)特性
2.3.1 降解曲線
Y3對(duì)柴油的降解曲線,如圖4所示。在7 d的培養(yǎng)過程中,菌株Y3持續(xù)生長(zhǎng),同時(shí)柴油降解率也不斷提高,直至第5 d,OD600達(dá)到最高值,柴油降解率可達(dá)46.7%,隨后趨于平穩(wěn),因此后續(xù)降解實(shí)驗(yàn)時(shí)長(zhǎng)以5 d為宜。
圖4 菌株的柴油降解曲線
2.3.2 菌株的降解特性
由圖5可知,隨著接種量逐漸提高,菌株的OD600和柴油降解率也隨之升高,當(dāng)接種量為10%(V/V)時(shí),菌株的OD600和柴油降解率最高,接種量超過10%(V/V)時(shí),菌株的生長(zhǎng)量和柴油降解率略有降低(圖5-a)。由此可知,單純提高接種量并不能顯著提升菌株的柴油降解率,接菌量過大,會(huì)引起細(xì)菌競(jìng)爭(zhēng)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)而使部分細(xì)菌死亡[13]。當(dāng)接種量為5%,柴油濃度在1%(V/V)以內(nèi),菌株Y3生長(zhǎng)旺盛,對(duì)柴油的降解率均在40%以上,而隨著柴油濃度的提升,菌株的生長(zhǎng)受到抑制,OD600僅為0.7左右,降解率大幅下降,后續(xù)實(shí)驗(yàn)均選擇1%(V/V)柴油濃度進(jìn)行(圖5-b)。菌株Y3在30℃條件下柴油降解率最高,可達(dá)48.1%,溫度為20℃和40℃時(shí),發(fā)酵液相對(duì)澄清,Y3的生長(zhǎng)與降解能力明顯下降 (圖5-c)??梢姕囟冗^高或過低,都會(huì)抑制微生物的代謝活動(dòng)[14]。在pH為5的高酸性環(huán)境,菌株Y3難以生長(zhǎng),對(duì)柴油的降解率僅有10%,而在pH為6的弱酸環(huán)境下,Y3對(duì)柴油的降解效果最好,降解率可達(dá)55%(圖5-d)。碳酸鈉對(duì)Y3降解柴油的促進(jìn)效果明顯,柴油降解率由47.2%提升至71.2%(圖5-e)。氯化銨為Y3降解柴油過程中的最佳氮源(圖5-f)。
圖5 菌株Y3的降解特性
長(zhǎng)期的含柴油、燃料油潮濕泥土環(huán)境使菌株耐受碳?xì)浠衔镂廴经h(huán)境,而柴油富含長(zhǎng)鏈烷烴,且燃料油中約含有52%的芳烴組分,使其很難被生物降解[15],從此環(huán)境中篩選得到的菌株Y3也由此具備了良好的碳?xì)浠衔锃h(huán)境耐受性與降解能力。與未接菌的對(duì)照CK相比,在最適培養(yǎng)條件下培養(yǎng)5 d后菌株Y3對(duì)柴油中各組分(C10-C32)均有一定的降解效果,柴油各單一組分發(fā)生明顯變化(圖6)。菌株Y3對(duì)柴油中的直鏈烷烴具有良好的降解效果,均達(dá)到30%以上的降解率,其中正十六烷、正十九烷、正三十二烷的降解率分別達(dá)到47.8%、71.2%與51.2%,Y3對(duì)支鏈烷烴也有著一定降解能力,其中2,6,10-三甲基十三烷降解率高達(dá)57.6%(圖7)。與菌株Y3相比,Ivanovaa等[16]篩選得到的嗜酸分枝桿菌對(duì)輕質(zhì)低粘度油(體積分?jǐn)?shù)為0.5%~1%)的正構(gòu)烷烴和異烷烴降解率分別為99%和44%, Kim等[17]利用Mycobacterium vanbaalenii-PYR-1菌株對(duì)十二烷、十三烷、十六烷、二十烷、二十四烷、二十五烷和二十八烷(體積分?jǐn)?shù)為1%)進(jìn)行降解,發(fā)現(xiàn)其對(duì)十二烷、十三烷降解速度最快,分別為62%和68%,而其他烷烴降解率為20%~30%。這與菌株Y3降解特性相似,這種降解趨勢(shì)在大多數(shù)代謝烷烴的分枝桿菌中較為典型[18]。但值得注意的是,以上研究中菌株對(duì)烷烴的降解時(shí)間分別長(zhǎng)達(dá)28 d和30 d,而Y3僅用5 d即達(dá)到上述水平,可見Mycolicibacterium fluoranthenivoransY3有較高的烷烴降解效率。
圖6 柴油降解的GC-MS分析
圖7 菌株Y3對(duì)柴油各組分利用情況
鑒于上述研究的分析比較結(jié)果以及分枝桿菌對(duì)多環(huán)芳烴降解研究的普遍性[19,20],可見MycolicibacteriumfluoranthenivoransY3具有較為獨(dú)特與高效的石油烴降解能力,同時(shí),螢蟲分枝桿菌(Mycolicibacterium fluoranthenivorans)的柴油烷烴降解特性是首次進(jìn)行研究,填補(bǔ)了分枝桿菌降解柴油相關(guān)研究的空白,對(duì)分枝桿菌屬修復(fù)石油烴污染的研究具有重要的推動(dòng)意義。
(1)從天津港南疆污水處理廠含油污泥中篩選得到MycolicibacteriumfluoranthenivoransY3菌株,具有良好的耐鹽性以及耐Mn2+的能力。
(2)Y3能耐受3%(V/V)的柴油,在柴油濃度為1%(V/V)、接種量為10%(V/V)、溫度為30℃、pH為6.0的條件下,降解柴油第5 d可達(dá)50.1%的降解率。
(3)Y3可降解柴油中所有的碳?xì)浠衔铮–10-C32),能夠較好地利用直鏈或支鏈烷烴,在柴油等石油烴污染修復(fù)領(lǐng)域具有良好的應(yīng)用價(jià)值。