張小康,咼生容,馬曉良,張大軍
抗腸道病毒靶點(diǎn)藥物研究進(jìn)展
張小康,咼生容,馬曉良,張大軍
人類腸道病毒(EVs)是小 RNA 病毒科下的一屬病毒,通常在夏秋季節(jié)爆發(fā)流行。在腸道病毒中,目前只有脊髓灰質(zhì)炎病毒(PV1-3)、甲型肝炎病毒(HAV)和腸道病毒71 型(EV71)有相應(yīng)的疫苗[1],仍有超過 110 種的腸道病毒對(duì)人類健康造成巨大威脅。這些病毒最常造成的危害是呼吸道和消化道的輕度癥狀,但同時(shí)它們也是造成無菌性腦膜炎和心肌炎的常見元兇。腸道病毒造成的疾病多種多樣,且同一種、同一型病毒的感染所造成的危害程度也不盡相同,從輕度癥狀到嚴(yán)重臨床疾病的發(fā)展過程也是難以預(yù)知的。例如腸道病毒 71 型以及柯薩奇病毒 A16 型(CVA16)引起的手足口病,大多數(shù)病例都可康復(fù),但少數(shù)患者則會(huì)發(fā)展為腦干腦炎、肺水腫或其他致命癥狀[2-3]。
近年來,腸道病毒感染呈現(xiàn)常年流行的態(tài)勢(shì)。在中國,手足口病已經(jīng)成為常見的兒童感染疾病,并且成為一個(gè)重要的公共健康問題,僅 2014 年一年,便報(bào)告了近 285 萬例手足口病病例。值得警惕的是,由于基因變異,已知血清型的毒株會(huì)產(chǎn)生具有新的致病特性的變異型,對(duì)人群健康不斷造成新的威脅。例如,2007 年美國出現(xiàn)的一新型柯薩奇B1 病毒(CVB1),便是全美 40 多個(gè)地區(qū)報(bào)道的新生兒膿毒血癥及心肌炎的罪魁禍?zhǔn)祝?-5]。與此類似,2014 年腸道病毒 D68(EV-D68)的爆發(fā)[6],導(dǎo)致 1100 多例嚴(yán)重呼吸道疾病和 100 多例急性弛緩性脊髓炎,而此前該病毒毒力僅與鼻病毒相當(dāng)[7]。
盡管經(jīng)過了數(shù)十年的研究,目前仍沒有開發(fā)出可以應(yīng)用于臨床的抗腸道病毒藥物[8]。理論上講,病毒生命周期中的每一步都可以是設(shè)計(jì)抗病毒藥物的靶點(diǎn),本文則聚焦于腸道病毒蛋白。
雖然腸道病毒所致疾病癥狀各異,但它們都有著相同的病毒學(xué)特征[9]。腸道病毒是單正鏈 RNA 無包膜小病毒(27 ~ 30 nm),其病毒衣殼為二十面體對(duì)稱結(jié)構(gòu),由 60 個(gè)蛋白質(zhì)亞基組成,每一個(gè)蛋白亞基又都包含 4 個(gè)病毒結(jié)構(gòu)蛋白(VP1-VP4)。其基因組約有 7500 個(gè)核苷酸,單一的開放閱讀框編碼一個(gè)大的多聚體蛋白(約 240 kD),兩側(cè)為非翻譯區(qū),參與基因組的復(fù)制與翻譯。細(xì)胞黏附分子是典型的病毒受體,促進(jìn)病毒顆粒與靶細(xì)胞的附著以及受體介導(dǎo)的胞吞作用?;蚪M RNA 從病毒顆粒中釋放后,被翻譯為病毒多聚體蛋白,多聚體蛋白自身水解分裂為 3 種蛋白,P1 ~P3,再進(jìn)一步分解為結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白(即酶蛋白)。早期的關(guān)鍵步驟是多聚體蛋白分解,釋放 P1,隨后 P1 經(jīng)過 3C 蛋白酶作用水解為 4 個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白,構(gòu)成成熟病毒顆粒的衣殼。P2 和 P3 的水解產(chǎn)物參與負(fù)鏈 RNA 的合成以及正鏈 RNA 的復(fù)制,進(jìn)而使病毒擴(kuò)增。腸道病毒的生命周期通常在 6 ~ 12 h 內(nèi)完成,之后細(xì)胞迅速溶解,病毒顆粒釋放。
