劉欣欣,王 瑤,史紅玲,姚倫廣,王 賢,唐存多,,3,*
(1.南陽(yáng)師范學(xué)院生命科學(xué)與農(nóng)業(yè)工程學(xué)院,河南 南陽(yáng) 473061;2.賒店老酒股份有限公司博士后創(chuàng)新實(shí)踐基地,河南 南陽(yáng) 473300;3.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)技術(shù)學(xué)院,河南 鄭州 450002)
2,5-二甲基吡嗪(2,5-dimethylpyrazine, 2,5-DMP)是一種雜環(huán)含氮化合物,廣泛存在于各種食品中,是食品中重要的香氣化合物[1]。由于2,5-DMP具有增香作用,它作為食品工業(yè)中的食品添加劑受到了廣泛關(guān)注。天然的2,5-DMP常存在于熱處理后原料種子[2]、烤牛肉[3]、白醋[4]、酒[5-6]、醬油[7]、咖啡豆[8-9]、烤花生[10-11]、烏龍茶[12]以及發(fā)酵大豆[13]中,具有炒花生香氣和巧克力、奶油風(fēng)味,是食品工業(yè)中不可缺少的調(diào)味添加劑。同時(shí),2,5-DMP還被應(yīng)用于制藥工業(yè),是生產(chǎn)降糖類藥物和抗脂類藥物的重要底物,如5-甲基吡嗪-2-羧酸是合成抗脂分解藥物中間體的合成原料[14],常用于合成抗高血壓類藥物阿莫西林、降血糖血脂類藥物格列吡嗪以及抗結(jié)核藥物5-甲基吡嗪-2-羧酸甲酯等[15-16]。
L-蘇氨酸是一種必需氨基酸,可用于食品增香劑、醫(yī)藥、飼料添加等方面[17]。目前,安全綠色且廣泛使用的生產(chǎn)方法是微生物發(fā)酵法[18]。近年來(lái),L-蘇氨酸的生產(chǎn)過(guò)熱,導(dǎo)致出現(xiàn)了產(chǎn)能嚴(yán)重過(guò)剩的窘境[19]。因此,L-蘇氨酸的轉(zhuǎn)產(chǎn)增值迫在眉睫,其途徑主要有以下幾種:一是以L-蘇氨酸為底物,經(jīng)過(guò)多酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)進(jìn)行脫氨和還原生成L-氨基丁酸,同時(shí)還原反應(yīng)所消耗的NADH通過(guò)甲酸脫氫酶再生[20]。二是以L-蘇氨酸為底物,利用L-蘇氨酸脫氫酶(L-threonine dehydrogenase,L-TDH)使L-蘇氨酸脫氫生成L-2-氨基乙酰乙酸,經(jīng)過(guò)一系列自發(fā)反應(yīng)生成2,5-DMP。三是L-蘇氨酸在蘇氨酸醛縮酶的作用下直接生成甘氨酸。本研究擬挖掘鑒定出高活性的L-TDH,試圖以L-蘇氨酸為底物采用全細(xì)胞催化法生產(chǎn)2,5-DMP,實(shí)現(xiàn)L-蘇氨酸的轉(zhuǎn)產(chǎn)增值,力爭(zhēng)解決蘇氨酸產(chǎn)能過(guò)剩問(wèn)題[12,14]。在大腸桿菌(Escherichia coli)中,2,5-DMP可以由L-蘇氨酸天然合成,全細(xì)胞催化途徑中的催化過(guò)程為L(zhǎng)-蘇氨酸在L-TDH的作用下轉(zhuǎn)化為L(zhǎng)-2-氨基乙酰乙酸[21],L-TDH是催化過(guò)程中的關(guān)鍵酶[22]。
已有文獻(xiàn)報(bào)道,來(lái)源于E.coli的L-TDH借助pET28a載體在E.coli中實(shí)現(xiàn)了可溶性表達(dá),其比活力約為132 mU/mg。曹艷麗等[19]經(jīng)枯草芽孢桿菌外源表達(dá)了來(lái)源不同的L-TDH,結(jié)果表明,來(lái)源于E.coliK-12的L-TDH在枯草芽孢桿菌中更有利于L-蘇氨酸合成2,5-DMP,但其L-TDH活力僅為0.024 IU,比活力為0.15 IU/mg。本研究擬以E.coli為出發(fā)菌株,從中調(diào)取L-TDH基因,再借助pACYCDuet-1質(zhì)粒強(qiáng)化其在E.coliBL21(DE3)的表達(dá),并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行分析,旨在為提高蘇氨酸轉(zhuǎn)化為L(zhǎng)-2-氨基乙酰乙酸效率提供參考。
1.1.1 試劑
