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多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定登革熱Ⅰ~Ⅳ型方法的建立與初步評(píng)價(jià)

2019-02-20 14:30費(fèi)云霞張祥波何韜張雨婷高依丹高嶺王潔陳公英
中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)生 2019年34期
關(guān)鍵詞:熒光定量PCR登革熱血清型

費(fèi)云霞 張祥波 何韜 張雨婷 高依丹 高嶺 王潔 陳公英

[摘要] 目的 探討多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定登革熱Ⅰ~Ⅳ型方法的建立與初步評(píng)價(jià)。 方法 針對(duì)登革熱Ⅰ~Ⅳ型使用自建的引物探針對(duì)反應(yīng)條件及溫度進(jìn)行調(diào)整,且對(duì)陽(yáng)性樣本進(jìn)行不同濃度的稀釋,檢測(cè)自建多重?zé)晒舛縋CR在登革熱Ⅰ~Ⅳ型測(cè)定中的重復(fù)性、靈敏性及特異性。 結(jié)果 6份登革熱陽(yáng)性樣本通過(guò)自建的檢測(cè)方法來(lái)進(jìn)行檢測(cè),全部能夠顯示明顯的S曲線擴(kuò)增,且與原有確證方法相比,不同型別的結(jié)果一致。其他10份病毒陽(yáng)性樣本及陰性樣本全部沒(méi)有顯示擴(kuò)增曲線,提示自建的檢測(cè)方法特異性良好。分別檢測(cè)登革熱Ⅰ~Ⅳ型,變異系數(shù)(CV%)值水平范圍:0.51~5.51,提示重復(fù)性較好。使用自建的多重?zé)晒舛縋CR對(duì)登革熱不同型別進(jìn)行檢測(cè)的平均用時(shí)與ELISA法相比無(wú)顯著差異(t=1.561,P>0.05)。通過(guò)自建的多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定通過(guò)儀器來(lái)完成核酸的自動(dòng)提取,在儀器當(dāng)中加樣、上機(jī)之后不需要另外的操作,充分降低了發(fā)生污染的風(fēng)險(xiǎn)。 結(jié)論 本次研究設(shè)計(jì)建立的登革熱Ⅰ~Ⅳ型多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,在重復(fù)性、靈敏性及特異性方面均較為理想;且相比ELISA法在加樣后無(wú)需另外手動(dòng)操作,更加簡(jiǎn)易方便。

[關(guān)鍵詞] 登革熱;熒光定量PCR;血清型;病毒載量

[中圖分類號(hào)] R512.8? ? ? ? ? [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] A? ? ? ? ? [文章編號(hào)] 1673-9701(2019)34-0008-06

Establishment and preliminary evaluation of multiplex quantitative PCR for determination of dengue fever type Ⅰ-Ⅳ

FEI Yunxia1? ?ZHANG Xiangbo2? ?HE Tao2? ?ZHANG Yuting1? ?GAO Yidan3? ?GAO Ling3? ?WANG Jie3

CHEN Gongying3

1.Zhejiang University of Traditional Chinese Medicine, Hangzhou? ?310053, China; 2.Hangzhou Normal University, Hangzhou? ?310053, China; 3.Department of Infectious Diseases and Liver Diseases, Affiliated Hospital of Hangzhou Normal University, Hangzhou? ?310053, China

[Abstract] Objective To establish and evaluate the method of multiplex quantitative PCR for the determination of dengue fever type Ⅰ-Ⅳ. Methods For the dengue type Ⅰ-Ⅳ, the self-built primer probe was used to adjust the reaction conditions and temperature, and the positive samples were diluted at different concentrations. The repeatability, sensitivity and specificity of self-built multiplex quantitative PCR in the determination of dengue type Ⅰ-Ⅳ. Results Six dengue-positive samples were tested by self-built detection methods, all of which showed significant S-curve amplification, and the results of the different types were consistent compared with the original confirmation method. The other 10 virus-positive samples and negative samples did not show amplification curves, suggesting that the self-built detection method was specific. The dengue type Ⅰ-Ⅳ type was detected separately, and the coefficient of variation(CV%) value range was 0.51-5.51, indicating good repeatability. The mean time to test different types of dengue using self-built multiplex quantitative PCR was not significantly different from ELISA(t=1.561, P>0.05). Through the self-built multiplex quantitative PCR assay, the automatic extraction of nucleic acid was completed by the instrument, and no additional operation was required after the sample was loaded in the instrument and the machine was taken on, which completely reduced the risk of contamination. Conclusion The dengue type Ⅰ~Ⅳ multiplex quantitative PCR method established in this study is ideal in terms of repeatability, sensitivity and specificity. Compared with ELISA, no additional manual operation is required after the sample is added. It is easy and convenient.

