孫寅璐,郭 彥,趙健偉
(1. 南京大學 化學化工學院 生命分析化學國家重點實驗室,南京 210008;2. 南京信息工程大學 環(huán)境科學與工程學院 江蘇省大氣環(huán)境監(jiān)測與污染控制高技術研究重點實驗室,南京 210044)
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基于隨機擴散理論的色譜動力學模擬
孫寅璐1,郭彥2,趙健偉1
(1. 南京大學 化學化工學院 生命分析化學國家重點實驗室,南京 210008;2. 南京信息工程大學 環(huán)境科學與工程學院 江蘇省大氣環(huán)境監(jiān)測與污染控制高技術研究重點實驗室,南京 210044)
為了深入理解粒子擴散對色譜過程動力學的影響,利用微尺度受限空間內隨機行走的方法對待分離粒子在氣相色譜填充柱內的擴散過程進行了動態(tài)模擬.重點考察了固定相的填充率和排布方式、柱壓和柱長對色譜動力學的影響.結果表明,短柱和大填充率有利于提高柱效,而固定相的排布方式對柱效影響較小.待分離粒子的運動表現(xiàn)出微尺度空間限域的超擴散運動特征,其軸向擴散行為隨著柱內壓力的增加而愈發(fā)明顯.本文提出的模擬方法對加速優(yōu)化分離過程和開發(fā)新型色譜分離技術具有參考意義.
隨機行走; 色譜動力學; 粒子擴散; 固定相
粒子擴散問題是微觀理論化學研究中的基本問題,在微流控、微通道、微反應器等領域中引起了研究者們的廣泛關注.粒子擴散與輸運行為密切相關,是研究傳質過程和計算傳質速率的重要基礎.實驗上通常采用熒光顯微鏡、原子力顯微鏡等單粒子跟蹤技術來追蹤粒子的擴散過程[1].這些技術手段大大提高了人們對粒子微觀運動的認識,然而基于現(xiàn)有的技術水平,依靠實驗方法還不足以獲得較為全面的擴散信息.隨著計算技術的飛速發(fā)展,計算機模擬方法將成為分子微觀行為研究中的重要輔助手段.它打破了實驗技術水平的限制,同時各實驗條件參數(shù)經過計算機模型化處理后更能清晰準確的表達對擴散行為的影響,從而揭示出粒子擴散的本質規(guī)律以及不同操作條件下的擴散模式,為實驗提供理論基礎.
色譜法是分離分析中最為常見的方法之一,其分離過程中的擴散問題是色譜動力學研究的基礎.深入理解粒子在兩相中的擴散和傳質行為,探索不同條件下的擴散機理,可有效控制峰展寬、提高分離度,為實現(xiàn)快速優(yōu)化分離、提升色譜性能和改進分離器件提供了重要的理論依據(jù).
以色譜過程熱力學為基礎的分離理論和以擴散過程為基礎的峰形預測理論,均能很好的闡述色譜的保留值規(guī)律和峰形規(guī)律.但是這些理論屬于宏觀理論,沒有考慮到分離器件內填充物的形狀、大小、填充密度和表面理化性質對分離分析的影響,然而這些微觀性質對分離效果至關重要.因此色譜理論的發(fā)展亟需從微觀角度對色譜的分離規(guī)律、條件控制開展模擬研究.Slusher等[2]用分子動力學方法計算了反相色譜體系中,溶劑密度和取向分布與色譜柱壁之間距離的函數(shù)關系.Sun等采用分子動力學方法分別模擬了配體密度[3]和溶劑pH[4]對蛋白質在疏水電荷誘導色譜中的吸附脫附行為的影響.Makrodimitris等[5]應用格子-偶極模型在介觀尺度上模擬了肽鏈在反相色譜上的吸附行為.Turowski等[6]應用MM+力場和AM1半經驗方法計算了脂肪族和芳香族溶質的范德華半徑、與固定相和流動相的相互作用,及這些作用情況在反相色譜分離中的應用.Sarti等[7]應用數(shù)學模型研究了蛋白質在膜親和相色譜中的吸附平衡和流出曲線.Siepmann課題組長期致力于色譜的蒙特卡羅模擬研究,例如考察氣相色譜中氣液界面的吸附和分配[8],非極性和極性物質在反相液相色譜中的保留機理[9],待測物質在氣相色譜中的過保留行為[10]以及流動相改性對分配的影響[11]等等.
