蔣迎娣,殷 瑩,浦浙寧,張 博,龔玲麗,胡亞玲,紀(jì) 麗,汪京京,張真豪,鄒 健
膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(Glioblastoma,GBM)是人腦最常見的腫瘤。其主要特點(diǎn)是高增殖性和侵襲性,腫瘤無明確邊界,極易復(fù)發(fā),平均中位生存時(shí)間僅15 個(gè)月[1-3]。目前,GBM 主要治療手段是手術(shù)切除聯(lián)合放化療。而替莫唑胺作為一線化療藥有效率僅為45%左右,雖能在短期內(nèi)提高患者生存時(shí)間,但由于腫瘤異質(zhì)性的存在最終產(chǎn)生耐藥而導(dǎo)致腫瘤復(fù)發(fā)[4-6]。GBM 是一種典型的具有高度異質(zhì)性的腫瘤,腫瘤組織中細(xì)胞、基因的時(shí)空異質(zhì)性是產(chǎn)生耐藥和復(fù)發(fā)的分子基礎(chǔ)[7-9]。人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞細(xì)胞系U87是被廣泛使用的一種GBM 工具細(xì)胞系,在體外培養(yǎng)條件下存在多種形態(tài),如典型的細(xì)長形細(xì)胞和短梭形細(xì)胞,因此U87也被作為GBM異質(zhì)性研究的模型[10],但從基因水平探討其異質(zhì)性來源的研究較少。本研究旨在構(gòu)建人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系U87 單克隆細(xì)胞株,經(jīng)鑒定后檢測不同單克隆細(xì)胞株的表型和遺傳背景差異,并探討產(chǎn)生表型差異的分子機(jī)制。
1.1 材料人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系U87 購自中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會細(xì)胞庫,并由本實(shí)驗(yàn)室擴(kuò)增和保存。DMEM 培養(yǎng)基、D/F12 培養(yǎng)液、青霉素-鏈霉素雙抗混合液和0.25%胰蛋白酶溶液購自美國HyClone 公司;胎牛血清購自以色列Biological Industries 公司;細(xì)胞培養(yǎng)板、培養(yǎng)皿以及鼠尾膠原I購自美國Corning公司;細(xì)胞爬片購自上海臥宏生物科技有限公司;3D細(xì)胞侵襲裝置購買于美國AIMBiotech Pte Ltd 公司;B-27、GlutaMAX 添加劑、重組人表皮生長因子、10×PBS、鼠單克隆抗體Beta-tubulin、驢抗鼠熒光二抗Alexa Flour 488 和Hoechest 33342購自美國ThermoFisherScientific 公司;牛血清白蛋白、Fluoromount 封片劑、曲拉通(TritonX-100)、酚紅鈉鹽和TRIzol試劑購自美國Sigma公司;CCK-8檢測試劑盒購自美國Bimake 公司;kFluor555-EdU 法細(xì)胞增殖檢測試劑盒購自南京凱基生物科技發(fā)展有限公司;Annexin V-Alexa Fluor 647/PI 細(xì)胞凋亡流式檢測試劑盒購自上海翊圣生物科技有限公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒HiFiScript cDNA Synthesis Kit 購自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司;鬼筆環(huán)肽購自美國Cell Signaling Technology 公司;阿霉素購自美國Selleck公司;驢血清購自美國Jackson ImmunoResearch 公司;CFSE 購自英國Abcam 公司;4%多聚甲醛溶液(4%PFA)和結(jié)晶紫染色液購自生工生物工程(上海)股份有限公司;PCR 引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
1.2 方法
1.2.1 單克隆細(xì)胞株的篩選U87 細(xì)胞培養(yǎng)于含10%胎牛血清和1%雙抗的DMEM 完全培養(yǎng)基中,于37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)。取對數(shù)生長期U87 細(xì)胞,經(jīng)CFSE 染色后計(jì)數(shù)并進(jìn)行梯度稀釋制成細(xì)胞密度為100 個(gè)/mL 的細(xì)胞懸液,以每孔100 μL 接種于96 孔板中,合計(jì)4 個(gè)96 孔板,待細(xì)胞貼壁后在熒光顯微鏡下觀察,選出僅有單個(gè)細(xì)胞的培養(yǎng)孔,作擴(kuò)大培養(yǎng)并凍存保種,并根據(jù)單克隆化的細(xì)胞形態(tài)特征,最終選取2 株典型特征的細(xì)胞(分別命名為CF5和G11)作為后續(xù)研究的對象細(xì)胞。
