林恒屹,馮仁海,尹彬彬,王柏森
由于解剖結(jié)構(gòu)復(fù)雜而精細(xì),膝關(guān)節(jié)是最容易受到嚴(yán)重?fù)p傷的身體部位之一。膝關(guān)節(jié)病變發(fā)病率高且具有致殘、致畸的風(fēng)險(xiǎn),嚴(yán)重影響患者生活質(zhì)量,并給社會(huì)、經(jīng)濟(jì)帶來巨大負(fù)擔(dān)。精準(zhǔn)判斷膝骨關(guān)節(jié)疾病進(jìn)程及狀態(tài),可有助于提供精準(zhǔn)化、階梯化、個(gè)性化的治療方案。目前,磁共振成像(MRI)是評(píng)估和診斷此類疾病的標(biāo)準(zhǔn)臨床方法。通過對(duì)關(guān)節(jié)軟骨、骨、滑膜、半月板等結(jié)構(gòu)的定量分析,可以了解關(guān)節(jié)的形態(tài)學(xué)和結(jié)構(gòu)學(xué)變化,如軟骨退化、半月板損傷等,并評(píng)估疾病的嚴(yán)重程度。隨著計(jì)算機(jī)算力、算法等軟硬件水平的提升,以及醫(yī)學(xué)影像、生物樣本大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來,人工智能在影像學(xué)組的應(yīng)用特別是深度學(xué)習(xí)方法,已經(jīng)在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域取得了顯著成果[1]。人工智能技術(shù)為開展膝關(guān)節(jié)影像智能研究和膝骨關(guān)節(jié)炎智能評(píng)估提供了新思路,通過深度學(xué)習(xí)來改善圖像質(zhì)量用以輔助診斷也有許多研究。
1.1 影像組學(xué)概念 Lembin 等[2]在2012 年首次提出了影像組學(xué)(Radiomics)的概念。影像組學(xué)是一種利用醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)進(jìn)行定量分析和模式識(shí)別的研究領(lǐng)域,它通過提取和分析醫(yī)學(xué)影像中的特征,結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)和統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,來研究和預(yù)測(cè)疾病的發(fā)展、治療效果和預(yù)后等方面的信息。影像組學(xué)可以幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地診斷疾病、評(píng)估疾病的嚴(yán)重程度和預(yù)測(cè)患者的治療反應(yīng),為個(gè)體化醫(yī)療提供支持。
1.2 機(jī)器學(xué)習(xí)概念 機(jī)器學(xué)習(xí)是一種人工智能的分支領(lǐng)域,人工智能(artificial intelligence)是在1956年達(dá)特茅斯會(huì)議上麥卡錫首先提出的,它是研究、開發(fā)用于模擬、延伸和擴(kuò)展人的智能的理論、方法、技術(shù)及應(yīng)用系統(tǒng)的一門新的技術(shù)科學(xué)。機(jī)器學(xué)習(xí)通過讓計(jì)算機(jī)從數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)和提取模式,從而實(shí)現(xiàn)自主學(xué)習(xí)和預(yù)測(cè)能力的方法。它通過構(gòu)建和訓(xùn)練模型,使計(jì)算機(jī)能夠自動(dòng)識(shí)別和理解數(shù)據(jù)中的模式和規(guī)律,并根據(jù)這些模式和規(guī)律做出決策或預(yù)測(cè)。機(jī)器學(xué)習(xí)廣泛應(yīng)用于各個(gè)領(lǐng)域,如圖像識(shí)別、語音識(shí)別、自然語言處理、推薦系統(tǒng)等,為人們提供了更智能、高效的解決方案。機(jī)器學(xué)習(xí)也并不是足夠智能的,因?yàn)檫@個(gè)過程需要人類提供特征。