限制性內(nèi)切酶BamH I和Hind III New England Biolabs(北京)公司;L-蘇氨酸 美國(guó)Sigma-Aldrich公司;2,5-DMP、2,4-二硝基氟苯 上海阿拉丁生化科技股份有限公司;NAD+日本Chem-Station公司;異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-beta-D-thiogalactoside,IPTG)Master of Bioactive Molecules(北京)公司;Prime STAR HS (Premix)、DL 2000 DNA Marker、rTaqDNA聚合酶、PrimeScript? II 1st Strand cDNA Synthesis Kit、DNA連接試劑盒Ver.2.1 寶生物工程(大連)有限公司;甲醇、甲酸(均為色譜純) 天津科密歐化學(xué)試劑有限公司;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.1.2 菌株與質(zhì)粒
本研究所涉及到的菌株和質(zhì)粒如表1所示,重組質(zhì)粒的構(gòu)建如圖1所示。
圖1 重組質(zhì)粒pACYCDuet-1-Ectdh的構(gòu)建Fig.1 Construction of the recombinant plasmid pACYCDuet-1-Ectdh
表1 本研究用到的菌株和質(zhì)粒Table 1 Strains and plasmids used in this study
核酸電泳儀、Hypersil C18柱 美國(guó)Thermo Fisher公司;UNIVERSAL Hood凝膠成像系統(tǒng)、PowerPacTMHC/Mini-PROTEAN?蛋白電泳系統(tǒng) 美國(guó)Bio-Rad公司;VCX 130型超聲破碎儀 美國(guó)Sonics and Materials公司;UV1000紫外-可見分光光度計(jì) 梅特勒-托利多科技(中國(guó))有限公司;EC 2006型高效液相色譜(high performance liquid chromatography,HPLC)系統(tǒng) 大連依利特分析儀器有限公司。
1.3.1 重組菌株的構(gòu)建及序列分析
從EMBL’s European Bioinformatics Institute(https://www.ebi.ac.uk/)數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索到一個(gè)E.coli來(lái)源的L-TDHEcTDH(ACI75701.1)。根據(jù)此序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增E c t d h的特異性引物E c t d h-F:CGCGGATCCGATGAAAGCGTTATCCAAACTG( 含B a mH I 酶 切 位 點(diǎn)) 和E c t d h- R :CCCAAGCTTTTAATCCCAGCTCAGAATAAC(含Hind III酶切位點(diǎn)),委托蘇州泓訊生物技術(shù)有限公司進(jìn)行合成。以E.coliBL21(DE3)基因組DNA為模板,利用Ectdh-F和Ectdh-R引物進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增Ectdh的編碼基因,再利用限制性核酸內(nèi)切酶BamH I和Hind III對(duì)目的基因及載體pACYCDuet-1分別進(jìn)行雙酶切,然后連接轉(zhuǎn)化進(jìn)入E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng)氯霉素抗性篩選和測(cè)序鑒定獲得E.coliBL21(DE3)/ pACYCDuet-1-Ectdh重組菌。將上述重組菌連續(xù)在無(wú)抗LB培養(yǎng)基上進(jìn)行培養(yǎng),然后接種至含氯霉素抗性的LB培養(yǎng)基上培養(yǎng),觀察生長(zhǎng)情況,通過(guò)氯霉素抗性篩選考察重組菌攜帶質(zhì)粒的遺傳穩(wěn)定性[23]。基于測(cè)序結(jié)果,通過(guò)Jalview對(duì)該酶進(jìn)行多序列比對(duì)。
1.3.2 重組E.coli誘導(dǎo)
重組E.coli的誘導(dǎo)表達(dá)采用低溫、低濃度誘導(dǎo)劑的方法。分別將E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1、E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh單菌落接種至5 mL含100 μg/mL氯霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)14 h,以2%接種量將過(guò)夜培養(yǎng)的菌液轉(zhuǎn)接至100 mL新鮮LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)約2 h至菌體細(xì)胞密度(OD600nm)為1.0,加入1 mol/L IPTG至終濃度為0.1 mmol/L,16 ℃、200 r/min誘導(dǎo)培養(yǎng)20 h。將100 mL菌液于8 000 r/min、4 ℃離心5~10 min,收集菌體,將菌體用20 mmol/L Tris-HCl重懸后進(jìn)行超聲破碎,破碎后收集上清液,上清液通過(guò)鎳瓊脂糖柱上進(jìn)行純化,利用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)進(jìn)行分析[24]。
