巨少華, 代 淵, 王 平, 徐世軍△
(1.四川省中藥資源系統(tǒng)研究與開發(fā)利用國家重點實驗室培育基地,成都 611137;2.成都中醫(yī)藥大學(xué),成都 611137)
類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)是一種以關(guān)節(jié)滑膜炎為主的全身性自身免疫性疾病,以滑膜增生、慢性侵蝕性炎癥和自身免疫進(jìn)程為特征,常常累及周圍關(guān)節(jié)[1]。其病理表現(xiàn)主要為由免疫反應(yīng)引起的滑膜炎、增生和肉芽浸潤,從而破壞關(guān)節(jié)的軟骨面、軟骨下骨質(zhì)、關(guān)節(jié)囊、韌帶和肌腱組織,逐漸導(dǎo)致關(guān)節(jié)的強直、畸形和功能嚴(yán)重受損,表現(xiàn)為慢性對稱性的關(guān)節(jié)炎[2]。我國RA患病率為0.32~0.36%左右[3],世界上約有1%的人受其影響[4]。近年來對于RA發(fā)病機制的認(rèn)知和治療策略有了顯著的改善[5],最新的生物制劑如TNF-α針等應(yīng)用治療RA取得了一定的進(jìn)展,但還是沒有徹底治愈此類疾病。在過去的幾年,人們發(fā)現(xiàn)RA滑膜成纖維細(xì)胞(rheumatoid arthritis synovialbroblasts,RASF)為RA病情的發(fā)展和關(guān)節(jié)破壞的關(guān)鍵因素。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),在沒有細(xì)胞免疫和體液免疫的情況下,RASF依舊可保持其活化表型[6]并破壞軟骨,且與正?;こ衫w維細(xì)胞的形態(tài)和基因表達(dá)模式不同[7],表觀遺傳修飾在RA的病程變化中扮演了重要的角色。
表觀遺傳學(xué)(epigenetics)是傳統(tǒng)遺傳學(xué)的分支,最早由英國科學(xué)家Waddington于1942年提出[8]。其涵義為DNA序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達(dá)與功能發(fā)生改變,并產(chǎn)生可遺傳的表型,在生物體內(nèi)從一代傳到另一代[9,10]。這種現(xiàn)象首先在植物中被發(fā)現(xiàn)[11],現(xiàn)已擴(kuò)大到酵母、果蠅、小鼠和人類等[12~14]。表觀遺傳學(xué)主要有以下調(diào)節(jié)機制,即DNA甲基化[15]、組蛋白甲基化及乙?;痆16]及非編碼RNA[17]。 本文主要從RASF的表觀遺傳修飾,特別是不同的表觀遺傳修飾在RA發(fā)展中的作用進(jìn)行闡述。
DNA甲基化是由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶催化S腺苷甲硫氨酸作為甲基供體,將胞嘧啶轉(zhuǎn)化為5-甲基胞嘧啶的反應(yīng)[18]。DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)的一個重要修飾,在哺乳動物中DNA甲基化主要發(fā)生在CpG二核苷酸上,涉及整個基因組70~80%的CpG位點[19]。生物體一生中都發(fā)生著DNA甲基化模式的改變,一些變化可能是環(huán)境改變的生理反應(yīng),另外一些變化可能與惡性轉(zhuǎn)化或細(xì)胞老化等病理進(jìn)程有關(guān)。
