劉戀,丁銀環(huán),向成玉,吳澤才,楊葵,唐敏,劉靳波
(西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院,四川瀘州646000)
鮑曼不動(dòng)桿菌是醫(yī)院感染的重要致病菌,它能在無(wú)生命的物體表面生存,并通過(guò)受感染的物體傳播給易感人群[1,2]。此外,鮑曼不動(dòng)桿菌能通過(guò)本身固有的或獲得的機(jī)制對(duì)常用抗菌藥物產(chǎn)生耐藥性[3]。碳青霉烯類(lèi)抗菌藥物是治療鮑曼不動(dòng)桿菌感染的有效藥物[4,5];然而,由于全球抗菌藥物耐藥性的影響,對(duì)此類(lèi)抗菌藥物耐藥的鮑曼不動(dòng)桿菌不斷增加。在中國(guó),碳青霉烯類(lèi)耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的感染率從2005年的31%上升到2014年的66.7%[6],并且多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌(MDR-AB)的感染率也在不斷上升。MDR-AB多重耐藥的機(jī)制十分復(fù)雜,幾乎涉及了所有的抗菌藥物耐藥機(jī)制。本文就MDR-AB的同源性及其耐藥機(jī)制進(jìn)行研究,現(xiàn)報(bào)告如下。
收集2015~2016年西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院各臨床科室分離的非重復(fù)MDR-AB 63株,標(biāo)本主要為各科室住院患者送檢的痰液及分泌物,按標(biāo)準(zhǔn)方法進(jìn)行分離和培養(yǎng)。
采用微量肉湯稀釋法測(cè)定亞胺培南、美羅培南、頭孢他啶、頭孢吡肟、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、阿米卡星、多黏菌素8種抗菌藥物對(duì)MDR-AB的最低抑菌濃度(MIC)。以512 μg/mL為起始濃度,倍比稀釋法制備11個(gè)濃度梯度(分別為512、256、128、64、32、16、8、4、2、1、0.5 μg/mL)的藥物,分別加入到滅菌96孔聚苯乙烯板的第1~11孔中,100 μL/孔,第12孔加入無(wú)藥水解酪蛋白胨(MH)肉湯作為空白對(duì)照。將生長(zhǎng)良好的目標(biāo)菌落制備成0.5麥?zhǔn)蠞舛鹊木鷳乙?,?jīng)MH肉湯1∶500稀釋后向每孔加入100 μL,加蓋后置于37 ℃普通空氣孵箱中,孵育16~20 h后判讀結(jié)果,此時(shí)第1~11孔的藥物濃度分別為256~0.25 μg/mL,無(wú)細(xì)菌生長(zhǎng)的第1孔為最低抑菌濃度,以銅綠假單胞菌(ATCC27853)、大腸埃希菌(ATCC25922)為質(zhì)控菌株進(jìn)行同批次試驗(yàn)。各藥物的藥敏折點(diǎn)判斷標(biāo)準(zhǔn):以50%細(xì)菌被抑制時(shí)的MIC為MIC50,90%細(xì)菌被抑制時(shí)的MIC為MIC90。
使用北京天根DNA提取試劑盒(離心柱型)提取63株菌株的全基因組DNA為模板,TaKaRa擴(kuò)增試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。引物序列:OXA-23上游5′-GATCGGATTGGAGAACCAGA-3′,下游5′-ATTTCTGACCGCATTTCCAT-3′;AmpC上游5′-CGGGCAATACACCAAAAGAC-3′,下游5′-CCTTAATGCGCTCTTCATTTGG-3′;TEM上游5′-AG-GAAGAGTATGATTCAACA-3′,下游5′-CTCGTCGTT-TGGTATGGC-3′;adeB上游5′-TTAACGATAGCGTTGTAACC-3′,下游5′-TGAGCAGACAATGGAATAGT-3′;adeJ上游5′-ATTGCACCACCAACCGTAAC-3′,下游5′-TAGCTGGATCAAGCCAGATA-3′;adeG上游5′-TTCATCTAGCCAAGCAGAAG-3′,下游5′-ATGTGGGCTAGCTAACGGC-3′。擴(kuò)增總體系為25 μL:ddH2O 12.875 μL、TaKaRa Taq(5 U/μL)0.125 μL、10×PCR Buffer 2.5 mL、MgCl2(25 mmol/L)1.5 mL、dNTP Mixture(各2.5 mmol/L)2 μL、模板DNA 2 μL、上下游引物(10 μmmoL/L)各1 μL。PCR擴(kuò)增條件:98 ℃ 10 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共30個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增產(chǎn)物采用1.5%瓊脂糖于電泳儀中110 V電泳30 min,使用TaKaRa DL2000 DNA Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn),凝膠成像系統(tǒng)觀察電泳結(jié)果并拍照保存,以電泳出現(xiàn)明亮的條帶并且該條帶與預(yù)期產(chǎn)物大小相同判斷為基因表達(dá)陽(yáng)性。
