王孟虎,許亮,蔣磊,李峰,孫一帆,康廷國,孟祥松,張圣陽,鐘明月,黃文康,石飄柔
1.遼寧中醫(yī)藥大學(xué),遼寧 大連 116600;
2.亳州學(xué)院,安徽 亳州 236800;
3.亳州市食品藥品檢驗中心,安徽 亳州 236800;
4.亳州職業(yè)技術(shù)學(xué)院,安徽 亳州 236800;
5.中國藥科大學(xué),江蘇 南京 210000
蘄蛇(Agkistrodon)為蝰科尖吻蝮屬動物五步蛇Agkistrodon acutus(Guenther)的干燥體,烏梢蛇(Zaocys)為游蛇科動物烏梢蛇Zaocys dhumnades(Cantor)的干燥體,金錢白花蛇(Bungarus Parvus)為眼鏡蛇科動物銀環(huán)蛇Bungarus multicinctusBlyth的幼蛇干燥體,具有祛風(fēng)、通絡(luò)、止痙的功效,主治風(fēng)濕頑痹、中風(fēng)、麻木拘謹(jǐn)、半身不遂等,均收載于《中華人民共和國藥典》(以下簡稱《中國藥典》)2020年版[1]。由于野生蛇類資源匱乏,人工養(yǎng)殖規(guī)模還未滿足需求,導(dǎo)致市售蛇類藥材價格較高。市售藥材為不完整個體,常常摻雜有混偽品。為了保證用藥的安全性、維護(hù)蛇類藥材市場的穩(wěn)定性,建立快速、準(zhǔn)確鑒別蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇及其易混偽品的方法具有重要意義。
DNA 條形碼由Hebert等[2-3]在2002年提出,陳士林等[4]在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了大量研究,確立了動物類藥材DNA條形碼細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)基因鑒定體系。由于該方法不受個體、環(huán)境等因素影響,能夠準(zhǔn)確、快速地對物種進(jìn)行鑒定,現(xiàn)已應(yīng)用在各動物類樣品的鑒定及鑒別領(lǐng)域。晁志等[5]基于DNA條形碼COⅠ基因?qū)疱X白花蛇及其8種混偽品進(jìn)行鑒定,顯示各物種均獨立聚為一支,其中游蛇科與眼鏡蛇科為姐妹群。廖倩等[6]基于DNA 條形碼COⅠ基因?qū)?3種蛇類進(jìn)行鑒定,顯示各物種均獨立聚為一支,游蛇科與眼鏡蛇科為姐妹群,鏈蛇屬與白環(huán)蛇屬親緣關(guān)系較近,并支持前人研究中對錦蛇屬的重新劃分(玉斑錦蛇被歸類于麗蛇屬,稱為玉斑麗蛇;三索錦蛇被歸類為頜腔蛇屬,稱為三索頜腔蛇;王錦蛇仍歸屬于錦蛇屬)。黃勇等[7]基于DNA條形碼COⅠ基因?qū)?9 種蛇類進(jìn)行鑒定,結(jié)果顯示灰鼠蛇有可能被錯誤鑒定為烏梢蛇,赤練蛇種內(nèi)遺傳距離差異較大。石林春等[8]基于DNA條形碼COⅠ基因?qū)诿煎\蛇、錦蛇、烏梢蛇蛇蛻進(jìn)行鑒定,結(jié)果顯示該方法能夠準(zhǔn)確鑒定3 種蛇蛻。崔麗娜等[9]基于DNA 條形碼COⅠ基因?qū)疱X白花蛇及4 種偽品進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定?!吨袊幍洹?020 年版利用性狀、特異性引物對蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇及其混偽品進(jìn)行鑒別,其中設(shè)計的特異性引物能夠?qū)φ愤M(jìn)行擴(kuò)增并有單一條帶,而偽品則無條帶[1]。雖然,利用該方法能夠準(zhǔn)確鑒定蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇,但卻無法對混偽品進(jìn)行鑒定,無法獲知混偽品的基原信息。
