【摘 要】目的：觀察尿路菌群在急性單純性和反復(fù)發(fā)作性下尿路感染的不同特征，以探索反復(fù)發(fā)作性尿路感染（recurrent uri?nary tract infection，rUTI）診治新方向。方法：納入2020年5月至2021年9月重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院和奉節(jié)縣人民醫(yī)院的單純下尿路感染女性患者53 例，分為急性組27 例和反復(fù)組26 例，收集尿液標(biāo)本進(jìn)行尿培養(yǎng)并采用16s 核糖體核糖核酸（16 sribosomal ribonucleic acid，16srRNA）二代測(cè)序檢測(cè)尿液中菌群。結(jié)果：①2組尿路菌群在菌門(mén)中，儉菌超門(mén)急性組平均值0.004 9±0.0026，反復(fù)組平均值0.002 8±0.001 8，浮霉菌門(mén)急性組平均值0.003 5±0.001 9，反復(fù)組平均值0.002 3±0.002 0，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（t=3.444、2.160，P=0.001、0.035）；在菌屬中，急性組相對(duì)豐度平均值較高的菌屬中，蒼白桿菌屬急性組平均值0.026 9±0.010 9，反復(fù)組平均值0.017 1±0.010 3，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（t=3.372，P=0.001）；②急性組的α多樣性分值中位數(shù)與反復(fù)組相比，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義；β多樣性急性組矩陣距離中位數(shù)為0.277（0.225，0.361），反復(fù)組矩陣距離中位數(shù)為0.319（0.240，0.519），差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（F=2.259、R=0.042、P=0.027）；③組間相對(duì)豐度中位數(shù)具有明顯差異的分類(lèi)單元有α變形桿菌綱等。結(jié)論：急性組和反復(fù)組的菌群多樣性、菌群相對(duì)豐度、優(yōu)勢(shì)菌群差異明顯。

【關(guān)鍵詞】尿路感染；尿路菌群；16s核糖體核糖核酸

【中圖分類(lèi)號(hào)】R714.258 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A 【收稿日期】2023-12-26

已知約50% 以上的尿路感染（urinary tract in?fection，UTI）患者會(huì)在6個(gè)月內(nèi)發(fā)生2次及以上或1年內(nèi)發(fā)生3次及以上經(jīng)培養(yǎng)證實(shí)的急性發(fā)作性尿路感染 [1]，即反復(fù)發(fā)作性尿路感染（recurrent urinarytract infection，rUTI）。近年來(lái)尿路菌群在rUTI發(fā)生中的作用是研究新方向，將為以后調(diào)節(jié)尿路菌群，防治rUTI提供依據(jù)。本研究觀察尿路菌群在急性單純性和反復(fù)發(fā)作性下尿路感染的不同特征。

1 資料與方法

1.1 一般資料

納入2020年5月至2021年9月重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院和奉節(jié)縣人民醫(yī)院門(mén)診的單純性下UTI女性患者。納入標(biāo)準(zhǔn)為：年齡18～55歲，為急性或反復(fù)發(fā)作的，有尿急、尿痛、尿頻等典型UTI癥狀，接受了尿液分析、尿液培養(yǎng)和尿液二代測(cè)序（next generation sequencing，NGS）檢查的女性患者。排除標(biāo)準(zhǔn)：有尿路畸形病史、泌尿道功能障礙、神經(jīng)源性膀胱、泌尿系梗阻性疾病、陰道相關(guān)感染性疾??；有嚴(yán)重的心腦肝腎疾病、糖尿?。婚L(zhǎng)期使用激素和服用免疫抑制劑；有泌尿生殖道手術(shù)史等有尿路功能或結(jié)構(gòu)異常；處于妊娠期；就診前2 d內(nèi)已服用抗菌藥物的患者；共納入了53例符合標(biāo)準(zhǔn)的患者。分析這些患者的臨床和實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)。本研究符合倫理學(xué)標(biāo)準(zhǔn)并經(jīng)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)（倫理批件號(hào)：FY-PJ-201901），已征得患者的知情同意。

