李宏全, 郭興明, 鄭伊能
(重慶大學(xué) 生物工程學(xué)院,重慶市醫(yī)療電子技術(shù)工程研究中心,重慶 400044)
基于EMD和MFCC的舒張期心雜音的分類識別
李宏全, 郭興明, 鄭伊能
(重慶大學(xué) 生物工程學(xué)院,重慶市醫(yī)療電子技術(shù)工程研究中心,重慶 400044)
心音信號是一種具有非線性和非平穩(wěn)特性的振動信號,基于線性時變或時不變模型的特征提取方法勢必會忽略信號的一些內(nèi)在信息,為了更好的反映心音的本質(zhì)特征,提出了一種經(jīng)驗?zāi)J椒纸?Empirical Mode Decomposition,EMD)結(jié)合Mel頻率倒譜系數(shù)(Mel-Frequency Cepstrum Coefficient,MFCC)的舒張期心雜音的分類識別方法。心音信號經(jīng)EMD分解得到有限個固有模態(tài)函數(shù)(Intrinsic Mode Function,IMF),利用互相關(guān)系數(shù)準(zhǔn)則篩選出主IMF分量,分別提取主IMF分量的MFCC、MFCC的一階差分系數(shù)和Delta值,以此作為隱馬爾科夫模型的輸入向量,實現(xiàn)對臨床采集的正常心音和2類舒張期心雜音分類識別,實驗結(jié)果表明,該方法能有效的識別心音。
舒張期心雜音;經(jīng)驗?zāi)J椒纸猓籑el頻率倒譜系數(shù);隱馬爾科夫模型
心音是人體重要的生理信號之一,由心肌收縮、心臟瓣膜啟閉和血液撞擊房室壁、大動脈壁等引起的振動所產(chǎn)生的聲音。心雜音是指在正常心音與額外心音之外,在心臟收縮或舒張過程中由層流的血液轉(zhuǎn)變?yōu)橥牧骰蜾鰷u而沖擊心壁、大血管壁、瓣膜、腱索等使之振動而在相應(yīng)部位產(chǎn)生的異常聲音。心雜音包含重要的病理信息,對于心血管疾病的診斷具有重要價值[1]。根據(jù)雜音在心動周期中發(fā)生的時間,可將心雜音分為收縮期雜音、舒張期雜音和連續(xù)性雜音。根據(jù)雜音的臨床意義,可將心雜音分為病理性雜音和生理性雜音。通常情況下,收縮期雜音可以是病理性的,也可以為生理性的,而舒張期雜音為病理性雜音[1-2]。因此對舒張期心雜音信號進行識別分析對于心臟疾病的診斷具有重要的意義,同時也能避免生理性心雜音對識別結(jié)果的影響。
心音的分類識別一直是心音分析領(lǐng)域中的研究熱點,旨在利用分類器根據(jù)不同心音中雜音的內(nèi)在特征判定出不同的心音信號所屬的心臟疾病類型。目前許多學(xué)者提出了多種心音的特征提取和分類方法[3-5],但這些方法大多數(shù)建立在心音信號線性時變或時不變模型的基礎(chǔ)上。而心音心雜音為具有非線性和非平穩(wěn)特性的振動信號,線性的分析方法勢必會忽略信號內(nèi)部一些重要的信息。
經(jīng)驗?zāi)J椒纸?Empirical Mode Decomposition,EMD)是一種有效的時頻分析方法,能自適應(yīng)地將任何信號按頻率由高到低分解成多個固有模態(tài)函數(shù)(Intrinsic Mode Function,IMF),每個IMF分量包含原信號不同時間尺度的局部特征,對其分析可以更準(zhǔn)確的反映原信號細(xì)節(jié)特征的相關(guān)信息。由于EMD分解是基于信號局部的時變特點,因此它非常適合處理非線性和非平穩(wěn)信號[6]。故利用EMD對復(fù)雜的心音信號進行分解,再從分解得到的IMF分量中提取信號的特征信息更能反映心音的內(nèi)在本質(zhì)信息。Mel頻率倒譜系數(shù)(Mel-frequency Cepstrum Coefficient,MFCC)基于人耳對不同頻率的語音具有不同的感知能力而提出,具有較好的魯棒性[7],廣泛應(yīng)用于語音信號處理并取得較好的識別效果,而心音和語音都是振動信號且具有相似的特點[8],因此可將其應(yīng)用于心音特征提取。
本文采用EMD和MFCC相結(jié)合的心音特征提取方法,首先對心音進行EMD分解得到不同頻段的IMF分量,利用互相關(guān)系數(shù)準(zhǔn)則篩選出主IMF分量以去除虛假分量,計算主IMF分量的MFCC、MFCC的一階差分系數(shù)和Delta值,實現(xiàn)心音信號特征向量的有效提取,然后將特征向量輸入隱馬爾科夫模型(Hidden Markov Model, HMM)分類器實現(xiàn)正常心音和2類舒張期心雜音的分類識別。利用臨床采集到的病例數(shù)據(jù)進行測試,結(jié)果表明所提出的特征提取方法比單獨使用MFCC特征能夠獲得更高的識別率,說明所提方法是有效的,從而為心音信號的分類識別提供一種新的思路。
