沈昕草, 朱孝仁, 劉媛媛, 吳曉陽
(1. 江蘇大學醫(yī)學院,江蘇 鎮(zhèn)江 212013; 2. 江蘇大學附屬昆山醫(yī)院臨床實驗研究中心,江蘇 蘇州 215300; 3. 江蘇大學附屬昆山醫(yī)院胃腸外科,江蘇 蘇州 215300)
在全球惡性腫瘤中,胃癌發(fā)病率占第5位,病死率占第2位[1]。我國胃癌發(fā)病率逐年上升,已成為全球胃癌高發(fā)地區(qū)[2]。胃癌轉(zhuǎn)移患者生存預后較差,無化療的中位生存時間為3~5個月[3]。胃癌的發(fā)生和進展過程復雜,與多種基因的突變和表觀遺傳學改變相關[4]。
磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(phosphoenolpyruvate carboxykinase,PCK)是一種多功能酶,在物種間高度保守,是調(diào)節(jié)糖異生的關鍵酶[5]。脊椎動物均含有兩種PCK亞型,胞質(zhì)型PCK1和線粒體型PCK2,二者由不同的基因編碼[6]。PCK1位于染色體20q13.31,生理狀態(tài)下PCK1蛋白主要位于細胞質(zhì)中,激活時可轉(zhuǎn)運至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。PCK1在糖異生、甘油異生和氨基酸合成等生物學過程中發(fā)揮重要作用[7],其高表達易引起高血糖癥和胰島素抵抗,既往研究多探究PCK1在2型糖尿病中的發(fā)病機制與治療方案[8-9]。近年來,Montal等[10]研究發(fā)現(xiàn),PCK1在結(jié)腸源性腫瘤中呈高表達,抑制其表達可顯著降低三羧酸循環(huán)活性并抑制細胞周期。但是,PCK1對胃癌細胞增殖和遷移的影響尚不清楚。本研究擬檢測PCK1在胃癌細胞中的表達及其調(diào)控網(wǎng)絡并結(jié)合相關功能學實驗等,探討PCK1在胃癌中潛在的生物學作用。
人胃癌HGC-27、AGS細胞由中科院上海生命科學研究院細胞庫提供。RPMI 1640、F-12K培養(yǎng)基、胎牛血清、胰蛋白酶均為美國Gibco公司產(chǎn)品;敲低與過表達PCK1慢病毒和空載體購自上海吉凱基因科技有限公司(GENE);5-乙炔基-2′脫氧尿嘧啶核苷(EdU)細胞增殖檢測試劑盒為廣州銳博生物技術有限公司產(chǎn)品;Transwell細胞遷移板為美國Corning公司產(chǎn)品;一抗兔抗人PCK1、一抗小鼠抗人β-肌動蛋白均為英國Abcam公司產(chǎn)品;兔抗人蛋白激酶B(AKT)、p-mTOR(Ser2448)、p-Akt(Ser473)、核糖體蛋白S6(S6)、p-S6、真核翻譯起始因子-4E結(jié)合蛋白1(4EBP1)、p-4EBP1均為美國Cell公司產(chǎn)品;一抗β-微管蛋白、二抗均為中國ABclonal公司產(chǎn)品;BCA蛋白定量試劑盒為美國Thermo Fisher公司產(chǎn)品。
1.2.1 基于數(shù)據(jù)庫分析PCK1表達水平 在R軟件(3.3.3版本,用于可視化)中利用ggplot2軟件包整合TCGA數(shù)據(jù)庫(http://gepia.cancer-pku/index.html)以及GTEx數(shù)據(jù)庫(https://www.genome.gov/Funded-Programs-Projects/Genotype-Tissue-Expression-Project)樣本,分析PCK1在胃癌及癌旁組織中的表達水平,其中胃癌414例,癌旁組織210例。