韋 葦 易賢林 廖 海
[1 廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院醫(yī)學(xué)影像中心/廣西臨床重點???醫(yī)學(xué)影像科)/優(yōu)勢培育學(xué)科(醫(yī)學(xué)影像學(xué)科),南寧市 530021,電子郵箱:570944612@qq.com; 2 廣西醫(yī)科大學(xué)附屬武鳴醫(yī)院泌尿外科,南寧市 530199]
【提要】 早期診斷、早期治療是改善乳腺癌患者預(yù)后的關(guān)鍵。目前用于篩查和診斷乳腺癌的方法均存在一定的局限性,其中組織活檢只能在診斷穿刺或腫瘤切除時進行,不能反映整個腫瘤復(fù)雜的分子表達譜。而液體活檢可以在不同時間點多次進行,可以通過原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性腫瘤部位采樣來確定腫瘤成分及腫瘤起源,模仿腫瘤個體的結(jié)構(gòu)組合,可用于腫瘤遺傳分析,這有助于乳腺癌的早期診斷、預(yù)后評估、個體化治療。本文就液體活檢技術(shù)及其在乳腺癌中應(yīng)用的研究進展進行綜述。
乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤[1]。近年來,我國乳腺癌的發(fā)病率及檢出率逐年上升[2],嚴重影響女性的生活質(zhì)量和身心健康。早期診斷、早期治療是降低乳腺癌死亡率、提高患者生活質(zhì)量的關(guān)鍵。乳腺X線鉬靶或超聲是目前篩查乳腺癌的常用手段,但這些檢查均存在一定假陰性和假陽性率[3];乳腺癌組織病理檢查是診斷乳腺癌的金標(biāo)準,但其只能在診斷穿刺或腫瘤切除時進行,不能反映整個腫瘤分子復(fù)雜的表達譜。因此,需要一種更有效的新方法來診斷乳腺癌。
隨著分子病理學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及基因組學(xué)的深入研究,循環(huán)腫瘤標(biāo)志物備受關(guān)注。循環(huán)腫瘤標(biāo)志物包括循環(huán)腫瘤細胞(circulating tumor cell,CTC)、循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)、循環(huán)腫瘤RNA(circulating tumor RNA,ctRNA)及腫瘤細胞來源的外泌體等,而目前臨床上采用液體活檢的方法從患者的血液、胸腹腔積液、尿液等標(biāo)本中檢測這些標(biāo)志物[3],以達到診斷疾病的目的。上述循環(huán)腫瘤標(biāo)志物在乳腺癌的早期診斷、進展與轉(zhuǎn)移、異質(zhì)性與耐藥性以及預(yù)后療效評估等方面都發(fā)揮著重要的協(xié)助作用,因此乳腺癌的液體活檢已成為研究熱點之一。本文就液體活檢技術(shù)及其在乳腺癌中應(yīng)用的研究進展進行綜述,旨在為乳腺癌的分子診斷及臨床療效監(jiān)測等提供新信息。
1.1 液體活檢技術(shù)概述 在原發(fā)性腫瘤形成和生長、凋亡及壞死過程中,其各種組分如CTC、ctDNA、ctRNA和外泌體等,可釋放到人體外周體液中[4]。液體活檢通過檢測人體體液的各種組分從而獲取相關(guān)疾病的分子信息數(shù)據(jù),具有可連續(xù)取樣、自動化完成及結(jié)果可重復(fù)等諸多優(yōu)點[5]。目前,常用的液體活檢技術(shù)包括酶聯(lián)免疫吸附檢測、聚合酶鏈反應(yīng)、生物傳感器技術(shù)、高通量測序等。酶聯(lián)免疫吸附檢測、聚合酶鏈反應(yīng)可檢測蛋白、DNA/RNA的表達水平;生物傳感器技術(shù)具有超靈敏、免標(biāo)記的特點;高通量測序多用于基因組、表觀基因組、轉(zhuǎn)錄組等檢測;高通量納米生物芯片集成系統(tǒng)可快速、同時和多重檢測單個細胞囊泡的蛋白質(zhì)、mRNA/微小RNA(microRNA,miRNA)及其組合[6]。上述檢測技術(shù)均可通過檢測患者體液(如尿液、血液、腦脊液及胸腹水等),觀察病癥(如惡性腫瘤等)相關(guān)特異性蛋白、DNA、RNA等生物標(biāo)志物的表達變化,從而診斷或輔助診斷疾病及評價臨床治療效果。
