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喀斯特地區(qū)不同海拔對(duì)油茶根際土壤叢枝菌根真菌物種群落的影響

2024-04-01 08:13曾維軍劉燕秦維羅文敏
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年1期
關(guān)鍵詞:多樣性油茶

曾維軍 劉燕 秦維 羅文敏

摘要:本研究旨在了解喀斯特地區(qū)不同海拔油茶根際土壤叢枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)的種群多樣性及物種分布特征,以提高AMF 在喀斯特地區(qū)生態(tài)修復(fù)中的應(yīng)用基礎(chǔ)。 以貴州喀斯特高、低海拔地區(qū)油茶根際土壤為材料,利用Illumina MiSeq 測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序,分析AMF 物種多樣性及差異。 結(jié)果表明,喀斯特地區(qū)油茶根際土壤AMF 中球囊霉屬(Glomus)占主要地位,整體豐度為87.28%;低海拔油茶根際土壤AMF 群落特異OTU 數(shù)和Shannon、Chao1 指數(shù)顯著高于高海拔,物種多樣性較為豐富,且組間AMF 物種聚類較遠(yuǎn);油茶根際土壤有機(jī)質(zhì)和有效磷含量與球囊霉屬真菌豐度呈顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為0.58、0.65,表明喀斯特的低磷土壤促進(jìn)油茶根際球囊霉屬的生長(zhǎng),增加土壤碳庫(kù),促進(jìn)油茶對(duì)磷的吸收利用。其作用機(jī)理待進(jìn)一步研究驗(yàn)證。

關(guān)鍵詞:油茶;喀斯特地區(qū);根際土壤;叢枝菌根真菌;多樣性

中圖分類號(hào):S154.3文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2024)01-0105-08

貴州?。叮玻サ膰?guó)土面積為喀斯特地貌,總面積達(dá)10.91 萬(wàn)km2,居全國(guó)之首,是全球喀斯特發(fā)育最典型、最復(fù)雜、景觀類型最豐富的地區(qū)之一[1] 。 喀斯特地貌地表干旱缺水,容易造成石漠化等生態(tài)退化問(wèn)題[2] 。 通過(guò)植被恢復(fù)緩解石漠化是該地區(qū)生態(tài)修復(fù)的關(guān)鍵,但土壤的缺水和貧瘠導(dǎo)致植物難以定居、生長(zhǎng)緩慢[3] 。 油茶是具有重要經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值的油料植物,貴州引種面積逐年增加,栽培過(guò)程中也面臨著土壤保水保肥能力弱等問(wèn)題,制約著油茶果產(chǎn)量和質(zhì)量的提升。尋找一種提高油茶抗逆性的高效方法成為解決該問(wèn)題的關(guān)鍵[4-5] 。

近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),廣泛定植于植物根部的叢枝菌根真菌(AMF) 具有促進(jìn)宿主營(yíng)養(yǎng)吸收、抗病、抗旱和改善土壤微生態(tài)等功能[6-9] 。 世界上許多國(guó)家和地區(qū)也規(guī)定在特定環(huán)境下造林,必須采用菌根化的苗木,以增加移栽的存活率[10-11] 。劉燕等[12] 前期研究也發(fā)現(xiàn),耐旱且油茶果產(chǎn)量穩(wěn)定的貴州野生油茶,其根系普遍被AMF 定殖。 因此,對(duì)AMF 的開(kāi)發(fā)應(yīng)用是未來(lái)研究的熱點(diǎn)和趨勢(shì)。

AMF 的開(kāi)發(fā)利用過(guò)程中存在兩個(gè)主要問(wèn)題,一是不同AMF 對(duì)環(huán)境適應(yīng)性存在差異,二是其高效培養(yǎng)和接種技術(shù)有待突破[13-14] 。 貴州喀斯特高、低海拔地區(qū)都有野生油茶林分布,不同海拔的油茶可能形成了自己特有的根際AMF 群落。 本研究通過(guò)Illumina MiSeq 平臺(tái)對(duì)喀斯特高、低海拔地區(qū)野生油茶根際土樣進(jìn)行高通量測(cè)序,探究AMF 的物種多樣性及其在土壤營(yíng)養(yǎng)形成中的作用,為AMF 在貴州喀斯特地區(qū)油茶綠色種植中的應(yīng)用提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 研究區(qū)概況

設(shè)置高海拔和低海拔2 個(gè)研究區(qū),海拔高度300~2 421 m。 研究區(qū)屬亞熱帶季風(fēng)性和季風(fēng)性濕潤(rùn)氣候,年平均氣溫11.5 ~ 19.2 ℃,年降水量926.2~1 340.7 mm,年日照時(shí)數(shù)為1 328 ~ 1 812h,無(wú)霜期180~345 d。 樣區(qū)為野生油茶林,林齡為40~50 年,經(jīng)度在104.08° E~109.07° E,緯度在24.93° N~27.47° N。 每樣地設(shè)3 個(gè)野生油茶根際土壤采樣點(diǎn),樣地詳情見(jiàn)表1。

