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燙水蛭(螞蟥)配方顆粒的位點(diǎn)特異性PCR鑒別△

2023-09-30 07:58胡力袁媛張輝張?zhí)?/span>金艷趙玉洋蔣超
中國現(xiàn)代中藥 2023年8期
關(guān)鍵詞:螞蟥凍干粉偽品

胡力,袁媛,張輝,張?zhí)?,金艷,趙玉洋,蔣超

1.安徽中醫(yī)藥大學(xué) 藥學(xué)院,安徽 合肥 230012;

2.中國中醫(yī)科學(xué)院 中藥資源中心,北京 100700;

3.華潤三九現(xiàn)代中藥制藥有限公司,廣東 深圳 518029

水蛭是我國傳統(tǒng)名貴中藥,《中華人民共和國藥典》(以下簡稱《中國藥典》)2020 年版規(guī)定其為水蛭科動(dòng)物螞蟥Whitmania pigraWhitman、水蛭Hirudo nipponicaWhitman 或柳葉螞蟥W.acranulataWhitman 的干燥全體,夏、秋二季捕捉,用沸水燙死,曬干或低溫干燥。燙水蛭為取凈水蛭段,按《中國藥典》2020 年版炒法(通則0213),用滑石粉燙至微鼓起[1]。燙水蛭(螞蟥)經(jīng)過水提、濃縮、干燥、制粒成配方顆粒后,具有療效穩(wěn)定、規(guī)格統(tǒng)一、標(biāo)準(zhǔn)一致的優(yōu)勢。但由于加工后配方顆粒不再具備傳統(tǒng)性狀、顯微等鑒別特征,運(yùn)用傳統(tǒng)方法對其進(jìn)行鑒定具有很大的局限性。與傳統(tǒng)鑒別方法相比,分子鑒定具有快速、準(zhǔn)確、專屬性強(qiáng)的特點(diǎn),目前已建立多種分子鑒定方法用于中藥材、中藥飲片[2-8]、中成藥的基原鑒定[9-12]。

DNA 作為遺傳信息的載體,具有信息量大、遺傳穩(wěn)定性高、化學(xué)穩(wěn)定性強(qiáng)等特點(diǎn)[13],對于煎煮炮制后的中藥物種鑒定具有天然的優(yōu)勢。位點(diǎn)特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是基于單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的一種基因分型方法,使用具有種屬特異性的引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,僅目的物種可檢測到擴(kuò)增產(chǎn)物,并通過瓊脂糖凝膠電泳法檢測PCR 產(chǎn)物是否存在,可進(jìn)行定性判斷。特異性PCR 鑒定已廣泛應(yīng)用于貴細(xì)藥材、冷背藥材、外來藥材及其提取液和配方顆粒的基原鑒定中[14-18],尤其對配方顆粒進(jìn)行專屬性鑒別,有助于保證臨床用藥的安全性、有效性。本研究擬建立燙水蛭(螞蟥)配方顆粒PCR 鑒別方法,為規(guī)范燙水蛭(螞蟥)及其相關(guān)產(chǎn)品質(zhì)量提供檢測依據(jù)。

1 材料

1.1 儀器

Veriti? 型PCR 儀、GeneAmp 9700 型PCR 儀、Veriti? PRO 型PCR 儀(Applied Biosystems 公司);TC-512 型PCR 儀(Techne 公司);SYNGENE 型凝膠成像系統(tǒng)(Gene公司)。

1.2 試劑

Wizard?SV Genomic DNA Purification System(美國Promega 生物公司,批號:0000518550);2×M5 PCR Mix(北京聚合美生物科技公司,批號:23DB0801);2×TaqPCR Mix(金百特生物公司,批號:P0195);SpeedSTAR HSTaqDNA 聚合酶、LATaqHS DNA 聚合酶、6×loading buffer(日本Takara公司,批號分別為AK81590A、AL22021A、R10201);Trans2000 DNA Marker(北京全式金生物技術(shù)有限公司,批號:R20222);GelRed 核酸染料(北京蘭博利德公司,批號:R0010407)。

