陳建坤
蛋白質(zhì)作為生命活動(dòng)的執(zhí)行者和體現(xiàn)者,與生物的遺傳、疾病等都有著重要關(guān)聯(lián)。在細(xì)胞內(nèi),有些蛋白質(zhì)是先合成再進(jìn)行分選轉(zhuǎn)運(yùn),如線粒體、葉綠體、細(xì)胞核等結(jié)構(gòu)中的蛋白質(zhì);而有些是邊合成邊分選轉(zhuǎn)運(yùn),如分泌蛋白、膜蛋白等。細(xì)胞根據(jù)蛋白質(zhì)是否攜有分選信號(hào)(信號(hào)序列)以及分選信號(hào)的性質(zhì),有選擇地將蛋白質(zhì)運(yùn)送到細(xì)胞的不同部位。
1分選信號(hào)的種類
分選信號(hào)有兩類:①信號(hào)肽:蛋白質(zhì)多肽鏈上一段連續(xù)的特定氨基酸序列,一般位于新肽鏈的N端,屬于一級(jí)結(jié)構(gòu)。完成分選任務(wù)后常被切除。②信號(hào)斑:位于多肽鏈不同部位的幾個(gè)特定氨基酸序列經(jīng)折疊后形成的斑塊區(qū),是一種三維結(jié)構(gòu)。完成分選任務(wù)后,仍然存在。
2原核細(xì)胞中蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)途徑
原核細(xì)胞(如細(xì)菌)沒有復(fù)雜的生物膜系統(tǒng)。但是為了維持生命,原核細(xì)胞需要合成一些蛋白質(zhì)分泌到細(xì)胞質(zhì)或者轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞外發(fā)揮作用。原核生物中蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)分泌途徑主要包括3種:①一般分泌途徑,即SEC途徑;②雙精氨酸移位酶途徑,即TAT途徑;③信號(hào)顆粒識(shí)別途徑,即SRP途徑。除此之外,還有V型分泌途徑、TPS分泌途徑和分子伴侶引導(dǎo)分泌途徑等。
①一般分泌途徑,即SEC途徑:SEC分泌途徑是原核生物中蛋白質(zhì)主要的跨膜運(yùn)輸機(jī)制,主要由SEC移位酶作為介導(dǎo)。SEC途徑可以轉(zhuǎn)運(yùn)多種蛋白質(zhì),包括毒性因子、菌毛、黏附素和蛋白酶等。SEC途徑主要功能是把尚未折疊完成的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到質(zhì)膜外,在質(zhì)膜外折疊成有活性的蛋白質(zhì)。SEC途徑大致可分為3個(gè)過程:信號(hào)序列的識(shí)別與定位、跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)和多肽的釋放。
②雙精氨酸移位酶途徑,即TAT途徑:TAT途徑識(shí)別的肽鏈N端信號(hào)序列通常含有兩個(gè)連續(xù)的精氨酸殘基。TAT途徑主要轉(zhuǎn)運(yùn)已經(jīng)折疊完成的蛋白質(zhì),而尚未折疊完成的蛋白質(zhì)通常不能通過該系統(tǒng)分泌,從而避免未完成折疊蛋白在胞外被降解的命運(yùn),保證了分泌產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)和功能的準(zhǔn)確性。此外,TAT途徑還可以將少數(shù)蛋白質(zhì)整合到質(zhì)膜中。
③信號(hào)顆粒識(shí)別途徑,即SRP途徑:SRP途徑是原核細(xì)胞內(nèi)專一性轉(zhuǎn)運(yùn)質(zhì)膜蛋白。SRP介導(dǎo)的質(zhì)膜定位是一個(gè)共翻譯過程。新生肽在核糖體上合成的同時(shí)N端信號(hào)序列在SRP的作用之下,與質(zhì)膜上的SPR受體結(jié)合識(shí)別完成定位。
3真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)分選轉(zhuǎn)運(yùn)途徑
真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)是在核糖體上合成后,根據(jù)細(xì)胞需求運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞內(nèi)的各個(gè)部位(如線粒體、葉綠體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、細(xì)胞核、細(xì)胞膜等)或者被運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外(圖1)。
3.1真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)的分選轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制和運(yùn)輸方式
真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)的分選轉(zhuǎn)運(yùn)可分為兩條途徑:
①翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)途徑:先在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)游離的核糖體上合成多肽鏈,然后再轉(zhuǎn)運(yùn)到眾多細(xì)胞器或者留在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中利用。