1.1 EMD方法原理
EMD是由Huang等提出的一種適用于分析非線性、非平穩(wěn)信號的時頻分析方法,能將復(fù)雜信號分解成有限個IMF分量。每個IMF分量必須滿足兩個條件:①在整個時間序列數(shù)據(jù)集中極值點的個數(shù)和過零點的個數(shù)相等或至多相差一個;②極大值包絡(luò)線和極小值包絡(luò)線在任何一點的均值為零。其原理如下:對于一時間序列信號x(t),首先確定出信號所有的局部極大值和局部極小值,然后利用三次樣條插值法對極值點進行處理得到極大值和極小值包絡(luò),并求出包絡(luò)均值曲線m(t),用x(t)減去m(t)可得:
(1)
將h1(t)作為新的信號重復(fù)k次上述步驟得到h1k(t),此時標(biāo)準(zhǔn)差SD為:
(2)
若SD≤0.3,令h1k(t)=cc1(t)即為所求的第一個固有模態(tài)分量IMF1,則剩余分量r1(t)=x(t)-cc1(t),對r1(t)繼續(xù)重復(fù)上述步驟直至rn(t)為一單調(diào)函數(shù),則分解過程結(jié)束。則此時信號x(t)可表示為
(3)
EMD通過迭代的方法將IMF分量按照頻率由高到低的順序依次從原始信號中分離出來,它們充分體現(xiàn)了原始信號所包含的細(xì)節(jié)成分。
1.2 隱馬爾科夫模型
HMM是一種在Markov鏈的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的動態(tài)時間序列統(tǒng)計模型,能夠通過較少的樣本訓(xùn)練出較為可靠的模型,按照模式匹配原理,尋找出與未知信號最為相似的模式作為識別結(jié)果[9],重在表達信號類別內(nèi)的相似程度,廣泛應(yīng)用于模式匹配、統(tǒng)計學(xué)習(xí)和分類識別。
HMM是由兩個隨機過程組成,其中一個隨機過程是描述每個狀態(tài)與觀察值之間的統(tǒng)計對應(yīng)關(guān)系,它解決了用短時模型來描述短時平穩(wěn)段信號的問題;另一個是用Markov鏈來描述狀態(tài)的轉(zhuǎn)移,它解決了每個短時平穩(wěn)段是如何轉(zhuǎn)變到下一個短時平穩(wěn)段的問題,這是基本的隨機過程[10]。一個HMM模型可以記為λ=(N,M,π,A,B)[11],其中N為模型的狀態(tài)數(shù);M為每個狀態(tài)所對應(yīng)的觀察值的數(shù)目;π為初始狀態(tài)概率矩陣;A為狀態(tài)轉(zhuǎn)移概率矩陣;B為觀察值概率矩陣。對于連續(xù)型HMM,B是一組觀察值概率函數(shù),M是高斯混合分量個數(shù)。
HMM模型運用于實際應(yīng)用時,有三個問題需要解決,即:①評估問題:給定觀察值序列O和模型λ,計算產(chǎn)生觀察值序列O的概率,常用的解決方法是前向-后向算法。在心音識別中,該問題可以描述為:給定一未知類型的心音信號和訓(xùn)練好的幾類心音模型,計算該心音信號與哪類心音模型產(chǎn)生的概率最大,則認(rèn)為該未知心音信號即是那一類心音;②解碼問題:給定觀察值序列O和模型λ,確定產(chǎn)生觀察值序列O概率最大的路徑,最常用的解決方法是Viterbi算法;③學(xué)習(xí)問題:根據(jù)給定觀察值序列O的訓(xùn)練集來確定產(chǎn)生該訓(xùn)練集最大概率的模型λ,常用的解決方法是Baum-Welch算法。
由于心音信號為一維時變序列,且連續(xù)混合高斯密度函數(shù)HMM模型與離散型HMM模型相比,具有失真小、分類更明顯的優(yōu)點,因此本文選擇左向右的連續(xù)混合高斯密度函數(shù)HMM模型。其中狀態(tài)數(shù)為N=5,高斯混合數(shù)為M=4。
由心臟瓣膜異常引起的舒張期心雜音包括二尖瓣狹窄(Mitral Stenosis,MS)、主動脈瓣關(guān)閉不全(Aortic Insufficiency,AI)、三尖瓣狹窄(Tricuspid Stenosis, TS)和肺動脈瓣關(guān)閉不全(Pulmonary Insufficiency, PI)。然而單純性的三尖瓣狹窄是極其罕見的,常常合并主動脈和二尖瓣疾病[12]。肺動脈瓣關(guān)閉多由肺動脈擴張導(dǎo)致相對性關(guān)閉不全所致,常見于二尖瓣狹窄合并肺動脈高壓。因此本文選擇二尖瓣狹窄和主動脈關(guān)閉不全兩類舒張期心雜音作為實驗對象。
