谷海燕,律苗,丁玲,馬萌,張楠,李拓,李娜
疫苗用原輔料中豬源性病毒PCR檢測(cè)方法的建立
谷海燕,律苗,丁玲,馬萌,張楠,李拓,李娜
100176 北京生物制品研究所有限責(zé)任公司質(zhì)量檢定室(谷海燕、律苗、丁玲、馬萌、李拓、李娜),疫苗 5 室(張楠)
豬源性病毒是一類廣泛寄生于豬體內(nèi)的病毒,其不只感染豬,對(duì)人和多種哺乳動(dòng)物也能造成感染,并可能致病[1-2]。2015 版《中國(guó)藥典》要求[3],制備疫苗用的動(dòng)物細(xì)胞需要檢測(cè)豬源性病毒為陰性。目前生物制品中越來越多涉及到豬來源的原料或輔料,如疫苗生產(chǎn)中使用的胰蛋白酶和水解乳蛋白及明膠等。雖然目前法規(guī)并未將豬源性病毒納入原輔料質(zhì)控,但是一些豬來源原輔料有攜帶豬源性病毒的風(fēng)險(xiǎn),其中包括豬圓環(huán)病毒 1(porcine circovirus 1,PCV1)、豬圓環(huán)病毒 2(porcine circovirus 2,PCV2)及豬細(xì)小病毒(porcine parvovirus,PPV)。確保生產(chǎn)用原輔料不攜帶豬源性病毒是生產(chǎn)出合格疫苗產(chǎn)品的保證,因此質(zhì)控原輔料中豬源性病毒至關(guān)重要。
1.1.1 病毒、細(xì)菌、質(zhì)粒、胰蛋白酶及水解乳蛋白 大腸桿菌(批號(hào):2017053104-3)、金黃色葡萄球菌(批號(hào):2017053104-3)、麻疹病毒標(biāo)準(zhǔn)品(批號(hào):20150902213)、風(fēng)疹病毒標(biāo)準(zhǔn)品(批號(hào):2015S0401)及所有標(biāo)準(zhǔn)菌毒株均購自中國(guó)食品藥品檢定研究院;水解乳蛋白(批號(hào):1833902)和胰蛋白酶(批號(hào):C01171008)均購自美國(guó) Gibco 公司。PCV1、PCV2、PPV 陽性質(zhì)粒由生工生物工程(上海)股份有限公司合成構(gòu)建。
1.1.2 主要試劑及儀器 胰蛋白酶和酵母提取物購自美國(guó) Oxid 公司;Taq DNA 聚合酶購自日本 Takara 公司;DNA marker、Gel-red、病毒 DNA/RNA 提取試劑盒、質(zhì)粒小提試劑盒均購自天根生化科技有限公司;瓊脂糖和氯化鈉購自國(guó)藥化學(xué)試劑有限公司;PCR 儀、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)為美國(guó) Bio-Rad 公司設(shè)備。
1.2.1 基因組合成 根據(jù) GenBank 中的登錄號(hào),PCV1(GenBank:AY193712.1)合成其 929 ~ 1655 bp 位點(diǎn)核酸序列,PCV2(GenBank:AY181946.1)合成其 1151 ~1584 bp 位點(diǎn)核酸序列,PPV(NC:001718)合成其 3001 ~ 3531 bp 位點(diǎn)核酸序列,合成的序列構(gòu)入 pUC57 載體,并轉(zhuǎn)化 top10 感受態(tài)細(xì)胞,由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
1.2.2 陽性模板 分別取 10 μl 3 種菌液,涂布于 Amp 抗性的 LB 平板,37 ℃過夜培養(yǎng),挑取單克隆菌落,接種于 LB 液體培養(yǎng)基,220 r/min、37 ℃培養(yǎng) 16 h 后收集菌體,利用質(zhì)粒小提試劑盒對(duì)菌體中質(zhì)粒進(jìn)行提取,檢測(cè)濃度和純度后作為實(shí)驗(yàn)用陽性對(duì)照模板。
1.2.3 引物設(shè)計(jì)及合成 利用文獻(xiàn)[4]報(bào)道的豬源性病毒檢測(cè)引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,合成后的引物稀釋成 10 μmol/L 備用,設(shè)計(jì)引物如表 1所示。
表 1 引物信息
1.2.4 PCR 反應(yīng)條件優(yōu)化 PCR 反應(yīng)體系為:陽性模板 2.5 μl,上游引物(10 μmol/L)1.25 μl,下游引物(10 μmol/L)1.25 μl,Ex Taq 0.25 μl,dNTPs(2.5 mmol/L)2 μl,10 × Buffer 2.5 μl,滅菌水補(bǔ)至 25 μl。將體系放入 PCR 儀,反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性 4 min,95 ℃變性 30 s,(50 ~ 64 ℃)退火 30 s,72 ℃延伸 1 min,72 ℃延伸最后一次 10 min,4 ℃保溫。在 PCR 退火溫度設(shè)置中,設(shè)置了 50 ~ 64 ℃8 個(gè)退火溫度,PCR 完成后取 5 μl 樣品進(jìn)行凝膠電泳分析,確定其最佳退火條件。
