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北京市肺結(jié)核病人耐藥篩查實(shí)施效果的研究

2022-12-14 10:10陳雙雙代小偉田麗麗楊新宇趙琰楓易俊莉張紅偉王嫩寒李傳友丁北川
關(guān)鍵詞:利福平表型結(jié)核病

陳雙雙, 代小偉, 田麗麗, 楊新宇, 趙琰楓, 陳 昊, 易俊莉, 張紅偉, 王嫩寒, 李傳友, 丁北川

據(jù)世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)估算,2019年我國(guó)利福平耐藥結(jié)核病患者數(shù)為6.5萬例,占全球利福平耐藥患者數(shù)的14%,位居全球第2位[1]。耐多藥或利福平耐藥結(jié)核病(multidrug/rifampicin-resistant tuberculosis,MDR/RR-TB)傳播時(shí)間長(zhǎng)、治愈率低、病死率高,給結(jié)核病控制帶來極大的挑戰(zhàn)[2]。近年來肺結(jié)核發(fā)病率位居北京市乙類傳染病的首位,是首都重點(diǎn)防治的重大傳染病,其中MDR/RR-TB的防治是我市乃至全國(guó)結(jié)核病控制的難點(diǎn)和重點(diǎn)問題。

根據(jù)《“十三五”全國(guó)結(jié)核病防治規(guī)劃》要求,為進(jìn)一步提高耐藥肺結(jié)核患者的發(fā)現(xiàn)、治療和管理水平,北京市開展所有病原學(xué)陽性肺結(jié)核患者的耐藥篩查工作(具體篩查流程見圖1)。為了解2019年北京市耐藥結(jié)核病篩查方案實(shí)施以來的效果,及RR-TB患者對(duì)其他抗結(jié)核藥物的耐藥情況,以便進(jìn)一步完善耐藥結(jié)核病的快速篩查流程,本文對(duì)2019年北京市結(jié)核病防治機(jī)構(gòu)及定點(diǎn)醫(yī)院所有的結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis, MTB)臨床分離株進(jìn)行比例法藥物敏感性試驗(yàn),從而為今后耐藥結(jié)核病防治策略及治療方案提供理論基礎(chǔ)。

圖1 北京市利福平耐藥肺結(jié)核患者發(fā)現(xiàn)流程Fig.1 Identification process of patients with RR-TB in Beijing

1 材料與方法

1.1 資料來源 搜集北京市結(jié)核病防治機(jī)構(gòu)及定點(diǎn)醫(yī)院2019年1月至12月可疑肺結(jié)核病患者臨床標(biāo)本中分離的MTB 1 174株,進(jìn)行3種抗結(jié)核藥物[利福平(RFP)、異煙肼(INH)、左氧氟沙星(LFX)]的比例法藥敏試驗(yàn),篩選出RFP耐藥株進(jìn)行研究分析。采用回顧性研究的方法,分析RFP耐藥的86株MTB對(duì)應(yīng)的86例RR-TB患者診療實(shí)踐過程中耐藥篩查Xpert試驗(yàn)、Hain檢測(cè)及比例法藥敏試驗(yàn)的執(zhí)行情況。所有菌株均經(jīng)抗酸染色及PNB/TCH方法鑒定為MTB,同一例患者有多個(gè)樣本時(shí),只選取第1個(gè)樣本進(jìn)行試驗(yàn)及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。

根據(jù)中華人民共和國(guó)衛(wèi)生行業(yè)標(biāo)準(zhǔn) WS 196-2017[3]所有結(jié)核病患者,分為初治和復(fù)治。1)初治結(jié)核病患者:指初次發(fā)現(xiàn)肺結(jié)核且未接受抗結(jié)核藥物治療,或不規(guī)則抗結(jié)核治療療程<1個(gè)月的患者。2)復(fù)治患者:指不規(guī)則抗結(jié)核治療≥1個(gè)月,或初治失敗和復(fù)發(fā)的患者。3)按照《北京市耐藥結(jié)核病的快速篩查流程》所有肺結(jié)核疑似病人(包括Xpert陰性培養(yǎng)陽性病人),均需進(jìn)行RFP耐藥篩查, 本文中漏診率是指:按照本研究比例法藥敏試驗(yàn)結(jié)果得到的利福平耐藥病人在臨床診療中未被判定為RFP耐藥的比例;漏篩率是指按照本研究比例法藥敏試驗(yàn)結(jié)果得到的利福平耐藥病人在診療過程中未進(jìn)行RFP耐藥篩查的比例。

