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革蘭染色與MALDI-TOF MS在快速鑒定兒童陽性血培養(yǎng)病原菌種類中的應(yīng)用

2022-11-15 06:20:50宋文琪孟慶盈甄景慧
檢驗醫(yī)學(xué) 2022年10期
關(guān)鍵詞:陽性菌陰性菌革蘭

楊 溪, 宋文琪, 董 方, 孟慶盈, 甄景慧, 周 為

(國家兒童醫(yī)學(xué)中心 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院檢驗科,北京 100045)

血流感染是一種嚴(yán)重的全身感染性疾病,病死率高、預(yù)后差。全球每年約有300萬的新生兒患有敗血癥,死亡率為11%~19%[1]。2016年,我國因敗血癥死亡的≤5歲兒童占總死亡例數(shù)的2.5%[2]。及時、準(zhǔn)確地診斷兒童血流感染非常重要。目前,臨床診斷兒童血流感染的重要實驗室依據(jù)仍為血培養(yǎng)結(jié)果,該方法需將報陽后的血培養(yǎng)轉(zhuǎn)種至固體培養(yǎng)基,培養(yǎng)24~48 h,甚至更長時間后,分離出單個菌落,再進(jìn)行細(xì)菌鑒定,結(jié)果報告周期長。而將陽性血培養(yǎng)物直接進(jìn)行革蘭染色鏡檢可了解病原菌的初步判斷結(jié)果,但是不能鑒定出具體菌種。有研究發(fā)現(xiàn),將無菌體液樣本中的病原菌進(jìn)行富集處理后,再使用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)進(jìn)行快速鑒定,可以大大縮短細(xì)菌鑒定時長。本研究以轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后的鑒定結(jié)果為標(biāo)準(zhǔn),對革蘭染色鏡檢和MALDI-TOF MS直接快速鑒定結(jié)果進(jìn)行比較,為臨床提供快速、準(zhǔn)確的兒童血流感染實驗室診斷依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 樣本收集

收集2019年2月—2020年10月首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院臨床送檢的陽性兒童需氧血培養(yǎng)瓶。質(zhì)控菌株大腸埃希菌(ATCC 8739)和大腸埃希菌(ATCC 25922)、糞腸球菌(ATCC 19433)、光滑念珠菌(ATCC MYA-2950)、金黃色葡萄球菌(ATCC 25923)購自法國生物梅里埃公司。

1.2 儀器和試劑

美國BD公司兒童需氧血培養(yǎng)瓶(BD BACTEC Peds Plus/F Culture Vials)和BACTEC FX全自動血培養(yǎng)系統(tǒng),鄭州安圖公司哥倫比亞血瓊脂平板、麥康凱瓊脂平板、巧克力瓊脂平板(不加抗菌藥物),法國生物梅里埃公司MALDI-TOF MS儀、MS-DS靶板、α-氰基-4-羥基肉桂酸(alpha-cyano-4-hydroxy-cinnamic acid,CHCA)基質(zhì)、甲酸和革蘭染色液,德國布魯克公司Sepsityper Kit,日本奧林巴斯公司BX53(LED)生物顯微鏡。

1.3 方法

1.3.1 轉(zhuǎn)種培養(yǎng) 用1 mL一次性無菌注射器從陽性兒童需氧血培養(yǎng)瓶中抽取0.5 mL液體,同時接種于哥倫比亞血瓊脂平板、麥康凱瓊脂平板、巧克力瓊脂平板(不加抗菌藥物),分區(qū)劃線,置于35 ℃ 5%~10% CO2孵箱中孵育18~24 h。再用MALDI-TOF MS儀對培養(yǎng)出的單個菌落進(jìn)行鑒定,嚴(yán)格按照儀器說明書操作。