1.2.5 方法驗(yàn)證[5-8]
1.2.5.1 中間精密度 由兩名實(shí)驗(yàn)人員分別進(jìn)行,時(shí)間間隔 24 h,連續(xù) 5 d 檢測(cè)同一陽性樣品 5 次,評(píng)價(jià)此方法檢測(cè)原輔料中豬源性病毒的中間精密度。
1.2.5.2 專屬性驗(yàn)證 分別取陽性樣品、大腸桿菌標(biāo)準(zhǔn)品、金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)品、麻疹病毒標(biāo)準(zhǔn)品、風(fēng)疹病毒標(biāo)準(zhǔn)品及無菌水,編號(hào)為 1 ~ 6,對(duì) 6 個(gè)樣品分別利用 3 對(duì)引物進(jìn)行 PCR 檢測(cè),驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)室常見的微生物,驗(yàn)證此方法對(duì) PCV、PPV 檢測(cè)的專屬性。
1.2.5.3 檢測(cè)限驗(yàn)證 將提取的質(zhì)粒濃度調(diào)整為 1 ng/μl,再用無菌水將質(zhì)粒進(jìn)行 10 倍梯度稀釋,對(duì)稀釋后的質(zhì)粒進(jìn)行 PCR 檢測(cè),驗(yàn)證此方法對(duì)豬源性病毒的最低檢測(cè)限度。
1.2.5.4 重復(fù)性驗(yàn)證 同時(shí)取陽性樣品 6 份,在相同的測(cè)量環(huán)境下,對(duì) 6 份樣品進(jìn)行 PCR檢測(cè)。驗(yàn)證此方法對(duì)原輔料中豬源性病毒檢測(cè)的重復(fù)性。
1.2.5.5 耐用性驗(yàn)證 取 2 份陽性樣品,在相同的環(huán)境下配制反應(yīng)體系,然后將反應(yīng)體系分別在室溫放置 15、30 min后進(jìn)行 PCR 檢測(cè)。驗(yàn)證在日常工作中室溫對(duì)體系耐用性造成的影響。
1.2.6 樣品檢測(cè) 取一批供試品胰蛋白酶及兩批水解乳蛋白,溶解后利用病毒基因組提取試劑盒,按照說明書提取病毒基因組 DNA,再進(jìn)行 PCR、電泳后凝膠成像,進(jìn)行 PCV1、PCV2 及 PPV 檢測(cè)。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在引物濃度為 10 μmol/L 時(shí)候,PCR 擴(kuò)增效果很好。在 PCV1 和 PPV 實(shí)驗(yàn)組中設(shè)置了 50 ~57 ℃的退火溫度范圍,實(shí)驗(yàn)表明,在 54 ℃退火 30 s 時(shí),PCR 擴(kuò)增效果最佳,擴(kuò)增條帶明亮清晰,條帶特異。在 PCV2 實(shí)驗(yàn)組中首先設(shè)置了 50 ~ 57 ℃退火溫度范圍,結(jié)果無特異條帶產(chǎn)生,將退火溫度提高至 64 ℃時(shí),產(chǎn)生特異條帶,PCR 擴(kuò)增結(jié)果見圖 1。
經(jīng)過 2 名實(shí)驗(yàn)員每次間隔 24 h,連續(xù) 5 d 對(duì) 3 種陽性對(duì)照連續(xù)進(jìn)行 PCR 檢測(cè),均在目標(biāo)區(qū)域產(chǎn)生特異性條帶,中間精密度驗(yàn)證結(jié)果良好,結(jié)果如表 2 所示。
為了驗(yàn)證該方法是否容易被實(shí)驗(yàn)室常見的微生物污染,選用大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、風(fēng)疹病毒、麻疹病毒作為 PCR 模板,利用優(yōu)化的反應(yīng)條件,進(jìn)行 PCR 檢測(cè)。結(jié)果表明,選擇的引物對(duì)實(shí)驗(yàn)室常見的核酸模板不具有特異性,其專屬性良好(圖 2)。
對(duì)稀釋后的陽性樣品進(jìn)行 PCR 檢測(cè),驗(yàn)證此方法對(duì)豬源性病毒的最低檢測(cè)限度。結(jié)果如圖 3 所示,在陽性質(zhì)粒稀釋度為 100 fg/μl 時(shí)仍可檢測(cè)出。
為了驗(yàn)證 PCR 檢測(cè)原輔料中豬源性病毒的重復(fù)性,在同一條件下,取同一陽性樣品分為 6 份,對(duì) 6 份樣品在相同的條件下進(jìn)行 PCR 檢測(cè)。結(jié)果表明,6 次檢測(cè)均能在特異大小區(qū)域得到特異的條帶,該方法重復(fù)性較好,試驗(yàn)結(jié)果如表 3 所示。