1.2 資料收集

收集入組門(mén)診患者的臨床資料和實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果，包括年齡、性別、癥狀、合并疾病、既往妊娠史、尿紅細(xì)胞、尿白細(xì)胞、尿細(xì)菌、尿亞硝酸鹽、尿培養(yǎng)結(jié)果等。各指標(biāo)判斷標(biāo)準(zhǔn)根據(jù)《中國(guó)女性尿路感染診療專(zhuān)家共識(shí)（2017）》[2]，異常指標(biāo)為：尿紅細(xì)胞計(jì)數(shù)gt;3個(gè)/視野，尿白細(xì)胞計(jì)數(shù)gt;5個(gè)/視野，尿細(xì)菌計(jì)數(shù)gt;1個(gè)/視野，尿亞硝酸鹽（+）、尿培養(yǎng)≥105 cfu/mL。

1.3 病例分組

根據(jù)以下定義將患者分為急性組和反復(fù)組。急性組：在有膿尿和尿培養(yǎng)病史的患者中，急性發(fā)作UTI癥狀，過(guò)去3年內(nèi)無(wú)急性下UTI病史。反復(fù)組：在有膿尿和尿培養(yǎng)病史的患者中，有排尿困難或恥骨上疼痛及1種或多種其他刺激性排尿癥狀，在過(guò)去6個(gè)月中有過(guò)2次及以上急性下UTI發(fā)作史，且每年發(fā)作3次及以上。

1.4 尿液收集、細(xì)菌培養(yǎng)及細(xì)胞因子水平和尿路微生態(tài)測(cè)定

用無(wú)菌的干凈試管收集患者清潔中段尿液50 mL，向患者充分說(shuō)明留取無(wú)污染中段尿的意義和具體采集方法，收集后，標(biāo)本立即送到實(shí)驗(yàn)室，儲(chǔ)存在-20°C 冰箱。在1～2 d內(nèi)，樣本用干冰冷凍后送到基因?qū)嶒?yàn)室，離心20 min 左右（2 000～3 000 r/min），立即分析或分裝后-20 ℃冷凍保存。將一環(huán)充分混合的尿液（0.001 mL）接種到血瓊脂平板和麥康基瓊脂（碧云天公司，上海）上。平板在5%的二氧化碳孵育箱以37 ℃孵育過(guò)夜。孵育24～48 h后，檢查培養(yǎng)板，細(xì)菌生長(zhǎng)≥105 mL被認(rèn)為是菌尿的重要臨界值。通過(guò)Vitek2Compact（梅里埃公司，法國(guó)） 全自動(dòng)細(xì)菌鑒定儀進(jìn)行細(xì)菌鑒定。微生態(tài)測(cè)序步驟為微生物組總DNA提取，目標(biāo)片段PCR擴(kuò)增，引物：338F ACTCCTACGGGAGGCAGCA，806R GGACTACHVGGGTWTCTAAT；擴(kuò)增產(chǎn)物磁珠純化回收，擴(kuò)增產(chǎn)物熒光定量，測(cè)序文庫(kù)制備，上機(jī)進(jìn)行高通量測(cè)序，上機(jī)測(cè)序前進(jìn)行質(zhì)檢，對(duì)文庫(kù)進(jìn)行定量，雙端測(cè)序儀器為MiSeq測(cè)序儀。

1.5 泌尿病原體的分類(lèi)和定義

將尿培養(yǎng)試驗(yàn)和NGS中檢測(cè)到的細(xì)菌分為3組。①明確的泌尿病原體：通過(guò)尿培養(yǎng)等常規(guī)診斷方法已經(jīng)確定為泌尿病原體的細(xì)菌[13]；②不太可能是泌尿病原體的細(xì)菌：從健康男性和女性的尿液中分離出的細(xì)菌，但很少?gòu)幕疾€(gè)體的尿液中分離出[5]；③可能的泌尿病原體：不包括在組1或組2中的細(xì)菌。在本研究中，組1和組3被視為泌尿病原體。

