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基于無(wú)人機(jī)高光譜影像的水稻葉片SPAD 值反演方法研究

2024-05-11 00:00:00謝東何敬何嘉晨王彬林遠(yuǎn)楊劉剛
關(guān)鍵詞:高光譜相關(guān)系數(shù)主成分分析

摘要:[目的]通過(guò)無(wú)人機(jī)高光譜影像實(shí)現(xiàn)對(duì)水稻葉綠素含量高效、無(wú)損監(jiān)測(cè)是現(xiàn)代化精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)發(fā)展的重要手段。研究水稻葉片原始光譜的不同預(yù)處理方法及其組合,構(gòu)建不同光譜參數(shù)進(jìn)行模型反演,得到研究區(qū)水稻葉片SPAD 值的最佳反演模型,可為高效無(wú)損監(jiān)測(cè)水稻葉綠素含量提供參考。[方法]以四川省成都市青白江區(qū)姚渡鎮(zhèn)水稻種植區(qū)的水稻為研究對(duì)象,分別測(cè)定其葉片SPAD 值和500~900 nm 范圍內(nèi)的高光譜反射率,對(duì)原始反射率進(jìn)行一階微分(D1)、Savitzky‐Golay 卷積平滑(SG 平滑)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變換(SNV)和多元散射校正(MSC)及其組合的預(yù)處理方式,通過(guò)相關(guān)系數(shù)篩選出plt;0. 1 的特征波段作為第1 種光譜參數(shù),在特征波段的基礎(chǔ)上進(jìn)行主成分分析(PCA)降維,將得到的主成分作為第2 種光譜參數(shù)。將2 種參數(shù)分別作為Extra Trees 模型的輸入變量,建立研究區(qū)水稻SPAD 值的反演模型。[結(jié)果]相比于利用相關(guān)系數(shù)篩選的特征波段所建的模型,通過(guò)PCA 對(duì)特征波段進(jìn)行降維,得到的光譜參數(shù)建模精度更高,其中,ET_D1 和ET_SG_MSC 的R2 分別由0. 769 和0. 782 增加到0. 793 和0. 825,提升幅度為3% 和5. 5%;ET_SG_SNV 的R2 由0. 754 增加到0. 796,提升幅度為5. 6%;模型ET_PCA_特征_SG_MSC 精度最高,R2 和RMSE分別為0. 825 和0. 984,是研究區(qū)水稻SPAD 值的最佳反演模型。[結(jié)論]研究結(jié)果可為實(shí)現(xiàn)高效、精準(zhǔn)的水稻葉片葉綠素含量監(jiān)測(cè)提供參考及依據(jù)。

關(guān)鍵詞:水稻; 葉綠素; 高光譜; 相關(guān)系數(shù); 主成分分析; Extra Tress

中圖分類號(hào):S511 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1671-8151(2024)01-0120-10

水稻作為我國(guó)主要糧食作物,占全國(guó)糧食播種面積的27%,在我國(guó)糧食生產(chǎn)中占有重要地位[1]。水稻進(jìn)行光合作用和物質(zhì)積累的主要場(chǎng)所是葉片,水稻葉片的葉綠素含量表征了水稻的營(yíng)養(yǎng)和生長(zhǎng)狀況,是植物營(yíng)養(yǎng)脅迫、光合作用、葉片氮素含量以及各階段生長(zhǎng)發(fā)育狀況的重要指示劑[2-5]。傳統(tǒng)的葉片葉綠素檢測(cè)方法中最常見(jiàn)的是分光光度法[5-6],不僅會(huì)造成葉片結(jié)構(gòu)的損害,并且十分費(fèi)時(shí)費(fèi)力。此外,葉綠素具有結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定、見(jiàn)光易分解的特點(diǎn),這會(huì)導(dǎo)致測(cè)量值和實(shí)際含量之間存在一定誤差[7]。研究表明便攜式葉綠素儀測(cè)定的葉片葉綠素相對(duì)含量(SPAD 值)與葉綠素含量呈正相關(guān)[8],因此SPAD 值能夠代替通過(guò)化學(xué)分析方法檢測(cè)出的葉綠素含量,實(shí)現(xiàn)葉片葉綠素的高效、無(wú)損檢測(cè)。