1.2 儀器與試劑 GeneXpert技術(shù)反應(yīng)盒及樣品試劑均購(gòu)自美國(guó)Cepheid公司。GenoType MTBDRplus ver 1.0試劑盒及GT-Blot 48雜交儀均購(gòu)自法國(guó)生物梅里埃公司。所有改良羅氏培養(yǎng)基均購(gòu)自河南賽諾特生物技術(shù)有限公司。

1.3 基因Xpert檢測(cè)試驗(yàn) Xpert檢測(cè)參照產(chǎn)品說明書,將2 mL痰液根據(jù)標(biāo)本性狀加入1~2倍體積前處理液消化后放入檢測(cè)試劑盒,由儀器2 h內(nèi)自動(dòng)報(bào)告是否檢出MTB,以及利福平是否耐藥。

1.4 線性探針MTBDRplus(簡(jiǎn)稱Hain)檢測(cè)試驗(yàn) 采用超聲裂解法提取陽性培養(yǎng)物中的MTB-DNA。取5 μL提取后的DNA加入45 μL擴(kuò)增混合物,按照說明書的擴(kuò)增程序進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增完成后取20 μL擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行雜交,雜交過程包括化學(xué)變性、雜交孵育、洗滌、偶聯(lián)和顯色等。根據(jù)顯色結(jié)果進(jìn)行耐藥情況的判讀。判讀標(biāo)準(zhǔn):27個(gè)反應(yīng)條帶中,所有野生條帶均顯色且突變條帶無顯色時(shí)為敏感;野生條帶缺失不顯色或突變條帶顯色為耐藥。

1.5 比例法藥物敏感性試驗(yàn) 參照《結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)程》[4]培養(yǎng)陽性菌株均采用比例法進(jìn)行藥敏試驗(yàn)。藥物濃度分別為INH(0.20 μg/mL),RFP(40 μg/mL),LFX(2 μg/mL),對(duì)照培養(yǎng)基為中性改良羅氏培養(yǎng)基。 耐藥百分比(%)=(含藥培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的菌落數(shù)/ 對(duì)照培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的菌落數(shù))×100%。耐藥判定標(biāo)準(zhǔn):若耐藥百分比≥1% 時(shí)判定為耐藥,<1%判定為敏感。

1.6 質(zhì)量控制 每批藥敏試驗(yàn)均利用標(biāo)準(zhǔn)株H37Rv進(jìn)行質(zhì)量控制。實(shí)驗(yàn)室每年參加中國(guó)疾病預(yù)防控制中心結(jié)核病參比實(shí)驗(yàn)室組織的藥敏試驗(yàn)熟練度測(cè)試,成績(jī)均為優(yōu)秀。

1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 使用Excel 2016軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)收集和整理,SPSS 19.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。計(jì)數(shù)資料采用率表示,組間采用χ2檢驗(yàn)及Fisher確切概率法,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;兩種檢驗(yàn)方法的一致率=(觀察符合例數(shù)/觀察總例數(shù))×100%。

2 結(jié) 果

2.1 培陽患者耐藥篩查基本情況 2019年1-12月北京市19家結(jié)核病定點(diǎn)醫(yī)療機(jī)構(gòu)共分離MTB 1 174株,全部進(jìn)行比例法藥敏試驗(yàn)篩出利福平耐藥株為86株,利福平耐藥率為7.33%(86/1 174),其中初治患者為80.23%(69/86)。耐多藥結(jié)核病(multidrug—resistant tuberculosis,MDR-TB)患者的分離株為64株,2019年北京市MTB耐多藥率為5.45%(64/1 174)。

