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含單蝶狀[2Fe2S]骨架的新型[FeFe]氫化酶模型物{(μ-FcS)(μ-SMe)Fe2(CO)6}的合成及其晶體結(jié)構(gòu)

2011-11-23 01:32劉金庭
合成化學(xué) 2011年6期
關(guān)鍵詞:二茂鐵晶胞氫化

張 磊, 劉金庭

(1. 浙江師范大學(xué) 化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,浙江 金華 321004;2. 山東大學(xué) 化學(xué)與化工學(xué)院,山東 濟(jì)南 250100)

[FeFe]氫化酶是一種能高效催化質(zhì)子還原為氫氣及其可逆反應(yīng)的生物酶。對(duì)[FeFe]氫化酶的仿生化學(xué)研究不僅具有重要的理論意義,而且對(duì)緩解日益嚴(yán)重的環(huán)境污染和能源危機(jī)具有廣闊的應(yīng)用前景[1]。目前對(duì)[FeFe]氫化酶的化學(xué)模擬主要集中在活性中心的催化部位:[2Fe2S]蝶狀子簇的結(jié)構(gòu)上[2,3]。由于二茂鐵(FcH)具有穩(wěn)定、無毒、易衍生化及良好的氧化還原性質(zhì),自上個(gè)世紀(jì)50年代被發(fā)現(xiàn)以來,在生物傳感器、粒子信道、合成藥物等方面都有廣泛的應(yīng)用[4],因此FcH必然會(huì)對(duì)[2Fe2S]活性中心產(chǎn)生一定的影響。但到目前為止,只有宋禮成課題[5,6]組報(bào)道了一種含二茂鐵的[FeFe]氫化酶活性中心模擬物:[Fe2(μ-SCH2OCH2S-μ)(CO)5]2[(η5-Ph2PC5H4)2Fe][5,6],但它是通過二茂鐵二苯基膦的形式與活性中心Fe原子配位而形成的化合物,而FcH直接以共鍵價(jià)的形式與[FeFe]氫化酶活性中心[2Fe2S]子簇連接的化合物至今未見報(bào)道。

Scheme 1

本文報(bào)道二茂鐵基溴化鎂(FcMgBr)與(μ-S2)Fe2(CO)6及MeI反應(yīng),合成了一種新型含二茂鐵基[FeFe]氫化酶活性中心模型化合物——(μ-FcS)(μ-SMe)Fe2(CO)6(1, Scheme 1),其結(jié)構(gòu)經(jīng)1H NMR, IR,元素分析和X-射線單晶衍射表征。

1 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 儀器與試劑

XT-4型顯微熔點(diǎn)儀(溫度未經(jīng)校正);Bruker 400型核磁共振儀(CD3Cl為溶劑,TMS為內(nèi)標(biāo));島津FT-IR8101型紅外光譜儀(KBr壓片); Elementar Vario EL型元素分析儀; Bruker Smart Apex CCD型X-射線單晶衍射儀。

(μ-S2)Fe2(CO)6[7]和單溴代二茂鐵(FcBr)[8]按文獻(xiàn)方法合成;其余所用試劑均為分析純。

1.2 1的合成

氮?dú)獗Wo(hù)下,在反應(yīng)瓶中加入鎂屑187.6 mg(7.82 mmol)和干燥THF 3 mL,攪拌下滴入1滴引發(fā)劑MeI;滴加FcBr 582 mg(2.22 mmol)的THF(5 mL)溶液,滴畢,于38 ℃~42 ℃反應(yīng)3.5 h得二茂鐵基溴化鎂(FcMgBr),冷卻備用。

氮?dú)獗Wo(hù),在單口瓶中加入(μ-S2)Fe2(CO)6750 mg(2.182 5 mmol)和干燥THF 50 mL,攪拌下于-78 ℃慢慢加入FcMgBr;加入MeI 0.15 mL(2.182 5 mmol),于-78 ℃反應(yīng)1 h。自然升至室溫,反應(yīng)10 h。抽濾,濃縮濾液,剩余物經(jīng)硅膠柱色譜[洗脫劑:V(石油醚) ∶V(二氯甲烷)=1 ∶1]純化得深紅色固體1 543 mg,產(chǎn)率45.8%, m.p.85 ℃;1HNMRδ: 2.08(s, 3H, CH3), 4.14(s, 2H, Fc-Hβ), 4.18(br s, 5H, C5H5), 4.22(s, 2H, Fc-Hα); IRν: 1 965, 1 974, 1 982, 2 032, 2 005, 2 072 cm-1; Anal.calcd for C17H12O6S2Fe3: C 37.54, H 2.22, S 11.79; found C 37.58, H 2.11, S 12.02; MSm/z: 544.2[M+]。

