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尿液microRNAs作為局灶節(jié)段性腎小球硬化疾病活動生物標志物的研究

2013-04-26 06:45:45張婉芬,張昌明,劉春蓓
腎臟病與透析腎移植雜志 2013年4期
關(guān)鍵詞:活動性尿蛋白尿液

對象和方法

研究對象按患者蛋白尿的程度將患者分為兩組:活動性FSGS組(FSGS-A組)98例,患者尿蛋白定量>3.5 g/24h;非活動性FSGS組(FSGS-NA組)94例,患者尿蛋白定量<0.4 g/24h。

FSGS治療組:41例初次接受60 mg足量激素治療的FSGS患者,激素治療8周,留取治療前后尿液標本,其中26例激素治療有效,15例激素治療無效。

疾病對照組:膜性腎病(MN),分為MN活動組(MN-A組)29例,患者尿蛋白>3.5 g/24h ; MN非活動組(MN-NA組)26例,患者尿蛋白<0.4 g/24h。糖尿病腎病(DN),分為DN活動組(DN-A組) 23例,患者尿蛋白>3.5 g/24h;DN非活動組(DN-NA組) 27例,患者尿蛋白<0.4 g/24h。

正常對照組(NC組):共94例,年齡性別與患者年齡、性別匹配,全身無器質(zhì)及功能性疾病。

記錄性別、年齡、尿蛋白、尿N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAG)、尿視黃醇結(jié)合蛋白(RBP)、血白蛋白、血清肌酐(SCr)、血胱抑素C(CysC)、血總膽固醇、三酰甘油等臨床資料。采用MDRD4估算腎小球濾過率(eGFR),eGFR=186×SCr-1.154×年齡-0.203×(0.742,女性)[7]。所有標本留取都根據(jù)倫理委員會的標準經(jīng)過本人的同意。

RNA提取方法送檢TaqMan低密度芯片尿標本RNA的提取:每組每例取等量尿液上清混合后(每組共100 ml尿液上清)使用Trizol(Invitrogen公司)法提取總RNA,即每份血漿中加入兩倍體積的Trizol,然后進行2次酚/氯仿抽提,得到的RNA用20 μl DEPC水溶解后送Invitrogen公司行microRNA低密度芯片檢測[8]。尿液單個樣本miRNAs提取方法:取300 μl樣品加入100 μl DEPC水,充分混勻后加入等體積的酸性酚(pH 4.7~5.5)和氯仿,酸性酚氯仿體積1∶1,進行抽提,后續(xù)抽提方法同血清中提取RNA方法一致[9],RNA用10 μl DEPC水溶解,-80℃保存。

miRNA RT-PCR和quantitative Real-time實時定量PCR(qRT-PCR) 采用探針法檢測尿中的miRNAs的含量,探針購于Applied Biosystems(Foster City,CA,USA)。逆轉(zhuǎn)錄酶及taq聚合酶購于takara。逆轉(zhuǎn)錄使用RNA 2 μl,所得到的cDNA于-20℃保存?zhèn)溆谩6縋CR每反應體系使用不稀釋的cDNA 1 μl。所有的PCR反應均行3副孔。qRT-PCR采用ABI Prism 7900 定量PCR儀器進行檢測。CT值越大表示含量越低[10]。

他的聲調(diào),陰沉沉的,干巴巴的,完全沒有感情。他冷冷地說著這些話;前面的那個只顧一瘸一拐地向流過巖石、激起一片泡沫的白茫茫的小河里走去,一句話也不回答。

TaqMan microRNAarray檢測將提取的尿液上清總RNA送invitrogen公司行TaqMan低密度芯片檢測。芯片版本為TaqMan Array Human MicroRNA A+B Cards Set v3.0,可檢測754個人類miRNA分子,采用7900HT PCR 系統(tǒng)進行檢測(Applied biosystems)。以U6為內(nèi)參,2-ΔΔCT計算各miRNAs的變化倍數(shù),選取CT>30且FSGS組尿液上清中miRNAs較正常對照組升高>2倍的miRNAs進行后續(xù)的驗證。