1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

運(yùn)用SPSS 24.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。用ShaPiro-Wilk檢驗(yàn)對(duì)計(jì)量資料進(jìn)行正態(tài)性檢驗(yàn)，符合正態(tài)分布的用均值±標(biāo)準(zhǔn)差（x±s）描述，組間比較采用t 檢驗(yàn)；不符合正態(tài)分布的用中位數(shù)（四分位間距）[Md（P25，P75）]描述，組間比較采用秩和檢驗(yàn)。計(jì)數(shù)資料采用例（百分?jǐn)?shù)）表示，組間比較采用卡方檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。微生物多樣性分α 多樣性和β多樣性。α 多樣性計(jì)算了Shannon和Simpson指數(shù)，非參數(shù)統(tǒng)計(jì)wilcoxon秩和檢驗(yàn)用于檢驗(yàn)組間差異。β多樣性使用了非量度多維尺度（non-metric multidimensional scaling，NMDS）和weight-unifrac距離，非參數(shù)統(tǒng)計(jì)wilcoxon秩和檢驗(yàn)用于檢驗(yàn)組間差異。使用對(duì)數(shù)10轉(zhuǎn)換的相對(duì)豐度的熱圖顯示有差異的分類(lèi)群，并根據(jù)歐式距離進(jìn)行等級(jí)聚類(lèi)。使用線(xiàn)性判別分析效應(yīng)大?。╨inear discriminant analysis effect size，LEfSe）分析組間相對(duì)豐度中位數(shù)具有顯著差異的分類(lèi)單元，僅顯示通過(guò)線(xiàn)性判別分析（linear discriminant analysis，LDA）閾值3.0的分類(lèi)群，非參數(shù)統(tǒng)計(jì)wilcoxon秩和檢驗(yàn)用于檢驗(yàn)組間差異。

2 結(jié)果

2.1 基線(xiàn)特征

患者的特征見(jiàn)表1。患者均為女性，平均年齡為（35.72±10.02）歲。反復(fù)組的平均年齡為（37.23±9.81）歲，急性組平均年齡為（34.26±10.19）歲，2組年齡差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（t=-1.081，P=0.285）。在既往妊娠史方面，急性組占比92.6%，反復(fù)組占比88.5%，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ2=0.265，P=0.669）。組間菌尿分析包含尿紅細(xì)胞、尿白細(xì)胞、尿細(xì)菌和尿亞硝酸鹽的陽(yáng)性結(jié)果比例，差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2.2 急性組和反復(fù)組UTI的菌群多樣性

圖1A代表2個(gè)組的α多樣性。通過(guò)Shannon指數(shù)測(cè)出急性組多樣性分值中位數(shù)5.615（4.520，6.119），反復(fù)組多樣性分值中位數(shù)5.174（3.867，6.167）（Z=-1.032，P=0.302）。通過(guò)Simpson指數(shù)測(cè)出急性組多樣性分值中位數(shù)0.885（0.844，0.932），反復(fù)組多樣性分值中位數(shù)0.851（0.750，0.933）（Z=-1.174，P=0.240）。2個(gè)指數(shù)測(cè)定的菌群α多樣性差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。圖1B代表2個(gè)組的β多樣性。用NMDS分析weight-unifrac 算法得到的距離矩陣，并對(duì)距離矩陣進(jìn)行Adonis統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)，急性組矩陣距離中位數(shù)為0.277（0.225，0.361），反復(fù)組矩陣距離中位數(shù)為0.319（0.240，0.519），2組之間的β 多樣性明顯不同（F=2.259，R=0.042，P=0.027），差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2.3 急性組和反復(fù)組UTI的菌群組成

在2組組成差異方面，見(jiàn)圖2A。2組相對(duì)豐度平均值排列前10的菌門(mén)內(nèi)平均值較高的菌門(mén)分為4類(lèi)，分別是變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、放線(xiàn)菌門(mén)、擬桿菌門(mén)。余下的菌門(mén)中儉菌超門(mén)急性組平均值0.004 9±0.002 6，反復(fù)組平均值0.002 8±0.001 8（t=3.444，P=0.001）和浮霉菌門(mén)急性組平均值0.003 5±0.001 9，反復(fù)組平均值0.002 3±0.002 0（t=2.160，P=0.035），差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見(jiàn)圖2B，2組相對(duì)豐度平均值排列前10的菌屬分別是氣單胞菌屬、博代氏桿菌屬、涅斯捷連科氏菌屬、乳酸菌屬、短波單胞菌屬、假單胞菌屬、大腸埃希氏菌屬、蒼白桿菌屬、不動(dòng)桿菌屬、污染沙氏菌屬。其中氣單胞菌屬急性組平均值0.248 6±0.136 8，反復(fù)組平均值0.269 7±0.165 7（t=-0.506，P=0.615）；乳酸菌屬急性組平均值0.033 4±0.071 2，反復(fù)組平均值0.071 9±0.164 6（t=-1.115，P=0.270）；大腸埃希氏菌屬急性組中位數(shù)0.001 4（0.000 9，0.006 9），反復(fù)組中位數(shù)0.001 4（0.000 7，0.003 6）（Z=-0.427，P=0.669），差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。其余急性組相對(duì)豐度平均值較高的菌屬中，蒼白桿菌屬急性組平均值0.026 9±0.010 9，反復(fù)組平均值0.017 1±0.010 3，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（t=3.372，P=0.001）。

