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蛋白質(zhì)組學(xué)教學(xué)中的一些思考

2011-12-29 00:00:00劉清梅
考試周刊 2011年61期


  摘 要: 蛋白質(zhì)組學(xué)是一門新興的交叉性學(xué)科,在醫(yī)學(xué)和生物學(xué)各領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用。本文結(jié)合師范類院校學(xué)生的培養(yǎng)特點(diǎn),對(duì)該課程的教學(xué)目標(biāo)和教學(xué)內(nèi)容進(jìn)行了深入分析,并著重提出了相關(guān)的教改措施,包括以多媒體授課方式為主,強(qiáng)調(diào)學(xué)生動(dòng)手實(shí)驗(yàn)操作與教師錄像演示方法相結(jié)合,教學(xué)雙邊活動(dòng)的有效組織與考試形式的改進(jìn)等方面。以期學(xué)生能夠從整體上掌握這門課程,熟悉相關(guān)科學(xué)前沿,拓寬視野,最終提高自己的教育教學(xué)水平,促進(jìn)自身和職業(yè)的發(fā)展。
  關(guān)鍵詞: 蛋白質(zhì)組學(xué) 教學(xué)改革 多媒體教學(xué)
  
  自1995年基因組計(jì)劃的大規(guī)模開(kāi)展以來(lái),我們得到了前所未有的海量遺傳信息。但是,對(duì)這些遺傳信息如何進(jìn)行解讀,包括:基因的識(shí)別,基因時(shí)間、空間表達(dá)特異性的調(diào)控,多個(gè)基因產(chǎn)物之間的相互關(guān)系,等等,都需要通過(guò)研究具體的生物功能的體現(xiàn)者和執(zhí)行者——蛋白質(zhì),才能最終揭示生命活動(dòng)的真諦。正因?yàn)槿绱?,蛋白質(zhì)組學(xué)(Protemics)研究成為后基因組學(xué)(post-genomics)即功能基因組學(xué)(functional genomics)中的中流砥柱。Nature和Science雜志也在2001年2月公布人類基因組草圖的同時(shí),分別發(fā)表了“And now for the proteome”與“Protemics in genomeland”的綜述,將蛋白質(zhì)組學(xué)的研究提到了前所未有的高度。陜西師大生命科學(xué)學(xué)院積極設(shè)立蛋白質(zhì)組學(xué)這門課程,并將它設(shè)置為生物技術(shù)專業(yè)的限選課及生物科學(xué)和理科基地專業(yè)的專業(yè)任選課。
  蛋白質(zhì)組學(xué)(Protemics)是一門交叉型的新型學(xué)科,涉及生物化學(xué)、分子生物學(xué)、基因?qū)W、細(xì)胞學(xué)及生物信息學(xué)等多種學(xué)科的知識(shí)點(diǎn)。同時(shí)它又是一門理論與實(shí)踐緊密結(jié)合的課程,涉及較多的新型實(shí)驗(yàn)原理與方法,比較抽象,相對(duì)較難理解。綜合考慮之后,學(xué)院將該課程的授課時(shí)間設(shè)置為大三學(xué)年的第二學(xué)期,一方面學(xué)生已經(jīng)學(xué)習(xí)了各種基礎(chǔ)專業(yè)課程,具備了一定的知識(shí)儲(chǔ)備,另一方面經(jīng)過(guò)多種學(xué)科配備的實(shí)驗(yàn)課程學(xué)習(xí),學(xué)生具備了一定的實(shí)驗(yàn)操作技能及科學(xué)思考方法。
  師大設(shè)置該課程已經(jīng)有近6年的歷史了,通過(guò)這幾年的課程教學(xué),我在該課程的教改方面也進(jìn)行了思索,有了一些心得體會(huì)。我在此拋磚引玉,與廣大同仁共同探討。
  一、蛋白質(zhì)組學(xué)的教學(xué)目標(biāo)
