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基于主成分分析和灰色關(guān)聯(lián)度分析的谷子品種(系)綜合評(píng)價(jià)

2023-09-11 03:21:20王淑君解慧芳邢璐宋慧宋中強(qiáng)張揚(yáng)閆宏山劉海萍李龍王素英劉金榮
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年15期
關(guān)鍵詞:灰色關(guān)聯(lián)度分析相關(guān)分析綜合評(píng)價(jià)

王淑君 解慧芳 邢璐 宋慧 宋中強(qiáng) 張揚(yáng) 閆宏山 劉海萍 李龍 王素英 劉金榮

摘要:綜合評(píng)價(jià)近年來谷子新品種(系)在東北春谷區(qū)的種植表現(xiàn),篩選適宜東北春谷區(qū)種植的谷子品種。本研究以2016—2021年全國谷子品種區(qū)域適應(yīng)性聯(lián)合鑒定試驗(yàn)東北春谷區(qū)的35個(gè)谷子新品種(系)為試驗(yàn)材料,利用變異系數(shù)、主成分分析和灰色關(guān)聯(lián)度分析等方法對(duì)參試材料的產(chǎn)量、生育期等9個(gè)主要農(nóng)藝性狀進(jìn)行分析和綜合評(píng)價(jià)。結(jié)果表明,9個(gè)農(nóng)藝性狀變異系數(shù)存在一定差異,變幅為1.75%~10.68%,其中單穗粒質(zhì)量和株高的變異系數(shù)較大,分別為10.68%、10.31%,生育期變異系數(shù)最小。主成分分析時(shí),根據(jù)特征值大于1的原則,共提取3個(gè)主成分,其中第1主成分的貢獻(xiàn)率最大(45.954%);主成分綜合得分較高且排前5位的參試品種(系)分別是豫谷32、豫谷31、豫雜谷2號(hào)、冀谷41、豫谷35。灰色關(guān)聯(lián)度分析得出,產(chǎn)量與其他8個(gè)性狀關(guān)聯(lián)度表現(xiàn)為單穗粒質(zhì)量>單穗質(zhì)量>出谷率>穗長>株高>穗粗>千粒質(zhì)量>生育期,說明單穗粒質(zhì)量、單穗質(zhì)量和出谷率對(duì)產(chǎn)量影響較大;加權(quán)關(guān)聯(lián)度值排前5位,綜合性狀優(yōu)異的品種(系)分別為豫谷31、豫谷32、冀谷41、豫雜谷2號(hào)和龍谷39。2種方法評(píng)價(jià)結(jié)果的秩相關(guān)系數(shù)為0.941(P<0.01),一致性較好。綜合主成分分析和灰色關(guān)聯(lián)度分析可得,豫谷31、豫谷32、冀谷41和豫雜谷2號(hào)等4個(gè)谷子新品種(系)的綜合性狀優(yōu)異,適宜在東北春谷區(qū)大面積推廣種植。

關(guān)鍵詞:谷子;相關(guān)分析;主成分分析;灰色關(guān)聯(lián)度分析;綜合評(píng)價(jià)

中圖分類號(hào):S515.037 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

文章編號(hào):1002-1302(2023)15-0042-07

基金項(xiàng)目:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):CARS-06-14.5-B25);河南省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):Z2020-14-01)。