借助于高光譜遙感技術(shù)對(duì)植物特別是農(nóng)作物進(jìn)行SPAD 值的快速、準(zhǔn)確、無(wú)損的獲取與監(jiān)測(cè)等方面研究已經(jīng)取得了突出的進(jìn)展[9-10]。與多光譜遙感相比,高光譜遙感對(duì)植物生理生化參數(shù)的變化感知更加敏感,反映的特征更加精細(xì),這為準(zhǔn)確估算植被生理生化參數(shù)提供了良好的基礎(chǔ)[11-13]。

無(wú)人機(jī)作為低空遙感的一種方式,操作簡(jiǎn)單,起飛條件寬松,機(jī)動(dòng)性、靈活性高,可以獲取高空間、高光譜分辨率的遙感影像[14]。因此,近年來(lái)利用無(wú)人機(jī)高光譜遙感數(shù)據(jù)監(jiān)測(cè)作物SPAD 值的方法已被廣泛應(yīng)用。常瀟月等[15]利用無(wú)人機(jī)平臺(tái)搭載高光譜相機(jī)獲得玉米農(nóng)田高光譜影像,從中提取了光譜參數(shù)進(jìn)行玉米葉片葉綠素含量估測(cè),結(jié)果顯示以紅邊一階微分最大值為自變量構(gòu)建的回歸模型建模精度最高。尹航等[16]利用無(wú)人機(jī)為平臺(tái)搭載S185 光譜儀獲取馬鈴薯試驗(yàn)區(qū)高光譜影像,通過(guò)波段優(yōu)化算法建立優(yōu)化光譜指數(shù)和馬鈴薯葉綠素含量估測(cè)模型,發(fā)現(xiàn)通過(guò)優(yōu)化波段建立的光譜指數(shù)能夠明顯提高模型準(zhǔn)確性。袁煒楠等[17]針對(duì)無(wú)人機(jī)高光譜遙感數(shù)據(jù)的高維特性,提出一種基于主基底分析的降維方法,并建立最小二乘回歸模型對(duì)水稻冠層葉片葉綠素含量進(jìn)行估算,結(jié)果表明與3 種植被指數(shù)降維后建立的模型相比,該方法的建模精度有了很大提升。

在對(duì)高光譜數(shù)據(jù)的前期處理方面,已有學(xué)者分別采用標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變換、多元散射校正、基線校正、卷積平滑濾波和一階導(dǎo)數(shù)等預(yù)處理方法,分析比較了線性回歸、偏最小二乘、支持向量機(jī)、BP 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和隨機(jī)森林等模型預(yù)測(cè)作物葉片營(yíng)養(yǎng)元素的效果[18-22]。還有學(xué)者采用7 種光譜預(yù)處理方法及其組合,結(jié)合偏最小二乘、支持向量回歸和隨機(jī)森林3 種模型,建立了光譜反射率與水稻葉片SPAD 值的映射關(guān)系,比較了不同組合的預(yù)測(cè)精度[23]。陳志超等[24]通過(guò)5 種方法對(duì)提取的春玉米冠層高光譜信息進(jìn)行預(yù)處理,并分別采用偏最小二乘回歸、BP 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)回歸和隨機(jī)森林回歸3 種算法構(gòu)建春玉米氮營(yíng)養(yǎng)指數(shù)反演模型,結(jié)果表明隨機(jī)森林算法結(jié)合MSC 預(yù)處理反演效果最好。

在波段降維方面,姚付啟等[25]采用主成分分析對(duì)原始光譜進(jìn)行降維,將得到的主成分作為BP人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的輸入變量,實(shí)現(xiàn)了對(duì)法國(guó)梧桐葉綠素含量的估算。孫小香等[26]利用主成分分析對(duì)原始光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行降維,結(jié)合逐步多元線性回歸和支持向量回歸構(gòu)建了葉片SPAD 值的高光譜估算模型。劉文雅等[27]將對(duì)馬尾松冠層原始光譜進(jìn)行主成分分析降維后的前4 個(gè)主成分以及篩選出的植被指數(shù)和紅邊參數(shù)作為BP 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸入變量構(gòu)建葉綠素含量的高光譜估算模型,發(fā)現(xiàn)基于主成分分析的特征參數(shù)預(yù)測(cè)效果最好。