比例法藥敏試驗(yàn)中利福平耐藥株對(duì)應(yīng)的86位患者Xpert試驗(yàn)及結(jié)果如表1, Xpert陽性病例與表型藥敏試驗(yàn)利福平耐藥檢出的一致率為88.57%(62/70),初復(fù)治在4組Xpert試驗(yàn)不同情況中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.50,P>0.05)。

表1 Xpert試驗(yàn)在表型耐藥RR-TB患者中的分布Tab.1 Distribution of Xpert test in patients with phenotype-resistant RR-TB

按照北京市耐藥篩查流程,16例MTB分離培養(yǎng)陽性且Xpert試驗(yàn)結(jié)果為陰性或未進(jìn)行Xpert試驗(yàn),應(yīng)取分離培養(yǎng)的MTB菌株進(jìn)行快速Hain試驗(yàn)以補(bǔ)充篩查利福平耐藥情況,其中有3例患者進(jìn)行了Hain試驗(yàn)且結(jié)果為利福平耐藥,86例RR-TB中經(jīng)Xpert和Hain兩種分子生物學(xué)方法快速篩查出65例,2例Xpert陰性和1例無Xpert結(jié)果后期培養(yǎng)陽性患者,取培養(yǎng)物進(jìn)行了表型藥敏試驗(yàn),剩余10例未進(jìn)行任何分子和表型方法的臨床藥敏篩查,漏篩率為11.63%(10/86),詳情見表2。2019年全年經(jīng)耐藥篩查工作發(fā)現(xiàn)RR-TB 68例,8例Xpert為利福平敏感而表型藥敏為利福平耐藥,以比例法藥敏試驗(yàn)為金標(biāo)準(zhǔn),通過耐藥篩查工作RR-TB患者發(fā)現(xiàn)率為79.07%(68/86),其中分子生物學(xué)方法RR-TB患者發(fā)現(xiàn)率為75.58%(65/86),漏診率為20.93%(18/86)。

表2 Xpert試驗(yàn)陰性及未進(jìn)行Xpert試驗(yàn)的RR-TB中耐藥篩查情況Tab.2 Screening of drug resistance in RR-TB with negative Xpert test and without Xpert test

2.2 MTB耐藥性檢測(cè)結(jié)果分析 1 174株MTB中比例法藥敏檢測(cè)肼耐藥為144株,MDR為64株,異煙肼耐藥菌株中MDR為44.44%,RR中MDR為74.42%。RR耐藥株中MDR比例明顯高于異煙肼耐藥株,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=20.04,P<0.05)。

以表型藥敏結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),根據(jù)2021年WHO最新發(fā)布的準(zhǔn)廣泛耐藥(pre-extensive drug resistance tuberculosis,pre-XDR-TB)的新定義,符合MDR/RR-TB外,同時(shí)對(duì)任意氟喹諾酮類藥品(包括左氧氟沙星、莫西沙星)耐藥。86株RR臨床分離株中LFX耐藥為20株,準(zhǔn)廣泛耐藥率為1.70%(20/1174),在RR-TB中準(zhǔn)廣泛耐藥率為23.26%(20/86)。初復(fù)治在3種不同耐藥類型中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.02,P>0.05),見表3。

表3 不同耐藥類型的分布情況Tab.3 Distribution of different resistance types

3 討 論

北京市結(jié)核病防治機(jī)構(gòu)及定點(diǎn)醫(yī)院2019年利福平耐藥株占全年MTB的7.33%,較2009年的9.5%[5]有所下降,遠(yuǎn)低于吉林省的17.23%[6],這與上海地區(qū)相似[7],說明我市RR-TB耐藥狀況處于較低水平且逐步改善。這可能與我市2011年起對(duì)疑似耐多藥患者進(jìn)行免費(fèi)一二線抗結(jié)核藥物藥敏試驗(yàn),從而制定針對(duì)性的治療方案有關(guān)。

