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效應(yīng)子及其與小麥條銹菌致病性的關(guān)系

2018-04-01 09:04劉秀峰袁文婭孫振宇梁丹時(shí)曉偉
生物技術(shù)通報(bào) 2018年2期
關(guān)鍵詞:銹菌寄主植物病原

劉秀峰 袁文婭 孫振宇 梁丹 時(shí)曉偉

(1. 天津市農(nóng)作物研究所,天津 300381;2. 甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,蘭州 730070)

植物與病原菌共同進(jìn)化過程中發(fā)展出不同層次的免疫防衛(wèi)體系。首先,植物細(xì)胞的模式識(shí)別受體(Pattern-recognition receptors,PRRs)識(shí)別病原菌相關(guān)分子模式(Pathogen-associated molecular patterns,PAMPs)。PAMPs是病原微生物表面共有的一些高度保守的分子,這些分子不是病原菌特有的,而是廣泛存在于微生物中,對(duì)維持微生物的基本生物學(xué)特征十分重要。真菌PAMPs包括麥角甾醇、多聚半乳糖醛酸內(nèi)切酶、木聚糖酶以及細(xì)胞壁衍生物葡聚糖和幾丁質(zhì)等。PRRs可以識(shí)別一種或多種PAMPs并誘導(dǎo)植物產(chǎn)生PAMPs觸發(fā)的免疫反應(yīng)(PAMP-triggered immunity,PTI),如產(chǎn)生活性氧、分泌蛋白酶抑制劑、幾丁質(zhì)酶及葡聚糖酶等。病原菌為抑制寄主植物的PTI防衛(wèi)反應(yīng),分泌多種效應(yīng)子(Effectors)調(diào)節(jié)和操縱寄主的各種細(xì)胞功能,逃避寄主的識(shí)別以實(shí)現(xiàn)對(duì)寄主植物的侵染。寄主植物進(jìn)化出免疫受體可以特異性識(shí)別這些效應(yīng)子,并引發(fā)寄主植物產(chǎn)生效應(yīng)子觸發(fā)的免疫反應(yīng)(Effectortriggered immunity,ETI),使寄主植物表現(xiàn)出抗性。在這種情況下,寄主植物的免疫受體被稱為抗性(R)蛋白,被識(shí)別的效應(yīng)子充當(dāng)了誘導(dǎo)寄主防衛(wèi)反應(yīng)的信號(hào),這樣的效應(yīng)子蛋白曾被稱為無毒基因(Avr)蛋白。病原菌則通過拋棄被識(shí)別的效應(yīng)子或者突變出新的效應(yīng)子來避免寄主植物的ETI識(shí)別,相應(yīng)的,寄主植物將共進(jìn)化出新的R蛋白再次觸發(fā)免疫反應(yīng)。如此反復(fù),植物-病原菌間形成的競(jìng)爭(zhēng)循環(huán)曾被形容為“Z字形模式”[1-2],這種競(jìng)爭(zhēng)性進(jìn)化也驅(qū)使植物-病原菌互作的基因序列頻繁發(fā)生例如單核苷酸多態(tài)性(Single-nucleotide polymorphisms,SNPs)、插入、缺失等變化,使這些基因呈現(xiàn)高度的多態(tài)性[3-4]。從植物病原菌角度觀察,有利于提高病原菌適合度、定殖能力及傳播能力的效應(yīng)子可能是基因組中進(jìn)化最快的[5]。因此,效應(yīng)子可以作為植物病害防治的重要靶標(biāo)。