DNA甲基化模式的可繼承性使基因組的表觀遺傳標(biāo)記在大量的細(xì)胞分裂過程中得以穩(wěn)定,從而建立了一種細(xì)胞記憶的形式。近來研究發(fā)現(xiàn),RA患者存在基因組DNA的廣泛低甲基化,尤其是滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)內(nèi)的DNA長散布核元件(LINE-1)啟動子上富含GC的CpG島序列,其發(fā)生低甲基化作用導(dǎo)致某些基因的異常表達(dá),從而參與RA的全身及關(guān)節(jié)局部炎癥[20]。研究者發(fā)現(xiàn),RA組織中正常沉默逆轉(zhuǎn)錄L1因子存在異常表達(dá),用甲基化試劑5-氮-2’-脫氧胞苷培養(yǎng)滑膜成纖維細(xì)胞(SF)的誘導(dǎo)治療,揭示了DNA低甲基化在RA發(fā)病過程中起到了功能性作用[21]?;谝陨羡E象,研究人員對類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)和類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎組織全部DNA低甲基化進(jìn)行檢測,并在低甲基化環(huán)境中培養(yǎng)正常滑膜成纖維細(xì)胞得到了與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)相類似的活化表型[22]。所有DNA低甲基化被證明是由于類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)多胺代謝的增加和S-腺苷-L-甲硫氨酸水平下降所致[23]。另外,除了在RA中DNA甲基化模式有所改變外,單個基因例如趨化因子(CXC基序)、配體12(CXCL-12)的啟動子區(qū)域也發(fā)生甲基化[24]。最近研究表明,單一CpG序列中IL -6[25,26]和IL-10[27,28]基因的啟動子去甲基化與基因表達(dá)水平有關(guān),因此有助于在疾病過程中細(xì)胞因子水平的提高,這也反映了DNA甲基化與RA發(fā)病過程中炎癥的相關(guān)起因。
分子和遺傳學(xué)研究都表明DNA胞嘧啶甲基化與沉默基因有關(guān),并且在諸如X染色體失活、基因印記等事件中起重要作用。DNA甲基化參與RA發(fā)病機制的另一項研究主要是對女性第2個X染色體沉默進(jìn)行調(diào)查,這項研究發(fā)現(xiàn)了在RA患者中傾斜性XCI狀態(tài)升高。而隨機XCI,至少有80%的細(xì)胞表現(xiàn)出相同的X染色體失活[29],說明XCI嵌合體參與了RA的發(fā)病,并且這也可能是為什么RA在女性中更為普遍的原因。
組蛋白包括組蛋白 H1、H2A、H2B、H3和H4,H2A、H2B、H3和 H4組蛋白各2個分子形成1個8聚體, 組蛋白H1起到連接的作用, 把每個核小體連接到一起。組蛋白通過裝入核小體核心部分以包裝DNA,使DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)環(huán)繞其上。組蛋白在進(jìn)化中進(jìn)一步多樣化為各種變體,產(chǎn)生了具有表觀遺傳學(xué)效果的染色質(zhì)分化。組蛋白修飾包括組蛋白的乙?;c去乙酰化、甲基化與去甲基化、組蛋白的磷酸化及泛素化,這些修飾因素單一或共同作用來調(diào)節(jié)基因的表達(dá)與功能的發(fā)揮[30]。在RA中組蛋白主要通過乙酰化、去乙酰化和甲基化參與病情的發(fā)展。
組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和組蛋白去乙?;?HDACs)相互調(diào)節(jié)細(xì)胞蛋白乙?;癄顟B(tài)。人類的18種HDACs已經(jīng)被確定并分為4種類型(表1),其抑制劑常被用于研究RA的發(fā)病機制。HATs和HDACs不僅針對組蛋白,而且還針對其他蛋白質(zhì)如轉(zhuǎn)錄因子NF-κB和信號傳導(dǎo)轉(zhuǎn)錄激活因子3。這些轉(zhuǎn)錄因子在炎癥過程中扮演著重要的角色,同時參與了RA的發(fā)病過程。在對關(guān)節(jié)炎的研究中發(fā)現(xiàn),與正常個體比較,RA滑膜組織中總組蛋白酶去乙?;富钚栽黾?,且總滑膜組蛋白去乙?;富钚院虷DAC1表達(dá)與TNF-α含量密切相關(guān)。TNF-α對類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞的刺激導(dǎo)致細(xì)胞滑膜組蛋白去乙?;富钚院虷DAC1表達(dá)暫時性的增加。