吳明科,劉嶸明,梁麗亞,馬江鋒,2,陳可泉,姜岷
1 南京工業(yè)大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院 材料化學(xué)工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 211816
2 中國(guó)石化揚(yáng)子石油化工有限公司研究院,江蘇 南京 210048
丁二酸,又被稱為琥珀酸,是TCA循環(huán)的中間產(chǎn)物同時(shí)也是厭氧發(fā)酵中碳代謝的終端還原性產(chǎn)物之一,作為一種重要的化工原料和中間體,廣泛應(yīng)用于食品、化學(xué)和醫(yī)藥工業(yè)[1]。相對(duì)于化學(xué)合成法,生物法[2-5]合成丁二酸由于消耗低、污染小、反應(yīng)溫度等優(yōu)點(diǎn),已成為近年來(lái)研究的熱點(diǎn)[6-7]。
大腸桿菌 AFP111是有氧-厭氧兩階段生產(chǎn)丁二酸的潛力菌株[8]。Vemuri等[9]研究了有氧轉(zhuǎn)厭氧時(shí)間節(jié)點(diǎn)對(duì)菌體產(chǎn)丁二酸的影響,姜岷等[10]通過(guò)有氧階段碳限制策略提高細(xì)胞活力,使AFP111產(chǎn)丁二酸量達(dá)到101.2 g/L。但是,隨著厭氧發(fā)酵時(shí)間的延長(zhǎng),菌體的活力不斷降低[11],菌體的產(chǎn)酸速率也不斷下降。Andersson等[12]在發(fā)酵過(guò)程中通過(guò)去除產(chǎn)物丁二酸來(lái)保持菌體的高產(chǎn)酸能力,結(jié)果表明整個(gè) 100 h的厭氧發(fā)酵過(guò)程中丁二酸產(chǎn)量提高達(dá)60%以上。然而丁二酸生產(chǎn)效率明顯降低。文中通過(guò)有氧誘導(dǎo)回收的菌體細(xì)胞,提高菌體轉(zhuǎn)化后的產(chǎn)酸能力,進(jìn)一步提高轉(zhuǎn)化過(guò)程中丁二酸的產(chǎn)量及生產(chǎn)效率。
大腸桿菌 Escherichia coli AFP111 [F+λ-rpoS396 (Am)rph-1 △(pflAB::Cam)ldhA::Kan 95ptsG]由 David P.Clark 教授 (Southern Illinois University)惠贈(zèng)。
1.2.1 種子培養(yǎng)基
有氧搖瓶培養(yǎng)基:蛋白胨 10 g/L,酵母粉5 g/L,NaCl 5 g/L,pH 7.0,氯霉素添加量為25 μg/mL,硫酸卡那霉素添加量 30 μg/mL。
JSM培養(yǎng)基參考文獻(xiàn)[13]。
血清瓶培養(yǎng)基:JSM培養(yǎng)基如前所述。JSM-P培養(yǎng)基為在JSM培養(yǎng)基中去除磷酸鹽,JSM-N培養(yǎng)基為JSM培養(yǎng)基中去除銨鹽,JSM-T培養(yǎng)基為在JSM培養(yǎng)基中去除微量元素,JSM-B培養(yǎng)基為在JSM培養(yǎng)基中去除生物素和VB1,BM培養(yǎng)基為只含無(wú)菌水培養(yǎng)基。
1.2.2 種子培養(yǎng)
將保存于–80 ℃凍存管中的菌株以1%的接種量轉(zhuǎn)接到裝液量為 5 mL的試管中,37 ℃、200 r/min過(guò)夜培養(yǎng)后,以1%的接種量接種到裝液量為100 mL的500 mL搖瓶中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)6 h。
1.2.3 發(fā)酵罐培養(yǎng)
將種子液以10%的接種量接入裝有3 L發(fā)酵培養(yǎng)基的 7.5 L發(fā)酵罐 (BioFlo 110 fermenter;New Brunswick ScientificCo., Edison, N.J.),初糖濃度為30 g/L,12.5%的氨水調(diào)節(jié)pH 6.8, 37 ℃有氧培養(yǎng)至初糖耗盡,流加800 g/L葡萄糖,控制菌體的相對(duì)生長(zhǎng)速率為0.7 h–1至OD600=60;厭氧階段,無(wú)菌過(guò)濾條件下通二氧化碳?xì)怏w,通氣量0.5 L/min,25%的 Na2CO3調(diào)節(jié) pH 6.6,厭氧發(fā)酵 60 h。