1.2 液體活檢技術(shù)檢測的主要循環(huán)腫瘤標(biāo)志物
1.2.1 CTC:CTC是從原發(fā)性或轉(zhuǎn)移性腫瘤中脫落的腫瘤細胞,通過淋巴系統(tǒng)或血管進入血液循環(huán),這些細胞可以在腫瘤形成和生長期間、微轉(zhuǎn)移期間等任何時間釋放,甚至可以從腫瘤前病變中釋放[7]。在腫瘤轉(zhuǎn)移的早期階段,腫瘤細胞可發(fā)生侵襲、脫落從而進入外周血液循環(huán),并與原發(fā)性腫瘤具有相似的遺傳或免疫學(xué)特征[8]。但由于機械因素或人體免疫系統(tǒng)的破壞,只有極少部分CTC能存活并進入血液循環(huán)系統(tǒng),同時大多數(shù)CTC處于休眠狀態(tài)或增殖能力低下,對化療藥物耐藥,并可逃避機體的免疫監(jiān)視[7]。目前認為CTC逃避細胞凋亡和免疫監(jiān)視、抗脫落凋亡的能力可能與上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化相關(guān)[8],但CTC的具體生存機制尚不明確。有研究顯示,CTC特異性存在于腫瘤患者體內(nèi),1 g癌組織每天大約向外周血釋放1×106個CTC,即使切除原發(fā)性腫瘤,在腫瘤衍生的炎性趨化因子的誘導(dǎo)下,CTC可通過基質(zhì)金屬蛋白酶1、肌成束蛋白1等載體從外周血滲透進入組織,返回原發(fā)性腫瘤的發(fā)生部位進行克隆性增殖,因此切除原發(fā)性腫瘤后外周血中仍能檢測到CTC[8]。CTC可應(yīng)用于預(yù)測癌癥轉(zhuǎn)移的風(fēng)險,研究顯示,CTC含量越高,轉(zhuǎn)移的可能性越大[9];檢測CTC中的相關(guān)基因,可為靶向藥物的選擇提供指導(dǎo)[10];CTC還可用于預(yù)測患者對治療的反應(yīng)及預(yù)后評估等[11]。
1.2.2 ctDNA:外周血游離DNA和外泌體是兩個重要的液體活檢生物標(biāo)志物[12]。1977年,Leon等[13]發(fā)現(xiàn)癌癥患者的循環(huán)游離DNA(circulating free DNA,cfDNA)含量顯著高于正常健康人,故猜測其與癌癥的發(fā)生相關(guān) 。因為cfDNA在血液中的濃度較高,其作為液體活檢標(biāo)志物的效果優(yōu)于CTC[14]。在腫瘤患者中,ctDNA是總cfDNA的一個亞群。ctDNA僅占血漿總cfDNA的一小部分[15]。ctDNA可用于監(jiān)測正在發(fā)生的腫瘤學(xué)改變,其表達水平可反映腫瘤突變、表觀遺傳變化和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性等基因組學(xué)變化[16]。可通過靶向和非靶向測序技術(shù)分析從血液樣品中提取的ctDNA序列,其中靶向測序可用于分析已知的乳腺癌相關(guān)基因組,而非靶向全基因組測序可用于識別未知的新變異。
1.2.3 ctRNA:高代謝率是腫瘤細胞的一個關(guān)鍵特征,這需要特定基因的高表達從而導(dǎo)致大量mRNA的產(chǎn)生,而這些mRNA又可能從細胞中大量流失。原發(fā)性腫瘤細胞壞死后可將核酸釋放入血,在血液循環(huán)中凋亡或被人體免疫系統(tǒng)消滅的腫瘤細胞亦可將核酸釋放入血,其中包含了ctRNA。目前,針對ctRNA的研究熱點是循環(huán)非編碼RNA,循環(huán)非編碼RNA包括長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)、環(huán)狀RNA、小核RNA(small nuclear RNA,snRNA)和核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)、miRNA以及與Piwi蛋白相互作用RNA(piRNA)[8]。