統(tǒng)計學分析所有的數(shù)據(jù)采用SPSS 18.0統(tǒng)計分析軟件進行處理。本研究中臨床指標用均數(shù)±標準差表示;各組之間miRNAs表達水平用均數(shù)±標準誤差示,比較采用Nonparametric Mann—Whitney U檢驗。相關(guān)性分析采用Spearman檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

結(jié) 果

篩選和驗證FSGS疾病活動相關(guān)的miRNAs FSGS患者臨床資料見表1和表2。

表1 芯片檢測及初步篩選FSGS患者的臨床資料

表2 大樣本驗證FSGS患者的臨床資料

芯片篩選與FSGS活動性相關(guān)的miRNAs 實驗采用低密度芯片檢測FSGS患者尿液上清中循環(huán)microRNAs表達譜,檢測分為三組:FSGS-A,F(xiàn)SGS-NA和NC組。三組患者的具體信息見表1。在芯片檢測的754種miRNAs中,F(xiàn)SGS-A組,F(xiàn)SGS-NA組和NC患者分別檢測到226種,197種和 173種miRNAs的表達。miRNAs表達認為具有顯著性差異的標準:(1) 檢測的CT值≤30;(2) 在兩組之間進行比較時,變化倍數(shù)在2倍以上?;谏鲜龅臉藴?,與NC組比較,FSGS-A組患者尿液中,有52種miRNAs表達升高,111種miRNAs表達下降;與FSGS-NA組比較,F(xiàn)SGS-A患者尿液中,有32種miRNAs表達上調(diào),164種miRNAs表達下調(diào)。27個miRNAs在FSGS-A組中比FSGS-NA組和NC組表達均上調(diào)。

小樣本初步篩選尿液miRNAs的表達 在初步篩選中對18例FSGS-A組,14例FSGS-NA組患者和18例NC組對照的尿液進行了qR-PCR測定。除了FSGS-A組升高的27個miRNAs,另外miRNA-10a,miRNA-10b,miRNA-21,miRNA-27b,miRNA-29c,miRNA-30a,miRNA-146a,miRNA-155,miRNA-192,miRNA-194,miRNA-196a,miRNA-200a,miRNA-204,miRNA-320也進行了測定[11-13]。 qRT-PCR測定CT>32或在標本中的檢出率<75%認為超過準確的定量范圍,排除后續(xù)的驗證。結(jié)果顯示其中miRNA-21、miRNA-146a、miRNA-192、miRNA-199a、miRNA-200a和miRNA-204各組之間表達水平不存在明顯差異。有6個miRNAs表達水平在活動組明顯升高,分別是miRNA-196a、miRNA-30a-5p、miRNA-155、miRNA-320、miRNA-135b和miRNA-490。 活動性FSGS組與正常組相比,尿液上清miRNA-196a、miRNA-155和miRNA-320尿液上清表達變化倍數(shù)>5,miRNA-135b、miRNA-490和miRNA-30a的變化倍數(shù)>2,(P均<0.05);非活動性FSGS組與正常組相比,尿液上清miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-320的水平明顯升高(P<0.05),其中miRNA-155的變化最為明顯,變化倍數(shù)>5(圖1)。據(jù)此,選定miRNA-196a,miRNA-30a-5p,miRNA-155,miRNA-320,miRNA-135b和miRNA-490進行后續(xù)大樣本的驗證。