為了驗(yàn)證 PCR 體系的耐用性,將配置好的 PCR 反應(yīng)體系分別在室溫放置 15 和 30 min,然后進(jìn)行 PCR 檢測(cè)。結(jié)果表明,在放置 30 min 后,該反應(yīng)體系依然能很好檢測(cè)出特異的目標(biāo)條帶,結(jié)果如圖 4 所示。
bp M 1 2 3 4 4500300020001200800500 200
表 2 方法驗(yàn)證的中間精密度結(jié)果
bp M 1 2 3 4 5 6 7 8 4500300020001200800500200
取一批供試品胰酶及兩批水解乳蛋白,樣品溶解后使用試劑盒提取病毒基因組 DNA,再運(yùn)用 PCR 對(duì)其進(jìn)行 PCV1、PCV2 及 PPV 檢測(cè),電泳后凝膠成像結(jié)果如圖 5 所示,兩批樣品中 PCV1、PCV2 及 PPV 都呈陰性。
bp M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 4500300020001200800500 200
表 3 重復(fù)性驗(yàn)證結(jié)果
bp M 1 2 3 4 5 6 7 4500300020001200800500200
bp M 1 2 3 4 5 M 6 7 8 9 10 M 11 12 13 14 15 20001000750500200100
M:DNA marker;1:PCV1 陽性;2:水解乳蛋白 1 PCV1 檢測(cè);3:水解乳蛋白 2 PCV1 檢測(cè);4:胰酶 PCV1 檢測(cè);5:PCV1 陰性對(duì)照;6:PCV2 陽性;7:水解乳蛋白 1 PCV2 檢測(cè);8:水解乳蛋白 2 PCV2 檢測(cè);9:胰酶 PCV2 檢測(cè);10:PCV2 陰性對(duì)照;11:PPV 陽性;12:水解乳蛋白 1 PPV 檢測(cè);13:水解乳蛋白 2 PPV 檢測(cè);14:胰酶 PPV 檢測(cè);15:PPV 陰性對(duì)照
圖 5 PCR 檢測(cè) 3 批樣品 PCV1、PCV2、PPV 結(jié)果
隨著生物技術(shù)的不斷發(fā)展以及對(duì)生物制品認(rèn)識(shí)越來越全面,人們對(duì)生物制品質(zhì)量控制的要求越來越高,要求我們對(duì)生物制品中的有效成分及雜質(zhì)含量能夠充分了解,并評(píng)估雜質(zhì)存在可能造成的影響。2010 年科學(xué)家 Victoria 等[9]利用基因組學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)某疫苗中含有 PCV1 病毒基因組序列,隨后其他生物制品中發(fā)現(xiàn)豬源性病毒污染。人用生物制品中外源病毒成為了各國(guó)藥監(jiān)部門關(guān)注的焦點(diǎn),也使得生物制品在外源因子質(zhì)量控制方面向前邁進(jìn)一步。本文利用合成病毒基因作為陽性對(duì)照模板[4],驗(yàn)證 PCR 法檢測(cè)疫苗用原輔料中豬源性病毒,分別從中間精密度、專屬性、檢測(cè)限、重復(fù)性和耐用性 5 個(gè)方面來驗(yàn)證該方法檢測(cè) PCV1、PCV2 及 PPV的可行性。結(jié)果達(dá)到預(yù)期,PCR 法可用于疫苗用原輔料中豬源性病毒檢測(cè)。
豬源性病毒實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法眾多,傳統(tǒng)檢測(cè)有酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)、巢式 PCR 法、實(shí)時(shí)定量 PCR 法、環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增法、基因芯片等一系列方法[10]。其中熒光定量 PCR 檢測(cè)豬源性病毒靈敏度更高,但是熒光定量 PCR 法存在一些缺點(diǎn),如成本高、技術(shù)要求高、極易出現(xiàn)假陽性等。對(duì)疫苗生產(chǎn)企業(yè)來說需要選擇一種靈敏度適合、特異性好、費(fèi)用更低、操作更簡(jiǎn)便、檢驗(yàn)結(jié)果更穩(wěn)定的方法。本研究驗(yàn)證的 PCR 法檢測(cè)疫苗用原輔料中豬源性病毒具有高效、省時(shí)的優(yōu)點(diǎn),靈敏度和特異性也能達(dá)到我們的需求,可用于疫苗用原輔料中豬源性病毒快速檢測(cè)。
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李娜,Email:115735267@qq.com
2019-03-20
10.3969/j.issn.1673-713X.2019.04.016