  蛋白質(zhì)組學(xué)一詞由澳大利亞科學(xué)家Marc Wilkins于1994年在意大利Siena的一次二維電泳會(huì)議He1XY3nL5X6hOxdwujeSoowsqRMHMZSFqmKlEt50jgw=上首次提出。1997年之后,各國(guó)科學(xué)家慢慢重視并開(kāi)展了廣泛研究。雖然蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展歷史非常短暫,但其研究?jī)?nèi)容非常前沿。
  目前,國(guó)家提出高校教改應(yīng)注重學(xué)生的素質(zhì)教育。有學(xué)者提出,素質(zhì)教育與教學(xué)過(guò)程的融合是大學(xué)教學(xué)改革的關(guān)鍵,而構(gòu)建科學(xué)合理的培養(yǎng)方案是“融合”的基礎(chǔ);其中重要的一項(xiàng)措施就是“注重學(xué)科交叉”。教師要做到給學(xué)生傳授整體性的知識(shí),同時(shí)注重其他學(xué)科知識(shí)對(duì)本學(xué)科的影響,以及在本學(xué)科領(lǐng)域中的應(yīng)用;更要在知識(shí)的精選和交叉融合上下工夫,搞好知識(shí)的整體優(yōu)化。在授課過(guò)程中,切忌簡(jiǎn)單地照搬、機(jī)械地設(shè)置相關(guān)專業(yè)的課程[1]。
  目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究在醫(yī)學(xué)、生物學(xué)各學(xué)科領(lǐng)域均有廣泛的應(yīng)用,以及不同的偏重。針對(duì)師范類院校學(xué)生的專業(yè)特點(diǎn),并結(jié)合高校教改的素質(zhì)教育要求,我們將本課程的教學(xué)目標(biāo)定位讓學(xué)生從總體上掌握這門課程,從整體上了解這門課程的地位、前沿技術(shù)與發(fā)展動(dòng)向、面臨的困難與挑戰(zhàn),等等,拓寬學(xué)生的視野,從而提高學(xué)生的教育教學(xué)水平,促進(jìn)自身和職業(yè)的發(fā)展。
  二、蛋白質(zhì)組學(xué)的教學(xué)內(nèi)容
  根據(jù)以上的教學(xué)目標(biāo),我們選擇了科學(xué)出版社出版的錢小紅與賀福初院士主編的《蛋白質(zhì)組學(xué):理論與方法》。并使用多種參考書(shū),如S.R.Pennington,M.J.Dunn編著,錢小紅與賀福初翻譯的《蛋白質(zhì)組學(xué):從序列到功能》;Hubert Rehm編著的《Protein Biochemistry and Proteomics》;J.E.Coligan編著,李慎濤翻譯的《精編蛋白質(zhì)科學(xué)實(shí)驗(yàn)指南》。教材及各參考書(shū)內(nèi)容新穎、豐富,如何使用,以及如何充分利用36個(gè)學(xué)時(shí)達(dá)到既定教學(xué)目標(biāo),該課程的內(nèi)容設(shè)置顯得尤為重要。
  該課程緒論課的內(nèi)容設(shè)置,我認(rèn)為最好涵蓋其發(fā)展歷史、研究背景、研究?jī)?nèi)容,并結(jié)合大量的新興研究實(shí)例(如細(xì)胞發(fā)育的蛋白質(zhì)組研究、各種疾病癌變的蛋白質(zhì)組研究等),以期使學(xué)生建立對(duì)這門課程的總的認(rèn)識(shí),務(wù)必使學(xué)生了解這門課程的研究?jī)?nèi)容、研究方向等,充分激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)熱情和興趣[2]。
  在隨后的教學(xué)中,將蛋白質(zhì)組學(xué)研究中應(yīng)用最廣泛的技術(shù)原理與方法分章節(jié)詳細(xì)介紹。
  第一部分是樣品的制備。結(jié)合學(xué)生學(xué)習(xí)過(guò)的植物學(xué)、微生物學(xué)、細(xì)胞學(xué)等知識(shí),重點(diǎn)闡述樣品制備的通用原則及注意事項(xiàng)。另外,簡(jiǎn)單介紹一些針對(duì)特殊蛋白質(zhì)的樣品制備技術(shù),如蛋白質(zhì)的分步分離提取法、亞細(xì)胞分離與蛋白質(zhì)提取等。讓學(xué)生掌握通用原則,并根據(jù)具體的研究?jī)?nèi)容進(jìn)行方案的調(diào)整。
