沈子又 張超 董彬 付建新 胡紹慶 趙宏波
(1. 浙江農(nóng)林大學(xué)風(fēng)景園林與建筑學(xué)院,臨安 311300;2. 浙江理工大學(xué)建筑工程學(xué)院,杭州 310018)
類胡蘿卜素是由異戊二烯骨架構(gòu)成的C40或C30萜類化合物,是一類重要的天然色素的總稱,在可見光下呈紅色、橙色或黃色[1],是果實(shí)和花的重要呈色物質(zhì)之一。番茄紅素環(huán)化是類胡蘿卜素代謝中的一個(gè)重要分支點(diǎn),植物中存在兩種番茄紅素環(huán)化酶(LCYB和LCYE)。LCYB能對稱地催化番茄紅素兩端各生成1個(gè)β環(huán),只有一端被環(huán)化時(shí),生成γ-胡蘿卜素,另一端進(jìn)一步被環(huán)化后則生成β-胡蘿卜素;LCYE僅能催化番茄紅素的一端生成ε環(huán),即δ-胡蘿卜素,另一端再由LCYB進(jìn)一步催化生成α-胡蘿卜素[2]。氨基酸序列分析表明擬南芥中的LCYB和LCYE同源性為36%,可能有共同的起源[3]。LCYB和LCYE基因表達(dá)的相對水平?jīng)Q定了下游由β-胡蘿卜素代謝生成的β-隱黃質(zhì)、玉米黃質(zhì)、新黃質(zhì)以及由α-胡蘿卜素代謝生成的α-隱黃質(zhì)和葉黃素等在類胡蘿卜素總量中的比例[4-5]。果實(shí)中有大量的類胡蘿卜素積累,目前克隆出的LCYB和LCYE基因大多為果實(shí)和作物中分離出來的。在番茄果實(shí)中克隆得到番茄紅素 -β-環(huán)化酶 -CrtL-b(LCYB)[6]、番茄紅素 -ε-環(huán)化酶 -CrtL-e(LCYE)[7];玉米中克隆和鑒定的LCYB和LCYE基因[8-9];甘薯中分離出了 LCYE 基因[10]和 LCYB 基因等[11]。
桂花(Osmanthus fragrans Lour.)隸屬于木犀科木犀屬(Osmanthus),是我國十大傳統(tǒng)名花之一,也是重要的園林綠化樹種。根據(jù)開花特性不同,可分為秋桂和四季桂,秋桂品種按照花色不同又分為金桂品種群(黃色至金黃色系)、銀桂品種群(黃白色至黃色系)和丹桂品種群(橙色至橙紅色系)[12]。桂花花瓣中含有類黃酮化合物和類胡蘿卜素兩大類色素成分,在黃酮類化合物形成基本淺黃色系的基礎(chǔ)上,決定不同品種間花色變化的主要成分是類胡蘿卜素,且類胡蘿卜素種類及其含量的變化決定不同品種花色的差異[13]。前期研究發(fā)現(xiàn),OfLCYB1、OfLCYE1等基因的差異表達(dá)決定了類胡蘿卜素代謝分支下游產(chǎn)物的含量。本研究克隆OfLCYB和OfLCYE基因啟動子序列,分析順式作用元件,構(gòu)建其植物表達(dá)載體并進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá)分析,以期為明確OfLCYB和OfLCYE基因參與類胡蘿卜素代謝及其調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
實(shí)驗(yàn)材料為6-8年生的丹桂品種‘堰虹桂’(Osmanthus fragrans ‘Yanhong Gui’),種植于浙江農(nóng)林大學(xué)桂花資源圃。
DNA限制性內(nèi)切酶、LA Taq酶、核酸分子量標(biāo)準(zhǔn)(DNA marker ladder)、T4-DNA連接酶、克隆載體pMD18-T、大腸桿菌感受態(tài)DH5α以及瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、普通質(zhì)粒小提試劑盒、In-Fusion HD Cloning Kit、XbaI和Hind Ⅲ等均購自TaKaRa公司,染色用X-gluc(5-溴-4-氯-3-吲哚基-beta-D-葡糖苷酸環(huán)己胺鹽)購于上海生工,pBI121由本實(shí)驗(yàn)室保存,其他常規(guī)試劑采用進(jìn)口分裝或國產(chǎn)分析純。
1.2.1 桂花啟動子的克隆及序列分析 基因組DNA的提取采用CTAB法[14]。根據(jù)‘堰虹桂’LCYB和LCYE基因序列設(shè)計(jì)引物,由生工生物工程(上海)有限公司合成(表1)。用限制性內(nèi)切酶DraI、StuI、Pvu II和EcoR V分別對桂花基因組DNA進(jìn)行酶切并連接接頭,進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增。第二輪反應(yīng)模板為第一輪反應(yīng)產(chǎn)物1 μL與49 μL ddH2O混合產(chǎn)物。50 μLPCR 反應(yīng)體系為 :模板 DNA 1 μL,AP1/AP2 1 μL,GSP1/GSP2 1 μL,10×La PCR buffer 5 μL,dNTP 5 μL,Mg2+3.75 μL,LA Taq 1 μL,ddH2O 32.5 μL。