趙滿+李麗芳+王友竹+Elena+N.+Elpidina+朱家穎
摘要:翅芽生長(zhǎng)因子(imaginal disc growth factor,IDGF)是一類調(diào)節(jié)昆蟲發(fā)育和生長(zhǎng)的因子。利用RACE克隆技術(shù),克隆獲得黃粉甲(Tenebrio molitor) IDGF基因,其cDNA序列長(zhǎng)1 465 bp,開放閱讀框?yàn)? 296 bp,可編碼431個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)理論分子量為48.25 ku,等電點(diǎn)為7.63。氨基酸序列同源比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),黃粉甲IDGF與赤擬谷盜(Tribolium castaneum)和蔗根非耳象(Diaprepes abbreviatus)的IDGF相似性分別為89%、71%。系統(tǒng)發(fā)育樹分析表明,黃粉甲IDGF與赤擬谷盜IDGF進(jìn)化關(guān)系最近。熒光定量PCR分析表明,在不同發(fā)育階段,IDGF基因在幼蟲1齡和2齡中的表達(dá)量明顯高于其他發(fā)育階段。在蛹期不同組織中,IDGF基因在脂肪體中的表達(dá)量最高。被管氏腫腿蜂(Scleroderma guani)寄生后,IDGF基因的轉(zhuǎn)錄水平未受影響,表明寄生不能調(diào)控該基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。
關(guān)鍵詞:翅芽生長(zhǎng)因子;基因克?。稽S粉甲;序列分析;管氏腫腿蜂
中圖分類號(hào): S433.5
文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2016)04-0095-04
翅芽生長(zhǎng)因子(imaginal disc growth factor,IDGF)是一種可溶性多肽生長(zhǎng)因子,因在黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)翅芽C1.8+細(xì)胞中鑒定具有促進(jìn)翅芽細(xì)胞的增殖和生長(zhǎng)而得名[1-2]。最初,科學(xué)家們?cè)诤诟构壷型ㄟ^同源性搜索和遺傳分析發(fā)現(xiàn)存在一些類生長(zhǎng)因子,如Spitz和Gurken的表皮生長(zhǎng)因子(EGF)、纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子(FGF)及轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β(TGF-β)[2-6]。但是,這些基因不具有生長(zhǎng)因子所具備的促進(jìn)有絲分裂活性,而僅是這些基因編碼的分泌蛋白異常表達(dá)能導(dǎo)致細(xì)胞增生并抑制生長(zhǎng)[7-9]。然而,經(jīng)細(xì)胞體外培養(yǎng)認(rèn)為,IDGF可能是作為胰島素或類胰島素的一個(gè)輔助因子而發(fā)揮生理功能[10-11]。目前,遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),IDGF參與調(diào)節(jié)果蠅的生長(zhǎng)發(fā)育,在果蠅的胚胎卵黃細(xì)胞、胚胎和幼蟲的脂肪體中顯著表達(dá),其蛋白分泌到血淋巴并運(yùn)輸?shù)桨袠?biāo)組織而發(fā)揮生理功能[2]。本研究從黃粉甲(Tenebrio molitor)蛹中克隆得到IDGF基因的cDNA序列,并采用熒光定量PCR方法研究該基因在黃粉甲不同發(fā)育階段、不同組織以及被管氏腫腿蜂(Scleroderma guani)寄生后的表達(dá)情況,為今后深入研究該基因的功能奠定了基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 供試?yán)ハx
供試?yán)ハx參照Z(yǔ)hu等的方法[12]進(jìn)行飼養(yǎng)。黃粉甲幼蟲用飼料和潔凈白菜葉室溫自然光條件飼養(yǎng)。利用黃粉甲蛹在人工氣候箱[(25 ± 1) ℃,相對(duì)濕度75%]中繁育管氏腫腿蜂。管氏腫腿蜂成蜂用蘸透20%蜂蜜水的脫脂棉球提供營(yíng)養(yǎng)。
1.2 IDGF的克隆及分析