[Key words] Dengue fever; Real-time PCR; Serotype; Viral load

登革熱病毒在臨床中歸屬于黃病毒科,依據(jù)不同的表面抗原,臨床中將其分為4個(gè)不同的血清型別,分別為DEN-Ⅰ~DEN-Ⅳ[1]。最近幾年,隨著氣候及環(huán)境的變化,同時(shí)旅游業(yè)及城市化的飛速發(fā)展等,均為登革熱病毒的擴(kuò)散及傳播提供更加便利、快捷的條件,導(dǎo)致登革熱病毒的流行區(qū)域持續(xù)增大。目前臨床中診斷登革熱病毒的金標(biāo)準(zhǔn)方法就是病毒分離,但登革熱病毒需要1 d才能在細(xì)胞中生長(zhǎng),且通過(guò)分離病毒進(jìn)行診斷時(shí)其靈敏性較低[2]。臨床中最常用的一種登革病毒抗體檢測(cè)方法就是血清學(xué)檢測(cè),尤其是檢測(cè)特異性抗體[3]。但抗體只能在發(fā)病后的1 d才可以檢測(cè)到[4]。實(shí)時(shí)定量PCR是在普通PCR基礎(chǔ)上發(fā)展而得,包括兩種:探針類及非探針類,探針類增加了識(shí)別特異性探針這一步驟,因此具有很高的檢測(cè)特異性[5]。國(guó)內(nèi)已經(jīng)有相關(guān)研究開(kāi)始著手使用熒光定量PCR對(duì)登革熱病毒進(jìn)行檢測(cè)。本實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步研究不同分型登革熱病毒的熒光定量PCR檢測(cè)方法,且對(duì)該檢測(cè)方法的臨床檢測(cè)效能進(jìn)行評(píng)價(jià),現(xiàn)報(bào)道如下。

1 資料與方法

1.1儀器與試劑

登革熱盲樣、諾如病毒、乙腦病毒、流感病毒等全部由本地疾控中心提供;健康者血清由本地血站提供;引物探針:由伯樂(lè)生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品(上海)有限公司合成,熒光定量PCR儀:型號(hào):AB7500,購(gòu)自Applied Biosystems;核酸提取儀器和配套試劑盒:購(gòu)自上海西寶生物,熒光定量PCR試劑盒,型號(hào):RR064A,購(gòu)自上海酶聯(lián)科研;登革熱病毒通用型試劑盒購(gòu)自上海酶聯(lián)科研;登革熱分型引物探針由本地疾控中心提供。ELISA特異性檢測(cè)IgM抗體試劑盒:購(gòu)自上海紀(jì)寧生物;流感病毒試劑盒:購(gòu)自上海紀(jì)寧生物,諾如試劑盒:購(gòu)自上海紀(jì)寧生物。BHK-21細(xì)胞:含胎牛血清(濃度為8%)的DMEM培養(yǎng)液進(jìn)行傳代培養(yǎng),溫度:37℃,CO2:5%的條件下進(jìn)行培養(yǎng)。

1.2方法

1.2.1 標(biāo)準(zhǔn)品的制備? 將登革熱陽(yáng)性樣本、登革熱病毒通用型試劑盒的陽(yáng)性對(duì)照品,分別進(jìn)行四個(gè)不同梯度的稀釋:10倍、100倍、1000倍、10000倍。