第一輪PCR反應(yīng)條件為:94℃ 25 s,72℃ 3 min,7個(gè)循環(huán);94℃ 25 s,67℃ 3 min,32個(gè)循環(huán);67℃ 7 min。第二輪PCR反應(yīng)條件為:94℃ 25 s,72℃ 3 min,5 個(gè)循環(huán) ;94℃ 25 s,67℃ 3 min,20個(gè)循環(huán);67℃,7 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,切下目的條帶,使用凝膠回收試劑盒回收并純化。將純化產(chǎn)物與pMD18-T載體連接,再轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,接種到含Amp(50 mg/L)的LB平板上37℃培養(yǎng)14-16 h,挑取單菌落進(jìn)行PCR,測序。用Plantcare(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)對啟動子序列結(jié)果進(jìn)行順式作用元件預(yù)測。
表1 啟動子克隆相關(guān)引物序列
1.2.2 OfLCYB和OfLCYE啟動子表達(dá)載體的構(gòu)建 根據(jù)上述研究中克隆出的OfLCYB和OfLCYE啟動子設(shè)計(jì)引物(表2),使用In-Fusion HD Cloning Kit進(jìn)行表達(dá)載體的構(gòu)建。表達(dá)載體pBI121用XbaI和 Hind Ⅲ雙酶切,10 μL連接體系為2 μL 5× In-Fusion HD Enzyme Premix,2 μL pBI121 純化產(chǎn)物,6 μL目的片段。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。挑取單菌落搖菌后進(jìn)行PCR檢測,測序。
表2 啟動子表達(dá)載體相關(guān)引物
1.2.3 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的煙草轉(zhuǎn)化與瞬時(shí)表達(dá) 制備農(nóng)桿菌感受態(tài),將構(gòu)建好的載體轉(zhuǎn)化到根癌農(nóng)桿菌GV3101中[15],將煙草葉片剪成切成0.5 cm×0.5 cm的葉塊,在農(nóng)桿菌菌液濃度OD600為0.6的侵染液中浸染10 min,用無菌濾紙吸干葉片表面的菌液,將侵染的外植體移至于無菌水浸潤的濾紙上培養(yǎng)24 h并進(jìn)行GUS染色,37℃下保溫16-24 h。用乙酸∶乙醇(3∶1)的混合液脫色后取出觀察染色結(jié)果[16]。
以‘堰虹桂’基因組DNA為模板通過兩輪PCR擴(kuò)增分別獲得OfLCYB和OfLCYE啟動子片段大約1 kb和900 bp(圖1)。將此片段回收,與pMD18-T載體連接,經(jīng)菌落PCR驗(yàn)證后,證明該啟動子片段已克隆到pMD18-T載體上。陽性克隆測序結(jié)果表明,OfLCYB序列長度為1 028 bp,OfLCYE序列長度904 bp。
通過Plantcare對OfLCYB和OfLCYE啟動子進(jìn)行序列分析發(fā)現(xiàn),OfLCYB啟動子在起始密碼子上游-156 bp處發(fā)現(xiàn)核心元件TATA-box,且多處發(fā)現(xiàn)CAAT-box,同時(shí)還有光響應(yīng)元件ACE、Box 4、GATT-motif、Sp1,脫落酸響應(yīng)元件ABRE,赤霉素響應(yīng)元件P-box,水楊酸響應(yīng)元件TCA-element,高轉(zhuǎn)錄水平順式作用元件5' UTR Py-rich stretch,參與晝夜控制的順式作用調(diào)節(jié)元件circadian,MYB結(jié)合位點(diǎn)MBS以及防御和應(yīng)激反應(yīng)中的元件TC-rich repeats等(圖2)。OfLCYE啟動子中TATA-box位于起始密碼子上游-295 bp處,同時(shí)還有兩個(gè)光響應(yīng)元件AE-box、G-box,赤霉素響應(yīng)元件GARE-motif,水楊酸響應(yīng)元件TCA-element,熱擊響應(yīng)元件HSE,參與蛋白代謝調(diào)節(jié)的順式調(diào)控原件O2-site,厭氧誘導(dǎo)必需的調(diào)控元件ARE,胚乳表達(dá)所需的調(diào)控元件Skn-1_motif等(圖 3)。
圖1 ‘堰虹桂’OfLCYB(A)和OfLCYE(B)啟動子擴(kuò)增圖譜