  第二部分介紹蛋白質(zhì)組的分離技術(shù),包括二維色譜(2D-HPLC)、毛細(xì)管電泳(CE)、等電聚焦(IEF)和二維電泳(2-DE)。其中二維電泳是目前應(yīng)用最為廣泛也是分辨率最高的蛋白質(zhì)組分離技術(shù),是三大支撐技術(shù)之一,也是本章的重點(diǎn)。其中一維等點(diǎn)聚焦電泳(1D-IEF-PAGE),二維SDS電泳;實(shí)驗(yàn)原理是難點(diǎn),需詳細(xì)闡述;最后讓學(xué)生結(jié)合生化知識(shí),根據(jù)原理進(jìn)行討論,得出該項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)及局限性,讓學(xué)生掌握該技術(shù)的具體應(yīng)用范圍,并熟悉相關(guān)的操作步驟。
  第三部分學(xué)習(xí)蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析,介紹相關(guān)的雙向電泳凝膠的染色技術(shù)、數(shù)據(jù)采集和統(tǒng)計(jì)分析的軟件,對(duì)二維凝膠上的蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析,最終建立細(xì)胞蛋白質(zhì)譜;介紹一些批量凝膠上蛋白質(zhì)點(diǎn)的比對(duì)技術(shù)。讓學(xué)生掌握各染色技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)及應(yīng)用范圍,并對(duì)相關(guān)技術(shù)軟件有所熟悉,掌握一些參數(shù)的設(shè)置方法。
  第四部分對(duì)凝膠上特殊的蛋白質(zhì)斑點(diǎn)進(jìn)行定性分析,尤其是當(dāng)前應(yīng)用最為廣泛的質(zhì)譜鑒定技術(shù),這是本章也是本課程的重點(diǎn)和難點(diǎn),還是蛋白質(zhì)組研究三大支撐技術(shù)之一。內(nèi)容包括質(zhì)譜的原理、發(fā)展歷程,其中原理是重點(diǎn)也是難點(diǎn)。在質(zhì)譜知識(shí)的基礎(chǔ)上,介紹目前使用最為廣泛的基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)、電噴霧質(zhì)譜(ESI-MS),二者的工作原理是重點(diǎn)難點(diǎn),需要詳細(xì)闡述說(shuō)明,以及基于這兩種質(zhì)譜而發(fā)展起來(lái)的蛋白質(zhì)組鑒定技術(shù)—肽質(zhì)量指紋圖譜(PMF)、肽序列標(biāo)簽(PST)和從頭測(cè)序技術(shù),教師應(yīng)結(jié)合具體的研究實(shí)例說(shuō)明其使用方法,用提問(wèn)的方式來(lái)啟發(fā)學(xué)生,循序漸進(jìn)、由易到難,根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果讓學(xué)生自己總結(jié)其各自的優(yōu)缺點(diǎn),最終掌握其工作原理與應(yīng)用范圍。
  第五部分介紹一些基于質(zhì)譜技術(shù)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾的鑒定方法,主要包括蛋白質(zhì)的磷酸化修飾和糖基化修飾,重點(diǎn)是其原理與技術(shù)方法,同時(shí)也是對(duì)上一章內(nèi)容的深化與應(yīng)用。
  第六部分學(xué)習(xí)蛋白質(zhì)組研究中的生物信息學(xué)。介紹生物信息學(xué)的定義、發(fā)展歷史及其應(yīng)用,根據(jù)上一章節(jié)介紹的質(zhì)譜鑒定得到的信息,具體實(shí)例說(shuō)明如何利用生物信息學(xué)進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,讓學(xué)生掌握其在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的應(yīng)用。