在前人研究的基礎(chǔ)上,本課題組收集蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇及其混偽品,結(jié)合從GenBank 下載的正品及混偽品COⅠ序列構(gòu)建鄰接(NJ)系統(tǒng)發(fā)育樹,不僅對正品及混偽品進(jìn)行鑒定,也能夠為物種的分類提供一定信息。
T100 型PCR 擴(kuò)增儀[伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品(上海)有限公司];DYY-7C 型電泳系統(tǒng)(北京六一生物科技有限公司);JXFSTPRP-CL 型全自動樣品冷凍研磨儀、JS-2000 型紫外凝膠成像儀(上海培清科技有限公司);QH07058 型微量移液器(賽默飛世爾科技公司);WZB-32AF/S 型制冰機(jī)(寧波惠康國際工業(yè)有限公司);LC-JSY-1 型恒溫金屬浴、LCMini-12KSP 型離心機(jī)(上海力辰儀器科技有限公司);SPEED×10 型混勻儀(群安實驗儀器有限公司);P70F23P-G5(B0)型微波爐(格蘭仕集團(tuán))。
Ezup 柱式動物基因組DNA 抽提試劑盒(批號:B518251-0301)、GelRed(批號:H902KA1483)、Marker DL 2000(批 號:B500350-0500)、5×TBE buffer(批號:B548102-0500)、雙蒸水(批號:A500197-0500)、1×TE buffer(批 號:B548106-0500)均購自生工生物工程(上海)股份有限公司;瓊脂糖(批號:1110GR100,德國Biofroxx 公司);2×TaqMaster Mix(批號:L/N 017E2201CB,南京諾唯贊生物科技股份有限公司)。
蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇的混偽品較多,通過查閱《常用中藥材及混偽品種整理》[10]、《中藥材市場常見易混品種鑒別圖集》[11]、《中國中藥材真?zhèn)舞b別圖典1(常用貴重藥材、進(jìn)口藥材分冊)》[12]、《實用中藥材品種鑒別》[13]、《易混淆中藥鑒別》[14]等書籍發(fā)現(xiàn),蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇的混偽品數(shù)量分別有16、19、11種。同時,參考《中國動物志·爬行綱(第三卷)》[15]及在線網(wǎng)站iNaturalistGT(https://guatemala.inaturalist.org/taxa/85553-Serpentes)對各物種的分類學(xué)信息進(jìn)行分析,最終確定各物種拉丁學(xué)名并在GenBank下載各物種COⅠ堿基序列。將記載蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇各自對應(yīng)的混偽品進(jìn)行統(tǒng)計(表1)。分別從安徽亳州、河北安國、成都荷花池藥材市場購買金錢白花蛇、蘄蛇、烏梢蛇及其混偽品,所有樣品均經(jīng)亳州學(xué)院孟祥松主任中藥師鑒定,存放在亳州學(xué)院冷庫內(nèi),樣品信息見表2。
表1 蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇的混偽品
表2 蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇及其混偽品
取樣品蛇肌肉組織,用75%乙醇擦拭滅菌后用手術(shù)剪剪碎,低溫冷凍研磨儀研磨,取粉末約20 mg,使用Ezup 柱式動物基因組DNA 抽提試劑盒提取總DNA,具體操作步驟按試劑盒操作說明進(jìn)行。