1.3 樣品

燙水蛭(螞蟥)、標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、配方顆粒由華潤三九醫(yī)藥股份有限公司提供。燙水蛭(螞蟥)飲片(批號為2005001~2005015)經(jīng)中國中醫(yī)科學(xué)院蔣超副研究員鑒定為燙水蛭(螞蟥)Whitmania pigraWhitman(表1)。以鑒定后燙水蛭(螞蟥)飲片制備了15 批燙水蛭(螞蟥)標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉(批號為2005001Y~2005015Y),為了建立統(tǒng)一準(zhǔn)確的鑒定標(biāo)準(zhǔn),對生產(chǎn)過程中的各個(gè)階段都進(jìn)行了樣品收集和制備,燙水蛭和水蛭相比經(jīng)過了炮制加工,為考察分子標(biāo)記對不同加工階段樣品的鑒定效果,制備了3 批配方顆粒中間體(批號為520901Y~520903Y),3 批配方顆粒成品(批號為2010001Y~2010003Y)。為了確保使用的分子鑒定標(biāo)記對不同加工階段樣品都有良好的鑒定效果,收集了3 批水蛭(螞蟥)飲片,取出一部分飲片制成燙水蛭(螞蟥)飲片,再將兩者制成相應(yīng)的3 批標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉用于生熟異治區(qū)分(表2)。收集7 批陰性樣品(包括《中國藥典》2020 年版中規(guī)定的燙水蛭的另外2 個(gè)來源):1 批柳葉螞蟥W.acranulataWhitman、2 批水蛭Hirudo nipponicaWhitman、2 批海南山蛭Haemadipsa hainanaSong、2 批菲牛蛭Poecilobdella manillensisLesson(表3)作為常見混偽品?;靷纹酚芍袊嗅t(yī)科學(xué)院蔣超副研究員鑒定。燙水蛭(螞蟥)對照藥材(中國食品藥品檢定研究院,批號:121061-201305)。

表1 15批燙水蛭(螞蟥)飲片信息

表2 燙水蛭(螞蟥)生熟異治樣品

表3 燙水蛭(螞蟥)陰性樣品

2 方法

2.1 DNA提取

使 用Wizard ? SV Genomic DNA Purification System 試劑盒依據(jù)說明書步驟提取。樣品模板DNA溶液提取完成后置4 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

2.2 引物設(shè)計(jì)

通過對比燙水蛭(螞蟥)與同屬近源種及常見偽品的細(xì)胞色素C 氧化酶Ⅰ(COⅠ)序列選擇特異性片段設(shè)計(jì)燙水蛭(螞蟥)特異性PCR 鑒別引物,篩選出燙水蛭(螞蟥)的穩(wěn)定引物區(qū)間;在區(qū)間內(nèi)篩選獲得燙水蛭(螞蟥)的特異性SNP 位點(diǎn),將燙水蛭(螞蟥)序列中的5?-TTTCCTCGTCTGAATAAC-3?特異性位點(diǎn)C 的前一位從A 替換為T,設(shè)計(jì)燙水蛭特異性鑒別引物TSZ-F 及TSZ-R,其中上游引物序列TSZ-F為5?-TTTCCTCGTCTGAATATC-3?,下游引物序 列TSZ-R 為5?-GAGATACGGAGTCTG ATAG-3?。預(yù)期PCR 產(chǎn)物長度為133 bp。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

2.3 PCR擴(kuò)增條件

取燙水蛭(螞蟥)飲片、燙水蛭(螞蟥)標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、燙水蛭(螞蟥)配方顆粒及混偽品DNA考察退火溫度(54、56、58、60 ℃)、PCR 循環(huán)數(shù)(32、34、36、38 個(gè)循環(huán))、Taq酶種類(2×M5 PCR Mix、2×TaqPCR Mix、SpeedSTAR HSTaq和LATaqHS)、DNA模板量(75.0、37.5、15.0、6.0 ng)對PCR 鑒別結(jié)果穩(wěn)定性的影響。篩選出最適合的鑒別條件,對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒進(jìn)行位點(diǎn)特異性PCR鑒別。PCR產(chǎn)物使用1.5%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測。

3 PCR鑒別條件的確定與耐用性考察

3.1 退火溫度

使用燙水蛭(螞蟥)特異性鑒別引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,選用Veriti? PRO 型PCR 儀進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為2×M5 PCR Mix 12.5 μL、燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物(10 μmol·L-1)各0.4 μL、DNA 模板2.5 μL、ddH2O 9.2 μL。PCR 參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)34 次(94 ℃變性30 s,退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min,其中退火溫度分別設(shè)置為54、56、58、60 ℃。結(jié)果表明,在54 ℃時(shí),燙水蛭(螞蟥)飲片、標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、配方顆粒能在100~250 bp(約133 bp)處擴(kuò)增得單一明亮條帶,混偽品和陰性樣品在56~58 ℃時(shí)出現(xiàn)弱擴(kuò)增,隨著退火溫度升高,擴(kuò)增效率降低導(dǎo)致配方顆粒的條帶逐漸變暗甚至消失;60 ℃時(shí)配方顆粒條帶模糊不清,無法作為鑒別依據(jù)(圖1)。為避免產(chǎn)生假陽性或假陰性結(jié)果,選擇PCR退火溫度為54 ℃。