  第七部分是蛋白質(zhì)的功能研究,重點(diǎn)強(qiáng)調(diào)蛋白質(zhì)相互作用的研究,包括酵母雙雜交、噬菌體展示、蛋白質(zhì)芯片技術(shù)等,最終建立蛋白質(zhì)間的連鎖圖。學(xué)生需要掌握其原理與應(yīng)用范圍,學(xué)會(huì)基本的操作方法。
  最后介紹蛋白質(zhì)組學(xué)研究中一些非凝膠的技術(shù),包括定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù),例如熒光染料標(biāo)記、同位素標(biāo)記及蛋白質(zhì)芯片技術(shù)等。
  
  總之,該課程的內(nèi)容要緊緊圍繞選課學(xué)生的專業(yè)特點(diǎn)展開(kāi),務(wù)必讓學(xué)生從整體上把握該課程,熟悉其研究?jī)?nèi)容與研究前言。
  三、教學(xué)方法和教學(xué)手段的改革
  首先在教學(xué)手段上,以多媒體教學(xué)方法為主、傳統(tǒng)教學(xué)方法為輔。多媒體PPT課件貫穿整個(gè)教學(xué)過(guò)程,其優(yōu)勢(shì)是圖像清晰、形象逼真、表達(dá)直觀、闡述清晰明了,可幫助學(xué)生有效地學(xué)習(xí)和掌握知識(shí)點(diǎn),有助于解決教學(xué)重點(diǎn)、突破教學(xué)難點(diǎn)。同時(shí)多媒體課件穿插大量的圖片、表格,有效地增加了教學(xué)信息量,對(duì)課本上的內(nèi)容有很好的深化和拓展作用,能取得比較好的教學(xué)效果。但是正因?yàn)槎嗝襟w的信息量大,需要結(jié)合傳統(tǒng)板書(shū),一方面可以給學(xué)生思考、消化的時(shí)間,另一方面可以對(duì)該課時(shí)涉及的重點(diǎn)和難點(diǎn)進(jìn)一步闡述說(shuō)明,最終讓學(xué)生對(duì)所學(xué)的內(nèi)容有個(gè)整體認(rèn)識(shí)??傊瑢⒏鞣N教學(xué)手段的優(yōu)勢(shì)發(fā)揮到最大,以期達(dá)到最好的教學(xué)效果。
  其次在教學(xué)方法上,在傳統(tǒng)的教師講授、學(xué)生聽(tīng)課的講授法的基礎(chǔ)上,需要激發(fā)學(xué)生的熱情,提高學(xué)生的參與度。教學(xué)過(guò)程是師生的雙邊活動(dòng),教師的“教”和學(xué)生的“學(xué)”相互適應(yīng)才能取得預(yù)期的教學(xué)效果。在授課過(guò)程中要鼓勵(lì)學(xué)生敢于提出問(wèn)題,獨(dú)立思考問(wèn)題,教師與學(xué)生共同參與教學(xué)內(nèi)容。同時(shí)可以在授課過(guò)程中,穿插學(xué)生小組討論的環(huán)節(jié),這樣可以有效地活躍課堂氣氛,吸引學(xué)生注意力,使學(xué)生通過(guò)自我思考,最終得到答案。
  蛋白質(zhì)組學(xué)不僅是一門理論性較強(qiáng)的學(xué)科,而且是一門實(shí)驗(yàn)性很強(qiáng)的學(xué)科。因此在教學(xué)過(guò)程中要注意理論與實(shí)驗(yàn)演示相結(jié)合[3]。對(duì)于實(shí)驗(yàn)室可滿足實(shí)驗(yàn)條件的教學(xué)內(nèi)容,可以采用探究式教學(xué)方法,給學(xué)生自己動(dòng)腦動(dòng)手的機(jī)會(huì),自己設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)、實(shí)施實(shí)驗(yàn),并發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,最終解決問(wèn)題、得出結(jié)論。