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孕婦外周血胎兒游離DNA高通量測序在產(chǎn)前非整倍體核型遺傳篩查中的應(yīng)用

2020-07-26 11:13緱靈山王傳霞顧茂勝
關(guān)鍵詞:核型高風(fēng)險陽性率

張 燕,王 億,緱靈山,王 鵬,方 媛,王傳霞,王 娜,索 峰,顧茂勝

(1.徐州市婦幼保健院遺傳醫(yī)學(xué)中心,江蘇徐州 221000;2.蘇州貝康醫(yī)療器械有限公司,江蘇蘇州 215123)

在我國,出生缺陷是造成嬰兒死亡率和兒童發(fā)病率升高的主要原因[1],致使出生缺陷發(fā)生的最常見原因之一為染色體非整倍體異常,主要包括21三體綜合征(21 trisomic syndrome,T21),18三體綜合征(18 trisomic syndrome,T18),13三體綜合征(13 trisomic syndrome,T3)等[2],此類疾病尚缺少有效的治療方法,故孕婦進(jìn)行產(chǎn)前染色體非整倍體篩查及診斷是降低出生缺陷率的最有效辦法。傳統(tǒng)的早中孕期產(chǎn)前篩查主要依靠血清學(xué)篩查及影像學(xué)排畸,但檢出率只有50%~95%,還存在5%的假陽性率[3]。介入性穿刺進(jìn)行核型分析準(zhǔn)確率高,是產(chǎn)前診斷金標(biāo)準(zhǔn),但其存在一定的流產(chǎn)及感染風(fēng)險,導(dǎo)致孕婦依從性差。無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(non invasive prenatal testing,NIPT)因其深度測序、高通量性、無創(chuàng)性、高特異度、高靈敏度、高檢出率等優(yōu)點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于產(chǎn)前胎兒染色體非整倍體篩查[4-6]。故本研究對8 001例孕婦NIPT結(jié)果行回顧性分析,探討NIPT檢測技術(shù)在評估胎兒染色體非整倍體風(fēng)險中的臨床應(yīng)用價值。

1 材料與方法

1.1 研究對象 選取2018年4月~2019年10月于徐州市婦幼保健院因各種原因行NIPT檢測的孕婦8 001人,年齡16~48(29.8±5.0)歲,采血孕周12+0~31+0周(對于孕周大于22+6周的孕婦,均已告知其可能錯過介入性診斷最佳時間并簽署知情同意書)。孕婦均已簽署檢查知情同意書。

1.2 儀器與試劑 NIPT檢測采用中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司研發(fā)的DA8600高通量DNA測序平臺及其配套生產(chǎn)的檢測試劑。

1.3 方法

1.3.1 NIPT檢測:EDTA管采集孕婦靜脈全血8~10ml,分離血漿,提取血漿中游離DNA,進(jìn)行文庫構(gòu)建、乳液PCR,ES富集、上機(jī)測序等步驟。實(shí)驗(yàn)加入陰陽性對照,測序結(jié)果經(jīng)過生物信息分析后,將各三體風(fēng)險指數(shù)Z值處于[-3.00~3.00]之間的樣本判斷為相應(yīng)T21,T18和T13低風(fēng)險,各Z值>3.00的樣本判斷為相應(yīng)T21,T18和T13高風(fēng)險。

1.3.2 羊水染色體核型確診:對NIPT結(jié)果高風(fēng)險者進(jìn)行遺傳咨詢,告知其進(jìn)行羊膜腔穿刺及羊水染色體核型分析,避免NIPT結(jié)果假陽性,對在本院行此檢查者簽署知情同意書,對在外院行此檢查者進(jìn)行電話隨訪。低風(fēng)險者進(jìn)行后續(xù)常規(guī)產(chǎn)檢。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 計(jì)量資料采用均值±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,計(jì)數(shù)資料采用率(%)表示,組間比較采用行×列表資料χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 NIPT結(jié)果分析 8 001例樣本中共檢出34例高風(fēng)險(0.425%),其中包括28例T21(0.350%),4例T18(0.050%),2例T13(0.025%)。

2.2 核型分析 所有NIPT高風(fēng)險者均在本院或外院行羊水染色體核型分析,確診19例T21,3例T18,1例T13,陽性預(yù)測值分別為67.86%,75%和50%,復(fù)合陽性預(yù)測值為67.65%(23/34)。

2.3 不同篩查指征組的陽性率比較 見表1。六組數(shù)據(jù)比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=5.454,P>0.05)。

表1 不同篩查指征組的陽性率[n(真陽性數(shù))]

3 討論

本研究8 001例樣本中共檢出34例三體高風(fēng)險,陽性率為0.425%,所有高風(fēng)險者經(jīng)回訪均已行羊水染色體核型分析,T21,T18和T13復(fù)合陽性預(yù)測值為67.65%,符合指南與共識要求不低于50%的標(biāo)準(zhǔn)[7],但稍低于其他檢測機(jī)構(gòu)[2,8-9],這主要與篩查人群有關(guān)。NIPT技術(shù)規(guī)范[10]將產(chǎn)篩臨界風(fēng)險為1/1 000~1/270的孕婦納入NIPT篩查范圍,但本產(chǎn)前診斷中心將該范圍擴(kuò)大為1/2 000~1/270,在增加真陽性例數(shù)的同時假陽性例數(shù)也有所提高,因此降低了復(fù)合陽性預(yù)測值。

根據(jù)篩查指征將孕婦分為六組,其中彩超提示異常組陽性率最高,這與染色體異常者的臨床表現(xiàn)有關(guān),與NIPT檢測技術(shù)無關(guān)[11],其次為產(chǎn)篩高風(fēng)險組、高齡組、產(chǎn)篩臨界風(fēng)險組,孕婦要求及其他篩查指征組陽性率最低。因此,NIPT均適用于這六組人群,尤其是前五組以及有介入性產(chǎn)前診斷禁忌者,與傳統(tǒng)的介入性診斷相比,大大減少了行介入性診斷的人數(shù),同時也減輕了部分孕婦的心理壓力。

本研究入選產(chǎn)篩臨界風(fēng)險(1/2 000~1/1 000)組的孕婦有1 709例,確診1例T18,該組的核型分析陽性率為0.059%,NIPT假陽性率(3/4)高于產(chǎn)篩臨界風(fēng)險(1/1 000~1/270)組的假陽性率(2/4)。因此,將NIPT適用產(chǎn)篩臨界風(fēng)險范圍擴(kuò)大為1/2 000~1/270可以提高染色體非整倍體的檢出率,避免三體患兒的出生,但會導(dǎo)致NIPT假陽性率有一定比例的升高。

NIPT檢測技術(shù)的自身優(yōu)勢以及該技術(shù)的不斷升級優(yōu)化等優(yōu)點(diǎn)使其在臨床具有越來越廣泛的應(yīng)用前景,但該技術(shù)仍存在一定的假陽性率及假陰性率[12],所以也僅局限用于染色體非整倍體的篩查,對于檢出高風(fēng)險者仍需進(jìn)一步確診,檢出低風(fēng)險者仍需進(jìn)行后續(xù)常規(guī)產(chǎn)檢。

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