圖1 尿液miRNAs的表達水平的比較

大樣本尿液miRNAs表達的驗證 大樣本驗證階段對80例FSGS-A組,80例FSGS-NA組和76例NC組患者尿液miRNA-196a,miRNA-30a-5p,miRNA-155,miRNA-320,miRNA-135b和miRNA-490的水平進行了測定。結(jié)果顯示,尿液miRNA-135b和miRNA-320的水平在樣本增大之后,各組間無明顯的差異。miRNA-196a,miRNA-30a-5p,miRNA-155和miRNA-490的水平在FSGS-A組尿液中的水平顯著高于FSGS-NA組和對照組(P<0.001)。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn):miRNA-155在尿液上清中的含量最高,miRNA-490的含量最低。尿液上清miRNA-196a和miRNA-30a的水平在FSGS-NA組和NC組之間無統(tǒng)計學差異,而尿液上清miRNA-155和miRNA-490的水平,不僅FSGS-A組顯著高于FSGS-NA組和NC組(P<0.001),而且FSGS-NA組顯著高于NC組(P<0.05)。與NC組相比,F(xiàn)SGS-A組尿液上清miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155和miRNA-490的變化倍數(shù)分別是7.58,2.52,7.72,6.11;與正常組相比,F(xiàn)SGS-NA組尿液上清miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155和miRNA-490的變化倍數(shù)分別是1.24,0.8,2.38,1.61(圖2)。驗證結(jié)果顯示,尿液miRNAs在FSGS疾病活動狀態(tài)下顯著升高,疾病緩解狀態(tài)時水平較活動組下降,提示尿液miRNAs可能與疾病活動性相關(guān)。

圖2 尿液上清miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155and miRNA-490的表達變化

尿液miRNAs水平與臨床指標之間的關(guān)系本研究結(jié)果顯示,尿液miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155和miRNA-490的水平在FSGS-A組患者顯著高于NC組和FSGS-NA組的患者,進一步分析miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155和miRNA-490的升高倍數(shù)與患者臨床指標之間的關(guān)系驗證miRNAs水平與FSGS活動性之間的關(guān)系。結(jié)果顯示,尿液miRNAs的水平與蛋白尿正相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別是miRNA-196a(r=0.622,P<0.01),miRNA-30a(r=0.561,P<0.01),miRNA-155(r=0.363,P<0.01)和miRNA-490(r=0.624,P<0.01)(圖3);尿液miRNAs的水平與血清白蛋白水平負相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別是miRNA-196a(r=-0.608,P<0.01),miRNA-30a(r=-0.544,P<0.01),miRNA-155(r=-0.361,P<0.01)和miRNA-490(r=-0.591,P<0.01)(圖4);此外,尿液miRNAs水平與總膽固醇水平正相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別是miRNA-196a(r=0.568,P<0.01),miRNA-30a(r=0.556,P<0.01),miRNA-155(r=0.404,P<0.01)和miRNA-490(r=0.554,P<0.01);與三酰甘油的水平也存在正相關(guān)性,分別是miRNA-196a(r=0.485,P<0.01),miRNA-30a(r=0.421,P<0.01),miRNA-155(r=0.228,P<0.01)和miRNA-490(r=0.483,P<0.01)。相關(guān)性分析顯示,尿液miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155和miRNA-490的變化水平與患者尿蛋白、白蛋白、膽固醇、三酰甘油等臨床特征性指標相關(guān)性良好。

FSGS患者尿液miRNAs表達的特異性

臨床資料 作為疾病對照的MN和DN患者的基本情況見表3。

圖3 尿液miRNAs水平與尿蛋白之間的相關(guān)性

圖4 尿液miRNAs水平與血清白蛋白之間的相關(guān)性

表3MN和DN患者的臨床資料

MN:膜性腎?。籇N:糖尿病腎??;eGFR:估算的腎小球濾過率;MN-A組:活性性MN組;MN-NA組:非活動性MN組;DN-A組:活動性DN組;DN-NA組:非活動性DN組