表型藥敏耐藥的86例RR-TB患者中,Xpert陽性檢出MTB為70例,其中利福平耐藥為62例,兩方法利福平耐藥檢出的一致率為88.57%,高于廣東地區(qū)報(bào)道的利福平耐藥株rpoB的突變率81.5%[8],低于國(guó)內(nèi)外眾多報(bào)道的90%~95%的突變率[9]。Xpert檢測(cè)直接使用原始臨床標(biāo)本未分離培養(yǎng),而分子生物學(xué)方法直接檢測(cè)臨床標(biāo)本需耐藥MTB含量高于20%以上才能檢出[10-11],而藥敏試驗(yàn)為培養(yǎng)陽性的菌株,因此造成部分耐藥MTB的漏檢。本研究中有8例表型藥敏結(jié)果為耐藥而Xpert檢測(cè)為敏感。有研究表明,rpoB基因RRDR區(qū)外存在影響MTB對(duì)利福平耐藥的其他未知機(jī)制或者非ropB基因突變引起耐藥[12]。另外,異質(zhì)性耐藥也是導(dǎo)致表型和基因型耐藥檢測(cè)結(jié)果不符的重要原因[13]。

按照北京市耐藥篩查流程,分離培養(yǎng)陽性且Xpert陰性或未進(jìn)行Xpert試驗(yàn),應(yīng)使用MTB菌株進(jìn)行Hain試驗(yàn)以補(bǔ)充篩查利福平耐藥情況,以便迅速獲得RFP的耐藥結(jié)果,盡快調(diào)整治療方案,仍有3例未選擇Hain試驗(yàn)而直接進(jìn)行比例法藥敏,由于表型藥敏耗時(shí)長(zhǎng),在一定程度延誤了耐藥治療方案的調(diào)整。另外10例分枝桿菌培養(yǎng)陽性未經(jīng)過分子生物學(xué)耐藥檢測(cè),漏篩率為11.63%。這提示我們各結(jié)防機(jī)構(gòu)及定點(diǎn)醫(yī)院對(duì)耐藥結(jié)核病的重視程度不夠,仍有部分病原學(xué)陽性患者未獲得耐藥結(jié)果,工作落實(shí)層面存在問題。部分結(jié)核病防治機(jī)構(gòu)及定點(diǎn)醫(yī)院對(duì)耐藥篩查流程熟悉程度不夠,貫徹執(zhí)行力度不足,應(yīng)繼續(xù)加強(qiáng)市區(qū)各結(jié)防機(jī)構(gòu)耐藥篩查的督導(dǎo)與管理,從而進(jìn)一步發(fā)揮Xpert聯(lián)合Hain方法的分子生物學(xué)耐藥檢測(cè)的優(yōu)勢(shì)。

2019年通過耐藥篩查檢出RR-TB 68例,通過耐藥篩查工作RR-TB患者發(fā)現(xiàn)率為79.07%,遠(yuǎn)高于同年我國(guó)RR-TB 28.7%的發(fā)現(xiàn)率[14],但是仍然存在20.93%的漏診率。主要存在技術(shù)層面和工作落實(shí)層面兩方面的原因。首先,在技術(shù)方面存在著表型藥敏與分子生物學(xué)方法結(jié)果不一致現(xiàn)象,另外在耐藥篩查診療過程中工作機(jī)制有待完善,加強(qiáng)區(qū)縣市級(jí)診療人員對(duì)耐藥篩查重要性的認(rèn)知,并定期開展督導(dǎo)檢查。

北京市耐藥篩查工作以Xpert方法為主的分子生物學(xué)快速耐藥檢測(cè)較傳統(tǒng)培養(yǎng)物藥敏試驗(yàn),對(duì)RR-TB診斷時(shí)間大幅縮短,報(bào)告時(shí)間的中位數(shù)分別為1.0(0.0~7.0) d和 62.5(34.0~94.3) d,大大提高了耐藥結(jié)核病的納入治療率[15-16]。其中通過Xpert試驗(yàn)檢出RR-TB 62例,相比我市2018年以前僅對(duì)疑似耐多藥患者藥敏試驗(yàn)篩查中RR-TB數(shù)量大大增加,其中初治患者占82.26%,說明耐藥MTB的傳播是本市RR-TB的重要來源[17]。因此在北京特大人口城市中,早期開展Xpert檢測(cè),管理并治愈耐藥結(jié)核病人,從而盡早降低其傳染性是控制耐藥結(jié)核病的根本策略。