構(gòu)建OfLCYB和OfLCYE啟動子表達(dá)載體經(jīng)菌落PCR鑒定準(zhǔn)確無誤后命名為PBI121-LCYB、PBI121-LCYE。以煙草的葉為受體材料,以含pBI121載體的菌株為陽性對照,以GV3101空菌株為陰性對照,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的瞬時(shí)表達(dá)法對OfLCYB和OfLCYE啟動子表達(dá)特性進(jìn)行分析。圖4顯示,在農(nóng)桿菌侵染后的煙草葉片中除了GV3101外均檢測到GUS基因的產(chǎn)物,表明所克隆的桂花基因OfLCYB和OfLCYE啟動子序列具有啟動子功能,同時(shí)也表明這兩個(gè)啟動子均具有驅(qū)動下游GUS報(bào)告基因表達(dá)的能力。但由圖中結(jié)果可以看出,OfLCYB啟動子驅(qū)動報(bào)告基因在煙草葉片中只是少量表達(dá)(圖4-C)。
圖2 OfLCYB啟動子中相關(guān)順式作用元件預(yù)測分析
目前在花中LCYB和LCYE基因已從菊花(Chrysanthemum moriflium)[17]、黃花龍膽(Gentiana lutea)[5]、金花茶(Camellia nitidissima)[18]、鶴望蘭(Strelitzia reginae)[19]等植物中分離出來。‘堰虹桂’花瓣中的類胡蘿卜素主要為α-胡蘿卜素和β-胡蘿卜素。對類胡蘿卜素合成途徑中的相關(guān)基因進(jìn)行qRT-PCR分析,在鈴梗期到初開期的過程中OfLCYE表達(dá)量上升,到盛開期下降[20]。
植物啟動子在調(diào)控基因表達(dá)過程中起關(guān)鍵作用,關(guān)于LCYB和LCYE啟動子的研究較少,目前僅在番茄(Solanum habrochaites)[21]、杧 果(Mangifera indica)[22]、西瓜(Citrullus lanatus)[23]等作物上有報(bào)道。李靜[24]在研究黃瓜和西瓜基因組中類胡蘿卜素合成相關(guān)基因的比較分析中將3種葫蘆科植物的LCYB和LCYE啟動子序列進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)LCYB的啟動子序列是高度保守的,而LCYE啟動子序列不同物種間會有一段序列的插入或缺失,但這并不是造成番茄紅素積累差異的原因。柑橘CsLCYb1啟動子長度為1 584 bp,含有大量激素響應(yīng)元件如赤霉素響應(yīng)元件GARE-motif、水楊酸響應(yīng)元件the TCA motif和生長素響應(yīng)元件TGA motif等,并通過相應(yīng)的激素誘導(dǎo)說明其能提高CsLCYb1啟動子活性[25]。外源GA3處理抑制番茄成熟過程中各部位類胡蘿卜素和番茄紅素含量,對β-胡蘿卜素含量的影響表現(xiàn)為先抑制后促進(jìn)的作用;外源ABA處理増加了番茄果實(shí)中類胡蘿素和β-胡蘿卜素的含量[26]。OfLCYB和OfLCYE啟動子都具有多個(gè)激素響應(yīng)元件。OfLCYB啟動子中包含一個(gè)脫落酸響應(yīng)元件ABRE,水楊酸響應(yīng)元件TCA-element和一個(gè)赤霉素響應(yīng)元件P-box;OfLCYE啟動子中包含一個(gè)赤霉素響應(yīng)元件GARE-motif和3個(gè)水楊酸響應(yīng)元件TCA-element,推測這兩個(gè)啟動子的轉(zhuǎn)錄水平應(yīng)該受到ABA、赤霉素和水楊酸等激素的影響。有研究表明植物基因5'UTR區(qū)對基因的表達(dá)調(diào)控起著重要作用[27],水稻中的5' UTR的內(nèi)含子可使rubi3的轉(zhuǎn)錄水平大幅度提升[28]。在OfLCYB啟動子-585 bp處有一個(gè)5' UTR區(qū),可能對該基因的表達(dá)起重要的調(diào)控作用。在OfLCYB啟動子-896 bp處發(fā)現(xiàn)一個(gè)MYB的結(jié)合位點(diǎn)MBS,推測MYB也可能對LCYB的表達(dá)起調(diào)控作用。OfLCYE啟動子-520 bp處含有一個(gè)熱激響應(yīng)元件HSE,表明該基因表達(dá)可能受溫度調(diào)控。除此之外,OfLCYB和OfLCYE啟動子含有多個(gè)不同類型的光響應(yīng)元件,如ACE、Box 4、GATT-motif、Sp1、AE-box和G-box,推測OfLCYB和OfLCYE啟動子的表達(dá)可能受光信號的調(diào)控。在不同的光周期和不同的光質(zhì)條件下,越桔(Vaccinium myrtillus L.)果實(shí)中包括LCYB和LCYE在內(nèi)的類胡蘿卜素代謝途徑中的相關(guān)基因表達(dá)水平不同,說明光照對LCYB和LCYE的表達(dá)可能有一定的影響[29]。
圖3 OfLCYE啟動子中相關(guān)順式作用元件預(yù)測分析
圖4 OfLCYB和OfLCYE啟動子瞬時(shí)表達(dá)檢測