1.2.2 免疫熒光染色實(shí)驗(yàn)檢測細(xì)胞形態(tài)實(shí)驗(yàn)前將經(jīng)包被處理過的細(xì)胞爬片放入24孔板中,取對數(shù)生長期的U87、CF5 和G11 細(xì)胞,消化后計(jì)數(shù)。以2×104/孔種于爬片,37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h 后4%PFA 固定15 min,用 含0.3% Triton-X 100 的PBS 通 透15 min,驢血清室溫封閉1 h 后將鼠抗Beta-tubulin 加入爬片,4 ℃孵育過夜,經(jīng)PBS 洗滌后加入驢抗鼠Alexa Flour 488 二抗室溫孵育1 h,PBS 洗滌3 次后用含Hoechst 33342 的Fluoromount 封片劑封片,熒光顯微鏡下觀察細(xì)胞形態(tài)并拍照。
1.2.3 CCK-8 法和EdU 摻入成像法檢測細(xì)胞增殖能力取對數(shù)生長期的U87、CF5 和G11 細(xì)胞,消化后計(jì)數(shù),以1000/孔接種于96孔板,每組設(shè)6個(gè)復(fù)孔,分5 個(gè)時(shí)間點(diǎn)(第0、24、48、72、96 小時(shí))檢測。每100 μL DMEM 完全培養(yǎng)基中加入10 μL CCK-8 試劑,37 ℃培養(yǎng)箱內(nèi)孵育2 h,用多功能酶標(biāo)儀檢測各孔在450nm 波長下吸光度值(A),以第0 天即接種4 h后的A值為1,繪制細(xì)胞生長曲線。
取對數(shù)生長期的U87、CF5 和G11 細(xì)胞,消化后計(jì)數(shù),以2×104/孔接種于細(xì)胞爬片,每組設(shè)3 個(gè)復(fù)孔。以完全培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h 后換為含有10μmol/LEdU 完全培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)3 h,PBS 洗 滌 后4%PFA 室 溫 固 定15 min,用 含3%BSA-PBS 洗 滌3 次,0.3%Triton-X 100-PBS 室 溫破膜20 min 后洗滌3 次。根據(jù)試劑盒說明書配置Click-iT 染色液,室溫避光孵育30 min,3% BSAPBS 洗滌3 次后用含Hoechst33342 的Fluoromount封片劑封片后,熒光顯微鏡下拍照,并用Image J軟件統(tǒng)計(jì)陽性細(xì)胞比例。
1.2.4 平板克隆形成實(shí)驗(yàn)檢測細(xì)胞克隆形成能力取對數(shù)生長期的U87、CF5 和G11 細(xì)胞,消化后計(jì)數(shù),以1000/孔接種于6 孔板,每組設(shè)3 個(gè)復(fù)孔,37 ℃培養(yǎng)箱連續(xù)培養(yǎng)14 d,4%PFA 室溫固定15 min,PBS 洗滌3 次,10%結(jié)晶紫染色15 min,洗滌后空氣干燥,倒置顯微鏡下計(jì)數(shù)每組細(xì)胞的克隆形成數(shù)(>50 個(gè)細(xì)胞為1 個(gè)克?。?。
1.2.5 干細(xì)胞樣細(xì)胞成球?qū)嶒?yàn)檢測細(xì)胞成球能力取對數(shù)生長期的U87、CF5和G11細(xì)胞,消化后計(jì)數(shù),用神經(jīng)干細(xì)胞培養(yǎng)液(由D/F12 培養(yǎng)液中加入20 ng/mL EGF、20 ng/mLbFGF、B27 和2 mmol/L GlutaMAX配制而成)培養(yǎng)細(xì)胞。細(xì)胞以5000/孔接種于低吸附6孔板,每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔,37 ℃培養(yǎng)箱連續(xù)培養(yǎng)15 d,用EVOSTM FL Auto 細(xì)胞成像系統(tǒng)拍照,Image J軟件統(tǒng)計(jì)的細(xì)胞球個(gè)數(shù)及直徑(>50μm為1個(gè)克隆球)。