擴(kuò)增的序列的引物為動物COⅠ基因通用引物,正向引物:LCO1490 5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′,反向引物:HCO21985′-TAAACTTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′。PCR 反應(yīng)體系為50 μL,體系內(nèi)含引物對各1.0 μL(10 μmol·L-1),2×TaqMaster Mix 25 μL,模板1 μL,加雙蒸水補(bǔ)足至50 μL。擴(kuò)增程序參考《中國藥典》2020年版(四部)[16],為95 ℃,3 min;94 ℃,40 s,45 ℃,30 s,72 ℃,30 s,30個循環(huán);72 ℃,10 min。4 ℃短期保存,-20 ℃長期保存。
取PCR 產(chǎn)物5 μL,用1.5%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,電泳電壓為100 V,電泳時間為35 min,Marker 為DL2000,將PCR 產(chǎn)物進(jìn)行雙向測序,得到正、反堿基序列,利用CodonCodeAligner 11.0.1查看峰圖并進(jìn)行雙向拼接,去除低質(zhì)量區(qū)及引物區(qū),獲得目標(biāo)堿基序列。從GenBank下載32種蛇類COⅠ基因序列,為保證下載堿基序準(zhǔn)確性,所有下載堿基均經(jīng)Blast 檢索和BOLD 平臺驗證,鑒定率均達(dá)到99%以上(表3)。
表3 蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇及其混偽品的GenBank登錄號
利用MEGA 11.0 軟件對蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇測序獲得的COⅠ基因序列進(jìn)行比對分析,獲得三者的簡約信息位點。將實驗測得蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇與混偽品種堿基序列和表3 中堿基序列進(jìn)行比對,分別獲得蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇與其各自對應(yīng)混偽品的簡約信息位點。
利用MEGA 11.0 軟件將所測物種的COⅠ序列與從GenBank 下載的堿基序列進(jìn)行遺傳距離比對分析,獲得各物種種間、種內(nèi)遺傳距離。
利用MEGA 11.0 軟件將所測物種的COⅠ序列與從GenBank 下載的堿基序列構(gòu)建NJ 系統(tǒng)聚類樹,同時以自舉檢驗法(Bootstrap)檢驗聚類樹各分支的支持率,自展次數(shù)設(shè)置為1000次。
將測序獲得的蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇COⅠ基因序列進(jìn)行比對分析,蘄蛇與烏梢蛇、金錢白花蛇分別有134、135 個信息位點,烏梢蛇與金錢白花蛇有117個信息位點,三者共有189個信息位點;蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇與其對應(yīng)的混偽品分別有253、265、233 個信息位點,三者種內(nèi)信息位點分別有27、28、13個。
將測序獲得的COⅠ堿基序列與從GenBank下載的堿基序列進(jìn)行比對分析,由于物種數(shù)量較多,表3 的序號對應(yīng)的物種只展示種間遺傳距離及種內(nèi)平均遺傳距離,各物種種間遺傳距離均大于0.100,種內(nèi)遺傳距離均小于0.056,蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇及其混偽品物種平均種內(nèi)、種間遺傳距離見增強(qiáng)出版附加材料。