1.2.2 核酸PCR擴(kuò)增? 詳見(jiàn)說(shuō)明書(shū);PCR反應(yīng)體系參數(shù):12.5 μL Buffer,0.5 μL逆轉(zhuǎn)錄酶,0.5Ixl Taq酶,上游引物、下游引物共0.5 μL,探針0.5 μL,0.5 μL模板,加清水補(bǔ)足到25 μL。參數(shù)條件:42℃、10 min,60℃、34 s,95℃、2 min,95℃、5 s,40個(gè)循環(huán)。評(píng)估標(biāo)準(zhǔn):擴(kuò)增曲線呈S型,且CT值≤35判定陽(yáng)性[6]。

1.2.3 登革混合感染Ⅰ型病毒及Ⅱ型病毒的樣本制備和檢測(cè)? 將BHK-21細(xì)胞接種到12孔細(xì)胞培養(yǎng)板中進(jìn)行培養(yǎng)到單層,并將制備好的登革Ⅰ型病毒懸液及Ⅱ型病毒懸液根據(jù)10倍的梯度進(jìn)行等比稀釋,接種至12孔(規(guī)格:0.2 mL/孔)細(xì)胞培養(yǎng)板當(dāng)中并進(jìn)行搖勻:15 min/次,在37℃的環(huán)境下進(jìn)行1.5 h的孵育,再加入低熔點(diǎn)瓊脂(2%):1 mL,跟2×DMEM培養(yǎng)基混合物進(jìn)行1:1的覆蓋,等到凝固之后,放置到培養(yǎng)箱當(dāng)中繼續(xù)進(jìn)行培養(yǎng),在6 d之后使用結(jié)晶紫實(shí)施染色,計(jì)算空斑數(shù)水平。

C6/36細(xì)胞根據(jù)2.5×105/孔轉(zhuǎn)移至6孔細(xì)胞培養(yǎng)板當(dāng)中,溫度:28℃,CO2:5%進(jìn)行24 h的培養(yǎng)后,接種病毒,共分成:感染登革Ⅰ型病毒組、感染登革Ⅱ型病毒組、混合感染登革Ⅰ型病毒及Ⅱ型病毒組。每組依據(jù)感染復(fù)數(shù)MOI=1(2.5×105 PFU/孔)來(lái)接種病毒,培養(yǎng)箱內(nèi)溫度:37℃,CO2:5%進(jìn)行1.5 h的孵育后,將病毒懸液的上清層吸出,使用RPIM1640培養(yǎng)液進(jìn)行兩次清洗,再加入FBS(2%):2 mL的RPIM1640培養(yǎng)液分別進(jìn)行不同時(shí)間段的培養(yǎng):36 h、48 h、60 h、72 h、84 h、96 h、120 h,吸取病毒上清,冷凍保存待用。在取樣之后,在各個(gè)培養(yǎng)孔內(nèi)加入維持液:100 μL,補(bǔ)齊到2 mL,重復(fù)實(shí)驗(yàn)3次。依據(jù)RNA提取試劑盒當(dāng)中的操作說(shuō)明書(shū)來(lái)提取并收集病毒上清中的RNA,用本次實(shí)驗(yàn)當(dāng)中所建立的多重?zé)晒舛縋CR來(lái)檢測(cè)C6/36混合感染登革Ⅰ型病毒和登革Ⅱ型病毒之后的不同時(shí)間病毒拷貝數(shù)水平。

1.3 觀察指標(biāo)

1.3.1 觀察評(píng)估多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定的特異性? ? 共選取16份樣本進(jìn)行特異性檢測(cè),其中,登革熱盲樣:7份,確證Ⅰ型2份,Ⅱ型1份,Ⅲ型1份,Ⅳ型1份,陰性樣本2份;DEN-Ⅰ陽(yáng)性標(biāo)本1份:通過(guò)ELISA進(jìn)行IgM抗體特異性檢測(cè),且通過(guò)核酸檢測(cè)驗(yàn)證;乙腦陽(yáng)性2份;流感陽(yáng)性2份,諾如陽(yáng)性2份,健康者血清2份。對(duì)上述的16份樣本通過(guò)登革熱不同型別探針和引物試劑盒(表1)、諾如試劑盒、流感試劑盒和登革熱通用型進(jìn)行分別檢測(cè),沒(méi)有雙重或多重病毒感染,最多感染1種病毒。使用自建的方法來(lái)檢測(cè)所有樣本,以評(píng)估其特異性。

