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LncRNA CUST_49525和CUST_47163在急性髓系白血病患者外周血中的表達及其診斷意義

2023-10-20 05:55哈麗亞塔力達吾別克劉曉東
癌變·畸變·突變 2023年5期
關(guān)鍵詞:核率外周血淋巴細胞

高 冉,哈麗亞·塔力達吾別克,劉曉東,田 薇

(新疆醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院,新疆 烏魯木齊 830011)

急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是血液系統(tǒng)高發(fā)的惡性腫瘤之一,其特征是骨髓和外周血中尚未成熟的干細胞增殖失控、凋亡受阻,造血功能異常,且具有高度異質(zhì)性[1]。近年來,雖然AML 治療和抑制方法的研究取得了顯著進展[2],提高了患者生存率。但是診斷、治療和預(yù)后的檢測效果仍然不夠理想[3]。AML 是環(huán)境、遺傳以及多種因素共同作用的結(jié)果,從分子層面探究AML的復(fù)雜發(fā)病機制,能夠為AML診斷標準提供新的方向。

在人類轉(zhuǎn)錄本中,80%~90%的RNA 均不編碼蛋白質(zhì),被稱為非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA),其中長度超過200個核苷酸的ncRNA被稱為長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA)[4]。LncRNA 可以在轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄后、翻譯或翻譯后多重水平調(diào)控基因的表達。研究表明,LncRNA 參與生物體生長發(fā)育、免疫、代謝等多種生命活動過程[5]。也參與癌癥的發(fā)生與發(fā)展[6],其在腫瘤中的作用主要是對癌基因和抑癌基因的調(diào)控。比如Fu 等[7]發(fā)現(xiàn)LncRNA EPEL 可通過與RUNX2 相互作用來調(diào)節(jié)癌細胞行為并影響胃癌的預(yù)后。實際上已有研究[8]表明LncRNA有望成為AML病情演化及診斷的潛在生物標志物。

本課題組前期采用微陣列分析對AML 患者和健康對照組人群外周血淋巴細胞基因表達的差異進行鑒定[9],篩選出了431 個差異表達的LncRNA,其中173個表達上調(diào),258 個表達下調(diào)。LncRNA CUST_49525和CUST_47163 被認為在AML 患者體內(nèi)表達異常。因此,本研究通過實時熒光定量PCR(quantitative realtime PCR,qPCR)檢測AML 患者和健康對照組人群外周血LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 的表達水平,采用受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)評估其預(yù)測能力,并結(jié)合微核率研究其診斷價值,進而為AML診斷輔助指標提供研究線索。

1 材料與方法

1.1 研究對象

課題組選取AML 患者35 例,均來自山東省臨沂市,其中男性17 例,女性18 例,平均年齡(44.14±18.46)歲。AML 組患者均通過骨髓涂片形態(tài)學和細胞化學研究確診為AML。健康對照組共47例,均來自上海市某廠后勤和行政管理人員,均知情同意,其中男性30 例,女性17 例,平均年齡(47.11±9.14)歲。健康對照組人群符合以下標準:無癌癥診斷史;無伴全身免疫系統(tǒng)疾病和感染性疾??;排除孕婦和哺乳期女性。從每名受試者采集2 mL 空腹外周靜脈血用于qPCR檢測。

1.2 實驗試劑與儀器

淋巴細胞分離液購自天津灝洋華科生物科技有限公司,TRIzol 購自美國Life Technologies 公司,miRNeasy 迷你試劑盒、QuantiNovaTMSYBR?Green PCR 試劑盒均購自德國Qiagen 公司,PrimeScript RT Reagent Kit with gDNA Eraser 購自日本TaKaRa 公司;氯仿購自國藥集團化學試劑有限公司。

1.3 實驗方法

1.3.1 實時熒光定量PCR 檢測LncRNA 的表達用淋巴細胞分離液分離出外周血中的淋巴細胞,利用miRNeasy 試劑盒進行RNA 提取,并測定純度和濃度,然后進行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,設(shè)定反轉(zhuǎn)錄程序為37 ℃、15 min;85 ℃、5 s;4 ℃保存。以上述cDNA 為模板,GAPDH 為內(nèi)參,按照qPCR 試劑盒操作指南配制反應(yīng)體系,設(shè)置PCR 程序為:95 ℃、1 min;95 ℃、30 s;55 ℃、30 s;72 ℃、1 min,共40 個循環(huán)。用目的基因的表達水平相對于GAPDH 的水平進行定量。實驗過程中,所有樣本均采用3 個復(fù)孔,采用2-ΔΔCT法計算LncRNA的相對表達水平。依據(jù)基因芯片提供的信息,獲得目標LncRNA 全長基因序列,其中引物的設(shè)計及合成由上海生工生物工程股份有限公司完成,引物序列見表1。

