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急性胰腺炎機(jī)器學(xué)習(xí)模型的研究進(jìn)展

2023-12-18 04:10:10殷民月朱錦舟高靜雯林嘉希許春芳
臨床肝膽病雜志 2023年12期
關(guān)鍵詞:胰腺炎機(jī)器預(yù)測

殷民月, 朱錦舟, 劉 璐, 高靜雯, 林嘉希, 許春芳

蘇州大學(xué)附屬第一醫(yī)院消化內(nèi)科, 江蘇 蘇州 215000

急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)作為一種常見的、需要住院治療的消化系統(tǒng)疾病,其發(fā)病率逐年升高,根據(jù)全球疾病負(fù)擔(dān)研究數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計,2019 年全球范圍內(nèi)胰腺炎發(fā)病率約為36.38/10 萬,死亡率約為1.49/10 萬[1]。根據(jù)2012 年修訂版的亞特蘭大分類標(biāo)準(zhǔn),大部分AP 呈自限性,稱為輕癥AP(mild acute pancreatitis,MAP),約20%的AP 患者可進(jìn)展為中度重癥AP(moderate severe acute pancreatitis,MSAP)和重癥AP(severe acute pancreatitis,SAP)。MSAP定義為一過性(≤48 h)器官衰竭或局部并發(fā)癥,包括急性胰周液體積聚、胰腺假性囊腫、急性壞死物積聚等,或全身并發(fā)癥,包括膿毒癥、急性呼吸窘迫綜合征、腹腔內(nèi)高壓等。SAP定義為持續(xù)性(>48 h)器官衰竭,包括呼吸、心血管、腎臟等器官衰竭[2]。研究[3]表明,相較于MAP,MSAP 和SAP病死率可高出十倍左右。因此,早期(<24 h)評估嚴(yán)重程度、識別預(yù)后相關(guān)高危因素將影響胰腺炎患者的病情進(jìn)展、重癥監(jiān)護(hù)管理、多學(xué)科會診等干預(yù)時機(jī)和處理措施,但是,這在臨床上面臨較大挑戰(zhàn)。

傳統(tǒng)評分系統(tǒng)(如APACHE-Ⅱ、Ranson、BISAP 評分)通過結(jié)合臨床特征(年齡、昏迷狀態(tài)等)和實驗室檢查(如谷丙轉(zhuǎn)氨酶、空腹血糖水平等),預(yù)測AP 嚴(yán)重程度[4]。隨后又出現(xiàn)基于CT影像特征的CTSI、MCTSI評分,范圍0~10 分,≥4 分提示MSAP 或SAP[5]。近年來,也有研究[6]提出了一些新型評分系統(tǒng),如PASS,這是依據(jù)患者腹痛癥狀、器官衰竭、全身炎癥反應(yīng)綜合征、阿片類藥物需求以及口服耐受性五個指標(biāo)來動態(tài)監(jiān)測胰腺炎患者不同階段的臨床反應(yīng),通過了基于德爾菲法的專家共識。這些評分系統(tǒng)雖在臨床上得到很多應(yīng)用,但仍存在一些局限性。傳統(tǒng)評分系統(tǒng)如APACHE-Ⅱ評分涉及復(fù)雜參數(shù)、測量難度較大,如Ranson 評分需要測量入院后24 h和48 h的臨床變量,實現(xiàn)不了動態(tài)評估;基于CT 影像特征評分與放射科醫(yī)生的經(jīng)驗水平相關(guān),準(zhǔn)確性波動較大;PASS 評分所需指標(biāo)并不適用于所有醫(yī)院,泛化能力較低。

作為人工智能的分支之一,機(jī)器學(xué)習(xí)憑借其強(qiáng)大的計算能力和學(xué)習(xí)能力被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。研究[7-10]表明,機(jī)器學(xué)習(xí)在構(gòu)建醫(yī)學(xué)模型方面取得了顯著成就,包括疾病診斷、臨床預(yù)后、生存分析等。本文就近年來AP 機(jī)器學(xué)習(xí)模型的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述,主要闡述機(jī)器學(xué)習(xí)在預(yù)測AP 嚴(yán)重程度、并發(fā)癥、死亡等方面的應(yīng)用,為人工智能協(xié)助AP 臨床診療的進(jìn)一步應(yīng)用提供理論依據(jù)和新思路。

