曹尚銀 沈程清 曹達 薛華柏 謝深喜 李好先
摘 要: 【目的】為了探明鹽脅迫下棗蛋白表達的差異,【方法】以較耐鹽堿的‘七月鮮棗品種的扦插苗為材料,經(jīng)過臨界濃度(0.60%)的鈉鹽(NaCl)處理,取其葉片進行蛋白質(zhì)雙向電泳,經(jīng)ImageMaster 2D分析,【結(jié)果】結(jié)果表明,處理與對照之間總蛋白的整體分布模式非常相似,在pH 3~10和MW50~90 kD內(nèi)的蛋白點分布最多,處理與對照之間量變倍數(shù)大于1.5倍的差異點有26個,其中6個蛋白受脅迫上調(diào), 20個蛋白受脅迫下調(diào)。在上調(diào)的蛋白質(zhì)點中,3個點受鹽脅迫誘導增加了近4倍,2個蛋白質(zhì)點相對豐度增加了2倍以上,表現(xiàn)出強烈的鹽誘導特性。說明他們可能在棗的抗鹽機制中發(fā)揮重要作用。在下調(diào)的蛋白質(zhì)點中,2個點相對豐度降低至對照的5倍左右,表現(xiàn)出強烈的鹽抑制特性,說明其可能是對鹽脅迫比較敏感的2個蛋白質(zhì)或多肽,并且在棗的抗鹽性機制中也發(fā)揮比較重要的作用?!窘Y(jié)論】在臨界濃度鈉鹽脅迫下,棗葉片蛋白質(zhì)表達有顯著差異。
關(guān)鍵詞: 棗; 鹽脅迫; 蛋白質(zhì); 雙向凝膠電泳
中圖分類號:S665.1 文獻標志碼:A 文章編號:1009-9980?穴2013?雪01-0043-05
土壤鹽漬化已經(jīng)成為制約世界農(nóng)業(yè)發(fā)展的重要因素,鹽脅迫是影響植物生長、降低作物產(chǎn)量的重要因素。隨著溫室效應(yīng)引起的全球氣候變暖,使得部分地區(qū)環(huán)境持續(xù)惡化,預計到2050年全球?qū)⒂谐^50%的耕地會變得鹽堿化[1-2]。探索植物耐鹽機制,提高植物耐鹽性,開展耐鹽作物分子育種已成為一種有效的應(yīng)對措施[3],這對減輕人類所面臨的土地資源和淡水資源短缺、糧食供需矛盾以及有效控制環(huán)境惡化都有著重要的戰(zhàn)略意義。
棗原產(chǎn)我國,已有7700余年的栽培歷史,較抗鹽堿、耐旱、耐瘠薄。棗果實營養(yǎng)豐富,含糖量居各類果品之首,維生素C的含量高于柑橘10倍,高于蘋果80倍,是梨的100倍。棗是我國優(yōu)勢果品,國外有30多個國家先后引種了我國的棗,但除韓國外均尚未形成規(guī)模化商品栽培,迄今98%的棗資源和100%的棗產(chǎn)品國際貿(mào)易集中在我國。目前我國的主要棗區(qū)大多是在過去不適宜耕作的山、沙、堿地區(qū)建立發(fā)展起來的。在河北、山東環(huán)渤金絲小棗產(chǎn)區(qū)和河南內(nèi)黃扁核酸棗區(qū)歷史上是著名的鹽堿區(qū),形成上千公頃的棗林帶或林區(qū),但產(chǎn)量較低,品質(zhì)較差。近年來,我國的新疆和沿海地區(qū),在鹽堿地正探索大面積發(fā)展棗樹生產(chǎn)。如何提高棗樹的耐鹽性已成為我們亟待研究的重大問題[4]。這不僅關(guān)系到提供棗產(chǎn)量和品質(zhì),更關(guān)系到國內(nèi)外棗產(chǎn)品的供應(yīng),我國民族果樹的振興,關(guān)系到數(shù)百萬棗農(nóng)的小康生活,關(guān)系到鹽堿地的綜合治理與開發(fā)。
當前,關(guān)于棗樹耐鹽性的研究主要集中于生態(tài)學和生理生化特性研究[4],而其耐鹽性相關(guān)分子生物學研究,尤其是蛋白組學研究幾乎無人涉及。研究嘗試并確定了抗鹽性較強的‘七月鮮棗葉片雙向電泳體系,通過高通量的蛋白組學方法[5-6] ,分析棗耐鹽脅迫反應(yīng)相關(guān)蛋白,為進一步研究鹽脅迫下棗葉片特異蛋白質(zhì)的功能及揭示棗耐鹽分子機制奠定基礎(chǔ)。
