司曉光,郭 剛,王小霞,鄭春陽,高 強,*
(1.工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點實驗室,天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457;2.天津強微特生物科技有限公司,天津 300384)
丙酮酸是一種重要的有機酸,廣泛應(yīng)用于化工、制藥、農(nóng)用化學(xué)品和營養(yǎng)保健品等領(lǐng)域,近年來全球市場需求量不斷增長[1-2]。丙酮酸的工業(yè)生產(chǎn)方法主要有化學(xué)合成法、酶轉(zhuǎn)化法和微生物發(fā)酵法。化學(xué)合成法是利用化學(xué)方法在液相或氣相反應(yīng)條件下中將酒石酸或乳酸氧化為丙酮酸脂[3],進(jìn)一步水解為丙酮酸,但該方法成本較高且污染嚴(yán)重。酶轉(zhuǎn)化法利用微生物細(xì)胞中的酶系將乳酸脫氫氧化成丙酮酸[4],但該方法成本高,無法形成工業(yè)性生產(chǎn)。微生物發(fā)酵法生產(chǎn)丙酮酸具有效率高、污染小、原料葡萄糖成本低等優(yōu)點,是一條極具發(fā)展前景的工業(yè)化生產(chǎn)丙酮酸的方法。但微生物產(chǎn)能低、可利用碳源種類有限等問題成為微生物發(fā)酵生產(chǎn)丙酮酸的瓶頸。為此篩選增殖速度快、丙酮酸產(chǎn)量高和可利用碳源廣泛的菌株成為了迫在眉睫的問題,國內(nèi)外研究人員不斷從自然界中篩選優(yōu)良菌株、優(yōu)化培養(yǎng)基來提高產(chǎn)量,或者嘗試?yán)米贤饩€、化學(xué)誘變劑等方法誘變獲取高產(chǎn)菌株,雖然取得一些成效但還無法滿足市場的需求,因此需要尋找更有效的丙酮酸高產(chǎn)菌株選育方法顯得尤為重要[5]。
目前,我國在丙酮酸的發(fā)酵生產(chǎn)方面的研究處于國際先進(jìn)水平。李寅等篩選到一株以葡萄糖為底物生產(chǎn)丙酮酸的光滑球擬酵母WSH-IP12,發(fā)酵55h,丙酮酸含量達(dá)到57.3g/L[6];張澎湃通過誘變篩選得到一株高產(chǎn)丙酮酸的突變株TK418,經(jīng)條件優(yōu)化后丙酮酸產(chǎn)量較出發(fā)菌株提高了35.60%[7];胡曉冰等研究了磷對丙酮酸發(fā)酵的影響[8];趙博、王欽宏等對產(chǎn)丙酮酸的光滑球擬酵母菌3672進(jìn)行高溫定向優(yōu)化,丙酮酸含量達(dá)到28g/L,發(fā)酵時間有36h變?yōu)?4h,發(fā)酵溫度由30℃提高到40℃[9]。
常壓室溫等離子(ARTP)誘變系統(tǒng)是近年來發(fā)展起來的微生物基因組快速誘變方法。ARTP誘變系統(tǒng)是利用等離子體中的活性粒子作用于微生物,使微生物細(xì)胞壁和細(xì)胞膜的結(jié)構(gòu)及通透性改變,并引起基因損傷,進(jìn)而使微生物基因序列及其代謝網(wǎng)絡(luò)顯著變化,最終導(dǎo)致微生物產(chǎn)生突變[10-11]。ARTP具有射流溫度低、產(chǎn)生的等離子體均勻、無需真空裝置、操作簡單、成本低、與生物大分子和細(xì)胞作用明顯等優(yōu)點[12],已成為快速突變微生物基因組的有效方法。研究表明,ARTP誘變育種技術(shù)可以快速地誘變細(xì)菌、微藻、真菌、酵母等微生物[13],突變率高,并易獲得遺傳穩(wěn)定性良好的突變株[14]。本研究利用新型常壓室溫等離子體(ARTP)誘變產(chǎn)丙酮酸的光滑球擬酵母(Torulopsis glabrata)Tp19,建立了應(yīng)用CaCO3篩選平板透明圈與菌落直徑比與100孔板法快速簡便篩選突變株的方法,并通過搖瓶發(fā)酵確定了突變菌株的遺傳穩(wěn)定性,以期獲得遺傳穩(wěn)定性良好的丙酮酸高產(chǎn)突變菌株。