由TNF-α刺激的組蛋白去乙酰化酶活性與表達(dá)的時序變化與滑膜成纖維細(xì)胞因子信號蛋白相一致,包括核因子-κB-B(NF-κB)p65、JAK / STAT信號混合物、AP -1 和p53,因此在RA滑膜成纖維細(xì)胞中,組蛋白去乙?;敢种苿┳柚筃F-κB p65的激活[31],基因調(diào)控的表觀遺傳機制認(rèn)為這有助于對免疫介導(dǎo)的炎癥性疾病復(fù)雜病理的認(rèn)識。Nishida和他同事的研究結(jié)果證實,HDAC抑制劑FK228通過誘導(dǎo)P21和P16基因啟動子的乙?;瘉硪种芌ASF的增殖[32]。高劑量的TSA和Nicotinamide可以使RA巨噬細(xì)胞誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[33]。因此,HDAC抑制劑可能對RA滑膜增生產(chǎn)生積極的影響:一方面通過抑制RASF的增殖,另一方面在巨噬細(xì)胞中誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。炎癥部位組蛋白去乙酰化酶活性降低與炎癥部位疾病的嚴(yán)重程度、炎癥細(xì)胞因子產(chǎn)生和糖皮質(zhì)激素抵抗有一定的相關(guān)性,組蛋白去乙?;富钚越档涂赡苡兄赗A病理認(rèn)識和在未來使用組蛋白去乙?;敢种苿A患者進(jìn)行抵抗治療[34]。
關(guān)節(jié)炎動物模型已證明HDAC抑制劑在體內(nèi)的有益效果[32,35~38]。自身抗體介導(dǎo)的關(guān)節(jié)炎小鼠模型全身HDAC抑制劑FK228給藥減少了關(guān)節(jié)腫脹、滑膜炎癥和骨與軟骨的破壞[32]。在CIA關(guān)節(jié)炎大鼠和小鼠中研究了HDAC抑制劑SAHA和MS-275的預(yù)防性和治療性影響,這項研究得出HDAC抑制劑是一種創(chuàng)新的RA治療策略的結(jié)論[35]。在同一模型中,TSA的量效可以減少關(guān)節(jié)炎的臨床體征。筆者觀察到組蛋白H4乙酰化細(xì)胞、MMP1(TIMP1)的組織抑制因子、陽性細(xì)胞分別增加,免疫組化染色檢測到MMP3和MMP13的陽性軟骨細(xì)胞信號降低[36]。此外,HDAC抑制劑丙戊酸(VPA)能顯著降低CIA小鼠的發(fā)病率和嚴(yán)重性。這些影響通過改善CD25+FOXP3+調(diào)控的T細(xì)胞的功能來發(fā)揮作用,而CD25+FOXP3+調(diào)控的T細(xì)胞在RA患者中是有缺陷的[37]。
在RA發(fā)病機制中,除了乙?;酝膺€有其他組蛋白修飾作用外,研究發(fā)現(xiàn)了類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)中組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶(EZH2)的過度表達(dá)。EZH2是多梳基因家族抑制復(fù)合體2的催化亞基,它給特定沉默基因H3K27添加了三甲基標(biāo)記物。作為一種MMTV整合位點(Wnt)信號通路抑制劑,它的過度表達(dá)導(dǎo)致相關(guān)蛋白分泌減少,在RA發(fā)展中起著重要作用,并與關(guān)節(jié)炎癥發(fā)病機制有一定的牽連[39]。
表1 組蛋白去乙酰化酶的分類及其抑制劑[40]
人類組蛋白去乙?;?HDACs)分為4個小組。SAHA為辛二酰苯胺異羥肟酸,SIRT為sirtuin,TSA為曲古抑菌素A,VPA為丙戊酸。
miRNA是大小約22個核苷酸(nts)的內(nèi)源性非編碼小RNA,對基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,參與細(xì)胞增殖、分化、代謝和凋亡等過程。它通過結(jié)合靶基因的3’非翻譯區(qū)起到基因表達(dá)翻譯后的阻遏作用,這導(dǎo)致了翻譯過程的降解或抑制。