實驗數(shù)據(jù)包含210例心音信號,其中60例二尖瓣狹窄、60例主動脈瓣關(guān)閉不全和90例正常心音(Normal Heart Sounds, NHS)。全部病理數(shù)據(jù)都是經(jīng)臨床醫(yī)生確診的單一性疾病,正常心音信號的測試者均無心血管疾病史。所有心音數(shù)據(jù)均采用重慶博精醫(yī)學(xué)信息研究所研制的“運動心力監(jiān)測儀”在重慶醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院采集獲得,其中采樣頻率為11 025 Hz,量化值為8 bit,文件采用wav格式保存。采集信號時,受試者均取端坐位,身體稍前傾,平穩(wěn)呼吸,心音傳感器置于受試者的心尖區(qū),輕輕均勻用力按壓使其緊貼心尖區(qū)皮膚。
3.1 預(yù)處理
心音是一種微弱的生理信號,在采集的過程中非常容易受人為或環(huán)境中噪聲的干擾,從而影響特征參數(shù)提取的準(zhǔn)確性,因此有必要對采集的心音信號進行消噪處理以突出其特征。對于心音信號去噪,小波變換是一種非常有效的方法[13],為此本文采用能量集中度高、時間局部性好的db6小波[14]、‘sqtwolog’閾值和5層分解的方法對采集的心音消噪,如圖1所示,一例臨床采集的主動脈瓣關(guān)閉不全心音信號去噪前后的效果對比,此方法能夠較好的保留心音的主要成分。
圖1 一例原始的主動脈關(guān)閉不全和消噪后的主動脈關(guān)閉不全
3.2 MFCC特征提取
人耳對不同頻率f的語音具有不同的感知能力,Mel頻率正是為了描述這種感知特性而提出,它與頻率f成非線性關(guān)系。MFCC則利用Mel頻率與f之間的關(guān)系,從Mel尺度頻率域提取的一種倒譜系數(shù),是語音相關(guān)識別研究中常用的特征參數(shù)[15]。其提取流程如下圖2所示,具體過程為:
(1) 對經(jīng)小波去噪后的心音信號s(n)預(yù)加重處理,以增強心音的高頻成分,然后分幀、2加窗得到每幀心音的時域信號x(n),其中窗為哈明窗,幀長25 ms,幀移10 ms。
(2) 將時域信號x(n)經(jīng)離散傅里葉變換得到線性頻譜X(k)。轉(zhuǎn)換公式為
(4)
式中,N為傅里葉變換的點數(shù)。
(3) 將線性頻譜X(k)通過一組Mel尺度的三角形濾波器組(即Mel頻率濾波器組)得到Mel頻譜,并通過對數(shù)能量的處理得到對數(shù)頻譜S(m)。
(5)
式中:M=24為濾波器組的個數(shù);Hm(k)為每個濾波器的傳遞函數(shù)。
(4) 將S(m)經(jīng)離散余弦變換變換到倒譜域,即可得到MFCC,計算公式為
(6)
圖2 MFCC提取過程
由于濾波器的個數(shù)是24,則可得到24維的MFCC倒譜系數(shù),有相關(guān)實驗表明最前若干維以及最后若干維的MFCC系數(shù)對信號的區(qū)分性能最大[16],因此本文取前12維的MFCC系數(shù)。
3.3 MFCC的一階差分系數(shù)特征提取
在提取MFCC以后即可計算其一階差分系數(shù),將其記為△MFCC,其計算公式為
(7)
式中:c(n)為一幀心音信號的MFCC特征參數(shù)序列;k為常數(shù),通常取2。由式(7)可以看出△MFCC為信號幀MFCC特征參數(shù)前后四幀的線性組合。
3.4 Delta特征提取
對MFCC特征向量序列在時序方向上做一次傅里葉變換,便可得到對應(yīng)于MFCC特征的Delta特征,Delta特征反映的是信號幀間的動態(tài)特性,也稱作是二維系數(shù)或速度系數(shù),其計算過程可簡化為
(8)
式中:D(t)表示第t幀MFCC特征的Detla特征;Θ表示第t幀時序變化的信號幀的數(shù)量。
3.5 基于EMD和MFCC的特征提取
3.5.1 主IMF分量的選取
對一例經(jīng)小波去噪后的主動脈瓣關(guān)閉不全的心音信號進行EMD分解,其分解結(jié)果見圖3。
圖3 一例主動脈瓣關(guān)閉不全的EMD分解圖
從圖3中看出主動脈瓣關(guān)閉不全的舒張期心雜音信號經(jīng)EMD分解成了按照頻率由高到低排列的11個IMF分量和1個殘余分量,不同的IMF分量包含不同的時間尺度。由于不同的心音信號的頻率范圍有所差異,則不同的心音信號所分解出來的IMF個數(shù)也不同,而原始信號最主要的本質(zhì)信息往往集中體現(xiàn)在某幾個IMF分量上,加上虛假分量的存在,因此必須對IMF分量進行篩選?;ハ嚓P(guān)函數(shù)是判斷在頻域內(nèi)兩個信號是否相關(guān)的一個指標(biāo),它可以用來確定目標(biāo)信號有多大可能性來自于輸入信號。故可采用互相關(guān)系數(shù)準(zhǔn)則對IMF分量篩選,即計算每階IMF分量與原消噪后的心音信號之間的互相關(guān)系數(shù),選擇系數(shù)較大的IMF分量作為主IMF分量。正常心音信號和2類舒張期心音信號的互相關(guān)系數(shù)平均值如表1所示,前4階IMF分量的互相關(guān)系數(shù)均大于0.1,而其它高階的IMF分量的互相關(guān)系數(shù)的均在0.01或更小的值,一般情況認(rèn)為,互相關(guān)系數(shù)大于0.1即可認(rèn)為兩個信號之間具有較強的相關(guān)性,則前四階IMF分量與原去噪后的心音信號具有較強的相關(guān)性,因此選擇IMF1~IMF4作為主IMF分量。