總體而言,以上描述微觀擴散的方法可分為分子動力學和蒙特卡羅兩種.分子動力學方法[12-15]是一種確定性的模擬方法,其優(yōu)勢在于可全面模擬體系所經歷的物理化學全過程,精確獲取體系內部各種物理化學信息.而蒙特卡羅方法[16-18]是隨機動力學方法,求解問題通過建立概率模型然后統(tǒng)計分析得出,該方法側重于結果而忽略過程中的細節(jié).目前這兩種方法均用于處理色譜吸附熱力學、待分離物質的性質以及溶劑化環(huán)境等局部問題,尚未用于研究色譜擴散分離的整體情況,實現(xiàn)色譜的全過程模擬.這是因為現(xiàn)有的計算水平往往適用于較小的擴散體系,而對于色譜分離等較大規(guī)模的擴散體系來說,計算量過大,模擬用時遠遠超過可以接受的程度.
為了既能保留擴散分離過程中的重要細節(jié),同時又能兼顧全過程模擬,我們結合分子動力學和隨機運動理論[19-23]的優(yōu)勢提出了一種新的簡化方法——受限空間內的隨機行走模擬方法.該方法保留了制約擴散行為的關鍵信息,對粒子間的相互作用進行合理簡化,將模擬步長的時間尺度放大,從而減小運算量,提高運算效率,使大體系擴散過程模擬成為可能.該方法可模擬分離過程中的粒子運動、碰撞、分離介質的性質等微觀細節(jié),其模擬結果更為準確可靠,同時也可促進分離條件的優(yōu)化和分離器件的改進.由于模擬的規(guī)模足夠大、時間足夠長,其結果可與一般宏觀測量信號相對照,也可與基于宏觀理論的模擬作對比.該方法在大規(guī)模體系、長時間分離過程的模擬中找到了計算量與計算體系之間的平衡點,現(xiàn)已應用于膜滲透過程[24-25]和電化學過程[26-27]的粒子擴散行為的模擬研究中.
本文根據(jù)粒子在色譜中的基本運動規(guī)律,設計了粒子在含有周期排布勢壘的二維受限空間內隨機行走的仿真模型,模擬粒子在填充柱中的擴散行為.重點考察了勢壘的填充率和排布方式、柱壓和柱長對色譜動力學的影響.
如圖1所示,將填充柱定義為二維平面空間,該空間在x方向上無限延伸,y方向上有上下兩個邊界.空間內包含周期排布的結構單元,如虛線框所示.結構單元內均包含一圓形勢壘用于模擬固定相.粒子不可進入勢壘,只能在勢壘以外的區(qū)域內運動.虛線方格表示的結構單元中,空白部分代表粒子可自由運動的區(qū)域,紅色曲線代表粒子的運動軌跡.組分在色譜柱內的總體運動趨勢是沿著柱長的方向遷移(近似一維分離體系),所以我們主要研究粒子在x方向上的擴散行為.
采用忽略了質量和體積的質點來表示待分離粒子.粒子的速度由兩部分組成,一是粒子自身擴散的隨機速度δ,其大小與粒子的相對分子質量和溫度相關,其方向隨機產生,即以粒子為中心360°范圍內等概率分布;另一速度為在x軸向上給粒子施加的附加速度uM,用于模擬載氣定向流動時對粒子的推動作用.需要注意的是,模型中的隨機速度并非僅為粒子在真空中的熱運動速度,它實際上是一種表觀速率,是對粒子自身的熱運動、粒子與其他粒子的碰撞、粒子與勢壘的碰撞以及粒子與載氣分子的碰撞等各種因素相互作用后的綜合體現(xiàn).