采用腸桿菌科基因間重復(fù)序列-聚合酶鏈反應(yīng)(ERIC-PCR)法對(duì)63株菌株進(jìn)行同源性分析。引物序列:ERIC-PCR上游5′-TGTAAGCTCCTGGGGATTCAC-3′,下游5′-AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCG-3′。擴(kuò)增體系為:引物各1 μL,DNA模板2.5 μL,PCR Master Mix 12.5 μL,雙蒸水8 μL。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min、26 ℃復(fù)性1 min、72 ℃延伸1 min,共4個(gè)循環(huán);然后94 ℃變性30 s、40 ℃復(fù)性30 s、72 ℃延伸1 min,共40個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物在含溴化乙錠的2%瓊脂糖凝膠儀上進(jìn)行電泳,電壓90 V,時(shí)間90 min,以DL2000 DNA Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn),于凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果并拍照,采用Quantity One軟件進(jìn)行聚類(lèi)分析,以相似性80%為同一型別判定標(biāo)準(zhǔn)。
63株菌株對(duì)亞胺培南、美羅培南、頭孢他啶、頭孢吡肟、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、阿米卡星7種抗菌藥物的MIC50、MIC90均屬于耐藥水平。見(jiàn)表1。
在63株菌株中,表達(dá)TEM基因50株(79.4%),表達(dá)AmpC基因58株(92.1%),表達(dá)OXA-23基因62株(98.4%),同時(shí)表達(dá)以上3種耐藥基因45株(71.4%)。攜帶外排泵基因adeB、adeJ、adeG的菌株分別為61株(96.8%)、62株(98.4%)、62株(98.4%)。
經(jīng)ERIC-PCR擴(kuò)增后的DNA片段形成的條帶4~10條,63株菌株經(jīng)基因分型共分為5個(gè)型別,分別命名為A~E型,其中A型58株(占92.1%),B型2株,C、D、E型各1株。
表1 63株多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌藥敏結(jié)果
鮑曼不動(dòng)桿菌是條件致病菌,容易導(dǎo)致患有嚴(yán)重基礎(chǔ)疾病、年老及抵抗力弱的患者發(fā)生感染。CHINET中國(guó)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)網(wǎng)監(jiān)測(cè)結(jié)果顯示,從2010年到2014年,鮑曼不動(dòng)桿菌的檢出率已超越銅綠假單胞菌,成為排名第3的醫(yī)院感染致病菌[6],MDR-AB的檢出率居高不下[7]。本研究中,63株MDR-AB僅對(duì)多黏菌素敏感,對(duì)亞胺培南、美羅培南、頭孢他啶、頭孢吡肟、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、阿米卡星的MIC50均屬耐藥水平,MIC90也遠(yuǎn)超耐藥折點(diǎn),耐藥現(xiàn)象非常嚴(yán)重。MDR-AB的耐藥機(jī)制十分復(fù)雜,包括產(chǎn)生各種β-內(nèi)酰胺酶、外膜通透性下降、藥物作用靶位改變、外排泵的過(guò)度表達(dá)及產(chǎn)生生物被膜等[8]。
細(xì)菌產(chǎn)生的β-內(nèi)酰胺酶主要分為4類(lèi),A類(lèi)主要是指廣譜β-內(nèi)酰胺酶,包含TEM、SHV、KPC等;B類(lèi)為金屬β-內(nèi)酰胺酶,包含IMP、VIM和SIM;C類(lèi)即AmpC酶;D類(lèi)為苯唑西林酶,又稱OXA碳青霉烯酶,其中OXA-23為我國(guó)最常見(jiàn)的苯唑西林酶。各類(lèi)β-內(nèi)酰胺酶的共同作用可以介導(dǎo)鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)青霉素、碳青霉烯類(lèi)、單環(huán)酰胺類(lèi)及頭孢菌素抗菌藥物產(chǎn)生耐藥[8]。本研究分析了63株MDR-AB中β-內(nèi)酰胺酶的攜帶情況,結(jié)果顯示,OXA-23基因的陽(yáng)性率最高,為98.2%,與文獻(xiàn)[9]報(bào)道一致;TEM基因檢出率為79.4%;AmpC基因檢出率為92.1%;同時(shí)攜帶以上3種耐藥基因的菌株占71.4%。本研究中,63株MDR-AB對(duì)碳青霉烯類(lèi)抗菌藥物耐藥率高達(dá)100%,對(duì)頭孢類(lèi)等抗菌藥物的耐藥率>92.0%,說(shuō)明產(chǎn)生β-內(nèi)酰胺酶是導(dǎo)致MDR-AB多重耐藥的原因之一。