光滑球擬酵母(Torulopsis glabrata)Tp19(NA-+Bio-+TPP-+Pdx-) 天津科技大學(xué)生化工程研究室保藏;葡萄糖、蛋白胨、KH2PO4、MgSO4、(NH4)2SO4、MgSO4、煙酸、鹽酸硫胺素、生物素、鹽酸吡哆醇 分析純;丙酮酸 色譜純。
ARTP-II誘變系統(tǒng) 北京思清源生物科技有限公司;高效液相色譜儀Agilent 1200 美國安捷倫科技公司;紫外可見分光光度計TU-1810 北京普析通用儀器有限責(zé)任公司;Bioscreener全自動生長曲線分析儀FP-1100-C Oy Growth Curves Ab Ltd.;恒溫?fù)u床HYG 上海欣蕊自動化設(shè)備有限公司;SBA-40E生物傳感儀 山東省科學(xué)院生物研究所。
1.2.1 培養(yǎng)基
1.2.1.1 CaCO3篩選培養(yǎng)基 葡萄糖40g,蛋白胨10g,KH2PO41g,MgSO4·7H2O 0.5g,煙酸8mg,鹽酸硫銨素20μg,鹽酸吡哆醇0.5mg,生物素10μg,瓊脂20g,CaCO35g,蒸餾水定容至1L。
1.2.1.2 種子培養(yǎng)基 葡萄糖30g,蛋白胨10g,玉米漿5mL,KH2PO41g,MgSO4·7H2O 0.5g,蒸餾水定容至1L。
1.2.1.3 發(fā)酵培養(yǎng)基[15]葡萄糖80g,硫酸銨8g,KH2PO41g,MgSO4·7H2O 0.5g,煙酸8mg,鹽酸硫胺素20μg,生物素10μg,鹽酸吡哆醇0.5mg,CaCO330g(搖瓶12h添加),金屬離子母液5mL,蒸餾水定容至1L,pH5.6。
1.2.2 培養(yǎng)方法[15]
1.2.2.1 種子培養(yǎng) 從斜面培養(yǎng)基挑取1環(huán)活化好的菌種接種到含有50mL種子培養(yǎng)基的500mL三角瓶中,30℃、200r/min搖床振蕩培養(yǎng)20h。
1.2.2.2 發(fā)酵培養(yǎng) 以5%接種量接入含有50mL發(fā)酵培養(yǎng)基的500mL三角瓶中,30℃、200r/min搖床發(fā)酵培養(yǎng)36h。
1.2.2.3 100孔板種子/發(fā)酵培養(yǎng) 取40μL種子液加入含有360μL種子培養(yǎng)基/發(fā)酵培養(yǎng)基,置于Bioscreener全自動生長曲線分析儀中培養(yǎng),培養(yǎng)條件見表1。
表1 Bioscreener操作條件Table 1 Operating conditions using Bioscreener
1.3.1 菌體前培養(yǎng) 取上述活化的種子液,以5%的接種量按上述培養(yǎng)方法培養(yǎng)8~9h,使細(xì)胞處于對數(shù)繁殖期。
1.3.2 菌懸液制備 取1mL上述培養(yǎng)液5000r/min室溫下離心5min,收集菌體,分別用1mL生理鹽水洗2次,然后將菌體重新懸浮于適量的無菌水中,制成細(xì)胞濃度為1×107cfu/mL的菌懸液。
1.3.3 ARTP誘變 取上述菌懸液10μL涂布于不銹鋼載片表面,晾干后移至ARTP-II誘變系統(tǒng)中誘變。誘變條件[16]見表2。
表2 ARTP誘變條件Table 2 Operating conditions using ARTP
將用ARTP處理后的載片置于含1mL生理鹽水的2mL離心管振蕩洗脫1min,涂布種子培養(yǎng)基平板(種子培養(yǎng)基加2%瓊脂)活菌計數(shù)。
1.3.4 突變株初篩 取誘變液稀釋涂布CaCO3篩選培養(yǎng)基平板,30℃培養(yǎng)36h,挑選R值(R值:透明圈直徑/菌落直徑)較大的單菌落接種到100孔板,30℃培養(yǎng)24h測定丙酮酸產(chǎn)量。