1 機(jī)器學(xué)習(xí)在AP中的應(yīng)用現(xiàn)狀

機(jī)器學(xué)習(xí)是計算機(jī)模擬人類大腦進(jìn)行數(shù)據(jù)學(xué)習(xí)的一門科學(xué)技術(shù),它能夠從已知的大量且復(fù)雜數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)并總結(jié)規(guī)律,從而預(yù)測未知的結(jié)果或趨勢。機(jī)器學(xué)習(xí)主要包括監(jiān)督學(xué)習(xí)、無監(jiān)督學(xué)習(xí)。監(jiān)督學(xué)習(xí)的目標(biāo)是預(yù)測一個已知的輸出,如心電圖的自動解讀、肺結(jié)節(jié)的自動識別等,監(jiān)督學(xué)習(xí)的特點(diǎn)是使機(jī)器學(xué)習(xí)的表現(xiàn)無限接近甚至超越訓(xùn)練有素的醫(yī)生的表現(xiàn)。無監(jiān)督學(xué)習(xí)則相反,它沒有可以預(yù)測的輸出,而是嘗試在海量數(shù)據(jù)中找到自然而然的分類模式,這種學(xué)習(xí)方式往往會獲得識別新疾病機(jī)制的機(jī)會[11]。例如,有研究[12]發(fā)現(xiàn)淋巴細(xì)胞減少是抗MDA5陽性皮肌炎患者預(yù)后的獨(dú)立預(yù)測因子,并利用無監(jiān)督學(xué)習(xí)歸納出了淋巴細(xì)胞減少程度與疾病嚴(yán)重程度和疾病預(yù)后的相關(guān)性,為臨床醫(yī)生理解抗MDA5陽性皮肌炎疾病的臨床特點(diǎn)和表型提供可靠依據(jù),有助于該病的診療及管理。

機(jī)器學(xué)習(xí)的基本步驟包括:(1)數(shù)據(jù)準(zhǔn)備:預(yù)測結(jié)局以及一系列與該結(jié)局存在潛在關(guān)系的變量;(2)數(shù)據(jù)預(yù)處理:對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行清洗、轉(zhuǎn)換、離散、歸約等處理,以確保數(shù)據(jù)的完整性和規(guī)范化;隨后將數(shù)據(jù)隨機(jī)劃分為訓(xùn)練集、驗證集和測試集;(3)模型選擇:根據(jù)既定任務(wù),選擇對應(yīng)模型,例如分類任務(wù),可選擇回歸模型;(4)模型訓(xùn)練:模型基于訓(xùn)練集數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練,學(xué)習(xí)規(guī)律;(5)參數(shù)調(diào)整:根據(jù)模型在驗證集上的性能,選擇適當(dāng)?shù)膮?shù)調(diào)整,以進(jìn)一步提升模型的表現(xiàn);(6)模型評估:訓(xùn)練及調(diào)整好的模型在測試集上進(jìn)行性能評估,主要指標(biāo)包括敏感度、特異度、召回率、精確度、F1 值等;(7)模型預(yù)測:將模型運(yùn)用到新的任務(wù)中,呈現(xiàn)預(yù)測結(jié)果。

目前,機(jī)器學(xué)習(xí)在AP 中應(yīng)用廣泛,監(jiān)督學(xué)習(xí)任務(wù)主要包括預(yù)測嚴(yán)重程度、并發(fā)癥和死亡,無監(jiān)督學(xué)習(xí)任務(wù)主要為識別炎癥因子表型。具體特點(diǎn)見表1。

表1 機(jī)器學(xué)習(xí)在AP中應(yīng)用研究的基本特點(diǎn)Table 1 Characteristics of studies on application of machine learning in acute pancreatitis

1.1 監(jiān)督學(xué)習(xí)

1.1.1 預(yù)測AP 嚴(yán)重程度 Pearce 團(tuán)隊[13]在2006 年首次利用機(jī)器學(xué)習(xí)基于APACHE-Ⅱ評分和C反應(yīng)蛋白指標(biāo)建模以提升SAP預(yù)測性能,他們在邏輯回歸基礎(chǔ)上引入核函數(shù),以去除冗余特征、識別相關(guān)特征,最終模型的AUC 為0.82,敏感度為0.87,特異度為0.71,優(yōu)于傳統(tǒng)評分系統(tǒng)APACHE-Ⅱ評分(AUC=0.74)。Sun等[14]開發(fā)了APSAVE 模型對AP 患者進(jìn)行風(fēng)險分層,通過隨機(jī)森林算法對92個臨床變量(包括65個靜脈血結(jié)果、17個動脈血結(jié)果和9個尿檢結(jié)果)進(jìn)行分析,最后得出AUC 為0.73,此外,APSAVE 聯(lián)合Ranson 評分可以提高模型性能至0.79。Langmead 等[15]發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞因子譜(由5 個細(xì)胞因子組成)能準(zhǔn)確預(yù)測AP 患者持續(xù)性器官衰竭,并且在獨(dú)立的、前瞻的133個患者隊列里驗證其性能,該作者通過隨機(jī)森林算法建模,模型AUC 為0.91,準(zhǔn)確性為0.89,陽性預(yù)測值為0.89,陰性預(yù)測值為0.90。