利用Trizol試劑法(Invitrogen)提取黃粉甲蛹總RNA。采用分光光度法測(cè)定總RNA含量,并用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)總RNA的質(zhì)量。以提取的總RNA為模板,用SMARTM RACE cDNA amplification kit (Clontech)合成cDNA模板。依據(jù)實(shí)驗(yàn)室前期對(duì)黃粉甲cDNA文庫(kù)測(cè)序獲得IDGF片段序列,用Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)5′ RACE(5′-CGAACGCCAGACGATGTTCGACAGAT-3′)和3′RACE(5′-CGCACCCAACAACAAG CTGAT-3′)特異性引物。參照RACE試劑盒說明書,PCR擴(kuò)增獲得IDGF基因的3′端和5′端序列。PCR反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性2 min;94 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min 30 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分離,切取目的條帶并純化后送至上海杰李生物技術(shù)有限公司測(cè)序。
利用Genetyx軟件將翅芽生長(zhǎng)因子IDGF基因的核苷酸序列翻譯成氨基酸序列,利用SignalP 4.1 Server (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè),結(jié)構(gòu)域采用MotifScan(http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan)進(jìn)行預(yù)測(cè),利用ClustalX 1.83和MEGA 5.0軟件進(jìn)行多序列比對(duì)和構(gòu)建分子系統(tǒng)進(jìn)化樹[13-14]。
1.3 熒光定量PCR
參照Z(yǔ)hu等的方法[15]收集黃粉甲不同發(fā)育階段(幼蟲1~3齡、蛹、成蟲)、蛹不同組織(表皮、脂肪體、血細(xì)胞)及被管氏腫腿蜂寄生和未寄生(6、12、24、48 h)蛹樣品進(jìn)行總RNA提取,提取的總RNA使用RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit(Thermo)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA模板。根據(jù)本次克隆獲得的黃粉甲IDGF cDNA序列,設(shè)計(jì)熒光定量正向引物(5′-CCCAACGTTAACAGCTCT-3′)和反向引物(5′-CCTGTCGATTAATTCGTA-3′),以18 S RNA基因(5′-TTTCAAATGTCTGCCTTATC-3′和5′-TGTGGTAGCCGTTTCTCA-3′)作為內(nèi)參使用Rotor Gene-Q熒光定量PCR儀檢測(cè)IDGF基因在黃粉甲不同發(fā)育階段、不同組織以及寄生與未寄生后的表達(dá)情況,每個(gè)處理重復(fù)3次。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性2 min;95 ℃變性20 s,55 ℃退火30 s,40個(gè)循環(huán)。熒光定量PCR結(jié)果采用2-ΔΔCT法[16],數(shù)據(jù)顯著性差異分析采用SPSS軟件進(jìn)行分析[17]。
2 結(jié)果與分析
2.1 IDGF基因的克隆及序列分析
克隆獲得的黃粉甲IDGF基因cDNA長(zhǎng)為1 465 bp,開放閱讀框框長(zhǎng)為1 296 bp,該基因可編碼431個(gè)氨基酸,5′端非編碼區(qū)50 bp,3′端非編碼區(qū)119 bp(圖1)。其推導(dǎo)的氨基酸序列預(yù)測(cè)理論分子量為48.25 ku,等電點(diǎn)為7.63。SignalP分析發(fā)現(xiàn),該IDGF基因推導(dǎo)的氨基酸序列中存在信號(hào)肽序列(MKILICALLALAAYVAA)。氨基酸序列同源性比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),黃粉甲IDGF與赤擬谷盜(Tribolium castaneum)IDGF的相似性為89%,與蔗根非耳象(Diaprepes abbreviatus)IDGF的相似性為71%(圖2)。