1.2.4 細(xì)胞離心回收與轉(zhuǎn)化發(fā)酵
兩階段發(fā)酵結(jié)束,收集發(fā)酵液,離心(5 000 r/min,10 min,4 ℃)獲得細(xì)胞,用雙蒸水懸浮后轉(zhuǎn)入發(fā)酵罐進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)。有氧誘導(dǎo)3 h后,厭氧發(fā)酵條件同上。
細(xì)胞生物量OD600,菌體干重,葡萄糖濃度,有機(jī)酸濃度參考文獻(xiàn)[14],酶活參考文獻(xiàn)[15]。
有氧-厭氧兩階段生產(chǎn)丁二酸時(shí),有氧階段使用JSM培養(yǎng)基主要提供菌體生長(zhǎng)所需營(yíng)養(yǎng)元素,用于菌體細(xì)胞生長(zhǎng),而在厭氧轉(zhuǎn)化過(guò)程中,菌體主要利用葡萄糖進(jìn)行厭氧發(fā)酵產(chǎn)酸,菌體密度不會(huì)增長(zhǎng)[9],JSM 培養(yǎng)基中成分更多起到緩沖鹽作用。因此,優(yōu)化轉(zhuǎn)化培養(yǎng)基成分對(duì)菌體產(chǎn)酸以及發(fā)酵成本降低是十分重要的。
由表1可知,發(fā)酵整個(gè)過(guò)程BM培養(yǎng)基中菌體DCW降低最大,達(dá)到1.6 g/L,其余培養(yǎng)基中菌體DCW變化較小。各個(gè)組分的培養(yǎng)基中菌株耗糖,副產(chǎn)物乙酸量相差不大。當(dāng) BM 培養(yǎng)基為發(fā)酵培養(yǎng)基時(shí),丁二酸得率最高,達(dá)到 93%,且單位細(xì)胞生產(chǎn)率相比于JSM培養(yǎng)基只降低了0.9%,所以采用BM培養(yǎng)基作為轉(zhuǎn)化后培養(yǎng)基。
隨著轉(zhuǎn)化次數(shù)的增加,菌體的產(chǎn)酸速率逐漸降低,而通過(guò)空氣進(jìn)行有氧誘導(dǎo)可以部分恢復(fù)菌體中一些關(guān)鍵酶如異檸檬酸裂解酶[15-16]等活力,以利于菌體進(jìn)行下一次轉(zhuǎn)化過(guò)程產(chǎn)酸。故進(jìn)行了0 h、1 h、3 h和5 h 四個(gè)不同有氧誘導(dǎo)時(shí)間梯度對(duì)菌體產(chǎn)酸的考察。由圖1表明,在0~3 h范圍內(nèi),菌體凈產(chǎn)酸量 (去除厭氧開(kāi)始時(shí)殘留的丁二酸量)和總產(chǎn)酸量隨著有氧誘導(dǎo)時(shí)間的增長(zhǎng)而增加,而繼續(xù)提高有氧誘導(dǎo)時(shí)間至 5 h并沒(méi)有繼續(xù)增加菌體產(chǎn)酸的能力,故選擇3 h為最佳有氧誘導(dǎo)時(shí)間。
由表2可知,3 h誘導(dǎo)后磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶 (PPC),蘋果酸脫氫酶 (MDH)酶活相較于無(wú)誘導(dǎo)條件下分別提高了 31%和 46%,有利于還原性TCA循環(huán)支路產(chǎn)丁二酸,而異檸檬酸裂解酶 (ICL)酶活增加了7倍,表明乙醛酸途徑得到了加強(qiáng),從而有利于丁二酸的生成,使丁二酸的產(chǎn)量提高。
表1 厭氧血清瓶發(fā)酵后參數(shù)的測(cè)定結(jié)果Table 1 Results of these parameters on anaerobic fermentation in sealed bottles
圖1 不同有氧誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)菌體產(chǎn)酸的影響Fig. 1 Effect of different aerobic time on the final succinic acid concentration. Net succinic acid equals final succinic acid concentration minus initial succinic acid concentration;total succinic acid equals final concentration.