1.2 土壤樣品采集

2021 年8 月,在貴州省威寧、冊(cè)亨、從江、玉屏縣的野生油茶分布區(qū)內(nèi)各設(shè)置規(guī)格為400 m2的3 個(gè)相鄰樣方(20 m×20 m),在每個(gè)樣方內(nèi)沿“S”形路徑分別選擇10 株胸徑和樹(shù)高相近的油茶樹(shù),鏟除落葉層并挖開(kāi)上層覆土,剪下細(xì)根分枝并輕輕抖動(dòng),用毛刷將黏在細(xì)根上的土壤刷落到自封袋中。 每個(gè)樣方內(nèi)?。保?份根際土壤,混勻后4 ℃冰箱保存,用于測(cè)定AMF 多樣性。 樣品的采集與預(yù)處理參照?土壤微生物研究原理與方法?[15] 。

1.3 土壤樣品測(cè)序

根據(jù)soil DNA kit(Omega Bio-tek, Norcross,GA,U.S.)使用說(shuō)明進(jìn)行總DNA 提取。 1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA 質(zhì)量,使用Nano ̄Drop2000(Thermo Scientific 公司,美國(guó))測(cè)定DNA濃度和純度。 用兩對(duì)特異性引物AML1/ AML2(5′ - ATCAACTTTCGATGGTAGGATAGA - 3′;5′-GAACCCAAACACTTTGGTTTCC-3′)和AMV4-5NF/AMDGR(5′-AGCTCGTAGTTGAATTTCG-3′;5′-CCCAACTATCCCTATTAATCAT - 3′) 進(jìn)行巢式PCR 擴(kuò)增[16] 。 PCR 反應(yīng)體系為: 5 × TransStartFastPfu 緩沖液4 mL,2.5 mmol/ L dNTPs 2 mL,上、下游引物(5 mmol/ L)各0.8 mL,TransStart FastPfuDNA 聚合酶0.4 mL,DNA 模板10 mL,超純水補(bǔ)足至20 mL。 擴(kuò)增程序如下:95 ℃ 預(yù)變性3 min;95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s, 72 ℃延伸45 s,

27 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min;4 ℃保存。 每樣本3個(gè)重復(fù)。 將同一樣本的PCR 產(chǎn)物混合后使用2%瓊脂糖凝膠回收,利用AxyPrep DNA Gel Extrac ̄tion Kit(Axygen Biosciences,Union City,CA,USA)純化,2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其純度,并用Qua ̄ntusTM Fluorometer(Promega, USA)對(duì)回收產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)定量。 使用NEXTFLEX Rapid DNA-SeqKit 對(duì)純化后的PCR 產(chǎn)物進(jìn)行建庫(kù)。 委托上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司利用Illumina MiSeq 平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。

1.4 土壤理化性質(zhì)檢測(cè)

土壤全氮、全磷、全鉀、有效磷、速效鉀含量及pH 值分別參照NY/ T 53—1987、GB/ T 9837—1988、NY/ T 87—1988、NY/ T 1121.7—2014、NY/ T1849—2010、NY/ T - 1241—1999 中方法進(jìn)行測(cè)定;堿解氮采用堿解擴(kuò)散法測(cè)定[17] 。

1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

使用Flash1.2.11 進(jìn)行pair-end 雙端序列拼接;RDP Classifier2.13 進(jìn)行序列分類注釋;Use ̄arch11 進(jìn)行OTU 統(tǒng)計(jì);Mothur1.30.2 進(jìn)行Alpha多樣性分析,并對(duì)樣本間的多樣性指數(shù)進(jìn)行t 檢驗(yàn);Mega7 和IQ-TREE 進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)分析和構(gòu)建;R語(yǔ)言(version 3.3.1)進(jìn)行物種Venn 圖分析、制作群落柱形圖以及NMDS 分析和作圖。 最后使用Adobe Illustrator2022 修飾圖形。 其中聚類方式采用USEARCH7-uparse 算法,物種分類數(shù)據(jù)庫(kù)為maarjam081/ AMOTU。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同海拔野生油茶根際土壤AMF 群落OTU組成及結(jié)構(gòu)