表1 引物序列

1.3.2 胞質(zhì)分裂阻滯微核試驗從外周血樣本中抽取0.5 mL全血置于含有肝素的抗凝培養(yǎng)瓶中,采用胞質(zhì)分裂阻滯法處理,充分混合后,37 ℃、CO2體積分數(shù)為5%培養(yǎng)箱中培養(yǎng),44 h 后加入終濃度為6 μg/mL的細胞松弛素B,繼續(xù)培養(yǎng)28 h后收集細胞,低滲處理,用甲醇和乙酸以3∶1比例(V∶V)混合液固定,將處理好的細胞置于載玻片上風干過夜,用Giemsa染色后,在顯微鏡下觀察1 000 個雙核細胞中含有微核的淋巴細胞個數(shù),計算微核千分率(‰)。

1.4 統(tǒng)計分析

數(shù)據(jù)整理及分析采用SPSS 26.0 軟件,數(shù)據(jù)圖繪制采用GraphPad Prism 8.0 軟件。兩組之間比較采用非參數(shù)Mann-WhitneyU檢驗,ROC 曲線分析差異表達的LncRNA CUST_49525和CUST_47163及淋巴細胞微核千分率在AML 診斷中的價值,ROC 曲線下面積(area under curve,AUC)用于評價診斷價值指標,取約登指數(shù)最大的取值為Cut-off值,檢驗水準α=0.05。

2 結(jié)果

2.1 AML 患者與健康對照人群外周血中LncRNA 的表達及微核分布

結(jié)果見表2 和圖1。與對照組相比,LncRNA CUST_49525和CUST_47163在AML患者組人群外周血中的相對表達水平均明顯下調(diào)(均為P<0.01),而AML患者組雙核淋巴細胞微核率顯著升高,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.01)。

圖1 外周血中LncRNA CUST_49525和CUST_47163的相對表達水平和微核率分布

表2 兩組人群LncRNA CUST_49525、CUST_47163 表達和微核率差異

2.2 LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 及微核率在AML中的診斷價值分析

在單一變量的診斷價值評估中,淋巴細胞微核率的表現(xiàn)效果是最佳的。將LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 及微核率作為自變量,以AML 的診斷結(jié)果為因變量,構(gòu)建二元Logistic回歸,每個研究對象得出相應(yīng)的預(yù)測概率,以預(yù)測概率繪制ROC曲線,用于AML 的聯(lián)合診斷(見表3,圖2),所得AUC 為0.970,95%CI 為0.931~1.000。與對角線下面積(0.500)相比,CUST_49525、CUST_47163、微核率和聯(lián)合診斷各組AUC 均增大,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.01)。三項聯(lián)合診斷效果優(yōu)于單一指標診斷,單一指標診斷中微核率優(yōu)于其他指標(P<0.01)。

圖2 LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 及微核率診斷AML 的ROC曲線

表3 LncRNA CUST_49525和CUST_47163及微核率在AML診斷中的價值分析

3 討論

近年來,AML是成人白血病的最常見形式,其死亡率居高不下,嚴重威脅患者的生命健康。然而,當前我國在AML診斷、療效和預(yù)后的判斷中最常用的是流式細胞術(shù)檢測和骨髓穿刺涂片,除此之外,細胞組織化學染色也可用于形態(tài)學診斷[10]。在實際應(yīng)用中,骨髓穿刺取材具有一定局限性,患者組織的病理改變具有不均一性,患者實際病情進展無法通過常規(guī)診斷指標及時反映出來[11]。而LncRNA 表達檢測便捷快速,患者接受度高,同時具備靈敏高效的特點。因此,開展LncRNA 在AML 發(fā)生與發(fā)展中的差異表達以及微核率在AML診斷中的價值研究,在臨床中具有重要意義和應(yīng)用價值。LncRNA 曾一度被認為是“基因噪音”,隨著基因高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展,大量研究滲透到表觀遺傳學領(lǐng)域。眾多證據(jù)表明[12-13],LncRNA 在血液系統(tǒng)腫瘤的發(fā)生與發(fā)展中具有重要作用,其介導的多種細胞過程在疾病的發(fā)展中起到調(diào)控功能[14]。