表1 各IMF分量與原去噪后的心音信號的互相關(guān)系數(shù)
Tab.1 Mutual correlation coefficients between the IMF components and the original de-noised signals
心音類型各IMF分量與原去噪后心音信號之間的互相關(guān)系數(shù)IMF1IMF2IMF3IMF4IMF5≥IMF6NHS0.4790.7620.2880.1030.019<0.01AI0.4430.3710.2130.1110.012<0.01MS0.8010.5230.2990.1530.013<0.01
3.5.2 基于IMF和MFCC的特征提取
在確定了主IMF分量即IMF1~IMF4后,分別對每個IMF分量單獨提取12維的特征參數(shù)MFCC、△MFCC及Delta值,經(jīng)組合形成三個特征向量EMD+MFCC、EMD+MFCC+△MFCC及EMD +MFCC+Delta,分別簡記為E+MFCC、E+M+△MFCC和E+M+Delta,他們的維數(shù)分別為48維、96維和96維,以此作為HMM識別模型的輸入向量。圖4顯示了從三類心音信號的主IMF分量第一幀中提取48維的MFCC。
為了評價所提出算法的有效性,對采集的210例心音數(shù)據(jù)按訓(xùn)練樣本與測試樣本1∶2的比例進行實驗,即70例心音信號用于訓(xùn)練HMM模型,余下的140例信號(正常心音信號60例,主動脈瓣關(guān)閉不全40例,二尖瓣狹窄40例)用于測試。程序運行平臺為Windows 7 系統(tǒng),CPU:Intel T6400 2.0 GHz,RAM:2 GB。采用狀態(tài)數(shù)為5和高斯混合數(shù)為4的HMM識別模型作為分類器,其不同特征提取方法的識別結(jié)果如表2所示。
圖4 主IMF分量中提取的第一幀48維的MFCC
表2 不同特征提取方法的識別結(jié)果
對表2縱向分析可知,特征參數(shù)MFCC的識別率最低僅為85.71%,而采用所提出的三種特征值提取方法所提取的特征參數(shù)的識別率均在90%及以上,均優(yōu)于單獨使用MFCC作為特征參數(shù)的識別率,說明復(fù)雜的心音信號經(jīng)EMD分解后,再從分解得到的IMF分量中提取特征信息更能反映心音信號的本質(zhì)特征。針對所提出的三種特征提取方法,E+MFCC 獲得了最低的識別率,E+M+Delta獲得了最高的識別率95.71%,因為MFCC僅反映了心音信號的靜態(tài)特性,忽略心音信號的動態(tài)特性,而△MFCC能夠反映心音信號的動態(tài)特性,將兩者結(jié)合可更好的反映信號的特征信息,故特征參數(shù)E+M+△MFCC的識別率高于E+MFCC;MFCC、△MFCC均只考慮了幀內(nèi)的關(guān)系,并未考慮到幀與幀之間的動態(tài)聯(lián)系,參數(shù)Delta值能夠反映信號幀間的時變特性,有助于提高識別率,因此特征參數(shù)E+M+Delta獲得了最高的識別率。
表3 不同分類器的識別結(jié)果
針對分類方法,選擇具有較優(yōu)學(xué)習(xí)性能和較強分類能力的BT-SVM與本文的HMM進行對比,其中SVM的核函數(shù)選取RBF,決定其性能的兩個參數(shù)懲罰因子和核參數(shù)的取值均為2,特征向量選取E+M+Delta,其識別結(jié)果如表3所示。結(jié)果表明HMM模型獲得了比SVM更佳的識別性能,這與文獻[11]的結(jié)論一樣。雖然其訓(xùn)練時間要稍長于SVM,但也在合理范圍之內(nèi)。綜上,HMM更適用于對本文所提取的特征參數(shù)進行分類識別。
