莊文越, 李正祎, 劉 燕, 夏 薇△, 陳子興
(1北華大學(xué)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)院, 2吉林醫(yī)藥學(xué)院檢驗(yàn)學(xué)院, 吉林 吉林 132013; 3蘇州大學(xué)附屬第一醫(yī)院, 江蘇省血液學(xué)研究所, 江蘇 蘇州 215000)
近年來,丙戊酸鈉(sodium valproate,VPA)被發(fā)現(xiàn)具有抑制組蛋白脫乙酰酶(histone deacetylase,HDAC)活性的作用,屬于HDAC抑制劑(HDAC inhibitor,HDACI)的短鏈脂肪酸類,可通過抑制HDAC的作用,使核小體組蛋白乙酰化,逆轉(zhuǎn)HDAC參與的異常基因表達(dá),從而引起廣泛的抗腫瘤效應(yīng),包括誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞分化、阻滯細(xì)胞周期和促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡、增強(qiáng)機(jī)體對化療和放療的敏感性及逆轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)移性腫瘤的惡性表型等[1-2]。為研究AML1-ETO融合蛋白的致白血病機(jī)理,我們前期將AML1-ETO融合基因穩(wěn)定轉(zhuǎn)入白血病細(xì)胞株U937中,并以染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(chromatin immunoprecipitation,ChIP)等技術(shù)已確認(rèn)CCAAT/增強(qiáng)子結(jié)合蛋白α(CCAAT/enhancer-binding protein α,CEBPA)基因是AML1-ETO融合蛋白結(jié)合的直接調(diào)控轉(zhuǎn)錄的下游基因之一。AML1-ETO融合蛋白通過修飾組蛋白的乙酰化和甲基化使CEBPA基因沉默,從而改變了U937-A/E細(xì)胞的增殖分化表型[3]。本研究以急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)U937-A/E細(xì)胞株為模型,研究VPA對AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞中CEBPA基因表觀遺傳修飾的調(diào)控,探討VPA誘導(dǎo)沉默的CEBPA基因再表達(dá)的可能機(jī)制,為表觀遺傳學(xué)調(diào)控治療腫瘤提供理論基礎(chǔ)。
蛋白酶抑制劑混合物、RNase、VPA、蛋白酶K和CCK-8試劑盒均購自Sigma;RPMI-1640培養(yǎng)基和胎牛血清購自Thermo Scientific;ChIP kit及抗乙?;M蛋白H3(acetylated histone H3, AcH3)和AcH4 抗體均購自Millipore。
將本室構(gòu)建的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染了重組質(zhì)粒pcDNA3.1-AML1-ETO的亞克隆細(xì)胞株命名為U937-A/E1~4,設(shè)為實(shí)驗(yàn)組;將轉(zhuǎn)染了空質(zhì)粒pcDNA3.1(-)的U937細(xì)胞命名為U937-Mock,設(shè)為空載體組;U937-WT細(xì)胞由本實(shí)驗(yàn)室保存,為無質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的野生型U937細(xì)胞,設(shè)為空白對照組。細(xì)胞以5×106/L的密度接種于含10%胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)液中,于37 ℃、5% CO2和飽和濕度的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每2 d換液傳代。實(shí)驗(yàn)采用對數(shù)生長期的細(xì)胞,用不同濃度(0.1、0.5、1.0和2.0 mmol/L)的VPA分別處理細(xì)胞24 h、48 h和72 h,以不加藥物組作為對照組,收集細(xì)胞并洗滌,進(jìn)行相關(guān)檢測。
3.1CCK-8法檢測細(xì)胞活力 取對數(shù)生長期細(xì)胞,接種單細(xì)胞懸液于96孔板,每孔100 μL(含8 000個(gè)細(xì)胞),每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔,不同處理時(shí)間后,加入CCK-8溶液10 μL,繼續(xù)培養(yǎng)2 h后在450 nm波長下,酶聯(lián)免疫分析儀測定各孔吸光度(A),按照公式計(jì)算細(xì)胞生長抑制率。細(xì)胞抑制率(%)=(1-A實(shí)驗(yàn)組/A對照組)×100%。以抑制率為縱坐標(biāo),以藥物濃度(mmol/L)為橫坐標(biāo),繪制生長曲線。
3.2臺盼藍(lán)染色活細(xì)胞計(jì)數(shù)實(shí)驗(yàn) 將培養(yǎng)至對數(shù)生長期的細(xì)胞以每孔4×105個(gè)接種于6孔板,給予不同濃度VPA(0.1、0.5、1.0和2.0 mmol/L)作用不同時(shí)間(24 h、48 h和72 h),用濃度為0.1%的臺盼藍(lán)染色,3 min內(nèi)用計(jì)數(shù)板分別計(jì)數(shù)活細(xì)胞和死細(xì)胞。鏡下觀察,死細(xì)胞被染成藍(lán)色, 而活細(xì)胞拒染。