MN和DN患者尿液miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-490表達變化 為了進一步明確FSGS尿液miRNAs變化的疾病特異性,因此實驗進一步評估了miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-490在MN和DN尿液中的表達情況。結(jié)果顯示:在MN和DN患者尿液miRNA-196a、miRNA-30a和miRNA-490在MN-A組和MN-NA組CT值下降表明其表達水平在MN-A組和MN-NA組均明顯高于NC組(P<0.001),但是在MN-A和MN-NA組之間不存在統(tǒng)計學差異;尿液miRNA-196a、miRNA-30a和miRNA-490的表達變化在DN中與MN相同;但是miRNA-196a、miRNA-30a和miRNA-490的變化趨勢MN、DN患者與FSGS患者不同。尿液miRNA-155的水平在MN患者和DN患者中變化相同,在MN-A和DN-A組尿液中miRNA-155的水平不僅顯著高于正常組,且顯著高于MN-NA和DN-NA組(P<0.05),與其在FSGS患者尿液中的變化相同(圖5)。上述結(jié)果顯示,尿液miRNA-196a、miRNA-490和miRNA-30a的在FSGS中的變化與NN和DN不相同,在FSGS患者中活動性的患者中變化明顯。

FSGS患者尿液miRNAs的表達變化與治療的關(guān)系

臨床資料 治療組患者臨床資料見表4。接受足量激素治療的FSGS患者26例激素治療有效,15例激素治療無效。

圖5 MN和DN患者尿液miRNA-196a,miRNA-30a,miRNA-155和miRNA-490的表達情況

表4FSGS患者激素治療前后臨床資料的比較

FSGS:局灶節(jié)段性腎小球硬化:eGFR:估算的腎小球濾過率

FSGS患者激素治療前后尿液miRNAs的改變 為了評估同一個FSGS患者在治療前后的尿液miRNAs水平的改變,我們測定了41例FSGS患者在接受足量激素治療前后尿液miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-490的水平。在激素治療有效的FSGS患者尿液中,miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-490治療后CT值上升,表明其表達水平隨著病情的緩解明顯下降(P<0.001),與NC組相比,尿液miRNAs水平還是升高的;而激素治療無效的FSGS患者,miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-490在治療前后無明顯的變化(P>0.05)(圖6)。結(jié)果證實,當FSGS患者經(jīng)激素治療有效,上述四個miRNAs在尿液中的變化與激素治療無效情況存在明顯差異。

圖6 在激素治療前后尿液miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-155和miRNA-490的表達變化

討 論

本研究發(fā)現(xiàn)FSGS患者尿液中miRNA-155、miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-490的含量在疾病活動狀態(tài)明顯高于疾病緩解狀態(tài),miRNA-155、miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-490的改變與患者的尿蛋白、血清白蛋白,血脂等臨床指標具有很好的相關(guān)性,且治療后,隨著疾病的緩解上述miRNAs水平明顯下降。為了對其在反映FSGS疾病活動中的特異性進行驗證,我們同時測定了MN和DN患者尿液miRNA-155、miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-490的水平,發(fā)現(xiàn)miRNA-196a、miRNA-30a和miRNA-490這三種miRNAs是FSGS特異的標志物。因此,有必要在臨床上擴大病例,開展前瞻性的研究對上述標志物的臨床應用以進一步的研究驗證。

miRNA-30家族,miR196a、196b在人體的腎臟的含量明顯高于心、肺、肝、脾、結(jié)腸[11]。FSGS患者尿液中miRNA-196a和miRNA-30a含量的增加可能反映了腎臟組織固有細胞的表達情況。近期研究發(fā)現(xiàn),miRNA-30參與了足細胞損傷[14],足細胞Dicer敲除小鼠的腎小球基因表達譜芯片顯示在190個基因表達上調(diào),其中很多是miRNA-30家族的靶基因,推測miRNA-30家族可能參與了Dicer敲除小鼠的足細胞損傷的過程[14-16]。FSGS患者腎小球中表達下降,在嘌呤霉素誘導的大鼠腎病模型中表達下降,進一步研究發(fā)現(xiàn)miRNA-30能通過抑制p53和notch1的激活保護足細胞避免損傷。體內(nèi)和體外實驗還發(fā)現(xiàn),糖皮質(zhì)激素能維持miRNA-30在足細胞中的表達,發(fā)揮足細胞保護作用(未發(fā)表資料)。