1.3.3 酶活力測(cè)定
誘導(dǎo)表達(dá)后的重組菌進(jìn)行超聲破碎,離心取純化后的上清液,參照文獻(xiàn)[19]并進(jìn)行略微改動(dòng)測(cè)定重組酶活力。以L-蘇氨酸為底物測(cè)定EcTDH活力,總的1 mL反應(yīng)體系包含0.76 mL Tris-HCl(76 mmol/L,pH 7.8)、0.08 mLL-蘇氨酸(8 mmol/L)、0.06 mL NAD+溶液(3 mmol/L)混勻,放入35 ℃金屬浴中預(yù)熱5 min,加入0.1 mL酶液,測(cè)定1 min內(nèi)OD340nm的變化值。酶活力定義為1 min內(nèi)生成1 μmol NADH所需的酶量為1 IU[25]。
1.3.4 重組酶的溫度特性
參照1.3.3節(jié)方法,分別在20~60 ℃(以5 ℃為間隔)下測(cè)定重組酶活力以獲得重組酶的最適反應(yīng)溫度。將重組酶分別在35~55 ℃保溫0~120 min(以10 min為間隔),在最適反應(yīng)溫度下測(cè)定各自的殘留酶活力,以冰浴保存各時(shí)間段的殘留酶活力為100%,考察重組酶的溫度穩(wěn)定性。
1.3.5 重組酶的pH值特性
參照1.3.3節(jié)方法,控制在最適反應(yīng)溫度下,分別在pH 6.5~10.5(以0.5為間隔)下測(cè)定重組酶活力以獲得重組酶的最適反應(yīng)pH值。將重組酶分別在pH 6.5~10.5(以0.5為間隔)的緩沖液中放置在最適反應(yīng)溫度下保溫1.5 h,測(cè)定各自的殘留酶活力,以未經(jīng)處理的酶液為100%,考察重組酶的pH值穩(wěn)定性。
1.3.6 重組酶的動(dòng)力學(xué)參數(shù)
根據(jù)已報(bào)道的方法稍加修改,測(cè)定重組TDH的動(dòng)力學(xué)參數(shù),確定TDH底物的特異性[26-27],反應(yīng)系統(tǒng)中NAD+濃度為0.5 mmol/L。最佳反應(yīng)條件下,在4~14 mmol/L不同L-蘇氨酸濃度下測(cè)定重組酶的催化活性。每次測(cè)定重復(fù)3 次。同樣地,固定L-蘇氨酸濃度為10 mmol/L,將NAD+濃度設(shè)置為0.5~1.75 mmol/L,測(cè)定重組酶的催化活性,每次測(cè)定3 次,考察對(duì)NAD+的動(dòng)力學(xué)參數(shù)。所有計(jì)算均由Origin 9.0執(zhí)行,利用Origin 9.0軟件進(jìn)行非線性擬合,得出重組酶對(duì)底物的Km、Kcat和Vmax。
1.3.7 重組E.coli全細(xì)胞轉(zhuǎn)化L-蘇氨酸合成2,5-DMP
在250 mL三角瓶中構(gòu)建50 mL的反應(yīng)體系,體系包括:50 mL Tris-HCl-NaCl緩沖液、85 mmol/LL-蘇氨酸、0.75 mmol/L NAD+、50 mg凍干的重組E.coli和適量玻璃珠,并于30 ℃、220 r/min振蕩反應(yīng),在0~36 h內(nèi)每12 h取1 mL轉(zhuǎn)化液于60 ℃金屬浴鍋中加熱10 min終止反應(yīng),于12 000 r/min離心1 min,取上清液用0.22 μm濾膜進(jìn)行過(guò)濾,最后用HPLC法檢測(cè)2,5-DMP含量,并繪制反應(yīng)進(jìn)程曲線。
1.3.8 底物和產(chǎn)物的檢測(cè)
對(duì)底物L(fēng)-蘇氨酸、產(chǎn)物2,5-DMP進(jìn)行普通C18柱的HPLC分析,HPLC色譜柱為Thermo Hypersil C18柱,檢測(cè)波長(zhǎng)為275 nm,柱溫25 ℃,流動(dòng)相A(體積分?jǐn)?shù)0.1%甲酸)與流動(dòng)相B(甲醇),按照表2進(jìn)行梯度洗脫,流速為0.2 mL/min,運(yùn)行時(shí)間10 min。底物L(fēng)-蘇氨酸HPLC檢測(cè)方法通過(guò)柱前衍生測(cè)定[28-29]。