作者簡介:王淑君(1982—),女,河南安陽人,碩士,副研究員,主要從事谷子遺傳育種研究。E-mail:logccc@163.com。

谷子別稱粟,迄今已有8 000多年歷史,是中華民族的哺育作物和生態(tài)友好型作物[1-2]。隨著氣候惡化,水資源短缺,人們生活水平提高,膳食結(jié)構(gòu)多元化,谷子在優(yōu)化調(diào)整種植業(yè)結(jié)構(gòu)中具有重要作用[3-4]。綜合評(píng)價(jià)谷子品種,對(duì)新品種選育及推廣應(yīng)用具有重要意義。近年來,多元統(tǒng)計(jì)分析已應(yīng)用于谷子品種綜合評(píng)判。賈小平等利用灰色關(guān)聯(lián)度分析從71份谷子種質(zhì)資源中篩選出10個(gè)優(yōu)秀谷子品種(系)[2];陳素省等利用灰色關(guān)聯(lián)度分析對(duì)華北區(qū)試的13個(gè)谷子品種(系)進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)[5];徐峰等利用主成分分析法對(duì)不同來源的115個(gè)谷子品種(系)的15個(gè)表型性狀進(jìn)行分析,歸納出8個(gè)主因子,篩選出10個(gè)綜合評(píng)價(jià)較高的品種(系)[6];楊平等利用灰色多維綜合隸屬度對(duì)谷子品種(系)進(jìn)行適應(yīng)性評(píng)估[7-8]。這些方法能夠從產(chǎn)量和農(nóng)藝性狀等多個(gè)指標(biāo)著手分析評(píng)價(jià)谷子品種(系),結(jié)果更加全面、客觀;然而前人對(duì)谷子品種(系)的綜合評(píng)價(jià)研究多采用單一的多元統(tǒng)計(jì)分析方法。利用2種以上多元統(tǒng)計(jì)分析方法綜合評(píng)價(jià)作物品種[9-11],尤其是灰色關(guān)聯(lián)度和主成分分析結(jié)合使用雖已大量應(yīng)用于植物品種(系)評(píng)價(jià)[12-13],但在谷子品種(系)綜合評(píng)價(jià)中卻鮮見報(bào)道。本研究利用主成分分析和灰色關(guān)聯(lián)度分析,對(duì)近6年來全國谷子品種區(qū)域適應(yīng)性聯(lián)合鑒定試驗(yàn)東北春谷區(qū)的35個(gè)谷子新品種(系)進(jìn)行綜合評(píng)判,以期為東北春谷區(qū)谷子新品種選育及推廣應(yīng)用提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)材料為2016—2021年全國谷子品種區(qū)域適應(yīng)性聯(lián)合鑒定試驗(yàn)東北春谷區(qū)的35個(gè)谷子新品種(系)(表1)。數(shù)據(jù)來自全國谷子品種區(qū)域適應(yīng)性聯(lián)合鑒定試驗(yàn)總結(jié)。

1.2 統(tǒng)計(jì)分析方法

1.2.1 主成分分析 利用SPSS 22.0對(duì)35個(gè)參試品種(系)的9個(gè)主要性狀進(jìn)行主成分分析 提取特征值大于1的成分作為主成分,分析主成分特征值和貢獻(xiàn)率;計(jì)算各參試品種(系)主成分得分與綜合得分,按照綜合得分對(duì)參試品種(系)進(jìn)行評(píng)價(jià)分析。

1.2.2 灰色關(guān)聯(lián)度分析 依據(jù)灰色關(guān)聯(lián)理論[14],將參試品種(系)各性狀作為一個(gè)灰色系統(tǒng),取各性狀最優(yōu)值構(gòu)建理想品種X0,以參試品種(系)各性狀構(gòu)成的數(shù)列作為比較數(shù)列,判斷關(guān)聯(lián)程度;關(guān)聯(lián)度越大,說明該品種(系)綜合性狀越好;反之,綜合性狀越差。關(guān)聯(lián)系數(shù)和關(guān)聯(lián)度計(jì)算公式如下:[HT5,6]

式中,|X0(k)-Xi(k)|為X0 數(shù)列與Xi 數(shù)列在第k點(diǎn)的絕對(duì)差值;minimink|X0(k)-Xi(k)|為二級(jí)最小差;maximaxk|X0(k)-Xi(k)|為二級(jí)最大差;ρ為分辨系數(shù),通常取ρ=0.5;wk為權(quán)重(通過計(jì)算各性狀與產(chǎn)量的關(guān)聯(lián)度求得);Ri′為加權(quán)關(guān)聯(lián)度。

2 結(jié)果與分析

2.1 主要性狀表現(xiàn)