發(fā)酵罐厭氧發(fā)酵 60 h,丁二酸產(chǎn)量達(dá)到68.01 g/L,單位生產(chǎn)率為112.88 mg/(g·h)。此時(shí)通過(guò)離心收集菌泥,用無(wú)菌水洗滌稀釋OD600至60進(jìn)行有氧誘導(dǎo),結(jié)束后開(kāi)始重新發(fā)酵。由表3可知,重新發(fā)酵后丁二酸產(chǎn)量分別為55.9 g/L和45.6 g/L,單位菌體的生產(chǎn)速率分別為92.84 mg/(g·h)和 76.30 mg/(g·h)。整個(gè)過(guò)程 (菌體有氧生長(zhǎng)時(shí)間計(jì)算在內(nèi))產(chǎn)酸速度達(dá)到0.81 g/(L·h),相比于無(wú)有氧誘導(dǎo)條件下發(fā)酵時(shí)的產(chǎn)酸速度0.72 g/(L·h)提高了13%,總產(chǎn)量提高了19 g/L。
表2 厭氧發(fā)酵開(kāi)始時(shí)酶活的測(cè)定Table 2 Enzyme activities of cells at the beginning of anaerobic succinate production
表3 發(fā)酵結(jié)果各參數(shù)的測(cè)定Table 3 Result of parameters on anaerobic fermentation
[1]Willke T, Cukalovic KD. Industrial bioconversion of renewable resources as an alternative to conventional chemistry. Appl Microbiol Biotechnol, 2002, 66(2):131–142.
[2]Lee PC, Lee SY, Hong SH, et al. Batch and continuous cultures of Mannheimia succinicproducens MBEL55E for the production of succinic acid from whey and corn steep liquor. Bioprocess Biosyst Eng, 2003, 26(1): 63–67.
[3]Clark DP. The fermentation pathways of Escherichia coli. FEMS Microbiol Rev, 1989, 63(3): 223–234.
[4]Yuzbashev TV, Yuzbasheva EY, Sobolevskaya TI, et al.Production of succinic acid at low pH by a recombinant strain of the aerobic yeast Yarrowia lipolytica.Biotechnol Bioeng, 2010, 107(4): 673–682.
[5]Lee PC, Lee WG, Lee SY, et al. Fermentative production of succinic acid from glucose and corn steep liquor by Anaerobiospirillum succiniciproducens. Biotechnol Bioprocess Eng, 2000, 5(5): 379–381.
[6]Cukalovic A, Stevens CV. Feasibility of production methods for succinic acid derevatives: a marriage of renewable resources and chemical technology. Biofuels Bioprod Biorefin, 2008, 2(6): 505–529.
[7]Song H, Lee SY. Production of succinic acid by bacterial fermentation. Enzyme Microb Technol, 2006,39(3): 352–361.
[8]Vemuri GN, Eiteman MA, Altman E. Effects of growth mode and pyruvate carboxylase on succinic acid production by metabolically engineered strains of Escherichia coli. Appl Environ Microbiol, 2002, 68(4):1715–1727.
[9]Vemuri GN, Eiteman MA, Altman E. Succinate production in dual-phase Escherichia coli fermentations depends on the time on transition from aerobic to anaerobic conditions.J Ind Microbiol Biot, 2002, 28(6): 325–332.
[10]Jiang M, Liu S, Ma J, Chen K, et al. Effect of growth phase feeding strategies on succinate production by metabolically engineered E. coli. Appl Environ Microbiol, 2010, 76(4): 1298–1300.
[11]Warnecke T, Gill RT. Organic acid toxicity, tolerance,and production in Escherichia coli biorefining applications. Microb Cell Fact, 2005, 4: 25.
[12]Andersson C, Petrova E, Berglund K, et al. Maintaining high anaerobic succinic acid productivity by product removal. Bioprocess Biosyst Eng, 2010, 33(6): 711–718.
[13]Lu S, Eiteman MA, Altman E. Effect of CO2on succinate production in dual-phase Escherichia coli fermentation. J Biotechnol, 2009, 143(3): 213–223.
[14]Liu RM, Ma JF, Liang LY, et al. Effect of overexpression of nicotinic acid phosphoribosyl transferase on succinic acid production in Escherichia coli NZN111. Chin J Biotech, 2011, 27(10): 1438–1447(in Chinese).劉嶸明, 馬江峰, 梁麗亞, 等. 過(guò)量表達(dá)煙酸轉(zhuǎn)磷酸核糖激酶對(duì)大腸桿菌 NZN111產(chǎn)丁二酸的影響. 生物工程學(xué)報(bào), 2011, 27(10): 1438–1447.
[15]Wu H, Li ZM, Li Z, et al. Improved succinic acid production in the anaerobic culture of an Escherichia coli pflB ldhA double mutant as a result of enhanced anaplerotic activities in the preceeding aerobic culture.Appl Microbiol Bitotechnol, 2007, 73(24): 7837–7843.
[16]Wui H, Li ZM, Zhou L, et al. Enhanced anaerobic succinic acid production by Escherichia coli NZN111 aerobically grown on gluconeogenic carbon sources.Enzyme Microb Technol, 2009, 44(3): 165–169.