腸道病毒衣殼蛋白是最早被開發(fā)的抗病毒藥物靶點(diǎn)。在VP1 中,存在一個(gè)疏水口袋結(jié)構(gòu),在大多數(shù)腸道病毒中這一口袋結(jié)構(gòu)被脂肪酸所占據(jù),起到穩(wěn)定病毒衣殼的作用。在病毒附著細(xì)胞的過程中,口袋結(jié)構(gòu)中的脂肪酸被釋放,進(jìn)而協(xié)助病毒進(jìn)入細(xì)胞和脫殼。病毒衣殼蛋白抑制分子便是與這一口袋結(jié)構(gòu)結(jié)合并觸發(fā)衣殼蛋白的構(gòu)象改變,進(jìn)而阻礙病毒與宿主細(xì)胞的結(jié)合以及脫顆粒過程。此外,還有研究發(fā)現(xiàn)藥物在衣殼蛋白裝配過程中的整合抑制作用也與其抗病毒活性有關(guān)[10]。
研究獲得進(jìn)展最多的藥物是 pleconaril 和 vapendavir(BTA-798)(圖 1)。Pleconaril 于 2002 年申請(qǐng)應(yīng)用于普通感冒,但因安全性問題被 FDA 拒絕[11]。先靈葆雅在 2003年獲得許可,將 pleconaril 發(fā)展為治療普通感冒癥狀的鼻部噴霧,以及用于人輪狀病毒(HRV)誘導(dǎo)加重的哮喘或慢性阻塞性肺病(COPD)的高?;颊?。最近一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),pleconaril 對(duì)腸道病毒感染導(dǎo)致的新生兒膿毒血癥的治療效果顯著,這證實(shí) pleconaril 在抗腸道病毒方面仍值得繼續(xù)發(fā)展研究[12]。BTA-798 是一種 pleconaril 的衍生物,其體外抗病毒活性是 pleconaril 的 10 倍,并且半衰期更長,口服生物利用度更佳,目前正處于臨床前研究階段[13]。以pleconaril 為模型,發(fā)展出了一類吡啶基咪唑啉酮化合物,其中抗病毒活性最好的為 GPP3,其 EC50為 10 nmol/L[14]。最近,De Colibus 等[15]設(shè)計(jì)合成了 NLD,其為 GPP3 的衍生物,NLD 的體外抗 EV71 活性較 GPP3 高出一個(gè)數(shù)量級(jí),EC50值是 25 pmol/L,且選擇指數(shù)高達(dá) 6 × 104,是一個(gè)極具開發(fā)潛力的抗 EV71 化合物。
然而,現(xiàn)在已有研究發(fā)現(xiàn),衣殼蛋白疏水口袋區(qū)的單點(diǎn)氨基酸替換會(huì)阻礙藥物分子與疏水孔洞的整合,進(jìn)而引起病毒對(duì)衣殼抑制劑的高水平抵抗,這種單氨基酸替換已被證實(shí)是腸道病毒對(duì) pleconaril 及其衍生物產(chǎn)生耐藥性的原因[16-17]。一種新的吡唑并嘧啶類化合物,OBR-5-340,被發(fā)現(xiàn)對(duì)于柯薩奇病毒 B3 型(CVB3)誘導(dǎo)的慢性心肌炎小鼠具有明顯的預(yù)防及治療效果,它是一種廣譜抗腸道病毒化合物,對(duì)于 pleconaril 耐受的毒株,OBR-5-340 的體外EC50值為 0.04 ~ 0.64 μmol/L,并且對(duì)細(xì)胞色素酶基本無影響,口服利用度高,成為一個(gè)具有良好發(fā)展前景的抗腸道病毒藥物候選化合物[18]。
圖1 作用于病毒衣殼蛋白的化合物