在人類基因組計劃中,只有約2%的人類基因組編碼蛋白質(zhì)被發(fā)現(xiàn),而98%的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是非編碼RNA。lncRNA是一類長度大于200個核苷酸的非編碼RNA,其可通過基因沉默、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活等機制,在多個不同層面調(diào)控基因表達,從而調(diào)控癌癥的發(fā)生和發(fā)展并影響癌癥預(yù)后。根據(jù)其功能所涉及的不同分子機制,lncRNA可分為信號原型、誘餌原型、引導(dǎo)原型、支架原型等類型。近年來的研究表明,lncRNA、miRNA和mRNA三者之間可相互作用,lncRNA通過內(nèi)源性競爭性抑制miRNA的表達,促進下游靶基因的表達,從而發(fā)揮促腫瘤或抑腫瘤的作用[7]。
1.2.4 外泌體:外泌體是細胞之間溝通的載體,直徑在30~200 nm之間,是細胞分泌的包裹著DNA、RNA和蛋白質(zhì)的囊泡,具有典型的脂質(zhì)雙分子層膜結(jié)構(gòu),在細胞培養(yǎng)上清液及血清、唾液、尿液等體液中均可存在;腫瘤細胞分泌的外泌體具有抑制免疫系統(tǒng)、刺激細胞生長、促進腫瘤血管生成等功能,同時還參與了腫瘤細胞的轉(zhuǎn)移過程[8]。外泌體含有特定的標(biāo)志蛋白及大量的脂質(zhì),后者包括膽固醇、磷脂酰絲氨酸和飽和脂肪酸等[17],分析外泌體脂質(zhì)表面分子抗原還可以確定腫瘤細胞的來源。除了蛋白質(zhì)和脂質(zhì),外泌體還含有ctDNA、腫瘤mRNA和miRNA等成分,均在腫瘤生長、轉(zhuǎn)移及細胞間通訊中發(fā)揮著重要作用[18]。
臨床上,液體活檢可以分析原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者相關(guān)標(biāo)本中的生物標(biāo)志物,可用于早期診斷或復(fù)發(fā)的檢測。此外,液體活檢可獲得整個腫瘤基因組信息,可用于鑒定新的遺傳標(biāo)記,并用于患者個體化基因組分層和定制藥物[3]。
2.1 用于乳腺癌的早期診斷 早期診斷對于降低乳腺癌死亡率至關(guān)重要;早期乳腺癌通??梢灾斡?,如果腫瘤<2 cm,早期診斷能明顯提高患者的總體生存率和預(yù)后[19]。此外,乳腺癌的早期診斷可影響治療方案的選擇,而這與患者預(yù)后息息相關(guān)。然而,由于乳腺癌無特異性癥狀,早期診斷困難較大。多項研究表明液體活檢在有助于在早期發(fā)現(xiàn)乳腺癌。其中,利用液體活檢檢測外周血ctDNA/cfDNA的水平,可比臨床和放射學(xué)手段提前5個月診斷乳腺癌[20]。此外,在腫瘤的早期階段,可通過檢測體細胞中ctDNA的突變情況及血漿中的cfDNA水平提高早期診斷的準確度[21]。還有研究顯示,對于具有乳腺癌易感基因突變的人群或乳腺癌的高風(fēng)險人群,采用液體活檢方法可以在更早期進行診斷[22]。故為了早期乳腺癌檢測,需要開發(fā)高靈敏度檢測血漿cfDNA水平的方法。雖然乳腺癌患者cfDNA中確切的腫瘤突變譜尚不清楚,但是研究者們已經(jīng)開始通過篩選大量已知的乳腺癌始動基因、鑒定非腫瘤細胞的體細胞致癌突變以增加檢測敏感性。
CTC的檢測也有助于早期診斷乳腺癌。Kruspe等[23]開發(fā)了一種快速、靈敏的熒光核酸酶激活的探針來檢測乳腺癌CTC,該方法的原理是對CTC衍生的核酸酶進行信號擴增,這些酶在包括上皮細胞-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化誘導(dǎo)的乳腺癌在內(nèi)的多種惡性腫瘤中升高;結(jié)果顯示,熒光核酸酶激活的探針可用于快速檢查CTC水平,可作為一種經(jīng)濟有效的乳腺癌早期診斷方法。但CTC應(yīng)用于乳腺癌的診斷及預(yù)測尚處于早期研究階段,其作用仍有待進一步研究驗證。