3.3流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞表面抗原 取對數(shù)生長期的U937-WT、U937-Mock和U937-A/E1~4細(xì)胞2×105個(gè),每次每組設(shè)2孔,相同條件下重復(fù)3次,加PE-CD11b和FITC-CD14單抗,4 ℃培育30 min,PBS洗滌2次,用200 μL PBS混懸。用FACSCalibur流式細(xì)胞儀(Becton Dickinson)檢測,CellQuest軟件(Becton Dickinson)分析結(jié)果。
3.4RT-qPCR檢測藥物處理前后CEBPA mRNA的表達(dá)變化 首先應(yīng)用Invitrogen的M-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行cDNA合成。用SYBR Green染料法在ABI 7500型熒光實(shí)時(shí)定量PCR儀上進(jìn)行qPCR擴(kuò)增反應(yīng)。CEBPA的上游引物序列為5’-CTTCAACGACGAGTTCCTGGCCGA-3’;下游引物序列為5’-AGCTGCTTGGCTTCATCCTCCT-3’。β-actin的上游引物序列為5’-TCCCTGGAGAAGAGCTACGA-3’,下游引物序列為5’-AGCACTGTGTTGGCGTACAG-3’。根據(jù)2-ΔΔCt法計(jì)算CEBPA的 mRNA相對表達(dá)量。
3.5ChIP-qPCR方法檢測藥物處理前后CEBPA基因組蛋白H3和H4的乙?;癄顟B(tài) 收集1×108細(xì)胞加入終濃度體積分?jǐn)?shù)為1%的甲醛溶液,室溫?fù)u床孵育10 min,加入1/20體積的2.5 mol/L的甘氨酸,室溫?fù)u床孵育5 min后,4 ℃、400×g離心5 min,收集細(xì)胞用1×PBS洗2遍,細(xì)胞碎片用ChIP lysis buffer (Affymetrix)重懸,超聲得到染色體平均大小為500 bp,利用抗AcH3和抗AcH4 抗體,按照Millipore的ChIP具體步驟操作。ChIP沉淀富集的樣本,以CEBPA基因啟動子區(qū)設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物如下:上游引物5’-TGGACAAGAACAGCAACGAG-3’,下游引物5’-TTGTCACTGGTCAGCTCCAG-3’。ChIP沉淀富集的DNA用SYBR Green染料方法進(jìn)行real-time PCR分析。有效數(shù)據(jù)的判斷:(1)各樣品的擴(kuò)增曲線須達(dá)到平臺期;(2)熔解曲線為單一的峰,并且熔解溫度在75 ℃以上才能提示該擴(kuò)增為特異性擴(kuò)增。ChIP-qPCR的結(jié)果按%Input=2-ΔCt(normalized ChIP)公式處理數(shù)據(jù),其中ΔCt(normalized ChIP)=Ct(ChIP)-[Ct(Input)-log2(Input Dilution Factor)],Input Dilution Factor= (fraction of the input chromatin saved)-1。
所有的實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,運(yùn)用SPSS 22.0 軟件對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。定量資料結(jié)果以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示,兩獨(dú)立樣本之間均數(shù)比較采用t檢驗(yàn),多組樣本之間均數(shù)比較采用單因素方差分析,以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
CCK-8法結(jié)果表明,1.0 mmol/L及以上濃度的VPA在不同時(shí)點(diǎn)檢測的細(xì)胞抑制率均有顯著差異(P<0.05);在同一時(shí)點(diǎn),不同濃度下的細(xì)胞抑制率之間有明顯差異(P<0.05),隨著濃度的增加,VPA的增殖抑制效應(yīng)逐漸增強(qiáng),呈現(xiàn)劑量和時(shí)間依賴性,見圖1A。在活細(xì)胞計(jì)數(shù)實(shí)驗(yàn)中, 實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞的增殖情況與對照組相比明顯受到抑制, 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖1B。后續(xù)的實(shí)驗(yàn)中以VPA 1.0 mmol/L為藥物濃度組、48 h為作用時(shí)間進(jìn)行分析。
Figure 1. The effect of VPA on the proliferation of U937 andAML1-ETOtransfected cells. A: the cell viability was measured by CCK-8 assay; B: the living cell numbers were counted by the method of Trypan blue exclusion. Mean±SD.n=3.△P<0.05vs0.1 mmol/L group;*P<0.05vs0 mmol/L group.