在脊椎動物基因組中miRNA-196家族位于HOX基因簇上[17],miRNA-196的進化行為上與HOX基因非常相似[18],HOX基因與胚胎發(fā)育密切相關(guān)[19],研究證實miRNA-196a在胚胎發(fā)育中起著重要的作用[20,21]。miRNA-196a還參與了多種腫瘤的病理生理過程,參與調(diào)節(jié)免疫及細胞的增生[22]。血清miRNA-196a水平在胰腺導管腺癌的患者中顯著升高,腫瘤切除之后表達水平下降,并且miRNA-196a水平與患者的中位生存時間相關(guān)[23],提示血清miRNA-196a可能是診斷的潛在生物標志物。在腎透明細胞癌中,miRNA-196a表達下調(diào)[24],在高血壓腎臟病中,miR196a在腎皮質(zhì)中表達升高,在腎臟髓質(zhì)中無顯著變化[25]。本研究發(fā)現(xiàn)活動性FSGS患者尿液miRNA-196a水平升高,該變化與疾病發(fā)病機制之間的關(guān)聯(lián)尚需進一步研究闡明。

miRNA-155參與多種生理和病理過程,功能包括造血細胞的分化、免疫、炎癥、腫瘤及心血管疾病等等[26-28]。體內(nèi)研究發(fā)現(xiàn)miRNA-155通過影響Ⅰ型干擾素信號影響CD8+T細胞的應答和清除病毒的能力[29]。沉默miRNA-155通過上調(diào)腎腫瘤細胞BACH1,抑制腫瘤細胞增生和遷移,誘導細胞凋亡[30],IgA腎病患者腎組織和尿液中miRNA-155的表達均升高,且與疾病的嚴重程度相關(guān),提示了miRNA-155參與了腎臟細胞疾病狀態(tài)下的病理過程。在小鼠急性腎損傷模型中,miRNA-155在腎組織中表達升高,在血清和尿液上清中表達下降[31]。上述研究結(jié)果提示,miRNA-155是腎組織損傷后一個共同的反應,本研究也表明無論是FSGS,還是MN和DN,尿液miRNA-155在疾病活動情況下均明顯升高。此外,尿液miRNA-155含量的改變不有可能與患者的全身免疫調(diào)節(jié)異常有關(guān)。

目前尚無關(guān)于miRNA-490在腎臟方面的研究。之前的研究發(fā)現(xiàn)miRNA-490在肝細胞癌細胞中表達上調(diào),體外高表達miRNA-490導致細胞增生、遷移及浸潤能力的增加,有促進上皮細胞轉(zhuǎn)分化的作用[32]。本研究發(fā)現(xiàn)活動性FSGS患者尿液中miRNA-490 水平明顯增高,其在腎臟疾病發(fā)病機制中的作用值得進一步探究。

本研究也存在一些不足之處。首先,未對患者組織miRNAs譜進行檢測,因此,影響了對這幾個miRNAs的變化與FSGS發(fā)病機制之間的聯(lián)系進行討論。其次,缺少FSGS患者血清中miRNAs的同步研究。因此,進一步探尋FSGS患者疾病活動時尿液中miRNA-196a、miRNA-30a和miRNA-490這三種miRNAs的來源及其調(diào)控機制,對于提高FSGS發(fā)病機制的認識和上述三種尿液miRNAs的臨床應用具有重要的意義。

本研究發(fā)現(xiàn)活動性FSGS患者尿液中miRNA-196a、miRNA-30a、miRNA-490水平明顯升高,其水平不僅與疾病活動性密切相關(guān),且與治療反應密切相關(guān),提示尿液中這三種miRNAs,有可能成是判斷FSGS疾病活動和觀察療效的生物標志物。

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