將所測樣本序列與從GenBank 下載的堿基序列進(jìn)行比對分析并構(gòu)建NJ 系統(tǒng)聚類樹,如圖1 所示,蘄蛇、金錢白花蛇、烏梢蛇均獨立聚為一支,三者分別歸屬于蝰科、眼鏡蛇科、游蛇科,與科內(nèi)其他混偽品種均獨立聚為一支,說明基于COⅠ序列不僅能夠鑒別蘄蛇、金錢白花蛇、烏梢蛇,還能夠鑒別可能科內(nèi)其他物種。所有的樣品均為蝰科、眼鏡蛇科、游蛇科科內(nèi)物種,但基于3 科物種的NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹顯示并未聚為三大支,其中游蛇科有14 屬21種,科內(nèi)物種并未聚為一支,華游蛇屬(赤鏈華游蛇、環(huán)紋華游蛇)及腹鏈蛇屬(草腹鏈蛇)與蝰科聚為一大支;林蛇屬(黃環(huán)林蛇)及頸棱蛇屬(頸棱蛇)與眼鏡蛇科聚為一大支;水蛇屬(寬吻水蛇)、鉛色蛇屬(鉛色水蛇)、沼蛇屬(中國沼蛇)、漁游蛇屬(漁游蛇)并未與其他游蛇科物種聚為一大支;錦蛇屬玉斑錦蛇、百花錦蛇、黑眉錦蛇并未聚為一支,而是玉斑錦蛇與滯卵蛇屬聚為一小支,百花錦蛇與黑眉錦蛇并未聚為一小支。
圖1 蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇NJ系統(tǒng)聚類樹
根據(jù)NJ系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,除沼蛇屬中國沼蛇未聚為一支外,其余各物種均獨立聚為一支。中國沼蛇種內(nèi)遺傳距離為0.018,而赤鏈蛇、山烙鐵頭、王錦蛇、中介蝮種內(nèi)遺傳距離分別為0.022、0.056、0.019、0.018,均不小于0.018 且均聚為一支,這可能是由于中國沼蛇位于聚類樹外圍導(dǎo)致的。蝰科與游蛇科華游蛇屬、腹鏈蛇屬聚為一支,且游蛇科華游蛇屬、腹鏈蛇屬與游蛇科其他屬相距較遠(yuǎn),顯示華游蛇屬(赤鏈華游蛇、環(huán)紋華游蛇)、腹鏈蛇屬(草腹鏈蛇)與蝰科更近的親緣關(guān)系。眼鏡蛇科與游蛇科(林蛇屬、頸棱蛇屬)聚為一支并與游蛇科、蝰科并列聚類,顯示了林蛇屬黃環(huán)林蛇、頸棱蛇屬頸棱蛇與眼鏡蛇科有更近的親緣關(guān)系。眼鏡蛇科與蝰科為姐妹群,說明眼鏡蛇科與蝰科親緣關(guān)系較近?!吨袊鴦游镏尽づ佬芯V(第三卷)》將紅紋滯卵蛇、玉斑錦蛇、王錦蛇、百花錦蛇、黑眉錦蛇都?xì)w屬為錦蛇屬[15],而根據(jù)在線網(wǎng)站可知紅紋滯卵蛇歸屬為滯卵蛇屬,王錦蛇歸屬為玉斑蛇屬,玉斑錦蛇、百花錦蛇、黑眉錦蛇歸為錦蛇屬,NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹支持該物種在線網(wǎng)站中的最新歸屬,但錦蛇屬內(nèi)玉斑錦蛇、百花錦蛇、黑眉錦蛇并未聚為一支?!吨袊鴦游镏尽づ佬芯V(第三卷)》將烏梢蛇歸屬為烏梢蛇屬,白環(huán)蛇歸屬為白環(huán)蛇屬,赤鏈蛇歸屬為赤鏈蛇屬,黑背白環(huán)蛇及雙全白環(huán)蛇歸屬為白環(huán)蛇屬[15],在線網(wǎng)站將烏梢蛇歸屬為鼠蛇屬,白環(huán)蛇、赤鏈蛇、黑背白環(huán)蛇、雙全白環(huán)蛇歸屬為白環(huán)蛇屬,NJ 系統(tǒng)聚類樹均支持在線網(wǎng)站中的最新物種歸屬。
以上說明,基于DNA 條形碼COⅠ基因能夠?qū)?2 種蛇類進(jìn)行鑒定,赤鏈華游蛇、環(huán)紋華游蛇、草腹鏈蛇歸屬為蝰科和黃環(huán)林蛇、頸棱蛇歸屬為眼鏡蛇科有待進(jìn)一步研究;錦蛇屬玉斑錦蛇、百花錦蛇、黑眉錦蛇歸屬有待一進(jìn)步研究;蝰科、眼鏡蛇科、游蛇科聚為一大支,與寬吻水蛇、鉛色水蛇、中國沼蛇、漁游蛇并列聚類,這4 個物種獨立于蝰科、眼鏡蛇科、游蛇科,其種屬分類有待進(jìn)一步研究。