近年來,隨著機(jī)器學(xué)習(xí)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域發(fā)揮的顯著作用,越來越多的算法被開發(fā),醫(yī)學(xué)研究者不再局限于個別算法,而是比較多種算法尋求最優(yōu)解,同時探索新的算法來擴(kuò)增樣本從而解決真實世界中樣本量小、數(shù)據(jù)質(zhì)量差、分類不平衡的問題。Thapa 團(tuán)隊[16]回顧性分析61 894例AP患者入院12 h內(nèi)的臨床指標(biāo),利用邏輯回歸、XGBoost 和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法訓(xùn)練模型,得出三個模型的AUC分別為0.780、0.921和0.811,經(jīng)典評分系 統(tǒng)BISAP 和HAPS 評 分 的AUC 為0.682 和0.533。Kui等[17]設(shè)計了一個基于XGBoost 算法的簡易版應(yīng)用程序,以早期識別SAP 高?;颊撸撗芯渴且豁椂嘀行?、多國家、前瞻性的觀察性研究,該模型納入的六個重要變量包括性別、年齡、體溫、呼吸頻率、腹肌反射和血糖水平,預(yù)測準(zhǔn)確性達(dá)89.1%,平均AUC 為0.81。Yuan 團(tuán)隊[18]通過對5 460 例AP 患者的臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,采用五種機(jī)器學(xué)習(xí)算法,包括XGBoost、三種不同核的支持向量機(jī)以及邏輯回歸算法,結(jié)果提示基于XGBoost 算法的模型在外部測試集上獲得最高的AUC,該模型包括年齡、合并癥、神志狀態(tài)、肺部浸潤、降鈣素原、中性粒細(xì)胞百分比、谷丙轉(zhuǎn)氨酶/谷草轉(zhuǎn)氨酶、白蛋白/球蛋白、膽堿酯酶、尿素、血糖、谷草轉(zhuǎn)氨酶和血清總膽固醇。土耳其有項研究[19]基于梯度提升算法回顧性分析1 334 例AP 患者的臨床變量和CTSI 評分,并采用上采樣方法增加訓(xùn)練集中的小分類樣本,預(yù)測AP嚴(yán)重程度,結(jié)果提示聯(lián)合CTSI評分可提升模型準(zhǔn)確性。Luo 等[20]利用五種機(jī)器學(xué)習(xí)算法(隨機(jī)森林、K 近鄰算法、樸素貝葉斯、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和分類樹)構(gòu)建SAP 的預(yù)測模型,并與經(jīng)典評分系統(tǒng)(BISAP、Ranson 和GCS 評分)進(jìn)行比較,結(jié)果表明,基于隨機(jī)森林算法的模型性能最佳,其AUC達(dá)0.961。

研究[21]表明,10%~20%的AP 容易進(jìn)展為急性壞死性胰腺炎,從而進(jìn)一步增加病死率(約15%),當(dāng)合并感染時,病死率增加至少2 倍,可達(dá)30%~39%。Kiss等[22]利用XGBoost算法基于血糖、C反應(yīng)蛋白、性別、白細(xì)胞等臨床變量預(yù)測急性壞死性胰腺炎,經(jīng)過交叉驗證之后,AUC 達(dá)0.757,且隨著樣本量的增加,AUC也不斷提高。

1.1.2 預(yù)測AP 并發(fā)癥 多器官功能衰竭同樣會增加AP 患者的病死率,呼吸系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)和腎臟系統(tǒng)最容易發(fā)生衰竭。Fei團(tuán)隊[23]利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和邏輯回歸算法對217 例SAP 患者建模,評估SAP 并發(fā)急性肺損傷風(fēng)險,兩種模型的AUC 分別為0.859±0.048 和0.701±0.041。Xu 等[8]開展了一項多中心、回顧性研究,利用六種機(jī)器學(xué)習(xí)算法(邏輯回歸、樸素貝葉斯、支持向量機(jī)、AdaBoost、二次判別分析和反向傳播網(wǎng)絡(luò))預(yù)測MSAP 和SAP 患者的多器官功能衰竭,最終AdaBoost模型性能最佳(AUC=0.826)。