在Oncomine 4.5數(shù)據(jù)庫(https://www.oncomine.org)中查找Cho Gastric Statistics數(shù)據(jù)集和TCGA Gastric Statistics數(shù)據(jù)集,Cho Gastric Statistics數(shù)據(jù)集中有19例胃癌樣本和4例癌旁組織樣本,TCGA Gastric Statistics數(shù)據(jù)集中有236例血液、94例胃癌和173例胃癌旁組織樣本。生成PCK1轉(zhuǎn)錄差異表達圖后,分析在胃癌及癌旁組織中PCK1mRNA表達和DNA拷貝數(shù)。在人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas,HPA)數(shù)據(jù)庫(https://www.proteinatlas.org/)中在線查找胃癌樣本的免疫組織化學圖,通過比較該數(shù)據(jù)庫中胃癌組織與癌旁組織的PCK1免疫組織化學染色,分析PCK1在胃癌中的表達水平。
1.2.2 PCK1的基因本體論富集分析 在R軟件(3.6.3版本,用于統(tǒng)計分析與可視化)中,基于TCGA數(shù)據(jù)庫的胃癌樣本,以PCK1mRNA表達值的中位數(shù)為界,對低表達和高表達的差異基因進行基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA,https://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/index.jsp),以識別胃癌中差異激活的信號通路。
1.3.1 細胞分組及轉(zhuǎn)染 取處于對數(shù)期生長期的HGC-27、AGS細胞(5×104個/孔)接種于6孔板,于37 ℃和5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。當匯合率達60%~70%時進行轉(zhuǎn)染。將敲低PCK1的細胞分為shPCK1-Seq1組、shPCK1-Seq2組和shC組,分別轉(zhuǎn)染LV-Pck1-RNAi(91486-1)慢病毒、LV-Pck1-RNAi(91488-1)慢病毒和CON313(Hu6-MCS-C8h-gcGFP-Ires-puromycin)陰性對照病毒;將過表達PCK1的細胞分為OE-PCK1組和Vec組,分別轉(zhuǎn)染LV-PFDN5(48826-1)慢病毒和CON335(Ubi-MCS-3FLAG-CBh-gcgfp-IRES-puromycin)陰性對照病毒;轉(zhuǎn)染24 h后,加入2.5 μg/mL嘌呤霉素篩選3 d。shPCK1 Seq1的序列為CCAAGATCTTCCATGTCAA,shPCK1 Seq2的序列為TGGCCAGGATCGAAAGCAA。
1.3.2 CCK-8增殖實驗檢測細胞生長能力 取“1.3.1”轉(zhuǎn)染后細胞(2×103個/孔)接種于96孔板,分別在培養(yǎng)箱中孵育24、48、72 h;棄培養(yǎng)基,PBS清洗3次;用完全培養(yǎng)基按1 ∶10稀釋CCK-8試劑,每孔加入100 μL;孵育1 h,測450 nm處光密度值,并繪制細胞增殖曲線。每組設5個復孔。
1.3.3 EdU細胞增殖實驗檢測胃癌細胞增殖能力 取“1.3.1”轉(zhuǎn)染后細胞(5×104個/孔)接種于24孔板,在37 ℃和5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。當匯合率達70%~80%時,用完全培養(yǎng)基按1 ∶1 000稀釋EdU溶液,每孔加入300 μL EdU染色液,于培養(yǎng)箱中孵育2 h;加入Appolo染色液(按照說明書配制)避光孵育30 min;細胞核用1×Hoechst-33342染色30 min;于熒光顯微鏡(日本Olympus公司)下觀察。從3個隨機視野中選取至少200個細胞來計算每種細胞核內(nèi)EdU陽性比率。EdU陽性比率(%)=EdU細胞數(shù)目/Hoechst細胞數(shù)目(同一視野)×100%。