1.2.6 免疫熒光法和CCK8 法黏附實(shí)驗(yàn)檢測細(xì)胞黏附能力取對數(shù)生長期的U87、CF5 和G11 細(xì)胞,消化后計(jì)數(shù),以2×104/孔接種于細(xì)胞爬片,每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔。37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)1 h,取出爬片用PBS洗去未黏附的細(xì)胞,4% PFA 固定15 min,0.3%TritonX-100-PBS 通透20 min 后,用DyLight?554 Phalloidin室溫孵育20 min,經(jīng)PBS 洗滌后用含Hoechst33342的Fluoromount 封片劑封片,每張爬片隨機(jī)選取10個(gè)視野熒光顯微鏡拍照,并用Image J軟件統(tǒng)計(jì)每個(gè)細(xì)胞黏附面積。
將對數(shù)期生長的U87、CF5 和G11 細(xì)胞以2×104/孔接種于96 孔板,每組設(shè)6 個(gè)復(fù)孔,實(shí)驗(yàn)參照文獻(xiàn)[11],37 ℃培養(yǎng)1 h 后用PBS 清洗未黏附的細(xì)胞,并加入CCK-8 試劑檢測吸光度A 值,以黏附細(xì)胞吸光度A 值與總細(xì)胞A 值的比值計(jì)算黏附率,并將U87細(xì)胞黏附率設(shè)為1。
1.2.7 3D 侵襲實(shí)驗(yàn)檢測細(xì)胞侵襲能力參照文獻(xiàn)[12-13]配制2.0 mg/mL 鼠尾膠Collagen I(由10×PBS、NaOH、鼠尾膠以及雙蒸水配制而成)。將膠從3D侵襲裝置中間孔加入,37 ℃培養(yǎng)箱放置30 min使其凝固。以DMEM 水化3D 裝置中Collagen I 左右兩側(cè)通道,左側(cè)通道上下2 個(gè)孔各加70μL DMEM,并在左側(cè)通道入口處加入20 μL 上述細(xì)胞懸液,右側(cè)通道2 個(gè)孔也各加入70 μL DMEM 培養(yǎng)基,將裝置放入37 ℃培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)2 h 后,將右側(cè)無細(xì)胞通道側(cè)的DMEM培養(yǎng)基更換為含20%FBS的DMEM培養(yǎng)基,形成血清濃度差,放回培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)72 h。用PBS 洗滌3 次后固定通透,DyLight?594 Phalloidin室溫孵育1 h 后PBS 洗滌3 次,加入PBS 稀釋的Hoechst 33342 后熒光顯微鏡拍照,Image J 軟件統(tǒng)計(jì)各組穿過CollagenI的細(xì)胞數(shù)。
1.2.8 Annexin V-AlexaFluor647/PI雙染法流式檢測細(xì)胞凋亡取對數(shù)生長期的U87、CF5 和G11 細(xì)胞,以1×105/孔接種于6 孔板,每組設(shè)3 個(gè)復(fù)孔,24 h后更換培養(yǎng)基為無血清DMEM同時(shí)加入阿霉素誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,繼續(xù)培24h。按細(xì)胞凋亡檢測試劑盒說明書進(jìn)行操作,流式細(xì)胞儀上機(jī)檢測細(xì)胞凋亡率。
1.2.9 細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序和數(shù)據(jù)分析按RNA 提取試劑盒(QIAGEN 公司)方法提取細(xì)胞RNA,選擇純度較好(紫外260OD/280OD 為1.8-2.1)的樣本進(jìn)行RNA 變性膠電泳質(zhì)檢,樣本-80 ℃保存?zhèn)溆?。建庫后,使用HiSeq 3000(Illumina 公司)測序儀進(jìn)行上機(jī)檢測,CASAVA v1.8.2 軟件將原始測序數(shù)據(jù)(Bcl 文件)轉(zhuǎn)換成fastq 格式以備用,使用FastQC v0.11.2 軟件對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行序列比對前的初始質(zhì)量檢查,并以人類基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(GRCh37)為參考庫,綜合使用TopHat2、bowtie 軟件包對序列進(jìn)行比對拼接產(chǎn)生數(shù)據(jù)(bam 文件),用bedtools v2.22.1和python腳本程序等將bam 文件進(jìn)行格式轉(zhuǎn)化、并以mRNA表達(dá)值差異2倍以上的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行差異基因篩選和數(shù)據(jù)分析。數(shù)據(jù)分析包括:基因表達(dá)定量、表達(dá)分布、差異表達(dá)分析、KEGG和GO功能通路富集分析等。