LncRNA作為重要的分子標志物[15],其獨特的表達信號與疾病的臨床特征、突變及預(yù)后有關(guān)。研究表明[16],LncRNA能夠通過調(diào)控下游基因轉(zhuǎn)錄和表達參與機體正常造血,另一方面,LncRNA 也能使基因表觀遺傳沉默,或者使染色質(zhì)重構(gòu),導致癌基因激活或抑癌基因失活[17],造成惡性造血。Yang 等[18]的研究結(jié)果揭示了LncRNA 的促癌作用,他們提到的LINC00239促進了癌細胞增殖、集落形成和遷移能力,并且LINC00239 的存在一定程度上減少了阿霉素誘導的細胞凋亡,也就增加了AML 細胞對阿霉素的化學抗性。因此,LncRNA 在AML 的診斷和預(yù)后中有望成為一個新的分子標志物。Wang 等[19]報道,LINC00899 可用于AML的診斷和預(yù)后,成為一種新型血清生物分子標志物,他們對比了AML 患者組與對照組骨髓和血清中LINC00899 的表達水平,結(jié)果顯示LINC00899 在患者組表達上調(diào),同時與FAB分型和細胞遺傳學有關(guān)。根據(jù)ROC曲線結(jié)果,LINC00899具備區(qū)分AML患者與正常人的能力。周晉宇等[20]也提出,LncRNA XLOC_109948在AML患者骨髓和血清中均呈現(xiàn)高表達,可判斷AML 診斷、療效及預(yù)后效果。然而關(guān)于LncRNA CUST_49525和CUST_47163在AML診斷中的價值研究目前在國內(nèi)尚未見相關(guān)報道。

微核實驗?zāi)軌蚍从矨ML 患者淋巴細胞的遺傳損傷[21],近年來因其便捷快速,微核實驗應(yīng)用越來越廣泛。本次研究采用胞質(zhì)分裂阻滯法對比了AML患者與對照人群的血漿淋巴細胞微核率,結(jié)果顯示AML患者微核率顯著高于對照組。這說明AML患者的外周血淋巴細胞出現(xiàn)有絲分裂異常,從而引起染色體畸變,這種突變在AML 患者體內(nèi)的發(fā)生率顯著高于健康人群。因此,微核率可作為AML診斷的重要參考指標。本研究結(jié)果顯示,LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 在AML患者血清中的表達較健康對照組明顯下調(diào)。這表明,LncRNA CUST_49525和CUST_47163在AML中可能發(fā)揮著影響細胞增殖、遷移和侵襲的生理學功能,具有初步診斷AML 的作用。通過繪制AML 診斷價值的ROC 曲線,比較LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 以及微核率在AML 診斷中的截斷值,考察其作為臨床診斷指標的價值。ROC曲線分析結(jié)果提示,在診斷時檢測LncRNA CUST_49525和CUST_47163的表達水平可提供有價值的結(jié)果信息。通過進一步分析發(fā)現(xiàn),綜合LncRNA CUST_49525和CUST_47163及微核率,做出聯(lián)合診斷,其診斷價值高于單一指標,上述研究結(jié)果表明,AML診斷、治療及預(yù)后過程中,使用微核率作為傳統(tǒng)診斷指標的同時,將LncRNA CUST_49525和CUST_47163的相對表達納入臨床診斷的輔助指標,作出聯(lián)合診斷,有助于AML 診斷分析的細化,并有助于臨床決策。

目前對AML 中LncRNA 的調(diào)控機制和生物功能的研究,仍處于起步階段,需要更多的臨床試驗和證據(jù)對其進行探討。由于本研究采用的是橫斷面比較,并且納入的臨床病例較少,LncRNA CUST_49525 和CUST_47163 對患者生存率及預(yù)后的評估還需要進一步研究,其分子機制也需要體內(nèi)和體外實驗的結(jié)果來驗證。

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