1.3.2 革蘭染色鏡檢 用1 mL一次性無菌注射器從陽性兒童需氧血培養(yǎng)瓶中抽取0.5 mL液體進(jìn)行革蘭染色涂片鏡檢。

1.3.3 MALDI-TOF MS快速鑒定 從陽性兒童需氧血培養(yǎng)瓶中抽取1 mL液體,采用Sepsityper Kit進(jìn)行前處理。具體操作方法為:將1 mL陽性兒童需氧血培養(yǎng)瓶中的液體注入eppendorf管中,加200 μL Lysis Buffer,漩渦震蕩15 s,混勻后16 200×g離心2 min,棄上清,在沉淀中加入1 mL Washing Buffer,漩渦震蕩30~60 s至沉淀完全溶解,16 200×g離心1 min,棄上清,取沉淀。將沉淀物點入MS-DS靶板,加1 μL MSCHCA基質(zhì)(若為真菌,則先加0.5 μL甲酸,再加1 μL MS-CHCA基質(zhì)),自然干燥后上機(jī)鑒定。嚴(yán)格按儀器說明書要求進(jìn)行操作。結(jié)果判斷:MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果分為3種顏色,綠色表示唯一的鑒定結(jié)果,可信概率為60.0%~99.9%;黃色表示低分辨率結(jié)果,可信概率>60.0%,需要進(jìn)一步通過補(bǔ)充試驗確認(rèn);紅色表示不能鑒定,可信概率<60.0%,與數(shù)據(jù)庫的任何質(zhì)譜數(shù)據(jù)均不匹配。

1.4 統(tǒng)計學(xué)方法

采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析,計數(shù)資料用例或率表示,比較采用χ2檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 轉(zhuǎn)種培養(yǎng)結(jié)果

共收集166例陽性兒童血培養(yǎng)樣本,其中單一菌樣本162例(97.6%),2種菌樣本4例(2.4%)。162例單一菌樣本中,檢出革蘭陽性菌95株(58.6%),以凝固酶陰性葡萄球菌最多(61.1%);革蘭陰性菌63株(38.9%),以腸桿菌科細(xì)菌最多(76.2%);酵母樣真菌4株(2.5%),包括3株白念珠菌和1株近平滑念珠菌;見表1。4例2種菌樣本轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后的鑒定結(jié)果見表2。

表1 162例單一菌樣本3種方法鑒定結(jié)果比較

表2 4例2種菌樣本3種方法鑒定結(jié)果

2.2 革蘭染色鏡檢結(jié)果

與轉(zhuǎn)種培養(yǎng)結(jié)果比較,162例單一菌樣本中,革蘭染色鏡檢結(jié)果符合率為97.5%(158/162),其中革蘭陽性菌符合率為97.9%(93/95),革蘭陰性菌符合率為96.8%(61/63),酵母樣真菌鑒定符合率為100.0%(4/4);4例2種菌樣本革蘭染色鏡檢結(jié)果與轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后結(jié)果一致。見表1、表2。

2.3 MALDI-TOF MS快速鑒定結(jié)果

與轉(zhuǎn)種培養(yǎng)結(jié)果比較,162例單一菌樣本中,MALDI-TOF MS快速鑒定結(jié)果符合率為85.2%(138/162),其中革蘭陽性菌鑒定符合率為81.1%(77/95),革蘭陰性菌鑒定符合率為92.1%(58/63),酵母樣真菌鑒定符合率為75.0%(3/4);4例2種菌樣本MALDI-TOF MS快速鑒定只能鑒定出其中1種菌。MALDITOF MS快速鑒定法對革蘭陰性菌的鑒定符合率明顯高于革蘭陽性菌,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見表1、表2。

2.4 不同報陽時長(time to positivity,PPT)MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果比較

162例單一菌樣本平均TTP為21 h,其中革蘭陽性菌樣本平均TTP為23 h,革蘭陰性菌樣本平均TTP為18 h,酵母樣真菌樣本平均TTP為28 h。TTP≥21 h與TTP<21 h比較,MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果符合率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。不同TTP條件下,MALDI-TOF MS鑒定革蘭陰性菌的符合率差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),鑒定革蘭陽性菌的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。不同PPT質(zhì)譜鑒定結(jié)果見表3、表4。