表2 HPLC梯度洗脫Table 2 HPLC gradient elution program
1.3.9 產(chǎn)物2,5-DMP的定量分析
將2,5-DMP標(biāo)準(zhǔn)品用超純水分別配成1.82、2.27、3.03、4.55、9.10 mmol/L的溶液,經(jīng)0.22 μm微孔濾器過(guò)濾后,取10 μL進(jìn)行HPLC分析,獲得各個(gè)濃度2,5-DMP的峰面積,進(jìn)行線性擬合獲得回歸方程及相關(guān)系數(shù)。HPLC色譜柱為Thermo Hypersil C18柱,檢測(cè)波長(zhǎng)275 nm,柱溫25 ℃,流動(dòng)相為體積分?jǐn)?shù)0.1%的甲酸和色譜級(jí)甲醇,流速0.2 mL/min,進(jìn)行梯度洗脫。待檢樣品產(chǎn)物按照同樣的色譜條件進(jìn)行HPLC分析,根據(jù)測(cè)得的峰面積可以由回歸方程計(jì)算出相應(yīng)的樣品濃度。
1.3.10 常用網(wǎng)站及軟件
EMBL’s European Bioinformatics Institute(https://www.ebi.ac.uk/)數(shù)據(jù)庫(kù)和Basic Local Alignment Search Tool(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi):蛋白質(zhì)、基因序列的搜索;DNAMAN軟件:用于目的基因序列及限制性酶切位點(diǎn)分析和測(cè)序結(jié)果拼接;Origin 9.0軟件:用于數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及分析;Jalview軟件:用于酶的多序列比對(duì);NCBI Autodock:用于分子對(duì)接。
圖片均用PDF-Xchange Viewer軟件進(jìn)行清晰度調(diào)節(jié),用Adobe Photoshop CS 8.0軟件進(jìn)行色階、對(duì)比度調(diào)節(jié)及標(biāo)注等處理。簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)處理及分析均借助Origin 9.0進(jìn)行。
以E.coli的全基因組DNA為模板,Ectdh-F和Ectdh-R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,如圖2A所示,在約1 100 bp出現(xiàn)了明顯的特異性條帶,PCR產(chǎn)物片段與預(yù)期理論長(zhǎng)度基本一致,與已報(bào)道的來(lái)源于E.coliK-12的TDH序列相似度約為77%[19]。將PCR產(chǎn)物用PCR產(chǎn)物純化試劑盒進(jìn)行純化,用限制性核酸內(nèi)切酶BamH I和Hind III進(jìn)行雙酶切,將酶切產(chǎn)物連接至經(jīng)相同的限制性酶進(jìn)行同樣雙酶切的pACYCDuet-1載體,轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,再經(jīng)氯霉素抗性篩選和雙酶切驗(yàn)證,挑取重組子,用通用引物ACYCDuetUP1 Primer和DuetDOWN1 Primer進(jìn)行PCR檢測(cè),結(jié)果如圖2B所示,片段長(zhǎng)度約1 100 bp,大小與其預(yù)期條帶大小相符。將經(jīng)PCR檢測(cè)和雙酶切驗(yàn)證的重組子送至蘇州泓迅生物科技股份有限公司進(jìn)行測(cè)序鑒定,獲得Ectdh基因序列,并推測(cè)出其氨基酸序列。結(jié)果表明,EcTDH的序列及在載體上的插入位置與預(yù)期的結(jié)果相符,表明重組菌E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh已成功構(gòu)建。
圖2 Ectdh重組子的PCR擴(kuò)增(A)及pACYCDuet-1-Ectdh的通用引物驗(yàn)證(B)Fig.2 Agarose gel electropherograms of PCR amplified Ecctdh (A) and universal primer validation for pACYCDuet-1-Ectdh (B)