1 材料和方法
1.1 材料
試驗在中國農(nóng)業(yè)科學院鄭州果樹研究所棗良種圃進行,試驗材料為‘七月鮮棗當年生扦插苗。扦插苗屬于同一母樹上發(fā)育良好、無病蟲害及機械損傷的半木質(zhì)化枝條快繁而成。盆栽基質(zhì)為良種圃中普通土加草炭100 g·kg-1(干質(zhì)量,下同)和河沙50 g·kg-1,混勻、過篩。盆土基質(zhì)含有機質(zhì)0.98%、速效氮(N)0.0067%,速效磷(P)0.0033%,速效鉀(K)0.0115%,pH 7.12,含鹽量0.026%。栽植用塑料(PVC)盆,高33 cm,上口徑40 cm,下口徑33 cm,底部有排水孔,置于托盤上。每盆裝基質(zhì)7.12 kg(干質(zhì)量)。2009年3月12日每盆栽大小基本一致的3株棗苗, 每個處理3次重復,每個重復10盆,NaCl處理濃度為: 0, 0.60%(依文獻[4]試驗結(jié)果設(shè)計的超臨界濃度(0.60%)的鈉鹽,按基質(zhì)干質(zhì)量計),取相應(yīng)量NaCl加水至1 500 mL,一次澆入,自然光照避雨狀態(tài)下培養(yǎng),每5 d根據(jù)土壤濕度補充等量自來水,有溶液滲出到托盤中,于2 h后返澆盆中。第25天分別采集每株苗木中部3枚成熟葉片用ddH2O沖洗干凈后迅速用濾紙輕輕擦干,稱質(zhì)量。
1.2 蛋白質(zhì)的提取與定量
棗總蛋白的提取方法參照本實驗室朱志勇等[7] 已經(jīng)建立的蘋果蛋白質(zhì)提取的方法,略有改動。切取棗葉組織,切碎成3 mm×3 mm的小塊,在液氮中,用研缽磨碎成細粉狀。將組織細粉轉(zhuǎn)入50 mL離心管中,加入25 mL TCA/丙酮(1∶9),65 mmol·L-1 DTT,-20 ℃沉淀1 h。離心10 000 r·min-1,45 min,去除上清,沉淀加入25 mL純丙酮,-20 ℃沉淀1 h,離心10 000 r·min-1,45 min,去除上清,空氣干燥,-80 ℃保存。
稱取500 mg棗葉組織,加入0.5 mL全細胞裂解液(7 mol·L-1尿素,2 mol·L-1硫脲,65 mmol·L-1 Tris ,4% CHAPS,0.2%IPGbuffer),混均,超聲破碎細胞(冰?。kx心12 000 g,45 min,取上清,上清用0.22 μm過濾,獲得澄清溶液。上清采用Bradford法定量,100 μg分裝樣品,-80 ℃保存。
1.3 棗葉部蛋白質(zhì)雙向電泳及凝膠檢測
雙向電泳根據(jù)Bio-Rad公司的ProteomeWorksTMSystem中的方法進行。樣品制備后,用水化上樣緩沖液將樣品濃度稀釋為1 g·L-1,用于雙向電泳上樣。第1向等電聚焦采用pH 3~10,17 cm非線性的IPG預制膠條,對處理樣品分別取約含150 μg總蛋白的300 μL水化液,以主動水化上樣的方式上樣。等電聚焦程序設(shè)置為50 V, 14 h;250 V, 1 h;500 V, 1 h;1 000 V, 1 h;1 000~10 000 V線性上升5 h,10 000 V, 65 kVh;等電聚焦溫度為20 ℃。聚焦完畢后采用兩步平衡法,每步15 min。第2向電泳采用12% SDS-PAGE,在17℃循環(huán)水浴冷卻下進行。雙向電泳凝膠染色采用改良的銀染法[5]。
1.4 雙向電泳凝膠圖譜分析
雙向電泳凝膠圖象掃描采用GS800光密度掃描儀(Bio-Rad),用PDQuest8.0版軟件進行圖像分析,斑點檢測和匹配分析,找出差異蛋白。
1.5 作蛋白質(zhì)強度柱狀圖方法