外排泵的過(guò)表達(dá)是細(xì)菌對(duì)抗菌藥物耐藥的一個(gè)重要途徑,在能量的參與下可將細(xì)菌體內(nèi)的藥物或代謝產(chǎn)物泵出體外,最終導(dǎo)致細(xì)菌出現(xiàn)耐藥?;蚪M學(xué)研究發(fā)現(xiàn),外排泵系統(tǒng)廣泛存在于鮑曼不動(dòng)桿菌中。在5類(lèi)外排泵超家族中,與鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥相關(guān)的主要是耐藥結(jié)節(jié)分化(RND)超家族中的外排泵,由膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、膜融合蛋白、膜通道蛋白3部分組成,RND超家族包括adeABC、adeIJK、adeFGH系統(tǒng),它們的過(guò)度表達(dá)可導(dǎo)致氨基糖苷類(lèi)、喹諾酮類(lèi)、頭孢菌素類(lèi)、四環(huán)素等抗菌藥物產(chǎn)生耐藥。adeABC于2001年發(fā)現(xiàn),是第一個(gè)報(bào)道的RND外排泵系統(tǒng)[10],隨后于2008年和2010年分別發(fā)現(xiàn)adeIJK和adeFGH系統(tǒng)。adeB為adeABC外排系統(tǒng)的膜轉(zhuǎn)運(yùn)體蛋白,其編碼基因adeB是介導(dǎo)adeABC外排系統(tǒng)產(chǎn)生耐藥的主要因素。adeJ是adeIJK外排系統(tǒng)中的外排蛋白,adeIJK的過(guò)度表達(dá)可導(dǎo)致鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)β-內(nèi)酞胺類(lèi)、碳青霉烯酶類(lèi)、氟喹諾酮類(lèi)、氯霉素、四環(huán)素等抗菌藥物產(chǎn)生耐藥。adeG是典型的RND蛋白。Coyne等[11]研究發(fā)現(xiàn),adeFGH外排系統(tǒng)為鮑曼不動(dòng)桿菌所固有,但部分細(xì)菌中不存在adeFGH,過(guò)度表達(dá)的adeFGH可介導(dǎo)菌株對(duì)磺胺類(lèi)、氟喹諾酮類(lèi)及克林霉素等高水平耐藥。本研究對(duì)MDR-AB進(jìn)行RND外排泵結(jié)構(gòu)基因adeB、adeG、adeJ檢測(cè),結(jié)果表明,3種外排泵基因廣泛存在于MDR-AB中,adeB、adeG、adeJ的檢出率分別為96.8%、98.4%、98.4%;同時(shí)檢出3種泵基因的菌株占98.4%;有1株MDR-AB 3種基因均未檢出,并且其β-內(nèi)酰胺酶檢測(cè)也均為陰性,表明存在RND超家族外的其他外排泵發(fā)揮作用。
基因分型在醫(yī)院感染的爆發(fā)流行中起重要作用。ERIC-PCR屬于基因分型技術(shù)的一種,其與脈沖場(chǎng)凝膠電泳技術(shù)結(jié)果一致性高[12,13],并且具有簡(jiǎn)便、快捷、重復(fù)性好、穩(wěn)定性高等特點(diǎn),適用于臨床細(xì)菌的分型檢測(cè)。ERIC-PCR是根據(jù)腸桿菌科細(xì)菌中高度保守的反向重復(fù)序列設(shè)計(jì)引物,通過(guò)PCR擴(kuò)增產(chǎn)生不同的DNA片段,并通過(guò)瓊脂糖電泳分析條帶進(jìn)行基因分型,可以認(rèn)為ERIC-PCR是一種半隨機(jī)擴(kuò)增PCR[14]。本研究通過(guò)ERIC-PCR對(duì)63株MDR-AB進(jìn)行基因分型,結(jié)果顯示,63株菌株可分為A、B、C、D、E 5型,其中A型占92.1%,B、C、D、E型均為散在菌株。說(shuō)明本研究中臨床分離的MDR-AB大部分為同一菌株克隆進(jìn)化而來(lái),提示MDR-AB存在小型暴發(fā)流行的可能。
綜上所述,β-內(nèi)酰胺酶及主動(dòng)外排系統(tǒng)在MDR-AB中分布廣、存在率高,醫(yī)院科室之間的克隆播散及臨床科室對(duì)抗菌藥物的不合理使用可能導(dǎo)致鮑曼不動(dòng)桿菌出現(xiàn)多重耐藥。因此臨床需合理使用抗菌藥物,加強(qiáng)對(duì)已有抗菌藥物的改進(jìn)及新型抗菌藥物的研發(fā)迫在眉睫。
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