將上述推測(cè)出的EcTDH氨基酸序列在ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)上進(jìn)行理論理化性質(zhì)的預(yù)測(cè),結(jié)果表明,EcTDH的理論等電點(diǎn)為5.81,理論分子質(zhì)量為37 173.94 Da,不穩(wěn)定指數(shù)II為24.46,是一個(gè)較穩(wěn)定的蛋白,其在E.coli和酵母體內(nèi)的半衰期分別能達(dá)到10 h和20 h以上。利用TMHMM-2.0服務(wù)器預(yù)測(cè)蛋白跨膜結(jié)構(gòu)的結(jié)果顯示,EcTDH的所有氨基酸殘基均為膜外殘基,表明EcTDH理論上相當(dāng)容易實(shí)現(xiàn)胞外分泌型表達(dá)。將EcTDH的氨基酸序列和已經(jīng)報(bào)道來(lái)源不同的TDH氨基酸序列進(jìn)行分析(激烈熱球菌(Pyrococcus furiosus)、堀越熱球菌(Pyrococcus horikoshii)、柯達(dá)熱球菌(Thermococcus kodakaraensis)),用Jalview軟件進(jìn)行多序列比對(duì),結(jié)果如圖3所示,已報(bào)道的文獻(xiàn)表明來(lái)自P.horikoshii的L-TDH氨基酸殘基半胱氨酸Cys97、Cys100、Cys103、Cys111位在L-TDH中是保守的[30-31],其對(duì)應(yīng)來(lái)自E.coli的L-TDH Cys93、Cys96、Cys99、Cys107。建立L-TDH的三維結(jié)構(gòu)模型如圖4所示,L-TDH對(duì)于底物L(fēng)-蘇氨酸的催化中心是在107位的半胱氨酸。
圖3 EcTDH與其他3 個(gè)代表性TDH的多序列比對(duì)Fig.3 Multisequence alignment of EcTDH with three other representative TDHs
圖4 EcTDH三維結(jié)構(gòu)圖Fig.4 Three-dimensional structure analysis of EcTDH
分別將E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1、E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh菌株按照1.3.2節(jié)方法進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),將經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)后的菌體進(jìn)行離心,收集菌體重懸后進(jìn)行超聲破碎,8 000 r/min、4 ℃離心15 min后收集裂解上清液。將收集裂解的上清液進(jìn)行SDS-PAGE及酶活力分析。如圖5所示,E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh裂解上清液經(jīng)純化后在約37 kDa處有明顯的特異性條帶,與EcTDH的理論分子質(zhì)量37 173.94 Da基本一致,表明已成功實(shí)現(xiàn)了EcTDH在E.coli的可溶性表達(dá)。
圖5 重組E. coli表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig.5 SDS-PAGE analysis of recombinant Escherichia coli expression products
各重組子酶活力測(cè)定結(jié)果顯示,E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1的酶活力為0.24 IU/mL,而E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh的細(xì)胞裂解液中檢測(cè)到EcTDH活力可達(dá)到19.13 IU/mL,與本底細(xì)胞相比,其酶活力是E.coli本底細(xì)胞表達(dá)的79 倍,純化后的比活力可達(dá)12.77 IU/mg,表明EcTDH表現(xiàn)出較高的酶活力。比較已有文獻(xiàn)報(bào)道的不同來(lái)源的L-TDH活力結(jié)果如表3所示。可以看出,來(lái)源于E.coli的L-TDH經(jīng)載體pACYCDuet-1和pET28a表達(dá)后比活力產(chǎn)生較大差別,主要是由于酶活力定義不同,以及酶活力測(cè)定時(shí)底物和輔酶終濃度的差異導(dǎo)致,它們會(huì)對(duì)表觀酶活造成較大的影響。文獻(xiàn)報(bào)道[32]測(cè)定酶活力體系中底物L(fēng)-蘇氨酸和輔酶NAD+終濃度分別為100 mmol/L和200 mmol/L,而在本研究中終濃度分別為8 mmol/L和3 mmol/L。他們將每分鐘消耗1mol NAD+所需的酶量定義為1 U,而本研究將每分鐘產(chǎn)生1 μmol NADH所需的酶量定義為1 IU。