2.2 用于乳腺癌的復(fù)發(fā)和預(yù)后評估 由于CTC會進入二級器官或被從血液中清除,其在外周血中的半衰期非常短(1~2.4 h)[10]。雖然在血液中分離低豐度CTC具有挑戰(zhàn)性,但它們已被證明是預(yù)測腫瘤預(yù)后的有力工具。Bidard等[11]檢測了乳腺癌患者血液中CTC的豐度,發(fā)現(xiàn)乳腺癌患者平均每7.5 mL血液中有5個或更多的CTC,同時也發(fā)現(xiàn)CTC低水平(低于5個/7.5 mL)患者的疾病無進展生存時間和總生存時間較CTC高水平患者更長。Madic等[24]探討了三陰性乳腺癌患者的預(yù)后與血漿CTC水平的關(guān)系,也發(fā)現(xiàn)CTC計數(shù)與患者預(yù)后呈負相關(guān),即CTC計數(shù)高的患者其總生存期及疾病進展時間更短。因此,CTC可作為潛在的液體活檢標(biāo)志物,為監(jiān)測患者病情變化提供實時信息,有助于對乳腺癌患者預(yù)后進行評估。
ctDNA也可用于乳腺癌患者術(shù)后復(fù)發(fā)的評估[25]?;蚪M改變(包括多種ESR1基因組改變)有助于評估復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移性乳腺癌,基于ctDNA的基因組分析是一種敏感的檢測手段[26]。研究表明,ctDNA水平與乳腺癌患者的總體存活率升高相關(guān),并可定量評估早期的治療反應(yīng);對ctDNA基因組畸變的測定也可用于輔助預(yù)測乳腺癌復(fù)發(fā)[3]。Garcia-Murillas等[25]跟蹤檢測ctDNA以監(jiān)測早期乳腺癌患者根治性手術(shù)治療后的復(fù)發(fā)情況,發(fā)現(xiàn)多數(shù)(96%)未復(fù)發(fā)患者術(shù)后ctDNA為陰性,ctDNA預(yù)測復(fù)發(fā)的準確率為80%(12/15)。另外一項回顧性研究結(jié)果顯示,針對轉(zhuǎn)移性乳腺癌,術(shù)后ctDNA水平診斷復(fù)發(fā)情況的準確率達到93%~100%[27]。此外,ctDNA可在出現(xiàn)臨床癥狀前7.9~11.0個月預(yù)測乳腺癌患者的復(fù)發(fā)情況[25]。
2.3 用于腫瘤間/腫瘤內(nèi)異質(zhì)性的判斷 干性突變發(fā)生于腫瘤的早期階段并存在于所有的腫瘤細胞中;相反,在后期轉(zhuǎn)移性腫瘤階段發(fā)生的個體突變僅發(fā)現(xiàn)于部分腫瘤克隆中[28]??v向監(jiān)測和比例分析干性突變有助于腫瘤克隆分層,以及區(qū)分原發(fā)腫瘤部位和轉(zhuǎn)移性腫瘤[28]。乳腺癌的組織活檢只能在診斷穿刺或腫瘤切除時進行,不能反映整個腫瘤復(fù)雜的分子表達譜。而液體活檢可以通過提供個體化的腫瘤圖譜來實現(xiàn)這些功能,即通過判斷腫瘤間的異質(zhì)性,從而進行原發(fā)腫瘤定位。其中,組織特異性甲基化和核小體定位模式可以為原發(fā)性腫瘤的定位提供有價值的信息。Lehmann-Werman等[29]使用甲基化組數(shù)據(jù)庫鑒定組織的特異性cfDNA,其利用硫酸氫鹽來處理提取的cfDNA,對其含有特征CpG位點的區(qū)域進行PCR擴增,并對擴增的cfDNA進行了測序,以確定甲基化模式,然后與甲基化組數(shù)據(jù)庫進行比對,從而確定從血液中提取的cfDNA的起源組織。