粒子和勢壘之間的相互作用可用多種模型來描述,本章采用彈性碰撞模型[28]來簡化處理.假定粒子在某一小段時間內隨機速度保持不變,那么隨機速度和時間步長的乘積決定了行走一步的步長.在不受勢壘阻礙下,根據(jù)粒子的當前位置和每步步長即可確定粒子完成一步之后的位置.當粒子與勢壘碰撞時,其擴散速度大小不變,方向上遵從反射定律,即粒子以原方向的反射方向繼續(xù)在色譜柱中運動.對粒子的步點位置進行時間積分獲得運動軌跡,根據(jù)運動軌跡來分析粒子的擴散行為及分離效果.
應用上述模型研究了待分離粒子在填充柱內的擴散行為,重點考察了勢壘的填充率和排布方式、柱壓和柱長等因素對色譜動力學行為的影響.模擬溫度均為298K,根據(jù)氣體布朗運動理論估算可將粒子的隨機速度設為20mm·s-1,時間步長設為0.005s·step-1.若無特殊說明,勢壘粒徑為 0.6mm,載氣流速為2mm·s-1,模擬時間為500s(對應長度為1m的填充柱).當體系濃度較低時,粒子之間的運動是相互獨立的,可將多粒子的隨機運動視為單粒子的多次隨機運動.實驗中的檢測信號為粒子在色譜柱內保留時間的統(tǒng)計分布;同樣地,粒子在給定時間內運動的位移也存在統(tǒng)計分布,即濃度分布.應用已建立的單粒子隨機行走模型對每個模擬條件均實施1000次模擬,以濃度分布的統(tǒng)計均值作為分析結果.
2.1填充率
固定相填充質量的優(yōu)劣直接影響到色譜柱的柱效.在模擬中,我們用勢壘的填充率大小來反映色譜柱固定相的填充情況.填充率用勢壘面積和單元格面積的比值表示.在周期單元格大小不變的條件下,勢壘粒徑小,則填充率小,相當于固定相填充得較為疏松的色譜柱;反之,勢壘粒徑大,則填充率大,相當于固定相填充得較為緊實的情況.模擬中,勢壘粒徑大小分別設置為0.98,0.90,0.80,0.60和0.20mm,相對應的填充率分別為75%,63%,50%,28%和3%.
圖2為同一載氣流速下,隨勢壘粒徑的變化,粒子沿x軸向擴散的統(tǒng)計分布圖.圖中曲線為高斯擬合得到的色譜峰.當勢壘粒徑從0.20mm增大到0.98mm時,相當于固定相填料粒度由大變小,色譜峰在x軸向上的濃度分布的平均位移變小,峰形逐漸變得窄而尖,柱效提高.
色譜中的渦流擴散過程與填充技術、固定相顆粒大小以及顆粒均勻度密切相關.色譜柱參數(shù)中,固定相的填充情況可以用渦流擴散項A來描述:
A=2λdp;
(1)
均方位移(Mean Square Displacement, MSD)[29-32]為粒子位移平方的平均值,用來表征粒子在體系中的平均擴散距離.它反映了粒子的擴散速率,是時間(或步數(shù))t的函數(shù),由下式給出:
(2)
其中N是總步數(shù),dk表示粒子在k步后的位置矢量(d0是初始位置),|dk+t-dk|表示k步到k+t步的位移矢量.
MSDx和MSDy分別為MSD在x和y方向上的分量,定義為
(3)
(4)
其中dx,k和dy,k分別為dk的x和y方向上的分量.
MSD的意義在于可以通過求解MSD得到粒子的擴散系數(shù)D.在二維空間內,MSD和D有如下關系[33]:
MSD=4Dtα,
(5)
指數(shù)α反映了粒子的運動模式:當α=1時,代表布朗運動,即自由擴散;當α=2時,代表理想的定向運動;當1<α<2時,介于布朗運動和定向運動之間,這種有方向的擴散被稱為超擴散運動;當0<α<1時,表現(xiàn)為受限區(qū)域內的擴散過程,被稱為次擴散運動.