分析多種植物病原真菌不同侵染階段的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示,病原真菌分泌效應(yīng)子類型與其寄生方式密切相關(guān),腐生病原真菌以分泌細(xì)胞外溶解酶類為主,活體寄生病原真菌分泌的溶解酶類表達(dá)量較低,而調(diào)節(jié)寄主細(xì)胞各種代謝的預(yù)測(cè)效應(yīng)子表達(dá)量很高。條形柄銹菌小麥?;停≒uccinia striiformisf.sp.tritici,Pst)真菌作為活體寄生菌,由其引起的小麥條銹病爆發(fā)性強(qiáng)、發(fā)生范圍廣,在中國(guó)曾發(fā)生多次大流行,危害嚴(yán)重[6]。目前中國(guó)90%以上的小麥生產(chǎn)品種因Pst小種變異失去抗銹性,2009年分離到的V26新菌系對(duì)貴農(nóng)22、含Yr10/24/26/抗銹基因的品種以及數(shù)十個(gè)小麥新品種均具有致病性,已引起相關(guān)部門重視[7]。小麥條銹病也是世界性的禾谷類作物重要病害之一,Pst致病性變異頻繁,新致病性小種的出現(xiàn)和發(fā)展是導(dǎo)致小麥品種抗銹性“喪失”,造成小麥條銹病在各洲和洲際間傳播的重要原因[8-9]。小麥品種在不斷更替,能克服其抗性的條銹菌新小種也在不斷的產(chǎn)生和發(fā)展,Derevnina等[10]稱小麥條銹菌為“never sleep”。根據(jù)研究結(jié)果推斷Pst毒性變異迅速與其含有豐富的效應(yīng)子有關(guān)[11],分析Pst基因組序列也發(fā)現(xiàn)了大量的預(yù)測(cè)效應(yīng)子。例如,美國(guó)小麥條銹菌分離物PST130含有1 088個(gè)預(yù)測(cè)效應(yīng)子[12],重測(cè)序4個(gè)Pst小種后將預(yù)測(cè)效應(yīng)子數(shù)量提高到2 999個(gè)[13],中國(guó)小麥條銹菌小種CY32含有2 092個(gè)預(yù)測(cè)效應(yīng)子[14]。Pst含有預(yù)測(cè)效應(yīng)子的數(shù)量即使與小麥稈銹菌P. graminisf. sp.tritici(1 106 個(gè))[15]和小麥葉銹菌P. triticina(1 358 個(gè))[16]比較,數(shù)量也是極高的。顯然,深入研究Pst效應(yīng)子在寄主細(xì)胞中的作用靶標(biāo)及其功能具有重要意義。

目前對(duì)細(xì)菌性植物病原菌和卵菌的效應(yīng)子功能研究較為深入[17-19],活體寄生菌中玉米瘤黑粉菌Ustilago maydis部分預(yù)測(cè)效應(yīng)子功能通過基因缺失和功能互補(bǔ)等方法得到確認(rèn)[20]。小麥條銹菌由于缺乏有效的遺傳轉(zhuǎn)化體系,效應(yīng)子研究尚處于起始階段[21],預(yù)測(cè)的兩千多個(gè)效應(yīng)子僅有少量經(jīng)過試驗(yàn)證實(shí)其生理功能,這些效應(yīng)子可以靶定在寄主各種亞細(xì)胞成分,有的被證實(shí)與Pst致病性直接相關(guān)。本文綜述了效應(yīng)子的特征、分類、靶標(biāo)及Pst效應(yīng)子研究的現(xiàn)狀,并對(duì)Pst效應(yīng)子研究中值得關(guān)注的問題及未來的研究方向進(jìn)行了探討。

1 效應(yīng)子及其定義

效應(yīng)子最初是借鑒醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)術(shù)語用于研究細(xì)菌性植物病原菌,隨后被用于植物病原真菌的研究[22]。大約在2000年前后,寄主植物-病原微生物互作研究中開始廣泛使用“效應(yīng)子”一詞[23]。相對(duì)于帶有傾向性的“無毒基因”、“激發(fā)子”等術(shù)語,效應(yīng)子這一中性術(shù)語不容易產(chǎn)生歧義。某病原菌分泌的分子抑制了寄主的防衛(wèi)反應(yīng)并使寄主植物感病,則該分子被稱為“毒性基因”。當(dāng)寄主植物進(jìn)化出受體可以特異性識(shí)別該病原菌的同一分子從而產(chǎn)生抗病反應(yīng),則該分子被視為“無毒基因”。這種病原菌致病性的變化是非常普遍的現(xiàn)象,病原菌的某個(gè)分子可能既是某一寄主的“毒性基因”又是另一寄主的“無毒基因”,甚至在同一寄主的不同品種間表現(xiàn)出不同致病型??梢?,病原菌的某一分子是“無毒基因”或“毒性基因”主要與寄主植物對(duì)病原菌表現(xiàn)為抗病或感病有關(guān),受寄主基因型影響,因此“無毒基因”等術(shù)語有其局限性[5]。

效應(yīng)子的范疇隨著對(duì)致病性的分子機(jī)制逐漸深入理解而持續(xù)拓展。起初植物細(xì)菌學(xué)家把效應(yīng)子等同于原核細(xì)菌性病原通過Ⅲ型分泌系統(tǒng)(T3SS)直接注入到植物細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。隨后發(fā)現(xiàn)病原菌可通過不同機(jī)制將多種特定分子轉(zhuǎn)運(yùn)到寄主細(xì)胞,效應(yīng)子涵蓋范圍再一次被拓寬。目前,效應(yīng)子廣義上包括諸如蛋白質(zhì)、糖類、次級(jí)代謝產(chǎn)物等可能參與侵染過程的所有分子[24]。植物病理學(xué)家傾向于把效應(yīng)子定義為“與植物相關(guān)的微生物分泌的可以改變寄主細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能的分子”[23]。這一定義在效應(yīng)子功能僅有少量信息可知時(shí)尤其符合實(shí)際。例如,已知病原菌某分子可以激發(fā)寄主植物的防衛(wèi)反應(yīng),則該分子可以被稱作“效應(yīng)子”,一旦了解更多該分子的功能,往往用描述其專化活性的術(shù)語(例如,蛋白酶抑制劑)替代“效應(yīng)子”[5]。