1.3.2 觀察評(píng)估多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定的靈敏性? 通過(guò)試劑盒陽(yáng)性對(duì)照品來(lái)對(duì)登革熱陽(yáng)性4個(gè)不同樣本型別定量,將濃度調(diào)整至:1×101 copies/mL、1×102 copies/mL、1×103 copies/mL、1×104 copies/mL、1×105 copies/mL、1×106 copies/mL。用自建的引物探針?lè)謩e檢測(cè)不同梯度濃度。

1.3.3 觀察評(píng)估多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定的重復(fù)性? 取1.3.2中所得的不同梯度濃度核酸,1次/d,共進(jìn)行3次重復(fù)平行檢測(cè),依據(jù)所得CT值來(lái)確定變異系數(shù)。

1.3.4 與ELISA方法相比,觀察評(píng)估多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定的使用性能? 選取隨機(jī)樣本,使用兩種不同的檢測(cè)方法來(lái)進(jìn)行平行檢測(cè),比較操作簡(jiǎn)便性及檢測(cè)耗時(shí)。

1.3.5 病毒復(fù)制動(dòng)態(tài)? C6/36混合感染登革Ⅰ型病毒及登革Ⅱ型病毒之后的病毒復(fù)制動(dòng)態(tài)檢測(cè)。

1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

使用SPSS22.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行分析,計(jì)數(shù)資料以%表示,采用χ2檢驗(yàn);計(jì)量資料以(x±s)表示,采用t檢驗(yàn);P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 特異性

6份登革熱陽(yáng)性樣本通過(guò)自建的檢測(cè)方法來(lái)進(jìn)行檢測(cè),全部能夠顯示明顯的S曲線擴(kuò)增,并且與原有確證方法相比,不同型別的結(jié)果一致。其他10份病毒陽(yáng)性樣本及陰性樣本全部沒(méi)有顯示擴(kuò)增曲線,提示自建的檢測(cè)方法特異性良好。

2.2 靈敏性

以DEN-Ⅰ為例,在1×103 copies/mL濃度核酸能夠明顯顯示擴(kuò)增曲線;在1×102 copies/mL濃度核酸沒(méi)有顯示明顯的擴(kuò)增曲線。因此,DEN-Ⅰ的檢測(cè)濃度限制范圍為1×103 copies/mL;DEN-Ⅱ的檢測(cè)濃度限制范圍為1×102 copies/mL;DEN-Ⅲ的檢測(cè)濃度限制范圍為1×102 copies/mL;DEN-Ⅳ的檢測(cè)濃度限制范圍為1×102? copies/mL。

2.3 重復(fù)性

分別檢測(cè)登革熱Ⅰ~Ⅳ型,每個(gè)不同的型別梯度濃度分別為102 copies/mL、103 copies/mL、104 copies/mL、105 copies/mL、106 copies/mL,變異系數(shù)(CV%)值水平范圍:0.51~5.51,提示重復(fù)性較好,見(jiàn)表2。

2.4 與ELISA方法相比,多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定的使用性能

使用自建的多重?zé)晒舛縋CR對(duì)登革熱不同型別進(jìn)行檢測(cè)的平均用時(shí)為(2.7±0.3)h;而使用ELISA法進(jìn)行檢測(cè)的平均用時(shí)為(2.6±0.1)h,檢測(cè)時(shí)間方面無(wú)顯著差異(t=1.561,P>0.05)。通過(guò)自建的多重?zé)晒舛縋CR測(cè)定通過(guò)儀器來(lái)完成核酸的自動(dòng)提取,在儀器當(dāng)中加樣、上機(jī)后不需要另外的操作,充分降低發(fā)生污染的風(fēng)險(xiǎn):使用ELISA法檢測(cè)時(shí)加樣之后,需要每隔一定時(shí)間來(lái)進(jìn)行手動(dòng)操作,增加污染樣本的風(fēng)險(xiǎn),多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)相比ELISA法更加簡(jiǎn)易方便。