現(xiàn)有研究在對(duì)原始光譜進(jìn)行多種預(yù)處理后直接將全波段光譜作為自變量代入模型中進(jìn)行作物參量的預(yù)測(cè),僅考慮不同預(yù)處理方式對(duì)建模精度的影響,忽略了波段信息冗余和無(wú)關(guān)信息干擾等問(wèn)題;此外前人在使用主成分分析時(shí)大多選擇對(duì)原始光譜進(jìn)行降維,基于特征波段進(jìn)行PCA 降維的建模效果需要進(jìn)一步研究。本文將幾種預(yù)處理方法進(jìn)行組合,在其基礎(chǔ)上基于相關(guān)系數(shù)提取特征波段作為第1 種光譜參數(shù),在第1 種光譜參數(shù)的基礎(chǔ)上,進(jìn)行主成分分析,將提取到的主成分作為第2 種特征參數(shù)。最后將2 種光譜參數(shù)代入ExtraTrees 模型中進(jìn)行訓(xùn)練和預(yù)測(cè),對(duì)比分析兩種光譜參數(shù)結(jié)合模型的預(yù)測(cè)效果,并優(yōu)選出研究區(qū)最佳水稻SPAD 值反演模型。

1 研究區(qū)與研究方法

1. 1 研究區(qū)概況

研究區(qū)(圖1)位于我國(guó)四川省成都市青白江區(qū)姚渡鎮(zhèn)(104°19 ′E,30°42 ′N)水稻產(chǎn)區(qū),總面積71. 72 km2。研究區(qū)屬于亞熱帶溫和濕潤(rùn)氣候,年平均氣溫16. 5 ℃,年平均降水量900 mm,無(wú)霜期平均300 d,年平均日照時(shí)數(shù)1 298. 2 h,光照條件適合水稻等糧食作物的生長(zhǎng)。

1. 2 水稻葉片SPAD 值及光譜測(cè)定

1. 2. 1 試驗(yàn)方案

在試驗(yàn)田中布置了2 個(gè)試驗(yàn)小區(qū),每個(gè)小區(qū)面積為7. 8 m×7. 8 m。試驗(yàn)在試驗(yàn)田布置小區(qū)內(nèi)進(jìn)行,共準(zhǔn)備10 個(gè)40 cm×40 cm 的白色樣方,在樣方的4 個(gè)角分別用紅、黃、藍(lán)和黑色膠帶固定住。在距離試驗(yàn)小區(qū)邊界1 m 的位置,根據(jù)五點(diǎn)采樣法在小區(qū)內(nèi)進(jìn)行樣方擺放,4 邊樣方的間距為5 m,在試驗(yàn)小區(qū)正中央放置1 個(gè)樣方,白板放置在距離2個(gè)小區(qū)位置相同處。

1. 2. 2 SPAD 值測(cè)定

采用手持式葉綠素儀(SPAD 502 Plus,KONICA MINOLTA,Japan)測(cè)定水稻葉片SPAD 值:對(duì)每個(gè)樣本點(diǎn)的水稻頂端完全展開(kāi)的3片健康且形狀大小均勻的葉片,分別測(cè)量距離葉端1/3 和2/3 處2 個(gè)部位的SPAD 值,每個(gè)部位測(cè)量3 個(gè)點(diǎn),測(cè)量時(shí)注意避開(kāi)葉脈部分,取6 個(gè)數(shù)值的平均值作為該葉片的SPAD 值,最后取3 片葉片的SPAD 平均值作為該樣本點(diǎn)葉片的最終SPAD值。數(shù)據(jù)采集時(shí)沿著每個(gè)樣方4 個(gè)角的不同顏色按照固定順序進(jìn)行采集,每個(gè)樣方共采集6 個(gè)水稻樣本點(diǎn),2 個(gè)試驗(yàn)田小區(qū)共采集60 個(gè)樣本點(diǎn)。