1.3 深度學(xué)習(xí)概念 深度學(xué)習(xí)是機(jī)器學(xué)習(xí)中的一個(gè)分支方法,避免了傳統(tǒng)方法中需要人工提取特征的問題,不需要區(qū)域標(biāo)注,通常定位也能夠勝任。通過在訓(xùn)練過程中同時(shí)進(jìn)行特征提取、選擇和最終分類,從無數(shù)可能的規(guī)律中總結(jié)最顯著、最合適的特征完成預(yù)測(cè)。
1.4 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural network,CNN) CNN 是一種深度學(xué)習(xí)模型,主要用于處理和分析具有網(wǎng)格結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù),是目前使用最多的深度學(xué)習(xí)算法之一,在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域的應(yīng)用也越來越廣泛。它通過使用卷積層、池化層和全連接層等組件來提取和學(xué)習(xí)圖像中的特征,通過共用卷積核和上下采樣等技術(shù),大幅降低整個(gè)網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)量,提高網(wǎng)絡(luò)的性能和效率[3]。
近年對(duì)深度學(xué)習(xí)在影像組學(xué)領(lǐng)域的研究也在不斷增多,其中MRI 圖像診斷的研究取得了一系列重要的進(jìn)展。本文通過對(duì)美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)開發(fā)的數(shù)據(jù)庫Pubmed 平臺(tái)2021—2023 論文進(jìn)行收集→篩選出MRI 與深度學(xué)習(xí)相關(guān)文獻(xiàn)→選擇其中針對(duì)膝關(guān)節(jié)的研究文獻(xiàn)→剔除部分綜述性文獻(xiàn)。通過對(duì)這些論文的歸納,可以大致了解深度學(xué)習(xí)在膝關(guān)節(jié)MRI 影像最新的研究方向。研究方向大致分為以下幾個(gè)方面。
2.1 基于MRI 圖像的組織智能分割研究 此類研究旨在開發(fā)出能夠準(zhǔn)確、快速地將MRI 圖像中的不同組織結(jié)構(gòu)進(jìn)行分割的算法,以提高醫(yī)學(xué)影像診斷的準(zhǔn)確性和效率。通過使用深度學(xué)習(xí)技術(shù),研究人員可以訓(xùn)練模型來學(xué)習(xí)MRI 圖像中不同組織的特征,并自動(dòng)進(jìn)行分割,膝關(guān)節(jié)的研究主要包括軟骨組織、骨組織、半月板韌帶等結(jié)構(gòu)區(qū)分。Hong 等[4]通過采用多個(gè)卷積層和全連接層結(jié)構(gòu)的多路徑CNN 構(gòu)建人工智能圖像輔助模型,用于膝關(guān)節(jié)韌帶和股神經(jīng)進(jìn)行準(zhǔn)確的分割圖像重建,ROC 曲線下的面積(AUC)為0.838,敏感性為0.800,特異性為0.836。
Si 等[5]、Szoldán 等[6]、Zhang 等[7]、Chadoulos 等[8]分別基于U-Net深度學(xué)習(xí)模型、深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、半監(jiān)督學(xué)習(xí)(SSL)框架下兩階段多圖譜方法等人工智能模型,進(jìn)行MRI 圖像中膝關(guān)節(jié)軟骨的分割,在戴斯相似性系數(shù)(dice similarity coefficient,DSC)、AUC 等評(píng)價(jià)指標(biāo)上取得不錯(cuò)的成績(jī)。更進(jìn)一步的研究中,Khan等[9]首次嘗試在完全自動(dòng)的情況下,使用多路徑CNN 和摳圖(image matting)算法來建模膝關(guān)節(jié)MRI的語義分割,通過低秩張量分解和重構(gòu)、自動(dòng)靜態(tài)圖像摳圖(trimap)算法和alpha 摳圖算法等技術(shù),解決CNN 模型缺乏圖像特定的適應(yīng)性(如組織對(duì)比度低和結(jié)構(gòu)不均勻性)問題,在邊界和形狀一致性方面取得了更好的成效。