②共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)途徑:蛋白質(zhì)合成在游離核糖體上起始之后,由信號(hào)肽引導(dǎo)轉(zhuǎn)移至糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng),然后新生肽邊合成邊轉(zhuǎn)入糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,再經(jīng)高爾基體的加工包裝運(yùn)至溶酶體、細(xì)胞膜或分泌細(xì)胞外。根據(jù)轉(zhuǎn)運(yùn)到的部位不同,細(xì)胞內(nèi)部利用的蛋白質(zhì)稱為胞內(nèi)蛋白,分泌到細(xì)胞外發(fā)揮作用的稱為分泌蛋白。
真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)的運(yùn)輸方式通常有以下3種形式:
①門控運(yùn)輸,主要指通過核孔復(fù)合體進(jìn)行。核可調(diào)控的門,可介導(dǎo)選擇性的雙向運(yùn)輸。此過程需要消耗能量。進(jìn)出細(xì)胞核的蛋白質(zhì)分別含有核定位信號(hào)和核輸出信號(hào)。這兩種信號(hào)序列可為信號(hào)肽或信號(hào)斑,分別被門控上的核輸入受體和核輸出受體識(shí)別,一般不被切除,可反復(fù)使用。
②穿膜運(yùn)輸:主要指蛋白質(zhì)從細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)穿越細(xì)胞器膜,分別進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、線粒體、葉綠體等細(xì)胞器的過程。蛋白質(zhì)上的分選信號(hào)被靶細(xì)胞器膜的轉(zhuǎn)運(yùn)子所識(shí)別。此過程需要消耗能量。
③小泡運(yùn)輸:細(xì)胞器之間通過運(yùn)輸小泡進(jìn)行的蛋白質(zhì)運(yùn)輸。如分泌蛋白和神經(jīng)遞質(zhì)的合成分泌過程中囊泡的運(yùn)輸,胞吞作用中出現(xiàn)的小泡等。此過程體現(xiàn)了生物膜的流動(dòng)性,運(yùn)輸小泡表面通常有特殊標(biāo)記,可被靶膜上的受體識(shí)別。此過程需要消耗能量。
3.2分泌蛋白的分選和轉(zhuǎn)運(yùn)
分泌蛋白的分選轉(zhuǎn)運(yùn)與信號(hào)肽有著重要關(guān)聯(lián),屬于共翻譯轉(zhuǎn)運(yùn)途徑。信號(hào)肽通常包括16~26個(gè)氨基酸殘基,可分為三部分:疏水核心區(qū)、信號(hào)肽的C端和信號(hào)肽N端。分泌蛋白質(zhì)首先在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)游離的核糖體上起始合成,當(dāng)多肽鏈延伸至80個(gè)氨基酸左右時(shí),N端信號(hào)肽暴露出來。在信號(hào)識(shí)別顆粒(SRP)的協(xié)助下,N端信號(hào)肽與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上SRP受體識(shí)別結(jié)合,使內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜產(chǎn)生通道。在信號(hào)肽的引導(dǎo)之下,新合成的肽鏈通過通道進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔。進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔后,信號(hào)肽被信號(hào)肽酶所降解。新合成的肽鏈如果存在停止轉(zhuǎn)移序列,該序列可以與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜有著很強(qiáng)的結(jié)合能力從而使得肽鏈轉(zhuǎn)移停留,這種多肽鏈最終轉(zhuǎn)變?yōu)閮?nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的跨膜蛋白。進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔的多肽鏈經(jīng)糖基化等修飾加工,再經(jīng)高爾基體的加工分類包裝,以囊泡的方式運(yùn)至溶酶體、細(xì)胞膜或者分泌細(xì)胞外。
3.3線粒體內(nèi)的蛋白質(zhì)分選和轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制
這類蛋白質(zhì)首先在核糖體上初步合成為不成熟蛋白質(zhì),稱為前體蛋白,屬于翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)途徑。前體蛋白中已經(jīng)存在信號(hào)序列。信號(hào)序列會(huì)被位于線粒體外膜上的外膜受體復(fù)合體所識(shí)別,通過外膜受體蛋白和內(nèi)膜受體蛋白所形成膜蛋白通道進(jìn)入線粒體。進(jìn)入之后,N端信號(hào)肽就會(huì)被信號(hào)肽酶切除水解。切除信號(hào)肽的蛋白質(zhì)在線粒體基質(zhì)中進(jìn)行空間折疊,形成成熟的蛋白質(zhì)。整個(gè)過程需要消耗能量。轉(zhuǎn)運(yùn)到葉綠體、氧化物酶體的蛋白質(zhì)與此過程類似,只是依賴的信號(hào)序列不同而已。此外,有的細(xì)胞器蛋白在穿越細(xì)胞器膜時(shí),需要分子伴侶的協(xié)助。分子伴侶可以幫助這些前體蛋白解折疊或者維持非折疊狀態(tài),便于通過膜蛋白通道。
無論原核細(xì)胞還是真核細(xì)胞,蛋白質(zhì)能準(zhǔn)確到達(dá)目的地,不僅僅取決于信號(hào)序列,還與目的地的信號(hào)識(shí)別裝置有關(guān)。蛋白質(zhì)分選不僅保證了蛋白質(zhì)的正確定位,也保證了蛋白質(zhì)的生物學(xué)活性。