2 植物病原真菌效應(yīng)子的特征及分類

植物病原真菌效應(yīng)子與病原細(xì)菌和卵菌的效應(yīng)子不同,其效應(yīng)子沒有類似RXLR的保守基序,難以在全基因組序列中直接分辨效應(yīng)子基因。因此人們利用已知效應(yīng)子特征制定出一些指標(biāo)對(duì)可能含效應(yīng)子的基因進(jìn)行分類。研究發(fā)現(xiàn)植物病原真菌分泌效應(yīng)子后,需要將效應(yīng)子轉(zhuǎn)運(yùn)到準(zhǔn)確的寄主亞細(xì)胞組分才能發(fā)揮其功能,一個(gè)主要特征是效應(yīng)子N末端含有約15-30個(gè)疏水性氨基酸殘基組成的信號(hào)肽,可以將效應(yīng)子引導(dǎo)轉(zhuǎn)運(yùn)到目的靶標(biāo)。因此人們將是否具有信號(hào)肽作為預(yù)測(cè)效應(yīng)子的一個(gè)指標(biāo)[25]。Saunders等[26]綜合已知效應(yīng)子特征后提煉出一些指標(biāo)并據(jù)此預(yù)測(cè)效應(yīng)子,這些指標(biāo)包括:具有信號(hào)肽、由可以原位誘導(dǎo)表達(dá)的基因編碼、與吸器蛋白具有相似性、不高于300個(gè)氨基酸、富含半胱氨酸、無跨膜區(qū)域、具有已知的效應(yīng)子基序或細(xì)胞核定位信號(hào)、由較長(zhǎng)的基因間區(qū)域編碼、具有內(nèi)部重復(fù)序列、與已知蛋白功能無同源性等。Saunders等和Nemri等[27]利用該方法均取得良好效果。另外,在一些如吸器等專化的侵染結(jié)構(gòu)中高表達(dá)的基因也被作為候選效應(yīng)子之列[15]。利用這些特征可以在基因組中尋找預(yù)測(cè)效應(yīng)子,減少需要進(jìn)行功能驗(yàn)證的預(yù)測(cè)效應(yīng)子數(shù)量,但以上指標(biāo)應(yīng)用于效應(yīng)子分析時(shí)仍需要注意其相對(duì)有效性。例如,亞麻銹菌(Melampsora lini)的AvrM效應(yīng)子分子量遠(yuǎn)超過300個(gè)氨基酸殘基[28],油菜莖基潰瘍病菌(Leptosphaeria maculans)的AvrLm1僅含有一個(gè)半胱氨酸[29],說明并非所有的效應(yīng)子蛋白都是小分子量和富含半胱氨酸的蛋白,僅僅按照這兩個(gè)指標(biāo)可能會(huì)漏掉真正的效應(yīng)子。同理,小分子量的富含半胱氨酸的蛋白也不一定全部具有效應(yīng)子的功能[4]。

根據(jù)效應(yīng)子靶定的寄主亞細(xì)胞組分和發(fā)揮作用的位置可以將其分為非原質(zhì)體效應(yīng)子(Apoplastic effectors)和原質(zhì)體效應(yīng)子(Cytoplasmic effectors)[30]。非原質(zhì)體效應(yīng)子作用于寄主植物細(xì)胞外空間,主要干擾寄主植物的蛋白酶、過氧化物酶及細(xì)胞溶解酶類[31],它們?cè)诒Wo(hù)病原菌細(xì)胞壁、鰲合或者中和寄主植物分泌的抗菌化合物等方面具有重要作用。原質(zhì)體效應(yīng)子可以經(jīng)病原菌分泌后穿過寄主原生質(zhì)到達(dá)亞細(xì)胞組分靶標(biāo),可以從上游關(guān)閉寄主的免疫反應(yīng)或者重新編輯寄主的轉(zhuǎn)錄過程從而有利于病原菌侵染[32]。

目前人們對(duì)小麥條銹菌效應(yīng)子的特征知之甚少,僅知道和病原真菌其它效應(yīng)子一樣沒有RXLR保守基序。最近Godfrey等[33]在包括小麥稈銹菌在內(nèi)的禾谷類專性寄生菌的基因組中發(fā)現(xiàn)了[YFW]xC基序,其生理功能還有待于進(jìn)一步研究。將來研究Pst效應(yīng)子應(yīng)該統(tǒng)一規(guī)范效應(yīng)子的發(fā)掘程序和預(yù)測(cè)標(biāo)準(zhǔn),注重Pst基因組的準(zhǔn)確注釋,在軟件分析基礎(chǔ)上注重專家的手工篩選,為研究分析Pst效應(yīng)子奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