2.2 基于MRI 圖像的圖像智能降噪及掃描序列優(yōu)化 傳統(tǒng)的掃描序列可能需要較長(zhǎng)的時(shí)間來獲取高質(zhì)量的圖像。通過使用人工智能技術(shù),在圖像后處理過程中人工智能技術(shù)可以通過圖像重建和降噪算法來提高圖像質(zhì)量;也可以優(yōu)化掃描序列的參數(shù)設(shè)置,從而提高掃描效率,減少掃描時(shí)間,減少運(yùn)動(dòng)偽影的發(fā)生。Fayad 等[10]使用修改后的基于CNN 的U-Net 來創(chuàng)建合成的脂肪抑制磁共振圖像(AFSMRI),從單個(gè)非脂肪抑制的PD序列創(chuàng)建合成的脂肪抑制MR 圖像。AFSMRI 與傳統(tǒng)的3D MR 序列相比,在評(píng)估膝關(guān)節(jié)常見異常的診斷性能方面具有相似的檢測(cè)率,但該序列掃描時(shí)間減少54.5%。Kaniewska 等[11]運(yùn)用螺旋槳采集技術(shù)(PROPELLER)與卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)重建的結(jié)合序列進(jìn)行膝關(guān)節(jié)成像,該序列可以同時(shí)減少運(yùn)動(dòng)偽影、圖像噪聲和掃描時(shí)間,該序列能夠?qū)?biāo)準(zhǔn)序列的平均采集時(shí)間減少60%,在評(píng)估膝關(guān)節(jié)病理方面表現(xiàn)出優(yōu)勢(shì),特別是對(duì)于評(píng)估髕骨軟骨的缺陷和軟骨剝離,在骨、脂肪和肌肉的信噪比和對(duì)比噪聲比方面也表現(xiàn)出顯著優(yōu)勢(shì)。Wang等[12]、Kim 等[13]分別運(yùn)用人工智能輔助壓縮感知(artificial intelligence assisted compressed sensing,ACS)技術(shù)對(duì)膝關(guān)節(jié)MRI 成像進(jìn)行優(yōu)化,利用深度學(xué)習(xí)增強(qiáng)和傳統(tǒng)重建技術(shù),研究并行成像(parallel imaging,PI)和同步多切片(SMS)加速成像的各種組合。兩個(gè)團(tuán)隊(duì)的研究結(jié)果都證明了新型的ACS 協(xié)議在圖像質(zhì)量上都表現(xiàn)出優(yōu)越性,并且在減少一半的采集時(shí)間的同時(shí)(Wang 等縮短56%,Kim 等縮短47%),能夠?qū)崿F(xiàn)與結(jié)構(gòu)異常的等效檢測(cè)。Iuga 等[14]以標(biāo)準(zhǔn)脂肪飽和2D質(zhì)子密度(proton density,PD)序列為基礎(chǔ),結(jié)合壓縮感知(compressed sensing,CS)和基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)算法(CS-AI)的新型算法來加速膝關(guān)節(jié)的二維診斷MRI 成像。研究結(jié)果顯示,CS-AI 加速的圖像在定性和定量方面都表現(xiàn)出優(yōu)越的成像質(zhì)量。Akai 等[15]同樣進(jìn)行人工智能-輔助壓縮感知研究,團(tuán)隊(duì)使用了壓縮感知與并行成像技術(shù),在相位編碼中使用隨機(jī)欠采樣,然后使用小波變換實(shí)現(xiàn)壓縮感知以去除偽影。經(jīng)過深度學(xué)習(xí)重建(deep learning reconstruction,DLR)優(yōu)化后,掃描時(shí)間為100 s的優(yōu)化圖像在噪聲、韌帶和半月板的可視化以及整體圖像質(zhì)量方面均優(yōu)于掃描時(shí)間390s的優(yōu)化前圖像。