圖3為粒子在不同勢壘粒徑下的MSD變化圖.從總體上看,MSD隨勢壘粒徑的減小而增大,表明粒子在勢壘粒徑較小時擴散能力較強,這與先前研究的模擬結果一致[34].由于x方向施加了定向速度,所以粒子的MSDx和MSD曲線類似,均隨時間呈指數(shù)增加.由于粒子在y方向上表現(xiàn)為自由擴散,MSDy隨時間線性增加,所以在相同的擴散時間內MSDx要遠高于MSDy.模擬中,粒子既存在受限空間內的次擴散運動,同時又受到載氣驅動的影響而具有超擴散運動特征.為了進一步揭示其內在擴散機制,我們對MSD曲線進行擬合,得到各粒徑對應的D和α,結果見表1:
表1 不同勢壘粒徑下擬合MSD得到的D和α參數(shù)
由表1可知,α值介于1和2之間表明了粒子在該條件下的超擴散運動行為.雖然勢壘會在一定程度上阻礙粒子的擴散運動,但其影響非常微弱,從α值均接近于2可以看出,載氣的推動作用仍占主導地位,粒子的整體擴散行為更接近于定向運動.隨勢壘粒徑的減小,粒子受到勢壘的阻礙作用越小,其自由擴散和定向擴散的空間越大,擴散能力顯著提高,同時其定向運動趨勢也愈發(fā)明顯.
平均位移(Average Displacement, AD)反映粒子平均一步的位移.計算采用逐差法,以步數(shù)的一半為分界把位點分為前后兩組,計算后一組第一個點和前一組第一個點之間的位移,以此類推,算出所有位移后取平均,再除以兩點之間的步數(shù)差,求出平均一步的位移.分別計算x和y分量,把兩分量相加即為實際的位移矢量.
對某一運動軌跡,若總步數(shù)N是奇數(shù),則位點數(shù)目N+1是偶數(shù),令N+1=2n,則有
(6)
若總步數(shù)N是偶數(shù),則位點數(shù)目N+1是奇數(shù),令N+1=2n+1,則有
(7)
最后
AD=ADx+ADy
(8)
圖4為不同勢壘粒徑下對應的平均位移.從(a)中明顯看出粒子在x方向上的位移隨勢壘粒徑的增大而減小,其中500s處各粒徑對應的平均位移與圖2中的各峰值點對應一致.而粒子在y方向表現(xiàn)為自由擴散,故其擴散位移隨粒徑沒有明顯的變化規(guī)律,如圖(b)所示.
2.2勢壘排布
除勢壘粒徑外,勢壘的排布方式也可能影響粒子的擴散行為.我們假定勢壘大小不變,通過改變晶胞角度來改變勢壘排布,適當調整晶胞尺寸大小以消除填充率的改變而造成的結果差異.本部分共設計了四種勢壘排布方式,晶胞角度從90°開始依次減小15°直至45°.不難發(fā)現(xiàn),當晶胞角度為45°時勢壘的排布方式與90°的情況相同,如圖5所示.
由晶胞角度引起的MSD、MSDx、MSDy和ADx的差異相比勢壘粒徑要小得多,但仍表現(xiàn)出一定的變化規(guī)律.隨晶胞角度變小MSD、MSDx、MSDy(圖6,見第194頁)和ADx(圖7(a),見第194頁)均呈現(xiàn)出先上升(90°減小到60°)后下降(60°減小到45°)的趨勢,這與y方向上勢壘之間的距離變化規(guī)律一致;而ADy沒有明顯的變化規(guī)律(圖7(b)).
表2 不同晶胞角度下擬合MSD得到的D和α參數(shù)
對MSD進行擬合,得到各晶胞角度對應的D和α,結果見表2.通過改變晶胞角度實現(xiàn)了對粒子擴散空間的調整,擴散空間的相對擴大有利于提高粒子的次擴散能力,表現(xiàn)為D和α都略有增加.然而對于色譜中以超擴散運動為主的粒子來說,這種影響是非常微弱的.
2.3柱壓
氣相色譜柱壓是通過調節(jié)載氣流速實現(xiàn)的,流速越大柱壓越大.在模擬中,我們通過改變驅動速度的大小來描述壓力的變化情況.設勢壘粒徑為0.6mm,載氣流速在x軸向的線速度分別設定為1,2,4mm·s-1,考察了500s內載氣流速的變化對粒子擴散分離的影響.