瞬時(shí)表達(dá)結(jié)果表明OfLCYB和OfLCYE啟動子可以驅(qū)動GUS基因在煙草葉片中的表達(dá),但OfLCYB啟動子驅(qū)動基因表達(dá)較少,這可能是由于OfLCYB啟動子活性較低或具有組織表達(dá)特異性所致。前期研究發(fā)現(xiàn)在不同溫度處理下‘堰虹桂’OfLCYB和OfLCYE的表達(dá)量隨溫度變化有明顯變化,尤其是OfLCYB基因。本研究對OfLCYB和OfLCYE啟動子中的元件預(yù)測發(fā)現(xiàn)僅OfLCYE啟動子中含與溫度相關(guān)的元件HSE,而OfLCYB啟動子中大多數(shù)為激素相關(guān)元件。在用25 mg/L和50 mg/L的水楊酸對紅潮球菌(Haematococcus pluvialis)進(jìn)行處理發(fā)現(xiàn)包括LCY基因在內(nèi)的部分類胡蘿卜素代謝相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄水平得到明顯提高[30]。因此推測在桂花中這些激素先與溫度相互作用,而后進(jìn)一步共同調(diào)控基因的表達(dá)。相關(guān)結(jié)果有待進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)加以驗(yàn)證。
本實(shí)驗(yàn)克隆了桂花番茄紅素環(huán)化酶基因OfLCYB和OfLCYE啟動子,并通過瞬時(shí)表達(dá)分析證明了這兩個(gè)啟動子具有活性。這兩個(gè)啟動子都含有一些水楊酸、赤霉素等激素響應(yīng)元件,推測對這兩個(gè)基因的表達(dá)起了一定作用。
[1]Hirschberg J. Carotenoid biosynthesis in flowering plants[J]. Curr Opin Plant Biol, 2001, 4(3):210-218.
[2]高慧君, 明家琪, 張雅娟, 等. 園藝植物中類胡蘿卜素合成與調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 園藝學(xué)報(bào), 2015, 42(9):1633-1648.
[3]Jr CF, Pogson B, Sun Z, et al. Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic carotenoid formation[J]. Plant Cell, 1996, 8(9):1613-1626.
[4]Harjes CE, Rocheford TR, Bai L, et al. Natural genetic variation in lycopene epsilon cyclase tapped for maize biofortification[J].Science, 2008, 319(5861):330-333.
[5]Zhu C, Yamamura S, Nishihara M, et al. cDNAs for the synthesis of cyclic carotenoids in petals of Gentiana lutea and their regulation during flower development[J]. Biochimica Et Biophysica Acta,2003, 1625(3):305-308.
[6]Pecker I, Gabbay R, Cunningham FX, et al. Cloning and characterization of the cDNA for lycopene β-cyclase from tomato reveals decrease in its expression during fruit ripening[J]. Plant Molecular Biology, 1996, 30(4):807-819.
[7]Ronen G, Cohen M, Zamir D, et al. Regulation of carotenoid biosynthesis during tomato fruit development:expression of the gene for lycopene epsilon-cyclase is down-regulated during ripening and is elevated in the mutant Delta[J]. Plant Journal, 1999, 17(4):341-351.
[8]Singh M, Brutnell TP. Activator mutagenesis of the pink scutellum1/viviparous7 locus of maize[J]. Plant Cell, 2003, 15(4):874.
[9]Bai L, Kim EH, Dellapenna D, et al. Novel lycopene epsilon cyclase activities in maize revealed through perturbation of carotenoid biosynthesis[J]. Plant Journal for Cell & Molecular Biology, 2009,59(4):588-599.