病毒增殖過程中的一個(gè)關(guān)鍵步驟是將單個(gè)的多聚體蛋白切割,形成最終成熟的結(jié)構(gòu)蛋白以及非結(jié)構(gòu)蛋白。多聚體蛋白總共需要切割 13 次,其中 10 次是由同一種病毒編碼蛋白—— 3C 蛋白酶(3Cpro)完成的,同時(shí)在易感宿主體內(nèi)也沒有發(fā)現(xiàn)該酶的細(xì)胞同系物,這使得小 RNA 病毒的3Cpro 酶成為一個(gè)潛在的抑制病毒增殖的藥物靶點(diǎn)[19]。以口蹄疫病毒(FMDV)為例,3Cpro 是病毒基因組中最為保守的蛋白之一,在所有的病毒血清型中,3Cpro 的氨基酸序列相似度為 76%,其中底物結(jié)合位點(diǎn)是整個(gè)酶中特征最為保守的區(qū)域[20]。經(jīng)過對(duì) HRV 的 3Cpro 的詳細(xì)研究,發(fā)現(xiàn)其結(jié)合的底物上都有著 APAKQ-LLNFD 序列,在這一序列中,P4 ~ P1 殘基(PAKQ)是決定選擇性的關(guān)鍵,在 P1 位置用吸電子基團(tuán)替代,便可以與 3C 蛋白酶活性部位的半胱氨酸反應(yīng),抑制其活性[21]。以此為基礎(chǔ),發(fā)展出了一系列小分子化合物,ruprintrivir 便是其中最具有代表性的化合物(圖 2)。
圖2 作用于 3C 蛋白酶的化合物
Ruprintrivir 是一種針對(duì) 3Cpro 的不可逆抑制劑,其EC50值在納摩爾級(jí)。該化合物有很高的廣譜抗腸道病毒活性,被選中進(jìn)入臨床試驗(yàn)。由于其口服生物利用度低,ruprintrivir 需要采用鼻部給藥。然而,在自然感染的患者身上,ruprintrivir 對(duì)癥狀的嚴(yán)重程度及病毒負(fù)荷都沒有明顯的減輕,因此暫停了對(duì)該化合物的研究[22]。不過這并不意味著對(duì) 3Cpro 的研究走入困境,蛋白酶作為一種抗病毒靶點(diǎn),早已在 HIV 和 HCV 感染患者的治療過程中證明了它的巨大價(jià)值[23]。Tan 等[24]合成了一種新的抗 3Cpro 化合物——SG85,其體外抗 EV71 和鼻病毒的活性濃度均在納摩爾水平。隨后的研究還證實(shí),SG85 與 ruprintrivir 無交叉耐藥性,這表明該化合物對(duì) 3Cpro 的作用位點(diǎn)與ruprintrivir 不同[25]。此外,近來還有一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),chrysin可以抑制 EV71 的 3Cpro,且其衍生物展現(xiàn)出抗 EV71 和CVB3 活性,提示該化合物有一定的抗病毒發(fā)展?jié)摿Γ?6]。
3D 聚合酶(3Dpol)是由腸道病毒編碼的一種 RNA 依賴的 RNA 聚合酶(RdRp),它在幾種細(xì)胞以及病毒蛋白的協(xié)助下,催化病毒 RNA 的合成??紤]到該酶在病毒復(fù)制過程中起著關(guān)鍵作用,而人類宿主細(xì)胞中完全缺乏這種RdRp,因此 3Dpol 被認(rèn)為是一種極具發(fā)展前景的藥物靶點(diǎn)[27]。RNA 聚合酶抑制劑可被細(xì)分為兩類,目前發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)抑制劑是核苷或核苷酸類似物,在 RNA 合成過程中,通過與內(nèi)源性核苷酸競(jìng)爭(zhēng),使終止子提前產(chǎn)生或造成突變。Ribavirin 是這類藥物的代表(圖 3),它可以誘導(dǎo)新合成的病毒 RNA 產(chǎn)生致死性突變,抑制病毒的復(fù)制[28]。第二類聚合酶抑制劑是非核苷類抑制劑(NNIs),這一類抑制劑的作用機(jī)制多樣,主要是作用于 RNA 聚合酶表面上各自的結(jié)合位點(diǎn),影響酶活性而發(fā)揮作用。NNIs 所結(jié)合的酶表面位點(diǎn)在病毒種間變異較大,因此其抗病毒譜較為局限。目前發(fā)現(xiàn)的非核苷類抗腸道病毒化合物不多。DTriP-22 于2009 年被發(fā)現(xiàn)可以抑制 EV71 復(fù)制,并顯示出廣譜抗腸道病毒活性,研究表明該化合物對(duì) 3Dpol 的影響是通過別構(gòu)調(diào)節(jié)阻礙核苷三磷酸鹽進(jìn)入酶結(jié)合位點(diǎn),進(jìn)而抑制 RNA 鏈的延長[29]。
