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貓泛白細(xì)胞減少癥病毒PCR檢測(cè)方法的建立

2022-10-29 12:22王利霞扈嘉琪鄔源泉楊文祥
關(guān)鍵詞:白細(xì)胞試劑盒引物

王利霞,扈嘉琪,王 平,鄔源泉,田 輝,楊文祥*

(1.湖北省疾病預(yù)防控制中心(應(yīng)用毒理湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室),湖北武漢 430070;2.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué),新疆烏魯木齊 830052;3.武漢科前生物股份有限公司,湖北武漢 430070)

0 引言

貓泛白細(xì)胞減少癥是由貓泛白細(xì)胞減少癥病毒(Feline panleukopenia virus,F(xiàn)PV)引起的一種高度接觸性急性傳染病,也稱(chēng)貓瘟熱、貓細(xì)小病毒病,該病在自然條件下可感染貓科、浣熊科和鼬科等家貓、野貓及野生動(dòng)物包括動(dòng)物園內(nèi)如虎、獅、豹、浣熊等動(dòng)物,患病動(dòng)物表現(xiàn)為高熱、嘔吐、腹瀉和白細(xì)胞明顯減少等癥狀。

FPV屬于細(xì)小病毒科、細(xì)小病毒屬,于1928年首次被發(fā)現(xiàn),1935年被正式命名為貓泛白細(xì)胞減少癥病毒。該病毒傳染性極強(qiáng),可通過(guò)糞便、尿液、嘔吐物、唾液、鼻涕等進(jìn)行傳播,可垂直傳播,亦可通過(guò)跳蚤等蟲(chóng)媒傳播,可致妊娠母貓流產(chǎn)或畸胎,死亡率高。

貓?jiān)诜诸?lèi)學(xué)上屬于動(dòng)物門(mén)、哺乳綱、食肉目、貓科、貓屬。貓具有獨(dú)特的生物學(xué)特征,早在19世紀(jì)末,就有科學(xué)家將貓用于動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。目前,廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,尤其是在神經(jīng)類(lèi)、心血管類(lèi)藥物、降壓物質(zhì)檢驗(yàn)等領(lǐng)域,有著不可替代的地位?!吨袊?guó)藥典》規(guī)定貓是藥品檢驗(yàn)——藥品降壓物質(zhì)檢查實(shí)驗(yàn)的唯一實(shí)驗(yàn)用動(dòng)物。

雖然貓被廣泛應(yīng)用于實(shí)驗(yàn),但目前缺乏實(shí)驗(yàn)用貓相應(yīng)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn),僅有部分省份制定了地方標(biāo)準(zhǔn),湖北省在實(shí)驗(yàn)用貓標(biāo)準(zhǔn)這一塊尚為空白?,F(xiàn)在用于實(shí)驗(yàn)的貓多來(lái)源于農(nóng)貿(mào)市場(chǎng),遺傳背景不清楚,微生物和寄生蟲(chóng)等病原攜帶情況不明確,貓的質(zhì)量難以得到有效保障,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性、重復(fù)性無(wú)法保證。

因FPV是侵害貓的重要病原微生物,該病的發(fā)病率和死亡率均較高,嚴(yán)重影響貓的健康,本研究旨在建立一種針對(duì)FPV的快速高效的PCR檢測(cè)方法,用于篩選健康的實(shí)驗(yàn)用貓,進(jìn)而保障實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行,同時(shí)為湖北省實(shí)驗(yàn)用貓地方標(biāo)準(zhǔn)制定提供技術(shù)支撐。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 毒株與樣品。貓泛白細(xì)胞減少癥病毒(FPV)、貓皰疹病毒(Feline herpes virus,F(xiàn)HV)、貓冠狀病毒(Feline coronavirus virus,F(xiàn)CV)來(lái)自武漢科前生物股份有限公司;疑似FPV感染貓臨床樣品來(lái)自華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)院和華星動(dòng)物醫(yī)院(武漢大學(xué)店)。

1.1.2 主要儀器和試劑。D2000 DNA Marker、2×Taq plus Master Mix(含染料)購(gòu)自北京蘭杰柯科技有限公司;血液基因組DNA提取試劑盒、微量樣品基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。PCR 儀、凝膠成像分析系統(tǒng)購(gòu)自美國(guó) Bio-RAD公司;超微量紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)購(gòu)自美國(guó)丹諾爾Denovix公司。

1.2 方法

1.2.1 引物設(shè)計(jì)及合成。根據(jù)GenBank上FPV基因組(ID:KP769859.1)的保守序列VP2 基因,使用NCBI在線(xiàn)設(shè)計(jì)引物,序列為FPV-F:5’-TGGAAAACGGATGGGTGGAAA-3’;FPV-R:5’-TCCATGGAGTTGGTATGGTTGG -3’,目的片段長(zhǎng)度為465 bp,引物由武漢賽維爾生物科技有限公司合成。

1.2.2 病毒DNA及樣品DNA的提取。FPV、FHV、FCV按照血液基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)提取DNA,疑似FPV感染貓臨床樣品按照微量樣品基因組DNA提取試劑盒提取DNA。

1.2.3 PCR檢測(cè)方法的建立。構(gòu)建PCR擴(kuò)增體系25μL:2×Taq plus Master Mix 12.5μL,模板3μl,引物FPV-F和FPV-R(10μm/L)各0.2μl,雙蒸水補(bǔ)足25μl。95℃預(yù)變性3min;95℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸60s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸5min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),目的片段送武漢賽維爾生物科技有限公司測(cè)序。