表3 不同來(lái)源L-TDH活力與比活力的對(duì)比Table 3 Specific activity of L-TDH from different sources
由圖6可知,在溫度為20~45 ℃范圍內(nèi),酶促反應(yīng)速率隨溫度的升高而不斷提高,超過(guò)45 ℃后,反應(yīng)速率逐漸下降,表明EcTDH的最適反應(yīng)溫度為45 ℃,在40~45 ℃之間時(shí)具有較高酶活力。這與之前文獻(xiàn)報(bào)道的最適溫度一致[22]。
圖6 重組L-TDH的最適反應(yīng)溫度Fig.6 Optimal reaction temperature for recombinant L-TDH
如圖7所示,在35 ℃和40 ℃保溫120 min后的殘留酶活力仍然高于90%,這表明它在35~40 ℃范圍內(nèi)有較好的穩(wěn)定性。與之前文獻(xiàn)報(bào)道的在35~40 ℃條件下測(cè)定的殘留酶活力相比,本研究殘留酶活提高了12.5%;在45、50、55 ℃殘留酶活力達(dá)到50%所對(duì)應(yīng)的時(shí)間分別為78、40 min和20 min。
圖7 重組L-TDH溫度穩(wěn)定性Fig.7 Temperature stability of recombinant L-TDH
緩沖液過(guò)酸過(guò)堿都會(huì)導(dǎo)致酶的空間結(jié)構(gòu)的改變,從而使酶的活性降低,由圖8可知,重組酶的最適反應(yīng)pH值在8.5~9.5之間,相對(duì)酶活力可達(dá)80%以上,EcTDH最適反應(yīng)pH值為9.0。
圖8 重組L-TDH的最適pH值Fig.8 Optimal reaction pH for recombinant L-TDH
如圖9所示,重組L-TDH在pH 7.5~8.5的緩沖液中保持1.5 h后殘留酶活力均能保持90%以上,表明它在pH 7.5~8.5范圍內(nèi)有較好的穩(wěn)定性,其pH值適應(yīng)性相對(duì)較廣,在pH 8.5~10.0范圍內(nèi)殘留酶活力在65%以上,而已報(bào)道的L-TDH在pH值為10時(shí),其殘留酶活力僅達(dá)到60%,表明在pH值穩(wěn)定性方面,該研究中L-TDH穩(wěn)定性更好。
圖9 重組L-TDH的pH值穩(wěn)定性Fig.9 pH stability of recombinant L-TDH
表4結(jié)果顯示,EcTDH對(duì)L-蘇氨酸的Kcat為1.13 s-1,Km為7.76 mmol/L,Vmax為1.827 μmol/(min·mg),Kcat/Km值為0.15 L/(mmol·s)。EcTDH對(duì)輔酶NAD+的Kcat為1.52 s-1,Km為1.61 mmol/L,Vmax為2.46 μmol/(min·mg),Kcat/Km值為0.94 L/(mmol·s)。對(duì)比文獻(xiàn)來(lái)源于Cupriavidus necator的野生型L-TDH和各位點(diǎn)突變型L-TDH的Km和Kcat值(表4),L-TDH因其空間結(jié)構(gòu)的不同,進(jìn)而影響反應(yīng)過(guò)程中活性位點(diǎn)殘基的運(yùn)動(dòng)使得動(dòng)力學(xué)參數(shù)產(chǎn)生差異。
表4 不同L-TDH動(dòng)力學(xué)參數(shù)的比較Table 4 Comparison of kinetic parameters of L-TDH from different sources
按照1.3.9節(jié)方法,將分析純的2,5-DMP在Thermo Hypersil C18柱上進(jìn)行HPLC分析,在該分析條件下,2,5-DMP的保留時(shí)間約為6.55 min,將2,5-DMP不同濃度對(duì)相應(yīng)的峰面積進(jìn)行線性擬合,獲得2,5-DMP的標(biāo)準(zhǔn)曲線,得出2,5-DMP濃度對(duì)應(yīng)的回歸方程為y=2 062.4x+354.29(x為2,5-二甲基吡嗪濃度(mmol/L);y為峰面積,相關(guān)系數(shù)為0.997 8),結(jié)果表明在該HPLC分析條件及濃度范圍下,2,5-DMP濃度與峰面積呈良好線性相關(guān)。因此,利用此法可以對(duì)2,5-DMP進(jìn)行精確定量分析。同樣條件下對(duì)底物L(fēng)-蘇氨酸進(jìn)行HPLC分析,底物的保留時(shí)間約為3.06 min。在相同的分析條件下,L-蘇氨酸的保留時(shí)間與2,5-DMP保留時(shí)間差約3.5 min,結(jié)果表明在該色譜條件下能夠?qū)崿F(xiàn)L-蘇氨酸與2,5-DMP的良好分離,該色譜方法能夠用于催化產(chǎn)物的分析鑒定。