圖1 退火溫度對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別結(jié)果的影響

3.2 循環(huán)次數(shù)考察

分別選用32、34、36、38個(gè)循環(huán)進(jìn)行考察,選用Veriti? PRO 型PCR 儀進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為2×M5 PCR Mix 12.5 μL、燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物(10 μmol·L-1)各0.4 μL、DNA 模板2.5 μL、ddH2O 9.2 μL。PCR 參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)(94 ℃變性30 s,退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min。4~10 ℃保存。結(jié)果表明,在32~38個(gè)循環(huán)時(shí)燙水蛭(螞蟥)飲片、標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、配方顆粒在100~250 bp(約133 bp)處擴(kuò)增得單一明亮條帶,均能得到正確鑒別結(jié)果,36~38 個(gè)循環(huán)時(shí)混偽品和陰性樣品出現(xiàn)擴(kuò)增條帶(圖2)。為保證結(jié)果的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性,選擇34個(gè)循環(huán)進(jìn)行PCR。

圖2 循環(huán)次數(shù)對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別結(jié)果的影響

3.3 不同Taq酶考察

為測試不同種類的Taq酶對燙水蛭(螞蟥)及其混偽品鑒別結(jié)果的影響,分別使用2×M5 PCR Mix、2×TaqPCR Mix、SpeedSTAR HSTaqDNA、LATaqHS DNA 聚合酶進(jìn)行測試。選用Veriti? PRO型PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為Taq酶12.5 μL、燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物(10 μmol·L-1)各0.4 μL、DNA模板2.5 μL、ddH2O 9.2 μL。PCR參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)34 次(94 ℃變性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃ 延伸30 s),72 ℃延伸5 min。4~10 ℃保存。結(jié)果表明,除2×M5 PCR Mix 在100~250 bp(約133 bp)擴(kuò)增出單一明亮條帶外,使用其他Taq酶均未在100~250 bp 擴(kuò)增出目的條帶,因此選擇2×M5 PCR Mix作為最優(yōu)的Taq酶(圖3)。

圖3 不同Taq DNA聚合酶對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別結(jié)果的影響

3.4 DNA模板量考察

對25 μLPCR 體系中的模板DNA 用量進(jìn)行了考察,調(diào)整DNA 質(zhì)量濃度約15 ng·μL-1,選用Veriti?PRO 型PCR 儀進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為2×M5 PCR Mix 12.5 μL,燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物(10 μmol·L-1)各0.4 μL,分別設(shè)置5.0、2.5、1.0、0.5 μL 的DNA 模板(DNA 量分別相當(dāng)于75.0、37.5、15.0、6.0 ng),ddH2O 的量分別為6.7、9.2、10.7、11.2 μL。PCR 參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)34 次(94 ℃變性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min。4~10 ℃保存。結(jié)果表明,DNA 模板量為0.5~5.0 μL均能在100~250 bp(約133 bp)擴(kuò)增出單一明亮條帶(圖4)。為防止模板質(zhì)量濃度過高產(chǎn)生假陽性或過低產(chǎn)生假陰性結(jié)果,選擇DNA 模板量為25 μL(約37.5 ng)。

圖4 DNA模板量對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別結(jié)果的影響

3.5 不同PCR儀考察

為測試不同PCR 儀對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒及其混偽品鑒別結(jié)果的影響,分別使用4 種PCR 儀進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增體系為2×M5 PCR Mix 12.5 μL、燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物(10 μmol·L-1)各0.4 μL、DNA 模 板2.5 μL、ddH2O 9.2 μL。PCR 參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)34 次(94 ℃變性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min。4~10 ℃保存。結(jié)果表明,使用Veriti? 型、GeneAmp 9700 型、Veriti? PRO 型PCR儀均可獲得正確的鑒定結(jié)果,而使用TC-512 型PCR儀未成功擴(kuò)增出條帶(圖5),表明進(jìn)行燙水蛭(螞蟥)配方顆粒PCR 鑒別時(shí)應(yīng)對擴(kuò)增溫度進(jìn)行微調(diào),并進(jìn)行方法確認(rèn)。

圖5 不同PCR儀對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別結(jié)果的影響

3.6 引物用量考察

為測試不同引物用量對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒及其混偽品鑒別結(jié)果的影響,分別使用4個(gè)引物用量進(jìn)行擴(kuò)增,引物濃度為10 μmol·L-1。選用Veriti? PRO型PCR儀擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為2×M5 PCR Mix 12.5 μL,分別設(shè)置0.2、0.4、0.6、0.8 μL(10 μmol·L-1)的燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物,DNA 模板2.5 μL,ddH2O 的量分別為9.6、9.2、8.8、8.4 μL。PCR 參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)34 次(94 ℃變性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min。4~10 ℃保存。結(jié)果表明,引物用量為0.2~0.8 μL 時(shí)正品均可獲得正確的鑒定結(jié)果,而引物用量>0.6 μL 時(shí)偽品出現(xiàn)雜帶(圖6)。為了防止引物濃度過高導(dǎo)致雜帶產(chǎn)生,選擇燙水蛭(螞蟥)配方顆粒PCR鑒別時(shí)引物濃度為10 μmol·L-1,用量為0.4 μL。