1.2.4 PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化。以提取的FPV基因組為模板,設(shè)置48.0℃,48.8℃,50.3℃,52.6℃,55.4℃,57.6℃,59.1℃,60.0℃共8個(gè)退火溫度進(jìn)行PCR反應(yīng),確定最佳復(fù)性溫度。

1.2.5 PCR的敏感性檢測(cè)。利用超微量紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)測(cè)定提取的FPV基因組濃度,將FPV基因組DNA連續(xù)10倍稀釋進(jìn)行PCR擴(kuò)增,凝膠電泳分析結(jié)果,確定PCR反應(yīng)的敏感性。

1.2.6 PCR的特異性檢測(cè)。以構(gòu)建的最佳PCR反應(yīng)條件對(duì)FHV、FPV和FCV進(jìn)行PCR擴(kuò)增,凝膠電泳分析結(jié)果。

1.2.7 臨床樣品檢測(cè)。在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)院和華星動(dòng)物醫(yī)院(武漢大學(xué)店)共采集了8份貓的肛拭子樣品,臨床診斷為疑似FPV感染。按照微量樣品基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)對(duì)肛拭子樣品進(jìn)行基因組DNA提取,使用本研究建立的PCR方法進(jìn)行檢測(cè)和結(jié)果分析。

2 結(jié)果

2.1 PCR檢測(cè)方法的建立

引物FPV-F和FPV-R成功擴(kuò)增出FPV的VP2基因目的片段,約500bp,與預(yù)期基因片段長(zhǎng)度相符,見(jiàn)圖1。

圖1 PCR擴(kuò)增結(jié)果

2.2 PCR產(chǎn)物的鑒定及分析

PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果顯示獲得有效序列片段442bp,經(jīng)BLAST分析,與GenBank公布的貓泛白細(xì)胞減少癥病毒HN39AA株VP2基因序列(ID:MK357738.1)同源性為98%,與設(shè)計(jì)引物的靶基因序列同源性為97%。

2.3 PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化

通過(guò)設(shè)置不同的退火溫度,優(yōu)化PCR的擴(kuò)增條件,結(jié)果如圖2 所示,8個(gè)退火溫度均能夠擴(kuò)增到明顯目的帶,但是在55.4℃時(shí),目的帶的亮度最高,因此確定55℃為最佳退火溫度。

圖2 PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化

2.4 PCR的敏感性檢測(cè)

原始FPV基因組的質(zhì)量為4.42 ng/μL,經(jīng)連續(xù)10倍稀釋后作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示PCR的最低檢測(cè)量為4.42×10-5ng/μL,見(jiàn)圖3。

圖3 PCR的敏感性檢測(cè)

2.5 PCR的特異性檢測(cè)

選擇臨床上常見(jiàn)的感染貓的FHV、FPV、FCV進(jìn)行特異性實(shí)驗(yàn),同時(shí)設(shè)陰、陽(yáng)性對(duì)照。結(jié)果顯示,僅FPV可以擴(kuò)增到特異性條帶(圖4)。

圖4 PCR的特異性檢測(cè)

2.6 臨床樣品檢測(cè)

采集8份疑似FPV感染的貓肛拭子樣品,提取DNA后,采用本研究建立的PCR檢測(cè)方法進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示2份樣品為FPV陽(yáng)性(圖5)。

圖5 臨床樣品檢測(cè)

3 結(jié)論

貓泛白細(xì)胞減少癥常表現(xiàn)為白細(xì)胞計(jì)數(shù)嚴(yán)重減少和腸炎伴腸絨毛退化,具有高度傳染性,并伴有高發(fā)病率和高死亡率。隨著貓?jiān)絹?lái)越多地應(yīng)用到科學(xué)研究和藥物檢測(cè)中,增加了貓瘟等傳染性疾病傳播流行的潛在風(fēng)險(xiǎn)。PCR方法具有敏感、特異、技術(shù)成熟等優(yōu)點(diǎn),便于在臨床使用。

本研究通過(guò)優(yōu)化PCR反應(yīng)的退火溫度,確定最佳反應(yīng)條件,并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行了測(cè)序分析,確定PCR反應(yīng)可以有效擴(kuò)增到目的片段。同時(shí)對(duì)PCR檢測(cè)方法的敏感性和特異性進(jìn)行了檢測(cè),確定該P(yáng)CR反應(yīng)的靈敏度高、特異性好,并進(jìn)行了初步的臨床應(yīng)用,該方法適用于貓泛白細(xì)胞減少癥病毒的檢測(cè)。

目前,標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物如大鼠、小鼠、豚鼠、兔、犬、猴等,均有相應(yīng)的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)對(duì)其微生物和寄生蟲(chóng)檢測(cè)指標(biāo)做了規(guī)定,但缺乏貓的相應(yīng)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn),我省擬制定實(shí)驗(yàn)用貓的相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)。貓泛白細(xì)胞減少癥病毒作為對(duì)貓健康狀況有重大影響的一個(gè)病毒,是我省實(shí)驗(yàn)用貓需要檢測(cè)的微生物項(xiàng)目,本研究方法的建立將為地方標(biāo)準(zhǔn)的制定提供技術(shù)支撐。

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