心音是一種具有非線性和非平穩(wěn)性的振動信號,針對基于線性時變或時不變模型的心音特征提取方法不能充分體現(xiàn)心音的內(nèi)在的特征信息,提出了基于EMD和MFCC相結(jié)合的舒張期心雜音信號的分類識別方法。小波去噪后的原始心音信號經(jīng)EMD分解成有限個IMF分量,這些IMF分量充分體現(xiàn)信號的局部特征信息,實現(xiàn)信號的特征信息的分離。然后提取主IMF分量的MFCC、△MFCC及Detla值,經(jīng)特征組合形成E+MFCC、E+M+△MFCC和E+M+Delta三個特征向量,結(jié)合HMM分類器對臨床采集到的210例心音信號進行試驗分析,得到了比單獨使用MFCC作為特征向量更高的識別率。同時將本文采用的HMM與SVM進行對比,其結(jié)果表明針對于本文所提出的特征參數(shù),HMM比SVM具有更優(yōu)的識別性能。因此,本文提出的三種特征值提取方法能夠有效的對心音進行分類識別,為心音信號的分類識別提供了一種新的方法,對進一步實現(xiàn)心臟疾病的臨床輔助診斷具有重要價值。
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Classification and recognition of diastolic heart murmurs based on EMD and MFCC
LI Hongquan, GUO Xingming, ZHENG Yineng
(Chongqing Engineering Research Center for Medical Electronic Technology, College of Bioengineering, Chongqing University, Chongqing 400044, China)
Heart sound is a kind of vibration signals with characteristics of nonlinearity and non-stationarity. So the feature extraction methods based on linear time-variant or time-invariant models are bound to ignore some important internal information of heart sound signals. To better reveal the essential features of heart sound signals, a new feature extraction method based on the empirical mode decomposition (EMD) and Mel-frequency cepstral coefficient (MFCC) was proposed to classify diastolic heart murmurs. Firstly, the heart sounds were decomposed into finite intrinsic mode functions (IMFs) with EMD. Then the main IMF components were selected with the mutual correlation coefficient criterion. The main IMF components’ MFCCs, MFCCs’ first-order difference coefficients and Delta values were extracted, respectively. Finally, those were taken as input vectors of a hidden Markov model (HMM) to classify and identify normal heart sounds (NHSs) and two kinds of diastolic heart murmurs acquired from clinic. The test results showed that the proposed method can be used to distinguish the three types of heart sound signals effectively.
diastolic heart murmurs; empirical mode decomposition (EMD); Mel-frequency cepstral coefficient (MFCC); hidden Markov model
國家自然科學(xué)基金(31570003)
2016-02-24 修改稿收到日期:2016-04-06
李宏全 男,碩士生,1989年生
郭興明 男,教授,博士生導(dǎo)師,1964年生
R318.04
A
10.13465/j.cnki.jvs.2017.11.002