1.3.4 克隆形成實驗檢測胃癌HGC-27、AGS細胞克隆能力 取處于對數(shù)期生長期的HGC-27、AGS細胞(1×103個/孔)接種于6孔板,在37 ℃和5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)10~14 d,直到形成肉眼可見的細胞集落;棄培養(yǎng)基,PBS洗滌2次;4%多聚甲醛固定30 min;PBS洗滌1次;加入“1.3.1”轉(zhuǎn)染后細胞用0.1%結(jié)晶紫染色30 min;洗去結(jié)晶紫待晾干后,拍照并計算克隆形成數(shù)。實驗重復3次。
1.3.5 Transwell實驗檢測胃癌HGC-27、AGS細胞遷移能力 Transwell小室放置在24孔板上,下室加入含有20%胎牛血清的600 μL F-12,上室加入約5×104個細胞重懸在無血清F-12培養(yǎng)基中,細胞培養(yǎng)箱中孵育24 h;用2.5%結(jié)晶紫染色30 min;在相位對比顯微鏡(日本Olympus公司)下隨機選擇3張染色細胞的顯微鏡圖,并用軟件Image J計數(shù)細胞。
1.3.6 蛋白質(zhì)免疫印跡實驗檢測胃癌細胞中相關蛋白表達水平 取“1.3.1”轉(zhuǎn)染后細胞(5×104個/孔)接種于6孔板中,在37 ℃和5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。當匯合率達80%~90%時,加入裂解緩沖液置于冰上裂解約30 min;4 ℃行12 000 r/min離心15 min;取上清液行BCA蛋白定量;95 ℃變性8 min;10% SDS-PAGE 80 V電泳30 min,110 V電泳直至蛋白按分子大小完全分離;330 mA轉(zhuǎn)膜120 min,將蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜;10%速溶脫脂奶粉封閉2 h;小鼠抗人β-肌動蛋白以1 ∶2 000稀釋,兔抗人PCK1、p-mTOR、mTOR、p-S6、S6、p-AKT、AKT、p-4EBP1、4EBP1及β-微管蛋白均以1 ∶1 000稀釋,4 ℃孵育過夜;TBST沖洗膜3次,每次10 min;二抗以1 ∶1 000稀釋,室溫孵育2~4 h;采用增強化學發(fā)光(ECL)檢測系統(tǒng),用Image J密度分析法定量條帶灰度值。
基于TCGA數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,PCK1mRNA在胃癌組織中的表達顯著高于癌旁組織(P<0.01,圖1)。ROC曲線顯示PCK1對胃癌患者預后具有良好的預測效能(圖2)。Oncomine 4.5數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,胃癌組織中PCK1mRNA表達水平明顯高于癌旁組織,DNA拷貝數(shù)變異高于胃正常組織(P<0.05或P<0.01,圖3)。HPA數(shù)據(jù)庫中獲得的免疫組織化學染色結(jié)果顯示,PCK1蛋白表達在癌旁組織中為“+”,在胃癌組織中為“++”(圖4)。
圖1 胃癌與癌旁組織中PCK1 mRNA表達水平比較