各參試品種(系)主要性狀的數(shù)據(jù)為2年的平均值(表2)。由表2可知,各性狀變異系數(shù)存在一定差異,變幅在1.75%~10.68%之間,變異系數(shù)由高到低排序?yàn)閱嗡肓Y|(zhì)量>株高>單穗質(zhì)量>穗長>穗粗>產(chǎn)量>千粒質(zhì)量>出谷率>生育期,其中單穗粒質(zhì)量和株高的變異系數(shù)較大,分別為10.68%、10.31%,其他性狀的變異系數(shù)均小于10%,生育期的變異系數(shù)最小。

2.2 相關(guān)性分析

將9個(gè)主要性狀進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果(表3)表明,各性狀間存在一定的相關(guān)性。其中,生育期與株高、單穗質(zhì)量、單穗粒質(zhì)量、千粒質(zhì)量和產(chǎn)量之間呈極顯著或顯著的負(fù)相關(guān)關(guān)系;株高與穗長、單穗粒質(zhì)量、產(chǎn)量呈極顯著正相關(guān),與單穗質(zhì)量和出谷率呈顯著正相關(guān);穗長與穗粗、單穗質(zhì)量呈極顯著正相關(guān),與單穗粒質(zhì)量呈顯著正相關(guān);穗粗與單穗質(zhì)量呈極顯著正相關(guān),與單穗粒質(zhì)量呈顯著正相關(guān);單穗質(zhì)量、單穗粒質(zhì)量、出谷率、產(chǎn)量之間呈極顯著正相關(guān)。說明9個(gè)主要性狀指標(biāo)間相關(guān)性較強(qiáng),存在信息上的重疊。

2.3 各性狀主成分分析

2.3.1 主成分分析 為減少指標(biāo)間的重疊信息,對(duì)35個(gè)品種(系)的9個(gè)主要性狀進(jìn)行主成分分析。根據(jù)特征值大于1的原則,共提取3個(gè)主成分,主成分1、2、3的貢獻(xiàn)率分別為45.954%、15.551%、14.624%,累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)76.129% (表4),說明提取的3個(gè)主成分包含了各參試品種(系)主要性狀的大部分信息,可用這3個(gè)主成分對(duì)35份材料進(jìn)行評(píng)價(jià)分析。第1主成分的貢獻(xiàn)率明顯大于其他主成分,說明該主成分綜合原有信息能力較強(qiáng)。

第1主成分特征值為4.136,除生育期載荷為負(fù)值外,其他性狀載荷均為正值;其中單穗粒質(zhì)量和單穗質(zhì)量的載荷較高,分別為0.924和0.878;該主成分可作為產(chǎn)量因子。第2主成分特征值為1.400,正載荷較高的性狀是穗粗,其次是穗長;該主成分可作為谷穗形態(tài)因子。第3主成分特征值為1.316,載荷較高且為負(fù)的性狀是千粒質(zhì)量,載荷較高且為正的是生育期,說明生育期和千粒質(zhì)量可作為第3主成分代表性評(píng)價(jià)指標(biāo)。

2.3.2 各性狀指標(biāo)綜合得分分析 根據(jù)主成分?jǐn)?shù)學(xué)模型,主成分特征向量是初始因子載荷矩陣除以特征值的平方根[15],可得出3個(gè)主成分與9個(gè)性狀指標(biāo)的線性組合公式:

第1主成分得分為F1=-0.263Z1+0.336Z2+0.291Z3+0.245Z4+0.432Z5+0.454Z6+0.321Z7+0.166Z8+0.387Z9;第2主成分得分為F2=0.301Z1-0.052Z2+0.461Z3+0.632Z4+0.153Z5-0.016Z6-0.424Z7-0.221Z8-0.203Z9;第3主成分得分為F3=0.379Z1-0.310Z2-0.311Z3-0.027Z4+0.244Z5+0.267Z6+0.190Z7-0.634Z8+0.307Z9。其中,Z1~Z9為各指標(biāo)歸一化值。

