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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的款冬花止咳化痰活性成分靶點研究

2018-11-06 10:19臧鋒磊周敬
健康大視野 2018年12期
關(guān)鍵詞:活性成分網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)款冬花

臧鋒磊 周敬

【摘 要】目的:研究款冬花止咳化痰活性成分的作用靶點。方法:以款冬花止咳化痰相關(guān)的12個化合物為研究對象,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)理論,采用反向藥效團匹配法,預(yù)測活性成分靶點,并和CooLGeN數(shù)據(jù)庫進行比對,構(gòu)建靶點網(wǎng)絡(luò)模型。結(jié)果:款冬花止咳化痰相關(guān)的潛在作用靶點有36個,主要靶點有GSTP1、MAPK14、ACHE、GSTA1、CFTR、VDR、ESR1、F2、GSTM1、MME、DAPK1;且不同活性成分可作用在相同靶點上,相同活性成分也可作用在不同靶點上。結(jié)論:款冬花止咳化痰作用具有多成分、多靶點的特點,為作用機制的研究提供科學(xué)依據(jù)。

【關(guān)鍵詞】款冬花;止咳化痰;活性成分;靶點;網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)

【中圖分類號】R749.053

【文獻標(biāo)志碼】 糎T〗

B 【文章編號】1005-0019(2018)12-100-02

款冬花具有止咳、祛痰、平喘的作用,是臨床上常用的中藥之一。就目前的研究而言[1],款冬花中的咖啡?;崴犷惓煞郑哂兄箍然祷钚?;槲皮素、蘆丁、山柰酚等成分,也在其他藥材中證實了止咳祛痰作用??偨Y(jié)來看,款冬花止咳化痰的活性成分已經(jīng)證實,但作用機制尚不明確。本文利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),以款冬花的活性成分為基準,構(gòu)建成分—通路—靶點網(wǎng)絡(luò),深入探討止咳化痰的作用機制,報告如下:

1 資料與方法

1.1 建立標(biāo)準格式文件 結(jié)合以往研究成果,已知款冬花止咳化痰相關(guān)的化合物有12個,分別是款冬花素、山奈酚、金絲桃苷、款冬酮、β-谷甾淳、綠原酸、咖啡酸、檞皮素、4,5-二咖啡?;崴?、3,5-二咖啡酰基奎尼酸、3,4-二咖啡?;崴?、蘆丁。利用ChemBioDraw Ultra軟件,畫出這些化合物的結(jié)構(gòu)圖,以sdf-mol格式進行保存。

1.2 靶點反向預(yù)測 輔助利用PharmMapper服務(wù)器,將款冬花活性成分sdf-mol格式文件上傳至服務(wù)器,通過反向藥效團匹配,得到虛擬篩選結(jié)果。然后選取活性小分子作為探針,對潛在藥物靶點進行搜查,并預(yù)測生物活性。考慮到這些藥物靶點的命名不規(guī)范,本次實驗利用UniRrotKB搜索功能,限定物種為人,輸入蛋白名稱,將檢索到的蛋白類型確定為官方名稱,經(jīng)數(shù)據(jù)庫檢索和轉(zhuǎn)化,得到相關(guān)蛋白信息。

1.3 靶點篩選 匯總反向預(yù)測后的靶點信息,和CooLGeN數(shù)據(jù)庫中的咳嗽靶點進行比較,從而明確預(yù)測靶點中具有止咳化痰作用的靶點。

1.4 構(gòu)建靶點網(wǎng)絡(luò) 利用Cytoscape軟件的Merge功能,以款冬花靶點預(yù)測結(jié)果為準,構(gòu)建靶點網(wǎng)絡(luò)模型,網(wǎng)絡(luò)節(jié)點代表活動成分、靶點、作用通路。節(jié)點連接原則[2]:如果活性成分靶點、作用通路靶點相同,此時兩者用邊連接起來。

2 結(jié)果

2.1 靶點信息 款冬花潛在作 冒械愎布?00個,按照從高到低的順序進行排列,并和CooLGeN數(shù)據(jù)庫進行比較,結(jié)果得到36個和止咳化痰相關(guān)的潛在作用靶點,主要靶點信息見表1。

2.2 靶點數(shù)目 款冬花止咳化痰活性成分的靶點數(shù)目如下:款冬花素29個、山奈酚24個、金絲桃苷21個、款冬酮20個、β-谷甾淳20個、綠原酸19個、咖啡酸18個、槲皮素17個、4,5-二咖啡?;崴?4個、3,5-二咖啡酰基奎尼酸12個、3,4-二咖啡酰基奎尼酸11個、蘆丁11個。分析可知,不同活性成分可作用在相同靶點上,相同活性成分也可作用在不同靶點上,凸顯出多成分、多靶點的作用機制。

3 討論

款冬花屬于菊科款冬屬植物,具有止咳化痰、潤肺下氣的功效,主要用來治療咳痰、咳喘、咯血、氣管炎等疾病。此外,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究表明[3],款冬花對心血管系統(tǒng)的作用,體現(xiàn)在升壓、收縮血管、抗血小板聚集上;對中樞神經(jīng)系統(tǒng)的作用,體現(xiàn)在驚厥、呼吸興奮上;對消化系統(tǒng)的作用,體現(xiàn)在解痙、緩解腹瀉上。具體到止咳化痰功效,雖然相關(guān)成分已經(jīng)明確,但活性成分的作用靶點尚不清楚,本文基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)理念對此進行研究。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),是在生物學(xué)、藥理學(xué)的基礎(chǔ)上進行的整合和創(chuàng)新,通過構(gòu)建藥物—靶點—疾病三者的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,來明確藥物的作用機制。簡單來看,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)就是將藥物—靶點網(wǎng)絡(luò)和生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)合在一起,為藥物研發(fā)提供新的途徑。反向藥效團匹配法,能根據(jù)配體特征預(yù)測靶點,對匹配的藥效團進行尋找、查詢、打分,不僅臨床適應(yīng)癥的涵蓋范圍廣,而且靶點信息全、運算速度快。從已有的研究結(jié)果來看,有學(xué)者發(fā)現(xiàn)逍遙散中的抗抑郁成分,包括25個作用靶點,參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、內(nèi)分泌和能量代謝;有學(xué)者發(fā)現(xiàn)百合地黃湯中包括11個活性成分、21個靶點,且兩者相互作用。

本次研究 校鑰疃ㄖ兄箍然迪喙氐?2個化合物為對象,首先建立sdf-mol格式文件,然后對靶點反向預(yù)測和篩選,最后建立靶點網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果顯示,和止咳化痰相關(guān)的潛在作用靶點共有36個,頻率較高的如GSTP1、MAPK14、ACHE、GSTA1等,且作用機制具有多成分、多靶點的特征。

參考文獻

[1] 李靜,高麗,高耀等.基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的款冬花止咳化痰活性成分靶點探究[J].中草藥,2018,(1):179-187.

[2] 張爭爭.款冬花活性成分及轉(zhuǎn)錄組研究[D].山西大學(xué),2016.

[3] 吳琪珍,張朝鳳,許翔鴻等.款冬花化學(xué)成分和藥理活性研究進展[J].中國野生植物資源,2015,(2):33-36.

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