A:在“Cho”數(shù)據(jù)子集中胃癌組織與癌旁組織中PCK1 mRNA表達水平比較;B:在TCGA數(shù)據(jù)庫中胃癌組織與胃癌旁組織及血液中DNA拷貝數(shù)變異比較;*:P<0.05,與癌旁組織相比;**:P<0.01,與胃正常組織相比
圖2 胃癌患者PCK1的診斷性ROC曲線
圖4 胃癌組織與癌旁組織中PCK1免疫組織化學染色結(jié)果(50×)
GSEA(條件:校正后P<0.05;容錯率<0.25)顯示了MSigDB集合富集(c2.cp.kegg.v6.2.symbols.gmt)的巨大差異。與原發(fā)性免疫缺陷、細胞黏附分子、趨化因子信號通路、全身性紅斑狼瘡、產(chǎn)生IgA的腸道免疫網(wǎng)絡及RIGⅠ樣受體信號通路相關的基因集在PCK1基因低表達表型中差異富集(圖5)。
圖5 PCK1基因低表達表型中差異富集的基因集
蛋白質(zhì)免疫印跡結(jié)果顯示,與shC組比較,shPCK1-Seq1組和shPCK1-Seq2組HGC-27與AGS細胞PCK1蛋白相對表達水平顯著下降(P<0.05或P<0.01,圖6)。CCK8實驗結(jié)果顯示,與shC組相比,shPCK1-Seq1組和shPCK1-Seq2組HGC-27與AGS細胞生長能力明顯下降(P均<0.01,圖7)??寺⌒纬蓪嶒灲Y(jié)果顯示,與shC組相比,shPCK1-Seq1組和shPCK1-Seq2組HGC-27與AGS細胞增殖能力明顯下降(P<0.05或P<0.01,圖8)。Transwell實驗結(jié)果顯示,與shC組相比,shPCK1-Seq1組和shPCK1-Seq2組HGC-27與AGS細胞遷移數(shù)顯著下降(P均<0.01,圖9)。由此表明,敲低PCK1抑制HGC-27與AGS細胞生長、增殖和遷移。
*:P<0.05,**:P<0.01,與shC組相比圖6 蛋白質(zhì)免疫印跡實驗檢測敲低PCK1后HGC-27與AGS細胞中PCK1蛋白表達水平
*:P<0.01,與shC組相比
*:P<0.05,**:P<0.01,與shC組相比
*:P<0.01,與shC組相比;標尺示100 μm
蛋白質(zhì)免疫印跡結(jié)果顯示,與Vec組比較,OE-PCK1組HGC-27與AGS細胞中PCK1蛋白相對表達水平顯著增高(P均<0.01,圖10)。CCK8實驗結(jié)果顯示,與Vec組相比,OE-PCK1組HGC-27與AGS細胞生長能力明顯增強(P均<0.01,圖11)。EdU細胞增殖實驗結(jié)果顯示,與Vec對照組相比,OE-PCK1組HGC-27與AGS細胞增殖能力明顯增強(P均<0.05,圖12)。Transwell實驗結(jié)果顯示,與Vec對照組相比,OE-PCK1組HGC-27與AGS細胞遷移數(shù)量顯著增加(P均<0.01,圖13)。由此表明,過表達PCK1增強HGC-27與AGS細胞生長、增殖和遷移。
*:P<0.01,與Vec組相比
*:P<0.01,與Vec組相比
*:P<0.05,與Vec組相比
*:P<0.01,與Vec組相比;標尺示100 μm
shRNA敲低PCK1后,蛋白免疫印跡檢測結(jié)果顯示,與shC組比較,shPCK1-Seq1組和shPCK1-Seq2組p-AKT、p-mTOR、p-S6和p-4EBP1相對表達水平顯著下降(P<0.05或P<0.01,圖14)。外源性過表達PCK1后,蛋白免疫印跡檢測結(jié)果顯示,與Vec組比較,OE-PCK1組p-AKT、p-mTOR、p-S6和p-4EBP1相對表達水平顯著升高(P<0.05或P<0.01,圖15)。由此提示,PCK1在胃癌中呈高表達,并可能以激酶形式調(diào)控AKT-mTOR通路的活化,從而參與調(diào)控胃癌細胞的惡性生物學行為。