以不同膠為x 軸,不同膠中某一個差異點的定量值信息為Y軸;以灰色豎線分割兩個組;藍色橫線表示該組內(nèi)蛋白的集中趨勢;紅色橫線表示該組內(nèi)蛋白的離散度; a、 b、c分別代表對照的統(tǒng)計學dispersion 極值;而a、b、 c矩形條代表對照蛋白點統(tǒng)計學定量在該范圍內(nèi)變化(即離散區(qū)間)。d、e、f 分別代表處理的統(tǒng)計學dispersion極值;而d、e、f矩形條代表處理蛋白點統(tǒng)計學定量在該范圍內(nèi)變化(即離散區(qū)間)。作蛋白質(zhì)強度柱狀圖。
2 結(jié)果與分析
2.1 棗葉片可溶性蛋白質(zhì)提取率
配置考馬斯亮藍G-250蛋白質(zhì)顯色液,以標準蛋白質(zhì)BSA作蛋白質(zhì)濃度與OD值之間標準曲線。為了增加標準曲線的可靠性,不同濃度BSA標準品的光吸收值均設(shè)3次重復,pH調(diào)節(jié)到7.4(圖1)。
抽提蛋白中,蛋白質(zhì)提取率的高低是檢驗提取方法優(yōu)劣的主要指標之一。本研究采用Bradford法對蛋白進行定量,用牛血清白蛋白(BSA)制作標準曲線,蛋白濃度在0~100 g·L-1內(nèi),R2=0.997 7。采用TCA丙酮沉淀法提取蛋白質(zhì),在λ=595 nm時,檢測出棗葉片中蛋白平均濃度為11 g·L-1,其濃度較高,表明此蛋白提取方法較可靠,且為后續(xù)雙向電泳圖譜的清晰度、重復性奠定了基礎(chǔ)。此外,提高樣品中的蛋白濃度從而增加重泡漲液(水化緩沖液)的用量,能夠使樣品得到充分泡漲,第1向電泳的聚焦效果好,電壓能上升到8 000 V,但樣品蛋白濃度也不能過高,以不析出結(jié)晶為宜,否則亦會影響等電聚焦效果。
利用雙向電泳技術(shù)對‘七月鮮棗葉片的蛋白進行分離,為保證試驗的重復性,在相同條件下對2組樣品分別進行了3次重復性試驗(a、b、c為對照、d、e、f為0.6%NaCl處理過的‘七月鮮棗)。蛋白質(zhì)濃度均為11 g·L-1,其總蛋白的整體分布模式非常相似: 在pH 3~10和MW50~90 kD內(nèi)的蛋白點分布最多。其中檢測到a蛋白質(zhì)點為: 2 642個;b蛋白質(zhì)點為: 2 386個;c蛋白質(zhì)點為: 2 835個;d蛋白質(zhì)點為: 2 333個;e蛋白質(zhì)點為: 2 210個;f蛋白質(zhì)點為: 2 576個。銀染后獲得的原始二維凝膠圖譜結(jié)果如圖2。
2.2 氯化鈉脅迫下棗葉片蛋白質(zhì)雙向電泳分析
經(jīng)掃描儀采集圖像后,用Image Master 2D圖像處理軟件進行了背景消除、污染點去除和放大檢測,共檢測出棗在鹽脅迫下26個蛋白質(zhì)點發(fā)生了變化,其中6個上調(diào)蛋白、20個下調(diào)蛋白(圖3)。
用蛋白質(zhì)強度柱狀圖信息顯示兩組樣品之間量變倍數(shù)大于1.5 倍差異點,26個受鹽脅迫影響而變化明顯的蛋白質(zhì)點中,6個受脅迫上調(diào),上調(diào)蛋白分別是1 717、1 253、1 459、1 233、2 120、2 474;20個受脅迫下調(diào),下調(diào)蛋白分別是2 443、2 496、2 498、287、2 543、2 288、2 550、1 896、1 418、1 527、1 526、1 374、1 362、1 438、 6 811、655、1 528、1 182、647、492。在上調(diào)的蛋白質(zhì)點中(圖4),1 459、2 474、1 233變化最大,與對照相比,受鹽脅迫誘導增加了4倍以上;其次是1 253和2 120 ,這2個蛋白質(zhì)點在鹽脅迫后相對豐度增加了2倍以上,表現(xiàn)出強烈的鹽誘導特性,說明他們可能在棗的抗鹽機制中發(fā)揮重要作用。在下調(diào)的蛋白質(zhì)點中,2 543、2 498受鹽脅迫抑制(圖4)最大,其相對豐度降低至不到對照的五分之一,表現(xiàn)出強烈的鹽抑制特性,說明2 543、2 498可能是對鹽脅迫比較敏感的2個蛋白質(zhì)或多肽,并且在棗的抗鹽性機制中也發(fā)揮比較重要的作用;其他受鹽脅迫抑制而相對豐度降低比較大(3倍以上)的蛋白質(zhì)點還有647、1 527、287、492(圖版)。