表3 不同流速下擬合MSD得到的D和α參數(shù)
如圖8所示,在相同擴散時間內MSD和MSDx隨載氣流速增加而顯著增加,這與圖3隨粒徑減小時的情況相似.實際上,減小勢壘粒徑相當于間接提高了載氣的推動作用,二者對粒子在x軸向擴散的影響在本質上是一樣的.而MSDy隨載氣流速增加略有下降,表明x方向加載較大的載氣流速會對y方向的自由擴散產成輕微的削弱影響.
對MSD曲線進行擬合,得到各流速下對應的D和α,見表3.結果表明,載氣流速越大粒子的流動性越明顯,其擴散能力顯著增強,D近乎呈指數(shù)增長.所以在保證一定分離度的前提下,適當增加載氣流速可有效縮短待測物質的保留時間,進而提高分離效率.
2.4柱長
我們進一步考察了柱長對粒子分離擴散的影響.通過增加隨機步數(shù)、延長粒子在柱內的擴散時間來表達柱長增加.以勢壘粒徑為0.6mm為例,步數(shù)分別設置為1.0×105,2.0×105,3.0×105,5.0×105和8.0×105步,即分離時間分別為500,1000,1500,2500,4000s,對應模擬長度分別為1,2,3,5,8m的色譜柱.
圖9為不同柱長沿x軸向擴散的位移統(tǒng)計分布圖.結果表明,柱子越長,粒子的濃度分布越寬.影響色譜峰寬的因素包括渦流擴散、縱向分子擴散和傳質阻力.由于簡化了粒子與固定相的相互作用,峰展寬主要受分子縱向擴散的影響.柱長越長,粒子的縱向擴散時間越長,峰展寬越嚴重,柱效顯著下降,所以在實際經驗中在確保待分離物質完全分離的前提下都盡可能使用短柱.
(9)
對隨機速度進行累加,得到位移的方差σdis為
(10)
式(10)表明峰寬與粒子擴散步數(shù)的平方根成正比.由于步數(shù)和柱長相對應,因此峰寬與柱長的平方根成正比.插圖亦表明了半峰寬(FWHM)與柱長平方根的線性關系,證實了我們的模擬結果與理論推導的一致性.
利用隨機行走算法對氣相色譜中粒子在填充柱中的擴散過程進行了動態(tài)模擬,流出曲線呈高斯分布.運用MSD和AD方法對粒子的擴散運動軌跡進行分析,從總體上看,待分離粒子表現(xiàn)出微尺度空間限域的超擴散運動特征.通過擬合MSD方程求解擴散系數(shù)的方法,直觀地比較了勢壘的粒徑大小、柱壓和柱長對粒子擴散能力的影響程度,模擬結果表明增大填充率、增加柱壓和減小柱長都會提高柱效,而勢壘的排布方式對色譜動力學的影響不明顯.
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Simulation of Chromatographic Dynamics Based on Random Diffusion
SUN Yinlu1, GUO Yan2, ZHAO Jianwei1
(1. State Key Laboratory of Analytical Chemistry for Life Science, School of Chemistry and ChemicalEngineering,NanjingUniversity,Nanjing210008,China; 2.KeyLaboratoryofAtmosphericEnvironmentMonitoringandPollutionControlofJiangsuProvince,SchoolofEnvironmentalScienceandEngineering,NanjingUniversityofInformationScienceandTechnology,Nanjing210044,China)
In order to thoroughly understand the influence of particle diffusion on chromatographic dynamics, we developed a model based on the theory of random walk in confined space and apply it to dynamical simulation of particle diffusion in a GC packing column. The effects of packing fraction and barrier arrangement of the stationary phase as well as pressure and column length on the chromatographic dynamics have been investigated in detail. It was demonstrated that short column and large packing fraction contributes to high column efficiency, while barrier arrangement of the stationary phase only has a slight effect on column efficiency. The super-diffusion of particles is characterized in confined space and the axial diffusion rises with the increasing pressure. The simulation method has some significance for the acceleration of optimization processes and the development of novel technologies of chromatographic separation.
random walk; chromatographic dynamics; particle diffusion; stationary phase
0427-7104(2016)02-0189-10
2015-07-14
國家自然科學基金(21121091,21273113)
孫寅璐(1990—),女,碩士研究生;趙健偉,男,教授,博士生導師,通訊聯(lián)系人,E-mail:zhaojw@nju.edu.cn.
O 657
A