表3 不同TTP MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果比較 例

表4 不同TTP革蘭陰性菌樣本MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果比較 例

3 討論

在臨床微生物實驗室常規(guī)工作中,當(dāng)出現(xiàn)血培養(yǎng)陽性時,需將陽性血培養(yǎng)樣本從血培養(yǎng)儀中取出進(jìn)行革蘭染色鏡檢,并在2 h內(nèi)將革蘭染色結(jié)果報告給臨床,同時將報陽樣本轉(zhuǎn)種至固體培養(yǎng)基,待培養(yǎng)18~24 h或長出單個菌落時,再進(jìn)行菌種鑒定和體外藥物敏感性試驗,該過程一般耗時1~2 d。革蘭染色鏡檢可在短時間內(nèi)獲知有無細(xì)菌,以及細(xì)菌大致的類型(革蘭陽性球菌、革蘭陰性菌或真菌),但是革蘭染色鏡檢影響因素較多,易導(dǎo)致結(jié)果的誤判誤報[3-4]。而MALDI-TOF MS可以直接將陽性血培養(yǎng)樣本中的病原菌鑒定到種,樣本前處理方法包括去污劑選擇裂解法、滲透壓選擇裂解法、分離膠分離法、濾膜過濾分離法,操作簡單、方便快捷,均可在1 h內(nèi)獲得細(xì)菌鑒定結(jié)果[5-6]。

本研究收集的162例單一菌兒童需氧血培養(yǎng)陽性樣本中最常見的病原菌為革蘭陽性菌,占58.6%,革蘭陰性菌占38.9%,酵母樣真菌占2.5%,與多數(shù)兒科醫(yī)院血流感染病原菌分布[7-11]結(jié)果相似,均是以革蘭陽性菌為主,最常見的是凝固酶陰性葡萄球菌(48.21%~55.7%)。但相關(guān)文獻(xiàn)顯示,2018—2019年全國血流感染病原菌以革蘭陰性菌(72.1%)為主,最常見的為大腸埃希菌(37.2%)和肺炎克雷伯菌(17.0%),可能與就診患者年齡差異有關(guān)[7-11],提示兒童血流感染病原菌與成人有所不同。

本研究以轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后的鑒定結(jié)果為標(biāo)準(zhǔn),革蘭染色鏡檢結(jié)果符合率為97.5%(158/162),有4例樣本與轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后結(jié)果不一致,1株屎腸球菌與1株唾液鏈球菌被誤報為革蘭陰性桿菌,2株鮑曼不動桿菌被誤報為革蘭陽性菌,考慮可能與細(xì)菌形態(tài)不典型、染色偏差和鏡檢者缺乏臨床經(jīng)驗有關(guān)[3-4];MALDI-TOF MS鑒定結(jié)果符合率(85.2%)低于革蘭陰性菌(92.1%),但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),與相關(guān)文獻(xiàn)結(jié)果[5,12-14]基本一致。本研究結(jié)果顯示,MALDITOF MS快速鑒定除凝固酶陰性葡萄球菌外的革蘭陽性菌的符合率可達(dá)89.2%(33/37)。MALDI-TOF MS快速鑒定革蘭陽性菌的符合率較低,可能與樣本前處理方法不當(dāng)或與數(shù)據(jù)庫局限性有關(guān)。CORDOVANA等[14]發(fā)現(xiàn),可以通過改良Sepsityper Kit中樣本前處理的步驟來提高M(jìn)ALDI-TOF MS對革蘭陽性菌的鑒定符合率,如將Lysis Buffer的用量減半,或在使用Lysis Buffer和Washing Buffer的間隙增加一步水洗的過程,從而提高革蘭陽性菌的鑒定符合率。也有研究發(fā)現(xiàn),可以通過提取法和優(yōu)化數(shù)據(jù)庫等方法提高M(jìn)ALDI-TOF MS對革蘭陽性菌的鑒定符合率[15-17]。本研究結(jié)果顯示,當(dāng)TTP<21 h時,MALDI-TOF MS與傳統(tǒng)血培養(yǎng)鑒定符合率較高(P<0.05),與相關(guān)研究結(jié)果[13,18]一致;當(dāng)TTP<21 h時,MALDI-TOF MS鑒定革蘭陰性菌的符合率更高;但不同TTP條件下,MALDITOF MS快速鑒定革蘭陽性菌與傳統(tǒng)血培養(yǎng)符合率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。