2.5 C6/36混合感染登革Ⅰ型病毒及登革Ⅱ型病毒之后的病毒復(fù)制動(dòng)態(tài)檢測(cè)

三次重復(fù)檢測(cè)的最大變異系數(shù)值水平為14.3%(<15%),認(rèn)為重復(fù)性好,結(jié)果完全可行。通過(guò)t配對(duì)檢驗(yàn):登革Ⅰ型病毒和登革Ⅱ型病毒混合感染C6/36細(xì)胞之后,登革Ⅰ型病毒的拷貝數(shù)水平與單獨(dú)感染時(shí)拷貝水平相比并未出現(xiàn)顯著的差異:36 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(4.7±0.2)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(4.6±0.3)copies/μL(t=1.021,P>0.05);48 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(5.1±0.3)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(4.9±0.4)copies/μL(t=1.164,P>0.05);60 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(5.8±0.4)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(5.7±0.4)copies/μL(t=0.492,P>0.05);72 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(5.9±0.6)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(5.8±0.4)copies/μL(t=1.021,P>0.05);84 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(6.1±0.3)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(6.2±0.2)copies/μL(t=0.946,P>0.05);96 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(6.6±0.2)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(6.5±0.3)copies/μL(t=0.361,P>0.05);120 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅰ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(6.5±0.3)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(6.6±0.4)copies/μL(t=0.746,P>0.05)。通過(guò)t配對(duì)檢驗(yàn),在36~60 h時(shí),登革Ⅱ型病毒混合感染C6/36細(xì)胞之后,登革Ⅱ型病毒拷貝數(shù)水平跟單獨(dú)感染C6/36細(xì)胞時(shí)的拷貝數(shù)水平相比并未出現(xiàn)顯著的差異:36 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(3.8±0.3)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(3.7±0.2)copies/μL(t=1.932,P>0.05);48 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(4.4±0.3)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(4.3±0.2)copies/μL(t=1.987,P>0.05);60 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(4.7±0.6)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(4.6±0.5)copies/μL(t=1.036,P>0.05)。72 h時(shí),混合感染時(shí)登革Ⅱ型病毒的拷貝數(shù)水平與單獨(dú)感染的病毒拷貝數(shù)水平相比顯著降低,登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(6.1±0.4)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(5.2±0.3)copies/μL(t=16.962,P<0.05);同樣在84~120 h時(shí),混合感染登革Ⅱ型病毒的拷貝數(shù)水平與單獨(dú)感染的病毒拷貝數(shù)水平相比顯著降低,84 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(6.6±0.2)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(5.3±0.4)copies/μL(t=19.061,P<0.05),96 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(7.0±0.3)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(5.7±0.3)copies/μL(t=18.375,P<0.05);120 h時(shí)間點(diǎn):登革Ⅱ型病毒單獨(dú)感染的拷貝數(shù)為(7.2±0.4)copies/μL、混合感染的拷貝數(shù)為(5.8±0.5)copies/μL(t=17.942,P<0.05),見(jiàn)圖2。

3討論

多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)自從問(wèn)世以來(lái),在臨床中得到了十分迅猛的發(fā)展,在臨床多個(gè)相關(guān)領(lǐng)域,如食物中毒及腫瘤篩查等當(dāng)中被應(yīng)用[7-8]。在溫度、反應(yīng)體系及探針等各個(gè)方面均不同[9-10]。檢測(cè)登革熱的多重PCR溫度及探針條件也不斷得到優(yōu)化。相關(guān)研究指出,在單管反應(yīng)中將2種探針進(jìn)行混合,可以在短時(shí)間內(nèi)快速地診斷大概具體型別[11]。未來(lái)臨床中對(duì)登革熱早期診斷的試劑主要特點(diǎn)為:方便操作、高度專一、更加敏感及時(shí)間更短[12-13]。目前臨床中傳統(tǒng)普遍使用的熒光定量PCR法對(duì)登革熱病毒進(jìn)行檢測(cè)時(shí),靈敏性好且專一[14]。但是傳統(tǒng)的檢查方式需要分兩步來(lái)進(jìn)行檢測(cè)操作[15]。