1.2.10 RT-PCR 檢測細(xì)胞中ITGA6、ITGA11 的表達(dá)水平TRIzol法提取U87、CF5和G11細(xì)胞的總RNA并檢測其純度及濃度。取2μg總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA;取2μL cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,每個(gè)樣品設(shè)3 個(gè)復(fù)孔,反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min、95 ℃變性30 s、60 ℃退火10 s、72 ℃延伸15 s,共40次循環(huán)。引物序列分別為:ITGA6 上游:5′-CGAAACCAAGGTTCTGAGCCCA-3′,下游:5′-CTTGGATCTCCACTGAGGCAGT-3′;ITGA11 上游:5′-GCCTCCAGTATTTTGGCTGCAG-3′,下游:5′-GCTCAAAGTGGAGGCTGGCATT-3′;內(nèi)參引物GAPDH上游:5′-GTCTCCTCTGACTTCAACAGCG-3′;下游:5′-ACCACCCTGTTGCTGTAGCCAA-3′。采用2-△△Ct法計(jì)算ITGA6和ITGA11mRNA的相對表達(dá)水平。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用SPSS 20.0 和Graphpadprism 6.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,定量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(xˉ±s)表示。多個(gè)樣本組間均數(shù)比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較采用LSD 法。以P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 U87 單克隆細(xì)胞株的篩選構(gòu)建可見混合型U87形態(tài)多樣,大小不一,而經(jīng)單克隆化后細(xì)胞株形態(tài)較為均一,其中CF5小而短粗,G11大而細(xì)長。見圖1。STR 分型鑒定顯示,3 株細(xì)胞與美國模式培養(yǎng)物研究所中參考細(xì)胞系匹配率均為86.67%,因此可認(rèn)為本研究使用的U87 以及2 株單克隆細(xì)胞CF5 和G11均來源于人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系U87。
2.2 U87、CF5 和G11 細(xì)胞株的增殖能力、平板克隆和干細(xì)胞成球能力比較CCK-8增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,U87、CF5 和G11 細(xì)胞在不同時(shí)間點(diǎn)增殖能力差異明顯(P<0.05)。CF5細(xì)胞增殖能力較U87、G11明顯增強(qiáng),U87較G11明顯增強(qiáng)(P<0.001),見表1。
EdU 摻入成像法增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,CF5 細(xì)胞EdU 陽性細(xì)胞比例(0.54±0.05)較U87、G11(0.44±0.03)、(0.35±0.03)明顯增強(qiáng),U87 較G11 明顯增強(qiáng)(P<0.01),見圖2。
圖1 明場和熒光視野下的3株細(xì)胞形態(tài)(×200)Figure 1 Morphology of the three cell lines under the phase-contrast and fluorescence microscope(×200)