這些miRNA分子在沒有基因編碼序列改變的情況下能夠改變基因和蛋白的表達(dá), 所以它們在表觀遺傳修飾中有著重要作用。對類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)和骨關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(OASF)中260個差異表達(dá)的miRNA進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)中miRNA一列數(shù)組存在過度表達(dá),最為突出的是miR-203。RASF中miR -203的過度表達(dá)導(dǎo)致MMP1表達(dá)增加并提高了IL-6的分泌率[41]。另外,類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)中下調(diào)和受啟動子區(qū)域甲基化調(diào)節(jié)的miRNA是miR-34A*,miR-34A*表達(dá)下降導(dǎo)致了其靶點伴X染色體抑制凋亡蛋白的上調(diào),從而有助于類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖維細(xì)胞(RASF)抗凋亡表型的產(chǎn)生[42]。
通過對RASF中DNA甲基化、組蛋白修飾、miRNA的研究,我們發(fā)現(xiàn)表觀遺傳學(xué)與RA的病理機制密切相關(guān)。一些研究表明,表觀遺傳學(xué)對類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎滑膜成纖細(xì)胞內(nèi)在表型的激活起一定作用[43],這些同時也可以作為動物模型中探究RA表觀遺傳學(xué)機制的數(shù)據(jù)點。現(xiàn)在仍舊需要更多數(shù)據(jù)來闡明何種修飾引起RA的發(fā)生,何種遺傳變化產(chǎn)生于慢性疾病中。雖然在RA中DNA甲基化的不同模式圖變得越來越清晰,但仍有一些表觀遺傳修飾尚未研究,或者已發(fā)現(xiàn)的修飾在RA發(fā)病機制中發(fā)揮何種作用。表觀遺傳學(xué)和miRNA介導(dǎo)的改變與疾病的研究正變得越來越重要,這些進(jìn)程直接參與基因的異常表達(dá),并最終確定細(xì)胞功能和藥理學(xué)的可逆性。
遺傳和環(huán)境因素在風(fēng)濕免疫疾病中扮演著重要角色,而這兩者也在同卵雙胞胎的部分一致性中得到體現(xiàn)。此外,環(huán)境在確定自身免疫性疾病中起著關(guān)鍵作用。許多環(huán)境因素,包括暴露于化學(xué)品、煙草煙霧、輻射、紫外線(UV)光、傳染性病原體等其他外部因素,都與風(fēng)濕免疫疾病的發(fā)展有關(guān)。目前研究表明,這些環(huán)境因素直接或間接誘發(fā)表觀遺傳與細(xì)胞功能的變化,調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。因此,表觀遺傳學(xué)提供了一個源自分子的機制來解釋環(huán)境對自身免疫性疾病發(fā)展上的影響[44]。環(huán)境、表觀遺傳狀態(tài)和自身免疫性風(fēng)濕性疾病之間的密切關(guān)系也常利用動物模型來例證,這種類型的研究為疾病的產(chǎn)生、發(fā)展和治療成效提供了新的臨床鑒定指標(biāo)。
總之,表觀遺傳學(xué)的認(rèn)識和研究已經(jīng)使人類在基因方面邁上了一個新的臺階。表觀遺傳學(xué)將作為新的武器,對一些重大的和難以攻克的醫(yī)學(xué)、遺傳學(xué)難題做出解答。RA的表觀遺傳學(xué)研究任重而道遠(yuǎn),希望在未來對RA表觀遺傳調(diào)節(jié)機制的詳盡掌握有助于開發(fā)出新的藥物,能夠預(yù)防或者徹底根治RA。
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