圖1VPA對U937及AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞增殖的影響
CD11b和CD14是髓系標(biāo)志,表達(dá)于較成熟的粒細(xì)胞和單核細(xì)胞。上述各組細(xì)胞經(jīng)1.0 mmol/L VPA培養(yǎng)48 h后,亞克隆細(xì)胞株間的CD11b和CD14表達(dá)陽性率相互比較,顯示AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞株U937-A/E1~4的CD11b和CD14表達(dá)陽性率均顯著低于U937-Mock和U937-WT細(xì)胞(P<0.05),這與藥物處理前的分化抗原表達(dá)下降趨勢是一致的。同時(shí),藥物處理后,與對照未加藥組比較,CD11b和CD14的表達(dá)均明顯升高(P<0.05),見圖2。
Figure 2. The effect of VPA on the expression of CD11b and CD14 in the U937 andAML1-ETOtransfected cells. Mean±SD.n=3.*P<0.05vsVPA-untreated group;△P<0.05vsU937-Mock or U937-WT.
圖2VPA對U937及AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞CD11b和CD14表達(dá)的影響
采用RT-qPCR檢測處理組和對照組細(xì)胞中CEBPA mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果顯示,經(jīng)1.0 mmol/L VPA作用48 h后U937-A/E1~4各細(xì)胞株中,與對照組比較,VPA均明顯上調(diào)CEBPA mRNA的表達(dá)水平(P<0.05),見圖3。
Figure 3. The effect of VPA on mRNA expression of CEBPA. Mean±SD.n=3.*P<0.05vscontrol group.
圖3VPA對CEBPAmRNA表達(dá)水平的影響
用VPA處理細(xì)胞后,與藥物處理前比較,CEBPA基因啟動子區(qū)核染色質(zhì)的組蛋白H3和H4乙酰化水平升高(P<0.05); 同時(shí),VPA處理細(xì)胞后,各細(xì)胞株間比較發(fā)現(xiàn),AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞U937-A/E1~4的CEBPA啟動子區(qū)所在染色質(zhì)的H3及H4乙酰化水平均顯著低于U937-Mock及U937-WT細(xì)胞(P<0.05),這些表觀遺傳學(xué)修飾的特征與藥物處理前是一致的,見圖4。
Figure 4. The effect of VPA on H3 and H4 acetylation ofCEBPAgene. A: H3 acetylation ofCEBPAgene; B: H4 acetylation ofCEBPAgene. Mean±SD.n=3.*P<0.05vsVPA-untreated group;△P<0.05vsU937-Mock or U937-WT.