表1 CCK-8檢測不同時(shí)間各組細(xì)胞相對增殖率比較(xˉ±s)Table 1 Relative proliferation of the three cell lines at different time points(xˉ±s)
平板克隆形成實(shí)驗(yàn)顯示,CF5 細(xì)胞克隆形成能力[(88.33±3.06)個(gè)]較U87、G11[(53.67±3.06)、(42.00±3.00)個(gè)]明顯增強(qiáng),U87較G11明顯增強(qiáng)(P<0.01),見圖2。
腫瘤干細(xì)胞成球?qū)嶒?yàn)顯示,CF5 細(xì)胞干細(xì)胞球的直徑[(281.8±83.83)μm]較U87、G11[(241.6±66.48)μm、(176.9±47.09)μm]明顯增強(qiáng),U87 較G11明顯增強(qiáng)(P<0.01),見圖2。
圖2 3株細(xì)胞的增殖能力、克隆形成和干細(xì)胞成球能力Figure 2 Proliferation,colony formation and tumor sphere formation of the glioblatoma U87 monoclonal cells
2.3 U87、CF5 和G11 細(xì)胞株粘附和侵襲能力的比較黏附1 h后,U87、CF5和G11平均黏附面積分別為(1459±164.1)μm2、(878.2±55.96)μm2和(2168±438.8)μm2,G11 黏 附 面 積 最 大,CF5 最 ?。≒<0.001),見圖3。
CCK-8 法黏附實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,黏附1 h 后,U87、CF5 和G11 細(xì)胞平均相對黏附率分別為(1.00±0.08)、(0.81±0.03)和(1.14±0.01),G11 黏附率能力最強(qiáng),U87次之,CF5最弱(P<0.001)。
3D 培養(yǎng)侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,U87、CF5 和G11 細(xì)胞72h內(nèi)從基質(zhì)膠接口處遷移到基質(zhì)膠內(nèi)細(xì)胞數(shù)量分別為(73.31±5.43)個(gè)、(34.01±4.55)個(gè)和(179.8±26.14)個(gè),G11 細(xì)胞侵襲能力最強(qiáng),CF5 最弱(P<0.05),見圖4。
圖3 免疫熒光法檢測細(xì)胞平均黏附面積(×200)Figure 3 Immunofluorescence images of the adhesion areas of the three cell lines(×200)
圖4 3D培養(yǎng)侵襲實(shí)驗(yàn)檢測細(xì)胞侵襲能力(×100)Figure 4 3D culture images of the invasion ability of the three cell lines(×100)
圖5 流式細(xì)胞術(shù)檢測3株細(xì)胞凋亡能力Figure 5 Apoptosis of the three cell lines detected by flow cytometry
2.4 U87、CF5 和G11 細(xì)胞株對藥物誘導(dǎo)凋亡敏感性的比較Doxorubicin 的促凋亡反應(yīng),U87、CF5 和G11 3 組細(xì)胞凋亡率分別為(8.75±0.09)%、(4.98±0.83)%和(11.23±0.80)%,CF5 耐受性最強(qiáng),G11 最弱,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01),見圖5。2.5 U87、CF5 和G11 細(xì)胞基因調(diào)控通路差異轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示,3 株細(xì)胞在基因表達(dá)層面存在較大差異,見圖6。交互分析發(fā)現(xiàn)CF5 相對G11 和U87 均下調(diào)的基因有159 個(gè),均上調(diào)的基因有303個(gè);G11 相對CF5 和U87 均下調(diào)的基因有281 個(gè),上調(diào)的基因則有116 個(gè);通路富集分析顯示CF5 和G11 在細(xì)胞外基質(zhì)相關(guān)的通路有最高的富集度,而細(xì)胞外基質(zhì)相關(guān)通路與腫瘤侵襲、耐藥等功能表型密切相關(guān)。因此,挑選了其中代表性的同一家族差異基因ITGA6和ITGA11進(jìn)行PCR驗(yàn)證。