圖6 引物用量對燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別結(jié)果的影響

根據(jù)以上結(jié)果,確定燙水蛭(螞蟥)配方顆粒PCR 鑒別的條件為PCR 體系為25 μL,包括2×M5 PCR Mix 12.5 μL、燙水蛭(螞蟥)配方顆粒鑒別引物(10 μmol·L-1)各0.4 μL、DNA 模板2.5 μL、ddH2O 9.2 μL。PCR參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)34次(94 ℃變性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min。4~10 ℃保存。

3.7 專屬性考察

使用所建立的燙水蛭(螞蟥)配方顆粒PCR 鑒定方法對燙水蛭(螞蟥)飲片、配方顆粒、標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉及其混偽品進(jìn)行鑒定。結(jié)果表明,燙水蛭飲片,標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉和配方顆粒成品均能在100~250 bp(約133 bp)擴(kuò)增出單一明亮條帶,7 批混偽品均無條帶(圖7)。

圖7 燙水蛭(螞蟥)專屬性考察

3.8 適用性考察

使用所建立的燙水蛭配方顆粒PCR 鑒定方法對15 批水蛭(螞蟥)飲片進(jìn)行適用性考察(圖8)。結(jié)果表明,15 批水蛭(螞蟥)飲片均能得到正確的鑒定結(jié)果。對15 批燙水蛭(螞蟥)飲片、15 批燙水蛭(螞蟥)飲片標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、3 批燙水蛭(螞蟥)配方顆粒中間體、3 批燙水蛭(螞蟥)配方顆粒、3 批水蛭(螞蟥)飲片、3 批燙水蛭(螞蟥)飲片、3 批水蛭(螞蟥)飲片標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、3 批燙水蛭(螞蟥)飲片標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉進(jìn)行適用性考察,凝膠電泳圖譜結(jié)果與燙水蛭對照藥材凝膠電泳圖譜相應(yīng)的位置上,在100~250 bp存在單一DNA 條帶,空白對照無條帶(圖9)。

圖8 15批水蛭(螞蟥)飲片適用性考察

圖9 燙水蛭配方顆粒適用性考察

4 結(jié)語

藥源調(diào)查和全面的樣品采集是建立準(zhǔn)確、可靠PCR鑒別方法的前提。燙水蛭(螞蟥)配方顆粒經(jīng)過了高溫水煮、干燥、制粒等一系列制備工藝,DNA高度降解,且加工后喪失性狀與顯微鑒別特征,傳統(tǒng)的鑒定手段無法滿足燙水蛭配方顆粒鑒定的需求。

配方顆粒經(jīng)過加工后,DNA 降解程度較大,留存的DNA片段較小,在進(jìn)行特異性PCR鑒別時(shí),主要依據(jù)存在變異的短小片段進(jìn)行特異性PCR 鑒別。相較于原藥材,在進(jìn)行配方顆粒PCR 擴(kuò)增時(shí),退火溫度不能過高,過高的退火溫度會導(dǎo)致擴(kuò)增效率降低,加之配方顆粒的DNA 質(zhì)量濃度較低會導(dǎo)致配方顆粒擴(kuò)增條帶逐漸變暗甚至消失。此外,配方顆粒也需要較高的PCR 循環(huán)來保證目的條帶的產(chǎn)生。上述因素使得對配方顆粒PCR 鑒別的引物特異性要求較高,在篩選引物時(shí),應(yīng)選擇擴(kuò)增效果好、條帶明亮清晰、陰性樣品無目的條帶的引物。

使用本研究建立的特異性PCR 方法對多批水蛭(螞蟥)飲片、燙水蛭(螞蟥)飲片、燙水蛭(螞蟥)標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉及燙水蛭(螞蟥)配方顆粒等進(jìn)行檢驗(yàn)。結(jié)果表明,63 批樣品均在100~250 bp 見單一特異性鑒別條帶。專屬性考察結(jié)果表明,燙水蛭(螞蟥)正品飲片、標(biāo)準(zhǔn)湯劑凍干粉、配方顆粒均在100~250 bp 見單一特異性鑒別條帶,水蛭另外2 個(gè)來源及偽品均無條帶。以上結(jié)果表明,本研究建立的燙水蛭(螞蟥)特異性鑒別方法對配方顆粒具有良好的適用性及專屬性,可為燙水蛭(螞蟥)藥材及其配方顆粒等加工產(chǎn)品提供相應(yīng)的檢測工具,為完善燙水蛭(螞蟥)的質(zhì)量控制體系、保障其臨床應(yīng)用提供依據(jù),也為其他中藥品種的配方顆粒鑒別方法研究提供參考。

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