最近有研究報(bào)道了一種新的 NNI——GPC-N114。與其他 NNIs 不同,該化合物的結(jié)合位點(diǎn)在 3Dpol 核心區(qū)域,是第一種以 RNA 模板引物結(jié)合位點(diǎn)為靶點(diǎn)的 NNI,具有廣譜抗腸道病毒和心肌炎病毒活性,其在體外抗 CVB3 感染的 EC50值為(0.15 ± 0.02)μmol/L,并且相關(guān)分析表明,CVB3 和脊髓灰質(zhì)炎病毒對(duì)該化合物產(chǎn)生耐受變異的基因屏障很高。該類化合物及其作用靶點(diǎn)為抗腸道病毒藥物開發(fā)提供了一個(gè)新的起點(diǎn)[30]。
圖3 作用于 3D 聚合酶的化合物
圖4 作用于 3A 蛋白的化合物
圖5 作用于 2C 蛋白的化合物
非結(jié)構(gòu)蛋白 3A 及其前體 3AB 是病毒復(fù)制過程中的關(guān)鍵蛋白,該蛋白可以通過 C 端疏水區(qū)域與細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)結(jié)合,對(duì)病毒感染的多個(gè)方面均有影響,包括 RNA 復(fù)制、宿主細(xì)胞向性以及病毒毒力等。3A 蛋白還可以作用于細(xì)胞分泌通路,降低細(xì)胞因子的分泌以及免疫受體的表達(dá)。由于3A 蛋白作用廣泛且在遺傳上較為保守,使其成為一個(gè)抗腸道病毒藥物的潛在靶點(diǎn),但它確切的作用機(jī)制還未完全闡明[31]。
Enviroxime(圖 4),一種苯并咪唑衍生物,是第一個(gè)被報(bào)道的具有抑制腸道病毒 3A 蛋白活性的化合物[32]。然而,臨床試驗(yàn)結(jié)果顯示該化合物治療效果無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性,且有較強(qiáng)的胃腸道與呼吸道副作用,enviroxime 的進(jìn)一步開發(fā)被暫停[33]。在此之后,探索合成了一系列 enviroxime 衍生物,較有代表性的為 GW5074,但發(fā)現(xiàn)其作用靶點(diǎn)可能并不是 3A 蛋白,而是與 3A 蛋白相互作用的宿主蛋白[34]。相關(guān)研究表明,3A 蛋白可以募集磷脂酰肌醇-4-激酶 IIIβ(PI4KIIIβ)到分泌細(xì)胞器膜,創(chuàng)造一個(gè)利于 3Dpol 結(jié)合的富磷脂酰肌醇-4-磷酸(PI4P)環(huán)境,進(jìn)而促進(jìn)病毒 RNA的復(fù)制[35]。
Itraconazole 是一種三唑類抗真菌藥,被發(fā)現(xiàn)可以有效抑制 EV71 的復(fù)制,其 EC50值為 1.15 μmol/L。研究顯示,其作用靶點(diǎn)為病毒 3A 蛋白,且與 GW5074 無交叉耐藥性。該化合物還顯示出廣譜抗腸道病毒活性,除 EV71 外,還可以抑制其他腸道病毒,包括 CVA16、CVB3、PV-1 以及 EV-D68 等[36]。此外,itraconazole 在兒童和嬰兒身上的耐受性也很好,提示其在人群中可以廣泛應(yīng)用[37]。