1. 2. 3 光譜測(cè)定

使用大疆M600Pro 搭載SENOP RIKOLA 高光譜儀作為本次試驗(yàn)的遙感平臺(tái),高光譜儀參數(shù)如表1 所示。無(wú)人機(jī)高光譜數(shù)據(jù)采集和地面SPAD 值采樣同時(shí)進(jìn)行,每次數(shù)據(jù)采集之前均進(jìn)行白板校正,以保證采集的數(shù)據(jù)質(zhì)量。采集時(shí)間為11∶00-14∶00[28],天氣晴朗,無(wú)風(fēng)干擾。無(wú)人機(jī)拍攝高度為30 m[29],曝光時(shí)間為0. 5 s。

1. 3 數(shù)據(jù)處理

利用SENOP RIKOLA 自帶軟件對(duì)采集的高光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行暗電流校正、波段配準(zhǔn)以及輻射定標(biāo),從而得到原始數(shù)據(jù),再?gòu)闹刑暨x出效果好的影像作為進(jìn)一步研究的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。將選擇的影像導(dǎo)入ENVI 5. 3,在影像范圍內(nèi)均勻地選取60 個(gè)葉片進(jìn)行打點(diǎn),所選取葉片的形態(tài)、長(zhǎng)勢(shì)要能代表整個(gè)研究區(qū)。最后將選取的60 個(gè)葉片點(diǎn)的光譜反射率導(dǎo)出到Excel 2016 中進(jìn)行整理,得到本實(shí)驗(yàn)所研究的60 個(gè)水稻葉片的原始光譜反射率數(shù)據(jù),每個(gè)樣本含有48 個(gè)波段。

本文參考傳統(tǒng)光譜預(yù)處理方法,選用了Savitzky-Golay 平滑(SG)、一階微分變換(DI)、SG平滑與標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變換(SG_SNV)、SG 平滑與多元散射校正(SG_MSC)對(duì)原始光譜進(jìn)行處理。其中,SG 平滑能在一定程度上提高圖譜信噪比,降低隨機(jī)噪音對(duì)光譜的影響;D1 可以消除背景土壤對(duì)水稻葉片反射率觀測(cè)的影響;MSC 和SNV 主要用來(lái)消除由于顆粒分布不均勻或顆粒大小不同而出現(xiàn)的散射對(duì)原始光譜造成的影響[30]。

1. 4 光譜參數(shù)篩選

高光譜影像波段數(shù)量多,含有豐富的光譜信息,可以為不同地物的研究提供良好的基礎(chǔ)。但是,復(fù)雜的波段也會(huì)伴隨著數(shù)據(jù)冗余、含有大量與研究無(wú)關(guān)信息等問(wèn)題,通常采取光譜參數(shù)篩選的方法來(lái)選取與試驗(yàn)相關(guān)的波段進(jìn)行進(jìn)一步的研究。此外,對(duì)于本文的研究對(duì)象,水稻冠層的波段反射率容易被土壤背景、大氣狀況以及作物自身的飽和狀態(tài)所影響,因此需要通過(guò)光譜參數(shù)篩選來(lái)減少這一系列的影響。

1. 4. 1 基于相關(guān)性分析的光譜參數(shù)篩選

相關(guān)性分析是一種評(píng)價(jià)2 個(gè)或多個(gè)存在一定聯(lián)系的指標(biāo)之間相關(guān)程度的方法,用來(lái)衡量這些變量之間相關(guān)程度的指標(biāo)是Pearson 系數(shù)(r)和顯著性值(p)。其中r 的取值范圍在?1 和1 之間,其值越接近?1 或1,表示2 個(gè)變量間相關(guān)程度越高,反之則相關(guān)性程度越低;對(duì)p 而言,plt;0. 1、plt;0. 5和plt;0. 01 分別對(duì)應(yīng)著10% 顯著相關(guān)、5% 顯著相關(guān)和1% 顯著相關(guān),若p 值在0. 05 和0. 1 之間,說(shuō)明2 變量間存在一定的線性關(guān)聯(lián);若p 值在0. 01 和0. 05 之間,說(shuō)明2 變量之間存在顯著的線性關(guān)聯(lián);若p 值小于0. 01,則說(shuō)明2 變量之間存在極顯著的線性關(guān)聯(lián)。