研究表明,AP 后新發(fā)糖尿病的風(fēng)險相較于無AP患者高2 倍以上。Zhang 等[24]利用一系列機(jī)器學(xué)習(xí)算法建模以預(yù)測AP 后糖尿病的發(fā)生,包括支持向量機(jī)、CatBoost、隨機(jī)森林、邏輯回歸、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),結(jié)果表明,邏輯回歸模型獲得最高的AUC(0.819)和F1值(0.357)。

1.1.3 預(yù)測AP 死亡 臨床上關(guān)于AP 患者死亡預(yù)測模型的研究有限,主要原因包括:(1)樣本量小,數(shù)據(jù)質(zhì)量差;(2)分類不均衡。Hameed等[25]通過擴(kuò)增三個公開數(shù)據(jù)庫(MIMIC-Ⅲ、MIMIC-Ⅳ、EICU)中AP 患者的數(shù)據(jù),并通過上采樣、下采樣等方式平衡分類(生存和死亡),最終利用隨機(jī)森林、決策樹、XGBoost、邏輯回歸、多層感知器和深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法預(yù)測死亡,結(jié)果表明經(jīng)擴(kuò)增后,基于MIMIC-Ⅲ所得到的最高AUC是0.748(基于多層感知器),基于MIMIC-Ⅳ的最高AUC為0.958(基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)),基于EICU的最高AUC 為0.702(基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)),基于三個數(shù)據(jù)集的最高AUC為0.944(基于XGBoost)。

1.2 無監(jiān)督學(xué)習(xí) AP 的特征之一是細(xì)胞因子風(fēng)暴,其通過誘發(fā)全身炎癥反應(yīng)綜合征導(dǎo)致胰腺和其他器官功能障礙甚至衰竭。針對這一現(xiàn)象,Kimita 等[26]首先利用隨機(jī)森林區(qū)分AP患者和健康人群的細(xì)胞因子/趨化因子,兩組人群中共22 個細(xì)胞因子/趨化因子存在顯著差異。接著,基于這22 個細(xì)胞因子/趨化因子對胰腺炎患者進(jìn)行聚類分析,結(jié)果分為2類,其中1類含75例患者,2類含32例患者。與1類患者相比,2類患者的抑胃肽(P=0.001)、多肽YY(P=0.017)、胃饑餓素(P=0.014)、胰島素(P=0.001)水平顯著升高,而鐵調(diào)素(P=0.016)水平顯著降低。這一發(fā)現(xiàn)有助于對胰腺炎患者進(jìn)行早期風(fēng)險分層,給予靶向抗炎藥物和診療方案,實現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療。

無監(jiān)督學(xué)習(xí)應(yīng)用于AP 的研究非常有限,但上述研究揭示了無監(jiān)督學(xué)習(xí)可觀的、潛在的臨床意義,值得進(jìn)一步探究。

2 深度學(xué)習(xí)在AP中的應(yīng)用前景

近年來,隨著人工智能的快速發(fā)展,深度學(xué)習(xí)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用愈發(fā)廣泛,尤其是計算機(jī)視覺領(lǐng)域,主要包括分類[27-29]、目標(biāo)檢測[30-32]和語義分割[33-35]等任務(wù)。性能最佳、應(yīng)用最廣泛的深度學(xué)習(xí)框架為卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),類似人類大腦神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的架構(gòu),基于圖像和圖像相應(yīng)結(jié)局成對形式的數(shù)據(jù)集進(jìn)行訓(xùn)練,充分且深層地學(xué)習(xí)影像特征,并不斷迭代更新,縮小誤差,屬于監(jiān)督學(xué)習(xí)范疇[36]。Tong 等[37]基于超聲增強(qiáng)圖像鑒別胰腺導(dǎo)管腺癌和慢性胰腺炎,首先由放射科醫(yī)生單獨(dú)診斷,然后利用ResNet框架提取深度特征構(gòu)建模型,讓放射科醫(yī)生根據(jù)模型結(jié)果再次診斷,最后比較前后兩次診斷的準(zhǔn)確性,結(jié)果表明,模型性能優(yōu)于第一次放射科醫(yī)生診斷,并且在模型的幫助下,放射科醫(yī)生的診斷敏感度和特異度都得到明顯改善。Chen 等[38]歸納了人工智能(深度學(xué)習(xí)和影像組學(xué))在胰腺疾病中的應(yīng)用,包括胰腺癌檢測、胰腺病變鑒別、胰腺癌預(yù)后和治療效果以及胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌瘤和囊性病變的診斷,反映了人工智能在醫(yī)學(xué)影像中的良好前景。