3 植物病原真菌效應(yīng)子的靶標(biāo)及功能

植物病原真菌分泌合適的效應(yīng)子只是成功侵染的第一步,將效應(yīng)子轉(zhuǎn)運(yùn)到準(zhǔn)確的靶標(biāo)才能發(fā)揮其功能。植物病原真菌效應(yīng)子靶定的寄主亞細(xì)胞組分和方式非常多樣,可以多個(gè)效應(yīng)子靶定同一個(gè)細(xì)胞器,也可能一個(gè)效應(yīng)子靶定多個(gè)亞細(xì)胞組分。植物病原真菌效應(yīng)子的功能極其復(fù)雜,至今人們對(duì)其功能了解仍不全面。它們對(duì)病原真菌產(chǎn)生有利或負(fù)面的影響取決于寄主植物的基因型。通常效應(yīng)子有利于病原菌發(fā)育,另一方面,許多已知效應(yīng)子可以被寄主R基因識(shí)別導(dǎo)致過敏性反應(yīng)(Hypersensitive response,HR)從而抑制病原菌發(fā)育。總結(jié)植物病原真菌效應(yīng)子與寄主互作中的功能可以歸納為以下幾個(gè)方面[34]:(1)抑制寄主的細(xì)胞溶解酶類活性。寄主植物分泌蛋白酶、幾丁質(zhì)酶等細(xì)胞溶解酶類進(jìn)入非原質(zhì)體以抵御病原菌侵染。目前雖然未發(fā)現(xiàn)直接作用于幾丁質(zhì)酶的效應(yīng)子,但已在多種病原真菌中鑒定出抑制非原質(zhì)體蛋白酶的效應(yīng)子。如玉蜀黍黑粉菌(Uromyces maydis)的Pit2抑制半胱氨酸蛋白酶活性并與致病性相關(guān)[35]。蠶豆銹菌U. fabae分泌的RTP1與13種銹菌的半胱氨酸蛋白酶抑制劑具有同源性[36];(2)作用于寄主免疫反應(yīng)路徑。如玉蜀黍黑粉菌分泌的See1干擾玉米的SGT1活性,調(diào)節(jié)寄主的免疫反應(yīng)[37];(3)抑制寄主的過氧化物酶類活性。如玉蜀黍黑粉菌的Pep1抑制寄主的過氧化物酶活性,清除活性氧積累,從而保護(hù)菌絲。Pep1突變體強(qiáng)烈誘導(dǎo)H2O2在侵染點(diǎn)的細(xì)胞壁處積累,引起寄主細(xì)胞死亡,從而限制菌絲擴(kuò)展[38-39];(4)干擾寄主代謝。玉蜀黍黑粉菌分泌的Cmu1催化寄主的莽草酸途徑中分支酸變換為預(yù)苯酸,從而干擾水楊酸的合成[40]。此外,還有結(jié)合幾丁質(zhì)的效應(yīng)子,這在稻瘟菌等半活體寄生菌中研究較為深入。在小麥稈銹菌、蠶豆銹菌等專性寄生菌的細(xì)胞壁表面是幾丁質(zhì)聚糖,而不是幾丁質(zhì)。幾丁質(zhì)在脫乙酰酶作用下轉(zhuǎn)化成幾丁質(zhì)聚糖,幾丁質(zhì)聚糖顯然不是幾丁質(zhì)酶的最佳底物。植物病原菌通過這種轉(zhuǎn)換阻止菌體細(xì)胞壁釋放幾丁質(zhì)低聚物以逃避寄主受體的識(shí)別,從而干擾寄主的防衛(wèi)反應(yīng)[41]。

4 小麥條銹菌效應(yīng)子功能研究進(jìn)展

基因組和比較基因組方法使效應(yīng)子篩選更加方便,目前研究重點(diǎn)已由效應(yīng)子篩選向效應(yīng)子功能驗(yàn)證轉(zhuǎn)變。由于銹菌目中的病原菌缺乏有效的遺傳轉(zhuǎn)化體系,其效應(yīng)子功能的研究進(jìn)展緩慢。例如,已經(jīng)篩選出亞麻銹菌的AvrM、AvrL567、AvrP4和AvrP123[42]、蠶豆銹菌的 RTP1[43]、小麥稈銹菌的PGTAUSPE10-1[44]等預(yù)測(cè)效應(yīng)子,限于方法這些效應(yīng)子在寄主細(xì)胞中的功能均未被驗(yàn)證。