按照1.3.7節(jié)方法對(duì)L-蘇氨酸進(jìn)行全細(xì)胞催化的生物轉(zhuǎn)化。E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1和E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh的催化產(chǎn)物經(jīng)過(guò)離心取樣后按照1.3.8節(jié)方法進(jìn)行HPLC分析,保留時(shí)間約為6.55 min和3.06 min處有明顯的特征峰,它們與相同分析條件下2,5-DMP和L-蘇氨酸標(biāo)品的保留時(shí)間一致,表明在該催化條件下,部分L-蘇氨酸已被轉(zhuǎn)化成2,5-DMP。在不同時(shí)間取樣分析、計(jì)算各時(shí)間節(jié)點(diǎn)的產(chǎn)物得率,它們的催化反應(yīng)進(jìn)程曲線如圖10所示。反應(yīng)進(jìn)行到36 h,反應(yīng)基本達(dá)到平衡狀態(tài),2,5-DMP得率基本不再隨時(shí)間的變化而變化,E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh的產(chǎn)物得率約為12%,顯著高于E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1的轉(zhuǎn)化水平。結(jié)果表明,強(qiáng)化L-TDH的表達(dá)可顯著提高2,5-DMP合成效率,但僅依靠強(qiáng)化TDH的表達(dá)難以實(shí)現(xiàn)L-蘇氨酸的高效轉(zhuǎn)化。
圖10 L-TDH對(duì)催化反應(yīng)進(jìn)程的影響Fig.10 Effect of L-TDH on the catalytic reaction process
L-TDH是以L-蘇氨酸為底物合成高值化合物2,5-DMP的關(guān)鍵酶,本研究對(duì)挖掘出來(lái)源于E.coli的L-TDH進(jìn)行了高效表達(dá)及酶學(xué)性質(zhì)分析。本研究從E.coli中克隆出L-TDH的基因片段,再借助pACYCDuet-1表達(dá)質(zhì)粒在E.coliBL21(DE3)中實(shí)現(xiàn)了高水平的可溶性表達(dá),酶活力測(cè)定結(jié)果表明,E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh發(fā)酵液中L-TDH活力可達(dá)19.13 IU/mL,純化后重組L-TDH的比活力為12.77 IU/mg。與已報(bào)道文獻(xiàn)相比[19],本研究表達(dá)水平和比活力均較高,比活力的差異可能歸因于蛋白序列本身的差異,兩者的序列相似度為77%;而表達(dá)水平的差異可能主要?dú)w因于宿主的差別,所用的E.coli表達(dá)系統(tǒng)比枯草芽孢桿菌表達(dá)系統(tǒng)具有更大表達(dá)潛力。也利用強(qiáng)化了TDH表達(dá)水平的重組E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1-Ectdh進(jìn)行了轉(zhuǎn)化L-蘇氨酸合成2,5-DMP的初步研究,它利用強(qiáng)化的TDH以及自身本底表達(dá)的NADH氧化酶、蘇氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白和氨基酸氧化酶等能夠協(xié)同催化2,5-DMP的合成,反應(yīng)24 h后產(chǎn)物得率約12%,顯著高于沒有強(qiáng)化TDH表達(dá)的E.coliBL21(DE3)/pACYCDuet-1,這說(shuō)明TDH確實(shí)在轉(zhuǎn)化L-蘇氨酸合成2,5-DMP的過(guò)程中起關(guān)鍵作用。然而,僅強(qiáng)化TDH表達(dá)難以實(shí)現(xiàn)L-蘇氨酸的高效轉(zhuǎn)化,后續(xù)研究需要參考前人的研究[32],充分利用代謝工程和酶工程的手段,繼續(xù)強(qiáng)化2,5-DMP積累正相關(guān)的基因表達(dá),敲除2,5-DMP積累負(fù)相關(guān)的基因,以期進(jìn)一步提高2,5-DMP的得率。