熒光定量PCR充分地將常規(guī)PCR技術(shù)、光學(xué)技術(shù)及光共振能量傳遞現(xiàn)象進(jìn)行充分地結(jié)合,進(jìn)而更好地實(shí)現(xiàn)對(duì)核酸的精準(zhǔn)定量。其在PCR指數(shù)擴(kuò)增的過(guò)程中通過(guò)連續(xù)性地檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度,完成對(duì)特異性產(chǎn)物量的實(shí)時(shí)測(cè)定,并以此來(lái)推斷目的基因的基礎(chǔ)初始量。TaqMan探針屬于寡核苷酸單鏈之一,熒光基團(tuán)(FAM)連接主要在探針5′的末端,但淬滅基團(tuán)(TAMRA)主要在3′的末端,5′端熒光基團(tuán)所發(fā)射的熒光因與3′端淬滅劑相互接近時(shí)被淬滅。當(dāng)靶序列與探針相互配對(duì)之后,會(huì)通過(guò)聚合酶的作用來(lái)進(jìn)行延伸反應(yīng),聚合酶5′→3′外切酶的活性會(huì)切斷探針,游離出熒光基團(tuán),使得淬滅基團(tuán)不再發(fā)揮其原有的淬滅效果,進(jìn)而發(fā)射出熒光信號(hào),一分子產(chǎn)物的生成同時(shí)會(huì)伴隨出現(xiàn)一分子熒光信號(hào)。隨著不斷增加的擴(kuò)增循環(huán)數(shù),釋放出的熒光基團(tuán)也繼續(xù)積累。因此,TaqMan探針?biāo)鶛z測(cè)到的是最終積累后的熒光量。其優(yōu)點(diǎn)主要是與探針雜交、PCR反應(yīng)的靈敏性進(jìn)行充分地結(jié)合;產(chǎn)生熒光的過(guò)程屬于不可逆的反應(yīng),生成信號(hào)之后并不會(huì)自動(dòng)淬滅;其主要是對(duì)反應(yīng)起始濃度水平進(jìn)行測(cè)定,并不是對(duì)最終產(chǎn)物濃度進(jìn)行測(cè)定,因此,其結(jié)果更加準(zhǔn)確,擁有更好的重復(fù)性。目前,這一方法的主要作用就是臨床中對(duì)病毒載量的測(cè)定,即病毒數(shù)量,反映病毒繁殖能力、水平,是臨床確認(rèn)感染情況、臨床診斷、指導(dǎo)治療、療效反應(yīng)和預(yù)后評(píng)估的一個(gè)重要參考指標(biāo),在病毒感染的臨床定量監(jiān)測(cè)過(guò)程中具有十分重要的作用。

本次研究通過(guò)一步法來(lái)檢測(cè)登革熱病毒的不同4個(gè)血清型別,檢測(cè)限高為102 copies/mL。本研究與衛(wèi)生部所推薦的登革熱的診斷標(biāo)準(zhǔn):RT-PCR引物系統(tǒng)相結(jié)合,對(duì)PCR反應(yīng)體系進(jìn)行更進(jìn)一步的優(yōu)化,通過(guò)4套針來(lái)分別針對(duì)登革熱病毒的不同4個(gè)型別的探針及引物,從而建立多重單管熒光定量PCR檢測(cè)方法。這一檢測(cè)方法有效地實(shí)現(xiàn)通過(guò)1個(gè)反應(yīng)管,進(jìn)行1次平行檢測(cè)能夠?qū)⒌歉餆岵《镜?個(gè)不同型別進(jìn)行檢測(cè)[16-17]。再與陽(yáng)性對(duì)照品相比,實(shí)現(xiàn)病毒的精確定量[18]。與此同時(shí),還可以監(jiān)測(cè)這一檢測(cè)方法的穩(wěn)定性[19-20]。

綜上所述,本次研究設(shè)計(jì)建立的登革熱Ⅰ~Ⅳ型多重?zé)晒舛縋CR檢測(cè)方法,在重復(fù)性、靈敏性及特異性方面均較為理想;且相比ELISA法在加樣后無(wú)需另外手動(dòng)操作,更加簡(jiǎn)易方便。

[參考文獻(xiàn)]

[1] 孫愛(ài)娟,林立豐,蘭策介,等.登革1型和2型病毒混合感染樣本的一步法實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J].寄生蟲(chóng)與醫(yī)學(xué)昆蟲(chóng)學(xué)報(bào),2018,9(1):23-27.

[2] 高鑫,朱武洋,盧學(xué)新.實(shí)時(shí)熒光定量PCR在病毒檢測(cè)中的應(yīng)用[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2018,34(7):84-91.