圖3分析了特定的細(xì)菌屬在2組中的不同。以熱圖的形式顯示了前10個(gè)屬對(duì)數(shù)10轉(zhuǎn)換的相對(duì)豐度。熱圖中的值代表對(duì)數(shù)10標(biāo)準(zhǔn)化的測(cè)序讀數(shù)，顏色越紅，豐度越高，顏色越藍(lán)，豐度越低。2組中氣單胞菌屬和博代氏菌屬豐度最高，其余菌屬豐度較低。

2.4 急性組和反復(fù)組UTI的差異菌群

圖4 所示，LEfSe 分析顯示2 組之間細(xì)菌分類(lèi)群不同（LDA scoregt;3）?？v坐標(biāo)為組間相對(duì)豐度中位數(shù)具有明顯差異的分類(lèi)單元（表2），橫坐標(biāo)則以條形圖直觀地展示各分類(lèi)單元的LDA的對(duì)數(shù)得分值。柱長(zhǎng)度越長(zhǎng)表明該分類(lèi)單元的差異越明顯。急性組中富集的分類(lèi)群顯示為藍(lán)色，LDA評(píng)分為正；反復(fù)組顯示為紅色，LDA 評(píng)分為正。僅顯示通過(guò)LDA閾值3.0的分類(lèi)群。急性組以α 變形桿菌綱、假單胞菌目、根瘤菌目、莫拉氏菌科、不動(dòng)桿菌屬、假單胞菌科、假單胞菌屬、布魯氏菌科、蒼白桿菌屬、節(jié)桿菌屬、叢毛單胞菌科等為代表，反復(fù)組以雙歧桿菌屬、梭菌科為代表。

2.5 常規(guī)尿培養(yǎng)與尿NGS檢出率的比較

針對(duì)組1和組3的泌尿病原體，將相對(duì)豐度較高的前10類(lèi)菌屬中的假單胞菌屬、大腸埃希氏菌屬和不動(dòng)桿菌屬作為可能的致病性泌尿病原體，并將同一樣本中3種病原體的相對(duì)豐度都低于2%定義為陰性結(jié)果。以此標(biāo)準(zhǔn)，比較了常規(guī)尿培養(yǎng)和尿NGS的檢出率。在53例患者中，尿NGS檢出39例（73.6%）符合定義的細(xì)菌，尿培養(yǎng)檢出22例（41.5%），尿NGS 的檢出率高于尿培養(yǎng)的檢出率（χ2=11.160，P=0.001）。急性組（77.8%）和反復(fù)組（69.2%）的尿NGS檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ2=0.498，P=0.480）。見(jiàn)表3。

3 討論

清潔中段尿細(xì)菌培養(yǎng)是診斷UTI的金標(biāo)準(zhǔn)并指導(dǎo)抗生素的使用，但其耗時(shí)長(zhǎng)約2～3 d，不能及時(shí)指導(dǎo)診斷和治療；再者標(biāo)本易受污染，容易出現(xiàn)假陽(yáng)性結(jié)果，同時(shí)若患者近期使用過(guò)抗菌藥或頻繁排尿、過(guò)量飲水等則假陰性率較高。而且，尿培養(yǎng)不能檢測(cè)到生長(zhǎng)緩慢、厭氧、有特殊營(yíng)養(yǎng)要求的細(xì)菌。二代測(cè)序中與細(xì)菌相關(guān)的16s rRNA基因測(cè)序則克服了這些局限。

本研究對(duì)53例UTI女性的尿液樣本進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的中段尿培養(yǎng)，結(jié)果顯示尿NGS檢出39例（73.6%）符合我們定義的細(xì)菌，尿培養(yǎng)檢出22例（41.5%），尿NGS的檢出率高于尿培養(yǎng)的檢出率（χ2=11.160，P=0.001）。與尿液培養(yǎng)比，尿液NGS進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了許多在傳統(tǒng)培養(yǎng)方法中未檢測(cè)到的厭氧菌，表明了NGS方法的潛在效用。有研究表明，與16s rRNA二代測(cè)序相比，在標(biāo)準(zhǔn)尿培養(yǎng)中大約90%的陰性結(jié)果樣品中存在活細(xì)菌[3]。Price TK等[4]在2016年的1項(xiàng)研究中對(duì)2種方法進(jìn)行了直接比較，結(jié)果顯示標(biāo)準(zhǔn)尿培養(yǎng)遺漏了67%的尿路病原體。這可以為培養(yǎng)陰性的有癥狀患者中難以治療的rUTI提供非常有用的信息。