此外,ctDNA突變檢測可用于判斷腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性。De Mattos-Arruda等[30]納入了發(fā)生骨和肝臟轉(zhuǎn)移的浸潤性乳腺癌患者,在其接受蛋白激酶B抑制劑進行四線治療期間,多次收集血漿來源的ctDNA用于測定腫瘤相關(guān)基因,結(jié)果表明,基于ctDNA的大規(guī)模并行測序是靶向治療期間識別新發(fā)基因突變和監(jiān)測體細胞遺傳變異的潛在方法,這或有助于應(yīng)對腫瘤內(nèi)異質(zhì)性所帶來的挑戰(zhàn)。
2.4 用于乳腺癌治療反應(yīng)的評估 在治療過程中,腫瘤組織不斷獲得克隆和亞克隆的耐藥細胞,而液體活檢可在藥物治療期間縱向監(jiān)測腫瘤細胞的動態(tài)克隆進化[31]。有研究顯示,在治療過程中可出現(xiàn)雌激素受體1(estrogen receptor 1,ESR1)基因突變,這可導(dǎo)致轉(zhuǎn)移性乳腺癌細胞對內(nèi)分泌治療產(chǎn)生耐藥性。例如,Beije等[32]納入43例初次接受一線內(nèi)分泌治療的轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者和40例一線內(nèi)分泌治療后進展的轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者,檢測了CTC和cfDNA中ESR1的突變情況,結(jié)果顯示,與前者相比,后者cfDNA中ESR1突變發(fā)生率升高,提示ESR1突變可導(dǎo)致轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者對內(nèi)分泌治療產(chǎn)生耐藥性。此外,O′Leary等[33]發(fā)現(xiàn),在早期乳腺癌患者中,周期蛋白依賴性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)4/6抑制劑治療前后ctDNA中磷脂酰肌醇-3-激酶催化亞基α突變的變化情況可較好地預(yù)測患者對CDK4/6抑制劑的反應(yīng)性。由此可見,液體活檢循環(huán)腫瘤標(biāo)志物中相關(guān)基因的突變情況,有助于評估或預(yù)測乳腺癌患者的治療效果。
2.5 用于乳腺癌微小殘余病灶的評估 轉(zhuǎn)移性腫瘤發(fā)生的決定性因素是治愈性手術(shù)和化療后存在乳腺癌微小殘余病灶(minimal residual disease,MRD)。早期檢測MRD可以最大限度地提高患者的治療效果。從MRD釋放至血液的ctDNA中腫瘤相關(guān)基因發(fā)生了特異性突變,即ctDNA中存在不同于原發(fā)瘤灶的新轉(zhuǎn)移瘤基因圖譜表達[34]。而這些特異性突變可利用液體活檢來鑒定。研究表明,對于已進行腫瘤切除術(shù)的乳腺癌患者,檢測ctDNA和cfDNA有助于這些患者的術(shù)后監(jiān)測,即尋找MRD,指導(dǎo)臨床切除術(shù)后可能導(dǎo)致復(fù)發(fā)的任何殘余腫瘤的治療[35]。有學(xué)者使用微滴式數(shù)字聚合酶鏈式反應(yīng)檢測早期乳腺癌患者手術(shù)前后的血漿ctDNA中PIK3CA基因的突變情況,結(jié)果顯示,14例術(shù)前cfDNA發(fā)現(xiàn)PIK3CA基因突變的患者中,有10例患者進行術(shù)后cfDNA檢測,其中5例在術(shù)后仍可檢測到PIK3CA突變[36]。這提示,在早期乳腺癌患者手術(shù)前后使用液體活檢技術(shù)檢測cfDNA有助于評估術(shù)后殘余腫瘤的情況,這助于臨床醫(yī)師制訂個性化治療方案進行及時干預(yù),避免過度治療。
盡管目前液體活檢還只能作為乳腺癌的二線診斷手段,但隨著高靈敏度檢測技術(shù)的進步,液體活檢可為乳腺癌傳統(tǒng)組織活檢提供強有力的輔助作用。隨著新的研究不斷開展和標(biāo)準化流程的建立,液體活檢的特異性和靈敏度不斷提高,液體活檢將為乳腺癌的篩查和治療提供更有力的支撐,在臨床上發(fā)揮更重要的作用。