TORRES等[19]發(fā)現(xiàn),陽性血培養(yǎng)的革蘭染色結(jié)果可以作為臨床早期調(diào)整經(jīng)驗性抗感染治療的依據(jù),但是通過MALDI-TOF MS快速鑒定可以明顯提高最終接受正確抗菌藥物治療的患者比例(P=0.008)。NIWA等[20]的研究結(jié)果顯示,與傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)種培養(yǎng)相比,通過MALDITOF MS快速鑒定血培養(yǎng)樣本中的病原菌,并將結(jié)果及時通知臨床,可以更早地指導(dǎo)臨床調(diào)整用藥方案,如將廣譜抗菌藥物改為有針對性的窄譜抗菌藥物、停止不恰當(dāng)或過度的抗菌藥物治療,從而將患者得到有效和最優(yōu)化的抗感染治療方案的時間分別縮短13.3和38.4 h;肝毒性、腎毒性和血小板減少等不良事件的發(fā)生率(分別為3.8%、1.1%和0%)與傳統(tǒng)轉(zhuǎn)種培養(yǎng)法(分別為12.2%、5.0%和4.4%)相比明顯降低(P<0.05);同時,臨床治療失敗率也由33.3%降至14.0%(P<0.05)。對于兒科患者來說,陽性血培養(yǎng)樣本中革蘭陰性桿菌的TTP是患兒住院死亡率、敗血癥休克的獨立危險因素,對于兒科患者來說,陽性血培養(yǎng)樣本中革蘭陰性桿菌的TTP是其患敗血癥休克的獨立危險因素,TTP越短,患兒的住院死亡率越高,住院費用也會相應(yīng)增加[21-22]。所以,快速鑒定兒童陽性血培養(yǎng)病原菌有重要的臨床意義。

革蘭染色鏡檢可以在短時間內(nèi)告知臨床病原菌的類別,但不能具體到種屬;而采用MALDI-TOF MS可以直接將陽性血培養(yǎng)樣本中的病原菌鑒定到種。本研究采用Sepsityper Kit進(jìn)行樣本前處理僅需要幾分鐘,操作簡便、易于標(biāo)準(zhǔn)化。檢驗人員在報告革蘭染色鏡檢結(jié)果的同時,通過MALDI-TOF MS可直接報告細(xì)菌鑒定的結(jié)果。本研究中,有4株菌革蘭染色鏡檢結(jié)果與轉(zhuǎn)種培養(yǎng)后的結(jié)果不一致,但是經(jīng)過MALDI-TOF MS快速鑒定,此4株菌均被正確鑒定到種。對于MALDI-TOF MS未能鑒定出結(jié)果的樣本,革蘭染色鏡檢結(jié)果均與轉(zhuǎn)種培養(yǎng)結(jié)果相符。但是,雖然MALDI-TOF MS能快速地將陽性血培養(yǎng)中的病原菌鑒定到種,但也存在局限性,如對于沙門菌只能鑒定到屬,無法區(qū)分志賀菌與大腸埃希菌,真菌鑒定率低,對于2種菌樣本大多數(shù)只能鑒定出其中1種菌。本研究只收集到4例含酵母樣真菌的陽性血培養(yǎng)樣本,MALDI-TOF MS鑒定符合率為75.0%(3/4)。而有研究共收集到194例含酵母樣真菌的陽性血培養(yǎng)樣本,鑒定符合率僅為37.1%(72/194),但是通過優(yōu)化樣本前處理,可將其鑒定符合率提高至89.5%(68/76)[14]。許春燕等[5]的研究結(jié)果顯示,MALDI-TOF MS真菌的種鑒定率也僅為32.4%(12/37)。本研究共收集到4例含有2種菌的陽性血培養(yǎng)樣本,MALDI-TOF MS均只能鑒定出其中1種菌。但有研究發(fā)現(xiàn),含2種菌的陽性血培養(yǎng)樣本中有12.5%~32.8%的樣本使用MALDI-TOF MS快速鑒定法能同時鑒定出其中所有的病原菌[12,14]。有學(xué)者通過將含2種菌的陽性血培養(yǎng)樣本進(jìn)行短時培養(yǎng),再用MALDITOF MS進(jìn)行快速鑒定,可將鑒定符合率提高至86.0%(43/50)[23]。

綜上所述,革蘭染色可以在短時間內(nèi)對兒童陽性血培養(yǎng)中病原菌的類別做出初步判斷,而MALDI-TOF MS快速鑒定可以將其鑒定到種。革蘭染色與MALDI-TOF MS均可在短時間內(nèi)對兒童陽性血培養(yǎng)中的病原菌做出快速判斷,從而為臨床及時診治兒童血流感染提供實驗室依據(jù),降低血流感染患兒病死率。

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