因此,深度學(xué)習(xí)憑借其基于特定任務(wù)自動學(xué)習(xí)自適應(yīng)特征的能力以及豐富復(fù)雜的超參數(shù),能反映更高階的成像模式,并捕獲更多的成像異質(zhì)性。而目前關(guān)于深度學(xué)習(xí)在AP 中的研究有限,這一研究方向具有一定的探索意義和臨床價值。

3 多模態(tài)模型在AP中的應(yīng)用前景

現(xiàn)代化醫(yī)療信息常依賴多種模態(tài)的信息數(shù)據(jù),包括圖像像素信息、結(jié)構(gòu)化實驗室檢查、非結(jié)構(gòu)化敘述性文本和語音信息等[39],多模態(tài)信息的整合有利于臨床醫(yī)生做出全面的鑒別診斷,指導(dǎo)臨床診治工作,對醫(yī)療行業(yè)的發(fā)展至關(guān)重要。

隨著機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)的快速發(fā)展,多模態(tài)融合的理念已取得初步成效[40-43]。Wang 等[44]將臨床變量和影像組學(xué)特征結(jié)合起來,構(gòu)建了一個列線圖以預(yù)測接受立體定向治療的肝細(xì)胞癌患者的總生存期,結(jié)果表明該列線圖的性能優(yōu)于單獨(dú)臨床模型和單獨(dú)影像組學(xué)模型(C 指數(shù):0.76~0.84 vs 0.72~0.75 vs 0.66~0.77)。Huang 等[45]在預(yù)測胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌瘤的疾病進(jìn)展任務(wù)中,分別基于超聲增強(qiáng)圖像、臨床變量以及兩者結(jié)合的特征構(gòu)建多因素邏輯回歸模型,結(jié)果表明,多模態(tài)模型效果優(yōu)于單獨(dú)的深度學(xué)習(xí)模型和臨床模型(AUC:0.85 vs 0.81 vs 0.78)。

綜上,多模態(tài)融合可以提升模型的性能,從復(fù)雜、海量的數(shù)據(jù)中提取充分信息并排除冗余信息,以達(dá)到最佳的預(yù)測作用。但目前尚未有關(guān)于多模態(tài)模型在AP中應(yīng)用的研究,這一研究方向值得深入探究。

4 結(jié)論

隨著人工智能技術(shù)的發(fā)展,大多數(shù)基于臨床變量的AP預(yù)測模型研究正在不斷克服樣本量小、分類不均衡、信息偏倚等問題,模型性能也因此不斷提升。此外,在臨床變量的基礎(chǔ)上,加入影像組學(xué)和深度學(xué)習(xí)的應(yīng)用,既符合真實世界臨床診療數(shù)據(jù)多模態(tài)來源的特點(diǎn),又能進(jìn)一步提升模型性能,為臨床決策提供更準(zhǔn)確的幫助。但是,機(jī)器學(xué)習(xí)在AP中的應(yīng)用仍存在一些局限性。首先,數(shù)據(jù)準(zhǔn)備方面仍有提高空間,例如對于缺失值、異常值的清洗方式,對于不平衡數(shù)據(jù)集的預(yù)處理方式,以及對于小樣本多變量的共線性問題等,都需要被合理、科學(xué)地解決。其次,在模型部署方面尚有欠缺,大部分研究構(gòu)建的模型未能實現(xiàn)日常應(yīng)用,缺乏臨床實踐性。此外,需要開展多中心、前瞻性研究以解決部分?jǐn)?shù)據(jù)異質(zhì)性問題和提高模型泛化能力。

利益沖突聲明:本文不存在任何利益沖突。

作者貢獻(xiàn)聲明:殷民月、朱錦舟負(fù)責(zé)課題設(shè)計,撰寫、修改論文;劉璐、高靜雯、林嘉希參與文獻(xiàn)檢索與歸納;許春芳負(fù)責(zé)指導(dǎo)撰寫文章并最后定稿。

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