1.3.5 突變株復(fù)篩 將初篩產(chǎn)酸量較高的突變株搖瓶發(fā)酵36h,測定發(fā)酵液殘?zhí)恰⒈岷挺?酮戊二酸的含量。
1.4.1 菌體濃度測定 稀釋發(fā)酵液,測定660nm處吸光度值。
1.4.2 致死率計算 致死率(%)=100×(對照組活菌數(shù)-誘變組活菌數(shù))/對照組活菌數(shù)
1.4.3 葡萄糖測定 用配有葡萄糖氧化酶膜的SBA-40E生物傳感儀檢測。
1.4.4 丙酮酸與α-酮戊二酸測定 高效液相色譜(HPLC)法,色譜柱Agilent ZORBAX SB-C18(4.6×250mm,5μm);流動相0.1%H3PO4溶液;流速1.0mL/min;檢測波長210nm。
常壓室溫等離子體產(chǎn)生的活性粒子能夠破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu),也能夠穿過細(xì)胞壁到達(dá)細(xì)胞內(nèi)打斷基因、蛋白質(zhì)分子等,從而導(dǎo)致大部分微生物死亡[17]。但少數(shù)經(jīng)過ARTP照射過的微生物會通過本身的自動修復(fù)系統(tǒng)修復(fù)存活,并在這一過程中產(chǎn)生基因突變,因此選擇合適的ARTP誘變條件能夠?qū)崿F(xiàn)微生物的快速誘變育種。
出發(fā)菌株菌懸液經(jīng)不同的常壓室溫等離子束照射時間處理后,生理鹽水洗脫并稀釋涂布,進(jìn)行平板計數(shù)。不經(jīng)過照射處理的對照組菌懸液以同樣的方法進(jìn)行平板計數(shù),計算得到每個照射時間下的致死率(圖1)。
由圖1可知,常壓室溫等離子體與光滑球擬酵母Tp19菌株的致死率之間存在著明顯的劑量效應(yīng)關(guān)系。ARTP處理80s時致死率達(dá)到90%以上;處理160s時致死率達(dá)到100%。由現(xiàn)代育種理論可知,當(dāng)微生物菌種的致死率在90%~95%范圍時,正突變率最高,因此選擇80s為ARTP最佳誘變處理時間,此時致死率為91.7%。
圖1 不同ARTP照射時間下的致死率曲線Fig.1 Influence of exposure time on the fatality rate
2.2.1 突變株初篩 誘變80s的處理液稀釋后涂布于CaCO3篩選平板,挑選出22株R值較大的單菌落,接種于100孔板并置于Bioscreener全自動生長曲線分析儀中培養(yǎng)20h,取40μL培養(yǎng)液接種于含有360μL發(fā)酵液的100孔板中,三組平行發(fā)酵測定24h丙酮酸和α-酮戊二酸含量,結(jié)果如圖2所示。
從圖2可以看出,CaCO3平板初篩得到突變株的丙酮酸產(chǎn)量與出發(fā)菌株TP19相比,只有8株菌增加,而其余14株菌降低。這一方面表明了CaCO3平板只能作為對產(chǎn)丙酮酸菌株的初篩,并不能作為精確衡量菌株產(chǎn)丙酮酸能力大小的依據(jù);另一方面也說明對丙酮酸產(chǎn)量進(jìn)行定量測定,即對突變株復(fù)篩是必要的。
圖2 突變株和出發(fā)菌株100孔板24h發(fā)酵時丙酮酸和α-酮戊二酸產(chǎn)量Fig.2 The pyruvate and α-ketoglutaric acid production of the mutants and the original strain in 100-well plate at 24h cultivation