用每個(gè)主成分特征值占提取特征值之和的比例作為權(quán)重,構(gòu)建主成分綜合得分公式:F=0.604F1+0.204F2+0.192F3,計(jì)算各參試品種(系)綜合得分并進(jìn)行排序。由表5可知,參試品種(系)綜合得分差異較大,變幅在-3.060~2.400之間。綜合得分較高且位于參試品種(系)前5位的是豫谷32、豫谷31、豫雜谷2號(hào)、冀谷41和豫谷35,說明這5個(gè)谷子品種(系)綜合性狀優(yōu)良;公谷88、通谷2號(hào)、公谷87、公谷86、金谷等5個(gè)品種(系)的主成分綜合得分低,排名靠后,綜合性狀較差。

2.4 灰色關(guān)聯(lián)度分析

2.4.1 各參試品種(系)關(guān)聯(lián)系數(shù)的計(jì)算 根據(jù)生產(chǎn)要求,株高、生育期選平均值為最優(yōu)值,其他性狀以最大值為最優(yōu)指標(biāo),則理想品種X0(k)={120,120.43,29.78,3.19,25.61,21.10,84.76,3.05,5 830.50}。為消除指標(biāo)間量綱差異,用X0(k)去除相應(yīng)的Xi(k),對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行無量綱化處理,計(jì)算絕對(duì)差值;其中minimink|X0(k)-Xi(k)|二級(jí)最小差值為0,maximaxk|X0(k)-Xi(k)|二級(jí)最大差值為0.369,根據(jù)公式求得關(guān)聯(lián)系數(shù)(表6)。

2.4.2 各性狀權(quán)重的計(jì)算 將產(chǎn)量作為參考數(shù)列,其他8個(gè)性狀作為比較數(shù)列,利用公式(1)和公式(2)計(jì)算產(chǎn)量與其他性狀的關(guān)聯(lián)度,然后計(jì)算出各性狀的權(quán)重。由表7可知,各性狀與產(chǎn)量關(guān)聯(lián)度由高到低排序?yàn)閱嗡肓Y|(zhì)量>單穗質(zhì)量>出谷率>穗長>株高>穗粗>千粒質(zhì)量>生育期,說明單穗粒質(zhì)量、單穗質(zhì)量和出谷率對(duì)產(chǎn)量影響較大,生育期和千粒質(zhì)量對(duì)產(chǎn)量影響較小。在選育品種時(shí)應(yīng)首先考慮單穗粒質(zhì)量、單穗質(zhì)量和出谷率這些與產(chǎn)量密切相關(guān)的性狀,對(duì)產(chǎn)量影響較小的性狀可適當(dāng)放寬選擇條件。

2.4.3 各參試品種(系)灰色關(guān)聯(lián)度分析與綜合評(píng)價(jià) 將表6中數(shù)據(jù)和各性狀權(quán)重代入公式(3),計(jì)算各參試品種(系)的加權(quán)關(guān)聯(lián)度。由表8可以看出,加權(quán)灰色關(guān)聯(lián)度值由高到低排在前5位的品種(系)是豫谷31、豫谷32、冀谷41、豫雜谷2號(hào)和龍谷39;公谷88、公谷87、通谷2號(hào)、公谷86和金谷的加權(quán)關(guān)聯(lián)度值較低,綜合性狀較差。

將評(píng)價(jià)結(jié)果與主成分分析綜合得分結(jié)果進(jìn)行相關(guān)性分析,2種方法評(píng)價(jià)結(jié)果的秩相關(guān)系數(shù)為0.941(P<0.01),說明評(píng)價(jià)結(jié)果一致性好。