2.3 基于膝關(guān)節(jié)MRI 圖像的疾病輔助診斷研究 通過對(duì)膝關(guān)節(jié)MRI 圖像的分析和解讀,可以幫助醫(yī)生確定膝關(guān)節(jié)的病變類型、程度和位置,從而指導(dǎo)臨床治療和手術(shù)決策。研究涉及多種膝關(guān)節(jié)疾病,如半月板損傷、韌帶損傷、滑膜炎等。通過對(duì)膝關(guān)節(jié)MRI圖像的定量和定性分析,可以評(píng)估病變的程度、范圍和嚴(yán)重程度,為醫(yī)生提供更準(zhǔn)確的診斷和治療建議。Awan 等[16]使用ResNet-14 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,并結(jié)合實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)增強(qiáng)技術(shù),用于三類ACL 病變(健康、部分破裂和完全破裂)的檢測(cè),研究者采用混合類別平衡和實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)增強(qiáng)的策略來解決MRI 數(shù)據(jù)稀缺和類別不平衡的問題。根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,通過敏感性、特異性、精確度、召回率、F1 值、接收器操作特征曲線(ROC)和AUC等指標(biāo)廣泛驗(yàn)證,平均準(zhǔn)確率、敏感性和精確度分別達(dá)到92%、91%和91%。Dunnhofer 等[17]利用MRP Net 進(jìn)行膝關(guān)節(jié)MRI 成像輔助診斷,該模組由金字塔細(xì)節(jié)池的特征金字塔網(wǎng)絡(luò)組成,其優(yōu)點(diǎn)是可插入任何現(xiàn)有的基于CNN的診斷管道。通過插入不同模塊如增強(qiáng)CNN 的中間特征和詳細(xì)信息捕捉等進(jìn)行效果驗(yàn)證,在ACL撕裂和半月板撕裂的診斷方面都具有較高的準(zhǔn)確性和敏感性,AUC 在0.87 ~0.97。它能夠更好地捕捉與這些損傷相關(guān)的特征,從而提高診斷的準(zhǔn)確性。Zheng 等[18]運(yùn)用基于低秩分解去噪的多模態(tài)MRI 成像算法,在診斷膝關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎和軟骨病變方面的敏感性、特異性、準(zhǔn)確性均較高,均超過0.85,一致性稍低(0.73)。Cui 等[19]使用深度學(xué)習(xí)算法在便攜設(shè)備上自動(dòng)評(píng)估膝關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎的嚴(yán)重程度,為便攜設(shè)備上的自動(dòng)化評(píng)估提供了新的可能性。Zhuang 等[20]設(shè)計(jì)了一個(gè)聯(lián)合進(jìn)行圖卷積和圖卷積的CSNet 模型,用于評(píng)估軟骨缺陷。CSNet 包含多個(gè)模型,如利用2D U-Net模型來提取局部外觀特征,SubdivNet 模型用于處理三角網(wǎng)格中的3D形狀,SDU-Net模型用于處理球面網(wǎng)格中的皮層表面等。相比于其他方法,CSNet 模型考慮了軟骨的曲面形狀和相鄰軟骨之間的缺陷相關(guān)性,因此在性能上表現(xiàn)更好。CSNet 的準(zhǔn)確率(ACC)為87.4%,召回率(REC)為79.5%,AUC 為94.7%。