圖4VPA對CEBPA基因組蛋白H3和H4乙?;降挠绊?/p>
表觀遺傳修飾中組蛋白的乙?;腿ヒ阴;揎椩谡婧思?xì)胞基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中發(fā)揮重要作用,而組蛋白乙酰化是一個(gè)可逆的動態(tài)過程,由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferases,HATs)和HDACs這一對酶的相互平衡進(jìn)行調(diào)節(jié)。組蛋白的乙?;腿ヒ阴;蔀樘囟ɑ虮磉_(dá)的切換開關(guān)[4],它們的功能紊亂是腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要分子機(jī)制。腫瘤細(xì)胞中HDACs異?;罨蓪?dǎo)致一系列基因的轉(zhuǎn)錄受抑,所涉及的有與增殖調(diào)節(jié)、遷移、血管發(fā)生、細(xì)胞分化、侵襲和轉(zhuǎn)移等相關(guān)基因[5]。VPA作為一種廣泛應(yīng)用于臨床的廣譜抗癲癇藥物,是一種HDAC抑制劑,多項(xiàng)體外研究顯示其可誘導(dǎo)多種腫瘤細(xì)胞分化與凋亡、導(dǎo)致細(xì)胞周期阻滯而抑制多種腫瘤細(xì)胞增殖[6-8]。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,用CCK-8法觀察VPA對U937細(xì)胞增殖狀態(tài)的影響, 在一定濃度范圍內(nèi)VPA隨著濃度的增加和作用時(shí)間的延長,抑制作用逐漸增強(qiáng),呈劑量和時(shí)間依賴性,說明VPA可以抑制U937及其轉(zhuǎn)染細(xì)胞的增殖。VPA在1.0 mmol/L分別作用48 h后可以誘導(dǎo)白血病細(xì)胞U937及其轉(zhuǎn)染了AML1-ETO的細(xì)胞發(fā)生分化。
在急性髓性白血病中,由于染色體易位t(8;21)和基因重排產(chǎn)生了新的融合基因AML1-ETO,其蛋白產(chǎn)物通過募集HDAC,使在造血細(xì)胞增殖、分化和凋亡過程中起重要作用的基因表達(dá)受到抑制,導(dǎo)致白血病的發(fā)生[9]。研究發(fā)現(xiàn),VPA能特異性誘導(dǎo)AML1-ETO陽性細(xì)胞系(Kasumi-1和Kasumi-6)分化,繼而誘導(dǎo)凋亡并上調(diào)AML1目的基因的表達(dá),但在AML1-ETO陰性細(xì)胞系MV4-11和K562未觀察到上述變化[10]。Insinga等[11]研究證明,VPA能提高AML1-ETO、PML-RARα陽性AML患者及小鼠骨髓原始細(xì)胞組蛋白乙?;?,通過腫瘤壞死因子相關(guān)凋亡誘導(dǎo)配體及Fas死亡受體途徑誘導(dǎo)凋亡。C/EBPα蛋白是造血系統(tǒng)中調(diào)控髓系分化的重要轉(zhuǎn)錄因子,在造血分化早期階段對造血干祖細(xì)胞分化命運(yùn)的選擇起決定作用。本研究前期實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),AML1-ETO轉(zhuǎn)染各細(xì)胞株中,CEBPA mRNA普遍處于低表達(dá)狀態(tài),使分化阻滯,導(dǎo)致白血病的發(fā)生[3]。在此基礎(chǔ)上,本研究深入探討VPA作為組蛋白去乙?;敢种苿ML1-ETO陽性細(xì)胞中CEBPA基因表達(dá)及表觀遺傳修飾的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)使用VPA可明顯上調(diào)CEBPA mRNA的表達(dá)水平,VPA處理組U937及AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞株CEBPA啟動子區(qū)的組蛋白H3和H4的乙?;缴?。由此證明,VPA能夠在一定程度上使M2b型白血病細(xì)胞因染色質(zhì)組蛋白低乙酰化而轉(zhuǎn)錄失活的CEBPA基因恢復(fù)其轉(zhuǎn)錄活性,CEBPA mRNA得以重新表達(dá),從而能夠發(fā)揮抗凋亡、促分化和腫瘤抑制的作用。
綜上所述,HDAC抑制劑VPA對U937及其AML1-ETO轉(zhuǎn)染細(xì)胞均有生長抑制和促分化的作用,并且通過提高CEBPA基因的組蛋白乙?;绞乖臼芤值腃EBPA基因在M2b型白血病細(xì)胞中重新表達(dá)或表達(dá)增加,通過人為的干預(yù)拮抗,甚至逆轉(zhuǎn)異常的表觀遺傳學(xué)改變,誘導(dǎo)因表觀遺傳學(xué)改變而失活的基因重新表達(dá)。這一機(jī)理提供了表觀遺傳學(xué)調(diào)控治療腫瘤的理論基礎(chǔ),為白血病的基因靶向治療開辟了新的途徑。