采用本氏煙(Nicotiana benthamiana)異種表達(dá)候選效應(yīng)子雖然不能揭示效應(yīng)子轉(zhuǎn)運(yùn)的全過程,但可為研究銹菌-寄主互作提供有價(jià)值的信息。Ramachandran等[45]應(yīng)用此法對(duì)20個(gè)取自小麥銹菌(9個(gè)來自小麥條銹菌,11個(gè)來自小麥稈銹菌)的預(yù)測(cè)效應(yīng)子功能進(jìn)行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中9個(gè)預(yù)測(cè)效應(yīng)子(shr1-shr9)可以抑制本氏煙的HR反應(yīng),并且對(duì)不同挑戰(zhàn)接種菌引發(fā)HR的抑制作用不同,即一部分效應(yīng)子可以抑制部分挑戰(zhàn)菌引發(fā)的HR,但不能抑制另外挑戰(zhàn)菌引發(fā)的HR,推測(cè)這些效應(yīng)子用不同的機(jī)制干擾本氏煙的細(xì)胞死亡。另外還發(fā)現(xiàn),一些效應(yīng)子可以抑制相同的挑戰(zhàn)菌引發(fā)的HR,這種相似性可能與銹菌效應(yīng)子功能冗余有關(guān)[45]。在本氏煙中異種表達(dá)研究候選效應(yīng)子與葉細(xì)胞中靶蛋白之間的互作,其優(yōu)點(diǎn)是得到的靶蛋白是在細(xì)胞內(nèi)與餌蛋白天然結(jié)合的,相互作用的蛋白質(zhì)都是處于天然狀態(tài),蛋白的相互作用也是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的,避免了人為的影響,試驗(yàn)得到的效應(yīng)子可能是真實(shí)的定位于細(xì)胞質(zhì)的效應(yīng)子,可信度高。使用本氏煙異種表達(dá)研究Pst效應(yīng)子的缺點(diǎn)一方面是可能檢測(cè)不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,另一方面是Pst在自然條件下不侵染茄屬植物,這樣可能會(huì)漏篩對(duì)小麥組分具有?;缘男?yīng)子,造成假陰性。

將Pst候選效應(yīng)子與GFP等熒光蛋白融合在本氏煙中短暫熒光表達(dá)可以提高被測(cè)效應(yīng)子在葉肉細(xì)胞中定位的靈敏性,這種方法受到國(guó)內(nèi)外學(xué)者的高度關(guān)注。Petre等[46]在Pst吸器的轉(zhuǎn)錄本中選擇了16個(gè)與其他蛋白沒有相似性的預(yù)測(cè)蛋白,將它們與GFP的融合蛋白在本氏煙葉肉細(xì)胞內(nèi)短暫熒光表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn),16個(gè)中的7個(gè)候選效應(yīng)子定位在?;闹参飦喖?xì)胞組分:小胞內(nèi)體(Cytosolic bodies)、內(nèi)膜間隔(Endomembrane compartment)、細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)、葉綠體、細(xì)胞核等,有的候選效應(yīng)子(PST18220)可以同時(shí)靶定在葉綠體和細(xì)胞核2個(gè)細(xì)胞器。同時(shí),還發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)效應(yīng)子PST02549可以與P小體(Processing Body)發(fā)生互作。P小體是存在于真核細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中的蛋白質(zhì)/RNA復(fù)合體,可以調(diào)節(jié)mRNA分子的脫帽、降解和貯藏,在基因表達(dá)過程中起到了至關(guān)重要的調(diào)控作用。他們進(jìn)一步利用抗GFP免疫共沉淀/氣質(zhì)聯(lián)用(coIP/MS)技術(shù)確認(rèn)PST02549可以?;陌卸ㄔ赑小體的EDC4(Enhancer of mRNA Decapping Protein 4)[46]。