但是目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究中一些實(shí)驗(yàn)周期較長(zhǎng),材料準(zhǔn)備比較困難;許多大型儀器都非常昂貴,需要專業(yè)人員而不能任由學(xué)生自由操作;甚至普通的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)室并無(wú)配備。對(duì)于這部分的實(shí)驗(yàn)內(nèi)容,教師可以自己實(shí)驗(yàn)并制作相應(yīng)的教學(xué)實(shí)驗(yàn)操作錄像,或者從網(wǎng)絡(luò)上尋找;這樣可以在教學(xué)過(guò)程中一邊播放一邊講解,有利于學(xué)生學(xué)習(xí)[4]。例如2-DE的具體操作,生物質(zhì)譜的蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)等,其原理抽象,難于理解,相應(yīng)地采用視聽(tīng)覺(jué)媒體,使得整個(gè)教學(xué)過(guò)程變得更為形象具體、直觀生動(dòng),具有較強(qiáng)的表現(xiàn)力;利用具體的場(chǎng)景和音響刺激學(xué)生,吸引學(xué)生的注意力,提高學(xué)生的具體感知認(rèn)識(shí)。在教學(xué)過(guò)程中,要注意將科研的思路、科研的方法融入教學(xué)中,從而提高學(xué)生的科研能力。
  在教學(xué)過(guò)程中,教師需注意聽(tīng)取學(xué)生的反饋意見(jiàn),注重學(xué)生對(duì)教學(xué)效果的評(píng)價(jià)。教師可以通過(guò)建立學(xué)生公共信箱,將某些授課內(nèi)容、習(xí)題、思考題等通過(guò)該信箱讓學(xué)生下載;學(xué)生也可通過(guò)教師的郵箱,提出建議和意見(jiàn),及時(shí)對(duì)課程進(jìn)行反饋,從而使教師及時(shí)調(diào)整教學(xué)活動(dòng)[5]。
  在考試形式上,采取課下查文獻(xiàn)、答題相結(jié)合的形式。在教學(xué)過(guò)程中針對(duì)重要章節(jié)中的知識(shí)點(diǎn),給學(xué)生出思考題,讓學(xué)生結(jié)合已有的知識(shí),查找相關(guān)的文獻(xiàn),再提出自己的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方案;安排一個(gè)課時(shí)讓學(xué)生課堂討論。這樣可以有效地調(diào)動(dòng)學(xué)生的積極性,加深對(duì)知識(shí)的理解和掌握;更重要的是,學(xué)生活學(xué)活用,理論聯(lián)系實(shí)際,培養(yǎng)了嚴(yán)謹(jǐn)務(wù)實(shí)的科研態(tài)度。
  總之,蛋白質(zhì)組學(xué)是一門新興的交叉型學(xué)科。如何把對(duì)學(xué)生而言是外在的知識(shí)和感受內(nèi)化為學(xué)生個(gè)人內(nèi)在的、穩(wěn)定的個(gè)性心理品質(zhì),從而為學(xué)生一生的發(fā)展提供良好的基礎(chǔ),值得我們付出努力,不斷探索。在教學(xué)過(guò)程中,教師要時(shí)刻注意,傳授必要的知識(shí)是重要的,但更重要的是使學(xué)生養(yǎng)成正確的學(xué)習(xí)方法和自學(xué)能力,培養(yǎng)科學(xué)精神和健全人格[1]。
  
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  本項(xiàng)目受中央高?;究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助,項(xiàng)目編號(hào):GK201002008。

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