MotifScan分析發(fā)現(xiàn),該IDGF基因cDNA序列中存在1個(gè)N-糖基化位點(diǎn)(NSSV216-219),1個(gè)依賴cGMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位點(diǎn)(RKGT360-363),5個(gè)酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(diǎn)(TILE116-119、SVVD176-179、SKEE322-325、SYPE329-332、TLDD408-411),6個(gè)N-豆蔻酰化位點(diǎn)(GLDLAW142-147、GLLLTL204-209、GAPNNK279-284、GIWVGY376-381、GNKASY388-393、GLCTGD414-419),5個(gè)蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn)(SDK18-20、SYK64-66、TFR199-201、TPK242-244、SKR358-360),2個(gè)酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn)(RNPKEADY245-252、RKFDENADY262-270),第119位點(diǎn)至第137位點(diǎn)是一個(gè)未知蛋白功能結(jié)構(gòu)域,第19位點(diǎn)至第410位點(diǎn)氨基酸區(qū)域是18糖基水解酶家族的保守結(jié)構(gòu)域。利用MEGA 5.0構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示黃粉甲IDGF與赤擬谷盜IDGF聚在一起,進(jìn)化關(guān)系最近(圖3)。
2.2 IDGF基因的表達(dá)特征
在不同發(fā)育階段,IDGF基因在幼蟲1齡和2齡中的表達(dá)量明顯高于其他發(fā)育階段,成蟲次之,蛹期表達(dá)量最低(圖4)。在蛹期不同組織中,IDGF基因在脂肪體中的表達(dá)量最高,血細(xì)胞次之,而表皮中幾乎沒有表達(dá)(圖5)。被管氏腫腿蜂寄生后,IDGF基因的表達(dá)不會(huì)發(fā)生顯著變化,表明寄生未對(duì)該基因的表達(dá)產(chǎn)生調(diào)控作用(圖6)。
3 結(jié)論與討論
通過RACE技術(shù)克隆獲得的IDGF基因推導(dǎo)的氨基酸序列預(yù)測(cè)分子量為48.25 ku,與先前報(bào)道的黑腹果蠅IDGF家族基因約為50 ku和菜粉蝶(Pieris rapae)IDGF為52 ku大小相近[1,18]。Varela等在果蠅IDGF-2基因研究中發(fā)現(xiàn)其含有18糖基水解酶家族,黃粉甲IDGF基因氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn)也存在18糖基水解酶家族保守結(jié)構(gòu)域[11]。
在果蠅IDGF研究中發(fā)現(xiàn),IDGF在果蠅胚胎卵黃細(xì)胞、胚胎和幼蟲中均有表達(dá),但在幼蟲期表達(dá)顯著[1-2]。通過對(duì)意大利蜜蜂(Apis mellifera)工蜂幼蟲不同日齡IDGF基因的表達(dá)特征研究表明,該基因在幼蟲期表達(dá)顯著[19]。與這些研究結(jié)果相似,黃粉甲IDGF在幼蟲1齡和2齡的表達(dá)量顯著高于蛹和成蟲階段。在果蠅幼蟲中,IDGF基因在脂肪體中的顯著表達(dá)[2,20]。在菜粉蝶中,IDGF在脂肪體和血細(xì)胞中均有表達(dá),但脂肪體中的表達(dá)量明顯高于血細(xì)胞中的表達(dá)量[10,21]。同樣,黃粉甲IDGF基因在脂肪體中顯著表達(dá),且明顯高于血細(xì)胞中的表達(dá)量。管氏腫腿蜂寄生黃粉甲蛹后,IDGF基因不受寄生所調(diào)控,這與Asgari等報(bào)道的菜粉蝶被微紅盤絨繭蜂寄生和注射多份DNA病毒后IDGF基因的表達(dá)沒有受到影響[18]以及Zhu等所報(bào)道的菜粉蝶被蝶蛹金小蜂寄生后IDGF轉(zhuǎn)錄水平不受影響[21]的結(jié)果相似。本研究結(jié)果表明,黃粉甲IDGF基因應(yīng)不受寄生蜂所攜帶的寄生因子所調(diào)控。
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