1. 4. 2 基于PCA 降維的光譜參數(shù)篩選

主成分分析(PCA)是由Pearson 于1901 年提出的一種分析、簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)集的方法。PCA 通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行線性變換和壓縮的方式實(shí)現(xiàn)了以較少的主成分保留原數(shù)據(jù)中絕大部分信息的目的,不僅可以有效降低數(shù)據(jù)集的維度,剔除不必要的信息,還能有效消除變量間的共線性問(wèn)題。

1. 5 模型構(gòu)建

Extra Trees(ET)是由Pierre Geurts 等人于2006 年提出的一種集成學(xué)習(xí)方法,通過(guò)一些去相關(guān)化的決策樹(shù)來(lái)進(jìn)行分類,其算法與隨機(jī)森林十分相似,都是由許多決策樹(shù)構(gòu)成。兩者的主要區(qū)別有2 點(diǎn),其一在于隨機(jī)森林應(yīng)用的是Bagging 模型,而ET 使用的是所有的訓(xùn)練樣本來(lái)得到每棵決策樹(shù),也就是每棵決策樹(shù)應(yīng)用的是相同的全部訓(xùn)練樣本,因?yàn)榉至咽请S機(jī)的,所以在某種程度上比隨機(jī)樹(shù)得到的結(jié)果更好[31];其二在于隨機(jī)森林是在一個(gè)隨機(jī)子集內(nèi)得到最佳分叉屬性,而ET 是完全隨機(jī)地得到分叉值,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)決策樹(shù)的分叉。對(duì)于某一棵決策樹(shù)來(lái)說(shuō),由于它的最佳分叉屬性是隨機(jī)選擇的,因此單一決策樹(shù)的預(yù)測(cè)結(jié)果往往是不準(zhǔn)確的,但是很多棵決策樹(shù)組合在一起,就可以達(dá)到很好地預(yù)測(cè)效果。

本試驗(yàn)所應(yīng)用的ET 模型于Python 3 環(huán)境進(jìn)行編譯,訓(xùn)練集和驗(yàn)證集的劃分通過(guò)train_test_splitt()函數(shù)實(shí)現(xiàn),驗(yàn)證集比例設(shè)置為30%,模型的誤差估算采用10 折交叉驗(yàn)證(10-flod Cross Validation),使用Grid-SearchCV()函數(shù)通過(guò)遍歷參數(shù)組合選擇最優(yōu)超參數(shù)進(jìn)而提高模型的預(yù)測(cè)精度和魯棒性。

1. 6 精度評(píng)估

建模精度由訓(xùn)練集決定系數(shù)Rc2、驗(yàn)證集決定系數(shù)Rp2、均方根誤差(RMSE)和相對(duì)分析誤差(RPD)共同決定[32],本文選用R2 和RMSE 作為評(píng)價(jià)指標(biāo)對(duì)Extra Trees 的估算精度進(jìn)行評(píng)估。其中R2 越大,RMSE 越小,意味著模型的綜合能力越好。其中,R2 主要體現(xiàn)模型的擬合效果,RMSE 則反映了模型的穩(wěn)定性。

2 結(jié)果與分析

2. 1 水稻葉片SPAD 值與光譜分析

實(shí)驗(yàn)測(cè)得的60 個(gè)水稻葉片的SPAD 值統(tǒng)計(jì)見(jiàn)表2,概率密度函數(shù)如圖2。研究區(qū)水稻葉片SPAD 值范圍為34. 98~49. 30,其中均值為44. 69,標(biāo)準(zhǔn)差為2. 61,變異系數(shù)為5. 8%,SPAD值樣本可滿足反演的范圍要求[33]。