3 討論與結(jié)論

主成分分析可綜合多個(gè)指標(biāo)性狀,排除重疊信息,將多個(gè)指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)不相關(guān)綜合指標(biāo),通過主成分綜合得分對(duì)參試品種進(jìn)行評(píng)價(jià)分析[16-17];灰色關(guān)聯(lián)度分析將參試品種看作一個(gè)灰色系統(tǒng),通過構(gòu)建理想品種,計(jì)算參試品種與理想品種之間的加權(quán)關(guān)聯(lián)度對(duì)參試品種進(jìn)行綜合評(píng)價(jià),關(guān)聯(lián)度越大,說明該品種的綜合性狀越接近理想品種[18] 。2種分析方法克服了單靠產(chǎn)量性狀評(píng)價(jià)品種優(yōu)劣的弊端。劉自遠(yuǎn)等認(rèn)為綜合評(píng)價(jià)過程中,權(quán)重的賦予至關(guān)重要,確定各評(píng)價(jià)因素的權(quán)重系數(shù)是科學(xué)、合理地作出評(píng)價(jià)的關(guān)鍵[19]。本研究在主成分分析時(shí)采用各主成分特征值占提取特征值之和的比例作為權(quán)重,在加權(quán)灰色關(guān)聯(lián)度分析中利用產(chǎn)量與各性狀的關(guān)聯(lián)度計(jì)算各性狀權(quán)重系數(shù),避免了依靠育種經(jīng)驗(yàn)賦予權(quán)重的主觀性。主成分分析和灰色關(guān)聯(lián)度分析的結(jié)合運(yùn)用,彌補(bǔ)了單個(gè)分析方法的不足,使評(píng)價(jià)結(jié)果更加客觀、準(zhǔn)確、科學(xué)。

結(jié)果表明,參試材料各性狀的變異系數(shù)存在一定差異,變幅在1.75%~10.68%之間,其中單穗粒質(zhì)量和株高的變異系數(shù)較大,分別為10.68%和10.31%,其他性狀變異系數(shù)均小于10%,生育期變異系數(shù)最小。主成分分析結(jié)果顯示,35個(gè)參試品種(系)的9個(gè)性狀共提取3個(gè)主成分;單穗粒質(zhì)量和單穗質(zhì)量等產(chǎn)量構(gòu)成因素指標(biāo)主要在第1主成分上,貢獻(xiàn)率最大(45.954%)。因此,選育谷子品種(系)時(shí)應(yīng)首先考慮單穗粒質(zhì)量和單穗質(zhì)量性狀的選擇,盡量選擇單穗質(zhì)量和單穗粒質(zhì)量較高的品種(系)。李志江等研究2010—2015年東北春谷區(qū)育成品種認(rèn)為,單穗質(zhì)量和單穗粒質(zhì)量對(duì)產(chǎn)量影響最大,育種中應(yīng)在注重單穗質(zhì)量和單穗粒質(zhì)量的同時(shí),兼顧株高、生育期、抗性等其他因素對(duì)產(chǎn)量的影響[3],本研究結(jié)果與之一致。從各性狀與產(chǎn)量的關(guān)聯(lián)度來看,單穗粒質(zhì)量和單穗質(zhì)量與產(chǎn)量的關(guān)聯(lián)度最大,說明單穗粒質(zhì)量和單穗質(zhì)量對(duì)產(chǎn)量的影響較大,這與相關(guān)性分析和主成分分析結(jié)果一致,也與趙禹凱等的研究結(jié)果[20-21]基本一致。

主成分綜合得分分析結(jié)果表明,豫谷32、豫谷31、豫雜谷2號(hào)、冀谷41和豫谷35的綜合得分較高,排在參試品種(系)前5位;公谷88、通谷2號(hào)、公谷87、公谷86、金谷的綜合得分排名靠后,綜合表現(xiàn)較差?;疑P(guān)聯(lián)度分析結(jié)果表明,加權(quán)關(guān)聯(lián)度值較大且排前5位的品種(系)分別為豫谷31、豫谷32、冀谷41、豫雜谷2號(hào)和龍谷39,公谷88、公谷87、通谷2號(hào)、公谷86和金谷的加權(quán)關(guān)聯(lián)度值排名靠后。將主成分分析與灰色關(guān)聯(lián)度分析評(píng)價(jià)結(jié)果進(jìn)行相關(guān)分析,2種方法評(píng)價(jià)結(jié)果的秩相關(guān)系數(shù)為0.941(P<0.01),說明評(píng)價(jià)結(jié)果一致性好,驗(yàn)證了評(píng)價(jià)結(jié)果的準(zhǔn)確性。

綜合主成分分析和灰色關(guān)聯(lián)度分析,豫谷31、豫谷32、冀谷41、豫雜谷2號(hào)的綜合性狀優(yōu)異,適宜在東北春谷區(qū)推廣種植。

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