2.2.2 突變株復(fù)篩 經(jīng)過以上高通量篩選獲得8株突變株進(jìn)行復(fù)篩,結(jié)果如圖3。從圖中可以看出有5個突變株(A109,A214,A302,A311,A605)的丙酮酸產(chǎn)量高于出發(fā)菌株Tp19,同時突變株的α-酮戊二酸產(chǎn)量低于出發(fā)菌株。這說明丙酮酸產(chǎn)量的提高是由于丙酮酸進(jìn)入三羧酸循環(huán)的代謝流降低。作為糖酵解途徑的最終產(chǎn)物,丙酮酸又是三羧酸循環(huán)的代謝起點,處于代謝途徑中的關(guān)鍵代謝支點。因此,在保證細(xì)胞正常代謝的前提下盡可能減少丙酮酸的降解和轉(zhuǎn)化也是提高丙酮酸產(chǎn)量的有效方法。與此同時,在丙酮酸分離提取階段應(yīng)盡可能降低非目標(biāo)產(chǎn)物的含量以提高丙酮酸提取效率,因此較低的α-酮戊二酸可以降低提取成本,提高經(jīng)濟效益[18]。
圖3 突變株和出發(fā)菌株搖瓶發(fā)酵36h的丙酮酸和α-酮戊二酸產(chǎn)量Fig.3 The pyruvate and α-ketoglutaric acid production of the mutants and the original strain at 36h shaking flask cultivation
誘變選育的突變體在傳代中可能會出現(xiàn)表型延遲現(xiàn)象,這樣就會導(dǎo)致篩選的高產(chǎn)菌株經(jīng)過傳代后很快出現(xiàn)生產(chǎn)性狀“衰退”即丙酮酸產(chǎn)量下降。因此,對篩選到得3株高產(chǎn)突變株A214,A302與A311連續(xù)轉(zhuǎn)接7代進(jìn)行遺傳穩(wěn)定性傳代驗證,結(jié)果見圖4。
圖4 突變株的遺傳穩(wěn)定性檢測Fig.4 Genetic stability of mutant strains
工業(yè)生產(chǎn)中的優(yōu)良的菌株不僅要有較高的目的產(chǎn)物生成率和原料利用率,而且還應(yīng)滿足生產(chǎn)性能穩(wěn)定的要求,即相同的生產(chǎn)條件下菌株性能保持不變。由圖4可以看出,突變株A214產(chǎn)丙酮酸的遺傳性能穩(wěn)定,發(fā)酵36h的丙酮酸產(chǎn)量保持在(37.43±0.16)g/L,比出發(fā)菌株(32.92±0.34)g/L提高了13.69%。表明該突變株產(chǎn)丙酮酸性能穩(wěn)定,既可以滿足工業(yè)生產(chǎn)的要求,也可以作為后續(xù)實驗的出發(fā)菌株。突變株A302雖然遺傳性能穩(wěn)定,但是丙酮酸的產(chǎn)量較A214低,而A311的丙酮酸產(chǎn)量起伏較大,不適合工業(yè)化應(yīng)用。
本研究表明,ARTP誘變育種方法能夠有效的誘變光滑球擬酵母(T.glabrata)Tp19菌株,而100孔平板培養(yǎng)可快速篩選產(chǎn)丙酮酸的突變株。通過搖瓶復(fù)篩和遺傳穩(wěn)定性檢測,篩選出了一株丙酮酸的突變株A214,該突變株發(fā)酵36h的丙酮酸產(chǎn)量達(dá)到37.43g/L,比出發(fā)菌株提高了13.69%。說明ARTP誘變系統(tǒng)可以引起光滑球擬酵母Tp19的基因突變,突變株A214丙酮酸產(chǎn)量提高的原因尚不清楚,有待進(jìn)一步研究。本文的實驗結(jié)果是在搖瓶條件下得到的,由于搖瓶培養(yǎng)過程中營養(yǎng)、溶氧和pH等條件不能調(diào)控,接下來需要通過發(fā)酵罐放大培養(yǎng)對突變菌株生產(chǎn)丙酮酸的過程和發(fā)酵特性進(jìn)行分析,并進(jìn)一步優(yōu)化其發(fā)酵條件,為中試和大規(guī)模生產(chǎn)提供基礎(chǔ)。
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