大麥條斑花葉病毒(Barley stripe mosaic virus,BSMV)介導(dǎo)的基因沉默(Virus mediated hostinduced gene silencing,VIGS)技術(shù)可以成功用于誘導(dǎo)小麥基因沉默,國(guó)內(nèi)外學(xué)者采用VIGS技術(shù)已經(jīng)在Pst候選效應(yīng)子功能研究中取得進(jìn)展。Liu等[47]將Pst候 選 效 應(yīng) 子 PEC6(Pucciniaeffector candidate 6)與GFP融合表達(dá),熒光分析顯示PEC6可以定位在寄主的細(xì)胞核和胞液。酵母雙雜試驗(yàn)和雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)(Bimolecular fluorescence complementation,BiFC)顯示PEC6可以與擬南芥和小麥中的腺苷激酶(Adenosine kinases,ADKs)互作。PEC6的N端含有22個(gè)氨基酸長(zhǎng)度的信號(hào)肽,成熟蛋白含66個(gè)氨基酸,在24個(gè)不同地理來源的Pst分離物中具有保守性。結(jié)果發(fā)現(xiàn)PEC6可以抑制熒光假單胞菌Pseudomonas fluorescens誘導(dǎo)的本氏煙活性氧積累和胼胝質(zhì)沉積,表達(dá)PEC6的擬南芥更容易被缺失AvrPto和AvrPtoB的丁香假單胞菌突變株P(guān)seudomonas syringaepv. tomato(Pto)DC3000 ΔAvrPto/ΔAvrPtoB侵染。PEC6還可以抑制熒光假單胞菌激發(fā)的小麥PTI反應(yīng)。應(yīng)用VIGS技術(shù)沉默PEC6,接種小麥后12 d,沉默PEC6基因的Pst產(chǎn)生的孢子量比對(duì)照株系減少約50%,這些結(jié)果顯示PEC6與小麥條銹菌的致病性相關(guān)。同時(shí)發(fā)現(xiàn)沉默小麥ADKs后小麥第4片葉片變短變窄,小麥條銹菌接種后10 d觀察到小麥抗銹性明顯下降,作者推測(cè)小麥ADKs與葉片生長(zhǎng)和抗條銹性相關(guān),PEC6可能通過靶定ADKs后影響ADKs的調(diào)節(jié)代謝和甲基化轉(zhuǎn)運(yùn)等作用促進(jìn)小麥條銹菌生長(zhǎng)。Yin等[48]在小麥條銹菌吸器cDNA文庫中篩選出6個(gè)候選效應(yīng)子,Cheng等[49]進(jìn)一步對(duì)其中命名為PSTha5a23的候選效應(yīng)子進(jìn)行了功能研究。PSTha5a23的N端包含18個(gè)氨基酸的分泌信號(hào)肽,并根據(jù)酵母細(xì)胞在選擇培養(yǎng)基上生長(zhǎng)與否的遺傳方法確認(rèn)了其具有功能性的分泌信號(hào)肽,成熟蛋白含108個(gè)氨基酸,與具有酶活性的其他蛋白比較缺乏已知的保守基序。在已發(fā)表基因組序列中未發(fā)現(xiàn)PSTha5a23的同源性基因,在小麥條銹菌基因組中也未發(fā)現(xiàn)其旁系同源基因。比對(duì)6個(gè)不同來源的Pst(中國(guó)的CY32、美國(guó)的PST-21、PST-43和PST-130以及英國(guó)的PST-08/21和PST-87/7)的PSTha5a23序列,結(jié)果發(fā)現(xiàn)它們間僅有一個(gè)堿基替換造成氨基酸變化,PSTha5a23可能是種內(nèi)多態(tài)性很低的Pst?;男?yīng)子。PSTha5a23-GFP融合蛋白在小麥原生質(zhì)體內(nèi)短暫熒光表達(dá)顯示,PSTha5a23定位于小麥的細(xì)胞質(zhì)。農(nóng)桿菌介導(dǎo)PSTha5a23在本氏煙中過表達(dá)可以抑制Bax和inF1激發(fā)的細(xì)胞程序化死亡。在小麥中過表達(dá)PSTha5a23可以抑制小麥細(xì)胞中胼胝質(zhì)的沉積。利用VIGS技術(shù)沉默PSTha5e23,接種后14 d,產(chǎn)生的孢子量與對(duì)照無變化。沉默PSTha5a23不改變小麥條銹菌的毒性表現(xiàn)型,這可能與效應(yīng)子功能冗余有關(guān),但過表達(dá)PSTha5a23明顯提高小麥條銹菌對(duì)小麥的毒性。