在所有腸道病毒非結(jié)構(gòu)蛋白中,2C 蛋白是最保守、最復(fù)雜的,也是最后被發(fā)現(xiàn)認(rèn)識(shí)的一種多功能蛋白?,F(xiàn)有的報(bào)道顯示,2C 蛋白參與腸道病毒感染的多種過程,包括 RNA結(jié)合、RNA 復(fù)制、膜定位和重排、抑制自體吞噬[38]、病毒衣殼化和形態(tài)建成[39]以及抑制核因子kappaB(NF-κB)活性[40]。最新的研究發(fā)現(xiàn),2C 蛋白既是一種 RNA 解螺旋酶,以 ATP 依賴的方式從 3' ~ 5' 解開 RNA 螺旋,同時(shí)也發(fā)揮 RNA 分子伴侶的作用,在不依賴 ATP 的情況下,破壞螺旋的雙向穩(wěn)定性,促進(jìn) RNA 鏈退火和高級(jí)結(jié)構(gòu)的形成[41]。
在以 2C 蛋白為靶點(diǎn)的化合物中,鹽酸胍(Gua-HCl)(圖 5)是發(fā)現(xiàn)較早同時(shí)研究較多的一個(gè)化合物,它可在多個(gè)方面抑制病毒的復(fù)制,可以阻斷 RNA 負(fù)鏈起始合成,阻止 2C 蛋白及其前體與細(xì)胞膜的結(jié)合以及抑制其 ATP 酶活性。HBB 和 MRL-1237 也是兩種針對(duì) 2C 蛋白的化合物,對(duì)脊髓灰質(zhì)炎病毒和柯薩奇 A 型病毒有抑制作用,病毒對(duì)這兩種化合物的耐藥性存在極高的重疊度,提示這兩種化合物有著相同的作用機(jī)制[33]。還有一種苯并咪唑衍生物——TBZE-029,也被報(bào)道對(duì)柯薩奇病毒 A9 型(CVA9)以及??刹《?9 型和 11 型具有抑制作用,該化合物作用于 2C 蛋白的解螺旋酶活性區(qū)域,而不抑制 2C 蛋白的ATP 酶活性[42]。值得注意的是,TBZE-029 誘導(dǎo)產(chǎn)生的耐藥毒株也呈現(xiàn)出與 HBB 和 MRL-1237 的交叉耐藥性,這提示在病毒 2C 蛋白中存在一個(gè)變異累積的“熱點(diǎn)”區(qū)域,需要進(jìn)一步探索研究。
目前防治病毒感染的最佳手段是疫苗,但面對(duì)種類、數(shù)量如此眾多的腸道病毒,疫苗的研發(fā)之路艱難而漫長,發(fā)展廣譜抗病毒藥物仍是治療腸道病毒感染的重要手段,而且隨著近年來腸道病毒流行呈現(xiàn)抬頭趨勢(shì),這一任務(wù)顯得日益緊迫。本文集中總結(jié)了抗腸道病毒的病毒靶點(diǎn)和相關(guān)抗病毒化合物的研究進(jìn)展,雖然針對(duì)病毒靶點(diǎn)的藥物產(chǎn)生耐藥的幾率不低,但其對(duì)病毒選擇性高,對(duì)宿主細(xì)胞正常的生命活動(dòng)影響較小。此外,進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段的抗腸道病毒化合物也大多是針對(duì)病毒靶點(diǎn)。隨著對(duì)腸道病毒結(jié)構(gòu)蛋白以及非結(jié)構(gòu)蛋白研究的深入,逐漸有新的靶點(diǎn)和藥物設(shè)計(jì)見諸報(bào)道,抗腸道病毒藥物的研發(fā)及臨床應(yīng)用將有更多的方向和選擇。
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10.3969/j.issn.1673-713X.2016.05.012
遼寧省科技廳一般項(xiàng)目(L2015543);沈陽市科技計(jì)劃項(xiàng)目(F15-139-9-02);沈陽醫(yī)學(xué)院大學(xué)生科研立項(xiàng)(20160823)
110034 沈陽醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)系(張小康、馬曉良),醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)系(咼生容),化學(xué)教研室(張大軍)
張大軍,Email:zhangdajun2008@126.com
2016-05-25