對(duì)采集到的60 個(gè)樣本點(diǎn)的水稻葉片原始光譜反射率進(jìn)行SG 平滑處理,處理后的光譜曲線如圖3 所示??梢?jiàn),水稻葉片光譜反射率變化基本呈現(xiàn)相同的趨勢(shì)。宏觀上看,反射率在可見(jiàn)光波段(500~780 nm)較低,在近紅外波段(780~900 nm)較高。其中,反射率在綠光波段(550 nm)附近出現(xiàn)1 個(gè)明顯的反射峰值,在藍(lán)光波段(680 nm)附近出現(xiàn)1 個(gè)吸收谷值,在680~750 nm 波段內(nèi),反射率急劇攀升,從而在近紅外波段(780~900 nm)內(nèi)形成了植物光譜所特有的高反射率區(qū)間。總的來(lái)說(shuō),在可見(jiàn)光波段,水稻葉片色素對(duì)于綠光進(jìn)行了反射,對(duì)藍(lán)光和紅光則吸收強(qiáng)烈。

2. 2 光譜參數(shù)篩選

2. 2. 1 基于相關(guān)性分析的光譜參數(shù)篩選

水稻葉片SPAD 值與原始光譜波段(OR)、經(jīng)SG 平滑處理后的光譜波段(SG)以及原始光譜波段的一階微分形式(D1)相關(guān)性如圖4a 所示。宏觀上看,原始光譜與經(jīng)SG 平滑處理后的光譜與SPAD 相關(guān)性都較低,且經(jīng)SG 平滑處理后光譜與SPAD 值相關(guān)性并沒(méi)有得到明顯提高,而原始光譜的一階微分形式與SPAD 值相關(guān)程度有所提高。在663~688、728~736 nm 處,原始光譜與SPAD值呈負(fù)相關(guān),在503~657、696~721、743~900 nm處兩者呈正相關(guān);在672~681、711~729 nm 處,經(jīng)SG 平滑處理后的光譜與SPAD 值呈負(fù)相關(guān),在503~664、687~705、735~900 nm 處兩者呈正相關(guān);在567~704、831~900 nm 處原始光譜的一階微分形式與SPAD 值呈負(fù)相關(guān),最大相關(guān)系數(shù)為0. 308,在503~560、711~824 nm 處兩者呈正相關(guān),最大相關(guān)系數(shù)為0. 319。在以上光譜參數(shù)中,僅D1 中的部分波段與SPAD 值的相關(guān)性達(dá)到顯著性水平。

水稻葉片SPAD 值與經(jīng)SG 平滑處理后的光譜波段、經(jīng)SG_SNV 和SG_MSC 處理后的光譜波段的相關(guān)性如圖4b 所示。從宏觀上來(lái)看,在SG 平滑基礎(chǔ)上進(jìn)行SNV 和MSC 處理后的光譜與SPAD 值的相關(guān)程度與僅經(jīng)SG 平滑處理的光譜相比有所提高,且兩者與SPAD 值的整體相關(guān)程度相似。在503~512、656~793 nm 處,經(jīng)SG_SNV 處理后光譜與SPAD 值呈負(fù)相關(guān),最大相關(guān)系數(shù)為0. 276,在519~649、800~900 nm 處兩者呈正相關(guān),最大相關(guān)系數(shù)為0. 344;在503~512、648~793 nm 處,經(jīng)SG_MSC 處理的光譜與SPAD值呈負(fù)相關(guān),最大相關(guān)系數(shù)為0. 283;在519~635、800~900 nm 處兩者呈正相關(guān),最大相關(guān)系數(shù)為0. 344。在以上光譜參數(shù)中,SG_SNV 和SG_MSC中部分波段與SPAD 值相關(guān)性達(dá)到顯著性水平。