酵母雙雜交可以在體外大規(guī)模研究預(yù)測(cè)效應(yīng)子蛋白-寄主植物蛋白間的互作,與其它技術(shù)結(jié)合不但可以研究候選效應(yīng)子的功能,還能篩選出與候選效應(yīng)子互作的植物蛋白。Wang等[50]據(jù)此最先報(bào)道了具有功能的Pst候選效應(yīng)子PNPi(PucciniaNPR1 interactor),并篩選出與PNPi互作的靶標(biāo)——NPR1(Nonexpresser of PR Genes 1)。PNPi是在小麥條銹菌吸器中發(fā)現(xiàn)的,其N端含有22個(gè)氨基酸長(zhǎng)度的分泌信號(hào)肽,預(yù)測(cè)成熟蛋白含333個(gè)氨基酸。信號(hào)肽末端緊鄰一個(gè)由24個(gè)氨基酸組成的RSLL-DEEP基序,該基序與卵菌效應(yīng)子的保守基序RxLR-dEER相似但并不完全相同,該基序或許與PNPi從吸器外基質(zhì)轉(zhuǎn)移到寄主細(xì)胞內(nèi)有關(guān)。PNPi不含有跨膜區(qū)域。通常,一個(gè)效應(yīng)子被植物識(shí)別后,病原菌將修飾或者剔除這個(gè)效應(yīng)子以逃避植物的識(shí)別,這種進(jìn)化力量驅(qū)使寄主抗性基因和病原菌效應(yīng)子的進(jìn)化都非常快速。不同尋常的是,PNPi表現(xiàn)出較高的保守性。6個(gè)小麥條銹菌小種(PST-78、PST-21、PST-43、PST-87/7、PST-08/21和PST-130)和2個(gè)小麥條銹菌小檗分離物[PSH-54(GenBank accession KT764126),PSH-72(GenBank accession KT764127)]的 PNPi蛋白序列100%一致,8個(gè)PNPi編碼區(qū)的核苷酸堿基序列也100%一致。同時(shí)發(fā)現(xiàn),小麥條銹菌PNPi的蛋白序列與小麥稈銹菌(Pgt,XP_003325658)和小麥葉銹菌(Pt,PTTG_03809)的相似性分別達(dá)到67.2%和66.8%。甚至小麥條銹菌PNPi的C端區(qū)域與青楊葉銹菌(Melampsora larici)、玉米黑粉菌、立枯絲核菌等分類距離較遠(yuǎn)的病原菌相應(yīng)區(qū)域也具有較高的相似性。作者推測(cè)PNPi的高度保守性或許與小麥條銹菌在進(jìn)化競(jìng)爭(zhēng)中取得優(yōu)勢(shì)有關(guān),改變PNPi蛋白結(jié)構(gòu)或許影響小麥條銹菌的寄生適合度。酵母雙雜交顯示PNPi通過它C端的DPBB-1區(qū)域直接與小麥NPR1(wNPR1)的NPR1/NIM1類區(qū)域互作,BiFC技術(shù)共表達(dá)YFPN-PNPi(23-333)和YFPC-wNPR1確認(rèn)了這種直接互作發(fā)生在本氏煙原生質(zhì)體的核中。效應(yīng)子激發(fā)寄主產(chǎn)生的抗性反應(yīng)除了局部性的HR反應(yīng),還可以使寄主植物產(chǎn)生系統(tǒng)性獲得抗性(SAR),從而對(duì)再次侵染的病原菌產(chǎn)生廣譜的系統(tǒng)抗性。通常寄主植物的SAR反應(yīng)包括產(chǎn)生信號(hào)分子、水楊酸積累、PR基因轉(zhuǎn)錄等。植物中NPR1蛋白是植物免疫系統(tǒng)中的古老組分,其序列不論在單子葉還是雙子葉植物中都是保守的,NPR1在SAR的信號(hào)傳導(dǎo)中具有重要作用,病原菌侵染后,NPR1從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核內(nèi)并與核內(nèi)的TGA2轉(zhuǎn)錄因子互作從而激活多種PR基因表達(dá)。酵母三雜交證實(shí)PNPi干擾wNPR1與小麥的TGA2轉(zhuǎn)錄因子(wTGA2.2)結(jié)合,從而阻止激活小麥的PR基因表達(dá)。進(jìn)一步將過表達(dá)PNPi的轉(zhuǎn)基因大麥接種,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在接種鄰近的區(qū)域多種PR基因表達(dá)受到抑制。作者推測(cè)PNPi通過干擾小麥wNPR1與wTGA2.2結(jié)合而影響寄主防衛(wèi)反應(yīng),也可能通過與wNPR4互作影響 wNPR1 的穩(wěn)定性[50]。

5 問題及展望

小麥條銹菌既要盡可能小的傷害侵入點(diǎn)小麥細(xì)胞,又要逃避寄主識(shí)別引發(fā)的防衛(wèi)反應(yīng)才能侵染成功,為此Pst進(jìn)化出復(fù)雜、精巧的系列效應(yīng)子。目前在效應(yīng)子預(yù)測(cè)、定位及功能研究方面已經(jīng)發(fā)展出多種技術(shù),但Pst效應(yīng)子研究還比較緩慢,仍有一些受限制因素。首先,預(yù)測(cè)Pst效應(yīng)子的指標(biāo)和基因組注釋錯(cuò)誤一定程度上阻礙Pst效應(yīng)子發(fā)掘進(jìn)程。Pst預(yù)測(cè)效應(yīng)子數(shù)量高于實(shí)際數(shù)量,目前采取的預(yù)測(cè)指標(biāo)雖然能極大程度降低待驗(yàn)證的效應(yīng)子數(shù)量,但研究Pst效應(yīng)子時(shí)仍需要不斷對(duì)這些指標(biāo)進(jìn)行完善。將來一方面加強(qiáng)已知效應(yīng)子特征研究、提高Pst基因組注釋程度以完善現(xiàn)有指標(biāo),另一方面發(fā)展新技術(shù)也非常重要,如效應(yīng)子三維結(jié)構(gòu)相似性對(duì)效應(yīng)子辨別可能有極大幫助[51]。其次,Pst效應(yīng)子-GFP融合蛋白在本氏煙細(xì)胞中短暫表達(dá)可實(shí)現(xiàn)高通量的細(xì)胞定位研究,為研究Pst-小麥互作提供有價(jià)值的信息,但仍需要注意該體系的不足,同時(shí)發(fā)展遺傳的、生化的和細(xì)胞生物學(xué)的方法用于在Pst侵染過程中標(biāo)記、檢測(cè)和觀察效應(yīng)子。未來研究效應(yīng)子定位的理想狀態(tài)是可視化,可以研究效應(yīng)子在侵入的植物細(xì)胞中的動(dòng)態(tài)定位,以及植物細(xì)胞組分相應(yīng)的結(jié)構(gòu)變化。