另一方面，本研究發(fā)現(xiàn)急性發(fā)作UTI和rUTI在細(xì)菌組成、相對(duì)豐度和多樣性方面有明顯差異。數(shù)據(jù)僅在急性UTI組觀察到α多樣性增加，微生物α多樣性減少與rUTI相關(guān)。已有研究表明，健康人群中以枸櫞酸桿菌屬、棒狀桿菌屬、腸球菌屬、大腸埃希菌屬、乳酸菌屬、普雷沃氏菌屬、葡萄球菌屬、鏈球菌屬為主[5]。這與本研究的UTI的急性組和反復(fù)組的菌屬差異顯著，本研究以氣單胞菌屬、博代氏桿菌屬、涅斯捷連科氏菌屬、乳酸菌屬、短波單胞菌屬、假單胞菌屬、大腸埃希氏菌屬、蒼白桿菌屬、不動(dòng)桿菌屬、污染沙氏菌屬為主。為了評(píng)估尿液菌群與rUTI之間的關(guān)系，Huang L等[6]比較了90例rUTI女性和62例健康對(duì)照的尿液菌群。研究發(fā)現(xiàn)，與健康組相比，反復(fù)組中變形菌門(mén)、伯克氏菌目、羅氏菌屬、普雷沃氏菌屬、小桿菌屬和棒狀桿菌屬的豐度更高，乳酸菌屬、加德納菌屬、鏈球菌屬和埃扎基菌屬的豐度明顯降低。與本研究類(lèi)似，反復(fù)組菌群與健康組菌群差異明顯。這表明腸桿菌科以外的不同物種可能是感染rUTI的原因。同樣與本研究結(jié)果類(lèi)似，反復(fù)組的α多樣性低于健康組，支持微生物組多樣性較低有利于感染而多樣性較高有保護(hù)作用的假設(shè)。Yoo JJ 等[7]就腸桿菌科以外的物種在rUTI發(fā)病機(jī)制中的作用得出了部分相似部分相反的結(jié)論。作者比較了11例急性膀胱炎女性和31例rUTI女性的尿液菌群。研究發(fā)現(xiàn)，與急性組相比，反復(fù)組的泌尿菌群在擬桿菌門(mén)、擬桿菌綱、擬桿菌目、普雷沃菌科和厚壁菌門(mén)中的豐度更高，反復(fù)組患者的α多樣性和豐富度更高。此外，在反復(fù)組的尿液中檢測(cè)到鞘氨醇單胞菌屬、葡萄球菌屬、鏈球菌屬和羅氏菌屬。就菌門(mén)組成來(lái)看，Yoo JJ等[7]與本研究的菌門(mén)結(jié)果大體一致，反復(fù)組厚壁菌門(mén)和擬桿菌門(mén)豐度比急性組高，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義；就菌屬來(lái)看，本研究的反復(fù)組乳酸菌屬和大腸埃希氏菌屬比急性組高，但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，且不與Yoo JJ等[7]類(lèi)似，未檢測(cè)到單獨(dú)存在于復(fù)發(fā)組的菌屬；就多樣性來(lái)看，與此相反，本研究與Huang L等[6]的結(jié)果都表明反復(fù)組較之非反復(fù)組α多樣性更低。類(lèi)似的研究Ceprnja M等[8]對(duì)28例急性膀胱炎患者的尿液菌群進(jìn)行了分析，其中包括16例女性和12例男性。研究發(fā)現(xiàn)，γ-變形菌綱和芽孢桿菌綱在所有樣本中占主導(dǎo)地位，變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和放線(xiàn)菌門(mén)占所有檢測(cè)分類(lèi)群的99%以上，這與本研究急性組的4類(lèi)高豐度菌門(mén)結(jié)果類(lèi)似。此外，在大多數(shù)情況下，觀察到單個(gè)菌科的優(yōu)勢(shì)，其中腸球菌科、腸桿菌科或假單胞菌科占細(xì)菌總數(shù)的90%以上。YooJJ等[7]也獲得了類(lèi)似的結(jié)果，與Ceprnja M 等[8]的情況一樣，研究發(fā)現(xiàn)急性膀胱炎組中γ-變形菌綱和變形菌門(mén)的患病率高于反復(fù)組，尤其是假單胞菌屬、不動(dòng)桿菌屬和腸桿菌科[7]。與Ceprnja M 等[8]類(lèi)似，本研究同樣發(fā)現(xiàn)單個(gè)菌科的優(yōu)勢(shì)。與Yoo JJ等[7]類(lèi)似，本研究急性組假單胞菌屬、不動(dòng)桿菌屬豐度高于反復(fù)組，但大腸埃希氏菌屬低于反復(fù)組。最后，與其他人的結(jié)果部分類(lèi)似，本研究的LEfSe圖表明了急性組和反復(fù)組的優(yōu)勢(shì)菌群差異，急性組以α變形桿菌綱、假單胞菌目、根瘤菌目、莫拉氏菌科、不動(dòng)桿菌屬、假單胞菌科、假單胞菌屬、布魯氏菌科、蒼白桿菌屬、節(jié)桿菌屬、叢毛單胞菌科等為代表，反復(fù)組以雙歧桿菌屬、梭菌科為代表?？傊狙芯拷Y(jié)果與其他人的菌群測(cè)序結(jié)果大體上類(lèi)似，產(chǎn)生具體菌屬和部分趨勢(shì)的差異原因可能是尿液收集方式、人種、人群年齡、人群地域、人群生活習(xí)慣等差異導(dǎo)致的。在泌尿系統(tǒng)中，已經(jīng)報(bào)告了其他3項(xiàng)與微生物多樣性相關(guān)的研究[9-11]。首先，Horwitz D等[10]報(bào)道，微生物多樣性減少的患者更有可能在留置導(dǎo)尿管后發(fā)生UTI。而Kramer H 等[11] 和Thomas-White K等[9]分別報(bào)道了慢性腎病和膀胱過(guò)度活動(dòng)癥的多樣性增加?？傊毙詥渭冃韵耈TI可被視為由特定病原體引起的暫時(shí)性感染，但在復(fù)發(fā)性下UTI中，微生態(tài)失調(diào)似乎在病理生理學(xué)中起著更重要的作用[12]。此外，即使在同一復(fù)發(fā)組中，隨著病情的延長(zhǎng)，也有可能出現(xiàn)更復(fù)雜的微生態(tài)失調(diào)的改變[13]。因此，本研究謹(jǐn)慎地提出復(fù)發(fā)性UTI 可能與尿路微生態(tài)失調(diào)有關(guān)，下一步還需要更細(xì)致地研究。