熒光定量PCR 結(jié)果顯示,G11 ITGA6 相對表達(dá)量(1.62±0.10)較U87、CF5(1.01±0.16、0.08±0.01)明顯增高,U87 較CF5 明顯增高(P<0.05)。CF5 ITGA11 表 達(dá) 量(3.10±0.58)較U87、CF5(1.00±0.11、0.10±0.02)明 顯 增 高,U87 較CF5 明 顯 增 高(P<0.05)。熒光定量PCR結(jié)果與測序結(jié)果一致。
圖6 3株細(xì)胞差異基因表達(dá)情況Figure 6 Differential gene expressions in the three cell lines determined by qRT-PCR
腫瘤異質(zhì)性是惡性腫瘤的特征之一,腫瘤在生長過程中,經(jīng)過多次分裂增殖,其子細(xì)胞呈現(xiàn)出分子生物學(xué)或基因方面的改變,從而使不同克隆亞群在生長速度、侵襲能力、藥物敏感性、預(yù)后等方面產(chǎn)生差異[14-15]。而腫瘤干細(xì)胞克隆選擇性、基因組不穩(wěn)定性和進(jìn)化差異是導(dǎo)致腫瘤異質(zhì)性的重要原因[16-17]。在腫瘤研究中,細(xì)胞離體實(shí)驗(yàn)是必不可少的,來源更單一的細(xì)胞系,受體外培養(yǎng)條件和傳代次數(shù)的影響,細(xì)胞間也存在較大差異[18-19]。細(xì)胞間特定基因或分子功能簇的差異會導(dǎo)致一些功能基因的過表達(dá)或敲減/敲除達(dá)不到所對應(yīng)的功能表型。因此,從混合細(xì)胞或細(xì)胞株中依據(jù)特定標(biāo)志物、形態(tài)和功能差異挑選單一細(xì)胞,擴(kuò)增并構(gòu)建細(xì)胞株,并從基因?qū)W背景尋找不同單克隆細(xì)胞株異質(zhì)性差異,對后續(xù)挑選合適的細(xì)胞進(jìn)行分子和藥物研究具有指導(dǎo)意義。
本研究構(gòu)建了多個(gè)U87 的單克隆細(xì)胞株,這些細(xì)胞在形態(tài)、功能表型上存在較大差異。結(jié)果顯示,CF5 細(xì)胞株具有典型的短梭形形態(tài)特征,其增殖、干細(xì)胞成球和抗凋亡能力最強(qiáng);而G11呈細(xì)長形態(tài),其黏附和侵襲能力最強(qiáng),增殖、干細(xì)胞成球和抗凋亡能力卻較弱。轉(zhuǎn)錄組測序及生物信息分析顯示,即使在全程平行培養(yǎng)條件下,這些細(xì)胞間也存在大量差異表達(dá)基因。富集分析展示了差異表達(dá)基因所影響的通路和功能的差異。CF5 和G11 下調(diào)基因在細(xì)胞外基質(zhì)相關(guān)通路上均有最高富集度,而細(xì)胞外基質(zhì)相關(guān)通路與惡性腫瘤功能表型和預(yù)后密切相關(guān),比如整合素家族基因ITGA6、ITGA11 及賴氨酰氧化酶等,在腫瘤侵襲和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)換中發(fā)揮重要作用[20-22]。另外即使CF5 和G11 下調(diào)基因在細(xì)胞外基質(zhì)相關(guān)通路上均有最高富集度,但是所富集到的基因完全不同,提示這2 株細(xì)胞在生物學(xué)表型上的差異由不同的基因或基因集所驅(qū)動(dòng)。另外,PCR 結(jié)果顯示,上述提到的基因在3 株細(xì)胞中的表達(dá)具有顯著差異,因此在研究基因功能時(shí)宜根據(jù)基因表達(dá)差異對所選細(xì)胞進(jìn)行針對性的過表達(dá)/敲減、敲除等操作,而不宜用混合型細(xì)胞。通過本研究,我們認(rèn)為造成相同培養(yǎng)環(huán)境下單克隆細(xì)胞株功能表型的差異來源于細(xì)胞間基因背景的差異,而這些基因表達(dá)差異的來源則需要更深入的研究。同時(shí),這些結(jié)果也提示我們在研究基因、蛋白等分子在腫瘤細(xì)胞中功能表型及機(jī)制時(shí),需明確這些分子在所選細(xì)胞中的表達(dá)情況。
綜上所述,本研究篩選建立的單克隆細(xì)胞株為GBM 功能學(xué)實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了一個(gè)有用的細(xì)胞模型,同時(shí)篩選出的單克隆細(xì)胞株轉(zhuǎn)錄組測序信息也為后續(xù)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤腫瘤異質(zhì)性機(jī)制的研究奠定了基礎(chǔ)。