3 討 論
差異蛋白質(zhì)組學研究是目前蛋白質(zhì)組學研究的熱點之一。通過尋找某種特定因素所引起的細胞或組織的蛋白質(zhì)組變化,并對某些標志性蛋白進行定性和功能分析,揭示這些差異蛋白與特定生理、病理過程的相關(guān)性,從而探察細胞或機體對環(huán)境刺激的反應(yīng)及細胞調(diào)控的機制。通過獲取的蛋白質(zhì)樣品的表達譜信息來進行差異蛋白質(zhì)組研究為細胞信號調(diào)節(jié)、代謝途徑、增殖分化等基礎(chǔ)性生命科學研究提供了一個有效工具。生命科學研究已經(jīng)從基因組時代走入到了蛋白質(zhì)組時代,雖然,植物蛋白質(zhì)組學研究要明顯落后于醫(yī)學相關(guān)的蛋白質(zhì)組學研究的進程,但是,隨著植物基因組和表達序列標簽(EST)數(shù)據(jù)庫的不斷發(fā)展,借助人類和動物模型研究獲得的方法,植物蛋白質(zhì)組學也越來越受到關(guān)注,并取得了一定的研究成果。紅海欖 (Rhizophora stylosa )是一種典型的紅樹林鹽生植物。 范吉星等[8]研究利用差異蛋白組學技術(shù)對淡栽(R0)和 30 g·kg-1氯化鈉鹽栽(R3)處理后的紅海欖根部總蛋白進行了比較研究。 結(jié)果表明,在鹽水栽培上調(diào)的蛋白質(zhì)一般與逆境脅迫有關(guān), 淡水栽培上調(diào)的蛋白質(zhì)一般與基本代謝有關(guān)。 這些研究結(jié)果為進一步研究紅海欖的耐鹽機制提供了有意義的線索。在高鹽脅迫下葡萄芽尖中 191 種蛋白質(zhì)表達豐度發(fā)生變化, 其中約 44%為具有同工型的蛋白質(zhì), 且參與光合作用、 蛋白質(zhì)合成和定位的蛋白質(zhì)的表達豐度明顯下調(diào)[9]。1997年,Ramani等[10]。以水稻幼苗葉片為材料,利用體內(nèi)標記結(jié)合雙向電泳和放射性同位素自顯影技術(shù),共檢測到52個蛋白質(zhì)與鹽脅迫有應(yīng)答關(guān)系。其中35個被鹽脅迫誘導,17個被鹽脅迫抑制,包括20個在這之前未曾報道的低豐度蛋白。這些發(fā)現(xiàn)對尋找鹽壓應(yīng)答新基因,尤其是那些在水稻鹽耐性獲得中起瞬時調(diào)節(jié)作用的基因十分重要。在本實驗中,以0.60%的鈉鹽(NaCl)處理‘七月鮮棗,結(jié)果表明,處理與對照之間蛋白質(zhì)量變倍數(shù)大于1.5倍的差異點有26個,其中6個蛋白受脅迫上調(diào), 20個蛋白受脅迫下調(diào)。在上調(diào)的蛋白質(zhì)點中,3個點受鹽脅迫誘導增加了近4倍,2個蛋白質(zhì)點相對豐度增加了2倍以上,表現(xiàn)出強烈的鹽誘導特性,說明他們可能在棗的抗鹽機制中發(fā)揮重要作用。在下調(diào)的蛋白質(zhì)點中,2個點相對豐度降低至對照的5倍左右,表現(xiàn)出強烈的鹽抑制特性,說明其可能在棗的抗鹽性機制中發(fā)揮了比較重要的作用。關(guān)于鈉鹽脅迫后棗葉片中發(fā)生顯著變化的26個蛋白質(zhì)點的具體生物學功能還有待于質(zhì)譜鑒定以及進一步的、系統(tǒng)的功能解析研究。(本文圖版見封3)
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