不同海拔野生油茶根際土壤中共獲得367 148條高質(zhì)量序列,樣品平均序列為20 397條,總堿基數(shù)為79 338 214 bp,平均序列長(zhǎng)度為216 bp,序列相似度為0.97,OTU 分類置信度為0.7。由稀釋曲線(圖1)可知,抽取的序列條數(shù)達(dá)到14 223條以上,曲線趨于平坦,表明不同處理的土樣樣本測(cè)序數(shù)量足夠,測(cè)序數(shù)據(jù)合理。 由Venn圖(圖2)可知,喀斯特高、低海拔地區(qū)AMF 群落共有的OTU 數(shù)為61 個(gè),占總數(shù)的18.32%;高海拔地區(qū)特異OTU 數(shù)為57 個(gè),占總數(shù)的17.12%;低海拔地區(qū)特異OTU 數(shù)為154 個(gè), 占總數(shù)的46.25%。

2.2 不同海拔野生油茶根際土壤AMF 群落結(jié)構(gòu)及多樣性

對(duì)喀斯特野生油茶根際土壤AMF 群落進(jìn)行物種注釋得到1 綱5 目8 科14 屬75 種。 由圖3可知,在屬水平上,相對(duì)豐度排前4 位的屬分別為球囊霉屬(Glomus,87.28%)、無(wú)梗囊霉屬(Acau ̄lospora,5. 97%)、盾巨孢囊霉屬( Scutellospora,2.78%)、球囊菌綱中不能注釋的菌屬(unclassified_c_Glomeromycetes,2.12%),球囊霉屬為優(yōu)勢(shì)屬??λ固馗?、低海拔地區(qū)相比,球囊霉屬相對(duì)豐度差異不顯著,無(wú)梗囊霉屬和球囊菌綱中不能注釋的菌屬在高海拔地區(qū)相對(duì)豐度較高。 高海拔地區(qū)未發(fā)現(xiàn)盾巨孢囊霉屬。不同海拔地區(qū)野生油茶根際土壤AMF 群落α 多樣性指數(shù)如表2 所示,高海拔地區(qū)Shannon指數(shù)和Chao1 指數(shù)均顯著低于低海拔地區(qū),SHEI指數(shù)和PD 指數(shù)與低海拔地區(qū)相比差異不顯著。表明喀斯特高海拔地區(qū)的野生油茶根際AMF 群落的多樣性和物種總數(shù)均顯著低于低海拔地區(qū)。

2.3 不同海拔野生油茶根際土壤AMF 群落PCoA 分析與樣本聚類分析

PCoA 分析可通過(guò)降維找出影響野生油茶根際土壤AMF 樣本群落組成差異的潛在主成分。由圖4 可知,在種水平上,主成分1(PC1)與主成分2(PC2)解釋方差分別為51.05%和32.59%;在OTU 水平上,主成分1(PC1)與主成分2(PC2)解釋方差分別為24.60%和22.86%,影響野生油茶根際土壤AMF 群落結(jié)構(gòu)的主導(dǎo)因子明顯(P <0.05)。在種水平上,同一海拔、同一地點(diǎn)根際土壤3 個(gè)重復(fù)比較聚集,不同地點(diǎn)之間分化明顯,高海拔樣點(diǎn)之間的物種分化較低海拔明顯。 在OTU水平上聚類情況與種水平上相反。

非度量多維尺度分析(NMDS)可將多維空間的研究對(duì)象簡(jiǎn)化到低維空間進(jìn)行定位、分析和歸類,揭示復(fù)雜背景下的簡(jiǎn)單規(guī)律。 由圖5 可知,在種水平上,高海拔野生油茶根際土壤樣本組的AMF 群落包含了低海拔土壤樣本組,且Stress<0.05,具有很好的代表性;在OTU 水平上,不同海拔樣本組間存在差異,且Stress<0.2。 PCoA 與NMDS 分析共同驗(yàn)證了貴州喀斯特高、低海拔間野生油茶根際土壤AMF 群落組成差異明顯,高海拔樣本組涵蓋了低海拔的AMF 分子種。

基于weighted normalized unifrac 距離算法對(duì)貴州喀斯特高、低海拔野生油茶根際土壤樣本進(jìn)行層級(jí)聚類分析(圖6)可知,高海拔地區(qū)A3 和A6 樣本組的AMF 種群相似,聚為一類。 高、低海拔的AMF 物種組成豐度上有較大差異,說(shuō)明海拔高低能改變AMF 種群結(jié)構(gòu)。 但是低海拔樣本組E2 與高海拔A2 組的AMF 種群相似,聚為一類。威寧縣草海鎮(zhèn)(A3)與從江縣拱孑村(D2)兩地海拔差為2 052 m,其AMF 群落結(jié)構(gòu)相似性最低。