本研究有2點(diǎn)局限性。①臨床研究不包括健康對(duì)照的信息。然而，為了與健康對(duì)照組進(jìn)行比較，必須考慮各種因素（年齡分布、飲食模式、絕經(jīng)、激素治療或既往抗生素使用史），并且需要相對(duì)大量的患者。因此，考慮到研究所需的患者數(shù)量和研究成本，本研究旨在比較實(shí)際疾病狀態(tài)患者的微生物群，而不是與健康對(duì)照組進(jìn)行比較。未來(lái)有必要加入健康對(duì)照組，使研究更具有代表性。②16s rRNA的NGS方法本身存在局限性，該方法不提供抗生素耐藥性的信息，并且比常規(guī)尿培養(yǎng)更昂貴。然而，就成本效益而言，一些人認(rèn)為，考慮到由于傳統(tǒng)尿培養(yǎng)陽(yáng)性率低、額外檢查和住院時(shí)間延長(zhǎng)而導(dǎo)致的不適當(dāng)抗生素使用，NGS相對(duì)具有成本效益。

總之，本研究發(fā)現(xiàn)新興的尿路菌群的研究為復(fù)發(fā)性UTI提供了新的研究方向。未來(lái)的重點(diǎn)是先明確可能在特定微生物生態(tài)系統(tǒng)中富集的核心分類(lèi)群及其在不同病理時(shí)期的分布、豐度和種類(lèi)的變化，然后探究微生物群落在生態(tài)位內(nèi)發(fā)揮功能所需的核心基因組和代謝途徑，為菌群移植和其他治療方法提供依據(jù)。

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（責(zé)任編輯：曾 玲）