通過(guò)對(duì)原始光譜以及原始光譜的變換形式和SPAD 值的相關(guān)性分析,選取了plt;0. 1 的波段作為特征波段,結(jié)果如表3 所示。從D1 中選取了10個(gè)特征波段,其中達(dá)到10% 顯著水平的波段為544、552、632、776、800 和808 nm,達(dá)到5% 顯著水平的波段為635、649、784 和792 nm;從經(jīng)SG_SNV 處理后的光譜中選取了15 個(gè)特征波段,其中達(dá)到10% 顯著水平的波段為536、544、552、592、680 和840 nm,達(dá)到5% 顯著水平的波段為560、568、576、584、752、760、816 和832 nm,達(dá)到1% 顯著水平的波段為824 nm。從經(jīng)SG_MSC 處理后的光譜中選取了15 個(gè)特征波段,其中達(dá)到10% 顯著水平的波段為544、552、592、680、801 和840 nm,達(dá)到5% 顯著水平的波段為560、568、576、584、752、760 和832 nm,達(dá)到1% 顯著水平的波段為816 和824 nm。

2. 2. 2 基于PCA 降維結(jié)合特征波段的光譜參數(shù)篩選

上述篩選出的特征波段的KMO 檢驗(yàn)結(jié)果均大于0. 7 且通過(guò)了Bartlett 球形檢驗(yàn),利用PCA 算法對(duì)這些特征波段進(jìn)行降維處理。結(jié)果由表4 可見(jiàn),其中,特征_D1 由10 個(gè)波段降維到5 個(gè)主成分,累計(jì)貢獻(xiàn)率為97. 81%;特征_SG_SNV 和特征_SG_MSC 均由15 個(gè)波段降維到5 個(gè)主成分,累計(jì)貢獻(xiàn)率分別為95. 90% 和95. 49%。

2. 3 水稻葉片SPAD 值反演模型建立及檢驗(yàn)

分別將相關(guān)性分析選取的特征波段和對(duì)特征波段進(jìn)行PCA 降維得到的主成分作為自變量(X),水稻葉片SPAD 值作為因變量(Y),采用ExtraTrees 模型進(jìn)行建模并對(duì)比分析,驗(yàn)證基于2 種光譜參數(shù)對(duì)Extra Trees 模型預(yù)測(cè)能力的影響,并優(yōu)選出研究區(qū)SPAD 值的最佳預(yù)測(cè)模型。

采用Extra Trees 模型分別對(duì)特征光譜和主成分進(jìn)行建模,其反演精度見(jiàn)表5 和表6。由表5 和表6 可知,構(gòu)建的2 種類型的特征參數(shù)結(jié)合Extratrees 建模都取得了不錯(cuò)的效果,訓(xùn)練集和驗(yàn)證集的R2均大于0. 75,RMSE 均小于1. 3。在基于特征光譜建模中,最優(yōu)模型是ET_特征_SG_MSC,訓(xùn)練集的R2 為0. 867,RMSE 為1. 057,驗(yàn)證集的R2為0. 782,RMSE 為0. 73;在基于主成分建模中,最優(yōu)模型為ET_PCA_特征_SG_MSC,訓(xùn)練集的R2為0. 85,RMSE 為1. 03,驗(yàn)證集的R2 為0. 825,RMSE 為0. 984。

對(duì)比2 種類型光譜參數(shù)的建模效果,結(jié)果如圖5 所示,在特征參數(shù)基礎(chǔ)上進(jìn)行PCA 降維進(jìn)一步降低了光譜參數(shù)的維度,建模效果相對(duì)于直接用特征參數(shù)進(jìn)行建模均有所提高。其中,ET_D1 和ET_SG_MSC 的R2 分別由0. 769 和0. 782 增加到0. 793 和0. 825,提升幅度為3% 和5. 5%;ET_SG_SNV 的R2 由 0. 754 增加到0. 796,提升幅度為5. 6%。

3 討論

植物葉片的營(yíng)養(yǎng)狀況和內(nèi)部的生理生化參數(shù)與其自身的光譜特征密切相關(guān),水稻葉片的光譜反射率會(huì)隨著SPAD 值的不同而呈現(xiàn)出不同的光譜響應(yīng)曲線[26]。在可見(jiàn)光波段,綠色植物的反射光譜主要受葉片色素的影響,吸收作用占主導(dǎo),反射率較低,因此會(huì)出現(xiàn)葉綠素含量越高光譜反射率反而越低的現(xiàn)象;近紅外波段的反射光譜主要受植被結(jié)構(gòu),背景和含水量的影響,與SPAD 值的相關(guān)性較低。因此本文試驗(yàn)所采集的光譜數(shù)據(jù)主要包含可見(jiàn)光波段。