2.4 基于膝關(guān)節(jié)MRI 圖像的疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)研究此類研究的相關(guān)文獻(xiàn)較少,主要包括運(yùn)動(dòng)量、體質(zhì)量控制、飲食習(xí)慣等因素的研究,或者探索早期干預(yù)和預(yù)防策略,預(yù)測(cè)膝關(guān)節(jié)疾病發(fā)展風(fēng)險(xiǎn)以延緩或預(yù)防膝關(guān)節(jié)疾病。Jamshidi 等[21]分別采取DeepSurv 模型、線性多任務(wù)邏輯回歸(MTLR)模型、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)MTLR模型等分析MRI圖像中的特征,如骨髓病變(BMLs)、骨髓水腫等,預(yù)測(cè)膝關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎(OA)是否需要全膝關(guān)節(jié)置換手術(shù)(TKR)以及何時(shí)需要進(jìn)行手術(shù),根據(jù)個(gè)性化治療建議為醫(yī)師提供指導(dǎo)。Ramkumar 等[22]運(yùn)用邏輯回歸、高斯樸素貝葉斯等機(jī)器學(xué)習(xí)模型來分析預(yù)測(cè)術(shù)前影像、術(shù)前患者報(bào)告的結(jié)果測(cè)量和患者人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征與術(shù)后2 年臨床意義差異和顯著臨床益處之間的關(guān)系,以評(píng)估膝關(guān)節(jié)軟骨缺損患者進(jìn)行骨軟骨移植術(shù)后的功能和生活質(zhì)量。這些模型在預(yù)測(cè)術(shù)后結(jié)果方面表現(xiàn)良好,其AUC 在0.60 ~0.91。Zech等[23]基于DenseNet121 深度學(xué)習(xí)模型,從膝關(guān)節(jié)MRI成像中自動(dòng)推斷小兒膝關(guān)節(jié)骨骼成熟度。
通過深度學(xué)習(xí)膝關(guān)節(jié)MRI 圖像完成圖像分類、目標(biāo)檢測(cè)、圖像分割、加速數(shù)據(jù)采集等任務(wù)已經(jīng)取得初步效果,各項(xiàng)評(píng)價(jià)指標(biāo)數(shù)據(jù)向好,但是仍然存在許多困難。(1)數(shù)據(jù)量不足,由于數(shù)據(jù)的獲取和標(biāo)注成本較高,很難獲得足夠的多樣化和代表性的數(shù)據(jù)集,一些模型研究樣本數(shù)量較少。數(shù)據(jù)可能出現(xiàn)模型過擬合,在訓(xùn)練集上表現(xiàn)良好但在測(cè)試集上表現(xiàn)較差。同時(shí)深度學(xué)習(xí)模型需要實(shí)時(shí)獲取最新的數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練和推理,最好能夠接入醫(yī)院系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)更新訓(xùn)練。(2)模型泛化能力不足:膝關(guān)節(jié)MRI 圖像具有較大的變化和復(fù)雜性,例如不同掃描序列、不同病變類型和不同解剖結(jié)構(gòu)等。在面對(duì)新的、未見過的數(shù)據(jù)時(shí),可能會(huì)出現(xiàn)泛化能力不足的問題,導(dǎo)致模型在實(shí)際應(yīng)用中的性能下降。(3)數(shù)據(jù)標(biāo)注準(zhǔn)確性缺乏標(biāo)準(zhǔn)。膝關(guān)節(jié)MRI 圖像的標(biāo)注通常需要專業(yè)醫(yī)生的知識(shí)和經(jīng)驗(yàn),而且標(biāo)注過程相對(duì)耗時(shí)和繁瑣。人工標(biāo)注就會(huì)存在主觀性和標(biāo)注誤差的存在,而且大量的圖片采取人工標(biāo)注將耗費(fèi)大量人力。未來研究也將針對(duì)智能分割區(qū)域、圖像智能降噪和掃描序列優(yōu)化、疾病輔助診斷等方向發(fā)展。通過數(shù)據(jù)增強(qiáng)、遷移學(xué)習(xí)、對(duì)抗訓(xùn)練、模型集成、強(qiáng)化學(xué)習(xí)、解釋模型的決策過程和關(guān)鍵特征方面探索更多的深度學(xué)習(xí)模型和算法,追求數(shù)據(jù)的即時(shí)性,加強(qiáng)人工智能圖像的魯棒性,讓模型更具有普適性,從而提高診斷的準(zhǔn)確性和效率。
利益沖突 所有作者聲明無利益沖突