小麥條銹菌若要侵染成功,除了分泌合適的效應(yīng)子外,還要在合適的時(shí)間將效應(yīng)子轉(zhuǎn)運(yùn)到準(zhǔn)確的小麥亞細(xì)胞組分。Pst在不同的侵染階段需要按照時(shí)間順序分泌不同的效應(yīng)子,分泌的效應(yīng)子還需要穿過吸器外基質(zhì)以及多種界面后才能到達(dá)亞細(xì)胞組分。目前人們不僅對(duì)Pst如何實(shí)現(xiàn)這一時(shí)間過程一無所知,而且對(duì)Pst效應(yīng)子從吸器外基質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到寄主亞細(xì)胞組分的途徑知之甚少。因此Pst效應(yīng)子如何轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入寄主亞細(xì)胞組分是將來研究的一個(gè)重點(diǎn)問題。另一個(gè)同樣重要的問題是Pst效應(yīng)子在轉(zhuǎn)運(yùn)過程中如何逃避寄主的免疫識(shí)別。研究發(fā)現(xiàn),病原真菌和寄主共同進(jìn)化過程中,病原真菌效應(yīng)子被寄主免疫受體識(shí)別后,病原真菌通過多種方式產(chǎn)生變異以逃避、抑制或改變這種識(shí)別。這種逃避機(jī)制主要包括兩類,一類是被識(shí)別效應(yīng)子的基因序列發(fā)生轉(zhuǎn)座插入、突變甚至該效應(yīng)子基因被完全丟棄。已有結(jié)果證實(shí)為便于這類逃避寄主識(shí)別機(jī)制發(fā)揮作用,病原真菌基因組在進(jìn)化過程中把效應(yīng)子經(jīng)常安排在序列重復(fù)區(qū)域[52]、富含轉(zhuǎn)座子區(qū)域[53]或非必需區(qū)域[54]。另一類則不丟棄或不改變被識(shí)別效應(yīng)子基因序列,而是使該效應(yīng)子的調(diào)控區(qū)域發(fā)生突變或調(diào)節(jié)病原菌基因組中影響該效應(yīng)子轉(zhuǎn)錄的區(qū)域,這樣被識(shí)別效應(yīng)子編碼區(qū)域DNA序列不變,但效應(yīng)子的表達(dá)發(fā)生了改變[55]。這類逃避機(jī)制的特點(diǎn)是可以在基因組中保留被識(shí)別效應(yīng)子基因本身,該效應(yīng)子基因可被重復(fù)使用。目前在大雄疫霉大豆?;蚉hytophthora sojae中發(fā)現(xiàn)這類逃避機(jī)制[56],但在小麥條銹菌中尚未有類似報(bào)道。因?yàn)樾←湕l銹菌是雙核病原菌,存在兩個(gè)或多個(gè)有功能的效應(yīng)子拷貝,如效應(yīng)子調(diào)控區(qū)某雙顯性等位基因位點(diǎn)中一個(gè)等位基因發(fā)生突變,該位點(diǎn)雖然變?yōu)殡s合位點(diǎn)但并未影響表型,只有兩個(gè)等位基因全部突變才會(huì)改變表型。顯然,這些效應(yīng)子全部發(fā)生毒性變化比只有單拷貝的病原菌將更加困難。

小麥條銹菌效應(yīng)子研究仍處于起步階段,Pst基因組含有兩千多個(gè)預(yù)測(cè)效應(yīng)子基因,但絕大多數(shù)功能是未知的。目前的研究技術(shù)仍有不足,還不能滿足規(guī)?;⑾到y(tǒng)化的研究需要。因此,創(chuàng)建新的研究方法和技術(shù),建立高通量研究體系,規(guī)模化鑒定Pst效應(yīng)子功能,對(duì)其分泌、轉(zhuǎn)運(yùn)分子機(jī)制進(jìn)行詳細(xì)研究將有助于了解Pst致病機(jī)制,也有助于制定新的抗病策略。

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