高光譜數(shù)據(jù)含有豐富信息,但原始光譜易受環(huán)境、背景及噪聲的影響,不可避免會(huì)伴隨一些與研究參量不相關(guān)的信息,影響建模精度。基于此,本文選用了SG 平滑、一階微分變換(DI)、SG 平滑與標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變換(SG_SNV)、SG 平滑與多元散射校正(SG_MSC)對(duì)原始光譜進(jìn)行處理,并將處理后的光譜與SPAD 值做相關(guān)性分析,將得到的特征波段作為第1 種光譜參數(shù);由于高光譜數(shù)據(jù)維度較大,經(jīng)過(guò)1 次光譜參數(shù)篩選后的特征參數(shù)仍可能伴隨著數(shù)據(jù)冗余、無(wú)關(guān)信息干擾等問(wèn)題,而PCA 可以通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行線性變換和壓縮的方式實(shí)現(xiàn)以較少的主成分保留原數(shù)據(jù)中絕大部分信息的目的,姚付啟等[25]、孫小香等[26]、劉文雅等[27]利用PCA 對(duì)原始光譜進(jìn)行降維,并建模估算了葉綠素含量,都取得了較好的結(jié)果。因此在前人的研究基礎(chǔ)上,本文在第1 種光譜參數(shù)的基礎(chǔ)上嘗試?yán)肞CA 算法進(jìn)行降維,將得到的主成分作為第2 種特征參數(shù)。對(duì)比2 種參數(shù)的建模效果,發(fā)現(xiàn)在特征波段基礎(chǔ)上進(jìn)行PCA 降維后建模效果更優(yōu),這與尚天浩等[34]利用高光譜估算土壤有機(jī)質(zhì)的研究結(jié)果一致。因此,當(dāng)使用單一方法對(duì)光譜篩選后建模效果不佳時(shí),可以嘗試組合多種篩選方法,這可以為后續(xù)相關(guān)研究提供參考。

4 結(jié)論

本文以四川省成都市青白江區(qū)姚渡鎮(zhèn)水稻產(chǎn)區(qū)的水稻為研究對(duì)象,通過(guò)3 種預(yù)處理方法對(duì)水稻葉片原始光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,并通過(guò)相關(guān)系數(shù)篩選出特征波段作為第1 類光譜參數(shù),在第1 類光譜參數(shù)基礎(chǔ)上進(jìn)行PCA 降維得到第2 類光譜參數(shù)。分別將2 類光譜參數(shù)代入Extra Trees 模型中進(jìn)行SPAD 值的反演,可得出以下結(jié)論:

(1)2 類光譜參數(shù)建立的模型都得到了較好的結(jié)果,決定系數(shù)均大于0. 75,均方根誤差均小于1. 3??蔀檠芯繀^(qū)水稻葉片SPAD 值的預(yù)測(cè)提供有效參考。其中模型ET_PCA_特征_SG_MSC 精度最高,R2 和RMSE 分別為0. 825 和0. 984,是研究區(qū)水稻SPAD 值的最佳反演模型。

(2)2 種光譜參數(shù)所建立的模型中,精度最高的都是以SG_MSC 預(yù)處理為前提篩選出的特征波段和主成分作為輸入變量的。說(shuō)明這種預(yù)處理組合方式有效消除了研究區(qū)水稻原始光譜中的噪音和散射,為后續(xù)的研究提供了良好的基礎(chǔ)。

(3)在特征波段基礎(chǔ)上進(jìn)行PCA 降維,所建立的模型精度均有所提高,提高幅度最大的模型是ET_特征_SG_SNV,R2 由0. 754 增加道0. 796,提升幅度為5. 6%。說(shuō)明這種方式不僅能有效降低參數(shù)維度、減少冗余信息,還保留了特征波段中的重要信息。

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(編輯:韓志強(qiáng))

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