2.4 AMF 群落與土壤養(yǎng)分因子的相關(guān)性分析

通過(guò)方差膨脹因子分析(VIF)對(duì)7 個(gè)影響樣本AMF 菌群組成的土壤養(yǎng)分因子進(jìn)行篩選,保留多重共線性較小的因子,進(jìn)行后續(xù)研究。 由表3可知,篩選后的土壤養(yǎng)分因子分別為全磷、全鉀、有效磷、速效鉀和有機(jī)質(zhì),VIF 值均小于10。

通過(guò)計(jì)算篩選后的土壤養(yǎng)分因子與AMF 物種之間的Pearson 相關(guān)系數(shù),獲得相關(guān)性熱圖(圖7)。 結(jié)果表明,球囊霉屬與土壤有機(jī)質(zhì)和有效磷呈顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為0.58、0.65;多樣孢囊霉屬(Diversispora) 和原囊霉屬(Archaeospo ̄ra)與全磷呈極顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為0.91、0.90;盾巨孢囊霉屬與速效鉀呈顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為-0.61;無(wú)梗囊霉屬(Acaulospora)與全鉀呈極顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為-0.78。

3 討論

除宿主特異性外,AMF 的分布還受氣候、土壤條件、緯度、空間隔離、干擾等多種非生物因子的影響[18-22] 。 研究發(fā)現(xiàn),隨著海拔的升高,青藏高原草甸AMF 的物種豐度逐漸降低[22] ;在宿主植物和土壤條件相似的情況下,AMF 多樣性隨氣溫升高而增加[23-24] 。 本研究發(fā)現(xiàn),低海拔地區(qū)油茶根際AMF 群落特異OTU 數(shù)、Shannon 指數(shù)、Chao1 指數(shù)顯著高于高海拔地區(qū),表明AMF 物種總數(shù)和多樣性隨海拔的升高而降低;同時(shí)AMF 的群落結(jié)構(gòu)也發(fā)生了改變,與低海拔地區(qū)相比,高海拔地區(qū)油茶根際土壤中未發(fā)現(xiàn)盾巨孢囊霉屬真菌。 本研究中,海拔高度的改變直接導(dǎo)致兩地區(qū)間較大的年平均氣溫差,達(dá)7.7 ℃,說(shuō)明野生油茶根際土壤AMF 的物種結(jié)構(gòu)和多樣性差異也可能是由緯度、海拔差造成的環(huán)境溫差導(dǎo)致。 另外,高、低海拔地區(qū)的油茶根際AMF 物種可以通過(guò)聚類分析分別聚在一起,同時(shí)高、低海拔組間又有一定的物種隔離,說(shuō)明在喀斯特地區(qū)海拔差異越大,油茶根際AMF 物種的親緣關(guān)系就越遠(yuǎn)。

石灰土是喀斯特地區(qū)分布最廣的非地帶性土壤,表現(xiàn)出高鈣鎂、低磷鉀和土壤偏堿性的地球化學(xué)特征[25] ,而在一定范圍內(nèi),低磷土壤會(huì)促進(jìn)AMF 的生長(zhǎng)[26-27] 。 研究表明,球囊霉屬真菌能分泌球囊霉素,作為一種非專性蛋白,其主要作用是穩(wěn)定和增加土壤有機(jī)碳庫(kù)、改善土壤團(tuán)聚體,還可以促進(jìn)植物對(duì)磷的吸收,并能與鉛結(jié)合在土壤重金屬形態(tài)轉(zhuǎn)化中具有潛在的重要意義[28-30] 。 本研究中,球囊霉屬在AMF 中占據(jù)主要地位,并與油茶根際土壤有機(jī)質(zhì)和有效磷含量呈顯著正相關(guān),說(shuō)明喀斯特的低磷土壤能提高油茶根際球囊霉屬豐度,使土壤中的球囊霉素含量理論上得到提高,從而改善土壤質(zhì)量,增加土壤碳庫(kù),促進(jìn)油茶對(duì)磷的吸收。

4 結(jié)論

貴州喀斯特高、低海拔地區(qū)的野生油茶根際土壤AMF 多樣性、群落結(jié)構(gòu)、種水平上的聚類關(guān)系均具有顯著差異,其中低海拔地區(qū)的AMF 多樣性較豐富,并與高海拔地區(qū)存在較為明顯的種群親緣隔離。 另外,喀斯特地區(qū)特有的石灰土中缺乏磷、鉀,促進(jìn)了油茶根際AMF 的生長(zhǎng),尤其是球囊霉屬,其分泌較多的球囊霉素?cái)U(kuò)撒到土壤中,可改善土壤質(zhì)量、增加土壤碳庫(kù)、促進(jìn)油茶對(duì)磷的吸收利用,從而使油茶根際土壤有機(jī)質(zhì)和有效磷含量增加。 其相關(guān)作用機(jī)理有待進(jìn)一步研究驗(yàn)證。

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