RR耐藥株中MDR占74.42%,異煙肼耐藥株中MDR為44.44%,稍低于WHO報(bào)道的新發(fā)耐利福平結(jié)核病中78%為耐多藥[1]。另外本研究顯示RR-TB、MDR-TB、pre-XDR-TB中初復(fù)治比例差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說明無論初治復(fù)治患者一旦檢出利福平耐藥應(yīng)高度懷疑耐多藥。因此建議臨床參考利福平檢測(cè)結(jié)果盡早開展主要抗結(jié)核藥物的藥敏試驗(yàn),同時(shí)通過診療專家組討論后確定診斷及治療方案,從而大大減低耐藥結(jié)核病的傳播風(fēng)險(xiǎn)。

本研究RR-TB中LFX耐藥株占23.26%,與魏淑貞等人報(bào)道的相似[18],我國(guó)MDR/RR-TB患者對(duì)氟喹諾酮類藥品的耐藥率約25%,處于較高水平。氟喹諾酮類藥物在MDR/RR-TB治療中具有關(guān)鍵作用,現(xiàn)已作為利福平耐藥肺結(jié)核的核心藥物,若發(fā)生耐藥會(huì)大大降低治療效果,且影響短程和長(zhǎng)程方案的選用[19]。若結(jié)果顯示氟喹諾酮類藥物敏感,優(yōu)先采用短程化療方案;若結(jié)果顯示氟喹諾酮類藥物耐藥,則選用長(zhǎng)療程化療方案治療,后續(xù)再結(jié)合傳統(tǒng)藥敏檢測(cè)結(jié)果調(diào)整化療方案。因此,按照《中國(guó)結(jié)核病預(yù)防控制工作技術(shù)規(guī)范(2020年版)》要求,對(duì)MDR/RR-TB在治療前應(yīng)進(jìn)行氟喹諾酮類藥物的分子藥敏檢測(cè),以給出精準(zhǔn)治療方案。MDR-TB治療方案中A組藥物貝達(dá)喹啉和利奈唑胺以及B組的氯法齊明較晚應(yīng)用于結(jié)核病的治療,耐藥率較低,本研究對(duì)這3種藥物的耐藥性未涉及。

本研究存在一定的局限性。第一,本研究搜集的結(jié)防系統(tǒng)及定點(diǎn)醫(yī)院就診的患者以初治、病情稍輕、并發(fā)癥較少的患者為主,可能對(duì)所有肺結(jié)核患者的代表性有限。第二,本研究所進(jìn)行的分子檢測(cè)及藥敏試驗(yàn),均沒有進(jìn)行重復(fù)驗(yàn)證,可能存在系統(tǒng)誤差。第三,由于本研究未開展MTB對(duì)貝達(dá)喹啉、利奈唑胺及氯法齊明藥物的表型藥敏試驗(yàn),對(duì)長(zhǎng)療程MDR-TB的治療不能提供全面耐藥信息。第四,常用于治療肺結(jié)核的氟喹諾酮類藥物主要包括LFX及莫西沙星(MFX),本研究未進(jìn)行MFX藥敏試驗(yàn),可能實(shí)際pre-XDR-TB的發(fā)病數(shù)稍高于現(xiàn)統(tǒng)計(jì)數(shù)。

綜上所述,我市實(shí)施分子生物學(xué)方法為主的耐藥篩查以來,RR-TB的發(fā)現(xiàn)顯著增多,但仍有一定的漏篩率,應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)管理和督促,以盡早降低MDR/RR-TB的傳染性。另外,我市應(yīng)盡早開展氟喹諾酮類藥物的分子藥敏檢測(cè),為耐藥結(jié)核病的治療提供精準(zhǔn)的化療方案。

利益沖突:無

引用本文格式:陳雙雙, 代小偉, 田麗麗, 等. 北京市肺結(jié)核病人耐藥篩查實(shí)施效果的研究[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2022,38(11):1018-1022. DOI:10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.152

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