*:P<0.05,**:P<0.01,與shC組相比
*:P<0.05,**:P<0.01,與Vec組相比
本研究結(jié)果顯示,PCK1蛋白在胃癌中表達上調(diào),但其高表達的調(diào)控機制和作用機制尚不明確,故進行GSEA以識別胃癌中差異激活可能的信號通路;結(jié)果顯示,原發(fā)性免疫缺陷、細胞黏附分子、趨化因子信號通路、全身性紅斑狼瘡、產(chǎn)生IgA的腸道免疫網(wǎng)絡及RIGⅠ樣受體信號通路相關的基因集在PCK1基因低表達表型中差異富集。Ma等[11]報道,PCK1能通過糖原代謝途徑調(diào)節(jié)CD8+免疫細胞形成和維持。Guo等[12]報道,孕烷X受體可能通過促進PCK1表達抑制趨化因子信號通路,進而對潰瘍性結(jié)腸炎發(fā)揮保護作用。由此初步提示,PCK1可能通過免疫途徑調(diào)控胃癌的進展。此外,ROC曲線顯示PCK1對胃癌患者預后診斷具有良好的效能。
代謝重編程是腫瘤的典型特征之一[13],PCK1作為糖異生的限速酶,在代謝重編程中起重要作用[14-15]。既往研究表明,在肝臟和腎臟中,PCK1表達量較高,其發(fā)揮糖異生酶的作用從而抑制腫瘤細胞生長[15-16]。有研究報道在自身PCK1表達量較低的肺和結(jié)直腸中,PCK1表達量增高可促進腫瘤細胞生長,其機制可能與葡萄糖和谷氨酰胺增多有關[10,17]。PCK1高表達可增加細胞中葡萄糖和氨基酸尤其是谷氨酰胺的合成[18],谷氨酰胺可以衍生為谷氨酸,在蛋白質(zhì)合成、轉(zhuǎn)氨反應、營養(yǎng)物質(zhì)交換等方面發(fā)揮作用,從而促進腫瘤細胞的生長[19]。本研究相關數(shù)據(jù)庫結(jié)果提示,PCK1在胃正常細胞中相對表達較低,而在胃癌細胞中明顯升高;此外,體外細胞功能學實驗證實,在胃癌細胞中敲低PCK1可抑制胃癌細胞生長,反之則增強。Yamaguchi等[20]研究證實,在缺氧條件下PCK1可通過對核苷酸庫的維持,主要促進還原羧化作用產(chǎn)生嘧啶前體天冬氨酸,進而促進腫瘤細胞遷移。本研究通過Transwell實驗也證實,PCK1對胃癌細胞的遷移有促進作用。由此說明,PCK1可能是促進胃癌細胞生長與遷移的一個關鍵基因。
此外,本研究還發(fā)現(xiàn),PCK1可能通過參與誘導AKT-mTOR通路調(diào)控胃癌的惡性生物學行為。研究表明AKT-mTOR信號通路是正常生理細胞和癌細胞生長的主要調(diào)節(jié)通路之一,該通路在腫瘤中經(jīng)常被激活,目前已證實與胃癌、卵巢癌和乳腺癌等多種腫瘤的發(fā)生及不良預后相關[21-24]。Montal等[10]提出PCK1促進消化道腫瘤細胞的生長與增殖,并可能與AKT-mTOR通路激活有關。PCK1可以通過谷氨酰胺的分解與α-酮戊二酸的產(chǎn)生激活mTOR通路[25],提高細胞氨基酸、葡萄糖、核苷酸和脂質(zhì)代謝[26];這些代謝途徑可以為癌細胞的大分子合成提供原料[27]。本研究結(jié)果顯示,敲低PCK1后胃癌細胞中AKT、mTOR以及其下游蛋白包括S6和4EBP1磷酸化水平顯著降低;反之,過表達則升高。S6以及4EBP1對蛋白質(zhì)合成起重要作用,其磷酸化水平可用于評價mTOR通路的活化程度,磷酸化水平越高說明AKT-mTOR通路活性越高。由此說明,PCK1可以促進AKT-mTOR信號通路的活化。
綜上所述,PCK1在胃癌中呈高表達且與患者預后相關,其高表達可促進胃癌細胞生長、增殖與遷移,這可能與PCK1調(diào)控AKT-mTOR信號通路的活化有關,但具體分子機制有待進一步研究。