1.3 晶體結(jié)構(gòu)測(cè)定

將固體1用二氯甲烷/正己烷(1/1)溶解,于-10 ℃緩慢揮發(fā)得單晶1。取單晶1(0.56 mm×0.35 mm×0.25 mm)置衍射儀上,室溫下采用石墨單色化的Mo-Kα射線(λ=0.710 73 ?),以ω-2θ掃描方式,在1.94°<θ<25.03°, -10≤h≤15, -13≤k≤11, -32≤l≤32衍射區(qū),共收集到獨(dú)立衍射點(diǎn)15 996個(gè),使用其中的I>2σ(I)的衍射點(diǎn)。數(shù)據(jù)收集程序采用Siemens公司SAINT程序,強(qiáng)度數(shù)據(jù)經(jīng)LP因子校正和SADABS經(jīng)驗(yàn)吸收校正。晶體結(jié)構(gòu)通過直接法解出,對(duì)全部的非氫原子的坐標(biāo)及各向異性熱參數(shù)和氫原子坐標(biāo)通過SHELXTL97程序進(jìn)行全矩陣最小二乘法修正。最終的一致性因子為R1=0.059 7,wR2=0.136 7,加權(quán)采用等權(quán)重方案,在最終傅立葉圖上最大和最小的電子密度為1.676 e·?-3和-0.469 e·?-3。

2 結(jié)果與討論

本文首先利用(μ-S2)Fe2(CO)6與FcMgBr反應(yīng),生成活潑絡(luò)合陰離子(μ-FcS)(μ-S-)Fe2(CO)6,然后使之與MeI作用,生成了一個(gè)新型含二茂鐵基[FeFe]氫化酶活性中心模型化合物1。 IR譜圖上2 072 cm-1~1 960 cm-1的6個(gè)特征峰為與中心鐵原子相連的6個(gè)末端羰基的伸縮振動(dòng)吸收峰。

為了進(jìn)一步確定1的結(jié)構(gòu),測(cè)定其單晶結(jié)構(gòu)。圖1和圖2分別為1的分子結(jié)構(gòu)和晶胞堆積圖;表1和表2分別為1的部分鍵角和鍵長(zhǎng)。從圖1中可以看出,1的中心結(jié)構(gòu)與已報(bào)道的雙鐵雙硫配合物結(jié)構(gòu)相似,呈蝶狀構(gòu)型;每個(gè)鐵原子除與兩個(gè)橋S原子配位外,還同三個(gè)末端CO配位,每個(gè)Fe原子均為扭曲的四方錐配位幾何;Fc-的兩個(gè)茂環(huán)在空間結(jié)構(gòu)上有重疊式和交錯(cuò)式兩種構(gòu)象所以產(chǎn)生了兩種單晶構(gòu)型;Fc與S(1)原子以a鍵相連,而甲基與S(2)原子以e鍵相連。 Fe-Fe鍵的鍵長(zhǎng)為2.488 4(17) ?,這比已報(bào)道的[FeFe]氫化酶活性中心的Fe-Fe鍵的鍵長(zhǎng)要短,如(μ-SC2H5)2Fe2(CO)6(2.537 ?)[9], Fe2(μ-SCH2OCH2S-μ)(CO)6(2.511 3(13) ?)[6], [(μ-SCH2)2N(4-NO2C6H4)]Fe2(CO)6(2.499 8(10) ?)[10],這可能是由于FcH良好的供電子性能和獨(dú)特的氧化還原特性使Fe-Fe鍵之間的電子云密度增大所致。

表1 1的部分鍵角Table 1 Selected bond angles of 1

圖1 1的分子結(jié)構(gòu)圖Figure 1 Molecular structure of 1

圖2 1的晶胞堆集圖Figure 2 Packing drawing of 1

1屬于斜方晶系,Pna2(1)空間群,晶胞參數(shù)a=12.707(2) ?,b=11.355(2) ?,c=27.621(5) ?,V=3 985.1(12) ?3,Z=8,Dc=1.813 g·cm-3,μ=2.395 mm-1,F(000)=2 176,R1=0.0597,wR2=0.1367。一個(gè)晶胞中含有4個(gè)分子。從圖2可以看出分子排列有序,分子取向相同且分子主體相互平行。

表2 1的部分鍵長(zhǎng)Table 2 Selected bond lengths of 1

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