[10]Ling YU, Hong Z, Wei C, et al. Cloning and Functional Analysis of Lycopene ε-Cyclase(IbLCYe)Gene from Sweetpotato, Ipomoea batatas(L.)Lam[J]. Journal of Integrative Agriculture, 2013,12(5):773-780.
[11]Sun HK, Jeong JC, Park S, et al. Down-regulation of sweetpotato lycopene β-cyclase gene enhances tolerance to abiotic stress in transgenic calli[J]. Mol Biol Rep, 2014, 41(12):8137-8148.
[12]向其柏, 劉玉蓮. 中國桂花品種圖志[M]. 杭州:浙江科學(xué)技術(shù)出版社, 2008.
[13]王藝光. 桂花花瓣類胡蘿卜素的呈色作用及其響應(yīng)溫度變化的機(jī)制[D]. 杭州:浙江農(nóng)林大學(xué), 2016.
[14] 王關(guān)林, 方宏筠. 植物基因工程[M]. 第2版. 北京:科學(xué)出版社, 2002.
[15]An G. Binary ti vectors for plant transformation and promoter analysis[J]. Methods in Enzymology, 1987, 153(153C):292-305.
[16] 李孟嬌. 柑橘果實(shí)成熟特異啟動子的分離與功能初步分析[D]. 杭州:浙江農(nóng)林大學(xué), 2013.
[17] Kishimoto S, Ohmiya A. Regulation of carotenoid biosynthesis in petals and leaves of chrysanthemum(Chrysanthemum moriflium)[J]. Physiol Plant, 2006, 128(3):436-447.
[18] 周興文, 康梅生, 馮曉娟, 孫迎坤. 金花茶CnLCYE基因cDNA克隆及表達(dá)載體構(gòu)建[J]. 分子植物育種, 2017, 15(7):2556-2562.
[19]樊榮輝, 黃敏玲, 鐘淮欽, 林兵. 鶴望蘭番茄紅素β-環(huán)化酶基因SrLCYB的克隆及表達(dá)分析[J]. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào),2016, 38(4):382-388.
[20]Zhang C, Wang Y, Fu J, et al. Transcriptomic analysis and carotenogenic gene expression related to petal coloration in Osmanthus fragrans, ‘Yanhong Gui’[J]. Trees, 2016, 30(4):1207-1223.
[21]Dalal M, Chinnusamy V, Bansal KC. Isolation and functional characterization of lycopene beta-cyclase(CYC-B)promoter from Solanum habrochaites[J]. Bmc Plant Biology, 2010, 10(1):1-15.
[22]許文天, 馬小衛(wèi), 武紅霞, 等. 杧果MiLCYB2基因啟動子的克隆與序列分析[J]. 果樹學(xué)報(bào), 2015, 32(4):561-566.
[23]Bang H, Yi G, Kim S, et al. Watermelon lycopene-β-cyclase :promoter characterization leads to the development of a PCR marker for allelic selection[J]. Euphytica, 2014, 200(3):363-378.
[24]李靜. 黃瓜和西瓜基因組中類胡蘿卜素合成相關(guān)基因的比較分析[D]. 泰安:山東農(nóng)業(yè)大學(xué), 2014.
[25] Lu S, Yin Z, Zheng X, et al. Isolation and functional characterization of a lycopene β-cyclase gene promoter from citrus[J]. Frontiers in Plant Science, 2016, 7(1367):1-14.
[26]于洋. 外源GA3和ABA對番茄果實(shí)主要色素形成的影響及生理機(jī)制研究[D]. 沈陽:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué), 2016.
[27]Karthikeyan AS, Ballachanda DN, Raghothama KG. Promoter deletion analysis elucidates the role of cis elements and 5' UTR intron in spatiotemporal regulation of AtPht1;4 expression in Arabidopsis[J]. Physiol Plant, 2009, 136(1):10-18.
[28]Samadder P, Sivamani E, Lu J, et al. Transcriptional and posttranscriptional enhancement of gene expression by the 5' UTR intron of rice rubi3, gene in transgenic rice cells[J]. Mol Genet Genomics, 2008, 279(4):429-439.
[29]Katja K, Laura Z, Marian S, et al. Carotenoid metabolism during bilberry(Vaccinium myrtillus L.)fruit development under different light conditions is regulated by biosynthesis and degradation[J]. Bmc Plant Biology, 2016, 16(1):1-16.
[30]Gao Z, Meng C, Zhang X, et al. Induction of salicylic acid(SA)on transcriptional expression of eight carotenoid genes and astaxanthin accumulation in Haematococcus pluvialis[J]. Enzyme &Microbial Technology, 2012, 51(4):225-230.