[3] Jerusalinsky L,Oliveira MM,Pereira RF,et al. Preliminary evaluation of the conservation status of callicebus coimbrai Kobayashi & Langguth,1999 in the Brazilian state of sergipe[J]. Primate Conservation,2017,35(15):25-32.

[4] 李要星,楊爽,李娜,等.國(guó)產(chǎn)酶聯(lián)免疫試劑檢測(cè)登革熱效能評(píng)價(jià)[J].中國(guó)病原生物學(xué)雜志,2017,4(5):434-436.

[5] Cucuzza LS,Biolatti B,Divari S,et al. Development and application of a screening method of absolute quantitative PCR to detect the abuse of sex steroid hormone admi-nistration in male bovines[J]. Journal of Agricultural & Food Chemistry,2017,65(23):4866-4874.

[6] 胡挺松,張海林,劉永華,等.云南省登革4型病毒全基因組序列特征研究[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2017,33(10):859-867.

[7] Min KK,Lee S,Kim BJ,et al. A preliminary analysis of the diet composition of overwintering Bean geese (Anser fabalis) and greater white-fronted geese(A. albifrons) in Korea using PCR on fecal samples[J]. Animal Cells and Systems,2017,21(2):141-145.

[8] 劉遠(yuǎn),蔣力云,景欽隆,等.2001-2016年廣州市登革3型病毒E基因序列及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2018,34(5):487-491.

[9] Naveca FG,Nascimento VAD,Souza VCD,et al. Multiplexed reverse transcription real-time polymerase chain reaction for simultaneous detection of Mayaro,Oropouche,and Oropouche-like viruses[J]. Memorias Do Instituto Oswaldo Cruz,2017,112(7):510-513.

[10] 高博,鄭暉,李樞,等.登革熱病毒(DENV)包膜蛋白特異性人源抗體篩選與鑒定[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2018, 34(10):62-68.

[11] Undurraga EA,Edillo FE,Erasmo JNV,et al. Disease burden of dengue in the Philippines:Adjusting for underreporting by comparing active and passive dengue surveillance in Punta Princesa,Cebu city[J]. American Journal of Tropical Medicine & Hygiene,2017,96(4):887-898.

[12] 杜燕華,李懿,王若琳,等.2017年河南省登革熱疑似病例的實(shí)驗(yàn)室診斷與分子溯源[J].中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志,2018,52(11):1164-1167.

[13] Bischof GF,Magnani DM,Ricciardi M,et al. Use of a recombinant gamma-2 herpesvirus vaccine vector against dengue virus in rhesus monkeys[J]. Journal of Virology,2017,91(16):JVI.00525-17.

[14] 徐勝平,劉琪琦,張嚴(yán)峻,等.9種發(fā)熱伴出疹病原體基因芯片檢測(cè)方法的建立[J].軍事醫(yī)學(xué),2017,41(2):135-140.

[15] Cherupanakkal C,Ramachadrappa V,Kadhiravan T,et al. A study on gene expression profile of endogenous antioxidant enzymes:CAT,MnSOD and GPx in dengue patients[J]. Indian Journal of Clinical Biochemistry,2017, 32(4):1-9.

[16] 張培,李春緣,陳迪嘉,等.Ⅰ型登革病毒感染后不同病程病毒核酸及其IgM抗體的變化規(guī)律[J].第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào),2017,39(4):328-332.

[17] 師永霞,黃鸝,廖蕓,等.2009-2015年廣州口岸輸入性登革熱的流行病學(xué)分析[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué),2017,44(6):965-967.

[18] Tan KK,Azizan NS,Yaacob CN,et al. Operational utility of the reverse-transcription recombinase polymerase amplification for detection of dengue virus[J]. Bmc Infectious Diseases, 2018,18(1):169.

[19] 呂榜軍,梁忠福.2016年柳州市蚊類種群分布和蚊蟲(chóng)病毒攜帶情況調(diào)查分析[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué),2017,44(17):47-51.

[20] 胡挺松,張海林,劉永華,等.云南中緬邊境登革1型病毒全基因組序列特征研究[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2017, 33(6):473-480.

(收稿日期:2019-08-06)

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